BC134347 // NONCODE // accn=BC134347 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000391139_04 cpcScore=0.0196761 cnci=-0.0541435 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000129817 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000129817 cpcScore=-1.1282000 cnci=-0.3994072 gene:OTTHUMG00000058662 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011lrg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011lrg.1 cpcScore=1.6092200 cnci=-0.3450649 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF065414 // NONCODE // accn=AF065414 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000065524_03 cpcScore=0.4044530 cnci=-0.4224080 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052552 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052552 cpcScore=-0.6307900 cnci=-0.2542593 gene:OTTHUMG00000019968 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052553 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052553 cpcScore=-0.7905880 cnci=-0.0169064 gene:OTTHUMG00000019968 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098218 // NONCODE // accn=AK098218 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5369 cpcScore=-0.9035830 cnci=-0.1579849 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052579 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052579 cpcScore=-1.3528700 cnci=-0.4745696 gene:OTTHUMG00000019980 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004agx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004agx.1 cpcScore=-0.2612610 cnci=-0.2568217 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ahc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ahc.1 cpcScore=0.2311650 cnci=-0.2347442 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085948 // NONCODE // accn=AF085948 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4166 cpcScore=-1.0773700 cnci=-0.2744897 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL713639 // NONCODE // accn=AL713639 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4168 cpcScore=-1.0566600 cnci=-0.2516428 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043510 // NONCODE // accn=BC043510 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4169 cpcScore=-0.8284060 cnci=-0.3915947 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aho.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004aho.1 cpcScore=-1.1213100 cnci=-0.3355365 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039990 // NONCODE // accn=NR_039990 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_039990 cpcScore=-1.0334100 cnci=-0.1972473 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_599 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_599 cpcScore=-1.3593200 cnci=-0.3773567 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052660 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052660 cpcScore=-0.0638690 cnci=-0.2919336 gene:OTTHUMG00000020015 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052661 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052661 cpcScore=-0.1186250 cnci=-0.2965923 gene:OTTHUMG00000020015 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052662 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052662 cpcScore=-0.1133230 cnci=-0.2890246 gene:OTTHUMG00000020015 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_600 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_600 cpcScore=-1.2581500 cnci=-0.4121488 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X75687 // NONCODE // accn=X75687 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323539 cpcScore=1.0789200 cnci=-0.2313514 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041938 // NONCODE // accn=BC041938 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4173 cpcScore=-1.2087200 cnci=-0.4588643 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056407 // NONCODE // accn=AK056407 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4174 cpcScore=0.7076470 cnci=-0.2732131 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023352 // NONCODE // accn=NR_023352 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_023352 cpcScore=3.5236200 cnci=-0.3044036 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026668 // NONCODE // accn=NR_026668 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026668 cpcScore=-1.0183200 cnci=-0.0957776 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052782 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052782 cpcScore=-0.8584770 cnci=-0.2068146 gene:OTTHUMG00000020070 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052783 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052783 cpcScore=-1.1328000 cnci=-0.4223155 gene:OTTHUMG00000020070 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052798 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052798 cpcScore=-1.2352200 cnci=-0.2585626 gene:OTTHUMG00000020074 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052804 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052804 cpcScore=-1.1545800 cnci=-0.3785922 gene:OTTHUMG00000020080 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_602 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_602 cpcScore=-1.3043400 cnci=-0.2540077 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR597008 // NONCODE // accn=CR597008 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4184 cpcScore=-1.0512800 cnci=-0.4945277 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1382 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1382 cpcScore=-1.2716000 cnci=-0.2128515 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056882 // NONCODE // accn=AK056882 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4185 cpcScore=-1.1487600 cnci=-0.4049333 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037638 // NONCODE // accn=NR_037638 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037638 cpcScore=7.7978900 cnci=-0.2782276 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1887 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1887 cpcScore=-1.3123900 cnci=-0.1908692 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1911 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1911 cpcScore=-1.2756200 cnci=-0.2755753 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00029447-XLOC_l2_015262 // Broad TUCP // linc-GAS1-1 chr9:-:89624806-89656889 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010mqg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010mqg.2 cpcScore=-1.1374800 cnci=-0.2821739 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036691 // NONCODE // accn=NR_036691 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036691 cpcScore=3.2133600 cnci=-0.1501047 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004apb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004apb.1 cpcScore=2.6198300 cnci=-0.3503809 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040117 // NONCODE // accn=NR_040117 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_040117 cpcScore=6.2652300 cnci=-0.0692877 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2029 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2029 cpcScore=-1.4566900 cnci=-0.1350959 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000052985 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000052985 cpcScore=0.3345370 cnci=-0.2088864 gene:OTTHUMG00000020178 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX538228 // NONCODE // accn=BX538228 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4189 cpcScore=-1.1893500 cnci=-0.2872229 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D84361 // NONCODE // accn=D84361 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5373 cpcScore=11.1520000 cnci=-0.0619671 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000144685 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000144685 cpcScore=-0.9448030 cnci=-0.4546755 gene:OTTHUMG00000067507 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053006 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053006 cpcScore=0.5250280 cnci=-0.2648299 gene:OTTHUMG00000020191 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053009 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053009 cpcScore=-0.3291440 cnci=-0.2820740 gene:OTTHUMG00000020194 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053010 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053010 cpcScore=0.2218240 cnci=-0.1921907 gene:OTTHUMG00000020194 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053013 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053013 cpcScore=-0.6681470 cnci=-0.3076724 gene:OTTHUMG00000020197 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053014 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053014 cpcScore=-1.1025500 cnci=-0.2969837 gene:OTTHUMG00000020197 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053023 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053023 cpcScore=-1.2638400 cnci=-0.2073804 gene:OTTHUMG00000020201 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038882 // NONCODE // accn=NR_038882 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038882 cpcScore=-0.7754760 cnci=-0.2574691 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053024 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053024 cpcScore=-0.3868490 cnci=-0.4491319 gene:OTTHUMG00000020202 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR592272 // NONCODE // accn=CR592272 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4192 cpcScore=-1.1934800 cnci=-0.2479096 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053026 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053026 cpcScore=-1.3157400 cnci=-0.5250184 gene:OTTHUMG00000020204 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053047 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053047 cpcScore=-1.0735400 cnci=-0.5731111 gene:OTTHUMG00000020214 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC045178 // NONCODE // accn=BC045178 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4194 cpcScore=0.1635420 cnci=-0.3414834 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024020 // NONCODE // accn=NR_024020 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024020 cpcScore=15.8698000 cnci=-0.1920768 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053138 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053138 cpcScore=-1.2806500 cnci=-0.4226848 gene:OTTHUMG00000020245 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053139 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053139 cpcScore=-0.8898320 cnci=-0.2758669 gene:OTTHUMG00000020246 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126072 // NONCODE // accn=AK126072 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5374 cpcScore=0.6966860 cnci=-0.1833383 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053172 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053172 cpcScore=-0.0957109 cnci=-0.2240657 gene:OTTHUMG00000020259 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1597 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1597 cpcScore=-1.3074500 cnci=-0.2646078 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015241 // NONCODE // accn=BC015241 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4198 cpcScore=0.2876260 cnci=-0.3223641 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004auk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004auk.2 cpcScore=-1.0678900 cnci=-0.2304938 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053234 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053234 cpcScore=-0.9892690 cnci=-0.2313481 gene:OTTHUMG00000020281 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053236 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053236 cpcScore=-0.1484260 cnci=-0.0695905 gene:OTTHUMG00000020283 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125873 // NONCODE // accn=AK125873 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4201 cpcScore=-0.9025690 cnci=-0.2932284 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB233423 // NONCODE // accn=AB233423 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000330032 cpcScore=1.3377000 cnci=-1.0000000 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB212827 // NONCODE // accn=AB212827 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000383650 cpcScore=-1.0184700 cnci=-1.0000000 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000321517 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000321517 cpcScore=1.9374900 cnci=-0.1939294 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412446 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000412446 cpcScore=-0.3981300 cnci=-0.1782870 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427259 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000427259 cpcScore=-0.9751730 cnci=-0.4657518 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429781 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000429781 cpcScore=0.3594630 cnci=-0.2742180 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433656 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000433656 cpcScore=-1.1087400 cnci=-0.2758023 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448465 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000448465 cpcScore=1.1469300 cnci=-0.3051035 gene:ENSG00000175611 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_023390 // NONCODE // accn=NR_023390 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_023390 cpcScore=0.3223860 cnci=-0.3004008 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AX747380 // NONCODE // accn=AX747380 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5376 cpcScore=-0.7680800 cnci=-0.2806855 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053343 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053343 cpcScore=-1.2309800 cnci=-0.2068265 gene:OTTHUMG00000020335 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC023631 // NONCODE // accn=BC023631 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5377 cpcScore=0.2964350 cnci=-0.1579922 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002894 // NONCODE // accn=NR_002894 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002894 cpcScore=2.5982000 cnci=-0.1671440 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000504063 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000504063 cpcScore=0.3064790 cnci=-0.2017595 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1827 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1827 cpcScore=-1.3289100 cnci=-0.2155177 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004axb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004axb.2 cpcScore=-1.2153900 cnci=-0.4730729 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027302 // NONCODE // accn=NR_027302 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027302 cpcScore=4.9594100 cnci=-0.2610378 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004axt.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004axt.1 cpcScore=0.5924410 cnci=-0.3599635 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126790 // NONCODE // accn=AK126790 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4209 cpcScore=-0.8356590 cnci=-0.2560776 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053397 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053397 cpcScore=-1.0381100 cnci=-0.2610594 gene:OTTHUMG00000020358 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024532 // NONCODE // accn=NR_024532 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024532 cpcScore=6.4576200 cnci=-0.2651285 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030123 // NONCODE // accn=BC030123 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4211 cpcScore=4.0899500 cnci=-0.2487060 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR541918 // NONCODE // accn=CR541918 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4214 cpcScore=5.9934600 cnci=-0.1451534 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094413 // NONCODE // accn=AK094413 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4216 cpcScore=-1.1618000 cnci=-0.3821849 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053466 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053466 cpcScore=0.4142060 cnci=-0.3839511 gene:OTTHUMG00000020399 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053467 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053467 cpcScore=-1.1402500 cnci=-0.5400973 gene:OTTHUMG00000020399 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053468 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053468 cpcScore=-1.1132400 cnci=-0.3008106 gene:OTTHUMG00000020400 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053496 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053496 cpcScore=-1.1915400 cnci=-0.4475631 gene:OTTHUMG00000020419 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010mti.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010mti.1 cpcScore=-0.8178340 cnci=-0.2287579 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053524 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053524 cpcScore=-1.3590300 cnci=-0.2666636 gene:OTTHUMG00000020432 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053531 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053531 cpcScore=-0.9678330 cnci=-0.3923108 gene:OTTHUMG00000020437 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053527 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053527 cpcScore=-1.2465800 cnci=-0.2677477 gene:OTTHUMG00000020434 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bcv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bcv.2 cpcScore=1.1326500 cnci=-0.4013227 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053552 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053552 cpcScore=-1.0710900 cnci=-0.2632123 gene:OTTHUMG00000020447 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053553 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053553 cpcScore=-0.8835830 cnci=-0.1413831 gene:OTTHUMG00000020447 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053566 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053566 cpcScore=-1.2330600 cnci=-0.2779208 gene:OTTHUMG00000020457 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_607 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_607 cpcScore=-1.5274700 cnci=-0.1380664 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_584 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_584 cpcScore=-1.3173800 cnci=-0.2253379 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055231 // NONCODE // accn=AK055231 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4226 cpcScore=-0.9940890 cnci=-0.3839083 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040293 // NONCODE // accn=BC040293 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4227 cpcScore=-1.2765800 cnci=-0.4195741 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bdv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bdv.2 cpcScore=-1.2494800 cnci=-0.4224969 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF155065 // NONCODE // accn=AF155065 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4228 cpcScore=7.2841500 cnci=-0.0668045 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bdx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bdx.1 cpcScore=0.3026130 cnci=-0.3370544 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bdy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bdy.1 cpcScore=-0.9993910 cnci=-0.1675752 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026918 // NONCODE // accn=NR_026918 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026918 cpcScore=2.4187900 cnci=-0.2652635 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053635 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053635 cpcScore=-0.2975350 cnci=-0.3722404 gene:OTTHUMG00000020487 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X64977 // NONCODE // accn=X64977 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4230 cpcScore=1.4629000 cnci=-0.1072570 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034087 // NONCODE // accn=NR_034087 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034087 cpcScore=1.5546300 cnci=-0.2708871 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bfk.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bfk.3 cpcScore=1.0627500 cnci=-0.2304894 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056358 // NONCODE // accn=AK056358 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4231 cpcScore=0.1394180 cnci=-0.2437137 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010muh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010muh.1 cpcScore=-0.3531540 cnci=-0.2507676 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_608 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_608 cpcScore=-1.2687600 cnci=-0.2357546 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085953 // NONCODE // accn=AF085953 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4232 cpcScore=-0.3939300 cnci=-0.4064298 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bge.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bge.1 cpcScore=-1.3091900 cnci=-0.1730340 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439875 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000439875 cpcScore=-0.0698789 cnci=-0.1982890 gene:ENSG00000225684 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR749681 // NONCODE // accn=CR749681 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4235 cpcScore=-0.7983750 cnci=-0.1821271 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bhb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bhb.2 cpcScore=0.4083410 cnci=-0.2792908 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027261 // NONCODE // accn=NR_027261 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027261 cpcScore=2.2154400 cnci=-0.3223587 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053785 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053785 cpcScore=-1.0579000 cnci=-0.3449402 gene:OTTHUMG00000020544 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053786 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053786 cpcScore=-1.0358800 cnci=-0.1571377 gene:OTTHUMG00000020544 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053783 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053783 cpcScore=-1.0674100 cnci=-0.2386216 gene:OTTHUMG00000020542 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053790 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053790 cpcScore=-1.0295900 cnci=-0.2943290 gene:OTTHUMG00000020548 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M96686 // NONCODE // accn=M96686 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000196931 cpcScore=-0.0618395 cnci=-0.0418759 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U88892 // NONCODE // accn=U88892 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4240 cpcScore=-0.0675267 cnci=-0.1165415 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092105 // NONCODE // accn=AK092105 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4247 cpcScore=-1.2690400 cnci=-0.3234799 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053806 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053806 cpcScore=-0.8090800 cnci=-0.2123480 gene:OTTHUMG00000020560 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053809 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053809 cpcScore=-1.0351500 cnci=-0.2416456 gene:OTTHUMG00000020563 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053812 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053812 cpcScore=0.1806520 cnci=-0.1619912 gene:OTTHUMG00000020566 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000053940 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000053940 cpcScore=-0.1897710 cnci=-0.3178141 gene:OTTHUMG00000020610 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003191 // NONCODE // accn=NR_003191 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003191 cpcScore=1.8318600 cnci=-0.2354711 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123875 // NONCODE // accn=AK123875 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4252 cpcScore=-1.0490800 cnci=-0.2159462 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411790 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000411790 cpcScore=-0.8210780 cnci=-0.2047555 gene:ENSG00000237548 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027125 // NONCODE // accn=NR_027125 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027125 cpcScore=3.2636500 cnci=-0.3045939 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010186 // NONCODE // accn=BC010186 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4256 cpcScore=-1.1006600 cnci=-0.2371279 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bnb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bnb.1 cpcScore=-1.1638100 cnci=-0.3543083 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026677 // NONCODE // accn=NR_026677 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026677 cpcScore=4.2065900 cnci=-0.2106905 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1405 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1405 cpcScore=-1.4008000 cnci=-0.1998673 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033234 // NONCODE // accn=NR_033234 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033234 cpcScore=10.2293000 cnci=-0.3406355 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK131516 // NONCODE // accn=AK131516 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4258 cpcScore=-1.2629500 cnci=-0.2253147 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453529 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000453529 cpcScore=-0.9285280 cnci=-0.1656369 gene:ENSG00000236668 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054083 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054083 cpcScore=-1.1286100 cnci=-0.2161494 gene:OTTHUMG00000020682 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004bpf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004bpf.1 cpcScore=0.3483570 cnci=-0.1899934 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054109 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054109 cpcScore=0.3009970 cnci=-0.3158586 gene:OTTHUMG00000020686 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY425957 // NONCODE // accn=AY425957 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000254572 cpcScore=1.7540300 cnci=-0.1717116 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR045006 // NONCODE // accn=NR045006 class=mRNAlike lncRNA name=NRON ref=lncRNAdb transcriptId=424070 cpcScore=-1.4318200 cnci=-0.2806439 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054329 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054329 cpcScore=-1.3365900 cnci=-0.4276595 gene:OTTHUMG00000020726 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054410 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054410 cpcScore=0.2331470 cnci=-0.2932716 gene:OTTHUMG00000020737 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_609 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_609 cpcScore=-1.5496400 cnci=-0.2786554 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC023210 // NONCODE // accn=BC023210 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000090735 cpcScore=-1.1102100 cnci=-0.1614987 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054468 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054468 cpcScore=-0.9595520 cnci=-0.2432303 gene:OTTHUMG00000020753 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR592853 // NONCODE // accn=CR592853 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000272048 cpcScore=-1.2844200 cnci=-0.1348627 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085951 // NONCODE // accn=AF085951 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4266 cpcScore=-0.8526410 cnci=-0.1933203 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054575 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054575 cpcScore=-0.8449700 cnci=-0.1552504 gene:OTTHUMG00000020780 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000315870 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000315870 cpcScore=-0.2165130 cnci=-0.2043871 gene:OTTHUMG00000020780 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028048 // NONCODE // accn=NR_028048 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028048 cpcScore=7.2982300 cnci=-0.0620811 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1442 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1442 cpcScore=-1.2919000 cnci=-0.0305128 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00016487-XLOC_007865 // Rinn lincRNA // linc-IER5L-3 chr9:-:132100957-132102959 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036799 // NONCODE // accn=BC036799 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4268 cpcScore=-0.6275260 cnci=-0.1356210 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC094851 // NONCODE // accn=BC094851 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000335152 cpcScore=0.5307170 cnci=-0.2191302 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_610 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_610 cpcScore=-1.4777600 cnci=-0.3370625 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1580 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1580 cpcScore=-1.3009100 cnci=-0.1594210 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056037 // NONCODE // accn=AK056037 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4270 cpcScore=-1.2590900 cnci=-0.2856809 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ925677 // NONCODE // accn=DQ925677 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468683 cpcScore=2.5037800 cnci=-0.0926782 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ925678 // NONCODE // accn=DQ925678 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468684 cpcScore=2.1465600 cnci=-0.0894129 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ925680 // NONCODE // accn=DQ925680 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468686 cpcScore=1.0384200 cnci=-0.0503771 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ925682 // NONCODE // accn=DQ925682 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468688 cpcScore=1.4728900 cnci=-0.0792876 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ925683 // NONCODE // accn=DQ925683 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468689 cpcScore=1.0164000 cnci=-0.0917688 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z36848 // NONCODE // accn=Z36848 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000327156 cpcScore=2.2888400 cnci=-0.2834511 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1466 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1466 cpcScore=-1.3364300 cnci=-0.2937601 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00030085-XLOC_l2_015397 // Broad TUCP // linc-TSC1-1 chr9:-:135894815-135896553 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC007959 // NONCODE // accn=BC007959 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4275 cpcScore=-0.9664370 cnci=-0.1519043 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054944 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054944 cpcScore=-0.8759050 cnci=-0.1333616 gene:OTTHUMG00000020883 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR592354 // NONCODE // accn=CR592354 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4276 cpcScore=-1.0165000 cnci=-0.2160287 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF129263 // NONCODE // accn=AF129263 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4277 cpcScore=-0.2436760 cnci=-0.1118257 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054945 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054945 cpcScore=-0.9860610 cnci=-0.2710076 gene:OTTHUMG00000020884 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054947 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054947 cpcScore=-0.8086570 cnci=-0.1953559 gene:OTTHUMG00000020886 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130575 // NONCODE // accn=AK130575 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4278 cpcScore=1.1236100 cnci=-0.1426039 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR592591 // NONCODE // accn=CR592591 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5386 cpcScore=-0.9180020 cnci=-0.2953889 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054979 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054979 cpcScore=-0.9346930 cnci=-0.0574676 gene:OTTHUMG00000020899 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054978 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054978 cpcScore=-0.6944050 cnci=-0.0639082 gene:OTTHUMG00000020898 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000054990 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000054990 cpcScore=-1.3443700 cnci=-0.2151329 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC058547 // NONCODE // accn=BC058547 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4281 cpcScore=-0.9054490 cnci=-0.1543043 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK097774 // NONCODE // accn=AK097774 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4284 cpcScore=-0.2086800 cnci=-0.1553890 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015688 // NONCODE // accn=BC015688 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4283 cpcScore=4.6114000 cnci=-0.1108077 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055078 // NONCODE // accn=AK055078 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4286 cpcScore=-0.9370610 cnci=-0.1782717 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cgv.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cgv.3 cpcScore=-0.6721160 cnci=-0.1793775 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000418388 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000418388 cpcScore=1.7951300 cnci=-0.1074213 gene:ENSG00000238227 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447934 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000447934 cpcScore=-0.9464050 cnci=-0.0873494 gene:ENSG00000238227 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448040 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000448040 cpcScore=-1.1830600 cnci=-0.0490791 gene:ENSG00000238227 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414962 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000414962 cpcScore=-0.5168460 cnci=-0.1405231 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026964 // NONCODE // accn=NR_026964 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026964 cpcScore=4.7291200 cnci=-0.1152587 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004cic.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cic.2 cpcScore=4.7868500 cnci=-0.1379210 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024542 // NONCODE // accn=NR_024542 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024542 cpcScore=-0.6594560 cnci=-0.1531190 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024543 // NONCODE // accn=NR_024543 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024543 cpcScore=-0.9542160 cnci=-0.1391268 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011meb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011meb.1 cpcScore=0.1174260 cnci=-0.2226465 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC128523 // NONCODE // accn=BC128523 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389888 cpcScore=-0.0450317 cnci=-0.1467669 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024580 // NONCODE // accn=NR_024580 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024580 cpcScore=8.3136200 cnci=-0.0922725 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032104 // NONCODE // accn=BC032104 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5387 cpcScore=0.1275940 cnci=-0.1256676 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC019844 // NONCODE // accn=BC019844 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4289 cpcScore=-1.0741700 cnci=-0.1969837 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR542066 // NONCODE // accn=CR542066 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000268935 cpcScore=2.5973200 cnci=-0.0156451 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U18236 // NONCODE // accn=U18236 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000218439 cpcScore=1.0462700 cnci=-0.0801625 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027447 // NONCODE // accn=NR_027447 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027447 cpcScore=-0.7816770 cnci=-0.1233973 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EU588721 // NONCODE // accn=EU588721 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000557809 cpcScore=1.5274400 cnci=-1.0000000 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000501337 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000501337 cpcScore=4.7943000 cnci=-0.0897988 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK097764 // NONCODE // accn=AK097764 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4290 cpcScore=-0.3816670 cnci=-0.1372264 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC027323 // NONCODE // accn=BC027323 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4291 cpcScore=2.3215100 cnci=-0.1619805 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055377 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055377 cpcScore=-0.5660660 cnci=-0.0722726 gene:OTTHUMG00000020999 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC127632 // NONCODE // accn=BC127632 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389260 cpcScore=-0.8566860 cnci=-0.1287487 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126935 // NONCODE // accn=AK126935 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4293 cpcScore=0.1625110 cnci=-0.2884139 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093220 // NONCODE // accn=AK093220 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4294 cpcScore=-1.0583200 cnci=-0.2008994 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004coj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004coj.1 cpcScore=-1.2100900 cnci=-0.1439960 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_206920 // RefSeq // Homo sapiens MAM domain containing 4 (MAMDC4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:136852367:136860797:1 gene:ENSG00000177943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:9:136852367:136860797:1 gene:ENSG00000177943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:136850943:136860799:1 gene:ENSG00000177943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144259 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052779, with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055156 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:136850943:136860799:1 Gene:OTTHUMG00000020951 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055158 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:136857005:136860797:1 Gene:OTTHUMG00000020951 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055159 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:136855559:136856219:1 Gene:OTTHUMG00000020951 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254642 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:136852367:136860797:1 Gene:OTTHUMG00000020951 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cjs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens MAM domain containing 4 (MAMDC4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mej.2 // UCSC Genes // Homo sapiens MAM domain containing 4 (MAMDC4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055157 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:9:139747564:139755249:1 Gene:OTTHUMG00000020951 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012166 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 10 (FBXO10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541829 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:9:37512544:37588871:-1 gene:ENSG00000147912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:37521718:37536062:-1 gene:ENSG00000147912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125124 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:149840 IMAGE:40119018), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125125 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:149841 IMAGE:40119019), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140785 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:176462 IMAGE:9021653), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432825 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1099:759672:780979:+ gene:ENSG00000147912 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052472 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:37510892:37576253:-1 Gene:OTTHUMG00000019926 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aab.3 // UCSC Genes // Homo sapiens F-box protein 10 (FBXO10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aac.3 // UCSC Genes // Homo sapiens F-box protein 10 (FBXO10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aad.3 // UCSC Genes // Homo sapiens F-box protein 10 (FBXO10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:37512547:37588874:-1 gene:ENSG00000256966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003028 // RefSeq // Homo sapiens Src homology 2 domain containing adaptor protein B (SHB), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377700 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:9:38015422:38069210:-1 gene:ENSG00000107338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136581 // GenBank // Homo sapiens Src homology 2 domain containing adaptor protein B, mRNA (cDNA clone MGC:168194 IMAGE:9020571), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377707 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1099:269840:404458:+ gene:ENSG00000107338 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052490 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:37919134:38069211:-1 Gene:OTTHUMG00000019936 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aax.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Src homology 2 domain containing adaptor protein B (SHB), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030940 // RefSeq // Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly 1 (ISCA1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:86265679:86282108:-1 gene:ENSG00000135070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:86266863:86282538:-1 gene:ENSG00000135070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:86264546:86282529:-1 gene:ENSG00000135070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002675 // GenBank // Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4276 IMAGE:3608301), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071621 // GenBank // Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:87743 IMAGE:5107151), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452279 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2839:1299856:1314965:- gene:ENSG00000135070 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052914 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:86264546:86282529:-1 Gene:OTTHUMG00000020135 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052915 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:86265679:86282108:-1 Gene:OTTHUMG00000020135 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052916 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:86266863:86282538:-1 Gene:OTTHUMG00000020135 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aop.3 // UCSC Genes // Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly 1 homolog (S. cerevisiae) (ISCA1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012419 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001012421 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A2 (ANKRD20A2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:40223285:40266392:1 gene:ENSG00000183148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:40230410:40258779:1 gene:ENSG00000183148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140809 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:176486 IMAGE:9021677), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171793 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:198508 IMAGE:9054447), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000129794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:40223285:40266392:1 Gene:OTTHUMG00000058641 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000129795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:40230410:40258779:1 Gene:OTTHUMG00000058641 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004acd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010mmv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026759 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 95, member B1 (FAM95B1), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:40321299:40329218:1 gene:ENSG00000223839 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK093443 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36124 fis, clone TESTI2022952. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK125850 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43862 fis, clone TESTI4007775. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000129776 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:40321299:40329218:1 Gene:OTTHUMG00000058623 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004acg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 95, member B1 (FAM95B1), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ach.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 95, member B1 (FAM95B1), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004acg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004acg.2 cpcScore=0.8578450 cnci=-0.1741851 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ach.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ach.2 cpcScore=0.5540550 cnci=-0.1753967 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aci.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004aci.1 cpcScore=-0.8333150 cnci=-0.2988578 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aci.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36124 fis, clone TESTI2022952. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005226 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 3 (S1PR3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:88996506:89005010:1 gene:ENSG00000213694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069579 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:97186 IMAGE:7262431), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052979 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:88996506:89005010:1 Gene:OTTHUMG00000020173 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aqe.3 // UCSC Genes // --- // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bjm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 3 (S1PR3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003692 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1 (TMEFF1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:100473113:100577636:1 gene:ENSG00000241697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035056 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:41873 IMAGE:5262325), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053418 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:100473113:100577636:1 Gene:OTTHUMG00000020367 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004baz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1 (TMEFF1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018376 // RefSeq // Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans) (NIPSNAP3B), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:104764170:104774010:1 gene:ENSG00000165028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:104764195:104773146:1 gene:ENSG00000165028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005202 // GenBank // Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:12211 IMAGE:3933738), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017914 // GenBank // Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:23845 IMAGE:4292375), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX647652 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L0786 (from clone DKFZp686L0786). // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053486 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:104764170:104774010:1 Gene:OTTHUMG00000020414 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053487 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:104764157:104777457:1 Gene:OTTHUMG00000020414 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053488 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:104764195:104773146:1 Gene:OTTHUMG00000020414 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bci.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans) (NIPSNAP3B), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bcj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans) (NIPSNAP3B), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015469 // RefSeq // Homo sapiens nipsnap homolog 3A (C. elegans) (NIPSNAP3A), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:104753599:104759130:1 gene:ENSG00000136783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK301410 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58863 complete cds, highly similar to Protein NipSnap3A. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005935 // GenBank // Homo sapiens nipsnap homolog 3A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:14553 IMAGE:4064889), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374767 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1260:1685839:1693809:- gene:ENSG00000136783 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053484 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:104747688:104760122:1 Gene:OTTHUMG00000020413 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053485 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:104753599:104759130:1 Gene:OTTHUMG00000020413 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bch.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nipsnap homolog 3A (C. elegans) (NIPSNAP3A), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011lvt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens nipsnap homolog 3A (C. elegans) (NIPSNAP3A), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000607 // RefSeq // Homo sapiens orosomucoid 1 (ORM1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000259396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:9:114323056:114326475:1 gene:ENSG00000229314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:114323766:114325251:1 gene:ENSG00000229314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538816 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:9:117085377:117086584:1 gene:ENSG00000229314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026238 // GenBank // Homo sapiens orosomucoid 1, mRNA (cDNA clone MGC:22246 IMAGE:4767956), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104818 // GenBank // Homo sapiens orosomucoid 1, mRNA (cDNA clone MGC:132478 IMAGE:8143821), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055426 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:114323056:114326475:1 Gene:OTTHUMG00000021012 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055427 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:114323766:114325251:1 Gene:OTTHUMG00000021012 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bik.4 // UCSC Genes // Homo sapiens orosomucoid 1 (ORM1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021057 // RefSeq // Homo sapiens interferon, alpha 7 (IFNA7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000239347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:21201469:21202205:-1 gene:ENSG00000214042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074991 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha 7, mRNA (cDNA clone MGC:104070 IMAGE:30915521), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113994 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha 7, mRNA (cDNA clone MGC:138899 IMAGE:40084821), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000051891 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:21201469:21202205:-1 Gene:OTTHUMG00000019662 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003zop.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interferon, alpha 7 (IFNA7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026677 // RefSeq // Homo sapiens MIR600 host gene (non-protein coding) (MIR600HG), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_030331 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 600 (MIR600), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385007 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:9:123111546:123111643:-1 gene:ENSG00000274325 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000236901 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:123109494:123115477:-1 gene:ENSG00000236901 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000530364 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:9:123109500:123122223:-1 gene:ENSG00000165209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:9:123109501:123115477:-1 gene:ENSG00000236901 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:123109494:123115477:-1 Gene:OTTHUMG00000020635 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bnp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens MIR600 host gene (non-protein coding) (MIR600HG), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC014180 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4620443, partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000052470 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:37509150:37510299:1 Gene:OTTHUMG00000019924 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aaa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ43482 fis, clone OCBBF3002600. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:37509150:37510299:1 gene:ENSG00000234160 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aaa.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004aaa.2 cpcScore=-0.8727500 cnci=-0.3018033 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012419 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032250 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A1 (ANKRD20A1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377477 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:9:67926761:67969840:1 gene:ENSG00000196774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140809 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:176486 IMAGE:9021677), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171793 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:198508 IMAGE:9054447), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083800 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:9:67926761:67969840:1 Gene:OTTHUMG00000034629 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004aeu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010mnn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A3 (ANKRD20A3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_054107 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 2 (OR1J2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK123016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16828 fis, clone UTERU3013781, highly similar to Olfactory receptor 1J2. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053942 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:122471358:122475817:1 Gene:OTTHUMG00000020612 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004bmj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 2 (OR1J2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:122471358:122475817:1 gene:ENSG00000231465 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004452 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 4 (OR1J4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_054107 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 2 (OR1J2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444856 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:9:125273081:125281860:1 gene:ENSG00000197233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340750 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4075:88419:89360:+ gene:ENSG00000239590 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053932 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:122510802:122511743:1 Gene:OTTHUMG00000020604 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053936 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:122519141:122520082:1 Gene:OTTHUMG00000020606 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011lyv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 2 (OR1J2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011lyw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily J, member 4 (OR1J4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024639 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 322 (ZNF322), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375210 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:9:99959537:99961910:-1 gene:ENSG00000188801 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050425 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 322A, mRNA (cDNA clone MGC:54129 IMAGE:6473688), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119669 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 322A, mRNA (cDNA clone MGC:149551 IMAGE:40116184), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000053307 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:9:97195351:97197687:-1 Gene:OTTHUMG00000020319 // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:9:97195351:97197687:-1 gene:ENSG00000242375 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ786258 // GenBank // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_282884 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004axc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_282884 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004axd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 322 (ZNF322), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ582265 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-32377, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cor.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32376, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S81656 // GenBank // tRNA(Ile) [human, skeletal muscle_progressive external ophtalmoplegia patient isol, mRNA Mitochondrial Mutant, 69 nt]. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cos.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cos.3 cpcScore=3.3302700 cnci=-0.3485624 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cos.4 // UCSC Genes // --- // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011mfi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mfi.1 cpcScore=4.6126500 cnci=-0.3104665 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mfi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA expressed only in placental villi, clone SMAP42. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB017116 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial mRNA for AD 1, partial cds. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bqu.1 // UCSC Genes // --- // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC061915 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3887455, **** WARNING: chimeric clone ****. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cov.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cov.3 cpcScore=5.0496900 cnci=-0.4375385 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cov.4 // UCSC Genes // --- // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584698 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51810, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cow.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cow.1 cpcScore=-1.2581700 cnci=-0.4341165 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cow.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-51809, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004cox.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cox.3 cpcScore=8.7780600 cnci=-0.2852693 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cox.4 // UCSC Genes // Homo sapiens NADH dehydrogenase subunit 5 (MTND5) mRNA, RNA 5, complete cds; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bqw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone 35w unknown mRNA; mitochondrial. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF079515 // GenBank // Homo sapiens IDL RNA, complete sequence; mitochondrial. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004coz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IDL RNA, complete sequence; mitochondrial. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ582201 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-32313, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004coq.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004coq.3 cpcScore=-1.1298900 cnci=-0.1002466 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004coq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA: FLJ22857 fis, clone KAT01615. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bqs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-34804, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bqt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31490, complete sequence. // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC000845 // NONCODE // accn=BC000845 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000085899 cpcScore=-1.4551000 cnci=-0.5371498 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cos.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cos.3 cpcScore=3.3302700 cnci=-0.3485624 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Y17174 // NONCODE // accn=Y17174 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325986 cpcScore=-1.3452000 cnci=-1.0000000 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB019563 // NONCODE // accn=AB019563 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058607 cpcScore=0.9076480 cnci=-0.2235797 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC013932 // NONCODE // accn=BC013932 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000088234 cpcScore=4.6480800 cnci=-0.4437541 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mfi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mfi.1 cpcScore=4.6126500 cnci=-0.3104665 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Y17171 // NONCODE // accn=Y17171 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325983_01 cpcScore=0.9571060 cnci=-0.5719786 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Y17179 // NONCODE // accn=Y17179 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325991_01 cpcScore=0.8074600 cnci=-0.6128884 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004cov.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cov.3 cpcScore=5.0496900 cnci=-0.4375385 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Y17176 // NONCODE // accn=Y17176 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325988 cpcScore=0.2895810 cnci=-0.2276079 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004cox.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cox.3 cpcScore=8.7780600 cnci=-0.2852693 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M28016 // NONCODE // accn=M28016 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000195205 cpcScore=-0.3637180 cnci=-0.5183138 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004coz.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004coz.1 cpcScore=-1.4258400 cnci=-0.3036949 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017047 // NONCODE // accn=BC017047 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000333832 cpcScore=-1.1457200 cnci=-0.3334616 // chrM // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027231 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027232 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:320990:321851:1 gene:ENSG00000226179 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055574 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:320990:321851:1 Gene:OTTHUMG00000021049 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mgz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000451 // RefSeq // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_006883 // RefSeq // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:624344:659411:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:630807:659411:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:624344:646823:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:630807:645568:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000558872 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:591542:612318:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000560001 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:591542:612316:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055586 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:630807:659411:1 Gene:OTTHUMG00000021053 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cph.1 // UCSC Genes // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576039 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44151, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cpj.1 cpcScore=-1.2952700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44151, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055588 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:990221:994365:1 Gene:OTTHUMG00000021054 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:990221:994365:1 gene:ENSG00000237531 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002183 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity) (IL3RA), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1336616:1382685:1 gene:ENSG00000185291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1336616:1382689:1 gene:ENSG00000185291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035407 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity), mRNA (cDNA clone MGC:34174 IMAGE:5167281), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FJ550347 // GenBank // Homo sapiens IL-3 receptor alpha SP2 isoform precursor, mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055600 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1336616:1382685:1 Gene:OTTHUMG00000021059 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055601 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1336796:1356331:1 Gene:OTTHUMG00000021059 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cps.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity) (IL3RA), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhd.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033380 // RefSeq // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033381 // RefSeq // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2616619:2638694:1 gene:ENSG00000223773 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055621 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2609394:2638329:1 Gene:OTTHUMG00000021071 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055622 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2616619:2638694:1 Gene:OTTHUMG00000021071 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105117 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2609392:2657229:1 Gene:OTTHUMG00000021071 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337678 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2609348:2616171:1 Gene:OTTHUMG00000021071 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cqi.1 cpcScore=1.3194900 cnci=-0.2547927 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004cqj.1 cpcScore=1.2246200 cnci=-0.2540266 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516039 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:2729941:2730021:1 gene:ENSG00000251848 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2904904:2906081:1 gene:ENSG00000229851 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2904904:2906081:1 Gene:OTTHUMG00000021076 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001011719 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase family, member H (ARSH), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:3006613:3033571:1 gene:ENSG00000205667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356489 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3006613:3033571:1 Gene:OTTHUMG00000159612 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens arylsulfatase family, member H (ARSH), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001201538 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001201539 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004042 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:3066833:3112706:1 gene:ENSG00000062096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:3041471:3112726:1 gene:ENSG00000062096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537104 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:2976652:3030747:1 gene:ENSG00000062096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022389 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase F, mRNA (cDNA clone MGC:24090 IMAGE:4609825), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055652 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3041471:3112726:1 Gene:OTTHUMG00000021081 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055653 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3066833:3112706:1 Gene:OTTHUMG00000021081 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cre.2 // UCSC Genes // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022brz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens arylsulfatase F (ARSF), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038428 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 28 (CXorf28), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420429 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:3189861:3195134:1 gene:ENSG00000228459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:3271820:3284653:1 gene:ENSG00000228459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055654 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3271820:3284653:1 Gene:OTTHUMG00000021082 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 28 (CXorf28), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384704 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:3572857:3572961:1 gene:ENSG00000207435 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:3659487:3668192:1 gene:ENSG00000236188 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055658 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3659487:3668192:1 Gene:OTTHUMG00000021086 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364790 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:5410122:5410251:1 gene:ENSG00000201660 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000351 // RefSeq // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S (STS), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM072428 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for steroid sulfatase (STS gene), transcript 1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM072429 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for steroid sulfatase (STS gene), transcript 2. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075030 // GenBank // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S, mRNA (cDNA clone MGC:104007 IMAGE:30915417), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000217961 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2479:362657:451587:+ gene:ENSG00000101846 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FM209047 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for steroid sulfatase isozyme S (STS gene), from mammary gland. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:7219456:7354810:1 Gene:OTTHUMG00000021102 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S (STS), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S (STS), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cry.4 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S (STS), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid sulfatase (microsomal), isozyme S (STS), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013452 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, X-linked (VCX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:7843088:7844016:1 gene:ENSG00000182583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:7842262:7844143:1 gene:ENSG00000182583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126902 // GenBank // Homo sapiens variable charge, X-linked 3A, mRNA (cDNA clone MGC:125796 IMAGE:40030357), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126903 // GenBank // Homo sapiens variable charge, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:125797 IMAGE:40030361), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000071474 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:7842262:7844143:1 Gene:OTTHUMG00000028608 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens variable charge, X-linked (VCX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030380 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 651 (MIR651), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384896 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:8126960:8127068:1 gene:ENSG00000207628 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 651 (MIR651), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:9133828:9133946:1 gene:ENSG00000200852 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365599 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:10061222:10061323:1 gene:ENSG00000202469 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001830 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel, voltage-sensitive 4 (CLCN4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380829 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:10158448:10233697:1 gene:ENSG00000073464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:10156984:10237660:1 gene:ENSG00000073464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:10156945:10237660:1 gene:ENSG00000073464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299611 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50190 complete cds, highly similar to Chloride channel protein 4. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036068 // GenBank // Homo sapiens chloride channel 4, mRNA (cDNA clone MGC:33700 IMAGE:5311366), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130278 // GenBank // Homo sapiens chloride channel 4, mRNA (cDNA clone MGC:163150 IMAGE:40146309), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055730 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:10156984:10237660:1 Gene:OTTHUMG00000021125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:10158532:10206719:1 Gene:OTTHUMG00000021125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:10158448:10233697:1 Gene:OTTHUMG00000021125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csy.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride channel, voltage-sensitive 4 (CLCN4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mid.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384473 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:10582817:10582919:1 gene:ENSG00000207202 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsv.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00026 hit found at contig region AC117406.2/50205-50103 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014728 // RefSeq // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 4 (FRMPD4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304087 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:12516791:12742633:1 gene:ENSG00000169933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:12138466:12724523:1 gene:ENSG00000169933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113700 // GenBank // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:142260 IMAGE:8322752), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143746 // GenBank // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:177277 IMAGE:9052260), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055771 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12138466:12724523:1 Gene:OTTHUMG00000021138 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cuz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 4 (FRMPD4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mij.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 4 (FRMPD4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429478 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1043:472354:679469:- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384068 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:12149126:12149238:1 gene:ENSG00000206795 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016562 // RefSeq // Homo sapiens toll-like receptor 7 (TLR7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:12867083:12890380:1 gene:ENSG00000196664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:12867479:12877639:1 gene:ENSG00000196664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033651 // GenBank // Homo sapiens toll-like receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:45096 IMAGE:5582912), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055769 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12867083:12890380:1 Gene:OTTHUMG00000021137 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055770 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12867479:12877639:1 Gene:OTTHUMG00000021137 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cvc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens toll-like receptor 7 (TLR7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_138636 // RefSeq // Homo sapiens toll-like receptor 8 (TLR8), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:12906620:12923169:1 gene:ENSG00000101916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF246971 // GenBank // Homo sapiens Toll-like receptor 8 (TLR8) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101074 // GenBank // Homo sapiens toll-like receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:119598 IMAGE:40008787), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311912 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1043:323205:326312:- gene:ENSG00000101916 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055783 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12906639:12922202:1 Gene:OTTHUMG00000021145 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12906620:12923169:1 Gene:OTTHUMG00000021145 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cvd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens toll-like receptor 8 (TLR8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cve.3 // UCSC Genes // Homo sapiens toll-like receptor 8 (TLR8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_046087 // RefSeq // Homo sapiens unknown transcript (GS1-600G8.3), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:13310652:13319933:1 gene:ENSG00000231216 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13310652:13319933:1 Gene:OTTHUMG00000021147 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045260 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1203 (LINC01203), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:13335241:13341825:1 gene:ENSG00000226985 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:13336381:13373634:1 gene:ENSG00000226985 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055790 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13335241:13341825:1 Gene:OTTHUMG00000021151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055791 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13336381:13373634:1 Gene:OTTHUMG00000021151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133123 (LOC100133123), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195328 // RefSeq // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family (RAB9A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004251 // RefSeq // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family (RAB9A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:13689186:13709354:1 gene:ENSG00000123595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:13689125:13710506:1 gene:ENSG00000123595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017265 // GenBank // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:29629 IMAGE:4139714), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055802 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13689125:13710506:1 Gene:OTTHUMG00000021156 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055803 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13689186:13709354:1 Gene:OTTHUMG00000021156 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cvm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family (RAB9A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010neh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family (RAB9A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9A, member RAS oncogene family (RAB9A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000434674 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:X:13785519:13785984:1 gene:ENSG00000225374 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055807 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:X:13785519:13785984:1 Gene:OTTHUMG00000021158 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000305934 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:14262325:14263544:1 gene:ENSG00000233247 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC021816 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VB pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3460742). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxd.3 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363750 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:15716208:15716346:1 gene:ENSG00000200620 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005089 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2 (ZRSR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:15790472:15823260:1 gene:ENSG00000169249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:15790472:15801790:1 gene:ENSG00000169249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:15790512:15803796:1 gene:ENSG00000169249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050451 // GenBank // Homo sapiens zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:54232 IMAGE:6499970), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113454 // GenBank // Homo sapiens zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:142014 IMAGE:8322506), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055889 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15790472:15823260:1 Gene:OTTHUMG00000021184 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055890 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15790472:15801790:1 Gene:OTTHUMG00000021184 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055891 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15790512:15803796:1 Gene:OTTHUMG00000021184 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2 (ZRSR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005314 // RefSeq // Homo sapiens gastrin-releasing peptide receptor (GRPR), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:16123556:16153021:1 gene:ENSG00000126010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535371 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:16142045:16170808:1 gene:ENSG00000126010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074733 // GenBank // Homo sapiens gastrin-releasing peptide receptor, mRNA (cDNA clone MGC:103806 IMAGE:30915187), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055901 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16123556:16153021:1 Gene:OTTHUMG00000021189 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gastrin-releasing peptide receptor (GRPR), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000329538 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:16188506:16189498:1 gene:ENSG00000182798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:16167713:16171464:1 gene:ENSG00000182798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:16167481:16171464:1 gene:ENSG00000182798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055900 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16167713:16171464:1 Gene:OTTHUMG00000021188 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251018 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16167481:16171464:1 Gene:OTTHUMG00000021188 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516839 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:16298390:16298474:1 gene:ENSG00000252648 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459470 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:16375636:16375732:1 gene:ENSG00000238623 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410358 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:149312233:149312315:1 gene:ENSG00000264702 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004057 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein G (S100G), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:16650158:16654670:1 gene:ENSG00000169906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112174 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein G, mRNA (cDNA clone MGC:138379 IMAGE:8327642), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055910 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16650158:16654670:1 Gene:OTTHUMG00000021194 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens S100 calcium binding protein G (S100G), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032796 // RefSeq // Homo sapiens synapse associated protein 1 (SYAP1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033181 // RefSeq // Homo sapiens synapse associated protein 1 (SYAP1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:16719632:16765336:1 gene:ENSG00000169895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:16719771:16736521:1 gene:ENSG00000169895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014657 // GenBank // Homo sapiens synapse associated protein 1, SAP47 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20415 IMAGE:4640905), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055904 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16719632:16765336:1 Gene:OTTHUMG00000021192 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055905 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16719771:16736521:1 Gene:OTTHUMG00000021192 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapse associated protein 1 (SYAP1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011miv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens synapse associated protein 1 (SYAP1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:16767844:16767905:1 gene:ENSG00000238709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001168683 // RefSeq // Homo sapiens taxilin gamma (TXLNG), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018360 // RefSeq // Homo sapiens taxilin gamma (TXLNG), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:16786427:16844519:1 gene:ENSG00000086712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:16786432:16844517:1 gene:ENSG00000086712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:16839837:16844519:1 gene:ENSG00000086712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101572 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 15, mRNA (cDNA clone MGC:126621 IMAGE:8069078), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055912 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16786427:16844519:1 Gene:OTTHUMG00000021196 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055913 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:16839837:16844519:1 Gene:OTTHUMG00000021196 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens taxilin gamma (TXLNG), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ney.2 // UCSC Genes // Homo sapiens taxilin gamma (TXLNG), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33481 fis, clone BRAMY2002853. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458802 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:17357930:17358033:1 gene:ENSG00000238764 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000433228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:17528435:17587160:1 gene:ENSG00000235834 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055930 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:17528435:17587160:1 Gene:OTTHUMG00000021202 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001037343 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5), transcript variant II, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003159 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5), transcript variant I, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:18425583:18653629:1 gene:ENSG00000008086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:18603947:18619957:1 gene:ENSG00000008086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379989 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2109:671150:789681:+ gene:ENSG00000008086 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HQ171445 // GenBank // Homo sapiens cyclin dependent kinase 5 transcript variant (CDKL5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055945 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18442188:18653625:1 Gene:OTTHUMG00000021214 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055946 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18425583:18653629:1 Gene:OTTHUMG00000021214 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055947 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18603947:18619957:1 Gene:OTTHUMG00000021214 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cym.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5), transcript variant I, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cyn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5), transcript variant II, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5), transcript variant II, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029379 // RefSeq // Homo sapiens PHKA2 antisense RNA 1 (PHKA2-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:18892744:18894497:1 gene:ENSG00000237836 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:18890296:18894335:1 gene:ENSG00000237836 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055957 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18892744:18894497:1 Gene:OTTHUMG00000021220 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055958 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18890296:18894335:1 Gene:OTTHUMG00000021220 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cyt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PHKA2 antisense RNA 1 (PHKA2-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365274 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:19376774:19376875:1 gene:ENSG00000202144 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383989 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:21214637:21214743:1 gene:ENSG00000206716 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015884 // RefSeq // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 2 (MBTPS2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000365779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:21839654:21873084:1 gene:ENSG00000012174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:21839636:21857593:1 gene:ENSG00000012174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307143 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97091. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379484 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1124:595115:638525:- gene:ENSG00000012174 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056026 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21839636:21885424:1 Gene:OTTHUMG00000021237 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056027 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21839654:21873084:1 Gene:OTTHUMG00000021237 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056028 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21839636:21857593:1 Gene:OTTHUMG00000021237 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dae.3 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 2 (MBTPS2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nfr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 2 (MBTPS2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383912 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:21872707:21872808:1 gene:ENSG00000206639 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dab.2 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 2 (MBTPS2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_206923 // RefSeq // Homo sapiens YY2 transcription factor (YY2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:21855987:21858727:1 gene:ENSG00000230797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137215 // GenBank // Homo sapiens YY2 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:168835 IMAGE:9021212), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056025 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21855987:21858727:1 Gene:OTTHUMG00000021236 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mjp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens YY2 transcription factor (YY2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000449605 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:21911718:21920026:1 gene:ENSG00000231771 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056029 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056029 cpcScore=0.3319580 cnci=-0.3342359 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152577 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 645 (ZNF645), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:22272943:22274457:1 gene:ENSG00000175809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074910 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 645, mRNA (cDNA clone MGC:103875 IMAGE:30915257), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126190 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 645, mRNA (cDNA clone MGC:161468 IMAGE:8991906), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056037 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:22272943:22274457:1 Gene:OTTHUMG00000021242 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dai.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 645 (ZNF645), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364225 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:22527835:22527941:1 gene:ENSG00000201095 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182699 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 53 (DDX53), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051703 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 53, mRNA (cDNA clone MGC:39552 IMAGE:5297066), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067878 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 53, mRNA (cDNA clone MGC:87571 IMAGE:5295819), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000327968 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold90:568895:571840:- gene:ENSG00000184735 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056043 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:22999961:23003589:1 Gene:OTTHUMG00000021248 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004daj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 53 (DDX53), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173495 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062344 // GenBank // Homo sapiens patched domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6579014), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121061 // GenBank // Homo sapiens patched domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:149798 IMAGE:40118449), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379361 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold90:127480:179415:- gene:ENSG00000165186 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056046 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:23335069:23393108:1 Gene:OTTHUMG00000021251 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056047 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:23334016:23404372:1 Gene:OTTHUMG00000021251 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dal.4 // UCSC Genes // Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nfu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365402 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:23782210:23782310:1 gene:ENSG00000202272 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btx.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00019 hit found at contig region AC131011.5/101718-101618 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001169574 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 58 (CXorf58), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152761 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 58 (CXorf58), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:23907801:23939507:1 gene:ENSG00000165182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117344 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ25444, mRNA (cDNA clone MGC:150953 IMAGE:40125895), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144007 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 58, mRNA (cDNA clone MGC:177543 IMAGE:9052526), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056071 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:23907801:23939507:1 Gene:OTTHUMG00000021258 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056072 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:23910383:23916501:1 Gene:OTTHUMG00000021258 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004daz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 58 (CXorf58), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mju.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 58 (CXorf58), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001415 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 3 gamma, 52kDa (EIF2S3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457332 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:24073262:24077408:1 gene:ENSG00000130741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:24071713:24073528:1 gene:ENSG00000130741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019906 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 3 gamma, 52kDa, mRNA (cDNA clone MGC:29889 IMAGE:4419438), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000253039 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold28:483365:498103:+ gene:ENSG00000130741 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056077 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:24091379:24095525:1 Gene:OTTHUMG00000021260 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056079 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24054716:24077971:1 Gene:OTTHUMG00000021262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24054971:24060479:1 Gene:OTTHUMG00000021262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24071713:24073528:1 Gene:OTTHUMG00000021262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056082 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24054946:24062626:1 Gene:OTTHUMG00000021262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 3 gamma, 52kDa (EIF2S3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364537 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:24133186:24133317:1 gene:ENSG00000201407 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136234 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of Ty 20 homolog (S. cerevisiae)-like 1 (SUPT20HL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mjx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens suppressor of Ty 20 homolog (S. cerevisiae)-like 1 (SUPT20HL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016937 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed), alpha 1, catalytic subunit (POLA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:24693947:24996986:1 gene:ENSG00000101868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:24726933:24734353:1 gene:ENSG00000101868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX648513 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K1672 (from clone DKFZp686K1672). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379068 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold756:214710:501554:+ gene:ENSG00000101868 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056111 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24693947:24996986:1 Gene:OTTHUMG00000021277 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056112 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24693919:24996986:1 Gene:OTTHUMG00000021277 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056113 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24745503:24810781:1 Gene:OTTHUMG00000021277 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056114 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24726933:24734353:1 Gene:OTTHUMG00000021277 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056115 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:24812830:24841983:1 Gene:OTTHUMG00000021277 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens polymerase (DNA directed), alpha 1, catalytic subunit (POLA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens polymerase (DNA directed), alpha 1, catalytic subunit (POLA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003007 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 23 (SCARNA23), guide RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516060 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:24744441:24744570:1 gene:ENSG00000251869 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 23 (SCARNA23), guide RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173699 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family B, 18 (MAGEB18), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000325250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:26138343:26140735:1 gene:ENSG00000176774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029525 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 18, mRNA (cDNA clone MGC:33889 IMAGE:5297993), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056120 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:26138343:26140735:1 Gene:OTTHUMG00000021282 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 18 (MAGEB18), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bub.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 18 (MAGEB18), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173523 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family B, 6 (MAGEB6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:26192440:26195646:1 gene:ENSG00000176746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067286 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 6, mRNA (cDNA clone MGC:75411 IMAGE:30386334), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074920 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 6, mRNA (cDNA clone MGC:103949 IMAGE:30915342), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056123 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:26192440:26195646:1 Gene:OTTHUMG00000021285 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 6 (MAGEB6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022buc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 6 (MAGEB6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000379029 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:26235419:26236246:1 gene:ENSG00000188408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:26216169:26218270:1 Gene:OTTHUMG00000021288 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001559 // RefSeq // Homo sapiens VENT homeobox pseudogene 1 (VENTXP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens VENT homeobox pseudogene 1 (VENTXP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000374117 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:26766146:26766469:1 gene:ENSG00000236683 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516682 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:26790142:26790286:1 gene:ENSG00000252491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000431122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:27590400:27746983:1 gene:ENSG00000189186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056143 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:27590383:27748791:1 Gene:OTTHUMG00000021305 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136533 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 8-like 2 (DCAF8L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157859 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 42C, mRNA (cDNA clone MGC:189754 IMAGE:9057078), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mjy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 8-like 2 (DCAF8L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182506 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family B, 10 (MAGEB10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:27807990:27823014:1 gene:ENSG00000177689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101307 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 10, mRNA (cDNA clone MGC:120393 IMAGE:40024749), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101308 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 10, mRNA (cDNA clone MGC:120394 IMAGE:40024751), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106216 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:27807990:27823014:1 Gene:OTTHUMG00000046084 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 10 (MAGEB10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bud.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 10 (MAGEB10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014271 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 (IL1RAPL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:29917463:29955820:1 gene:ENSG00000169306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126345 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:161623 IMAGE:8992061), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126347 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:161625 IMAGE:8992063), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378993 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2362:246240:933233:- gene:ENSG00000169306 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056155 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:28587399:29956723:1 Gene:OTTHUMG00000021317 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dby.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 (IL1RAPL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364796 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:28924069:28924138:1 gene:ENSG00000201666 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056153 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:28942050:28942568:1 Gene:OTTHUMG00000021315 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:28942050:28942568:1 gene:ENSG00000237994 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002364 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family B, 2 (MAGEB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:30215560:30220089:1 gene:ENSG00000099399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026071 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 2, mRNA (cDNA clone MGC:26438 IMAGE:4831169), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056157 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30215560:30220089:1 Gene:OTTHUMG00000021319 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 2 (MAGEB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022buf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 2 (MAGEB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002365 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3 (MAGEB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378986 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:30248553:30255607:1 gene:ENSG00000198798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069784 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:97346 IMAGE:7262601), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074756 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:103833 IMAGE:30915215), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126320 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:161598 IMAGE:8992036), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361644 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3326:20490:21455:+ gene:ENSG00000198798 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056158 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30230436:30237492:1 Gene:OTTHUMG00000021320 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dca.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3 (MAGEB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bug.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family B, 3 (MAGEB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401364 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:150489532:150489618:-1 gene:ENSG00000263713 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000441146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:30671635:30672166:1 gene:ENSG00000229331 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056163 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30671635:30672166:1 Gene:OTTHUMG00000021324 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000355355 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30698207:30721932:1 Gene:OTTHUMG00000159435 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:30698207:30721932:1 gene:ENSG00000241886 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000481143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:31097677:31169556:-1 gene:ENSG00000198947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:31097677:31169556:-1 Gene:OTTHUMG00000021336 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000489449 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:31279225:31341747:1 gene:ENSG00000242286 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:31261108:31323630:-1 Gene:OTTHUMG00000021336 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517094 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:31348192:31348296:1 gene:ENSG00000252903 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bum.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00026 hit found at contig region AC079177.21/2694-2799 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410990 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:32102065:32102176:1 gene:ENSG00000222922 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408477 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:126732436:126732520:-1 gene:ENSG00000263686 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152631 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member B (FAM47B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:34942796:34944915:1 gene:ENSG00000189132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035026 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member B, mRNA (cDNA clone MGC:33660 IMAGE:4828379), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056211 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:34942796:34944915:1 Gene:OTTHUMG00000021345 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member B (FAM47B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:35594173:35594273:1 gene:ENSG00000252411 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152632 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 22 (CXorf22), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000297866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:35919734:35990147:1 gene:ENSG00000165164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027936 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 22, mRNA (cDNA clone MGC:34831 IMAGE:5202137), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056216 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:35919734:35990147:1 Gene:OTTHUMG00000021350 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000286478 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:35919781:35990152:1 Gene:OTTHUMG00000021350 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 22 (CXorf22), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ngv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 22 (CXorf22), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173695 // RefSeq // Homo sapiens calponin homology domain containing 2 (CHDC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000313548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:36065661:36144809:1 gene:ENSG00000176034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:36035791:36145070:1 gene:ENSG00000176034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101698 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:126747 IMAGE:8069204), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101700 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:126749 IMAGE:8069206), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056217 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:36035791:36145070:1 Gene:OTTHUMG00000021351 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056218 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:36053913:36083843:1 Gene:OTTHUMG00000021351 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens calponin homology domain containing 2 (CHDC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397458 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold334:42027:84645:+ // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408802 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:36577396:36577491:1 gene:ENSG00000221729 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013736 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member C (FAM47C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:37008397:37011666:1 gene:ENSG00000198173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060508 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37008397:37011666:1 Gene:OTTHUMG00000024025 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member C (FAM47C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001170331 // RefSeq // Homo sapiens LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial) (LANCL3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_198511 // RefSeq // Homo sapiens LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial) (LANCL3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:37571652:37677394:1 gene:ENSG00000147036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:37571569:37684463:1 gene:ENSG00000147036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093667 // GenBank // Homo sapiens LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:120702 IMAGE:7939512), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080884 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37571569:37684463:1 Gene:OTTHUMG00000033177 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080885 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37571652:37677394:1 Gene:OTTHUMG00000033177 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial) (LANCL3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mkd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial) (LANCL3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021083 // RefSeq // Homo sapiens X-linked Kx blood group (XK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:37685759:37732130:1 gene:ENSG00000047597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036019 // GenBank // Homo sapiens X-linked Kx blood group (McLeod syndrome), mRNA (cDNA clone MGC:32986 IMAGE:5272840), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080875 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37685759:37732130:1 Gene:OTTHUMG00000033171 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens X-linked Kx blood group (McLeod syndrome) (XK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384256 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:37870109:37870215:1 gene:ENSG00000206983 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012274 // RefSeq // Homo sapiens huntingtin interacting protein M (HYPM), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:37990817:37991317:1 gene:ENSG00000187516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104428 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 27, mRNA (cDNA clone MGC:129784 IMAGE:40021552), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080888 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37990817:37991317:1 Gene:OTTHUMG00000033180 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddt.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 27 (CXorf27), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001163334 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001163335 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_138780 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000297875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:38006582:38128816:1 gene:ENSG00000147041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357972 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:37865835:37988072:1 gene:ENSG00000147041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:38033534:38128819:1 gene:ENSG00000147041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131585 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:149278 IMAGE:40113205), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080883 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:38006582:38128816:1 Gene:OTTHUMG00000033176 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin-like 5 (SYTL5), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000531 // RefSeq // Homo sapiens ornithine carbamoyltransferase (OTC), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000039007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:38352545:38421450:1 gene:ENSG00000036473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:38352605:38403667:1 gene:ENSG00000036473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074745 // GenBank // Homo sapiens ornithine carbamoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:103823 IMAGE:30915205), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107153 // GenBank // Homo sapiens ornithine carbamoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:129967 IMAGE:40032502), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114496 // GenBank // Homo sapiens ornithine carbamoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:138856 IMAGE:40083569), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059006 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:38352545:38421450:1 Gene:OTTHUMG00000022727 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081203 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:38352605:38403667:1 Gene:OTTHUMG00000022727 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081204 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:38260616:38271142:1 Gene:OTTHUMG00000022727 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004def.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ornithine carbamoyltransferase (OTC), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:38608215:38608276:1 gene:ENSG00000238606 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459471 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:40144349:40144452:1 gene:ENSG00000238920 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ596633 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-34699, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004der.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004der.1 cpcScore=-1.2498500 cnci=-0.0519254 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004der.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-55066, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ594696 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-60808, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004des.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004des.1 cpcScore=-1.3833500 cnci=-0.3167280 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004des.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40355, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574810 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42922, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bux.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42920, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579129 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47241, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022buy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31728, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383950 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:40492844:40492941:1 gene:ENSG00000206677 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195522 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial pyruvate carrier 1-like (MPC1L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022buz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial pyruvate carrier 1-like (MPC1L), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000456333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:40735400:40738701:1 gene:ENSG00000234636 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039399 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5300185. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:40735400:40738701:1 Gene:OTTHUMG00000024106 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dez.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5300185. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459189 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:41316488:41316589:1 gene:ENSG00000238426 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022567 // RefSeq // Homo sapiens nyctalopin (NYX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:41447434:41475710:1 gene:ENSG00000188937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:41447460:41475652:1 gene:ENSG00000188937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:41472181:41473709:1 gene:ENSG00000188937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF254868 // GenBank // Homo sapiens nyctalopin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112242 // GenBank // Homo sapiens nyctalopin, mRNA (cDNA clone MGC:138447 IMAGE:8327710), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056256 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:41447434:41475710:1 Gene:OTTHUMG00000021370 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056257 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:41447460:41475652:1 Gene:OTTHUMG00000021370 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056258 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:41472181:41473709:1 Gene:OTTHUMG00000021370 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens nyctalopin (NYX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mku.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nyctalopin (NYX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080817 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 82 (GPR82), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:41728133:41728771:1 gene:ENSG00000171657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK122626 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16047 fis, clone D3OST2002648, highly similar to Probable G-protein coupled receptor 82. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070180 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 82, mRNA (cDNA clone MGC:88161 IMAGE:30351329), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302548 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold573:820709:821707:- gene:ENSG00000171657 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056261 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:41724155:41730135:1 Gene:OTTHUMG00000021373 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056262 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:41728133:41728771:1 Gene:OTTHUMG00000021373 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dft.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 82 (GPR82), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 82 (GPR82), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 82 (GPR82), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ570500 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-30612, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dfx.2 cpcScore=-1.2502100 cnci=-0.1707099 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30612, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000240 // RefSeq // Homo sapiens monoamine oxidase A (MAOA), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:43656219:43746821:1 gene:ENSG00000189221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:43656302:43731382:1 gene:ENSG00000189221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:43654907:43746824:1 gene:ENSG00000189221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK293926 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61220 complete cds, highly similar to Amine oxidase (flavin-containing) A (EC 1.4.3.4). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008064 // GenBank // Homo sapiens monoamine oxidase A, mRNA (cDNA clone MGC:2288 IMAGE:2990003), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC044787 // GenBank // Homo sapiens monoamine oxidase A, mRNA (cDNA clone MGC:42558 IMAGE:4824582), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056300 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:43656219:43746821:1 Gene:OTTHUMG00000021387 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056301 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:43656302:43731382:1 Gene:OTTHUMG00000021387 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056302 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:43743704:43744658:1 Gene:OTTHUMG00000021387 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfy.3 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mkw.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363832 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:44401603:44401704:1 gene:ENSG00000200702 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvh.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00019 hit found at contig region AC018719.4/106713-106814 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000393839 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:44508639:44508965:1 gene:ENSG00000229168 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022076 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 21 (DUSP21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:44844004:44844888:1 gene:ENSG00000189037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537377 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:44703250:44704130:1 gene:ENSG00000189037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119755 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 21, mRNA (cDNA clone MGC:149877 IMAGE:40119299), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056323 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44844004:44844888:1 Gene:OTTHUMG00000021401 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dual specificity phosphatase 21 (DUSP21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516304 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:67858818:67858871:-1 gene:ENSG00000252113 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362356 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:46517766:46517868:1 gene:ENSG00000199226 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019886 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 7 (CHST7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:46573784:46598408:1 gene:ENSG00000147119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045537 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:57153 IMAGE:5261787), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056362 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46573784:46598408:1 Gene:OTTHUMG00000021423 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 7 (CHST7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 7 (CHST7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006915 // RefSeq // Homo sapiens retinitis pigmentosa 2 (X-linked recessive) (RP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043348 // GenBank // Homo sapiens retinitis pigmentosa 2 (X-linked recessive), mRNA (cDNA clone MGC:49904 IMAGE:5520795), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053530 // GenBank // Homo sapiens retinitis pigmentosa 2 (X-linked recessive), mRNA (cDNA clone MGC:61616 IMAGE:3871941), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218340 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1080:535949:585882:+ gene:ENSG00000102218 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056375 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46836940:46882358:1 Gene:OTTHUMG00000021430 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens retinitis pigmentosa 2 (X-linked recessive) (RP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077445 // RefSeq // Homo sapiens jade family PHD finger 3 (JADE3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_014735 // RefSeq // Homo sapiens jade family PHD finger 3 (JADE3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218343 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:46771868:46920640:1 gene:ENSG00000102221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397189 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:46771736:46920641:1 gene:ENSG00000102221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113880 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:138749 IMAGE:40081799), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114487 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:138748 IMAGE:40081796), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056376 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46912433:47061241:1 Gene:OTTHUMG00000021431 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000318538 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46912276:47027976:1 Gene:OTTHUMG00000021431 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000318539 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46912796:47024783:1 Gene:OTTHUMG00000021431 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PHD finger protein 16 (PHF16), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PHD finger protein 16 (PHF16), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:47087506:47087612:1 gene:ENSG00000206685 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364789 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:47132671:47132826:1 gene:ENSG00000201659 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024616 // RefSeq // Homo sapiens inactivation escape 1 (non-protein coding) (INE1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:47204921:47205865:1 gene:ENSG00000224975 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000107269 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:47204921:47205865:1 Gene:OTTHUMG00000046428 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dhl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens inactivation escape 1 (non-protein coding) (INE1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dhl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dhl.2 cpcScore=0.7768980 cnci=-0.2374606 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459524 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:47138526:47138629:1 gene:ENSG00000238729 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003446 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 157 (ZNF157), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:47370583:47414305:1 gene:ENSG00000147117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075003 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 157, mRNA (cDNA clone MGC:104152 IMAGE:30915612), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056415 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:47370583:47414305:1 Gene:OTTHUMG00000021443 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dhr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 157 (ZNF157), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003710 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 11C (SNORA11C), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408532 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:47388649:47388777:1 gene:ENSG00000221459 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nhr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 11C (SNORA11C), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000357412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:47483571:47484823:1 gene:ENSG00000196741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:47483571:47484823:1 Gene:OTTHUMG00000021445 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028119 // RefSeq // Homo sapiens UXT antisense RNA 1 (UXT-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027444 // NONCODE // accn=NR_027444 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027444 cpcScore=-0.7452170 cnci=-0.2779976 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mls.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133957 (LOC100133957), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mlt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133957 (LOC100133957), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033924 // RefSeq // Homo sapiens CXXC finger protein 1 pseudogene 1 (CXXC1P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:47707191:47736628:1 gene:ENSG00000187893 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dio.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CXXC finger protein 1 pseudogene 1 (CXXC1P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079900 // RefSeq // Homo sapiens sperm acrosome associated 5B (SPACA5B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_205856 // RefSeq // Homo sapiens sperm acrosome associated 5 (SPACA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48007796:48009729:1 gene:ENSG00000171489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304355 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3810:119256:121403:+ gene:ENSG00000171489 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056452 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48007796:48009729:1 Gene:OTTHUMG00000021459 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004diu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sperm acrosome associated 5 (SPACA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000436124 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:47915699:47925971:1 gene:ENSG00000238068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056454 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48056310:48066583:1 Gene:OTTHUMG00000021461 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459223 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:47941136:47941239:1 gene:ENSG00000238473 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028366 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 6 (pseudogene) (SSX6), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319275 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:47967367:47980068:1 gene:ENSG00000171483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48109981:48119630:1 gene:ENSG00000171483 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48109981:48119630:1 Gene:OTTHUMG00000021464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362116 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48107992:48114311:1 Gene:OTTHUMG00000021464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362117 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48117084:48120210:1 Gene:OTTHUMG00000021464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mlv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 6 (pseudogene) (SSX6), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 6 (pseudogene) (SSX6), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079900 // RefSeq // Homo sapiens sperm acrosome associated 5B (SPACA5B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_205856 // RefSeq // Homo sapiens sperm acrosome associated 5 (SPACA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48130657:48132613:1 gene:ENSG00000171478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056459 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48130657:48132613:1 Gene:OTTHUMG00000021465 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004diy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sperm acrosome associated 5 (SPACA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517047 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:48206258:48206374:1 gene:ENSG00000252856 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005635 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1 (SSX1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48255317:48267444:1 gene:ENSG00000126752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001003 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1, mRNA (cDNA clone MGC:5162 IMAGE:3445470), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125151 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1, mRNA (cDNA clone MGC:150425 IMAGE:40120554), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128611 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1, mRNA (cDNA clone MGC:131927 IMAGE:6159943), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150487 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1, mRNA (cDNA clone MGC:171191 IMAGE:40120555), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056485 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48255317:48267444:1 Gene:OTTHUMG00000021488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004djb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 1 (SSX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001034832 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B (SSX4B), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001040612 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B (SSX4B), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005636 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4 (SSX4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_175729 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4 (SSX4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375517 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48242939:48252290:1 gene:ENSG00000204645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376886 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48242863:48252785:1 gene:ENSG00000204645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005325 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4, mRNA (cDNA clone MGC:12411 IMAGE:3961688), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137394 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B, mRNA (cDNA clone MGC:169015 IMAGE:9021392), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058902 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:48242863:48252785:1 Gene:OTTHUMG00000022698 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356794 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:48242939:48252290:1 Gene:OTTHUMG00000022698 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004djf.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004djg.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080489 // RefSeq // Homo sapiens glyoxalase domain containing 5 (GLOD5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000303227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:48761750:48773646:1 gene:ENSG00000171433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48762298:48773648:1 gene:ENSG00000171433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067236 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4611282, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060770 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48761751:48766237:1 Gene:OTTHUMG00000024125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060771 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48765872:48773646:1 Gene:OTTHUMG00000024125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060772 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48762298:48773648:1 Gene:OTTHUMG00000024125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dko.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glyoxalase domain containing 5 (GLOD5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mmh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens glyoxalase domain containing 5 (GLOD5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002049 // RefSeq // Homo sapiens GATA binding protein 1 (globin transcription factor 1) (GATA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:48786573:48794311:1 gene:ENSG00000102145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48786554:48794308:1 gene:ENSG00000102145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009797 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 1 (globin transcription factor 1), mRNA (cDNA clone MGC:13628 IMAGE:4048082), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056517 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48786554:48794308:1 Gene:OTTHUMG00000021504 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056518 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48786573:48794311:1 Gene:OTTHUMG00000021504 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056519 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:48650838:48652718:1 Gene:OTTHUMG00000021504 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dkq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens GATA binding protein 1 (globin transcription factor 1) (GATA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:49082028:49082165:1 gene:ENSG00000206936 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002668 // RefSeq // Homo sapiens proteolipid protein 2 (colonic epithelium-enriched) (PLP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49171926:49173683:1 gene:ENSG00000102007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49171926:49175239:1 gene:ENSG00000102007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109066 // GenBank // Homo sapiens proteolipid protein 2 (colonic epithelium-enriched), mRNA (cDNA clone MGC:126187 IMAGE:40033888), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056540 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49171926:49175239:1 Gene:OTTHUMG00000021513 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056541 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49171926:49173683:1 Gene:OTTHUMG00000021513 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dmx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proteolipid protein 2 (colonic epithelium-enriched) (PLP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098408 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12C (GAGE12C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001098418 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12E (GAGE12E), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127199 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49579983:49587301:1 gene:ENSG00000224902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130374 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:163246 IMAGE:40146405), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143619 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:177149 IMAGE:9052132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49579983:49587301:1 Gene:OTTHUMG00000024149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004doh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007003 // RefSeq // Homo sapiens P antigen family, member 4 (prostate associated) (PAGE4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49829303:49833973:1 gene:ENSG00000101951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49829260:49833973:1 gene:ENSG00000101951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49829348:49831331:1 gene:ENSG00000101951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010897 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 4 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:13371 IMAGE:4043535), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060839 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49829303:49833973:1 Gene:OTTHUMG00000024155 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060840 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49829348:49831331:1 Gene:OTTHUMG00000024155 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060841 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49830684:49833967:1 Gene:OTTHUMG00000024155 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060842 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49829260:49833973:1 Gene:OTTHUMG00000024155 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004don.1 // UCSC Genes // Homo sapiens P antigen family, member 4 (prostate associated) (PAGE4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145073 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 27, X-linked (USP27X), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dop.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 27, X-linked (USP27X), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030241 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 532 (MIR532), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385025 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50003148:50003238:1 gene:ENSG00000207758 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 532 (MIR532), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029708 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 188 (MIR188), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385034 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50003497:50003607:1 gene:ENSG00000207768 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 188 (MIR188), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030224 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 500a (MIR500A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50008431:50008514:1 gene:ENSG00000207785 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 500a (MIR500A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029850 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 362 (MIR362), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50008964:50009028:1 gene:ENSG00000208015 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 362 (MIR362), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030225 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 501 (MIR501), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50009722:50009805:1 gene:ENSG00000211538 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 501 (MIR501), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036257 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 500b (MIR500B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50010671:50010749:1 gene:ENSG00000239057 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 500b (MIR500B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030397 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 660 (MIR660), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385235 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50013236:50013345:1 gene:ENSG00000207970 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 660 (MIR660), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030226 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 502 (MIR502), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385272 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:49779206:49779291:1 gene:ENSG00000208007 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 502 (MIR502), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410371 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:50649641:50649740:1 gene:ENSG00000222303 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005448 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 15 (BMP15), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069155 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:95440 IMAGE:7217015), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117264 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:150873 IMAGE:40125815), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117266 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:150875 IMAGE:40125817), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000252677 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4850:92196:98685:- gene:ENSG00000130385 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056572 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:50910784:50916607:1 Gene:OTTHUMG00000021525 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens bone morphogenetic protein 15 (BMP15), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153183 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10 (NUDT10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:51332231:51337525:1 gene:ENSG00000122824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC049383 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10, mRNA (cDNA clone MGC:49885 IMAGE:5725355), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050700 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10, mRNA (cDNA clone MGC:60293 IMAGE:5723622), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356450 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4943:2963:3442:+ gene:ENSG00000122824 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056577 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:51332830:51337525:1 Gene:OTTHUMG00000021530 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056578 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:51332231:51337525:1 Gene:OTTHUMG00000021530 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dph.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10 (NUDT10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dpi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10 (NUDT10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000342995 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:51406915:51408843:1 gene:ENSG00000187690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046248 // GenBank // Homo sapiens similar to CG32656-PA, mRNA (cDNA clone MGC:47837 IMAGE:6046539), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033772 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 1 (CENPVP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033773 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 2 (CENPVP2), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 1 (CENPVP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018094 // RefSeq // Homo sapiens G1 to S phase transition 2 (GSPT2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502175 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:51486538:51488658:1 gene:ENSG00000189369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036077 // GenBank // Homo sapiens G1 to S phase transition 2, mRNA (cDNA clone MGC:33729 IMAGE:5313878), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340438 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1436:334621:336366:+ gene:ENSG00000189369 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056587 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:51743431:51746232:1 Gene:OTTHUMG00000021538 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dpl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G1 to S phase transition 2 (GSPT2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000375625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:52199840:52203235:1 gene:ENSG00000179028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK096379 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39060 fis, clone NT2RP7013729. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056627 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52199840:52203235:1 Gene:OTTHUMG00000021548 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dqc.2 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative uncharacterized protein FLJ39060; // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079538 // RefSeq // [retired]Homo sapiens X antigen family, member 2B (XAGE2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_130777 // RefSeq // Homo sapiens X antigen family, member 2 (XAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52369030:52375680:1 gene:ENSG00000155622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009232 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:16513 IMAGE:3960352), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066311 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:87153 IMAGE:30330532), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056628 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52369030:52375680:1 Gene:OTTHUMG00000021549 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dqe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens X antigen family, member 2 (XAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027250 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 8 (SSX8), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK302291 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56587 complete cds, highly similar to Protein SSX8. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011moa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 8 (SSX8), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mob.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 8 (SSX8), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410676 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:52665231:52665347:1 gene:ENSG00000222608 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_130775 // RefSeq // Homo sapiens X antigen family, member 5 (XAGE5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000351072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:52812204:52818298:1 gene:ENSG00000171405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:52812567:52818301:1 gene:ENSG00000171405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52812204:52818237:1 gene:ENSG00000171405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425386 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:52841228:52847322:1 gene:ENSG00000171405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:52814911:52818301:1 gene:ENSG00000171405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069129 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:95410 IMAGE:7216985), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103962 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:119798 IMAGE:40014176), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056689 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52812567:52818301:1 Gene:OTTHUMG00000021589 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52814911:52818301:1 Gene:OTTHUMG00000021589 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens X antigen family, member 5 (XAGE5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018969 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 173 (GPR173), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:53049091:53080615:1 gene:ENSG00000184194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009861 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 173, mRNA (cDNA clone MGC:16375 IMAGE:3936037), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056717 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:53049091:53080615:1 Gene:OTTHUMG00000021596 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dru.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 173 (GPR173), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 173 (GPR173), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022117 // RefSeq // Homo sapiens TSPY-like 2 (TSPYL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:53082367:53088540:1 gene:ENSG00000184205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB209182 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TSPY-like 2 variant protein. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK131220 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16115 fis, clone ADRGL2000042, highly similar to Homo sapiens TSPY-like 2 (TSPYL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024270 // GenBank // Homo sapiens TSPY-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:39136 IMAGE:2819684), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056718 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:53082367:53088540:1 Gene:OTTHUMG00000021597 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056719 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:53084699:53085943:1 Gene:OTTHUMG00000021597 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TSPY-like 2 (TSPYL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TSPY-like 2 (TSPYL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TSPY-like 2 (TSPYL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515898 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:120503037:120503096:-1 gene:ENSG00000251707 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590295 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57407, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dry.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dry.2 cpcScore=0.5544190 cnci=-0.1672634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-49736, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY927613 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dsb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384677 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:53324562:53324674:1 gene:ENSG00000207408 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362552 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:53462209:53462310:1 gene:ENSG00000199422 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FM207502 // GenBank // Homo sapiens small vault-associated RNA b (svRNAb gene). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small vault-associated RNA a (svRNAa gene). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364748 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:53909054:53909161:1 gene:ENSG00000201618 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:54343546:54343652:1 gene:ENSG00000207104 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_058163 // RefSeq // Homo sapiens TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (TSR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011825 // GenBank // Homo sapiens TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:20451 IMAGE:3830864), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375151 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1058:86669:91080:- gene:ENSG00000158526 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056802 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54440401:54445487:1 Gene:OTTHUMG00000021628 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U92980 // GenBank // Homo sapiens clone DT1P1A10 mRNA, CAG repeat region. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dte.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (TSR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (TSR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002953 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 11 (SNORA11), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408789 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:54814370:54814497:1 gene:ENSG00000221716 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 11 (SNORA11), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014481 // RefSeq // Homo sapiens APEX nuclease (apurinic/apyrimidinic endonuclease) 2 (APEX2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55000393:55006757:1 gene:ENSG00000169188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK316186 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79085 complete cds, highly similar to DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2 (EC 4.2.99.18). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002959 // GenBank // Homo sapiens APEX nuclease (apurinic/apyrimidinic endonuclease) 2, mRNA (cDNA clone MGC:1419 IMAGE:3537317), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374987 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1221:184044:191344:+ gene:ENSG00000169188 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056845 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55000357:55009057:1 Gene:OTTHUMG00000021642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056846 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55000393:55006757:1 Gene:OTTHUMG00000021642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtz.3 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mom.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bxq.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTG) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056864 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55281371:55288785:1 Gene:OTTHUMG00000021651 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:55281371:55288785:1 gene:ENSG00000232765 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363765 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:55582733:55582834:1 gene:ENSG00000200635 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000433279 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:56100757:56102014:1 gene:ENSG00000233889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013444 // RefSeq // Homo sapiens ubiquilin 2 (UBQLN2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535171 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:56590060:56592545:1 gene:ENSG00000188021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK302885 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56541 complete cds, highly similar to Ubiquilin-2. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069237 // GenBank // Homo sapiens ubiquilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:78469 IMAGE:4543266), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338222 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold331:143610:145445:- gene:ENSG00000188021 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056891 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:56563639:56567868:1 Gene:OTTHUMG00000021669 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dus.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquilin 2 (UBQLN2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011moq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquilin 2 (UBQLN2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015367 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1420 (LINC01420), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:56729259:56818380:1 gene:ENSG00000204272 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:56729259:56818380:1 Gene:OTTHUMG00000021676 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056904 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:56729356:56817626:1 Gene:OTTHUMG00000021676 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056905 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:56729373:56817376:1 Gene:OTTHUMG00000021676 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dut.4 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC550643 (LOC550643), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dut.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dut.3 cpcScore=1.1107100 cnci=-0.3230131 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011mor.1 // UCSC Genes // Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018063 3' read SPIN2B mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bxy.1 // UCSC Genes // Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018063 3' read SPIN2B mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_174912 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase 2 (FAAH2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:57286706:57489196:1 gene:ENSG00000165591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:57431963:57489193:1 gene:ENSG00000165591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC073922 // GenBank // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:90428 IMAGE:5187808), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056919 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57286706:57489196:1 Gene:OTTHUMG00000021684 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056920 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57431963:57489193:1 Gene:OTTHUMG00000021684 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056921 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57431998:57452166:1 Gene:OTTHUMG00000021684 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase 2 (FAAH2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410664 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:64435117:64435222:1 gene:ENSG00000222596 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000426165 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:64628131:64628565:1 gene:ENSG00000228158 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010888 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12B (ZC3H12B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218172 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:64708706:64727766:1 gene:ENSG00000102053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:65488735:65507887:1 gene:ENSG00000102053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140767 // GenBank // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12B, mRNA (cDNA clone MGC:176444 IMAGE:9021635), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171781 // GenBank // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12B, mRNA (cDNA clone MGC:198496 IMAGE:9054435), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423889 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold75:3528855:3578549:+ gene:ENSG00000102053 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:65488735:65507887:1 Gene:OTTHUMG00000021719 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nko.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12B (ZC3H12B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056971 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:65488826:65507887:1 Gene:OTTHUMG00000021719 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:65588381:65589769:1 gene:ENSG00000147065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067907 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30330955. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056978 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056978 cpcScore=-1.0469800 cnci=-0.2760088 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056979 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056979 cpcScore=-1.0295400 cnci=-0.3313573 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056980 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056980 cpcScore=-0.9819230 cnci=-0.3455265 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dwe.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dwe.2 cpcScore=-0.4487850 cnci=-0.1968761 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dwe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30330955. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002444 // RefSeq // Homo sapiens moesin (MSN), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:65667670:65741931:1 gene:ENSG00000147065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486030 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:64956768:64961266:1 gene:ENSG00000147065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308486 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98527. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017293 // GenBank // Homo sapiens moesin, mRNA (cDNA clone MGC:29549 IMAGE:4908580), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:65667670:65741931:1 Gene:OTTHUMG00000021723 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056982 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:64956768:64961266:1 Gene:OTTHUMG00000021723 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dwf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens moesin (MSN), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nkp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens moesin (MSN), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029637 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 223 (MIR223), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:66018870:66018979:1 gene:ENSG00000207939 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022byg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 223 (MIR223), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ680071 // GenBank // Homo sapiens mir-223 transcript variant 1 mRNA, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ680072 // GenBank // Homo sapiens mir-223 transcript variant 2 mRNA, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dwg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA mir-223. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mox.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA mir-223. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383919 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:68361075:68361187:1 gene:ENSG00000206646 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004429 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-B1 (EFNB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000204961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:68828997:68842147:1 gene:ENSG00000090776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016649 // GenBank // Homo sapiens ephrin-B1, mRNA (cDNA clone MGC:8782 IMAGE:3867060), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052979 // GenBank // Homo sapiens ephrin-B1, mRNA (cDNA clone MGC:60068 IMAGE:6164440), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057029 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:68828997:68842147:1 Gene:OTTHUMG00000021751 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ephrin-B1 (EFNB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ephrin-B1 (EFNB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000399711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:69179557:69209924:1 gene:ENSG00000215162 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057035 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:69179557:69209924:1 Gene:OTTHUMG00000021754 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxj.1 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269; // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015686 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 155, member B (FAM155B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136518 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 155, member B, mRNA (cDNA clone MGC:168131 IMAGE:9020508), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136519 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 155, member B, mRNA (cDNA clone MGC:168132 IMAGE:9020509), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000252338 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1170:1621063:1647705:+ gene:ENSG00000130054 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057037 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:69505241:69532508:1 Gene:OTTHUMG00000021756 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 155, member B (FAM155B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364816 // ENSEMBL // [retired]ncrna:rRNA chromosome:GRCh37:X:68892323:68892441:1 gene:ENSG00000201686 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391132 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:69692956:69693155:1 gene:ENSG00000212434 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037494 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 676 (MIR676), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390702 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:70022829:70022939:1 gene:ENSG00000211991 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bym.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 676 (MIR676), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207320 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 6A (OTUD6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137355 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 6A, mRNA (cDNA clone MGC:168976 IMAGE:9021353), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137356 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 6A, mRNA (cDNA clone MGC:168977 IMAGE:9021354), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338352 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1170:2174851:2175516:+ gene:ENSG00000189401 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70062491:70064179:1 Gene:OTTHUMG00000159996 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens OTU domain containing 6A (OTUD6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001551 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 (IGBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70133463:70166324:1 gene:ENSG00000089289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK315660 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96752, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 (IGBP1),mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004137 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin (CD79A) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:1556 IMAGE:2962967), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342206 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1170:2215858:2260108:+ gene:ENSG00000089289 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057052 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70133449:70166324:1 Gene:OTTHUMG00000021767 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057053 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70133463:70166324:1 Gene:OTTHUMG00000021767 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 (IGBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 (IGBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198512 // RefSeq // Homo sapiens diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (DGAT2L6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70177483:70205545:1 gene:ENSG00000184210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057067 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70177483:70205545:1 Gene:OTTHUMG00000021774 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (DGAT2L6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004312 // RefSeq // Homo sapiens arrestin 3, retinal (X-arrestin) (ARR3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70268352:70281840:1 gene:ENSG00000120500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374480 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:69488185:69501690:1 gene:ENSG00000120500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70268305:70281232:1 gene:ENSG00000120500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012096 // GenBank // Homo sapiens arrestin 3, retinal (X-arrestin), mRNA (cDNA clone MGC:20066 IMAGE:4645867), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057054 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70268305:70281232:1 Gene:OTTHUMG00000021768 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70268352:70281840:1 Gene:OTTHUMG00000021768 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057056 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70268346:70276707:1 Gene:OTTHUMG00000021768 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057057 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70268334:70270009:1 Gene:OTTHUMG00000021768 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dya.3 // UCSC Genes // Homo sapiens arrestin 3, retinal (X-arrestin) (ARR3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dyb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens arrestin 3, retinal (X-arrestin) (ARR3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001032726 // RefSeq // Homo sapiens RAB41, member RAS oncogene family (RAB41), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70282172:70285002:1 gene:ENSG00000147127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70282172:70285002:1 gene:ENSG00000147127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117239 // GenBank // Homo sapiens RAB41, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:150848 IMAGE:40125790), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057064 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70282172:70285002:1 Gene:OTTHUMG00000021772 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358983 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70282172:70285002:1 Gene:OTTHUMG00000021772 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358984 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70282093:70283287:1 Gene:OTTHUMG00000021772 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nkv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB41, member RAS oncogene family (RAB41), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:70396279:70396375:1 gene:ENSG00000201377 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012278 // RefSeq // Homo sapiens integrin beta 1 binding protein (melusin) 2 (ITGB1BP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71303619:71304781:1 gene:ENSG00000147166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:71301787:71305301:1 gene:ENSG00000147166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108901 // GenBank // Homo sapiens integrin beta 1 binding protein (melusin) 2, mRNA (cDNA clone MGC:119214 IMAGE:40004692), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373829 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1696:341687:345011:+ gene:ENSG00000147166 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71301734:71305371:1 Gene:OTTHUMG00000021793 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71301761:71304234:1 Gene:OTTHUMG00000021793 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057128 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71303792:71304880:1 Gene:OTTHUMG00000021793 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057129 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71303619:71304781:1 Gene:OTTHUMG00000021793 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dzr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens integrin beta 1 binding protein (melusin) 2 (ITGB1BP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dzs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens integrin beta 1 binding protein (melusin) 2 (ITGB1BP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052957 // RefSeq // Homo sapiens acidic repeat containing (ACRC), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71580285:71613582:1 gene:ENSG00000147174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:71578411:71613583:1 gene:ENSG00000147174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71609066:71612854:1 gene:ENSG00000147174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136259 // GenBank // Homo sapiens acidic repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:167869 IMAGE:9020246), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081855 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71578411:71613583:1 Gene:OTTHUMG00000033327 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71580285:71613582:1 Gene:OTTHUMG00000033327 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081857 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71609066:71612854:1 Gene:OTTHUMG00000033327 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eae.2 // UCSC Genes // Homo sapiens acidic repeat containing (ACRC), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034004 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100132741 (LOC100132741), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034005 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 891 (LINC00891), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022byt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 891 (LINC00891), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508574 // ENSEMBL // [retired] ncrna:lincRNA chromosome:GRCh37:X:70917046:70926305:1 gene:ENSG00000248499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058868 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058868 cpcScore=-1.2030800 cnci=-0.1674546 gene:OTTHUMG00000022687 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71719925:71720800:1 gene:ENSG00000226870 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000238106 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145139 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49B (CXorf49B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001145140 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49 (CXorf49), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71765188:71767204:1 gene:ENSG00000215113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:X:71763424:71767199:1 gene:ENSG00000215113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057167 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71765188:71767204:1 Gene:OTTHUMG00000021804 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49B (CXorf49B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002309 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S26 pseudogene 11 (RPS26P11), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eai.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein S26 pseudogene 11 (RPS26P11), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eai.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eai.2 cpcScore=2.2845600 cnci=-0.2185488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207422 // RefSeq // Homo sapiens TPT1-like protein (FLJ44635), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137552 // GenBank // Homo sapiens TPT1-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:169175 IMAGE:9021552), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eal.2 // UCSC Genes // Homo sapiens TPT1-like protein (FLJ44635), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034116 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 684 (LINC00684), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373524 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72158069:72158780:1 gene:ENSG00000204119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373527 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72158003:72158798:1 gene:ENSG00000204119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057218 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:72158003:72158798:1 Gene:OTTHUMG00000021821 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057219 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:72158069:72158780:1 Gene:OTTHUMG00000021821 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022byz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 684 (LINC00684), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042506 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2B (PABPC1L2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538388 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72223449:72224594:1 gene:ENSG00000184388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136492 // GenBank // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:168104 IMAGE:9020481), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373521 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3557:87954:88556:- gene:ENSG00000184388 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057221 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73003517:73005713:1 Gene:OTTHUMG00000021823 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2B (PABPC1L2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003255 // RefSeq // Homo sapiens TSIX transcript, XIST antisense RNA (TSIX), antisense RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens TSIX transcript, XIST antisense RNA (TSIX), antisense RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// tsix // lncRNA Db // hg19 chrX:73,012,040-73,049,066 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024582 // RefSeq // Homo sapiens JPX transcript, XIST activator (non-protein coding) (JPX), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:73944342:74000491:1 gene:ENSG00000225470 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:73944367:73947430:1 gene:ENSG00000225470 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:73944346:73944946:1 gene:ENSG00000225470 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK056172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31610 fis, clone NT2RI2002865. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73944342:74000491:1 Gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057244 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73944346:73944946:1 Gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73944367:73947430:1 Gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens JPX transcript, XIST activator (non-protein coding) (JPX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens JPX transcript, XIST activator (non-protein coding) (JPX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// jpx // lncRNA Db // hg18 chrX:73080884-73206942 NR_024582.1 (human) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebp.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebp.2 cpcScore=1.9628400 cnci=-0.3194119 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000373488 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:73406775:73406990:1 gene:ENSG00000204113 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057253 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74185929:74187153:1 Gene:OTTHUMG00000021848 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037511 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 374c (MIR374C), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 374c (MIR374C), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203303 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 13 (ZCCHC13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021176 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:33185 IMAGE:5269882), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339534 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1906:380324:380814:+ gene:ENSG00000187969 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057260 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74304190:74305031:1 Gene:OTTHUMG00000021851 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebs.4 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 13 (ZCCHC13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363015 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:74680053:74680159:1 gene:ENSG00000199885 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:75202703:75202809:1 gene:ENSG00000199601 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ecf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36616 fis, clone TRACH2016410, moderately similar to RETROVIRUS-RELATED PROTEASE (EC 3.4.23.-). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057289 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:75107994:75109321:1 Gene:OTTHUMG00000021871 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431331 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:75107994:75109321:1 gene:ENSG00000230028 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016500 // RefSeq // Homo sapiens polysaccharide biosynthesis domain containing 1 (PBDC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:76173040:76178196:1 gene:ENSG00000102390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:76172936:76178204:1 gene:ENSG00000102390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY927616 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001220 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:874 IMAGE:3528586), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051894 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:60319 IMAGE:6528202), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057294 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:76172936:76178204:1 Gene:OTTHUMG00000021876 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057295 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:76173040:76178196:1 Gene:OTTHUMG00000021876 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eck.1 // UCSC Genes // Homo sapiens polysaccharide biosynthesis domain containing 1 (PBDC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ecl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens polysaccharide biosynthesis domain containing 1 (PBDC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364956 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:76244968:76245074:1 gene:ENSG00000201826 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020932 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family E, 1 (MAGEE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:76427724:76431353:1 gene:ENSG00000198934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050588 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family E, 1, mRNA (cDNA clone MGC:57856 IMAGE:6189864), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057298 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:76427724:76431353:1 Gene:OTTHUMG00000021879 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ecm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family E, 1 (MAGEE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003868 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor 16 (FGF16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:77454157:77457278:1 gene:ENSG00000196468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:77454157:77457278:1 Gene:OTTHUMG00000013133 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mqp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens fibroblast growth factor 16 (FGF16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364036 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:77837289:77837395:1 gene:ENSG00000200906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001866 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb (COX7B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:77899463:77903196:1 gene:ENSG00000131174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018386 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb, mRNA (cDNA clone MGC:9065 IMAGE:3861730), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481445 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1712:1078109:1082186:+ gene:ENSG00000131174 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058970 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:77899438:77907373:1 Gene:OTTHUMG00000022718 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058971 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:77899438:77905275:1 Gene:OTTHUMG00000022718 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058972 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:77899463:77903196:1 Gene:OTTHUMG00000022718 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ecu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb (COX7B), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005296 // RefSeq // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4 (LPAR4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373301 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:78010301:78012591:1 gene:ENSG00000147145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:78747728:78757094:1 gene:ENSG00000147145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:78747731:78755006:1 gene:ENSG00000147145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069996 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:79281 IMAGE:6971739), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074722 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:103791 IMAGE:30915172), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC095538 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:111757 IMAGE:30706564), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057320 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:78003228:78010503:1 Gene:OTTHUMG00000021893 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057322 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78747728:78757094:1 Gene:OTTHUMG00000021895 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nme.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4 (LPAR4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 4 (LPAR4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001170574 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152630 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:80335504:80445311:1 gene:ENSG00000174016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028710 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D, mRNA (cDNA clone MGC:26999 IMAGE:4827590), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030784 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D, mRNA (cDNA clone MGC:27083 IMAGE:4826421), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034979 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D, mRNA (cDNA clone MGC:26967 IMAGE:4824369), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308293 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold262:29811:30977:- gene:ENSG00000174016 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057338 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:80420466:80445311:1 Gene:OTTHUMG00000021902 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004edl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004edm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391321 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:80900757:80900864:1 gene:ENSG00000212623 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391244 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:80936434:80936540:1 gene:ENSG00000212546 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365313 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:82561201:82561347:1 gene:ENSG00000202183 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021118 // RefSeq // Homo sapiens cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 1 (CYLC1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:83861146:83886697:1 gene:ENSG00000183035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544771 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:83116170:83254350:1 gene:ENSG00000183035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070355 // GenBank // Homo sapiens cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6104769), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126461 // GenBank // Homo sapiens cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 1, mRNA (cDNA clone MGC:161739 IMAGE:8992177), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057371 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:83861146:83886697:1 Gene:OTTHUMG00000021922 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eeh.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eei.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024062 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal like (pseudogene) (UBE2DNL), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:84934260:84934869:1 gene:ENSG00000229547 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mqw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal like (pseudogene) (UBE2DNL), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198450 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein O-like (APOOL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:85003826:85088063:1 gene:ENSG00000155008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107095 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40015612. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107096 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein O-like, mRNA (cDNA clone MGC:129748 IMAGE:40015614), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057385 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:85003826:85088063:1 Gene:OTTHUMG00000021930 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eem.3 // UCSC Genes // Homo sapiens apolipoprotein O-like (APOOL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nmp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens apolipoprotein O-like (APOOL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373169 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold784:1846814:1898494:- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362697 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:86019608:86019715:1 gene:ENSG00000199567 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363552 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:87146733:87146804:1 gene:ENSG00000200422 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019117 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 4 (KLHL4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_057162 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 4 (KLHL4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:87517749:87670050:1 gene:ENSG00000102271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140839 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176516 IMAGE:9021707), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC142652 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:164878 IMAGE:40148044), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC161675 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176725 IMAGE:8862604), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373114 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4335:53606:190419:- gene:ENSG00000102271 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057413 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:87517749:87670050:1 Gene:OTTHUMG00000021946 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:87517814:87669596:1 Gene:OTTHUMG00000021946 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch-like family member 4 (KLHL4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch-like family member 4 (KLHL4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516207 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:88148792:88148918:1 gene:ENSG00000252016 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184771 // RefSeq // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1 (CPXCR1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_033048 // RefSeq // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1 (CPXCR1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:88747225:88754785:1 gene:ENSG00000147183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:88747235:88754780:1 gene:ENSG00000147183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027614 // GenBank // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:27036 IMAGE:4838752), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057418 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:88747225:88754785:1 Gene:OTTHUMG00000021950 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057419 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:88747235:88754780:1 Gene:OTTHUMG00000021950 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1 (CPXCR1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1 (CPXCR1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CPX chromosome region, candidate 1 (CPXCR1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408078 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:89790335:89790451:1 gene:ENSG00000221005 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_138960 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked (TGIF2LX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000283891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:89921882:89922883:1 gene:ENSG00000153779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000561129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:89921956:89922883:1 gene:ENSG00000153779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117398 // GenBank // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:151007 IMAGE:40125949), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:89921882:89922883:1 Gene:OTTHUMG00000021954 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked (TGIF2LX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked (TGIF2LX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080832 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 5 (PABPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:91434595:91437000:1 gene:ENSG00000174740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000402906 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:90689838:90692134:1 gene:ENSG00000174740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063113 // GenBank // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 5, mRNA (cDNA clone MGC:71926 IMAGE:6452933), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000312600 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold51:319945:321087:+ gene:ENSG00000174740 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:91434824:91438584:1 Gene:OTTHUMG00000021959 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057430 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:91434595:91437000:1 Gene:OTTHUMG00000021959 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 5 (PABPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 5 (PABPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410508 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:91798093:91798283:1 gene:ENSG00000222440 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ564954 // GenBank // Homo sapiens mRNA for protocadherin (PCDHY gene), exon 1d. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mrb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens 5'UTR for PCDHX gene, exon 1d. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011mrc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mrc.1 cpcScore=-1.1260200 cnci=-0.4307501 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mrc.2 // UCSC Genes // Sequence 56 from Patent WO2006092738. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390192 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:92460452:92460545:1 gene:ENSG00000211526 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365540 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:94178005:94178106:1 gene:ENSG00000202410 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408738 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:94893501:94893593:1 gene:ENSG00000221665 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390809 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:95134279:95134372:1 gene:ENSG00000212098 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:95582064:95582162:1 gene:ENSG00000201567 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013347 // RefSeq // Homo sapiens replication protein A4, 30kDa (RPA4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:96883908:96885467:1 gene:ENSG00000204086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069791 // GenBank // Homo sapiens replication protein A4, 34kDa, mRNA (cDNA clone MGC:97352 IMAGE:7262610), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104013 // GenBank // Homo sapiens replication protein A4, 34kDa, mRNA (cDNA clone MGC:120333 IMAGE:40024430), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057464 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:96883908:96885467:1 Gene:OTTHUMG00000021987 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens replication protein A4, 30kDa (RPA4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516487 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:100100084:100100172:1 gene:ENSG00000252296 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014467 // RefSeq // Homo sapiens sushi-repeat containing protein, X-linked 2 (SRPX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:100644218:100671299:1 gene:ENSG00000102359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:100644221:100651095:1 gene:ENSG00000102359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020733 // GenBank // Homo sapiens sushi-repeat-containing protein, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:22551 IMAGE:4769946), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057486 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100644218:100671299:1 Gene:OTTHUMG00000022003 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057487 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100644221:100651095:1 Gene:OTTHUMG00000022003 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004egb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sushi-repeat containing protein, X-linked 2 (SRPX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012990 // RefSeq // [retired]Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001162490 // RefSeq // [retired]Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001162491 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:X:100969711:100990806:1 gene:ENSG00000174225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140808 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A, mRNA (cDNA clone MGC:176485 IMAGE:9021676), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057504 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100969711:100990806:1 Gene:OTTHUMG00000022013 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378629 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100969708:100990829:1 Gene:OTTHUMG00000022013 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nng.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ego.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mrf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 13A (ARL13A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000538938 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:100212364:100212528:1 gene:ENSG00000182574 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000443801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:101043564:101094476:-1 gene:ENSG00000225839 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057507 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:101043564:101094476:-1 Gene:OTTHUMG00000022015 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021637 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 35 (TMEM35), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444892 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:100333871:100350296:1 gene:ENSG00000126950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:101081497:101094939:1 gene:ENSG00000126950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050273 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:26012 IMAGE:4801325), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC078658 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:87281 IMAGE:5261160), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372930 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold210:450594:463787:+ gene:ENSG00000126950 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057508 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:101078720:101096364:1 Gene:OTTHUMG00000022016 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057509 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:101081497:101094939:1 Gene:OTTHUMG00000022016 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004egw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 35 (TMEM35), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:101325404:101325510:1 gene:ENSG00000202024 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016608 // RefSeq // Homo sapiens armadillo repeat containing, X-linked 1 (ARMCX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538894 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:100805533:100809671:1 gene:ENSG00000126947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002691 // GenBank // Homo sapiens armadillo repeat containing, X-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:3387 IMAGE:3605690), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR749609 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P06199 (from clone DKFZp686P06199). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372829 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold210:841060:842421:+ gene:ENSG00000126947 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057561 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:101550531:101554700:1 Gene:OTTHUMG00000022033 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ehv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens armadillo repeat containing, X-linked 1 (ARMCX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ehw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens armadillo repeat containing, X-linked 1 (ARMCX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cak.1 // UCSC Genes // Homo sapiens armadillo repeat containing, X-linked 1 (ARMCX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391282 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:101691580:101691685:1 gene:ENSG00000212584 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517001 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:101915589:101915695:1 gene:ENSG00000252810 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080390 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 2 (TCEAL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102125703:102127711:1 gene:ENSG00000184905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:102125688:102127711:1 gene:ENSG00000184905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102125688:102126900:1 gene:ENSG00000184905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093932 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:120967 IMAGE:7939777), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104764 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:132424 IMAGE:8143767), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057605 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102125703:102127711:1 Gene:OTTHUMG00000022048 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102125688:102126900:1 Gene:OTTHUMG00000022048 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eip.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 2 (TCEAL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022car.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 2 (TCEAL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000508552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102182315:102184899:1 gene:ENSG00000251525 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000332190 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102182315:102184899:1 Gene:OTTHUMG00000022051 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002216 // RefSeq // Homo sapiens nuclear RNA export factor 4 pseudogene (NXF4), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102549965:102571695:1 gene:ENSG00000196970 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095720 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102549965:102571695:1 Gene:OTTHUMG00000039695 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear RNA export factor 4 pseudogene (NXF4), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001031834 // RefSeq // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like (RAB40AL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102937250:102938962:1 gene:ENSG00000102128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101169 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like, mRNA (cDNA clone MGC:119958 IMAGE:40016064), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101170 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like, mRNA (cDNA clone MGC:119959 IMAGE:40016065), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101171 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like, mRNA (cDNA clone MGC:119960 IMAGE:40016067), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101172 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like, mRNA (cDNA clone MGC:119961 IMAGE:40016069), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057679 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102937250:102938962:1 Gene:OTTHUMG00000022084 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family-like (RAB40AL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080425 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, X-linked 4 (BEX4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127688 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, X-linked 4 (BEX4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103215092:103217246:1 gene:ENSG00000102409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372691 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold8:451448:451810:+ gene:ENSG00000102409 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057694 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103215092:103217246:1 Gene:OTTHUMG00000022091 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103215124:103217099:1 Gene:OTTHUMG00000022091 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens brain expressed, X-linked 4 (BEX4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens brain expressed, X-linked 4 (BEX4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens brain expressed, X-linked 4 (BEX4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152278 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 7 (TCEAL7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103330196:103332326:1 gene:ENSG00000182916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:103330229:103332088:1 gene:ENSG00000182916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005988 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 7, mRNA (cDNA clone MGC:14789 IMAGE:3839180), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016786 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 7, mRNA (cDNA clone MGC:23947 IMAGE:4102677), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057704 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103330196:103332326:1 Gene:OTTHUMG00000022096 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057705 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103330229:103332088:1 Gene:OTTHUMG00000022096 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ekc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 7 (TCEAL7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 7 (TCEAL7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057715 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:102753723:102754210:1 Gene:OTTHUMG00000022101 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412375 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:102753723:102754210:1 gene:ENSG00000228885 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038978 // RefSeq // Homo sapiens MORF4L2 antisense RNA 1 (MORF4L2-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:103687284:103691772:1 gene:ENSG00000231154 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057740 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103687284:103691772:1 Gene:OTTHUMG00000022108 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens MORF4L2 antisense RNA 1 (MORF4L2-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182541 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 31 (TMEM31), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103710909:103714028:1 gene:ENSG00000179363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029575 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 31, mRNA (cDNA clone MGC:39655 IMAGE:5267530), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057741 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103710909:103714028:1 Gene:OTTHUMG00000022109 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 31 (TMEM31), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408465 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:103810384:103810508:1 gene:ENSG00000221392 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_194324 // RefSeq // Homo sapiens thymosin beta 15B (TMSB15B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:103962669:103965981:1 gene:ENSG00000158427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK090973 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33654 fis, clone BRAMY2024827. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019900 // GenBank HTC // Homo sapiens thymosin beta 15B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3876145), with apparent retained intron. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035660 // GenBank HTC // Homo sapiens thymosin beta15b, mRNA (cDNA clone IMAGE:5721900), with apparent retained intron. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057751 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103918896:103965987:1 Gene:OTTHUMG00000022117 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057752 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103962669:103965981:1 Gene:OTTHUMG00000022117 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057753 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103919187:103932911:1 Gene:OTTHUMG00000022117 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eln.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33654 fis, clone BRAMY2024827. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elo.4 // UCSC Genes // Homo sapiens thymosin beta 15B (TMSB15B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens thymosin beta 15B (TMSB15B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010noz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens thymosin beta 15B (TMSB15B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003238 // RefSeq // Homo sapiens H2B histone family, member X, pseudogene (H2BFXP), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010npa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens H2B histone family, member X, pseudogene (H2BFXP), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164416 // RefSeq // Homo sapiens H2B histone family, member M (H2BFM), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243297 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:103268269:103297020:1 gene:ENSG00000101812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355016 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:104039949:104042454:1 gene:ENSG00000101812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057758 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104039949:104042454:1 Gene:OTTHUMG00000022122 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317286 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104040283:104042454:1 Gene:OTTHUMG00000022122 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004els.2 // UCSC Genes // Homo sapiens H2B histone family, member M (H2BFM), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001143978 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 18 (ZCCHC18), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026694 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 18 (ZCCHC18), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537356 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:104112511:104115604:1 gene:ENSG00000166707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057759 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104112544:104115842:1 Gene:OTTHUMG00000022123 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 18 (ZCCHC18), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 18 (ZCCHC18), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207318 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 199, X-linked (FAM199X), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000299906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:104186118:104191446:1 gene:ENSG00000123575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016683 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 39, mRNA (cDNA clone IMAGE:4389250), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017665 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:17382 IMAGE:3903800), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC057847 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:71855 IMAGE:30344004), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493442 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1933:121049:146128:+ gene:ENSG00000123575 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057764 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104166620:104195902:1 Gene:OTTHUMG00000022126 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057765 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104186118:104191446:1 Gene:OTTHUMG00000022126 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 199, X-linked (FAM199X), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 199, X-linked (FAM199X), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017416 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 2 (IL1RAPL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:105717366:105767661:1 gene:ENSG00000189108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:104566315:105767829:1 gene:ENSG00000189108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:105740649:105765345:1 gene:ENSG00000189108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538500 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:104996733:105012102:1 gene:ENSG00000189108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104784 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:132444 IMAGE:8143787), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104566315:105767829:1 Gene:OTTHUMG00000022141 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:105740649:105765345:1 Gene:OTTHUMG00000022141 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 1 receptor accessory protein-like 2 (IL1RAPL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198465 // RefSeq // Homo sapiens Nik related kinase (NRK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:105822543:105958610:1 gene:ENSG00000123572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:105822581:105939947:1 gene:ENSG00000123572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:X:105822553:105895363:1 gene:ENSG00000123572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540278 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:105948438:105956593:1 gene:ENSG00000123572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK131549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16788 fis, clone PLACE7013963, weakly similar to Mus musculus Nik related kinase (Nrk). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK293500 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50079 complete cds, highly similar to Homo sapiens Nik related kinase (NRK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106480 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:105822543:105958610:1 Gene:OTTHUMG00000022143 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Nik related kinase (NRK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010npc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Nik related kinase (NRK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Nik related kinase (NRK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410229 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:105860689:105860762:1 gene:ENSG00000222161 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171020 // RefSeq // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1 (MUM1L1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152423 // RefSeq // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1 (MUM1L1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000337685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:106168305:106208955:1 gene:ENSG00000157502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:106201736:106208955:1 gene:ENSG00000157502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031229 // GenBank // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:39544 IMAGE:5272099), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357175 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1628:115918:118002:- gene:ENSG00000157502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106201736:106208955:1 Gene:OTTHUMG00000022146 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106168305:106208956:1 Gene:OTTHUMG00000022146 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1 (MUM1L1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1 (MUM1L1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cca.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma associated antigen (mutated) 1-like 1 (MUM1L1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000538229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:106327534:106327824:1 gene:ENSG00000256709 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365537 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:106426568:106426669:1 gene:ENSG00000202407 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024539 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase (RNF128), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_194463 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase (RNF128), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:106693838:106796993:1 gene:ENSG00000133135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063404 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:74626 IMAGE:5191785), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000255499 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold8:911778:973085:+ gene:ENSG00000133135 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057804 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106726664:106796993:1 Gene:OTTHUMG00000022151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057805 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106693838:106796993:1 Gene:OTTHUMG00000022151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057806 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106693794:106790205:1 Gene:OTTHUMG00000022151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase (RNF128), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eml.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase (RNF128), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171092 // RefSeq // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001171095 // RefSeq // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020384 // RefSeq // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:106918360:106930859:1 gene:ENSG00000165376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:106900164:106930859:1 gene:ENSG00000165376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014424 // GenBank // Homo sapiens claudin 2, mRNA (cDNA clone MGC:20191 IMAGE:4645075), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071747 // GenBank // Homo sapiens claudin 2, mRNA (cDNA clone MGC:88250 IMAGE:30322852), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000336803 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold8:1125284:1125976:+ gene:ENSG00000165376 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057815 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106920404:106930861:1 Gene:OTTHUMG00000022154 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ccc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ccd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 2 (CLDN2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362962 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:107202577:107202683:1 gene:ENSG00000199832 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001169154 // RefSeq // Homo sapiens PIH1 domain containing 3 (PIH1D3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173494 // RefSeq // Homo sapiens PIH1 domain containing 3 (PIH1D3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000336387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:107207148:107243364:1 gene:ENSG00000080572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:107206632:107244242:1 gene:ENSG00000080572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033510 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 41, mRNA (cDNA clone MGC:35261 IMAGE:5173807), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372453 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold981:8591:49652:+ gene:ENSG00000080572 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057832 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:107206632:107244243:1 Gene:OTTHUMG00000022160 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:107207148:107243364:1 Gene:OTTHUMG00000022160 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004enc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PIH1 domain containing 3 (PIH1D3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004end.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PIH1 domain containing 3 (PIH1D3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385111 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:107428989:107429079:1 gene:ENSG00000207846 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:108826764:108826869:1 gene:ENSG00000201443 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516235 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:108297553:108297626:1 gene:ENSG00000252044 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000543012 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:108975929:108978188:1 gene:ENSG00000232769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020769 // RefSeq // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 1 (RGAG1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:110450565:110456326:1 gene:ENSG00000243978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540483 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:109693793:109698741:1 gene:ENSG00000243978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK302427 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60962 complete cds, highly similar to Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 1 (RGAG1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113670 // GenBank // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:142230 IMAGE:8322722), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465301 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4675:100327:105352:+ gene:ENSG00000243978 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057906 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:110419057:110456334:1 Gene:OTTHUMG00000022196 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000375734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:110358816:110450881:1 Gene:OTTHUMG00000022196 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eor.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 1 (RGAG1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 1 (RGAG1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002718 // RefSeq // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 (TDGF1P3), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eos.1 // UCSC Genes // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 (TDGF1P3), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF070581 // GenBank // Homo sapiens clone 24540 mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla04246, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033974 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 890 (LINC00890), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eph.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 890 (LINC00890), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195576 // RefSeq // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001195577 // RefSeq // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001195578 // RefSeq // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:111881897:111903990:1 gene:ENSG00000204025 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057944 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:111881897:111903990:1 Gene:OTTHUMG00000022211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ccr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ccs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TRPC5 opposite strand (TRPC5OS), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004308 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 16 (ZCCHC16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:112454500:112457112:1 gene:ENSG00000187823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137430 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:169051 IMAGE:9021428), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137433 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:169054 IMAGE:9021431), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356964 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:112454500:112457112:1 Gene:OTTHUMG00000159706 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 16 (ZCCHC16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cct.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 16 (ZCCHC16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363566 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:112661657:112661768:1 gene:ENSG00000200436 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000395427 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:111933149:111933748:1 gene:ENSG00000213652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000542405 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:112765762:112766265:1 gene:ENSG00000220541 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:113949917:113950082:1 gene:ENSG00000207220 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391309 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:114017033:114017102:1 gene:ENSG00000212611 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002993 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 35 (SNORA35), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000386104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:114630797:114630924:1 gene:ENSG00000208839 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 35 (SNORA35), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_031581 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 764 (MIR764), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390811 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:114639435:114639519:1 gene:ENSG00000212100 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ccw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 764 (MIR764), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000435767 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:X:113992533:113995378:1 gene:ENSG00000223444 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057958 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:113992533:113995378:1 Gene:OTTHUMG00000022223 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029955 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 448 (MIR448), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362131 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:114823454:114823564:1 gene:ENSG00000199001 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mtd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 448 (MIR448), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mtd.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mtd.1 cpcScore=-1.5263000 cnci=-0.1639750 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:115032427:115032533:1 gene:ENSG00000222122 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145346 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked-like 3 (RBMXL3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:115189427:115192868:1 gene:ENSG00000175718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057968 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:115189427:115192868:1 Gene:OTTHUMG00000022230 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked-like 3 (RBMXL3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016383 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper protein 4 (LUZP4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:115289753:115307556:1 gene:ENSG00000102021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:115289727:115307554:1 gene:ENSG00000102021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451986 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:114524293:114542119:1 gene:ENSG00000102021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128134 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:149218 IMAGE:40112435), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057972 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:115289753:115307556:1 Gene:OTTHUMG00000022234 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057973 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:115289727:115307554:1 Gene:OTTHUMG00000022234 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine zipper protein 4 (LUZP4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine zipper protein 4 (LUZP4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516632 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:115545637:115545717:1 gene:ENSG00000252441 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000686 // RefSeq // Homo sapiens angiotensin II receptor, type 2 (AGTR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC095504 // GenBank // Homo sapiens angiotensin II receptor, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:111714 IMAGE:6971944), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371906 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2587:225727:226815:- gene:ENSG00000180772 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057984 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:116170722:116174972:1 Gene:OTTHUMG00000022243 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens angiotensin II receptor, type 2 (AGTR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens angiotensin II receptor, type 2 (AGTR2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007231 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (amino acid transporter), member 14 (SLC6A14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:116454977:116458942:1 gene:ENSG00000268104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000087916 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK304243 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51458 complete cds, highly similar to Sodium-and chloride-dependent neutral andbasic amino acid transporter B(0+). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093710 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (amino acid transporter), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:120745 IMAGE:7939555), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371900 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold207:76156:104091:+ gene:ENSG00000087916 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057986 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:116436622:116461458:1 Gene:OTTHUMG00000022245 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057987 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:116454977:116458942:1 Gene:OTTHUMG00000022245 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (amino acid transporter), member 14 (SLC6A14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mtm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (amino acid transporter), member 14 (SLC6A14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144658 // RefSeq // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 11 (DOCK11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:118495909:118686147:1 gene:ENSG00000147251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276204 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:118495898:118686163:1 gene:ENSG00000147251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498252 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:117712531:117722273:1 gene:ENSG00000147251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK124735 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42745 fis, clone BRAWH3000100. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058006 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:118495898:118686163:1 Gene:OTTHUMG00000022256 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058007 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:117712531:117722273:1 Gene:OTTHUMG00000022256 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356002 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:118495909:118686147:1 Gene:OTTHUMG00000022256 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 11 (DOCK11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 11 (DOCK11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173798 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12 (ZCCHC12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:118823790:118826968:1 gene:ENSG00000174460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031241 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:39623 IMAGE:5263970), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036572 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:41942 IMAGE:5274563), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC057841 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:71837 IMAGE:5264353), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058014 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:118823790:118826968:1 Gene:OTTHUMG00000022261 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004equ.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12 (ZCCHC12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 12 (ZCCHC12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006667 // RefSeq // Homo sapiens progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:119236245:119244465:1 gene:ENSG00000101856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK293618 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50115 complete cds, moderately similar to Membrane-associated progesterone receptor component 1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034238 // GenBank // Homo sapiens progesterone receptor membrane component 1, mRNA (cDNA clone MGC:8891 IMAGE:3863377), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000217971 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1213:424211:427140:- gene:ENSG00000101856 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119236253:119244466:1 Gene:OTTHUMG00000022268 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004erb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mts.2 // UCSC Genes // Homo sapiens progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058035 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119422917:119423547:1 Gene:OTTHUMG00000022274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:119422917:119423547:1 gene:ENSG00000237903 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:119423742:119423905:1 gene:ENSG00000207175 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516338 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:119456558:119456658:1 gene:ENSG00000252147 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdi.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00019 hit found at contig region AC004000.1/35676-35776 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001152 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 5 (SLC25A5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:119469277:119470940:1 gene:ENSG00000005022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC056160 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:65136 IMAGE:3867331), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317881 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1213:185823:187195:- gene:ENSG00000005022 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058952 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119468400:119471319:1 Gene:OTTHUMG00000022715 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058953 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119470262:119471081:1 Gene:OTTHUMG00000022715 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058954 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119469277:119470940:1 Gene:OTTHUMG00000022715 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000259344 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119468422:119470155:1 Gene:OTTHUMG00000022715 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004erh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 5 (SLC25A5), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105576 // RefSeq // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member D (SOWAHD), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:119758613:119760164:1 gene:ENSG00000187808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356469 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119758613:119760164:1 Gene:OTTHUMG00000159606 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nql.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member D (SOWAHD), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004541 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1, 7.5kDa (NDUFA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000266 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1, 7.5kDa, mRNA (cDNA clone MGC:2066 IMAGE:3352028), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371437 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2828:176761:178442:+ gene:ENSG00000125356 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119871487:119876662:1 Gene:OTTHUMG00000022287 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1, 7.5kDa (NDUFA1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000553843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:120036236:120146854:1 gene:ENSG00000258545 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK123976 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41982 fis, clone SMINT2017659. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ41982 fis, clone SMINT2017659. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099685 // RefSeq // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2B (RHOXF2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032498 // RefSeq // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2 (RHOXF2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120158561:120164039:1 gene:ENSG00000131721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021719 // GenBank // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:32918 IMAGE:5269333), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058085 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120250752:120258398:1 Gene:OTTHUMG00000171159 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2B (RHOXF2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184742 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33 (ZBTB33), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_006777 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33 (ZBTB33), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120250752:120258398:1 gene:ENSG00000177485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000557385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120250755:120255434:1 gene:ENSG00000177485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042753 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:42760 IMAGE:4828271), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33 (ZBTB33), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nqm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33 (ZBTB33), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 33 (ZBTB33), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459474 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:119678170:119678273:1 gene:ENSG00000238461 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012084 // RefSeq // Homo sapiens glutamate dehydrogenase 2 (GLUD2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:121047588:121050080:1 gene:ENSG00000182890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050732 // GenBank // Homo sapiens glutamate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:60371 IMAGE:6164919), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058133 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:121047588:121050080:1 Gene:OTTHUMG00000022320 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eto.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glutamate dehydrogenase 2 (GLUD2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408290 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:121868867:121868956:1 gene:ENSG00000221217 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391019 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:122840426:122840645:1 gene:ENSG00000212321 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058150 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:122867024:122868144:1 Gene:OTTHUMG00000022331 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442332 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:122867024:122868144:1 gene:ENSG00000229033 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516818 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:123874459:123874565:1 gene:ENSG00000252627 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459499 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:123267134:123267227:1 gene:ENSG00000239058 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516884 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:124197743:124197849:1 gene:ENSG00000252693 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458905 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:124062368:124062466:1 gene:ENSG00000238626 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195272 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed sequence 13-like (LOC100129520), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed sequence 13-like (LOC100129520), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410586 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:125662904:125662994:1 gene:ENSG00000222518 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516742 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:128652553:128652624:1 gene:ENSG00000252551 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdt.1 // UCSC Genes // Rfam model RF01169 hit found at contig region AL138745.19/37973-38044 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003399 // RefSeq // Homo sapiens X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 2, membrane-bound (XPNPEP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:129738974:129746863:1 gene:ENSG00000122121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:129739022:129769538:1 gene:ENSG00000122121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300954 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59052 complete cds, highly similar to Xaa-Pro aminopeptidase 2 precursor (EC 3.4.11.9). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126174 // GenBank // Homo sapiens X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 2, membrane-bound, mRNA (cDNA clone MGC:161452 IMAGE:8991890), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:129739022:129769538:1 Gene:OTTHUMG00000022373 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058211 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:129738974:129746863:1 Gene:OTTHUMG00000022373 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eut.1 // UCSC Genes // Homo sapiens X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 2, membrane-bound (XPNPEP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mum.2 // UCSC Genes // Homo sapiens X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 2, membrane-bound (XPNPEP2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004794 // RefSeq // Homo sapiens RAB33A, member RAS oncogene family (RAB33A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK094927 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37608 fis, clone BRCOC2010994, highly similar to RAS-RELATED PROTEIN RAB-33A. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001157 // GenBank // Homo sapiens RAB33A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:1488 IMAGE:3510745), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009996 // GenBank // Homo sapiens RAB33A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:15261 IMAGE:4129324), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000257017 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold138:177051:186713:+ gene:ENSG00000134594 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058246 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130171649:130184870:1 Gene:OTTHUMG00000022391 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004evl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB33A, member RAS oncogene family (RAB33A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nre.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB33A, member RAS oncogene family (RAB33A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016024 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked 2 (RBMX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:130401969:130413343:1 gene:ENSG00000134597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:130402005:130404450:1 gene:ENSG00000134597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:130402001:130411524:1 gene:ENSG00000134597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538614 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:129535943:129547317:1 gene:ENSG00000134597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033750 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:45091 IMAGE:5210341), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058265 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130401969:130413343:1 Gene:OTTHUMG00000022395 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058266 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130402001:130411524:1 Gene:OTTHUMG00000022395 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058267 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130402005:130404450:1 Gene:OTTHUMG00000022395 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058268 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130411203:130412395:1 Gene:OTTHUMG00000022395 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004evt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked 2 (RBMX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207009 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 45, member A (FAM45A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027141 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 45, member B (pseudogene) (FAM45B), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nrh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 45, member B (pseudogene) (FAM45B), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401228 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:131404510:131404602:-1 gene:ENSG00000216047 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004486 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily H, member 1 (OR13H1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:131544074:131545000:1 gene:ENSG00000171054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137050 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily H, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168670 IMAGE:9021047), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058297 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:131544074:131545000:1 Gene:OTTHUMG00000022411 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011muw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily H, member 1 (OR13H1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384372 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:133152754:133152892:1 gene:ENSG00000207100 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001101357 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 160 (CCDC160), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:134237047:134245778:1 gene:ENSG00000203952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000517294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:134237047:134246207:1 gene:ENSG00000203952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377679 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:134237047:134246207:1 Gene:OTTHUMG00000164183 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 160 (CCDC160), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000194 // RefSeq // Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370796 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:133594195:133634107:1 gene:ENSG00000165704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:134460351:134498641:1 gene:ENSG00000165704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000578 // GenBank // Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:1722 IMAGE:3163726), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298556 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold317:2403892:2425163:+ gene:ENSG00000165704 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058361 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:134460153:134500668:1 Gene:OTTHUMG00000022452 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058362 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:134460351:134498641:1 Gene:OTTHUMG00000022452 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058363 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:134473374:134520513:1 Gene:OTTHUMG00000022452 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038998 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 629 (LINC00629), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:134549973:134559923:1 gene:ENSG00000227060 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058374 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:134549973:134559923:1 Gene:OTTHUMG00000022456 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 629 (LINC00629), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390132 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:133811215:133811301:1 gene:ENSG00000211558 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408372 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:134895754:134895842:1 gene:ENSG00000221299 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001163438 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 10 (SMIM10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:134990938:134992473:1 gene:ENSG00000184785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small integral membrane protein 10 (SMIM10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001078171 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member A (FAM127A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000257013 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:135032366:135033546:1 gene:ENSG00000134590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:135032382:135033546:1 gene:ENSG00000134590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002385 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member A, mRNA (cDNA clone MGC:8656 IMAGE:2961665), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058390 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135032382:135033546:1 Gene:OTTHUMG00000022465 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135032366:135033546:1 Gene:OTTHUMG00000022465 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058392 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135032382:135033400:1 Gene:OTTHUMG00000022465 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member A (FAM127A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000453528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135116758:135123952:1 gene:ENSG00000228372 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC061642 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5744384, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058400 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135116758:135123952:1 Gene:OTTHUMG00000022470 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyj.3 // UCSC Genes // SubName: Full=Putative uncharacterized protein; Flags: Fragment; // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB062081 // GenBank // Homo sapiens cDNA, SINE-R retroposon, isolate:HFB-3. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA, SINE-R retroposon, isolate:HFB-1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024359 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 86 (LINC00086), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135421943:135428074:1 gene:ENSG00000178947 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058412 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135421943:135428074:1 Gene:OTTHUMG00000022479 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 86 (LINC00086), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyv.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eyv.3 cpcScore=-0.1232280 cnci=-0.1350713 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182540 // RefSeq // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 26B (DDX26B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135520993:135582509:1 gene:ENSG00000165359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140715 // GenBank // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 26B, mRNA (cDNA clone MGC:176392 IMAGE:9021583), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370752 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3315:122733:177350:+ gene:ENSG00000165359 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058420 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135520659:135582509:1 Gene:OTTHUMG00000022484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058421 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135520659:135582509:1 Gene:OTTHUMG00000022484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058422 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135520993:135582509:1 Gene:OTTHUMG00000022484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135579885:135582510:1 Gene:OTTHUMG00000022484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135579937:135582502:1 Gene:OTTHUMG00000022484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 26B (DDX26B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071753 // GenBank HTC // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 26B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4762492), **** WARNING: chimeric clone ****. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 26B (DDX26B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017417 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A1 (CT45A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370741 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134847185:134856990:1 gene:ENSG00000232478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482795 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134847370:134857008:1 gene:ENSG00000232478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140735 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:176412 IMAGE:9021603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140913 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:176590 IMAGE:9056725), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058428 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134847185:134856990:1 Gene:OTTHUMG00000022488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058429 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134847370:134857008:1 Gene:OTTHUMG00000022488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058430 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134847185:134858567:1 Gene:OTTHUMG00000022488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A1 (CT45A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018666 // RefSeq // Homo sapiens sarcoma antigen 1 (SAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:135889205:135913060:1 gene:ENSG00000181433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135896243:135913061:1 gene:ENSG00000181433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535938 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134975785:134995219:1 gene:ENSG00000181433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:135889205:135913060:1 gene:ENSG00000181433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310412 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17454. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144260 // GenBank // Homo sapiens sarcoma antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:177797 IMAGE:9052780), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058448 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135896243:135913061:1 Gene:OTTHUMG00000022496 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sarcoma antigen 1 (SAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nry.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sarcoma antigen 1 (SAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sarcoma antigen 1 (SAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058454 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:X:135056007:135057190:1 Gene:OTTHUMG00000022500 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370707 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:135056007:135057190:1 gene:ENSG00000203945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001727 // RefSeq // Homo sapiens bombesin-like receptor 3 (BRS3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:136487887:136493780:1 gene:ENSG00000102239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059005 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136487887:136493780:1 Gene:OTTHUMG00000022726 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens bombesin-like receptor 3 (BRS3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001163280 // RefSeq // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1 (HTATSF1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_014500 // RefSeq // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1 (HTATSF1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415377 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:135579720:135594493:1 gene:ENSG00000102241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:136497079:136512342:1 gene:ENSG00000102241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009896 // GenBank // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:2033 IMAGE:3504952), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218364 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1264:162518:177927:+ gene:ENSG00000102241 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058497 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136497511:136512346:1 Gene:OTTHUMG00000022510 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058498 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136497221:136502941:1 Gene:OTTHUMG00000022510 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058499 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136497234:136502877:1 Gene:OTTHUMG00000022510 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1 (HTATSF1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1 (HTATSF1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016267 // RefSeq // Homo sapiens vestigial-like family member 1 (VGLL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430688 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:135614311:135638965:1 gene:ENSG00000102243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:136550442:136556807:1 gene:ENSG00000102243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000045 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:2032 IMAGE:3504527), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003362 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:5266 IMAGE:2900293), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370634 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1264:201158:212519:+ gene:ENSG00000102243 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058493 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136532152:136556807:1 Gene:OTTHUMG00000022509 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058494 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136536128:136556496:1 Gene:OTTHUMG00000022509 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058495 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136550442:136556807:1 Gene:OTTHUMG00000022509 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058496 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136536195:136556807:1 Gene:OTTHUMG00000022509 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens vestigial like 1 (Drosophila) (VGLL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030631 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 934 (MIR934), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401241 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:136550878:136550960:1 gene:ENSG00000216060 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cev.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 934 (MIR934), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516511 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:136583240:136583345:1 gene:ENSG00000252320 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038461 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 892 (LINC00892), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038462 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 892 (LINC00892), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:136639667:136642426:1 gene:ENSG00000233093 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:136639543:136642426:1 gene:ENSG00000233093 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058500 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136639740:136642429:1 Gene:OTTHUMG00000022511 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000326699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136639543:136642426:1 Gene:OTTHUMG00000022511 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000326700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136639667:136642426:1 Gene:OTTHUMG00000022511 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cew.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 892 (LINC00892), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cex.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 892 (LINC00892), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000074 // RefSeq // Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:136648227:136660390:1 gene:ENSG00000102245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY197739 // GenBank // Homo sapiens CD154 protein (TNFSF5) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071754 // GenBank // Homo sapiens CD40 ligand, mRNA (cDNA clone MGC:88303 IMAGE:30418744), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074950 // GenBank // Homo sapiens CD40 ligand, mRNA (cDNA clone MGC:103892 IMAGE:30915276), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370629 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1264:324149:335915:+ gene:ENSG00000102245 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058501 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136648193:136660390:1 Gene:OTTHUMG00000022512 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058502 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:136648227:136660390:1 Gene:OTTHUMG00000022512 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004faa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nsd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// S66178 // GenBank // CD40 ligand {58 bp deletion between residues 288-289} [human, HIGMX-1 patient, peripheral blood mononuclear cells, mRNA PartialMutant, 64 nt]. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nse.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:136773999:136774105:1 gene:ENSG00000212510 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cey.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00026 hit found at contig region AL683813.10/545-651 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038405 // RefSeq // Homo sapiens FGF13 antisense RNA 1 (FGF13-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:138712107:138716617:1 gene:ENSG00000226031 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058531 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:138712107:138716617:1 Gene:OTTHUMG00000137416 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058532 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:138711452:138716092:1 Gene:OTTHUMG00000137416 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fao.3 // UCSC Genes // Homo sapiens FGF13 antisense RNA 1 (FGF13-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fao.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fao.2 cpcScore=-1.2296600 cnci=-0.3055462 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000309296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:139362040:139362382:1 gene:ENSG00000173954 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058554 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:139362040:139362382:1 Gene:OTTHUMG00000022534 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028597 // RefSeq // Homo sapiens steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 1 pseudogene 1 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha pseudogene) (SRD5A1P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 1 pseudogene 1 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha pseudogene) (SRD5A1P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000133 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor IX (F9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:139530758:139563458:1 gene:ENSG00000101981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:139530765:139562071:1 gene:ENSG00000101981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:139530758:139548392:1 gene:ENSG00000101981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB186358 // GenBank // Homo sapiens F9 mRNA for coagulation factor IX, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109214 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor IX, mRNA (cDNA clone MGC:129641 IMAGE:40007636), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:139530758:139563458:1 Gene:OTTHUMG00000022536 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058558 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:139530758:139548392:1 Gene:OTTHUMG00000022536 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fas.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor IX (F9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fat.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor IX (F9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408448 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:139885481:139885603:1 gene:ENSG00000221375 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516910 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:139909904:139910034:1 gene:ENSG00000252719 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412538 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:139115445:139115665:1 gene:ENSG00000214653 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028344 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 632 (LINC00632), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028345 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 632 (LINC00632), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:140709767:140714822:1 gene:ENSG00000203930 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:140709780:140772674:1 gene:ENSG00000203930 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058581 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:140709780:140772674:1 Gene:OTTHUMG00000022548 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058582 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:140709767:140714822:1 Gene:OTTHUMG00000022548 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 632 (LINC00632), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK054921 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30359 fis, clone BRACE2007760, highly similar to 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ30359 fis, clone BRACE2007760, highly similar to 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032461 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member B1 (SPANXB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_139019 // RefSeq // [retired]Homo sapiens SPANX family, member F1 (SPANXF1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145664 // RefSeq // [retired]Homo sapiens SPANX family, member B2 (SPANXB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141002591:141003706:1 gene:ENSG00000227234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034472 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:26207 IMAGE:4824918), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137533 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:169156 IMAGE:9021533), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058588 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141002591:141003706:1 Gene:OTTHUMG00000022554 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member F1 (SPANXF1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032461 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member B1 (SPANXB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_139019 // RefSeq // [retired]Homo sapiens SPANX family, member F1 (SPANXF1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145664 // RefSeq // [retired]Homo sapiens SPANX family, member B2 (SPANXB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370530 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:140096761:140097876:1 gene:ENSG00000235604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034472 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:26207 IMAGE:4824918), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137533 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:169156 IMAGE:9021533), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058587 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:140096761:140097876:1 Gene:OTTHUMG00000022553 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member F1 (SPANXF1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037183 // RefSeq // Homo sapiens SPANXA2 overlapping transcript 1 (SPANXA2-OT1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421554 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:140590843:140738057:1 gene:ENSG00000226574 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058601 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141502849:141649927:1 Gene:OTTHUMG00000022566 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANXA2 overlapping transcript 1 (non-protein coding) (SPANXA2-OT1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013453 // RefSeq // Homo sapiens sperm protein associated with the nucleus, X-linked, family member A1 (SPANXA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145662 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member A2 (SPANXA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141589435:141590772:1 gene:ENSG00000203926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069393 // GenBank // Homo sapiens sperm protein associated with the nucleus, X-linked, family member A1, mRNA (cDNA clone MGC:97406 IMAGE:7262682), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058600 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141589435:141590772:1 Gene:OTTHUMG00000022565 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member A2 (SPANXA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005462 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family C, 1 (MAGEC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000285879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141903894:141909388:1 gene:ENSG00000155495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370510 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:140993194:140994138:1 gene:ENSG00000155495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000406005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:141904802:141908914:1 gene:ENSG00000155495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127771 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family C, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40128997), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058604 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141903894:141909388:1 Gene:OTTHUMG00000022569 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058605 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:140991708:140994139:1 Gene:OTTHUMG00000022569 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family C, 1 (MAGEC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nsl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family C, 1 (MAGEC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY952890 // GenBank // Homo sapiens antigen MMSA-9 mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family C, 1 (MAGEC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:142411053:142411171:1 gene:ENSG00000201000 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009613 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member N4 (SPANXN4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370504 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:143025932:143034702:1 gene:ENSG00000189326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:143025918:143034280:1 gene:ENSG00000189326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130503 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member N4, mRNA (cDNA clone MGC:163375 IMAGE:40146534), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130505 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member N4, mRNA (cDNA clone MGC:163377 IMAGE:40146536), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058612 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:143025932:143034702:1 Gene:OTTHUMG00000022575 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377539 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:143025918:143034280:1 Gene:OTTHUMG00000022575 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member N4 (SPANXN4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012989 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2N-like (UBE2NL), transcript variant coding, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370494 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:142967173:142968355:1 gene:ENSG00000102069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058624 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:142967173:142968362:1 Gene:OTTHUMG00000022586 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fca.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2N-like (UBE2NL), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009614 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member N1 (SPANXN1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:145246828:145256112:1 gene:ENSG00000203923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058631 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:145246828:145256112:1 Gene:OTTHUMG00000022593 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fcb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member N1 (SPANXN1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004709 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 257 (TMEM257), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:145827410:145829850:1 gene:ENSG00000221870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113600 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 1, mRNA (cDNA clone MGC:142160 IMAGE:8322652), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356465 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:145827410:145829850:1 Gene:OTTHUMG00000159605 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fch.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 257 (TMEM257), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001144064 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51A (CXorf51A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001244892 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51B (CXorf51B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:146809784:146810409:1 gene:ENSG00000235699 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058638 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:146809784:146810409:1 Gene:OTTHUMG00000022599 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mwu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51B (CXorf51B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365181 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147827279:147827384:1 gene:ENSG00000202051 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000441414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:147946941:147947583:1 gene:ENSG00000236337 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106479 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:147946941:147947583:1 Gene:OTTHUMG00000046184 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152578 // RefSeq // Homo sapiens fragile X mental retardation 1 neighbor (FMR1NB), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:147981329:148026667:1 gene:ENSG00000176988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034320 // GenBank // Homo sapiens fragile X mental retardation 1 neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:42907 IMAGE:4836772), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058667 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:147981329:148026667:1 Gene:OTTHUMG00000022608 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058668 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:148006816:148026665:1 Gene:OTTHUMG00000022608 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fcm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fragile X mental retardation 1 neighbor (FMR1NB), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000435346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:148546878:148547397:1 gene:ENSG00000223516 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:148546878:148547397:1 Gene:OTTHUMG00000022611 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515988 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:X:148412432:148412492:1 gene:ENSG00000251797 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080790 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005365 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9 (MAGEA9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298974 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:148863600:148869397:1 gene:ENSG00000166008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002351 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9, mRNA (cDNA clone MGC:8421 IMAGE:2820966), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377530 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148863584:148868214:1 Gene:OTTHUMG00000164165 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377531 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148863600:148869397:1 Gene:OTTHUMG00000164165 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377532 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148863612:148868459:1 Gene:OTTHUMG00000164165 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377533 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148863612:148868798:1 Gene:OTTHUMG00000164165 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377534 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148864169:148868164:1 Gene:OTTHUMG00000164165 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cgn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001011544 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 11 (MAGEA11), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005366 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 11 (MAGEA11), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:149688824:149717266:1 gene:ENSG00000185247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:149712078:149717248:1 gene:ENSG00000185247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004479 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 11, mRNA (cDNA clone MGC:10511 IMAGE:3833322), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058725 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149712078:149717248:1 Gene:OTTHUMG00000022633 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058726 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149688228:149716459:1 Gene:OTTHUMG00000022633 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378839 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149688237:149717266:1 Gene:OTTHUMG00000022633 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 11 (MAGEA11), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 11 (MAGEA11), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001174092 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 185A (TMEM185A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mxr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 185A (TMEM185A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC013793 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 185A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4214132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ46855 fis, clone UTERU3010029, highly similar to Protein FAM11A. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdu.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fdu.2 cpcScore=-1.1474300 cnci=-0.2525309 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164415 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_016153 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 1 (HSFX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:149774068:149776867:1 gene:ENSG00000171116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310305 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17347. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021706 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:26102 IMAGE:4825659), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058717 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149774068:149776867:1 Gene:OTTHUMG00000022626 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ntb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cgm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408077 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:131996845:131996933:1 gene:ENSG00000265686 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517200 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:150070594:150070709:1 gene:ENSG00000253009 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005342 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 3 (HMGB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000325307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:150983286:150990775:1 gene:ENSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:150983406:150987932:1 gene:ENSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070482 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 3, mRNA (cDNA clone MGC:90319 IMAGE:6140626), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX537505 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779G118 (from clone DKFZp779G118); complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060867 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:150983286:150990775:1 Gene:OTTHUMG00000024162 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060868 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:150980509:150987877:1 Gene:OTTHUMG00000024162 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060869 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:150983385:150987892:1 Gene:OTTHUMG00000024162 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060870 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:150985531:150987297:1 Gene:OTTHUMG00000024162 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fep.3 // UCSC Genes // Homo sapiens high mobility group box 3 (HMGB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004feq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens high mobility group box 3 (HMGB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fer.3 // UCSC Genes // Homo sapiens high mobility group box 3 (HMGB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004224 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50 (GPR50), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:151176653:151181465:1 gene:ENSG00000102195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535473 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:150345056:150348932:1 gene:ENSG00000102195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY114101 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50 variant b (GPR50) mRNA, partial cds; alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103696 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50, mRNA (cDNA clone MGC:125342 IMAGE:40006713), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105684 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50, mRNA (cDNA clone MGC:125343 IMAGE:40006715), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060874 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:151176653:151181465:1 Gene:OTTHUMG00000024166 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ntg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50 (GPR50), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011myc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 50 (GPR50), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017980 // RefSeq // Homo sapiens VMA21 vacuolar H+-ATPase homolog (S. cerevisiae) (VMA21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:151397204:151409364:1 gene:ENSG00000160131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:151396566:151405157:1 gene:ENSG00000160131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:151396515:151405157:1 gene:ENSG00000160131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103701 // GenBank // Homo sapiens VMA21 vacuolar H+-ATPase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:125516 IMAGE:40023465), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110800 // GenBank // Homo sapiens VMA21 vacuolar H+-ATPase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:131652 IMAGE:6044374), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060876 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:151397204:151409364:1 Gene:OTTHUMG00000024168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060877 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:151396515:151405157:1 Gene:OTTHUMG00000024168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060878 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:151396566:151405157:1 Gene:OTTHUMG00000024168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004feu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens VMA21 vacuolar H+-ATPase homolog (S. cerevisiae) (VMA21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005140 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel alpha 2 (CNGA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:151738451:151745304:1 gene:ENSG00000183862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126302 // GenBank // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:161580 IMAGE:8992018), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060888 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:151738451:151745304:1 Gene:OTTHUMG00000024173 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fey.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel alpha 2 (CNGA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018558 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, theta (GABRQ), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333733 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:151806637:151821720:1 gene:ENSG00000147402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109210 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, theta, mRNA (cDNA clone MGC:129629 IMAGE:40006890), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370306 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1324:362466:377193:+ gene:ENSG00000147402 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152638183:152657534:1 Gene:OTTHUMG00000022649 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, theta (GABRQ), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005363 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6 (MAGEA6), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_175868 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6 (MAGEA6), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:152766136:152769747:-1 gene:ENSG00000197172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041599 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6, mRNA (cDNA clone MGC:52297 IMAGE:5458512), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067731 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6, mRNA (cDNA clone MGC:86948 IMAGE:4828429), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058747 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152766136:152769747:-1 Gene:OTTHUMG00000022642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058748 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152767047:152769716:-1 Gene:OTTHUMG00000022642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000334898 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152766944:152769677:-1 Gene:OTTHUMG00000022642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6 (MAGEA6), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6 (MAGEA6), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 6 (MAGEA6), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001129765 // RefSeq // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like (NSDHL), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_015922 // RefSeq // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like (NSDHL), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:152830967:152869729:1 gene:ENSG00000147383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:152830967:152869363:1 gene:ENSG00000147383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000245 // GenBank // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:848 IMAGE:3355755), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007816 // GenBank // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:14382 IMAGE:4299819), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060927 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152830967:152869729:1 Gene:OTTHUMG00000024185 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060928 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152830997:152867647:1 Gene:OTTHUMG00000024185 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fgs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like (NSDHL), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fgt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like (NSDHL), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013364 // RefSeq // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen 3 (PNMA3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370264 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:152225387:152227632:1 gene:ENSG00000183837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370265 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:152224766:152228827:1 gene:ENSG00000183837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447306 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:152224766:152228827:1 gene:ENSG00000183837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030761 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic antigen MA3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4798313). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105096 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic antigen MA3, mRNA (cDNA clone MGC:132756 IMAGE:8144099), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060944 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153056409:153060467:1 Gene:OTTHUMG00000024195 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060945 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153056482:153060462:1 Gene:OTTHUMG00000024195 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060946 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:152225387:152227632:1 Gene:OTTHUMG00000024195 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fhc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen 3 (PNMA3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fhd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic antigen MA3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4798313). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cho.1 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen 3 (PNMA3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136273 // RefSeq // Homo sapiens ZFP92 zinc finger protein (ZFP92), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011myo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP92 zinc finger protein (ZFP92), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423874 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:X:152684221:152686705:1 gene:ENSG00000189420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000428676 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:153485856:153487088:1 gene:ENSG00000224963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060961 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153485856:153487088:1 Gene:OTTHUMG00000024203 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001395 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 9 (DUSP9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:153647196:153651318:1 gene:ENSG00000130829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:153642534:153651326:1 gene:ENSG00000130829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:153642492:153648013:1 gene:ENSG00000130829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060837 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 9, mRNA (cDNA clone MGC:71726 IMAGE:30339218), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061020 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153642534:153651326:1 Gene:OTTHUMG00000024211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061022 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153647196:153651318:1 Gene:OTTHUMG00000024211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153642492:153648013:1 Gene:OTTHUMG00000024211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fhx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens dual specificity phosphatase 9 (DUSP9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fhy.4 // UCSC Genes // Homo sapiens dual specificity phosphatase 9 (DUSP9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153643478:153651322:1 Gene:OTTHUMG00000024211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000033 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 (ABCD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:153724868:153744762:1 gene:ENSG00000101986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370129 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:153725817:153729897:1 gene:ENSG00000101986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015541 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:9595 IMAGE:3896490), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025358 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:39449 IMAGE:4907640), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061041 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153724868:153744762:1 Gene:OTTHUMG00000024215 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061042 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153735344:153740604:1 Gene:OTTHUMG00000024215 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061043 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153725817:153729897:1 Gene:OTTHUMG00000024215 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fif.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 (ABCD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516037 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:153121158:153121222:1 gene:ENSG00000251846 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000357566 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153146127:153154425:1 gene:ENSG00000196987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000129563 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153880672:153888990:1 Gene:OTTHUMG00000058499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000513 // RefSeq // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (OPN1MW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001048181 // RefSeq // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive 2 (OPN1MW2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369935 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153448107:153461633:1 gene:ENSG00000147380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468495 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153448157:153459002:1 gene:ENSG00000147380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140938 // GenBank // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive, mRNA (cDNA clone MGC:176615 IMAGE:9056750), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143790 // GenBank // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive, mRNA (cDNA clone MGC:177321 IMAGE:9052304), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058771 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154182596:154196105:1 Gene:OTTHUMG00000022652 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280568 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154190058:154196135:1 Gene:OTTHUMG00000022652 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000320543 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154182668:154193511:1 Gene:OTTHUMG00000022652 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fkb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (OPN1MW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000513 // RefSeq // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (OPN1MW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001048181 // RefSeq // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive 2 (OPN1MW2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:154219756:154233286:1 gene:ENSG00000166160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:154219797:154230651:1 gene:ENSG00000166160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140938 // GenBank // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive, mRNA (cDNA clone MGC:176615 IMAGE:9056750), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143790 // GenBank // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive, mRNA (cDNA clone MGC:177321 IMAGE:9052304), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061149 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154219756:154233286:1 Gene:OTTHUMG00000024231 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280571 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154227196:154233277:1 Gene:OTTHUMG00000024231 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000320544 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154219797:154230651:1 Gene:OTTHUMG00000024231 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fkd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (OPN1MW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027401 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 223, member A (non-protein coding) (FAM223A), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027402 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 223, member B (non-protein coding) (FAM223B), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127600 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154571248:154571960:1 Gene:OTTHUMG00000057425 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mzt.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mzt.1 cpcScore=4.1891000 cnci=-0.2715193 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mzt.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001327 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B (CTAG1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_139250 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 1A (CTAG1A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333128 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153813418:153815074:1 gene:ENSG00000183678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443287 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:153813407:153815075:1 gene:ENSG00000183678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130362 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B, mRNA (cDNA clone MGC:163234 IMAGE:40146393), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061174 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:153813407:153815075:1 Gene:OTTHUMG00000024238 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061175 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154585154:154586816:1 Gene:OTTHUMG00000024238 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fme.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B (CTAG1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017990 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B1 (H2AFB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_080720 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354461 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154113317:154113833:1 gene:ENSG00000198082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101415 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125401 IMAGE:40021541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130510 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B3, mRNA (cDNA clone MGC:163382 IMAGE:40146541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC134365 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:158903 IMAGE:40021542), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082835 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154884972:154885558:1 Gene:OTTHUMG00000034291 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fmu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001007523 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 2 (F8A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001007524 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 3 (F8A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012151 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369446 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154114635:154116335:1 gene:ENSG00000197932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039693 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:44976 IMAGE:5214628), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071963 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:88655 IMAGE:5477018), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000037637 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154886349:154888061:1 Gene:OTTHUMG00000013500 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fmv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003372 // RefSeq // Homo sapiens von Hippel-Lindau binding protein 1 (VBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000459836 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154463966:154467925:1 gene:ENSG00000155959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:155197007:155239044:1 gene:ENSG00000155959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040002 // GenBank HTC // Homo sapiens von Hippel-Lindau binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5786380), containing frame-shift errors. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046094 // GenBank // Homo sapiens von Hippel-Lindau binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:57501 IMAGE:6058145), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286428 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2458:496213:517871:+ gene:ENSG00000155959 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058806 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155216366:155239817:1 Gene:OTTHUMG00000022666 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058807 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155197007:155239044:1 Gene:OTTHUMG00000022666 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058808 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155227144:155238961:1 Gene:OTTHUMG00000022666 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens von Hippel-Lindau binding protein 1 (VBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens von Hippel-Lindau binding protein 1 (VBP1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000453508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155348758:155349799:1 gene:ENSG00000230578 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017990 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B1 (H2AFB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001017991 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B2 (H2AFB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_080720 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:155380787:155381134:1 gene:ENSG00000277858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000198307 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101409 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125404 IMAGE:40021547), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101415 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125401 IMAGE:40021541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101417 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125402 IMAGE:40021543), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130510 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B3, mRNA (cDNA clone MGC:163382 IMAGE:40146541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC134365 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:158903 IMAGE:40021542), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082836 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155380787:155381134:1 Gene:OTTHUMG00000034292 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001007523 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 2 (F8A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001007524 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 3 (F8A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012151 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:155382115:155383230:1 gene:ENSG00000274791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000198444 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039693 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:44976 IMAGE:5214628), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071963 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:88655 IMAGE:5477018), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155382115:155383230:1 Gene:OTTHUMG00000034293 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fni.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039991 // RefSeq // Homo sapiens TMLHE antisense RNA 1 (TMLHE-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155466540:155494110:1 gene:ENSG00000224533 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155489323:155611616:1 gene:ENSG00000224533 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541151 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154695631:154697321:1 gene:ENSG00000224533 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155489323:155611616:1 Gene:OTTHUMG00000022672 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058815 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155466540:155494110:1 Gene:OTTHUMG00000022672 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TMLHE antisense RNA 1 (TMLHE-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005840 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369437 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:154997474:155006702:1 gene:ENSG00000168939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069609 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97072 IMAGE:7262284), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074972 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103904 IMAGE:30915293), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302805 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2458:883677:884543:+ gene:ENSG00000168939 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058823 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155767812:155782459:1 Gene:OTTHUMG00000022675 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cio.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012227 // RefSeq // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:304760:318787:-1 gene:ENSG00000178605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:304529:312463:-1 gene:ENSG00000178605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296003 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56662 complete cds, highly similar to Homo sapiens GTP binding protein 6 (GTPBP6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014636 // GenBank // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:1170 IMAGE:3528598), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058882 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:304750:314217:-1 Gene:OTTHUMG00000022694 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mgy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058883 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:303346:312463:-1 Gene:OTTHUMG00000022694 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:1300256:1300375:-1 gene:ENSG00000223274 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2334295:2336410:-1 gene:ENSG00000223571 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144311 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2334295:2336410:-1 Gene:OTTHUMG00000067406 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037842 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 102 (LINC00102), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2612988:2615347:-1 gene:ENSG00000230542 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055623 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2612988:2615347:-1 Gene:OTTHUMG00000021072 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bry.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 102 (LINC00102), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2852740:2853760:-1 gene:ENSG00000235483 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055632 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:2852740:2853760:-1 Gene:OTTHUMG00000021074 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015419 // RefSeq // Homo sapiens matrix-remodelling associated 5 (MXRA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000217939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:3308565:3346641:-1 gene:ENSG00000101825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381114 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:3226606:3264682:-1 gene:ENSG00000101825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055655 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3308565:3346641:-1 Gene:OTTHUMG00000021083 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens matrix-remodelling associated 5 (MXRA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390912 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:3532117:3532251:-1 gene:ENSG00000212214 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005044 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase, X-linked (PRKX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:3604370:3713608:-1 gene:ENSG00000183943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:3607258:3607365:-1 gene:ENSG00000207332 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:3612310:3670215:-1 gene:ENSG00000183943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041073 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:52228 IMAGE:5485308), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055659 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3604370:3713608:-1 Gene:OTTHUMG00000021087 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055660 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3612310:3670215:-1 Gene:OTTHUMG00000021087 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055661 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3608625:3612281:-1 Gene:OTTHUMG00000021087 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055662 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:3610951:3612255:-1 Gene:OTTHUMG00000021087 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nde.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein kinase, X-linked (PRKX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384590 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:3641443:3641555:-1 gene:ENSG00000207320 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bsc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Ile (anticodon GAT) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bsd.1 // UCSC Genes // transfer RNA Ile (anticodon GAT) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bse.1 // UCSC Genes // transfer RNA Ile (anticodon GAT) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410902 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:4718793:4718914:-1 gene:ENSG00000222834 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055667 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:5653421:5726305:-1 Gene:OTTHUMG00000021092 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055668 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:5653421:5725957:-1 Gene:OTTHUMG00000021092 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:5653421:5726305:-1 gene:ENSG00000236120 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:5653421:5725957:-1 gene:ENSG00000236120 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456559 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:5571464:5644121:-1 gene:ENSG00000236120 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055669 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055669 cpcScore=-0.9138780 cnci=-0.2006355 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516482 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:6061644:6061749:-1 gene:ENSG00000252291 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016378 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, X-linked 2 (VCX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:8169944:8171267:-1 gene:ENSG00000177504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096715 // GenBank // Homo sapiens variable charge, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:118977 IMAGE:40002645), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104167 // GenBank // Homo sapiens variable charge, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:125794 IMAGE:40030354), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC134350 // GenBank // Homo sapiens variable charge, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:149340 IMAGE:40114437), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:8169944:8171267:-1 Gene:OTTHUMG00000021105 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens variable charge, X-linked 2 (VCX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000216 // RefSeq // Homo sapiens Kallmann syndrome 1 sequence (KAL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:8528874:8732186:-1 gene:ENSG00000011201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:8535181:8536936:-1 gene:ENSG00000011201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137426 // GenBank // Homo sapiens Kallmann syndrome 1 sequence, mRNA (cDNA clone MGC:169047 IMAGE:9021424), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055692 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:8528874:8732186:-1 Gene:OTTHUMG00000021107 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055693 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:8565806:8570650:-1 Gene:OTTHUMG00000021107 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055694 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:8535181:8536936:-1 Gene:OTTHUMG00000021107 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Kallmann syndrome 1 sequence (KAL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171186 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A (FAM9A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_174951 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A (FAM9A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:8790795:8801383:-1 gene:ENSG00000183304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:8790795:8801337:-1 gene:ENSG00000183304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112022 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A, mRNA (cDNA clone MGC:138227 IMAGE:8327490), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113449 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A, mRNA (cDNA clone MGC:142009 IMAGE:8322501), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143805 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A, mRNA (cDNA clone MGC:177337 IMAGE:9052320), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:8790795:8801383:-1 Gene:OTTHUMG00000021110 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A (FAM9A), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 9, member A (FAM9A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004csk.2 cpcScore=-1.2496400 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597811 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35877, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45038, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mhx.1 cpcScore=-1.3173700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580770 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48882, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mhy.1 cpcScore=-1.4358800 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45533, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580770 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48882, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45533, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597811 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35877, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45038, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580770 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48882, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bso.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45533, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mia.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mia.1 cpcScore=-1.3173700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mia.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mib.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mib.1 cpcScore=-1.3173700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mib.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580770 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48882, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004csp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45533, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580770 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48882, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45533, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bsr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597811 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35877, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bss.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31487, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595787 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61899, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bst.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45038, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384117 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:9874601:9874701:-1 gene:ENSG00000206844 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:10216598:10216699:-1 gene:ENSG00000222133 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY660577 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:4081578, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY660578 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:4559061, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cuh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens clone IMAGE:4081578, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cui.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone IMAGE:4081578, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:10969891:11111114:-1 gene:ENSG00000234129 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055745 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:10981491:11129258:-1 Gene:OTTHUMG00000021129 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384422 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:11116092:11116193:-1 gene:ENSG00000207151 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516302 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:12148318:12148401:-1 gene:ENSG00000252111 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411014 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:X:12632122:12632316:-1 gene:ENSG00000222946 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// 7SK // lncRNA Db // hg19 chr6:52,860,418-52,860,749 gi|221219022|ref|NR_001445.2| Homo sapiens RNA, 7SK small nuclear (RN7SK), small nuclear RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030727 // RefSeq // Homo sapiens TLR8 antisense RNA 1 (TLR8-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:12902817:12908333:-1 gene:ENSG00000233338 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055776 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:12902817:12908333:-1 Gene:OTTHUMG00000021142 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TLR8 antisense RNA 1 (TLR8-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001135995 // RefSeq // Homo sapiens ataxin 3-like (ATXN3L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:13318236:13319952:-1 gene:ENSG00000123594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137186 // GenBank // Homo sapiens ataxin 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:168806 IMAGE:9021183), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:13318236:13319952:-1 Gene:OTTHUMG00000021146 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ned.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ataxin 3-like (ATXN3L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408351 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:14764975:14765117:-1 gene:ENSG00000221278 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001018113 // RefSeq // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B (FANCB), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152633 // RefSeq // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B (FANCB), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:14843407:14873069:-1 gene:ENSG00000181544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:14843407:14873062:-1 gene:ENSG00000181544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136558 // GenBank // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B, mRNA (cDNA clone MGC:168171 IMAGE:9020548), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136560 // GenBank // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B, mRNA (cDNA clone MGC:168173 IMAGE:9020550), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:14843693:14873052:-1 Gene:OTTHUMG00000021168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055834 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:14865343:14869243:-1 Gene:OTTHUMG00000021168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055835 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:14843407:14873069:-1 Gene:OTTHUMG00000021168 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cwg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B (FANCB), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cwh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group B (FANCB), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020665 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 27 (TMEM27), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:15627318:15665031:-1 gene:ENSG00000147003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014317 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:22707 IMAGE:4048217), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015099 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:22827 IMAGE:3829035), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050606 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:60059 IMAGE:5183554), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055879 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15627318:15665031:-1 Gene:OTTHUMG00000021181 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 27 (TMEM27), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000463076 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:X:15801328:15802658:-1 gene:ENSG00000240178 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354932 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:X:15801328:15802658:-1 Gene:OTTHUMG00000159359 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002725 // RefSeq // Homo sapiens inactivation escape 2 (non-protein coding) (INE2), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cxf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens inactivation escape 2 (non-protein coding) (INE2), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363696 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:15916189:15916303:-1 gene:ENSG00000200566 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362540 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:16912215:16912317:-1 gene:ENSG00000199410 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364597 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:17044380:17044511:-1 gene:ENSG00000201467 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184767 // RefSeq // Homo sapiens BEN domain containing 2 (BEND2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_153346 // RefSeq // Homo sapiens BEN domain containing 2 (BEND2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:18170975:18220750:-1 gene:ENSG00000177324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:18162931:18220883:-1 gene:ENSG00000177324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037301 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:33653 IMAGE:4827886), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096745 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:104533 IMAGE:4830576), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055940 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18162931:18220883:-1 Gene:OTTHUMG00000021211 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cyj.4 // UCSC Genes // Homo sapiens BEN domain containing 2 (BEND2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nfb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens BEN domain containing 2 (BEND2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384298 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:18395994:18396095:-1 gene:ENSG00000207025 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000330 // RefSeq // Homo sapiens retinoschisin 1 (RS1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:18639910:18672109:-1 gene:ENSG00000102104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:18641924:18650537:-1 gene:ENSG00000102104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055949 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18639910:18672109:-1 Gene:OTTHUMG00000021216 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055950 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:18641924:18650537:-1 Gene:OTTHUMG00000021216 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cyo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens retinoschisin 1 (RS1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022btp.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon TAC) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411086 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:18863564:18863708:-1 gene:ENSG00000223018 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383936 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:19985058:19985159:-1 gene:ENSG00000206663 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037414 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 23c (MIR23C), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 23c (MIR23C), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001412 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked (EIF1AX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:20128078:20141826:-1 gene:ENSG00000173674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000793 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:5131 IMAGE:3451631), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067851 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:87461 IMAGE:5288453), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379607 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1124:2200823:2207768:+ gene:ENSG00000173674 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058913 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:20124518:20141844:-1 Gene:OTTHUMG00000022704 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058914 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:20128078:20141826:-1 Gene:OTTHUMG00000022704 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004czt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked (EIF1AX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023358 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 9-like (SCARNA9L), guide RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nfp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 9-like (SCARNA9L), guide RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000364722 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:20136306:20136385:-1 gene:ENSG00000201592 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000365012 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:20136066:20136135:-1 gene:ENSG00000201882 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022btu.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153270 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 34 (KLHL34), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:21654690:21658330:-1 gene:ENSG00000185915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109031 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 34 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:125650 IMAGE:40027951), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056022 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21654690:21658330:-1 Gene:OTTHUMG00000021234 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004czz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch-like family member 34 (KLHL34), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014332 // RefSeq // Homo sapiens small muscle protein, X-linked (SMPX), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_045617 // RefSeq // Homo sapiens small muscle protein, X-linked (SMPX), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:21706338:21758022:-1 gene:ENSG00000091482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005948 // GenBank // Homo sapiens small muscle protein, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:14584 IMAGE:4246501), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379494 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1124:699826:718898:+ gene:ENSG00000091482 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056023 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21705972:21758163:-1 Gene:OTTHUMG00000021235 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:21706338:21758022:-1 Gene:OTTHUMG00000021235 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004daa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small muscle protein, X-linked (SMPX), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small muscle protein, X-linked (SMPX), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408859 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:23120832:23120905:-1 gene:ENSG00000221786 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458766 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:23525328:23525430:-1 gene:ENSG00000238327 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024921 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L9 (RPL9), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// D28399 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L9, 5UTR region. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022btz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein L9 (RPL9), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136233 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of Ty 20 homolog (S. cerevisiae)-like 2 (SUPT20HL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mjw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens suppressor of Ty 20 homolog (S. cerevisiae)-like 2 (SUPT20HL2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_139058 // RefSeq // Homo sapiens aristaless related homeobox (ARX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:25003694:25015948:-1 gene:ENSG00000004848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056109 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:25003694:25015948:-1 Gene:OTTHUMG00000021275 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens aristaless related homeobox (ARX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390786 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:25206370:25206460:-1 gene:ENSG00000212075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056136 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:27174920:27398997:-1 Gene:OTTHUMG00000021298 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:27174920:27398997:-1 gene:ENSG00000228933 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024027 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4824334. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbt.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dbt.2 cpcScore=-0.2894510 cnci=-0.2934917 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4824334. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516677 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:27252119:27252235:-1 gene:ENSG00000252486 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002784 // RefSeq // Homo sapiens SMEK homolog 3, suppressor of mek1 (Dictyostelium) pseudogene (SMEK3P), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SMEK homolog 3, suppressor of mek1 (Dictyostelium) pseudogene (SMEK3P), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017930 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 8-like 1 (DCAF8L1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:27977993:27981355:-1 gene:ENSG00000226372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056150 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:27977993:27981355:-1 Gene:OTTHUMG00000021312 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dbx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 8-like 1 (DCAF8L1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364486 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:28982852:28982970:-1 gene:ENSG00000201356 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000475 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 1 (NR0B1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:30305674:30308488:-1 gene:ENSG00000169297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:30304206:30309598:-1 gene:ENSG00000169297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453287 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:30323938:30327495:-1 gene:ENSG00000169297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011564 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:20161 IMAGE:4637694), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056161 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30304206:30309598:-1 Gene:OTTHUMG00000021323 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056162 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30305674:30308488:-1 Gene:OTTHUMG00000021323 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dcf.4 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 1 (NR0B1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025159 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 21 (CXorf21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020611 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:22215 IMAGE:4768735), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378962 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3326:351077:351979:- gene:ENSG00000120280 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056164 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:30558824:30577844:-1 Gene:OTTHUMG00000021325 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dcg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 21 (CXorf21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bui.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 21 (CXorf21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031894 // RefSeq // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 17 (FTHL17), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069069 // GenBank // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 17, mRNA (cDNA clone MGC:95343 IMAGE:7216882), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069538 // GenBank // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 17, mRNA (cDNA clone MGC:97027 IMAGE:7262236), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC100768 // GenBank // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 17, mRNA (cDNA clone MGC:118762 IMAGE:40000168), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359202 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3326:850610:850864:+ gene:ENSG00000132446 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056178 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:31071241:31072053:-1 Gene:OTTHUMG00000021332 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dcl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 17 (FTHL17), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:32641474:32641559:-1 gene:ENSG00000221348 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459244 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:32866024:32866122:-1 gene:ENSG00000238969 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203408 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member A (FAM47A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000346193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:34129756:34132311:-1 gene:ENSG00000185448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026171 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member A, mRNA (cDNA clone MGC:27003 IMAGE:4827969), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056205 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:34129756:34132311:-1 Gene:OTTHUMG00000021339 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 47, member A (FAM47A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031442 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 47 (TMEM47), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000275954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:34627064:34657288:-1 gene:ENSG00000147027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK311054 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18096. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039242 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:32949 IMAGE:5277761), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056209 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:34627064:34657288:-1 Gene:OTTHUMG00000021343 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ddh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 47 (TMEM47), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ngs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 47 (TMEM47), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410932 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:35056331:35056458:-1 gene:ENSG00000222864 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:36021939:36022045:-1 gene:ENSG00000206733 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006520 // RefSeq // Homo sapiens dynein, light chain, Tctex-type 3 (DYNLT3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:37838836:37847637:-1 gene:ENSG00000165169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:37836757:37847514:-1 gene:ENSG00000165169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:37840543:37847408:-1 gene:ENSG00000165169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000968 // GenBank // Homo sapiens dynein, light chain, Tctex-type 3, mRNA (cDNA clone MGC:5007 IMAGE:3448623), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080876 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37838836:37847637:-1 Gene:OTTHUMG00000033172 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080877 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37840543:37847408:-1 Gene:OTTHUMG00000033172 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080878 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:37836757:37847514:-1 Gene:OTTHUMG00000033172 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dds.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dynein, light chain, Tctex-type 3 (DYNLT3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408539 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:38023895:38023986:-1 gene:ENSG00000221466 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516241 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:38308112:38308241:-1 gene:ENSG00000252050 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384394 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:39081180:39081285:-1 gene:ENSG00000207122 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038968 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1281 (LINC01281), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:39305634:39327361:-1 gene:ENSG00000235304 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:39304956:39327362:-1 gene:ENSG00000235304 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060659 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:39304956:39327362:-1 Gene:OTTHUMG00000024095 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144797 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:39305634:39327361:-1 Gene:OTTHUMG00000024095 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dek.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC286442 (LOC286442), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:40535502:40535563:-1 gene:ENSG00000238730 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027761 // RefSeq // Homo sapiens A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene (LOC100132831), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mkp.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390905 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:41570923:41571029:-1 gene:ENSG00000212207 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516101 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:41655266:41655340:-1 gene:ENSG00000251910 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391258 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:42139425:42139530:-1 gene:ENSG00000212560 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384169 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:42174279:42174385:-1 gene:ENSG00000206896 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002191 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2 pseudogene 9 (PPP1R2P9), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dfv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2 pseudogene 9 (PPP1R2P9), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000266 // RefSeq // Homo sapiens Norrie disease (pseudoglioma) (NDP), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:43949682:43973386:-1 gene:ENSG00000124479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029901 // GenBank // Homo sapiens Norrie disease (pseudoglioma), mRNA (cDNA clone MGC:34503 IMAGE:5179578), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378062 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2795:397682:407972:+ gene:ENSG00000124479 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056309 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:43948776:43973504:-1 Gene:OTTHUMG00000021391 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056310 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:43949682:43973386:-1 Gene:OTTHUMG00000021391 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dga.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Norrie disease (pseudoglioma) (NDP), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025184 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand domain (C-terminal) containing 2 (EFHC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333807 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:44007129:44202923:-1 gene:ENSG00000183690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:44147882:44225756:-1 gene:ENSG00000183690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378056 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:44094631:44202923:-1 gene:ENSG00000183690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031039 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain (C-terminal) containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:32957 IMAGE:5272398), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR749363 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G08235 (from clone DKFZp686G08235). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056312 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44148665:44343672:-1 Gene:OTTHUMG00000021393 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056314 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44147882:44225756:-1 Gene:OTTHUMG00000021393 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens EF-hand domain (C-terminal) containing 2 (EFHC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EF-hand domain (C-terminal) containing 2 (EFHC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056313 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44148712:44343665:-1 Gene:OTTHUMG00000021393 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173794 // RefSeq // Homo sapiens FUN14 domain containing 1 (FUNDC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:44523772:44542304:-1 gene:ENSG00000069509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035015 // GenBank // Homo sapiens FUN14 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33479 IMAGE:4812334), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042813 // GenBank // Homo sapiens FUN14 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:51029 IMAGE:5274638), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378045 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1203:220655:231395:- gene:ENSG00000069509 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056320 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44523639:44543001:-1 Gene:OTTHUMG00000021399 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056321 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:44523772:44542304:-1 Gene:OTTHUMG00000021399 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens FUN14 domain containing 1 (FUNDC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516311 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:44577354:44577438:-1 gene:ENSG00000252120 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024689 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 36 (CXorf36), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_176819 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 36 (CXorf36), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:45162310:45200901:-1 gene:ENSG00000147113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:45148374:45200901:-1 gene:ENSG00000147113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:45149900:45191933:-1 gene:ENSG00000147113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056333 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:45148374:45200901:-1 Gene:OTTHUMG00000021403 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056334 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:45149900:45191933:-1 Gene:OTTHUMG00000021403 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056335 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:45162310:45200901:-1 Gene:OTTHUMG00000021403 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056336 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:45191393:45191869:-1 Gene:OTTHUMG00000021403 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 36 (CXorf36), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 36 (CXorf36), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000534915 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:45240813:45241325:-1 gene:ENSG00000237782 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029635 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 221 (MIR221), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385135 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:45746157:45746266:-1 gene:ENSG00000207870 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mle.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 221 (MIR221), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029636 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 222 (MIR222), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384992 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:45747015:45747126:-1 gene:ENSG00000207725 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mlf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 222 (MIR222), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414772 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:45707328:45710447:-1 gene:ENSG00000231566 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK098783 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25917 fis, clone CBR04926. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:45848074:45851490:-1 Gene:OTTHUMG00000021411 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056348 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056348 cpcScore=1.2401600 cnci=-0.2254895 gene:OTTHUMG00000021411 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dgk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ25917 fis, clone CBR04926. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391045 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:45892912:45892979:-1 gene:ENSG00000212347 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_046101 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 31 (CXorf31), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:46887417:46899703:-1 gene:ENSG00000204904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056374 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:46887417:46899703:-1 Gene:OTTHUMG00000021429 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364580 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:X:47211242:47211348:-1 gene:ENSG00000201450 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006950 // RefSeq // Homo sapiens synapsin I (SYN1), transcript variant Ia, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_133499 // RefSeq // Homo sapiens synapsin I (SYN1), transcript variant Ib, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:47571898:47619853:-1 gene:ENSG00000008056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:47571904:47619853:-1 gene:ENSG00000008056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056445 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:47571898:47619853:-1 Gene:OTTHUMG00000021454 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056446 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:47571904:47619853:-1 Gene:OTTHUMG00000021454 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004did.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapsin I (SYN1), transcript variant Ib, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004die.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapsin I (SYN1), transcript variant Ia, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC104165 // GenBank // Homo sapiens hypothetical gene supported by BC067869, mRNA (cDNA clone MGC:125775 IMAGE:40030250), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112980 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40030255. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dip.3 // UCSC Genes // SubName: Full=Hypothetical gene supported by BC067869; // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364647 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:48153980:48154074:-1 gene:ENSG00000201517 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021015 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 5 (SSX5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_175723 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 5 (SSX5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48186220:48196763:-1 gene:ENSG00000165583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000347757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:48186220:48196763:-1 gene:ENSG00000165583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48186220:48195358:-1 gene:ENSG00000165583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016640 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 5, mRNA (cDNA clone MGC:9494 IMAGE:3923927), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056465 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48186220:48196763:-1 Gene:OTTHUMG00000021471 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056466 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48186220:48195358:-1 Gene:OTTHUMG00000021471 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056467 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48186775:48192381:-1 Gene:OTTHUMG00000021471 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004diz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 5 (SSX5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dja.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 5 (SSX5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000376909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48296816:48304867:-1 gene:ENSG00000204648 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000407081 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48156255:48165614:-1 gene:ENSG00000204648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056489 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48296816:48304867:-1 Gene:OTTHUMG00000021490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bvu.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001034832 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B (SSX4B), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001040612 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B (SSX4B), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005636 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4 (SSX4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_175729 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4 (SSX4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376884 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48261524:48271344:-1 gene:ENSG00000198946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396928 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48261524:48271344:-1 gene:ENSG00000198946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005325 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4, mRNA (cDNA clone MGC:12411 IMAGE:3961688), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137394 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 4B, mRNA (cDNA clone MGC:169015 IMAGE:9021392), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056510 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48402078:48411899:-1 Gene:OTTHUMG00000021497 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004djh.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dji.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459609 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:48420090:48420189:-1 gene:ENSG00000239017 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000376775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48568014:48574860:-1 gene:ENSG00000204620 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383996 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:48724455:48724561:-1 gene:ENSG00000206723 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:48776965:48777071:-1 gene:ENSG00000207367 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013271 // RefSeq // Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor (PCSK1N), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48831094:48835633:-1 gene:ENSG00000102109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476838 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48689506:48693970:-1 gene:ENSG00000102109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002851 // GenBank // Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:3466 IMAGE:3660001), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083443 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:48689506:48693970:-1 Gene:OTTHUMG00000034502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083444 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48831094:48835633:-1 Gene:OTTHUMG00000034502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083445 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48832263:48834827:-1 Gene:OTTHUMG00000034502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dkz.3 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006875 // RefSeq // Homo sapiens Pim-2 proto-oncogene, serine/threonine kinase (PIM2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:48913182:48919024:-1 gene:ENSG00000102096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48914104:48914914:-1 gene:ENSG00000102096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018111 // GenBank // Homo sapiens pim-2 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:8925 IMAGE:3913552), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060805 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48913182:48919024:-1 Gene:OTTHUMG00000024132 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060806 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48914396:48915735:-1 Gene:OTTHUMG00000024132 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060807 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48914104:48914914:-1 Gene:OTTHUMG00000024132 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dls.3 // UCSC Genes // Homo sapiens pim-2 oncogene (PIM2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004979 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Shal-related subfamily, member 1 (KCND1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:48961378:48968386:-1 gene:ENSG00000102057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK094431 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37112 fis, clone BRACE2021433, highly similar to Potassium voltage-gated channel subfamily Dmember 1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045659 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Shal-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:43677 IMAGE:5271042), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218176 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2405:79902:85652:+ gene:ENSG00000102057 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060774 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48961386:48971569:-1 Gene:OTTHUMG00000024127 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48961378:48968386:-1 Gene:OTTHUMG00000024127 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060776 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:48966090:48966758:-1 Gene:OTTHUMG00000024127 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dlw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Shal-related subfamily, member 1 (KCND1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dlx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Shal-related subfamily, member 1 (KCND1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015698 // RefSeq // Homo sapiens G patch domain and KOW motifs (GPKOW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000156109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49113389:49123801:-1 gene:ENSG00000068394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000397 // GenBank // Homo sapiens G patch domain and KOW motifs, mRNA (cDNA clone MGC:8517 IMAGE:2822421), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056535 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49113389:49123801:-1 Gene:OTTHUMG00000021511 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dmr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G patch domain and KOW motifs (GPKOW), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003785 // RefSeq // Homo sapiens P antigen family, member 1 (prostate associated) (PAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49687450:49695993:-1 gene:ENSG00000068985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004861 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 1 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:10423 IMAGE:3829941), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49687450:49695993:-1 Gene:OTTHUMG00000033224 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dom.3 // UCSC Genes // Homo sapiens P antigen family, member 1 (prostate associated) (PAGE1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026742 // RefSeq // Homo sapiens USP27X antisense RNA 1 (head to head) (USP27X-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49876724:49879241:-1 gene:ENSG00000234390 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060838 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49876724:49879241:-1 Gene:OTTHUMG00000024154 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004doo.4 // UCSC Genes // Homo sapiens USP27X antisense RNA 1 (head to head) (USP27X-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:49945336:49945442:-1 gene:ENSG00000201341 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365625 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:50171197:50171297:-1 gene:ENSG00000202495 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013742 // RefSeq // Homo sapiens diacylglycerol kinase, kappa (DGKK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376025 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:50108408:50213737:-1 gene:ENSG00000204466 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000546288 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:50111897:50213737:-1 gene:ENSG00000204466 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137319 // GenBank // Homo sapiens diacylglycerol kinase, kappa, mRNA (cDNA clone MGC:168939 IMAGE:9021316), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000368187 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:50365409:50470738:-1 Gene:OTTHUMG00000021520 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010njr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens diacylglycerol kinase, kappa (DGKK), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dpc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36394 fis, clone THYMU2009104. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018159 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 11 (NUDT11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009942 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 11, mRNA (cDNA clone MGC:12595 IMAGE:4303422), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375992 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1436:595265:595744:+ gene:ENSG00000196368 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056579 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:51490011:51496596:-1 Gene:OTTHUMG00000021531 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010njt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 11 (NUDT11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022bwm.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTC) // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033772 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 1 (CENPVP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033773 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 2 (CENPVP2), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens centromere protein V pseudogene 1 (CENPVP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516568 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:51870706:51870809:-1 gene:ENSG00000252377 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000375644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:52050860:52054255:-1 gene:ENSG00000182776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137157 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9021154. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056604 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52050860:52054255:-1 Gene:OTTHUMG00000021545 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dpp.2 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative uncharacterized protein FLJ39060; // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC094793 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30343264. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dqd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dqd.2 cpcScore=0.4045140 cnci=-0.3008187 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dqd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30344146. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079538 // RefSeq // [retired]Homo sapiens X antigen family, member 2B (XAGE2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_130777 // RefSeq // Homo sapiens X antigen family, member 2 (XAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330906 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:52380351:52387001:-1 gene:ENSG00000185751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009232 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:16513 IMAGE:3960352), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066311 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:87153 IMAGE:30330532), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056650 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:52380351:52387001:-1 Gene:OTTHUMG00000021563 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dql.3 // UCSC Genes // Homo sapiens X antigen family, member 2 (XAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173358 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 7 (SSX7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52644090:52654900:-1 gene:ENSG00000187754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52644090:52654900:-1 Gene:OTTHUMG00000021572 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dqx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma, X breakpoint 7 (SSX7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009616 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member N5 (SPANXN5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52796144:52798101:-1 gene:ENSG00000204363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52796144:52798101:-1 Gene:OTTHUMG00000021590 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member N5 (SPANXN5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_130776 // RefSeq // Homo sapiens X antigen family, member 3 (XAGE3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_133179 // RefSeq // Homo sapiens X antigen family, member 3 (XAGE3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000346279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52862528:52868068:-1 gene:ENSG00000171402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:52862525:52867301:-1 gene:ENSG00000171402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062680 // GenBank // Homo sapiens X antigen family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:71925 IMAGE:4619720), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52862528:52868068:-1 Gene:OTTHUMG00000021587 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:52862525:52867301:-1 Gene:OTTHUMG00000021587 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dre.3 // UCSC Genes // Homo sapiens X antigen family, member 3 (XAGE3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004drf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens X antigen family, member 3 (XAGE3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:53212408:53214679:-1 gene:ENSG00000235262 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056729 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:53212408:53214679:-1 Gene:OTTHUMG00000021604 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029513 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 98 (MIR98), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354077 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:53583184:53583302:-1 gene:ENSG00000207787 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dsr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 98 (MIR98), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dsr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dsr.1 cpcScore=-1.2972500 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029484 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7f-2 (MIRLET7F2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:53557192:53557274:-1 gene:ENSG00000208012 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dss.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA let-7f-2 (MIRLET7F2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516366 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:54091278:54091399:-1 gene:ENSG00000252175 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002838 // RefSeq // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 3 (WNK3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020922 // RefSeq // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 3 (WNK3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:54192825:54358005:-1 gene:ENSG00000196632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:54192823:54358005:-1 gene:ENSG00000196632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375159 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1058:185717:361531:+ gene:ENSG00000196632 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056798 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54192823:54358005:-1 Gene:OTTHUMG00000021626 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056799 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54198324:54333673:-1 Gene:OTTHUMG00000021626 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056800 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54333178:54358642:-1 Gene:OTTHUMG00000021626 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 3 (WNK3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 3 (WNK3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004463 // RefSeq // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1 (FGD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51291 complete cds, highly similar to FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034530 // GenBank // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:24891 IMAGE:4938457), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375135 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1058:47347:85104:+ gene:ENSG00000102302 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056801 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54445454:54496166:-1 Gene:OTTHUMG00000021627 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1 (FGD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011moi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1 (FGD1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198510 // RefSeq // Homo sapiens inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family, member 6 (ITIH6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:54748899:54798240:-1 gene:ENSG00000102313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498398 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:54787197:54788608:-1 gene:ENSG00000102313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54748899:54798240:-1 Gene:OTTHUMG00000021634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056829 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54787197:54788608:-1 Gene:OTTHUMG00000021634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dtj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family, member 6 (ITIH6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002625 // RefSeq // Homo sapiens 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1 (PFKFB1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:54933134:54994078:-1 gene:ENSG00000158571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:54932961:54994078:-1 gene:ENSG00000158571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:54933134:54998534:-1 gene:ENSG00000158571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300724 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56883 complete cds, highly similar to 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096077 // GenBank // Homo sapiens 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:116715 IMAGE:40000710), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096078 // GenBank // Homo sapiens 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:116716 IMAGE:40000711), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096079 // GenBank // Homo sapiens 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:116717 IMAGE:40000713), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056847 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:54932961:54994078:-1 Gene:OTTHUMG00000021643 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dty.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nkd.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mol.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001190708 // RefSeq // Homo sapiens MT-RNR2-like 10 (MTRNR2L10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55181391:55182920:-1 gene:ENSG00000256045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens MT-RNR2-like 10 (MTRNR2L10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033460 // RefSeq // Homo sapiens P antigen family, member 3 (prostate associated) (PAGE3), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55258412:55264846:-1 gene:ENSG00000204279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000519203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:55258478:55264730:-1 gene:ENSG00000204279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140001 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 3 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:166975 IMAGE:8860308), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140741 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 3 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:176418 IMAGE:9021609), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144449 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 3 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:177992 IMAGE:9052975), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056867 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55258412:55264846:-1 Gene:OTTHUMG00000021654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000381604 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55258478:55264730:-1 Gene:OTTHUMG00000021654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mon.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxs.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_201286 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 51 (USP51), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55484616:55489202:-1 gene:ENSG00000247746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056871 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55484616:55489202:-1 Gene:OTTHUMG00000021656 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dun.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 51 (USP51), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 51 (USP51), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000513415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:55654721:55656965:-1 gene:ENSG00000169164 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517152 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:55930020:55930089:-1 gene:ENSG00000252961 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002308 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein pseudogene 1 (UQCRBP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nki.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019003 // RefSeq // Homo sapiens spindlin family, member 2A (SPIN2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:57135650:57137625:-1 gene:ENSG00000147059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:57134530:57136997:-1 gene:ENSG00000147059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071694 // GenBank // Homo sapiens spindlin family, member 2A, mRNA (cDNA clone MGC:87942 IMAGE:5201217), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058915 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57134530:57136997:-1 Gene:OTTHUMG00000022705 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058916 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57135650:57137625:-1 Gene:OTTHUMG00000022705 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spindlin family, member 2A (SPIN2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spindlin family, member 2A (SPIN2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007156 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, X-linked, duplicated A (ZXDA), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC059356 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, X-linked, duplicated A, mRNA (cDNA clone MGC:71491 IMAGE:30347480), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358697 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1809:87534:89162:+ gene:ENSG00000198205 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056925 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:57906708:57910820:-1 Gene:OTTHUMG00000021688 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dve.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, X-linked, duplicated A (ZXDA), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450308 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:62519126:62519551:-1 gene:ENSG00000230823 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012968 // RefSeq // Homo sapiens spindlin family, member 4 (SPIN4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:63347228:63351344:-1 gene:ENSG00000186767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043412 // GenBank // Homo sapiens spindlin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:50957 IMAGE:6156224), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112360 // GenBank // Homo sapiens spindlin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:133224 IMAGE:40032302), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335144 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1118:200678:201427:- gene:ENSG00000186767 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056933 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:63347228:63351344:-1 Gene:OTTHUMG00000021696 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spindlin family, member 4 (SPIN4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015353 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1278 (LINC01278), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:63509942:63561049:-1 gene:ENSG00000235437 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:sense_overlapping // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK130294 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26784 fis, clone PRS04220. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AL080202 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434F172 (from clone DKFZp434F172). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056936 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:63509942:63561049:-1 Gene:OTTHUMG00000021699 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC92249 (LOC92249), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC92249 (LOC92249), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bxz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ13736 fis, clone PLACE3000156. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:63670196:63671502:-1 gene:ENSG00000231729 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056935 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:63670196:63671502:-1 Gene:OTTHUMG00000021698 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_031567 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 1468 (MIR1468), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000410600 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:63786002:63786087:-1 gene:ENSG00000222532 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bya.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 1468 (MIR1468), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152424 // RefSeq // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 1 (AMER1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374869 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:64185117:64205744:-1 gene:ENSG00000184675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000403336 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:63405997:63413166:-1 gene:ENSG00000184675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330258 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1118:945736:949092:- gene:ENSG00000184675 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056945 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64185117:64205744:-1 Gene:OTTHUMG00000021703 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000316584 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64185117:64205744:-1 Gene:OTTHUMG00000021703 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 1 (AMER1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022byb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 1 (AMER1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033742 // RefSeq // Homo sapiens FERM domain containing 8 pseudogene 1 (FRMD8P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bye.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FERM domain containing 8 pseudogene 1 (FRMD8P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516336 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:68102068:68102132:-1 gene:ENSG00000252145 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384020 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:68539443:68539549:-1 gene:ENSG00000206747 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002565 // RefSeq // Homo sapiens pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4 (P2RY4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70258170:70259764:-1 gene:ENSG00000186912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC095503 // GenBank // Homo sapiens pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4, mRNA (cDNA clone MGC:111710 IMAGE:30706597), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096067 // GenBank // Homo sapiens pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4, mRNA (cDNA clone MGC:116702 IMAGE:40000385), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057058 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70258170:70259764:-1 Gene:OTTHUMG00000021769 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dxz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4 (P2RY4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016484 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 11 (PDZD11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000239666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70286595:70289979:-1 gene:ENSG00000120509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70286892:70289945:-1 gene:ENSG00000120509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70287735:70289913:-1 gene:ENSG00000120509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY358829 // GenBank // Homo sapiens clone DNA143010 GWSC6486 (UNQ6486) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012996 // GenBank // Homo sapiens PDZ domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:3404 IMAGE:3530647), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057060 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70286595:70289979:-1 Gene:OTTHUMG00000021771 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057061 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70286892:70289945:-1 Gene:OTTHUMG00000021771 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057062 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70287735:70289913:-1 Gene:OTTHUMG00000021771 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057063 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70287767:70290514:-1 Gene:OTTHUMG00000021771 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dyd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PDZ domain containing 11 (PDZD11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dye.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PDZ domain containing 11 (PDZD11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362899 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:70846079:70846295:-1 gene:ENSG00000277492 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000199769 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001048164 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (SLC7A3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032803 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (SLC7A3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:70925588:70931125:-1 gene:ENSG00000165349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70925582:70931096:-1 gene:ENSG00000165349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033816 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:44839 IMAGE:5206252), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70925582:70931096:-1 Gene:OTTHUMG00000021780 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:70925588:70931125:-1 Gene:OTTHUMG00000021780 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dyn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (SLC7A3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dyo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (SLC7A3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391303 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:71020275:71020438:-1 gene:ENSG00000212605 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001025265 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 65 (CXorf65), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033212 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 65 (CXorf65), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:71103987:71106605:-1 gene:ENSG00000204165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485951 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:70323837:70326472:-1 gene:ENSG00000204165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057089 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71103987:71106605:-1 Gene:OTTHUMG00000021785 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057090 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71106001:71106570:-1 Gene:OTTHUMG00000021785 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057091 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:70323838:70326561:-1 Gene:OTTHUMG00000021785 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057092 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:70323837:70326472:-1 Gene:OTTHUMG00000021785 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057093 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71103987:71104448:-1 Gene:OTTHUMG00000021785 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 65 (CXorf65), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 65 (CXorf65), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001568 // RefSeq // Homo sapiens brain cytoplasmic RNA 1 (BCYRN1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens brain cytoplasmic RNA 1 (BCYRN1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516716 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:70660367:70660477:-1 gene:ENSG00000252525 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362881 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:71491066:71491167:-1 gene:ENSG00000199751 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002226 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of growth family, X-linked, pseudogene (INGX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:71491682:71492449:-1 gene:ENSG00000243468 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dzz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens inhibitor of growth family, X-linked, pseudogene (INGX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dzz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dzz.2 cpcScore=1.2492100 cnci=-0.1782794 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001142797 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (CXCR3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001504 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (CXCR3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373687 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:70836184:70838367:-1 gene:ENSG00000186810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71615916:71618517:-1 gene:ENSG00000186810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034403 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:34593 IMAGE:5176136), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373691 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1696:626136:627175:- gene:ENSG00000186810 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081854 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71615916:71618510:-1 Gene:OTTHUMG00000033326 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144141 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71615916:71618517:-1 Gene:OTTHUMG00000033326 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eaf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (CXCR3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (CXCR3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bys.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (CXCR3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058987 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71662995:71665753:-1 Gene:OTTHUMG00000022722 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058988 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71662998:71664271:-1 Gene:OTTHUMG00000022722 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71662995:71665753:-1 gene:ENSG00000237265 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71662998:71664271:-1 gene:ENSG00000237265 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145139 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49B (CXorf49B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001145140 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49 (CXorf49), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:71714371:71716387:-1 gene:ENSG00000215115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:X:71714376:71718151:-1 gene:ENSG00000215115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058911 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:71714371:71716387:-1 Gene:OTTHUMG00000022702 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mpy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 49B (CXorf49B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408757 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:70979235:70979305:-1 gene:ENSG00000221684 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364522 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:71965972:71966074:-1 gene:ENSG00000201392 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024455 // RefSeq // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 4 (RGAG4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545866 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:71346958:71351758:-1 gene:ENSG00000242732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC151224 // GenBank // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:166799 IMAGE:9007468), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479991 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4916:62257:63735:+ gene:ENSG00000242732 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057171 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:72127110:72131901:-1 Gene:OTTHUMG00000021808 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eaj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 4 (RGAG4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nlh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retrotransposon gag domain containing 4 (RGAG4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401114 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:72152336:72152414:-1 gene:ENSG00000215933 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017669 // RefSeq // Homo sapiens excision repair cross-complementation group 6-like (ERCC6L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:72204660:72239047:-1 gene:ENSG00000186871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373657 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:72204657:72239027:-1 gene:ENSG00000186871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK056494 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31932 fis, clone NT2RP7006296, weakly similar to EXCISION REPAIR PROTEIN ERCC-6. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111486 // GenBank // Homo sapiens excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like, mRNA (cDNA clone MGC:131695 IMAGE:5529990), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057173 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:72204657:72239027:-1 Gene:OTTHUMG00000021810 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057174 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:72204660:72239047:-1 Gene:OTTHUMG00000021810 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eap.1 // UCSC Genes // Homo sapiens excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like (ERCC6L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eaq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like (ERCC6L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410980 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:72284945:72285045:-1 gene:ENSG00000238926 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410878 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:72376979:72377169:-1 gene:ENSG00000222810 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365612 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:72726122:72726337:-1 gene:ENSG00000273788 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000202482 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364401 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:72740706:72740869:-1 gene:ENSG00000201271 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034116 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 684 (LINC00684), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413458 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:72001689:72002454:-1 gene:ENSG00000229583 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445437 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:72001689:72002484:-1 gene:ENSG00000229583 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086423 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086423 cpcScore=-1.2440400 cnci=-0.3036265 gene:OTTHUMG00000035613 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086424 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086424 cpcScore=-1.1757500 cnci=-0.3432501 gene:OTTHUMG00000035613 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022byy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 684 (LINC00684), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012977 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2A (PABPC1L2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:73077276:73079512:-1 gene:ENSG00000186288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453389 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72298113:72299258:-1 gene:ENSG00000186288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136492 // GenBank // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:168104 IMAGE:9020481), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057222 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73077276:73079512:-1 Gene:OTTHUMG00000021824 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2A (PABPC1L2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027291 // RefSeq // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 6 (NAP1L6), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:73126037:73128080:-1 gene:ENSG00000204118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057224 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73126037:73128080:-1 Gene:OTTHUMG00000021826 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 6 (NAP1L6), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021963 // RefSeq // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 2 (NAP1L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:73212299:73214848:-1 gene:ENSG00000186462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536638 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72432492:72434668:-1 gene:ENSG00000186462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026325 // GenBank // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:26243 IMAGE:4798964), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057225 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:73212299:73214848:-1 Gene:OTTHUMG00000021827 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 2 (NAP1L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384755 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:73397531:73397637:-1 gene:ENSG00000207486 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029423 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 4 pseudogene 1 (MAP2K4P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bza.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 4 pseudogene 1 (MAP2K4P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028379 // RefSeq // Homo sapiens FTX transcript, XIST regulator (non-protein coding) (FTX), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:74278374:74292600:-1 gene:ENSG00000230590 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK057701 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33139 fis, clone UTERU1000109. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057255 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74278374:74292600:-1 Gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057256 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74247864:74293527:-1 Gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057257 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74280401:74292351:-1 Gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057258 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74280461:74292075:-1 Gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057259 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74280931:74293539:-1 Gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FTX transcript, XIST regulator (non-protein coding) (FTX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nlq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FTX transcript, XIST regulator (non-protein coding) (FTX), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030398 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 421 (MIR421), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000365696 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:74218373:74218484:-1 gene:ENSG00000202566 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 421 (MIR421), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030620 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 374b (MIR374B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390738 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:74218517:74218628:-1 gene:ENSG00000212027 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 374b (MIR374B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030258 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 545 (MIR545), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385085 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:74287104:74287209:-1 gene:ENSG00000207820 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bze.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 545 (MIR545), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030785 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 374a (MIR374A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362298 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:74287276:74287386:-1 gene:ENSG00000199168 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mqm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 374a (MIR374A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mqm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mqm.1 cpcScore=-1.3818900 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016120 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein, LIM domain interacting (RLIM), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_183353 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein, LIM domain interacting (RLIM), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:74585217:74614617:-1 gene:ENSG00000131263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013357 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein, LIM domain interacting, mRNA (cDNA clone MGC:15161 IMAGE:3834870), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000349225 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold13:663855:668004:+ gene:ENSG00000131263 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057268 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74585217:74614617:-1 Gene:OTTHUMG00000021859 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057269 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:74590118:74614617:-1 Gene:OTTHUMG00000021859 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein, LIM domain interacting (RLIM), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein, LIM domain interacting (RLIM), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030737 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 3 pseudogene 1 (TTC3P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 3 pseudogene 1 (TTC3P1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427129 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:74963216:74965819:-1 gene:ENSG00000215105 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_138703 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family E, 2 (MAGEE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:75782988:75785236:-1 gene:ENSG00000186675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093964 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family E, 2, mRNA (cDNA clone MGC:120999 IMAGE:7939809), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111949 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family E, 2, mRNA (cDNA clone MGC:138154 IMAGE:8327417), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057288 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:75782988:75785236:-1 Gene:OTTHUMG00000021870 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ecj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family E, 2 (MAGEE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411327 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:76655009:76655127:-1 gene:ENSG00000223259 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029909 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 384 (MIR384), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nlw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 384 (MIR384), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385260 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:77005404:77005501:-1 gene:ENSG00000207995 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001029891 // RefSeq // Homo sapiens phosphoglycerate mutase family member 4 (PGAM4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:77968874:77969638:-1 gene:ENSG00000226784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000128371 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:77968874:77969638:-1 Gene:OTTHUMG00000057865 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ecy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphoglycerate mutase family member 4 (PGAM4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015975 // RefSeq // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa (TAF9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:78129748:78139706:-1 gene:ENSG00000187325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009566 // GenBank // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:12251 IMAGE:3996687), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010350 // GenBank // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:13324 IMAGE:4276335), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071649 // GenBank // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:87820 IMAGE:5246715), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146952 // GenBank // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:182055 IMAGE:9056880), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146960 // GenBank // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:182063 IMAGE:9056888), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057308 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78129748:78139706:-1 Gene:OTTHUMG00000021887 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057309 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78131721:78139622:-1 Gene:OTTHUMG00000021887 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eda.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 31kDa (TAF9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006639 // RefSeq // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 (CYSLTR1), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:78318897:78327551:-1 gene:ENSG00000173198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035750 // GenBank // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:46139 IMAGE:5750221), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ131800 // GenBank // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 splice variant II mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ131801 // GenBank // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 splice variant III mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373304 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold6083:42202:43212:- gene:ENSG00000173198 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057315 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78271464:78327483:-1 Gene:OTTHUMG00000021889 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057316 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78318897:78327551:-1 Gene:OTTHUMG00000021889 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004edb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 (CYSLTR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nma.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 (CYSLTR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nmb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 (CYSLTR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteinyl leukotriene receptor 1 (CYSLTR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152694 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 5 (ZCCHC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:78656069:78659328:-1 gene:ENSG00000179300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136548 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:168161 IMAGE:9020538), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057319 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:78656069:78659328:-1 Gene:OTTHUMG00000021892 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004edc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 5 (ZCCHC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bzi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 5 (ZCCHC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627394 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L07113 (from clone DKFZp686L07113). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004edk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L07113 (from clone DKFZp686L07113). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459070 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:80857076:80857202:-1 gene:ENSG00000239008 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384099 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:82001220:82001327:-1 gene:ENSG00000206826 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:84225752:84225828:-1 gene:ENSG00000221494 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012980 // RefSeq // Homo sapiens spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1 (SATL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332921 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:84347293:84363974:-1 gene:ENSG00000184788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:85092287:85108968:-1 gene:ENSG00000184788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:85092294:85109048:-1 gene:ENSG00000184788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043215 // GenBank // Homo sapiens spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:44285 IMAGE:5295273), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126401 // GenBank // Homo sapiens spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:161679 IMAGE:8992117), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057386 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:85092294:85109048:-1 Gene:OTTHUMG00000021931 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004een.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1 (SATL1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024921 // RefSeq // Homo sapiens premature ovarian failure, 1B (POF1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:85277396:85379743:-1 gene:ENSG00000124429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276124 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:84561227:84634748:-1 gene:ENSG00000124429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017500 // GenBank // Homo sapiens premature ovarian failure, 1B, mRNA (cDNA clone MGC:22933 IMAGE:4905554), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373145 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold784:1570128:1669356:+ gene:ENSG00000124429 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:85277396:85379743:-1 Gene:OTTHUMG00000021934 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057392 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:85282115:85379717:-1 Gene:OTTHUMG00000021934 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eer.2 // UCSC Genes // Homo sapiens premature ovarian failure, 1B (POF1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ees.3 // UCSC Genes // Homo sapiens premature ovarian failure, 1B (POF1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057393 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:85277396:85379692:-1 Gene:OTTHUMG00000021934 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384784 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:90597235:90597340:-1 gene:ENSG00000207515 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004538 // RefSeq // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 3 (NAP1L3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:93670930:93673568:-1 gene:ENSG00000186310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475430 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:93670935:93673568:-1 gene:ENSG00000186310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543136 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:92925934:92928567:-1 gene:ENSG00000186310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034954 // GenBank // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:26312 IMAGE:4823724), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057449 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:93670930:93673568:-1 Gene:OTTHUMG00000021974 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057450 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:93670935:93673568:-1 Gene:OTTHUMG00000021974 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057451 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:92927652:92928547:-1 Gene:OTTHUMG00000021974 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004efq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 3 (NAP1L3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ580189 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48301, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022caa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-48300, complete sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003539 // RefSeq // Homo sapiens bromodomain, testis-specific pseudogene (LOC643486), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nmx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens bromodomain, testis-specific pseudogene (LOC643486), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nmx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nmx.2 cpcScore=4.2845100 cnci=-0.3299605 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:96701507:96701619:-1 gene:ENSG00000207426 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:97431286:97564505:-1 gene:ENSG00000236256 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:97533173:97617259:-1 gene:ENSG00000236256 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:97602830:97642589:-1 gene:ENSG00000236256 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057466 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:97533173:97617259:-1 Gene:OTTHUMG00000021989 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057467 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:97431286:97564505:-1 Gene:OTTHUMG00000021989 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB593036 // GenBank // Homo sapiens RBSG1 mRNA, complete sequence, clone: HP05198_RBd68C07. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB593037 // GenBank // Homo sapiens RBSG1 mRNA, complete sequence, clone: HP05198-RBdS015L17. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cac.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RBSG1 mRNA, complete sequence, clone: HP05198_RBd68C07. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cad.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RBSG1 mRNA, complete sequence, clone: HP05198_RBd68C07. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516621 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:99385195:99385276:-1 gene:ENSG00000252430 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024608 // RefSeq // Homo sapiens X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 pseudogene 5 (XRCC6P5), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mrd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 pseudogene 5 (XRCC6P5), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_212559 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, X-linked (XKRX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328526 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:100168431:100183898:-1 gene:ENSG00000182489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:100913445:100928909:-1 gene:ENSG00000182489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468904 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:100914299:100929433:-1 gene:ENSG00000182489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296711 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60646 complete cds, highly similar to XK-related protein 2. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137010 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:168626 IMAGE:9021003), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057501 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100913445:100928909:-1 Gene:OTTHUMG00000022010 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354553 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:100914299:100929433:-1 Gene:OTTHUMG00000022010 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004egn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, X-linked (XKRX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mre.1 // UCSC Genes // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, X-linked (XKRX), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000456301 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:100258821:100262962:-1 gene:ENSG00000228609 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057506 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057506 cpcScore=0.3302730 cnci=-0.3177274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410271 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:X:100543905:100543999:-1 gene:ENSG00000222203 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408205 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:101427393:101427495:-1 gene:ENSG00000221132 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:101634006:101634112:-1 gene:ENSG00000207291 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001006938 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 6 (TCEAL6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102140710:102142970:-1 gene:ENSG00000204071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:102140476:102142505:-1 gene:ENSG00000204071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536102 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:101395702:101396303:-1 gene:ENSG00000204071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071675 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:87877 IMAGE:5197831), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057609 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102140476:102142505:-1 Gene:OTTHUMG00000022050 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057610 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102140710:102142970:-1 Gene:OTTHUMG00000022050 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eiq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 6 (TCEAL6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cas.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 6 (TCEAL6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021992 // RefSeq // Homo sapiens thymosin beta 15a (TMSB15A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:102513676:102516784:-1 gene:ENSG00000158164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000183 // GenBank // Homo sapiens thymosin beta 15a, mRNA (cDNA clone MGC:2089 IMAGE:3350388), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057621 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102513676:102516784:-1 Gene:OTTHUMG00000022054 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eje.3 // UCSC Genes // Homo sapiens thymosin beta 15a (TMSB15A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:102678707:102678813:-1 gene:ENSG00000252294 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018476 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, X-linked 1 (BEX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103062651:103064240:-1 gene:ENSG00000133169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126427 // GenBank // Homo sapiens brain expressed, X-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:161705 IMAGE:8992143), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058925 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103062651:103064240:-1 Gene:OTTHUMG00000022708 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens brain expressed, X-linked 1 (BEX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens brain expressed, X-linked 1 (BEX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408083 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:103068865:103068986:-1 gene:ENSG00000221010 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363792 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:X:102411048:102411139:-1 gene:ENSG00000200662 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001006684 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8 (TCEAL8), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_153333 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8 (TCEAL8), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103252995:103255185:-1 gene:ENSG00000180964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103252995:103255203:-1 gene:ENSG00000180964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035573 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8, mRNA (cDNA clone MGC:45400 IMAGE:5405281), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103252995:103255203:-1 Gene:OTTHUMG00000022094 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103252995:103255185:-1 Gene:OTTHUMG00000022094 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103253658:103255192:-1 Gene:OTTHUMG00000022094 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8 (TCEAL8), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8 (TCEAL8), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 8 (TCEAL8), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012979 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 5 (TCEAL5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103273691:103276872:-1 gene:ENSG00000204065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132922 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:164553 IMAGE:40146944), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057696 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103273691:103276872:-1 Gene:OTTHUMG00000022092 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 5 (TCEAL5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII)-like 5 (TCEAL5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080879 // RefSeq // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family (RAB40A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103499754:103519489:-1 gene:ENSG00000172476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103499750:103502875:-1 gene:ENSG00000172476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074854 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:104017 IMAGE:30915461), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113501 // GenBank // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:142061 IMAGE:8322553), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057713 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103499754:103519489:-1 Gene:OTTHUMG00000022100 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057714 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103499750:103502875:-1 Gene:OTTHUMG00000022100 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ekk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family (RAB40A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB40A, member RAS oncogene family (RAB40A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024452 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 4 (GLRA4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001172285 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 4 (GLRA4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103707224:103728624:-1 gene:ENSG00000188828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:103719514:103722211:-1 gene:ENSG00000188828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057742 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103707224:103728624:-1 Gene:OTTHUMG00000022110 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000332205 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103719514:103722211:-1 Gene:OTTHUMG00000022110 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346520 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103707300:103728655:-1 Gene:OTTHUMG00000022110 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346521 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103718574:103728624:-1 Gene:OTTHUMG00000022110 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nou.2 // UCSC Genes // Homo sapiens glycine receptor, alpha 4 (GLRA4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mse.2 // UCSC Genes // Homo sapiens glycine receptor, alpha 4 (GLRA4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016370 // RefSeq // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family (RAB9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:103822322:103832228:-1 gene:ENSG00000123570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093756 // GenBank // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:120791 IMAGE:7939601), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093758 // GenBank // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:120793 IMAGE:7939603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057746 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103822322:103832228:-1 Gene:OTTHUMG00000022112 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ell.2 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family (RAB9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018033 // GenBank // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:4800052). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eli.2 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family (RAB9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family (RAB9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410487 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:103850797:103850911:-1 gene:ENSG00000222419 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000447281 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:103172005:103174131:-1 gene:ENSG00000231728 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK026512 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22859 fis, clone KAT01752. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:103917411:103919548:-1 Gene:OTTHUMG00000022115 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA: FLJ22859 fis, clone KAT01752. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451146 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:103216382:103216864:-1 gene:ENSG00000227067 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002916 // RefSeq // Homo sapiens H2B histone family, member W, testis-specific (H2BFWT), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000217926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:104011147:104013687:-1 gene:ENSG00000123569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038109 // GenBank // Homo sapiens H2B histone family, member W, testis-specific, mRNA (cDNA clone MGC:33423 IMAGE:5266336), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC118604 // GenBank // Homo sapiens H2B histone family, member W, testis-specific, mRNA (cDNA clone MGC:148131 IMAGE:40109007), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057756 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104011147:104013687:-1 Gene:OTTHUMG00000022120 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H2B histone family, member W, testis-specific (H2BFWT), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003238 // RefSeq // Homo sapiens H2B histone family, member X, pseudogene (H2BFXP), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens H2B histone family, member X, pseudogene (H2BFXP), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012755 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 53 (SLC25A53), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:104130604:104156988:-1 gene:ENSG00000269743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000176274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140812 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier triple repeat 6, mRNA (cDNA clone MGC:176489 IMAGE:9021680), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140814 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier triple repeat 6, mRNA (cDNA clone MGC:176491 IMAGE:9021682), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357421 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1933:50495:51409:- gene:ENSG00000176274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104099214:104157027:-1 Gene:OTTHUMG00000022124 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104130604:104156988:-1 Gene:OTTHUMG00000022124 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25, member 53 (SLC25A53), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cbz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25, member 53 (SLC25A53), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039980 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC286437 (LOC286437), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC286437 (LOC286437), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004elv.1 cpcScore=3.3682500 cnci=-0.2408946 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153448 // RefSeq // Homo sapiens ESX homeobox 1 (ESX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:104250038:104254933:-1 gene:ENSG00000123576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042633 // GenBank // Homo sapiens ESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:34743 IMAGE:5170565), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053599 // GenBank // Homo sapiens ESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:61691 IMAGE:5742902), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:104250038:104254933:-1 Gene:OTTHUMG00000022125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ely.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ESX homeobox 1 (ESX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031274 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 13A (TEX13A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372575 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:104463613:104465358:-1 gene:ENSG00000133149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372578 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:104463611:104465358:-1 gene:ENSG00000133149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042547 // GenBank // Homo sapiens testis expressed 13A, mRNA (cDNA clone MGC:34073 IMAGE:5164310), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108734 // GenBank // Homo sapiens testis expressed 13A, mRNA (cDNA clone MGC:131984 IMAGE:5744723), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413579 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1628:1052802:1054113:+ gene:ENSG00000133149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057774 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:105218929:105220674:-1 Gene:OTTHUMG00000022133 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:105218931:105220674:-1 Gene:OTTHUMG00000022133 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ema.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 13A (TEX13A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 13A (TEX13A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384137 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:105676071:105676177:-1 gene:ENSG00000206864 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171706 // RefSeq // Homo sapiens ripply transcriptional repressor 1 (RIPPLY1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_138382 // RefSeq // Homo sapiens ripply transcriptional repressor 1 (RIPPLY1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:106900063:106903317:-1 gene:ENSG00000147223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:106900326:106903335:-1 gene:ENSG00000147223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105691 // GenBank // Homo sapiens ripply1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:125511 IMAGE:40023299), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110436 // GenBank // Homo sapiens ripply1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:125512 IMAGE:40023301), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127250 // GenBank // Homo sapiens ripply1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:157642 IMAGE:40023300), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057813 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106900326:106903335:-1 Gene:OTTHUMG00000022153 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:106900063:106903317:-1 Gene:OTTHUMG00000022153 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004emr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ripply1 homolog (zebrafish) (RIPPLY1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ems.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ripply1 homolog (zebrafish) (RIPPLY1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384633 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:107901145:107901246:-1 gene:ENSG00000207363 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384417 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:108676951:108677057:-1 gene:ENSG00000207146 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001522 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase 2F, retinal (GUCY2F), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144241 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052761. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000218006 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1107:177284:274872:- gene:ENSG00000101890 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057884 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:109372906:109482072:-1 Gene:OTTHUMG00000022184 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eod.4 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase 2F, retinal (GUCY2F), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase 2F, retinal (GUCY2F), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cch.1 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase 2F, retinal (GUCY2F), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516260 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:109744643:109744749:-1 gene:ENSG00000252069 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004379 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 96B (SNORD96B), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000386148 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:110224985:110225063:-1 gene:ENSG00000208883 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010npr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 96B (SNORD96B), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014289 // RefSeq // Homo sapiens calpain 6 (CAPN6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541758 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:110489584:110507104:-1 gene:ENSG00000077274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50213 complete cds, highly similar to Calpain-6 (Calpamodulin). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000730 // GenBank // Homo sapiens calpain 6, mRNA (cDNA clone MGC:1883 IMAGE:3503916), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324068 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold903:235764:252538:- gene:ENSG00000077274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057922 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:111245103:111270523:-1 Gene:OTTHUMG00000022203 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens calpain 6 (CAPN6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011msu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens calpain 6 (CAPN6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516145 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:111421510:111421608:-1 gene:ENSG00000251954 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364550 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:111669829:111669948:-1 gene:ENSG00000201420 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012471 // RefSeq // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 (TRPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:111774315:112082776:-1 gene:ENSG00000072315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB209258 // GenBank // Homo sapiens mRNA for transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 variant protein. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137271 // GenBank // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168891 IMAGE:9021268), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057945 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:111774315:112082776:-1 Gene:OTTHUMG00000022212 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 (TRPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 (TRPC5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459560 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:112244247:112244356:-1 gene:ENSG00000238811 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364804 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:113944186:113944399:-1 gene:ENSG00000201674 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001243963 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 2 (LRCH2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020871 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 2 (LRCH2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536655 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:114345189:114468627:-1 gene:ENSG00000130224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:115110626:115234072:-1 gene:ENSG00000130224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125224 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:150671 IMAGE:40124466), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317135 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1492:592493:661186:+ gene:ENSG00000130224 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057971 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:115110616:115234072:-1 Gene:OTTHUMG00000022233 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004epz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 2 (LRCH2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nqe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 2 (LRCH2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410755 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:114360879:114361007:-1 gene:ENSG00000222687 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdc.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00566 hit found at contig region AL445164.14/7719-7591 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390939 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:115139030:115139123:-1 gene:ENSG00000212241 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000359806 // ENSEMBL // [retired] Similar to Thromboxane A2 receptor gene:ENSG00000006638 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC003645 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC642776, mRNA (cDNA clone IMAGE:3533146), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:115917271:115969089:-1 Gene:OTTHUMG00000022240 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eqg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein LOC642776, mRNA (cDNA clone IMAGE:3533146), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:115917271:115969089:-1 gene:ENSG00000235244 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:116400848:116400953:-1 gene:ENSG00000207033 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000435565 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:115803862:115812236:-1 gene:ENSG00000236077 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384025 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:116850839:116850945:-1 gene:ENSG00000206752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363421 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:117914244:117914345:-1 gene:ENSG00000200291 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384135 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:118569405:118569515:-1 gene:ENSG00000206862 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000431706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:119249346:119257667:-1 gene:ENSG00000214992 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543565 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:118388712:118391633:-1 gene:ENSG00000214992 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058023 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119249346:119257667:-1 Gene:OTTHUMG00000022267 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030413 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 766 (MIR766), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390223 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:119646743:119646854:-1 gene:ENSG00000211578 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 766 (MIR766), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001000 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L39 (RPL39), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002584 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 69 (SNORA69), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:119786506:119791643:-1 gene:ENSG00000198918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383895 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:119787353:119787484:-1 gene:ENSG00000206622 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:119786506:119791595:-1 gene:ENSG00000198918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001019 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L39, mRNA (cDNA clone MGC:1636 IMAGE:3343512), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070205 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L39, mRNA (cDNA clone MGC:88186 IMAGE:6732169), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058047 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119786506:119791643:-1 Gene:OTTHUMG00000022278 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058048 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119786506:119791595:-1 Gene:OTTHUMG00000022278 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058050 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119786504:119787456:-1 Gene:OTTHUMG00000022278 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ery.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 69 (SNORA69), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004erx.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024528 // RefSeq // Homo sapiens NFKB activating protein (NKAP), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:119925051:119938077:-1 gene:ENSG00000101882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK094446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37127 fis, clone BRACE2022848. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015354 // GenBank // Homo sapiens NFKB activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:21454 IMAGE:3450847), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032442 // GenBank // Homo sapiens NFKB activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:40260 IMAGE:5139142), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371410 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2828:205236:220824:- gene:ENSG00000101882 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058072 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119925055:119943772:-1 Gene:OTTHUMG00000022284 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058073 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119925051:119938077:-1 Gene:OTTHUMG00000022284 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058074 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:119930125:119932752:-1 Gene:OTTHUMG00000022284 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NFKB activating protein (NKAP), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NFKB activating protein (NKAP), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099685 // RefSeq // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2B (RHOXF2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032498 // RefSeq // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2 (RHOXF2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120072264:120077705:-1 gene:ENSG00000203989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021719 // GenBank // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:32918 IMAGE:5269333), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120072264:120077705:-1 Gene:OTTHUMG00000022288 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esj.4 // UCSC Genes // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 2B (RHOXF2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_139282 // RefSeq // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 1 (RHOXF1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000217999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120109053:120115937:-1 gene:ENSG00000101883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069324 // GenBank // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:96948 IMAGE:7262157), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069529 // GenBank // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:96960 IMAGE:7262169), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103857 // GenBank // Homo sapiens Rhox homeobox family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:119030 IMAGE:40003132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058083 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120109053:120115937:-1 Gene:OTTHUMG00000022290 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esk.1 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027131 // RefSeq // Homo sapiens NFKB activating protein pseudogene 1 (NKAPP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:120236458:120245233:-1 gene:ENSG00000233382 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:120178488:120245267:-1 gene:ENSG00000233382 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000555168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:120120953:120244888:-1 gene:ENSG00000233382 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058088 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120236458:120245233:-1 Gene:OTTHUMG00000022295 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NFKB activating protein pseudogene 1 (NKAPP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001011551 // RefSeq // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1 (C1GALT1C1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152692 // RefSeq // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1 (C1GALT1C1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120625793:120630150:-1 gene:ENSG00000171155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011930 // GenBank // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:19947 IMAGE:3355639), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050441 // GenBank // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:54192 IMAGE:5724507), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371313 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2822:38645:39601:- gene:ENSG00000171155 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058117 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120625793:120630150:-1 Gene:OTTHUMG00000022305 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058118 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120625931:120629995:-1 Gene:OTTHUMG00000022305 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1 (C1GALT1C1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004esz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1 (C1GALT1C1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cdo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens C1GALT1-specific chaperone 1 (C1GALT1C1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145718 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member B1 (CT47B1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120872603:120875929:-1 gene:ENSG00000236446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058121 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120872603:120875929:-1 Gene:OTTHUMG00000187483 gene:OTTHUMG00000022308 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011muc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member B1 (CT47B1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120933840:120937158:-1 gene:ENSG00000226929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058123 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120933840:120937158:-1 Gene:OTTHUMG00000022310 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eta.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A4 (CT47A4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120938701:120942023:-1 gene:ENSG00000224089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058122 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120938701:120942023:-1 Gene:OTTHUMG00000022309 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120943561:120946883:-1 gene:ENSG00000226600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058132 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120943561:120946883:-1 Gene:OTTHUMG00000022319 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A2 (CT47A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120948422:120951744:-1 gene:ENSG00000230347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058131 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120948422:120951744:-1 Gene:OTTHUMG00000022318 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A3 (CT47A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080140 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A7 (CT47A7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120953288:120956600:-1 gene:ENSG00000228517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058130 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120953288:120956600:-1 Gene:OTTHUMG00000022317 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ete.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A7 (CT47A7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120967886:120971208:-1 gene:ENSG00000230594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120967886:120971208:-1 Gene:OTTHUMG00000022314 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A5 (CT47A5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080141 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A6 (CT47A6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120972746:120976068:-1 gene:ENSG00000236126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120972746:120976068:-1 Gene:OTTHUMG00000022313 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408390 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:122471725:122471818:-1 gene:ENSG00000221317 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000435941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:123116107:123117781:-1 gene:ENSG00000224236 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058139 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:123116107:123117781:-1 Gene:OTTHUMG00000022326 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536016 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:122250821:122251609:-1 gene:ENSG00000255787 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384922 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:122695946:122696055:-1 gene:ENSG00000207655 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mug.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA mir-220. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:123772078:123772139:-1 gene:ENSG00000252178 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362835 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:123857062:123857163:-1 gene:ENSG00000199705 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013628 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 2 (DCAF12L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538699 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:125298337:125300080:-1 gene:ENSG00000198354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136673 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 40C, mRNA (cDNA clone MGC:168286 IMAGE:9020663), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136674 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 40C, mRNA (cDNA clone MGC:168287 IMAGE:9020664), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360028 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1288:3834995:3836219:- gene:ENSG00000198354 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058181 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:126164531:126165951:-1 Gene:OTTHUMG00000022348 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004euk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 2 (DCAF12L2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178470 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 1 (DCAF12L1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:126549383:126552851:-1 gene:ENSG00000198889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035674 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 40B, mRNA (cDNA clone MGC:46344 IMAGE:5741971), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058186 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:126549383:126552851:-1 Gene:OTTHUMG00000022353 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eul.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 1 (DCAF12L1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cds.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 1 (DCAF12L1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364648 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:129436530:129436647:-1 gene:ENSG00000201518 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001127197 // RefSeq // Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (ELF4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001421 // RefSeq // Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (ELF4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:130064928:130110495:-1 gene:ENSG00000102034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:130064874:130110716:-1 gene:ENSG00000102034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017194 // GenBank // Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor), mRNA (cDNA clone MGC:1755 IMAGE:3138355), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130064928:130110495:-1 Gene:OTTHUMG00000022390 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058244 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130064874:130110716:-1 Gene:OTTHUMG00000022390 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130074105:130110361:-1 Gene:OTTHUMG00000022390 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004evd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (ELF4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eve.4 // UCSC Genes // Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (ELF4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:130310072:130310178:-1 gene:ENSG00000202304 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178471 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119 (GPR119), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC095502 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:111707 IMAGE:30706606), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101166 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:119955 IMAGE:40016011), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101167 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:119956 IMAGE:40016012), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126179 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:161457 IMAGE:8991895), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126181 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:161459 IMAGE:8991897), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276218 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold138:375634:376641:- gene:ENSG00000147262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058270 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:130384440:130385447:-1 Gene:OTTHUMG00000022397 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011muv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 119 (GPR119), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026975 // RefSeq // Homo sapiens firre intergenic repeating RNA element (FIRRE), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:131702650:131830643:-1 gene:ENSG00000213468 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131554 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40108029. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058303 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:131702650:131830643:-1 Gene:OTTHUMG00000022417 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ewi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 195, member A pseudogene (LOC286467), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ewj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 195, member A pseudogene (LOC286467), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ewi.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ewi.2 cpcScore=1.0718500 cnci=-0.2877894 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016521 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor Dp family, member 3 (TFDP3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:133216669:133218348:-1 gene:ENSG00000183434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058337 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:133216669:133218348:-1 Gene:OTTHUMG00000022433 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription factor Dp family, member 3 (TFDP3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365329 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:133238657:133238816:-1 gene:ENSG00000202199 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001448 // RefSeq // Homo sapiens glypican 4 (GPC4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:133300103:133415490:-1 gene:ENSG00000076716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535467 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:132436668:132548587:-1 gene:ENSG00000076716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536418 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:132435064:132549205:-1 gene:ENSG00000076716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK304207 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51457 complete cds, highly similar to Glypican-4 precursor. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017166 // GenBank // Homo sapiens glypican 4, mRNA (cDNA clone MGC:9107 IMAGE:3922774), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058338 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:133300103:133415490:-1 Gene:OTTHUMG00000022434 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glypican 4 (GPC4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glypican 4 (GPC4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384038 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:133531723:133531826:-1 gene:ENSG00000206765 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390161 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:133746748:133746846:-1 gene:ENSG00000211495 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363702 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:134142228:134142340:-1 gene:ENSG00000200572 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029852 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 363 (MIR363), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384840 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134169361:134169473:-1 gene:ENSG00000207572 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ceb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 363 (MIR363), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029509 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 92a-2 (MIR92A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134169538:134169612:-1 gene:ENSG00000208034 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 92a-2 (MIR92A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004exf.2 cpcScore=-1.3524400 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029491 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 19b-2 (MIR19B2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385077 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134169671:134169767:-1 gene:ENSG00000207812 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 19b-2 (MIR19B2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029950 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 20b (MIR20B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134169809:134169877:-1 gene:ENSG00000207710 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ced.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 20b (MIR20B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029949 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 18b (MIR18B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cee.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 18b (MIR18B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029523 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 106a (MIR106A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384870 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134170198:134170278:-1 gene:ENSG00000207602 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 106a (MIR106A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516153 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:134403298:134403382:-1 gene:ENSG00000251962 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030587 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 450b (MIR450B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401182 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134540161:134540272:-1 gene:ENSG00000216001 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cef.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 450b (MIR450B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029962 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 450a-1 (MIR450A1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362262 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134540341:134540431:-1 gene:ENSG00000199132 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 450a-1 (MIR450A1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvl.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mvl.1 cpcScore=-1.1999200 cnci=-0.4905695 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030227 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 450a-2 (MIR450A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134540495:134540605:-1 gene:ENSG00000207755 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ceg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 450a-2 (MIR450A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030399 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 542 (MIR542), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134541344:134541455:-1 gene:ENSG00000207784 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ceh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 542 (MIR542), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030228 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 503 (MIR503), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385270 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134546328:134546398:-1 gene:ENSG00000208005 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 503 (MIR503), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvn.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mvn.1 cpcScore=-1.2967000 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134760208:134760348:-1 gene:ENSG00000199920 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384353 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:134918310:134918416:-1 gene:ENSG00000207081 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001078173 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member C (FAM127C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135020504:135022529:-1 gene:ENSG00000212747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538706 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:134155544:134156172:-1 gene:ENSG00000212747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113720 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member C, mRNA (cDNA clone MGC:142280 IMAGE:8322772), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058389 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135020504:135022529:-1 Gene:OTTHUMG00000022464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member C (FAM127C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001078172 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member B (FAM127B), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001134321 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member B (FAM127B), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000520964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135050940:135052196:-1 gene:ENSG00000203950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000393 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member B, mRNA (cDNA clone MGC:8471 IMAGE:2821721), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370775 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold7889:5023:5364:+ gene:ENSG00000203950 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058393 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135050932:135052175:-1 Gene:OTTHUMG00000022466 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135050932:135052090:-1 Gene:OTTHUMG00000022466 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135050940:135052196:-1 Gene:OTTHUMG00000022466 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377689 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135051058:135052141:-1 Gene:OTTHUMG00000022466 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member B (FAM127B), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 127, member B (FAM127B), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024493 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 87 (LINC00087), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135095028:135098634:-1 gene:ENSG00000196972 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058396 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135095028:135098634:-1 Gene:OTTHUMG00000022468 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 87 (LINC00087), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058395 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058395 cpcScore=-0.4198930 cnci=-0.0488464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058397 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058397 cpcScore=-1.1567300 cnci=-0.1890549 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033941 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 633 (LINC00633), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:135118955:135120526:-1 gene:ENSG00000224107 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058398 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135118955:135120526:-1 Gene:OTTHUMG00000022469 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058399 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135118955:135119746:-1 Gene:OTTHUMG00000022469 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 633 (LINC00633), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001031705 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 55 (CT55), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_017863 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 55 (CT55), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000276241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:135156536:135171398:-1 gene:ENSG00000169551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:135156540:135171398:-1 gene:ENSG00000169551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020662 // GenBank // Homo sapiens chromosome X open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:22339 IMAGE:4809793), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058403 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135156540:135171398:-1 Gene:OTTHUMG00000022473 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058404 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135156536:135171398:-1 Gene:OTTHUMG00000022473 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 48 (CXorf48), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 48 (CXorf48), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000444691 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:134812381:134814989:-1 gene:ENSG00000198022 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401331 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:X:134945432:134945507:-1 gene:ENSG00000216150 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516180 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:102261230:102261306:1 gene:ENSG00000251989 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173470 // RefSeq // Homo sapiens membrane magnesium transporter 1 (MMGT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:135962070:135974063:-1 gene:ENSG00000169446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433339 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:135044237:135056106:-1 gene:ENSG00000169446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295829 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54627 complete cds, highly similar to Homo sapiens transmembrane protein 32 (TMEM32), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033588 // GenBank // Homo sapiens membrane magnesium transporter 1, mRNA (cDNA clone MGC:40118 IMAGE:5213486), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058453 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135962070:135974063:-1 Gene:OTTHUMG00000022499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane magnesium transporter 1 (MMGT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane magnesium transporter 1 (MMGT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cet.1 // UCSC Genes // Homo sapiens membrane magnesium transporter 1 (MMGT1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458945 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:136134317:136134420:-1 gene:ENSG00000239080 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362554 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:136571705:136571815:-1 gene:ENSG00000199424 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365409 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:136816477:136816574:-1 gene:ENSG00000202279 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002735 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 61 (SNORD61), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384252 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:136879199:136879271:-1 gene:ENSG00000206979 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fah.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 61 (SNORD61), small nuclear RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026935 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 889 (LINC00889), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fal.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 889 (LINC00889), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030229 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 504 (MIR504), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:138667692:138667800:-1 gene:ENSG00000207800 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 504 (MIR504), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458890 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:139702287:139702390:-1 gene:ENSG00000238485 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030230 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 505 (MIR505), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384901 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:139924126:139924237:-1 gene:ENSG00000207633 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 505 (MIR505), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013403 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 66 (CXorf66), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:139955725:139965520:-1 gene:ENSG00000203933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137148 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC347487, mRNA (cDNA clone MGC:168768 IMAGE:9021145), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058572 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:139955725:139965520:-1 Gene:OTTHUMG00000022539 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 66 (CXorf66), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005634 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 3 (SOX3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:140502987:140505503:-1 gene:ENSG00000134595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093863 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 3, mRNA (cDNA clone MGC:120898 IMAGE:7939708), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093865 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 3, mRNA (cDNA clone MGC:120900 IMAGE:7939710), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058577 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:140502987:140505503:-1 Gene:OTTHUMG00000022544 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 3 (SOX3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004065 // RefSeq // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 1, 34kDa (CDR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:140782405:140784871:-1 gene:ENSG00000184258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113472 // GenBank // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 1, 34kDa, mRNA (cDNA clone MGC:142032 IMAGE:8322524), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058583 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:140782405:140784871:-1 Gene:OTTHUMG00000137398 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 1, 34kDa (CDR1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_031725 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 320d-2 (MIR320D2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:140926172:140926219:-1 gene:ENSG00000221081 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 320d-2 (MIR320D2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:141118030:141118136:-1 gene:ENSG00000207041 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012317 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper, down-regulated in cancer 1 (LDOC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141175745:141177125:-1 gene:ENSG00000182195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:141175749:141177016:-1 gene:ENSG00000182195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003104 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper, down-regulated in cancer 1, mRNA (cDNA clone MGC:1897 IMAGE:3503444), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058592 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141175745:141177125:-1 Gene:OTTHUMG00000022558 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058593 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141175749:141177016:-1 Gene:OTTHUMG00000022558 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine zipper, down-regulated in cancer 1 (LDOC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032417 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member D (SPANXD), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145665 // RefSeq // [retired]Homo sapiens SPANX family, member E (SPANXE), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370515 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141697411:141698739:-1 gene:ENSG00000196406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005382 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member E, mRNA (cDNA clone MGC:12501 IMAGE:3935644), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062672 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member E, mRNA (cDNA clone MGC:71908 IMAGE:4047937), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103961 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:119769 IMAGE:40013988), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121070 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:150331 IMAGE:40119569), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058598 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141697411:141698739:-1 Gene:OTTHUMG00000022563 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member E (SPANXE), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016249 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family C, 2 (MAGEC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000247452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:142202345:142205290:-1 gene:ENSG00000046774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005891 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family C, 2, mRNA (cDNA clone MGC:871 IMAGE:3050294), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013318 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family C, 2, mRNA (cDNA clone MGC:13377 IMAGE:4133159), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058611 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:142202345:142205290:-1 Gene:OTTHUMG00000022574 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family C, 2 (MAGEC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family C, 2 (MAGEC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458936 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:X:141961746:141961849:-1 gene:ENSG00000239188 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408578 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:143446208:143446337:-1 gene:ENSG00000221505 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009609 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member N3 (SPANXN3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:143508735:143517475:-1 gene:ENSG00000189252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062750 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member N3, mRNA (cDNA clone MGC:72116 IMAGE:6618011), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058620 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:143508735:143517475:-1 Gene:OTTHUMG00000022582 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member N3 (SPANXN3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009615 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member N2 (SPANXN2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370498 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:142795055:142804516:-1 gene:ENSG00000203924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058621 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:143711955:143721423:-1 Gene:OTTHUMG00000022583 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member N2 (SPANXN2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401213 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:145990867:145990937:-1 gene:ENSG00000216032 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516410 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:145992750:145992826:-1 gene:ENSG00000252219 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030589 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 890 (MIR890), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401256 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:145994275:145994351:-1 gene:ENSG00000216075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 890 (MIR890), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030592 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 888 (MIR888), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:145994784:145994860:-1 gene:ENSG00000216005 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 888 (MIR888), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030584 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 892a (MIR892A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401124 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:145996669:145996743:-1 gene:ENSG00000215943 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 892a (MIR892A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030593 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 892b (MIR892B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401279 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:145997198:145997274:-1 gene:ENSG00000216098 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 892b (MIR892B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030590 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 891b (MIR891B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401245 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:146001053:146001131:-1 gene:ENSG00000216064 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 891b (MIR891B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030581 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 891a (MIR891A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401237 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:146027794:146027872:-1 gene:ENSG00000216056 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cft.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 891a (MIR891A), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:146427456:146427572:-1 gene:ENSG00000201594 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001144064 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51A (CXorf51A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001244892 // RefSeq // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51B (CXorf51B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:146814106:146814726:-1 gene:ENSG00000224440 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058639 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:146814106:146814726:-1 Gene:OTTHUMG00000022600 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mwv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome X open reading frame 51A (CXorf51A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401352 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147189704:147189787:-1 gene:ENSG00000216171 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385136 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147199044:147199127:-1 gene:ENSG00000207871 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147213463:147213591:-1 gene:ENSG00000207873 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385249 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147225826:147225952:-1 gene:ENSG00000207984 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030233 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 506 (MIR506), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384998 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147230720:147230843:-1 gene:ENSG00000207731 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 506 (MIR506), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030234 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 507 (MIR507), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385234 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147230984:147231077:-1 gene:ENSG00000207969 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 507 (MIR507), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030235 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 508 (MIR508), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384857 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147236913:147237027:-1 gene:ENSG00000207589 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 508 (MIR508), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036173 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514b (MIR514B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516774 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147250151:147250230:-1 gene:ENSG00000252583 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cfx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 514b (MIR514B), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030237 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 510 (MIR510), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384909 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147272335:147272408:-1 gene:ENSG00000207641 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cga.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 510 (MIR510), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030238 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514a-1 (MIR514A1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385133 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147279247:147279344:-1 gene:ENSG00000207868 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cgb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 514a-1 (MIR514A1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030239 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514a-2 (MIR514A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_030240 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514a-3 (MIR514A3), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385131 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147281943:147282030:-1 gene:ENSG00000207866 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mww.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 514a-2 (MIR514A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mww.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mww.1 cpcScore=-1.3866200 cnci=-0.8757524 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030239 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514a-2 (MIR514A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_030240 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 514a-3 (MIR514A3), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385132 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:147284641:147284728:-1 gene:ENSG00000207867 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mwx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 514a-2 (MIR514A2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mwx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mwx.1 cpcScore=-1.3891300 cnci=-0.8690331 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024499 // RefSeq // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024500 // RefSeq // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024501 // RefSeq // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024502 // RefSeq // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024503 // RefSeq // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 5, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nsq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 4, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nsr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 5, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mwy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FMR1 antisense RNA 1 (FMR1-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433064 // ENSEMBL // [retired] Antisense fragile X mental retardation protein variant E gene:ENSG00000224191 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080790 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005365 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9 (MAGEA9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:149781930:149787737:1 gene:ENSG00000123584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002351 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9, mRNA (cDNA clone MGC:8421 IMAGE:2820966), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149781930:149787737:1 Gene:OTTHUMG00000022621 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fdk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cgj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 9B (MAGEA9B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164415 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_016153 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 1 (HSFX1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000524178 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:148674172:148676974:-1 gene:ENSG00000171129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310305 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17347. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021706 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:26102 IMAGE:4825659), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378835 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148674172:148676974:-1 Gene:OTTHUMG00000164446 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378836 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:148674868:148676436:-1 Gene:OTTHUMG00000164446 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nta.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cgk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock transcription factor family, X linked 2 (HSFX2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437286 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:X:149399291:149400721:-1 gene:ENSG00000234825 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410864 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:150955494:150955587:-1 gene:ENSG00000222796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391293 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:X:151026295:151026406:-1 gene:ENSG00000212595 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029521 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 105-1 (MIR105-1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:152392219:152392299:-1 gene:ENSG00000207957 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 105-1 (MIR105-1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffo.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ffo.2 cpcScore=-1.1920100 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030409 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 767 (MIR767), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390228 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:152393413:152393523:-1 gene:ENSG00000211583 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 767 (MIR767), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029522 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 105-2 (MIR105-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:152394412:152394492:-1 gene:ENSG00000207818 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011myf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 105-2 (MIR105-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011myf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011myf.1 cpcScore=-1.1795700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005362 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3 (MAGEA3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:152698752:152702347:1 gene:ENSG00000221867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393902 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:151934653:151938171:-1 gene:ENSG00000221867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000340 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:8564 IMAGE:2822978), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005963 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:14613 IMAGE:4064879), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011744 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:19667 IMAGE:3345801), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016803 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:24425 IMAGE:4073332), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017389 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:23695 IMAGE:4047542), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058744 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152698752:152702347:1 Gene:OTTHUMG00000022640 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058745 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:152698767:152701427:1 Gene:OTTHUMG00000022640 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fgp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3 (MAGEA3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 3 (MAGEA3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242319 // RefSeq // [retired]Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6D (PNMA6D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032882 // RefSeq // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6A (PNMA6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:153075769:153076968:-1 gene:ENSG00000268883 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene gene:ENSG00000257088 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6D (PNMA6D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000370261 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:152341458:152343394:-1 gene:ENSG00000203902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060941 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:152341458:152343394:-1 Gene:OTTHUMG00000024193 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060942 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060942 cpcScore=-0.8184210 cnci=-0.1841416 gene:OTTHUMG00000024194 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060943 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060943 cpcScore=-0.8979300 cnci=-0.1824098 gene:OTTHUMG00000024194 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420160 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:152435330:152439727:-1 gene:ENSG00000237736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420988 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:X:152435672:152439737:-1 gene:ENSG00000237736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004988 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 1 (directs expression of antigen MZ2-E) (MAGEA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:153179285:153183880:1 gene:ENSG00000198681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017555 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 1 (directs expression of antigen MZ2-E), mRNA (cDNA clone MGC:9326 IMAGE:3922845), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060940 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153179285:153183880:1 Gene:OTTHUMG00000024192 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fhf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 1 (directs expression of antigen MZ2-E) (MAGEA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 1 (directs expression of antigen MZ2-E) (MAGEA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427876 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:153397751:153398782:-1 gene:ENSG00000214897 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005334 // RefSeq // Homo sapiens host cell factor C1 (HCFC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:153947553:153971807:-1 gene:ENSG00000172534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354233 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153213014:153236819:-1 gene:ENSG00000172534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:153947559:153971184:-1 gene:ENSG00000172534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:153960009:153962267:-1 gene:ENSG00000172534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061099 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153947553:153971807:-1 Gene:OTTHUMG00000024222 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061100 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153960009:153962267:-1 Gene:OTTHUMG00000024222 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061101 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153947559:153971184:-1 Gene:OTTHUMG00000024222 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280573 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:153947557:153954121:-1 Gene:OTTHUMG00000024222 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fjp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens host cell factor C1 (VP16-accessory protein) (HCFC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001586 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369941 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153424682:153445634:-1 gene:ENSG00000102080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058950 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154159357:154176349:-1 Gene:OTTHUMG00000022713 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cie.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001586 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369932 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153461812:153482755:-1 gene:ENSG00000182242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154196471:154213487:-1 Gene:OTTHUMG00000024230 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mzk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001205201 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001586 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361930 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153498932:153523462:-1 gene:ENSG00000185254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369926 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:153498930:153523564:-1 gene:ENSG00000185254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026183 // GenBank // Homo sapiens testis expressed 28, mRNA (cDNA clone MGC:33160 IMAGE:5266650), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ655913 // GenBank HTC // Homo sapiens clone Affy08252A10, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058773 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154271265:154295211:-1 Gene:OTTHUMG00000022654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000130308 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154271267:154295085:-1 Gene:OTTHUMG00000022654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000268465 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154288336:154295853:-1 Gene:OTTHUMG00000022654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fke.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fkf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nut.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 28 (TEX28), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC009467 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3613029, mRNA, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fld.4 // UCSC Genes // Homo sapiens, clone IMAGE:3613029, mRNA, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fld.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fld.3 cpcScore=-0.6669550 cnci=-0.1406073 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006014 // RefSeq // Homo sapiens L antigen family, member 3 (LAGE3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000407062 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:153706028:153707268:-1 gene:ENSG00000196976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015744 // GenBank // Homo sapiens L antigen family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:23038 IMAGE:4899044), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062330 // GenBank // Homo sapiens L antigen family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:71120 IMAGE:5485603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357360 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold824:295765:296178:+ gene:ENSG00000196976 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000081651 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154477769:154479257:-1 Gene:OTTHUMG00000033294 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000320639 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:153706028:153707268:-1 Gene:OTTHUMG00000033294 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fln.1 // UCSC Genes // Homo sapiens L antigen family, member 3 (LAGE3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001327 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B (CTAG1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_139250 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 1A (CTAG1A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:154617609:154619271:-1 gene:ENSG00000184033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359887 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:X:154617609:154619282:-1 gene:ENSG00000184033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130362 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B, mRNA (cDNA clone MGC:163234 IMAGE:40146393), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061150 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154617609:154619282:-1 Gene:OTTHUMG00000024232 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061151 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154617609:154619271:-1 Gene:OTTHUMG00000024232 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fmf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen 1B (CTAG1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027401 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 223, member A (non-protein coding) (FAM223A), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027402 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 223, member B (non-protein coding) (FAM223B), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127599 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:153860736:153861448:-1 Gene:OTTHUMG00000057424 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mzu.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003639 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma (IKBKG), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cij.1 // UCSC Genes // Homo sapiens inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma (IKBKG), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020994 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 2 (CTAG2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_172377 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen 2 (CTAG2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000247306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:X:154651972:154653579:-1 gene:ENSG00000126890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:154651977:154653568:-1 gene:ENSG00000126890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454505 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:153880252:153881832:-1 gene:ENSG00000126890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002833 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:3803 IMAGE:3638129), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113998 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen 1A, mRNA (cDNA clone MGC:138724 IMAGE:40081511), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061176 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154651972:154653579:-1 Gene:OTTHUMG00000024239 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000061177 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:154651977:154653568:-1 Gene:OTTHUMG00000024239 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fmh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen 2 (CTAG2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fmi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen 2 (CTAG2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_171998 // RefSeq // Homo sapiens RAB39B, member RAS oncogene family (RAB39B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009714 // GenBank // Homo sapiens RAB39B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:9428 IMAGE:3900092), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369454 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2458:534938:537977:- gene:ENSG00000155961 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058792 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155258241:155264589:-1 Gene:OTTHUMG00000022659 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fne.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB39B, member RAS oncogene family (RAB39B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001289 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 2 (CLIC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:155276211:155334646:-1 gene:ENSG00000155962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155277980:155334542:-1 gene:ENSG00000155962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY191592 // GenBank // Homo sapiens chloride intracellular channel 2 isoform b (CLIC2) mRNA, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022305 // GenBank // Homo sapiens chloride intracellular channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:22558 IMAGE:4663624), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058793 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155276211:155334646:-1 Gene:OTTHUMG00000022660 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155279269:155334427:-1 Gene:OTTHUMG00000022660 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155277980:155334542:-1 Gene:OTTHUMG00000022660 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000316587 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155279206:155334657:-1 Gene:OTTHUMG00000022660 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride intracellular channel 2 (CLIC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nvj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride intracellular channel 2 (CLIC2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039991 // RefSeq // Homo sapiens TMLHE antisense RNA 1 (TMLHE-AS1), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058799 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155347137:155351957:-1 Gene:OTTHUMG00000022662 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058800 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155334858:155351926:-1 Gene:OTTHUMG00000022662 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fng.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TMLHE antisense RNA 1 (TMLHE-AS1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155347137:155351957:-1 gene:ENSG00000224216 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:155334858:155351926:-1 gene:ENSG00000224216 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fng.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fng.2 cpcScore=-1.0678700 cnci=-0.2914438 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001007523 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 2 (F8A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001007524 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 3 (F8A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012151 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369445 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154686576:154688276:-1 gene:ENSG00000185990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039693 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:44976 IMAGE:5214628), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071963 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated (intronic transcript) 1, mRNA (cDNA clone MGC:88655 IMAGE:5477018), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155456914:155458672:-1 Gene:OTTHUMG00000034289 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor VIII-associated 1 (F8A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017990 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B1 (H2AFB1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001017991 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B2 (H2AFB2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_080720 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369444 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:154689080:154689596:-1 gene:ENSG00000185978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101409 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125404 IMAGE:40021547), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101415 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:125401 IMAGE:40021541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130510 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B3, mRNA (cDNA clone MGC:163382 IMAGE:40146541), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC134365 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:158903 IMAGE:40021542), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058812 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:155459415:155460005:-1 Gene:OTTHUMG00000022670 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fnk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H2A histone family, member B3 (H2AFB3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AM992879 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like (DDX11L1 gene). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nad.1 // UCSC Genes // Homo sapiens partial mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like (DDX11L1 gene). // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055574 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055574 cpcScore=-1.4795500 cnci=-0.1809586 gene:OTTHUMG00000021049 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055588 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055588 cpcScore=-0.8606690 cnci=-0.7661260 gene:OTTHUMG00000021054 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055605 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055605 cpcScore=-0.2320860 cnci=-0.1784928 gene:OTTHUMG00000021062 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055606 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055606 cpcScore=-1.4443900 cnci=-0.2494443 gene:OTTHUMG00000021062 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055610 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055610 cpcScore=-1.1964300 cnci=-0.2490402 gene:OTTHUMG00000021064 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX801696 // NONCODE // accn=AX801696 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1 cpcScore=0.2637120 cnci=-0.2356530 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038428 // NONCODE // accn=NR_038428 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038428 cpcScore=1.1896000 cnci=-0.2165793 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_612 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_612 cpcScore=-1.3194000 cnci=-0.2964023 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AM072428 // NONCODE // accn=AM072428 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000385522 cpcScore=-1.1187600 cnci=-0.2095420 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129568 // NONCODE // accn=AK129568 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=3 cpcScore=-1.2020400 cnci=-0.3572422 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF167081 // NONCODE // accn=AF167081 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4 cpcScore=0.9619700 cnci=-0.1291215 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF167080 // NONCODE // accn=AF167080 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4689 cpcScore=1.0834000 cnci=-0.1338657 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055705 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055705 cpcScore=-0.6600800 cnci=-0.2167413 gene:OTTHUMG00000021115 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055733 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055733 cpcScore=-1.3000800 cnci=-0.2778888 gene:OTTHUMG00000021126 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL079309 // NONCODE // accn=AL079309 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=10 cpcScore=-0.9741070 cnci=-0.3374082 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055790 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055790 cpcScore=-1.1154800 cnci=-0.2561470 gene:OTTHUMG00000021151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055791 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055791 cpcScore=-0.8934860 cnci=-0.1380641 gene:OTTHUMG00000021151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_339 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_339 cpcScore=-1.3409100 cnci=-0.3664062 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC022040 // NONCODE // accn=BC022040 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4691 cpcScore=-0.9848640 cnci=-0.2365378 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055820 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055820 cpcScore=-1.0833900 cnci=-0.3080018 gene:OTTHUMG00000021161 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_613 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_613 cpcScore=-1.3043200 cnci=-0.2100302 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00016969-XLOC_007932 // Rinn lincRNA // linc-GLRA2-1 chrX:+:13973511-13982023 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026551 // NONCODE // accn=NR_026551 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026551 cpcScore=2.3969300 cnci=-0.0946609 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_626 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_626 cpcScore=-1.3185600 cnci=-0.2179599 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033181 // NONCODE // accn=NR_033181 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033181 cpcScore=5.3160700 cnci=-0.3318146 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123142 // NONCODE // accn=AK123142 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=16 cpcScore=-1.1146800 cnci=-0.3442032 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK097484 // NONCODE // accn=AK097484 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=17 cpcScore=-1.2422500 cnci=-0.3910720 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040915 // NONCODE // accn=BC040915 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=18 cpcScore=-0.8155770 cnci=-0.2693712 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC073810 // NONCODE // accn=BC073810 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=19 cpcScore=-0.6609620 cnci=-0.1351350 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038597 // NONCODE // accn=BC038597 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=20 cpcScore=-0.5944470 cnci=-0.2488490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056029 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056029 cpcScore=0.3319580 cnci=-0.3342359 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
FJ423751 // NONCODE // accn=FJ423751 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000558582 cpcScore=0.3746710 cnci=-0.0321000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056041 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056041 cpcScore=1.0736800 cnci=-0.3334216 gene:OTTHUMG00000021246 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027783 // NONCODE // accn=NR_027783 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027783 cpcScore=2.0757800 cnci=-0.3306485 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR624470 // NONCODE // accn=CR624470 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000303665 cpcScore=-0.3967830 cnci=-0.3726592 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF274932 // NONCODE // accn=AF274932 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000075889 cpcScore=-1.2614900 cnci=-0.5580548 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY736017 // NONCODE // accn=AY736017 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332226 cpcScore=0.8311080 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038512 // NONCODE // accn=BC038512 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=25 cpcScore=-1.1574800 cnci=-0.3624066 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056119 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056119 cpcScore=0.0695077 cnci=-0.3622327 gene:OTTHUMG00000021281 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF164963 // NONCODE // accn=AF164963 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4697 cpcScore=-1.1357200 cnci=-0.3629306 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dbv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dbv.1 cpcScore=4.8043800 cnci=-0.2836783 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056203 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056203 cpcScore=-0.2419660 cnci=-0.3762326 gene:OTTHUMG00000021338 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056204 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056204 cpcScore=-0.4675610 cnci=-0.4315338 gene:OTTHUMG00000021338 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030786 // NONCODE // accn=BC030786 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=32 cpcScore=1.9872600 cnci=-0.3883392 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010ngy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010ngy.1 cpcScore=4.6498900 cnci=-0.2313582 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060654 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060654 cpcScore=-1.1207200 cnci=-0.3227268 gene:OTTHUMG00000024091 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060663 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060663 cpcScore=0.4322900 cnci=-0.1888889 gene:OTTHUMG00000024099 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000080721 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000080721 cpcScore=-0.3854040 cnci=-0.1649749 gene:OTTHUMG00000033140 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080722 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000080722 cpcScore=-1.0259000 cnci=-0.1615224 gene:OTTHUMG00000033140 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039399 // NONCODE // accn=BC039399 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=39 cpcScore=1.8041900 cnci=-0.2440012 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_629 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_629 cpcScore=-1.3947900 cnci=-0.3283851 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_630 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_630 cpcScore=-1.4014400 cnci=-0.5217829 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056247 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056247 cpcScore=0.3657410 cnci=-0.3702121 gene:OTTHUMG00000021366 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056295 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056295 cpcScore=-0.7404440 cnci=-0.2317555 gene:OTTHUMG00000021383 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056296 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056296 cpcScore=-0.9878210 cnci=-0.2956590 gene:OTTHUMG00000021383 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056297 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056297 cpcScore=-0.9907860 cnci=-0.3921021 gene:OTTHUMG00000021384 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056341 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056341 cpcScore=-0.8181410 cnci=-0.2500448 gene:OTTHUMG00000021406 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056342 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056342 cpcScore=2.1786600 cnci=-0.3916258 gene:OTTHUMG00000021406 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1247 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1247 cpcScore=-1.3148400 cnci=-0.3351147 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_632 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_632 cpcScore=-1.3628100 cnci=-0.2949054 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dgq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dgq.1 cpcScore=0.2099470 cnci=-0.2388723 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086196 // NONCODE // accn=AF086196 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5443 cpcScore=-1.1347800 cnci=-0.2983513 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_633 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_633 cpcScore=-1.5087300 cnci=-0.3099702 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86969 // NONCODE // accn=D86969 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=54 cpcScore=8.2041100 cnci=-0.2955297 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L43845 // NONCODE // accn=L43845 class=snRNA name=u12 snRNA ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.3482772 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056411 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056411 cpcScore=-0.9207430 cnci=-0.3958487 gene:OTTHUMG00000021439 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC112175 // NONCODE // accn=BC112175 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000340304 cpcScore=2.2641700 cnci=-0.2243693 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dhl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dhl.2 cpcScore=0.7768980 cnci=-0.2374606 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_35 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_35 cpcScore=-1.3485000 cnci=-0.2430682 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_23 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_23 cpcScore=-1.3070600 cnci=-0.2047243 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR605071 // NONCODE // accn=CR605071 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000284266 cpcScore=-0.5747510 cnci=-0.0348696 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027444 // NONCODE // accn=NR_027444 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027444 cpcScore=-0.7452170 cnci=-0.2779976 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028119 // NONCODE // accn=NR_028119 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028119 cpcScore=-1.0240900 cnci=-0.1718120 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026716 // NONCODE // accn=AK026716 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=69 cpcScore=-1.0851600 cnci=-0.3155148 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028366 // NONCODE // accn=NR_028366 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028366 cpcScore=4.2085000 cnci=-0.1579664 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ508600 // NONCODE // accn=AJ508600 class=snoRNA name=5SN3 snoRNA ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.2433539 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029427 // NONCODE // accn=NR_029427 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_029427 cpcScore=8.9318200 cnci=-0.0536732 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_634 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_634 cpcScore=-1.3179500 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094377 // NONCODE // accn=AK094377 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=71 cpcScore=-1.1994000 cnci=-0.1792642 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK023038 // NONCODE // accn=AK023038 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=73 cpcScore=-0.9684890 cnci=-0.2100453 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC005363 // NONCODE // accn=BC005363 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000086518_08 cpcScore=1.2841500 cnci=-0.1889105 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY672104 // NONCODE // accn=AY672104 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332082 cpcScore=1.7195200 cnci=-0.1895565 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ421672 // NONCODE // accn=AJ421672 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000247904 cpcScore=-1.0418800 cnci=-0.2699395 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AJ421673 // NONCODE // accn=AJ421673 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000247905 cpcScore=-1.0466000 cnci=-0.2127834 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AJ421674 // NONCODE // accn=AJ421674 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000247906 cpcScore=-1.2074500 cnci=-0.2345812 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003933 // NONCODE // accn=NR_003933 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003933 cpcScore=2.6790000 cnci=-0.1132207 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056580 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056580 cpcScore=-1.0198000 cnci=-0.3277510 gene:OTTHUMG00000021532 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056581 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056581 cpcScore=-1.0481500 cnci=-0.3463616 gene:OTTHUMG00000021532 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033251 // NONCODE // accn=NR_033251 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033251 cpcScore=1.0184600 cnci=-0.1742921 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_635 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_635 cpcScore=-1.3614000 cnci=-0.2745119 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC013072 // NONCODE // accn=BC013072 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=83 cpcScore=-1.0747400 cnci=-0.1997126 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_15 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_15 cpcScore=-1.2809500 cnci=-0.2019644 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dry.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dry.2 cpcScore=0.5544190 cnci=-0.1672634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY927614 // NONCODE // accn=AY927614 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332776 cpcScore=-0.9362970 cnci=-0.1248571 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF069136 // NONCODE // accn=AF069136 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000065646 cpcScore=-1.0474500 cnci=-0.2204950 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF069136 // NONCODE // accn=AF069136 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=85 cpcScore=-1.3326800 cnci=-0.1449271 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF069137 // NONCODE // accn=AF069137 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000065647 cpcScore=-0.9121840 cnci=-0.1106643 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF069135 // NONCODE // accn=AF069135 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000065645 cpcScore=-1.3760700 cnci=-0.3446229 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC107040 // NONCODE // accn=BC107040 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000338604 cpcScore=1.1127000 cnci=-0.1501813 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK054627 // NONCODE // accn=AK054627 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=104 cpcScore=-1.2161500 cnci=-0.3938545 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056896 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056896 cpcScore=2.6793000 cnci=-0.3336678 gene:OTTHUMG00000021671 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056910 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056910 cpcScore=-0.8803040 cnci=-0.4851310 gene:OTTHUMG00000021679 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_16 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_16 cpcScore=-1.5709800 cnci=-0.1809724 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056978 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056978 cpcScore=-1.0469800 cnci=-0.2760088 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056979 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056979 cpcScore=-1.0295400 cnci=-0.3313573 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056980 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056980 cpcScore=-0.9819230 cnci=-0.3455265 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1375 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1375 cpcScore=-1.3519400 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U00945 // NONCODE // accn=U00945 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=114 cpcScore=-1.1063900 cnci=-0.3106947 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056991 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056991 cpcScore=-0.5719160 cnci=-0.2787533 gene:OTTHUMG00000021729 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dwg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dwg.1 cpcScore=-1.1224500 cnci=-0.2599494 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mox.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mox.1 cpcScore=-1.1162700 cnci=-0.2586438 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075034 // NONCODE // accn=AF075034 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000066056 cpcScore=-0.9857410 cnci=-0.4537902 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U79272 // NONCODE // accn=U79272 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=119 cpcScore=-1.2186700 cnci=-0.3332078 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dwz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dwz.2 cpcScore=-0.0503229 cnci=-0.4181090 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_618 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_618 cpcScore=-1.6476000 cnci=-0.2175443 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ306428 // NONCODE // accn=AJ306428 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000246932 cpcScore=1.5040700 cnci=-0.0742116 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U23863 // NONCODE // accn=U23863 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000218717 cpcScore=0.5035280 cnci=-0.0267087 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058868 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058868 cpcScore=-1.2030800 cnci=-0.1674546 gene:OTTHUMG00000022687 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057167 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057167 cpcScore=-1.1511400 cnci=-0.2642282 gene:OTTHUMG00000021804 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034004 // NONCODE // accn=NR_034004 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034004 cpcScore=2.5905700 cnci=-0.2683759 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_619 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_619 cpcScore=-1.6016300 cnci=-0.2246619 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eai.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eai.2 cpcScore=2.2845600 cnci=-0.2185488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056217 // NONCODE // accn=AK056217 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=136 cpcScore=-0.0784737 cnci=-0.2619791 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033187 // NONCODE // accn=NR_033187 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033187 cpcScore=1.4923000 cnci=-0.2588828 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY730282 // NONCODE // accn=AY730282 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332221 cpcScore=2.0062200 cnci=-0.2113505 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL832095 // NONCODE // accn=AL832095 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=137 cpcScore=2.3838800 cnci=-0.4339961 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057243 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057243 cpcScore=-1.1850300 cnci=-0.3519028 gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057244 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057244 cpcScore=-1.2387700 cnci=-0.2388473 gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057245 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057245 cpcScore=-0.9786610 cnci=-0.3069367 gene:OTTHUMG00000021840 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057238 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057238 cpcScore=-0.7894930 cnci=-0.2876474 gene:OTTHUMG00000021838 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030774 // NONCODE // accn=NR_030774 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_030774 cpcScore=4.0203200 cnci=-0.3222767 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ecf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ecf.1 cpcScore=1.2334600 cnci=-0.3602225 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057290 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057290 cpcScore=-1.2715500 cnci=-0.4295435 gene:OTTHUMG00000021872 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_640 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_640 cpcScore=-1.3315700 cnci=-0.3886622 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086039 // NONCODE // accn=AF086039 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000066918 cpcScore=-1.2793000 cnci=-0.7214292 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1310 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1310 cpcScore=-1.5491900 cnci=-0.2938526 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040290 // NONCODE // accn=BC040290 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=165 cpcScore=1.0227500 cnci=-0.1269570 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057387 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057387 cpcScore=-0.1932190 cnci=-0.4037870 gene:OTTHUMG00000021932 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057422 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057422 cpcScore=-1.1764000 cnci=-0.3207443 gene:OTTHUMG00000021953 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057423 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057423 cpcScore=-1.0773300 cnci=-0.1351471 gene:OTTHUMG00000021953 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057428 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057428 cpcScore=-0.6732610 cnci=-0.3225927 gene:OTTHUMG00000021958 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ564851 // NONCODE // accn=AJ564851 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000248805 cpcScore=-1.3268400 cnci=-0.2879851 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_641 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_641 cpcScore=-1.3483500 cnci=-0.3317359 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_336 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_336 cpcScore=-1.3335900 cnci=-0.2904476 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086477 // NONCODE // accn=AF086477 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000067356 cpcScore=-1.2552000 cnci=-0.3233177 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098473 // NONCODE // accn=AK098473 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=175 cpcScore=-1.1923300 cnci=-0.3490976 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033967 // NONCODE // accn=BC033967 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=176 cpcScore=-0.9034140 cnci=-0.2924093 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK091670 // NONCODE // accn=AK091670 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=177 cpcScore=-1.1080700 cnci=-0.2541751 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085872 // NONCODE // accn=AF085872 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=180 cpcScore=-0.9087410 cnci=-0.2740108 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057680 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057680 cpcScore=-0.9275980 cnci=-0.2471032 gene:OTTHUMG00000022085 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057681 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057681 cpcScore=-1.3988200 cnci=-0.3031804 gene:OTTHUMG00000022085 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ297363 // NONCODE // accn=AJ297363 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000246735 cpcScore=-0.1640390 cnci=-0.0883131 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1232 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1232 cpcScore=-1.3571500 cnci=-0.3145812 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z36792 // NONCODE // accn=Z36792 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000327100 cpcScore=-1.0950500 cnci=-0.0987122 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK091319 // NONCODE // accn=AK091319 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=184 cpcScore=-1.1993900 cnci=-0.3953064 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_642 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_642 cpcScore=-1.5282300 cnci=-0.4328318 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043382 // NONCODE // accn=BC043382 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=185 cpcScore=-0.9574120 cnci=-0.3036500 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038978 // NONCODE // accn=NR_038978 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038978 cpcScore=-0.9763310 cnci=-0.3670428 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1302 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1302 cpcScore=-1.4031800 cnci=-0.2937292 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eln.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eln.1 cpcScore=-1.2887200 cnci=-0.3069389 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086548 // NONCODE // accn=AF086548 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=187 cpcScore=-1.0918100 cnci=-0.3364219 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026694 // NONCODE // accn=NR_026694 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026694 cpcScore=-1.2023000 cnci=-0.2292285 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC054032 // NONCODE // accn=BC054032 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000259409 cpcScore=9.8974000 cnci=-0.3091516 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_644 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_644 cpcScore=-1.3262100 cnci=-0.1939682 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098221 // NONCODE // accn=AK098221 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=200 cpcScore=-1.1449700 cnci=-0.2803208 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M90464 // NONCODE // accn=M90464 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=204 cpcScore=5.5056800 cnci=-0.1996094 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL049291 // NONCODE // accn=AL049291 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=205 cpcScore=-0.9573070 cnci=-0.3814447 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1651 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1651 cpcScore=-1.2180600 cnci=-0.3016361 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_645 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_645 cpcScore=-1.4118900 cnci=-0.2428000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_646 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_646 cpcScore=-1.2731700 cnci=-0.2669586 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eon.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eon.1 cpcScore=5.9213900 cnci=-0.2098643 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY007113 // NONCODE // accn=AY007113 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=211 cpcScore=-1.3130600 cnci=-0.3465037 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eos.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eos.1 cpcScore=1.0870300 cnci=-0.2859956 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123629 // NONCODE // accn=AK123629 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=212 cpcScore=-0.8434710 cnci=-0.3320488 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX537613 // NONCODE // accn=BX537613 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=213 cpcScore=-1.1625700 cnci=-0.3864746 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L32067 // NONCODE // accn=L32067 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000192853 cpcScore=-1.1139900 cnci=-0.2514495 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_29 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_29 cpcScore=-1.6397700 cnci=-0.2736331 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00016921-XLOC_008046 // Rinn lincRNA // linc-ALG13 chrX:+:110754889-110765625 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033125 // NONCODE // accn=NR_033125 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033125 cpcScore=1.4075600 cnci=-0.4489273 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033124 // NONCODE // accn=NR_033124 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033124 cpcScore=9.3581200 cnci=-0.1442070 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033127 // NONCODE // accn=NR_033127 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033127 cpcScore=11.0240000 cnci=-0.2491357 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033132 // NONCODE // accn=NR_033132 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033132 cpcScore=1.5888800 cnci=-0.4437356 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026828 // NONCODE // accn=AK026828 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=218 cpcScore=-1.0892000 cnci=-0.3085894 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC034811 // NONCODE // accn=BC034811 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4736 cpcScore=1.3104900 cnci=-0.3992104 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK127862 // NONCODE // accn=AK127862 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=219 cpcScore=-1.1084700 cnci=-0.3797048 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1804 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1804 cpcScore=-1.3101600 cnci=-0.3033081 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000080578 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000080578 cpcScore=-0.3293820 cnci=-0.1588741 gene:OTTHUMG00000033102 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080579 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000080579 cpcScore=-0.4372350 cnci=-0.2030581 gene:OTTHUMG00000033102 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X87723 // NONCODE // accn=X87723 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000324307 cpcScore=-1.3204500 cnci=-0.3369410 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058013 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058013 cpcScore=0.0760592 cnci=-0.3859716 gene:OTTHUMG00000022260 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058027 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058027 cpcScore=0.3695730 cnci=-0.2811668 gene:OTTHUMG00000022271 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK091435 // NONCODE // accn=AK091435 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=224 cpcScore=-0.8591940 cnci=-0.1248213 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004esi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004esi.1 cpcScore=-0.0328148 cnci=-0.3135573 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX641171 // NONCODE // accn=BX641171 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=226 cpcScore=-1.1551700 cnci=-0.4373500 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2084 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2084 cpcScore=-1.3984300 cnci=-0.3511436 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037916 // NONCODE // accn=NR_037916 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037916 cpcScore=1.0119700 cnci=-0.3719233 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ655921 // NONCODE // accn=DQ655921 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393034 cpcScore=-0.8499010 cnci=-0.1846515 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ655922 // NONCODE // accn=DQ655922 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393035 cpcScore=-0.8620040 cnci=-0.2383940 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058182 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058182 cpcScore=-0.9868150 cnci=-0.3293166 gene:OTTHUMG00000022349 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D16468 // NONCODE // accn=D16468 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=229 cpcScore=-0.3364110 cnci=-0.4529025 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_30 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_30 cpcScore=-1.2859100 cnci=-0.2710829 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF093744 // NONCODE // accn=AF093744 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=234 cpcScore=-1.2688900 cnci=-0.3858694 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ewr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ewr.1 cpcScore=-0.2979410 cnci=-0.3073080 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_623 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_623 cpcScore=-1.6537300 cnci=-0.3814513 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085935 // NONCODE // accn=AF085935 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000066814 cpcScore=-1.2392400 cnci=-0.3673795 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017958 // NONCODE // accn=BC017958 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=239 cpcScore=3.0345900 cnci=-0.3810478 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058374 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058374 cpcScore=-0.8127620 cnci=-0.2990760 gene:OTTHUMG00000022456 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U31737 // NONCODE // accn=U31737 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000219158 cpcScore=-1.2810800 cnci=-0.4991723 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U31735 // NONCODE // accn=U31735 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000219156 cpcScore=-0.7225220 cnci=-0.1237180 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY145439 // NONCODE // accn=AY145439 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=241 cpcScore=-1.2930200 cnci=-0.3882999 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058387 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058387 cpcScore=0.2240400 cnci=-0.2926191 gene:OTTHUMG00000022462 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR595668 // NONCODE // accn=CR595668 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=244 cpcScore=-1.0380700 cnci=-0.3563700 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058407 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058407 cpcScore=-1.2241400 cnci=-0.4160017 gene:OTTHUMG00000022476 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058408 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058408 cpcScore=-1.1626700 cnci=-0.3217179 gene:OTTHUMG00000022476 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058414 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058414 cpcScore=-1.1571800 cnci=-0.2166688 gene:OTTHUMG00000022481 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058412 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058412 cpcScore=-1.1001100 cnci=-0.2859081 gene:OTTHUMG00000022479 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027621 // NONCODE // accn=NR_027621 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027621 cpcScore=2.4650300 cnci=-0.2564994 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U60118 // NONCODE // accn=U60118 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000220620 cpcScore=1.5601100 cnci=-0.0910365 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fao.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fao.2 cpcScore=-1.2296600 cnci=-0.3055462 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D16472 // NONCODE // accn=D16472 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=252 cpcScore=-1.0198400 cnci=-0.3892133 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028597 // NONCODE // accn=NR_028597 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028597 cpcScore=1.8850800 cnci=-0.2570420 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028344 // NONCODE // accn=NR_028344 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028344 cpcScore=-0.3855310 cnci=-0.1800738 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028345 // NONCODE // accn=NR_028345 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028345 cpcScore=-1.2490700 cnci=-0.3570981 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058584 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058584 cpcScore=-1.1823600 cnci=-0.2605940 gene:OTTHUMG00000022550 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094540 // NONCODE // accn=AK094540 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=256 cpcScore=-1.1938200 cnci=-0.2793841 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042953 // NONCODE // accn=BC042953 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=257 cpcScore=-1.0616000 cnci=-0.3427013 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fbm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fbm.1 cpcScore=0.0234719 cnci=-0.2622472 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D16476 // NONCODE // accn=D16476 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=259 cpcScore=-1.2205500 cnci=-0.3728664 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058638 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058638 cpcScore=0.0626451 cnci=-0.3299117 gene:OTTHUMG00000022599 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033699 // NONCODE // accn=NR_033699 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033699 cpcScore=12.2622000 cnci=-0.3721171 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U66049 // NONCODE // accn=U66049 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000220904 cpcScore=-1.0388900 cnci=-0.2322702 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fdu.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fdu.2 cpcScore=-1.1474300 cnci=-0.2525309 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U66051 // NONCODE // accn=U66051 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000220906 cpcScore=-1.2443600 cnci=-0.1375287 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060865 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060865 cpcScore=-0.2227340 cnci=-0.2728836 gene:OTTHUMG00000024161 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060866 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060866 cpcScore=0.0261635 cnci=-0.1427036 gene:OTTHUMG00000024161 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010378 // NONCODE // accn=BC010378 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000087473 cpcScore=1.7289400 cnci=-0.2955149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY114102 // NONCODE // accn=AY114102 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000250713 cpcScore=1.4891000 cnci=-0.1408096 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000078422 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000078422 cpcScore=-1.2574500 cnci=-0.3692310 gene:OTTHUMG00000032120 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033262 // NONCODE // accn=NR_033262 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033262 cpcScore=2.4764400 cnci=-0.1751153 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ844639 // NONCODE // accn=AJ844639 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000249441_04 cpcScore=-1.3137400 cnci=-0.2079340 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060955 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060955 cpcScore=-0.9989480 cnci=-0.2286229 gene:OTTHUMG00000024201 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK057819 // NONCODE // accn=AK057819 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=268 cpcScore=-1.0134400 cnci=-0.2284004 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC047580 // NONCODE // accn=BC047580 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=270 cpcScore=-0.6974970 cnci=-0.1638582 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U87167 // NONCODE // accn=U87167 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000222014 cpcScore=1.3172900 cnci=-0.0571948 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037927 // NONCODE // accn=NR_037927 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037927 cpcScore=2.5588700 cnci=-0.0771722 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X78938 // NONCODE // accn=X78938 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323694 cpcScore=-1.0736700 cnci=-0.1358954 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027419 // NONCODE // accn=NR_027419 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027419 cpcScore=3.0503200 cnci=-0.1137698 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010531 // NONCODE // accn=BC010531 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=277 cpcScore=-0.8578790 cnci=-0.1173384 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M13304 // NONCODE // accn=M13304 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000397419 cpcScore=1.8223000 cnci=-0.1618219 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X54707 // NONCODE // accn=X54707 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000398779 cpcScore=1.8821600 cnci=-0.1631683 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026898 // NONCODE // accn=NR_026898 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026898 cpcScore=3.7320300 cnci=-0.1873842 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024048 // NONCODE // accn=NR_024048 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024048 cpcScore=5.9558500 cnci=-0.1003267 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X87195 // NONCODE // accn=X87195 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000324268 cpcScore=-1.2380800 cnci=-0.3579502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL365368 // NONCODE // accn=AL365368 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000250522 cpcScore=2.0814100 cnci=-0.1930856 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X87197 // NONCODE // accn=X87197 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000324270 cpcScore=2.6960400 cnci=-0.0198409 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ655958 // NONCODE // accn=DQ655958 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393071 cpcScore=-0.8301930 cnci=-0.0543029 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1697 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1697 cpcScore=-1.2564900 cnci=-0.1167320 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011mzt.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mzt.1 cpcScore=4.1891000 cnci=-0.2715193 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058813 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058813 cpcScore=-1.2860700 cnci=-0.3864691 gene:OTTHUMG00000022671 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095886 // NONCODE // accn=AK095886 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=285 cpcScore=-1.0353400 cnci=-0.2885925 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L23870 // NONCODE // accn=L23870 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=286 cpcScore=-1.0813800 cnci=-0.3482157 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033714 // NONCODE // accn=NR_033714 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033714 cpcScore=2.8618000 cnci=-0.3516288 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024033 // NONCODE // accn=NR_024033 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024033 cpcScore=10.0751000 cnci=-0.1039822 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055604 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055604 cpcScore=-1.4053400 cnci=-0.3079380 gene:OTTHUMG00000021061 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055623 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055623 cpcScore=-0.2895600 cnci=-0.3408290 gene:OTTHUMG00000021072 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035462 // NONCODE // accn=BC035462 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000093918_03 cpcScore=-1.3240800 cnci=-0.1669358 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038894 // NONCODE // accn=BC038894 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000095414_04 cpcScore=-1.1459300 cnci=-0.1539712 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034031 // NONCODE // accn=NR_034031 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034031 cpcScore=3.0376700 cnci=-0.1619021 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1565 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1565 cpcScore=-1.4047700 cnci=-0.1046660 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004crj.2 cpcScore=2.9432700 cnci=-0.2037657 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004crk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004crk.2 cpcScore=2.9350400 cnci=-0.0765711 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mhk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mhk.1 cpcScore=2.1711400 cnci=-0.0735965 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000144380 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000144380 cpcScore=-0.0366248 cnci=-0.3743936 gene:OTTHUMG00000067420 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055663 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055663 cpcScore=-1.2831700 cnci=-0.3771074 gene:OTTHUMG00000021088 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055667 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055667 cpcScore=-0.2113410 cnci=-0.1519759 gene:OTTHUMG00000021092 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055668 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055668 cpcScore=-0.9623560 cnci=-0.2270872 gene:OTTHUMG00000021092 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055669 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055669 cpcScore=-0.9138780 cnci=-0.2006355 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR608080 // NONCODE // accn=CR608080 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4688 cpcScore=-1.2250000 cnci=-0.3979325 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055680 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055680 cpcScore=-1.1469300 cnci=-0.3510136 gene:OTTHUMG00000021098 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_624 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_624 cpcScore=-1.4393000 cnci=-0.4148553 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055698 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055698 cpcScore=-1.2748500 cnci=-0.5411226 gene:OTTHUMG00000021111 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093192 // NONCODE // accn=AK093192 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4690 cpcScore=-0.9106810 cnci=-0.2356304 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ctx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ctx.2 cpcScore=0.2671300 cnci=-0.4342178 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY112901 // NONCODE // accn=AY112901 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000084455 cpcScore=-1.0967800 cnci=-0.1676536 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL833277 // NONCODE // accn=AL833277 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=6 cpcScore=-1.0345400 cnci=-0.3490206 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF143324 // NONCODE // accn=AF143324 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=7 cpcScore=-1.0900600 cnci=-0.3976351 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL079282 // NONCODE // accn=AL079282 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000250121 cpcScore=-0.8278150 cnci=-0.3023661 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027253 // NONCODE // accn=AK027253 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=8 cpcScore=-1.2520700 cnci=-0.2907262 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037548 // NONCODE // accn=BC037548 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=9 cpcScore=0.0893627 cnci=-0.1951857 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_625 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_625 cpcScore=-1.5264800 cnci=-0.0796302 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055788 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055788 cpcScore=-0.3156310 cnci=-0.3770337 gene:OTTHUMG00000021149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000107231 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000107231 cpcScore=-0.3070910 cnci=-0.2903655 gene:OTTHUMG00000021149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055825 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055825 cpcScore=-1.0984800 cnci=-0.3060046 gene:OTTHUMG00000021163 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033835 // NONCODE // accn=NR_033835 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033835 cpcScore=5.2850200 cnci=-0.3215718 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033836 // NONCODE // accn=NR_033836 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033836 cpcScore=3.2816300 cnci=-0.3559763 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL079289 // NONCODE // accn=AL079289 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=11 cpcScore=-1.1210500 cnci=-0.3812214 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037859 // NONCODE // accn=NR_037859 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037859 cpcScore=2.8918500 cnci=-0.1972995 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Y10697 // NONCODE // accn=Y10697 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=12 cpcScore=-1.2588200 cnci=-0.3375151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1332 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1332 cpcScore=-1.3278400 cnci=-0.3733749 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1641 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1641 cpcScore=-1.2964600 cnci=-0.2091663 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1760 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1760 cpcScore=-1.2905700 cnci=-0.1976734 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033348 // NONCODE // accn=NR_033348 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033348 cpcScore=13.1475000 cnci=-0.1477389 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033349 // NONCODE // accn=NR_033349 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033349 cpcScore=13.1860000 cnci=-0.2184869 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000055939 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000055939 cpcScore=-0.0847313 cnci=-0.2674170 gene:OTTHUMG00000021210 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033717 // NONCODE // accn=NR_033717 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033717 cpcScore=6.0379300 cnci=-0.2840241 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_627 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_627 cpcScore=-1.2914200 cnci=-0.2817301 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X73875 // NONCODE // accn=X73875 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323403 cpcScore=0.2920480 cnci=-0.1768132 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY429563 // NONCODE // accn=AY429563 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000254651 cpcScore=4.4018500 cnci=-0.1959634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095185 // NONCODE // accn=AK095185 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=22 cpcScore=-1.0140500 cnci=-0.2476566 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026545 // NONCODE // accn=NR_026545 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026545 cpcScore=3.6700600 cnci=-0.2188689 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY038071 // NONCODE // accn=AY038071 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=26 cpcScore=8.1005900 cnci=-0.0305328 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056135 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056135 cpcScore=-0.9621960 cnci=-0.2857628 gene:OTTHUMG00000021297 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002784 // NONCODE // accn=NR_002784 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002784 cpcScore=13.6547000 cnci=-0.2457710 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056151 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056151 cpcScore=0.2359240 cnci=-0.3697512 gene:OTTHUMG00000021313 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF181286 // NONCODE // accn=AF181286 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000072817 cpcScore=-1.0709800 cnci=-0.2908693 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S74720 // NONCODE // accn=S74720 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=30 cpcScore=4.9932500 cnci=-0.1317777 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1538 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1538 cpcScore=-1.3145700 cnci=-0.3599663 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S38776 // NONCODE // accn=S38776 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000215569 cpcScore=0.0096730 cnci=-0.2228243 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S60973 // NONCODE // accn=S60973 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000215953 cpcScore=1.2449300 cnci=-0.1569370 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M63073 // NONCODE // accn=M63073 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000196056 cpcScore=1.1315800 cnci=-0.2789244 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060658 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060658 cpcScore=-1.2840200 cnci=-0.4160437 gene:OTTHUMG00000024094 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060659 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060659 cpcScore=-1.1684100 cnci=-0.3631478 gene:OTTHUMG00000024095 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144797 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000144797 cpcScore=-1.0172500 cnci=-0.3097277 gene:OTTHUMG00000024095 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060660 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060660 cpcScore=-1.0593400 cnci=-0.1761559 gene:OTTHUMG00000024096 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060661 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060661 cpcScore=-1.2791700 cnci=-0.3599606 gene:OTTHUMG00000024097 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR591476 // NONCODE // accn=CR591476 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=35 cpcScore=-1.0786300 cnci=-0.2136081 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125468 // NONCODE // accn=AK125468 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=37 cpcScore=-0.9797720 cnci=-0.1779769 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1839 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1839 cpcScore=-1.3319100 cnci=-0.1199497 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00030473-XLOC_l2_015711 // Broad TUCP // linc-MED14-2 chrX:-:40691122-40691926 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mkp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mkp.1 cpcScore=6.5027000 cnci=-0.1473522 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056476 // NONCODE // accn=AK056476 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=43 cpcScore=-0.5890090 cnci=-0.2475546 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056291 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056291 cpcScore=-1.2298400 cnci=-0.3649640 gene:OTTHUMG00000021379 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002191 // NONCODE // accn=NR_002191 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002191 cpcScore=2.8274300 cnci=-0.1282859 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_614 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_614 cpcScore=-1.6419400 cnci=-0.3414293 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF088019 // NONCODE // accn=AF088019 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=46 cpcScore=-1.0876200 cnci=-0.2440620 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_631 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_631 cpcScore=-1.4075800 cnci=-0.2811336 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056347 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056347 cpcScore=-0.0561791 cnci=-0.1400742 gene:OTTHUMG00000021411 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056348 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056348 cpcScore=1.2401600 cnci=-0.2254895 gene:OTTHUMG00000021411 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056353 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056353 cpcScore=-1.1647000 cnci=-0.4390814 gene:OTTHUMG00000021416 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024234 // NONCODE // accn=NR_024234 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024234 cpcScore=3.4983100 cnci=-0.1342183 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2028 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2028 cpcScore=-1.5514000 cnci=-0.3159535 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033730 // NONCODE // accn=NR_033730 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033730 cpcScore=8.5756700 cnci=-0.1168648 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056483 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056483 cpcScore=-1.1776400 cnci=-0.1236370 gene:OTTHUMG00000021486 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060763 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060763 cpcScore=-0.2589900 cnci=-0.2061442 gene:OTTHUMG00000024122 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147307 // NONCODE // accn=AF147307 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=72 cpcScore=-0.9506400 cnci=-0.1014387 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026742 // NONCODE // accn=NR_026742 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026742 cpcScore=3.9200400 cnci=-0.2226403 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dpc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dpc.1 cpcScore=1.4005400 cnci=-0.3316548 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY044234 // NONCODE // accn=AY044234 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=75 cpcScore=7.2152500 cnci=-0.1871231 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027121 // NONCODE // accn=NR_027121 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027121 cpcScore=13.9453000 cnci=-0.1943475 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_615 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_615 cpcScore=-1.3071500 cnci=-0.2818454 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056582 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056582 cpcScore=-1.2987100 cnci=-0.4157318 gene:OTTHUMG00000021533 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056584 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056584 cpcScore=-1.0824000 cnci=-0.2099116 gene:OTTHUMG00000021535 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033772 // NONCODE // accn=NR_033772 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033772 cpcScore=1.3990600 cnci=-0.1460213 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dqd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dqd.2 cpcScore=0.4045140 cnci=-0.3008187 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR621898 // NONCODE // accn=CR621898 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4707 cpcScore=-1.0817700 cnci=-0.4291540 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000056721 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000056721 cpcScore=-1.1983600 cnci=-0.4661423 gene:OTTHUMG00000021599 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024449 // NONCODE // accn=NR_024449 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024449 cpcScore=2.1642500 cnci=-0.1458017 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038184 // NONCODE // accn=BC038184 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=105 cpcScore=5.1685000 cnci=-0.1462541 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125664 // NONCODE // accn=AK125664 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=106 cpcScore=-1.1525600 cnci=-0.3268759 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124653 // NONCODE // accn=AK124653 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=107 cpcScore=-1.0725200 cnci=-0.3373205 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR591436 // NONCODE // accn=CR591436 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=108 cpcScore=2.4781900 cnci=-0.3654206 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030722 // NONCODE // accn=NR_030722 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_030722 cpcScore=1.0424600 cnci=-0.3083010 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033460 // NONCODE // accn=NR_033460 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033460 cpcScore=1.5583700 cnci=-0.1352856 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035907 // NONCODE // accn=BC035907 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000094165 cpcScore=2.9122700 cnci=-0.1755334 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF069138 // NONCODE // accn=AF069138 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4712 cpcScore=-0.8570020 cnci=-0.3394684 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010nki.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nki.1 cpcScore=2.2680500 cnci=-0.3732588 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_127 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_127 cpcScore=-1.6503300 cnci=-0.2997794 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_210 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_210 cpcScore=-1.3160000 cnci=-0.2553460 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027139 // NONCODE // accn=NR_027139 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027139 cpcScore=0.2785670 cnci=-0.2454149 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_636 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_636 cpcScore=-1.2893900 cnci=-0.3112562 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_637 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_637 cpcScore=-1.2888700 cnci=-0.2923872 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK122879 // NONCODE // accn=AK122879 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=116 cpcScore=2.7778000 cnci=-0.2627888 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045044 // NONCODE // accn=NR_045044 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_045044 cpcScore=5.0931600 cnci=-0.2375134 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033742 // NONCODE // accn=NR_033742 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033742 cpcScore=8.7131400 cnci=-0.0594025 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_638 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_638 cpcScore=-1.2895100 cnci=-0.4530307 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF070565 // NONCODE // accn=AF070565 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=117 cpcScore=-1.1826200 cnci=-0.3460537 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_639 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_639 cpcScore=-1.3277500 cnci=-0.2272875 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057038 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057038 cpcScore=-1.2557300 cnci=-0.3620589 gene:OTTHUMG00000021757 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dyq.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dyq.2 cpcScore=-0.9594620 cnci=-0.2596766 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057132 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057132 cpcScore=-1.1078100 cnci=-0.2492703 gene:OTTHUMG00000021796 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033212 // NONCODE // accn=NR_033212 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033212 cpcScore=3.2262000 cnci=-0.2329393 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004dzz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004dzz.2 cpcScore=1.2492100 cnci=-0.1782794 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058987 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058987 cpcScore=-0.9759220 cnci=-0.3235962 gene:OTTHUMG00000022722 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058988 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058988 cpcScore=-0.2853500 cnci=-0.1898483 gene:OTTHUMG00000022722 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058911 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058911 cpcScore=-1.3980000 cnci=-0.2701904 gene:OTTHUMG00000022702 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057168 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057168 cpcScore=-1.1758000 cnci=-0.2088557 gene:OTTHUMG00000021805 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000086423 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086423 cpcScore=-1.2440400 cnci=-0.3036265 gene:OTTHUMG00000035613 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086424 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086424 cpcScore=-1.1757500 cnci=-0.3432501 gene:OTTHUMG00000035613 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057212 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057212 cpcScore=-1.3167500 cnci=-0.5170590 gene:OTTHUMG00000021819 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057213 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057213 cpcScore=-1.3603000 cnci=-0.5031947 gene:OTTHUMG00000021819 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034116 // NONCODE // accn=NR_034116 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034116 cpcScore=3.2269800 cnci=-0.1337652 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ebe.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebe.3 cpcScore=1.6146500 cnci=-0.2293483 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ebh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebh.1 cpcScore=3.1458400 cnci=-0.2359671 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057239 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057239 cpcScore=3.8963400 cnci=-0.3476478 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057240 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057240 cpcScore=1.2891600 cnci=-0.2984493 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057241 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057241 cpcScore=1.4374700 cnci=-0.3739812 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057242 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057242 cpcScore=-0.1277510 cnci=-0.3200614 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083628 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000083628 cpcScore=0.6553920 cnci=-0.3083640 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083629 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000083629 cpcScore=1.3398000 cnci=-0.2295170 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083630 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000083630 cpcScore=1.0982800 cnci=-0.3402432 gene:OTTHUMG00000021839 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016373 // NONCODE // accn=BC016373 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=139 cpcScore=-1.1097700 cnci=-0.2432233 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebr.1 cpcScore=-0.5926650 cnci=-0.2643259 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nlq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nlq.1 cpcScore=-1.1108800 cnci=-0.3049437 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_152 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_152 cpcScore=-1.2887500 cnci=-0.3048318 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00030535-XLOC_l2_015760 // Broad TUCP // linc-NAP1L2-3 chrX:-:73465728-73495795 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00030536-XLOC_l2_015760 // Broad TUCP // linc-NAP1L2-3 chrX:-:73492775-73504672 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00030833-XLOC_l2_015760 // Broad TUCP // linc-NAP1L2-3 chrX:-:73501539-73504697 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebq.1 cpcScore=1.4206700 cnci=-0.2693856 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057255 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057255 cpcScore=1.9653600 cnci=-0.2999215 gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057256 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057256 cpcScore=-0.0533554 cnci=-0.3472704 gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057257 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057257 cpcScore=0.1161310 cnci=-0.3740590 gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057258 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057258 cpcScore=-0.4045030 cnci=-0.3436956 gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057259 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057259 cpcScore=-0.6793120 cnci=-0.3391461 gene:OTTHUMG00000021850 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX649033 // NONCODE // accn=BX649033 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4720 cpcScore=-1.0333500 cnci=-0.3499965 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC027222 // NONCODE // accn=BC027222 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=140 cpcScore=-1.1734000 cnci=-0.3953118 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123754 // NONCODE // accn=AK123754 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=143 cpcScore=-0.1669420 cnci=-0.3393892 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1432 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1432 cpcScore=-1.3119700 cnci=-0.2016114 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L33812 // NONCODE // accn=L33812 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000193105_03 cpcScore=0.1898010 cnci=-0.7486484 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR608622 // NONCODE // accn=CR608622 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000287817_03 cpcScore=-1.3765200 cnci=-0.6470843 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK090573 // NONCODE // accn=AK090573 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=162 cpcScore=-0.6375070 cnci=-0.3743477 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026301 // NONCODE // accn=AK026301 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=164 cpcScore=-1.2448900 cnci=-0.4221083 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004efp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004efp.1 cpcScore=1.8634800 cnci=-0.2138497 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_621 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_621 cpcScore=-1.7149800 cnci=-0.3925604 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1937 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1937 cpcScore=-1.3505600 cnci=-0.2636917 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010nmx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nmx.2 cpcScore=4.2845100 cnci=-0.3299605 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L22650 // NONCODE // accn=L22650 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=172 cpcScore=2.6333900 cnci=-0.2307021 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR620428 // NONCODE // accn=CR620428 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000299623 cpcScore=-1.3178100 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010nnf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nnf.2 cpcScore=5.2562300 cnci=-0.1887016 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004egm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004egm.2 cpcScore=4.8024900 cnci=-0.2938922 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057506 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057506 cpcScore=0.3302730 cnci=-0.3177274 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF153755 // NONCODE // accn=AF153755 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000071868 cpcScore=1.5881400 cnci=-0.2337586 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033669 // NONCODE // accn=NR_033669 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033669 cpcScore=-0.8366770 cnci=-0.1646652 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033670 // NONCODE // accn=NR_033670 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033670 cpcScore=-0.9481000 cnci=-0.1474558 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028089 // NONCODE // accn=NR_028089 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028089 cpcScore=8.9940100 cnci=-0.1894740 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036431 // NONCODE // accn=NR_036431 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036431 cpcScore=4.9575000 cnci=-0.3484917 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC113041 // NONCODE // accn=BC113041 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000386744 cpcScore=1.4071300 cnci=-0.4833121 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D82345 // NONCODE // accn=D82345 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4730 cpcScore=-0.1135790 cnci=-0.2942252 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123432 // NONCODE // accn=AK123432 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4732 cpcScore=-0.3214150 cnci=-0.3462964 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_310 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_310 cpcScore=-1.6041800 cnci=-0.4169398 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC105298 // NONCODE // accn=BC105298 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000338249 cpcScore=-1.0812800 cnci=-0.1341716 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX721149 // NONCODE // accn=AX721149 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=183 cpcScore=-1.0066300 cnci=-0.2020006 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057735 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057735 cpcScore=-1.1046600 cnci=-0.4047756 gene:OTTHUMG00000022105 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB050778 // NONCODE // accn=AB050778 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000059568 cpcScore=-1.2635700 cnci=-0.2239085 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_643 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_643 cpcScore=-1.3330300 cnci=-0.2547609 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC018033 // NONCODE // accn=BC018033 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=186 cpcScore=-1.0149500 cnci=-0.2499270 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057749 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057749 cpcScore=1.4132200 cnci=-0.4909176 gene:OTTHUMG00000022115 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026512 // NONCODE // accn=AK026512 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4733 cpcScore=-1.0852200 cnci=-0.2805186 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004elm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004elm.1 cpcScore=-1.2681800 cnci=-0.3144229 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004elv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004elv.1 cpcScore=3.3682500 cnci=-0.2408946 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033676 // NONCODE // accn=NR_033676 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033676 cpcScore=1.4531500 cnci=-0.2985333 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129673 // NONCODE // accn=AK129673 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=196 cpcScore=-1.1918700 cnci=-0.3264654 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D83197 // NONCODE // accn=D83197 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4734 cpcScore=2.1408800 cnci=-0.2926109 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040635 // NONCODE // accn=BC040635 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=207 cpcScore=-1.0245300 cnci=-0.2304309 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ227865 // NONCODE // accn=AJ227865 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000245014 cpcScore=-1.1823500 cnci=-0.4095214 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057955 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057955 cpcScore=-1.3955300 cnci=-0.3253791 gene:OTTHUMG00000022220 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_622 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_622 cpcScore=-1.3948200 cnci=-0.3445521 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1742 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1742 cpcScore=-1.2858000 cnci=-0.1685965 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR623574 // NONCODE // accn=CR623574 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=220 cpcScore=-0.9899130 cnci=-0.4959742 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eqc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eqc.1 cpcScore=-1.1395800 cnci=-0.3829151 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000057981 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000057981 cpcScore=-0.1010910 cnci=-0.3587298 gene:OTTHUMG00000022240 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eqf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eqf.2 cpcScore=2.0990600 cnci=-0.3912820 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1908 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1908 cpcScore=-1.6886400 cnci=-0.1362572 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR620152 // NONCODE // accn=CR620152 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=221 cpcScore=-0.9400450 cnci=-0.3210275 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058023 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058023 cpcScore=-0.8914320 cnci=-0.3342445 gene:OTTHUMG00000022267 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028443 // NONCODE // accn=NR_028443 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028443 cpcScore=1.7056600 cnci=-0.2656034 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ere.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ere.1 cpcScore=-1.0259600 cnci=-0.3417401 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004erg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004erg.1 cpcScore=-1.0301800 cnci=-0.3136051 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L32786 // NONCODE // accn=L32786 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4737 cpcScore=-1.0306500 cnci=-0.2515551 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_647 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_647 cpcScore=-1.2840200 cnci=-0.2965911 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004eri.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004eri.2 cpcScore=-1.1658900 cnci=-0.1637408 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC128440 // NONCODE // accn=BC128440 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389851 cpcScore=1.8660200 cnci=-0.1850490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058082 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058082 cpcScore=0.2168970 cnci=-0.1826234 gene:OTTHUMG00000022289 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058084 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058084 cpcScore=-1.2306700 cnci=-0.2784213 gene:OTTHUMG00000022291 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058088 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058088 cpcScore=-1.1832300 cnci=-0.2976042 gene:OTTHUMG00000022295 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC012502 // NONCODE // accn=BC012502 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=225 cpcScore=-1.1480800 cnci=-0.4209189 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ655919 // NONCODE // accn=DQ655919 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393032 cpcScore=-0.9210700 cnci=-0.1119605 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ655920 // NONCODE // accn=DQ655920 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393033 cpcScore=-0.9213970 cnci=-0.0785167 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L08437 // NONCODE // accn=L08437 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=227 cpcScore=-1.4011800 cnci=-0.4630630 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030766 // NONCODE // accn=BC030766 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=228 cpcScore=-0.9822980 cnci=-0.2882373 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1439 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1439 cpcScore=-1.3147000 cnci=-0.2975421 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D16470 // NONCODE // accn=D16470 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4738 cpcScore=-0.9319190 cnci=-0.3084988 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040595 // NONCODE // accn=BC040595 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=230 cpcScore=-1.1295700 cnci=-0.2231527 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026426 // NONCODE // accn=AK026426 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4739 cpcScore=14.8719000 cnci=-0.3830765 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR601260 // NONCODE // accn=CR601260 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=235 cpcScore=-0.8961800 cnci=-0.2708907 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627122 // NONCODE // accn=CR627122 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=236 cpcScore=-1.1633500 cnci=-0.4378281 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_309 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_309 cpcScore=-1.3579000 cnci=-0.1976638 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004exm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004exm.2 cpcScore=2.3264100 cnci=-0.1472746 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mvm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011mvm.1 cpcScore=-1.1465800 cnci=-0.1988984 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058396 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058396 cpcScore=-0.5924360 cnci=-0.1944238 gene:OTTHUMG00000022468 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058395 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058395 cpcScore=-0.4198930 cnci=-0.0488464 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058397 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058397 cpcScore=-1.1567300 cnci=-0.1890549 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR623208 // NONCODE // accn=CR623208 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=245 cpcScore=-0.9746310 cnci=-0.1009125 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR542228 // NONCODE // accn=CR542228 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000269096 cpcScore=1.5666500 cnci=-0.0306743 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR626057 // NONCODE // accn=CR626057 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000305252 cpcScore=-1.0620300 cnci=-0.2703448 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038203 // NONCODE // accn=BC038203 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=247 cpcScore=-1.1865500 cnci=-0.4140442 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028476 // NONCODE // accn=NR_028476 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028476 cpcScore=3.7028000 cnci=-0.2110924 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028477 // NONCODE // accn=NR_028477 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028477 cpcScore=4.2154100 cnci=-0.2323247 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_126 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_126 cpcScore=-1.6182700 cnci=-0.3297893 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00017380-XLOC_008245 // Rinn lincRNA // linc-RBMX-2 chrX:-:136007155-136018228 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058522 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058522 cpcScore=-1.1946700 cnci=-0.5312961 gene:OTTHUMG00000022524 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058523 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058523 cpcScore=-0.8567080 cnci=-0.3453887 gene:OTTHUMG00000022524 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fal.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fal.3 cpcScore=2.2661400 cnci=-0.2469309 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D16473 // NONCODE // accn=D16473 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=254 cpcScore=-1.1467200 cnci=-0.3350422 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF108756 // NONCODE // accn=AF108756 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=253 cpcScore=1.5245600 cnci=-0.1527517 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF199613 // NONCODE // accn=AF199613 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000073726 cpcScore=-1.1341400 cnci=-0.0929475 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_648 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_648 cpcScore=-1.2746800 cnci=-0.2996144 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058576 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058576 cpcScore=0.3182070 cnci=-0.3630321 gene:OTTHUMG00000022543 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X71137 // NONCODE // accn=X71137 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323153 cpcScore=1.9592400 cnci=-0.0159406 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058580 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058580 cpcScore=0.0214977 cnci=-1.0000000 gene:OTTHUMG00000022547 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_649 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_649 cpcScore=-1.2782700 cnci=-0.2923822 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086457 // NONCODE // accn=AF086457 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=258 cpcScore=-0.7445630 cnci=-0.4846916 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058630 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058630 cpcScore=-0.7186770 cnci=-0.2193865 gene:OTTHUMG00000022592 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058639 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058639 cpcScore=-0.9450320 cnci=-0.3213391 gene:OTTHUMG00000022600 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058654 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058654 cpcScore=-1.2286600 cnci=-0.4250160 gene:OTTHUMG00000022605 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024499 // NONCODE // accn=NR_024499 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024499 cpcScore=-0.9907780 cnci=-0.2599502 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024501 // NONCODE // accn=NR_024501 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024501 cpcScore=-0.9766860 cnci=-0.2668172 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024502 // NONCODE // accn=NR_024502 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024502 cpcScore=-0.9696220 cnci=-0.2624037 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL049247 // NONCODE // accn=AL049247 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000023693 cpcScore=-1.0333600 cnci=-0.1438157 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF050146 // NONCODE // accn=AF050146 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4746 cpcScore=3.3325600 cnci=-0.1554326 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027455 // NONCODE // accn=NR_027455 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027455 cpcScore=2.7069900 cnci=-0.1841154 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1790 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1790 cpcScore=-1.3216000 cnci=-0.1106638 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_314 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_314 cpcScore=-1.3305900 cnci=-0.5095784 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U66047 // NONCODE // accn=U66047 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4747 cpcScore=-0.6219030 cnci=-0.1892374 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR604456 // NONCODE // accn=CR604456 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=261 cpcScore=-1.1650600 cnci=-0.1386505 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_313 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_313 cpcScore=-1.1366700 cnci=-0.2682003 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX810709 // NONCODE // accn=AX810709 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=263 cpcScore=-0.9770820 cnci=-0.0457575 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY522506 // NONCODE // accn=AY522506 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255135 cpcScore=-1.0301200 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY522506 // NONCODE // accn=AY522506 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=266 cpcScore=-1.1293000 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058759 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058759 cpcScore=-1.0321100 cnci=-0.4232779 gene:OTTHUMG00000022647 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000060942 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060942 cpcScore=-0.8184210 cnci=-0.1841416 gene:OTTHUMG00000024194 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060943 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000060943 cpcScore=-0.8979300 cnci=-0.1824098 gene:OTTHUMG00000024194 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR617293 // NONCODE // accn=CR617293 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=267 cpcScore=2.1465900 cnci=-0.2445187 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF463515 // NONCODE // accn=AF463515 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000080285 cpcScore=1.5681200 cnci=-0.1060580 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// EU161102 // NONCODE // accn=EU161102 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000484692 cpcScore=1.6208700 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024450 // NONCODE // accn=NR_024450 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024450 cpcScore=4.8006600 cnci=-0.1840140 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2004 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2004 cpcScore=-1.3258600 cnci=-0.1965401 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058774 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000058774 cpcScore=0.3935070 cnci=-0.0921729 gene:OTTHUMG00000022655 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ656049 // NONCODE // accn=DQ656049 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393162 cpcScore=0.3040200 cnci=-1.0000000 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ656051 // NONCODE // accn=DQ656051 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000393164 cpcScore=1.2978800 cnci=-0.1682789 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC021806 // NONCODE // accn=BC021806 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=278 cpcScore=-0.3894400 cnci=-0.1612240 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC009467 // NONCODE // accn=BC009467 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=279 cpcScore=-0.6738060 cnci=-0.0767734 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fld.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fld.3 cpcScore=-0.6669550 cnci=-0.1406073 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fle.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fle.3 cpcScore=0.1100170 cnci=-0.1807410 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033237 // NONCODE // accn=NR_033237 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033237 cpcScore=4.5312400 cnci=-0.1412856 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033764 // NONCODE // accn=BC033764 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=282 cpcScore=-0.5549340 cnci=-0.1671497 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S58359 // NONCODE // accn=S58359 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000215871 cpcScore=0.7102960 cnci=-0.0866813 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fmr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fmr.1 cpcScore=1.8773600 cnci=-0.2950634 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152582 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A2 (CT45A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370736 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134866214:134874250:1 gene:ENSG00000242185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495729 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134866399:134874235:1 gene:ENSG00000242185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028711 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:27005 IMAGE:4828274), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140735 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:176412 IMAGE:9021603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058434 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134866214:134875839:1 Gene:OTTHUMG00000022490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:135811981:135820012:-1 Gene:OTTHUMG00000022490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058436 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134866399:134874235:1 Gene:OTTHUMG00000022490 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eyz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A2 (CT45A2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017435 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3 (CT45A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370734 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134883488:134891521:1 gene:ENSG00000232417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443882 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134887233:134891519:1 gene:ENSG00000232417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028711 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:27005 IMAGE:4828274), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140735 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:176412 IMAGE:9021603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058437 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134883488:134893393:1 Gene:OTTHUMG00000022491 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058438 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134883488:134891521:1 Gene:OTTHUMG00000022491 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3 (CT45A3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001170944 // RefSeq // [retired]Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6C (PNMA6C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242319 // RefSeq // [retired]Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6D (PNMA6D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032882 // RefSeq // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6A (PNMA6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:153072482:153075018:1 gene:ENSG00000235961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007631 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic antigen like 6A, mRNA (cDNA clone MGC:15827 IMAGE:3507248), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011myl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6C (PNMA6C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6C (PNMA6C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032882 // RefSeq // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6A (PNMA6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453825 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:152338301:152340864:1 gene:ENSG00000224201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060939 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:152338301:152340864:1 Gene:OTTHUMG00000024191 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022chr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen family member 6A (PNMA6A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012288 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_022148 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1187549:1212637:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1190897:1212634:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1196780:1212723:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK223303 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cytokine receptor-like factor 2 variant, clone: TMS01248. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144413 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1196780:1212637:-1 Gene:OTTHUMG00000067432 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1196780:1212723:-1 Gene:OTTHUMG00000067432 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022brs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178129 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1462572:1537107:-1 gene:ENSG00000182162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1466437:1494353:-1 gene:ENSG00000182162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043610 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8, mRNA (cDNA clone MGC:50878 IMAGE:5787268), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055602 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1462572:1537107:-1 Gene:OTTHUMG00000021060 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055603 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1466437:1494353:-1 Gene:OTTHUMG00000021060 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cpz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022brv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005088 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027383 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1591625:1600303:1 gene:ENSG00000197976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028151 // GenBank // Homo sapiens splicing factor, arginine/serine-rich 17A, mRNA (cDNA clone MGC:39904 IMAGE:5217247), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110496 // GenBank // Homo sapiens splicing factor, arginine/serine-rich 17A, mRNA (cDNA clone MGC:125365 IMAGE:40007662), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000313871 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold818:752407:753102:+ gene:ENSG00000197976 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1591623:1602502:1 Gene:OTTHUMG00000021063 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055608 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1591625:1600303:1 Gene:OTTHUMG00000021063 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055609 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:1591593:1602514:1 Gene:OTTHUMG00000021063 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cqb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ncx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026551 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase VB pseudogene 1 (CA5BP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:15675715:15703349:1 gene:ENSG00000186312 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mir.1 // UCSC Genes // Homo sapiens carbonic anhydrase VB pseudogene 1 (CA5BP1), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040663 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 1 (GAGE1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001468 // RefSeq // [retired] Homo sapiens G antigen 1 (GAGE1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49599062:49606355:1 gene:ENSG00000205777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49599025:49608536:1 gene:ENSG00000205777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036094 // GenBank // Homo sapiens G antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:33825 IMAGE:5296612), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069470 // GenBank // Homo sapiens G antigen 4, mRNA (cDNA clone MGC:96966 IMAGE:7262175), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060834 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49599025:49608536:1 Gene:OTTHUMG00000024150 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dok.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 1 (GAGE1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dol.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 1 (GAGE1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001127212 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 2A (GAGE2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49589529:49596827:1 gene:ENSG00000189064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069309 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96930 IMAGE:7262139), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069558 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96883 IMAGE:7262092), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060827 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49589529:49596827:1 Gene:OTTHUMG00000024143 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004doi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 2A (GAGE2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001032393 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H) (HNRNPH2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_019597 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H) (HNRNPH2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000316594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:101408295:101414133:1 gene:ENSG00000126945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457902 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:100663207:100668825:1 gene:ENSG00000126945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130343 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H), mRNA (cDNA clone MGC:163215 IMAGE:40146374), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057556 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:101408295:101414133:1 Gene:OTTHUMG00000022029 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ehm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H') (HNRNPH2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ehn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H') (HNRNPH2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cai.1 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H') (HNRNPH2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004469 // RefSeq // Homo sapiens c-fos induced growth factor (vascular endothelial growth factor D) (FIGF), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:15345972:15347475:-1 gene:ENSG00000165197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027948 // GenBank // Homo sapiens c-fos induced growth factor (vascular endothelial growth factor D), mRNA (cDNA clone MGC:34490 IMAGE:5207065), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000297904 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1580:233800:274404:+ gene:ENSG00000165197 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055859 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15345591:15384376:-1 Gene:OTTHUMG00000021175 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000055860 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:15345972:15347475:-1 Gene:OTTHUMG00000021175 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004cwt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens c-fos induced growth factor (vascular endothelial growth factor D) (FIGF), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007213 // RefSeq // Homo sapiens PRA1 domain family, member 2 (PRAF2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376386 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:49072031:49073989:-1 gene:ENSG00000243279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376390 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48928820:48931733:-1 gene:ENSG00000243279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491199 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:48929254:48931494:-1 gene:ENSG00000243279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021213 // GenBank // Homo sapiens PRA1 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:12776 IMAGE:4297902), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083415 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49071156:49074071:-1 Gene:OTTHUMG00000034499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083416 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49072031:49073989:-1 Gene:OTTHUMG00000034499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49071597:49073835:-1 Gene:OTTHUMG00000034499 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dmi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRA1 domain family, member 2 (PRAF2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_130388 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 12 (ASB12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361287 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:63444187:63445530:-1 gene:ENSG00000198881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:64224196:64230631:-1 gene:ENSG00000198881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069436 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:97035 IMAGE:7262244), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069555 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:97046 IMAGE:7262256), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093883 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:120918 IMAGE:7939728), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104946 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:132606 IMAGE:8143949), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396130 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1118:999344:1000697:- gene:ENSG00000198881 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056947 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64224196:64230631:-1 Gene:OTTHUMG00000021705 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 12 (ASB12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvq.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017677 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 8 (MTMR8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000247400 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:63487962:63580264:-1 gene:ENSG00000102043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:64268081:64395431:-1 gene:ENSG00000102043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:64331414:64345158:-1 gene:ENSG00000102043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012399 // GenBank // Homo sapiens myotubularin related protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:8876 IMAGE:3864128), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056949 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64268081:64395431:-1 Gene:OTTHUMG00000021707 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056951 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64331414:64345158:-1 Gene:OTTHUMG00000021707 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056952 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64331422:64348794:-1 Gene:OTTHUMG00000021707 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056953 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64336081:64350040:-1 Gene:OTTHUMG00000021707 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dvs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myotubularin related protein 8 (MTMR8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056950 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:64268081:64356234:-1 Gene:OTTHUMG00000021707 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080851 // RefSeq // Homo sapiens DMRT-like family C1B (DMRTC1B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_033053 // RefSeq // Homo sapiens DMRT-like family C1 (DMRTC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000290273 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72091859:72095622:-1 gene:ENSG00000159123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373529 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:72091863:72095808:-1 gene:ENSG00000159123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373530 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:X:72091863:72097698:-1 gene:ENSG00000159123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047596 // GenBank // Homo sapiens DMRT-like family C1, mRNA (cDNA clone MGC:48652 IMAGE:4830694), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057215 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:72872029:72877864:-1 Gene:OTTHUMG00000021820 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057216 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:72872121:72875974:-1 Gene:OTTHUMG00000021820 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DMRT-like family C1 (DMRTC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nln.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DMRT-like family C1 (DMRTC1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026594 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 226, member B (non-protein coding) (FAM226B), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026595 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 226, member A (non-protein coding) (FAM226A), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebe.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ebe.3 cpcScore=1.6146500 cnci=-0.2293483 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ebe.4 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012282 // RefSeq // Homo sapiens KCNE1-like (KCNE1L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:109623700:109625172:-1 gene:ENSG00000176076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035330 // GenBank // Homo sapiens KCNE1-like, mRNA (cDNA clone MGC:34389 IMAGE:5197378), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057892 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:109623700:109625172:-1 Gene:OTTHUMG00000022189 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004eoh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens KCNE1-like (KCNE1L), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017436 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A4 (CT45A4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434966 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134928695:134936735:-1 gene:ENSG00000228836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494421 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134928706:134936550:-1 gene:ENSG00000228836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058431 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134926788:134936735:-1 Gene:OTTHUMG00000022489 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058432 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134928695:134936735:-1 Gene:OTTHUMG00000022489 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058433 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134928706:134936550:-1 Gene:OTTHUMG00000022489 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A4 (CT45A4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017438 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A6 (CT45A6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448053 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134963213:134971244:-1 gene:ENSG00000226907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472834 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:134963224:134971059:-1 gene:ENSG00000226907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140735 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:176412 IMAGE:9021603), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140913 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:176590 IMAGE:9056725), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058445 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134961634:134971244:-1 Gene:OTTHUMG00000022495 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058446 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134963213:134971244:-1 Gene:OTTHUMG00000022495 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058447 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:134963224:134971059:-1 Gene:OTTHUMG00000022495 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ezf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 45, member A6 (CT45A6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013453 // RefSeq // Homo sapiens sperm protein associated with the nucleus, X-linked, family member A1 (SPANXA1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145662 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member A2 (SPANXA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141583674:141585011:-1 gene:ENSG00000198021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069393 // GenBank // Homo sapiens sperm protein associated with the nucleus, X-linked, family member A1, mRNA (cDNA clone MGC:97406 IMAGE:7262682), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058599 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141583674:141585011:-1 Gene:OTTHUMG00000022564 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member A2 (SPANXA2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022661 // RefSeq // Homo sapiens SPANX family, member C (SPANXC), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:141241463:141242496:-1 gene:ENSG00000198573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC054023 // GenBank // Homo sapiens SPANX family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:61861 IMAGE:6648369), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058590 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:141241463:141242496:-1 Gene:OTTHUMG00000022556 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fbk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SPANX family, member C (SPANXC), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000058684 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:149511509:149526264:-1 Gene:OTTHUMG00000022616 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:149511509:149526264:-1 gene:ENSG00000238039 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF050146 // GenBank // Homo sapiens clone 488469 iduronate-2-sulfatase (IDS2) pseudogene, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fcz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens clone 488469 iduronate-2-sulfatase (IDS2) pseudogene, mRNA sequence. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021049 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family A, 5 (MAGEA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109187 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family A, 5, mRNA (cDNA clone MGC:129526 IMAGE:40000127), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ffj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens melanoma antigen family A, 5 (MAGEA5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098407 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 2D (GAGE2D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001472 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 2C (GAGE2C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381708 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:49226182:49233481:1 gene:ENSG00000236249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018052 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2E, mRNA (cDNA clone MGC:26395 IMAGE:4812462), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069309 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96930 IMAGE:7262139), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069558 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96883 IMAGE:7262092), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113926 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2C, mRNA (cDNA clone MGC:120097 IMAGE:40021787), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144211 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:49226182:49233481:1 Gene:OTTHUMG00000067392 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dob.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 2D (GAGE2D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098411 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 2B (GAGE2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:49529869:49529985:1 gene:ENSG00000236737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381725 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:49235708:49242997:1 gene:ENSG00000231850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060826 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49529869:49529985:1 Gene:OTTHUMG00000024142 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144210 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:X:49235708:49242997:1 Gene:OTTHUMG00000067391 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U19143 // GenBank // Human GAGE-2 protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dny.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 2A (GAGE2A), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 2B (GAGE2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 2C (GAGE2C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098408 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12C (GAGE12C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127199 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127345 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12B (GAGE12B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49532211:49539538:1 gene:ENSG00000237671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC081536 // GenBank // Homo sapiens G antigen 7, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:105124 IMAGE:30524801), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104951 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12I, mRNA (cDNA clone MGC:132611 IMAGE:8143954), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130374 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:163246 IMAGE:40146405), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143619 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:177149 IMAGE:9052132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060828 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49532211:49539538:1 Gene:OTTHUMG00000024144 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004doc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mno.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098408 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12C (GAGE12C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001098410 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12H (GAGE12H), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127199 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127345 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12B (GAGE12B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000405679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49541767:49549094:1 gene:ENSG00000227488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC081536 // GenBank // Homo sapiens G antigen 7, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:105124 IMAGE:30524801), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104951 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12I, mRNA (cDNA clone MGC:132611 IMAGE:8143954), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130374 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:163246 IMAGE:40146405), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143619 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:177149 IMAGE:9052132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060829 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49541767:49549094:1 Gene:OTTHUMG00000024145 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dod.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnp.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098408 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12C (GAGE12C), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001098409 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12G (GAGE12G), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127199 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127345 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12B (GAGE12B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49551333:49558649:1 gene:ENSG00000216649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC081536 // GenBank // Homo sapiens G antigen 7, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:105124 IMAGE:30524801), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104951 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12I, mRNA (cDNA clone MGC:132611 IMAGE:8143954), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130374 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:163246 IMAGE:40146405), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143619 // GenBank // Homo sapiens G antigen 12B, mRNA (cDNA clone MGC:177149 IMAGE:9052132), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060830 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49551333:49558649:1 Gene:OTTHUMG00000024146 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004doe.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12D (GAGE12D), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnq.2 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098412 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 13 (GAGE13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127200 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 2E (GAGE2E), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012196 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 8 (GAGE8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381751 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:49188094:49195366:1 gene:ENSG00000237597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069309 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96930 IMAGE:7262139), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069558 // GenBank // Homo sapiens G antigen 2A, mRNA (cDNA clone MGC:96883 IMAGE:7262092), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143620 // GenBank // Homo sapiens G antigen 8, mRNA (cDNA clone MGC:177150 IMAGE:9052133), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060818 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49331616:49338952:1 Gene:OTTHUMG00000024138 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dnn.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 13 (GAGE13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mne.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 8 (GAGE8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011mnf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 8 (GAGE8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 13 (GAGE13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022bwc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 13 (GAGE13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098413 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 10 (GAGE10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000407599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49303669:49319844:1 gene:ENSG00000215274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060816 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49303669:49319844:1 Gene:OTTHUMG00000024136 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nir.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 10 (GAGE10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098406 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 12J (GAGE12J), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001474 // RefSeq // Homo sapiens G antigen 4 (GAGE4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:49322057:49329384:1 gene:ENSG00000224659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024914 // GenBank // Homo sapiens G antigen 5, mRNA (cDNA clone MGC:21275 IMAGE:4471969), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171769 // GenBank // Homo sapiens G antigen 4, mRNA (cDNA clone MGC:198484 IMAGE:9054423), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060817 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:49322057:49329384:1 Gene:OTTHUMG00000024137 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U19146 // GenBank // Human GAGE-5 protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U19147 // GenBank // Human GAGE-6 protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dnk.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12J (GAGE12J), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004dnl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12J (GAGE12J), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nit.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G antigen 12J (GAGE12J), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038988 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 630 (LINC00630), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:102769179:102885406:1 gene:ENSG00000223546 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032741 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5576940. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057664 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102769179:102885406:1 Gene:OTTHUMG00000022077 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057665 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102769181:102839964:1 Gene:OTTHUMG00000022077 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057666 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102769218:102827144:1 Gene:OTTHUMG00000022077 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057667 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102769161:102884166:1 Gene:OTTHUMG00000022077 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000057668 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:102839908:102866824:1 Gene:OTTHUMG00000022077 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 630 (LINC00630), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 630 (LINC00630), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ejq.1 cpcScore=-0.9304520 cnci=-0.3147468 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ejr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ejr.2 cpcScore=-0.0292182 cnci=-0.2602002 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080137 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A10 (CT47A10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080138 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A9 (CT47A9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173571 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120977606:120980928:-1 gene:ENSG00000242362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058125 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120977606:120980928:-1 Gene:OTTHUMG00000022312 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11 (CT47A11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080141 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A6 (CT47A6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001080146 // RefSeq // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A1 (CT47A1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371280 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:120117630:120119642:-1 gene:ENSG00000236371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:120982466:120985788:-1 gene:ENSG00000236371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029540 // GenBank // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A11, mRNA (cDNA clone MGC:33984 IMAGE:5297051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058124 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:120982466:120985788:-1 Gene:OTTHUMG00000022311 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004etn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cancer/testis antigen family 47, member A6 (CT47A6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207339 // RefSeq // Homo sapiens P antigen family, member 2 (prostate associated) (PAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374965 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:55089052:55092842:1 gene:ENSG00000234068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55089008:55092842:1 gene:ENSG00000234068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC054022 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 2 (prostate associated), mRNA (cDNA clone MGC:62094 IMAGE:6603202), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056857 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55089008:55092842:1 Gene:OTTHUMG00000021648 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056858 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55089052:55092842:1 Gene:OTTHUMG00000021648 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056859 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55089136:55090610:1 Gene:OTTHUMG00000021648 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004duf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens P antigen family, member 2 (prostate associated) (PAGE2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001015038 // RefSeq // Homo sapiens P antigen family, member 2B (PAGE2B), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:55075071:55078903:1 gene:ENSG00000238269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374974 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:X:55075063:55078909:1 gene:ENSG00000238269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130359 // GenBank // Homo sapiens P antigen family, member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:163231 IMAGE:40146390), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056849 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55075071:55078903:1 Gene:OTTHUMG00000021645 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000056850 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:X:55075063:55078909:1 Gene:OTTHUMG00000021645 // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004due.3 // UCSC Genes // --- // chrX // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018390 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 1 (PLCXD1), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028057 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 1 (PLCXD1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:281192:303356:1 gene:ENSG00000182378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:281462:303353:1 gene:ENSG00000182378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:276322:303353:1 gene:ENSG00000182378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:276324:291537:1 gene:ENSG00000182378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005028 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:12582 IMAGE:3953383), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fop.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 1 (PLCXD1), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nae.2 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 1 (PLCXD1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027231 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027232 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:320990:321851:1 gene:ENSG00000226179 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nag.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 685 (LINC00685), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000451 // RefSeq // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_006883 // RefSeq // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:624344:659411:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:630807:659411:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:624344:646823:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:630807:645568:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000558872 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:591542:612318:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000560001 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:X:591542:612316:1 gene:ENSG00000185960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fou.1 // UCSC Genes // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fov.3 // UCSC Genes // Homo sapiens short stature homeobox (SHOX), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576039 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44151, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fow.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fow.1 cpcScore=-1.2952700 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fow.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44151, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:990221:994365:1 gene:ENSG00000237531 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002183 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity) (IL3RA), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1336616:1382685:1 gene:ENSG00000185291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1336616:1382689:1 gene:ENSG00000185291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035407 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity), mRNA (cDNA clone MGC:34174 IMAGE:5167281), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FJ550347 // GenBank // Homo sapiens IL-3 receptor alpha SP2 isoform precursor, mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 3 receptor, alpha (low affinity) (IL3RA), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nak.2 // UCSC Genes // --- // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026710 // RefSeq // Homo sapiens ASMTL antisense RNA 1 (ASMTL-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026711 // RefSeq // Homo sapiens ASMTL antisense RNA 1 (ASMTL-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1403459:1414028:1 gene:ENSG00000236017 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1402043:1413131:1 gene:ENSG00000236017 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1401811:1413915:1 gene:ENSG00000236017 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1401769:1403493:1 gene:ENSG00000236017 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ASMTL antisense RNA 1 (ASMTL-AS1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ASMTL antisense RNA 1 (ASMTL-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1732584:1741988:1 gene:ENSG00000223511 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1734117:1755985:1 gene:ENSG00000223511 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000453953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1767347:1768776:1 gene:ENSG00000234622 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033380 // RefSeq // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033381 // RefSeq // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2616619:2638694:1 gene:ENSG00000223773 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CD99 molecule pseudogene 1 (CD99P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516032 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:2784749:2784853:1 gene:ENSG00000251841 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_139214 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, Y-linked (TGIF2LY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:3579041:3580041:1 gene:ENSG00000176679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000559055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:3579115:3580041:1 gene:ENSG00000176679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128604 // GenBank // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:158887 IMAGE:40003247), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:3579041:3580041:1 Gene:OTTHUMG00000036153 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, Y-linked (TGIF2LY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ciw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 2-like, Y-linked (TGIF2LY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:5019076:5019266:1 gene:ENSG00000252468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011nao.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011nao.1 cpcScore=-1.1260200 cnci=-0.4301708 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nao.2 // UCSC Genes // Sequence 56 from Patent WO2006092738. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516250 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:5573928:5574019:1 gene:ENSG00000252059 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001197242 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_022573 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 2 (TSPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6246223:6249013:1 gene:ENSG00000168757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:Y:6246269:6249012:1 gene:ENSG00000168757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// M98525 // GenBank // Homo sapiens testicular protein (TSPY) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098313 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6246223:6249013:1 Gene:OTTHUMG00000040957 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098314 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6246269:6249012:1 Gene:OTTHUMG00000040957 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098315 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6246269:6249019:1 Gene:OTTHUMG00000040957 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098316 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6247623:6249004:1 Gene:OTTHUMG00000040957 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 2 (TSPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 2 (TSPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001538 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1 (non-protein coding) (TTTY1), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003589 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1B (non-protein coding) (TTTY1B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6390431:6411564:1 gene:ENSG00000129816 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098355 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6390431:6411564:1 Gene:OTTHUMG00000040984 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1B (non-protein coding) (TTTY1B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001535 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21 (non-protein coding) (TTTY21), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003588 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21B (non-protein coding) (TTTY21B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6443434:6447077:1 gene:ENSG00000237563 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6443434:6447077:1 Gene:OTTHUMG00000040983 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21 (non-protein coding) (TTTY21), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028062 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase, Y-linked, pseudogene (PRKY), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516346 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:7378672:7378779:1 gene:ENSG00000252155 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000528056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:7273972:7381548:1 gene:ENSG00000099725 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074851 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:103956 IMAGE:30915351), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074852 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:104114 IMAGE:30915567), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085364 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:7273972:7381548:1 Gene:OTTHUMG00000035301 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088220 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:7333030:7356223:1 Gene:OTTHUMG00000035301 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088221 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:7326067:7328403:1 Gene:OTTHUMG00000035301 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fre.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein kinase, Y-linked, pseudogene (PRKY), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516187 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:7341531:7341642:1 gene:ENSG00000251996 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001551 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 12 (non-protein coding) (TTTY12), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:7804924:7810683:1 gene:ENSG00000237048 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000144994 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:7804924:7810683:1 Gene:OTTHUMG00000067560 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 12 (non-protein coding) (TTTY12), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001549 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 19 (non-protein coding) (TTTY19), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:8704472:8705283:1 gene:ENSG00000232419 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098863 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:8704472:8705283:1 Gene:OTTHUMG00000041268 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 19 (non-protein coding) (TTTY19), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000311828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:8909948:8914155:1 gene:ENSG00000173357 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077697 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3 (TSPY3), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001197242 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075016 // GenBank // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:103998 IMAGE:30915406), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121113 // GenBank // Homo sapiens similar to testis specific protein, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:150413 IMAGE:40120433), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121114 // GenBank // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:150414 IMAGE:40120435), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// M98525 // GenBank // Homo sapiens testicular protein (TSPY) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3 (TSPY3), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001533 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8 (non-protein coding) (TTTY8), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003591 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8B (non-protein coding) (TTTY8B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:9691100:9693699:1 gene:ENSG00000183385 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:9691100:9693957:1 gene:ENSG00000183385 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106569 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9691100:9693699:1 Gene:OTTHUMG00000046237 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106570 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9691100:9693957:1 Gene:OTTHUMG00000046237 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8 (non-protein coding) (TTTY8), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001536 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2 (non-protein coding) (TTTY2), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003590 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2B (non-protein coding) (TTTY2B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9740584:9758476:1 gene:ENSG00000212855 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106565 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9740584:9758476:1 Gene:OTTHUMG00000046230 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nws.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2 (non-protein coding) (TTTY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001539 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 22 (non-protein coding) (TTTY22), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9801153:9813245:1 gene:ENSG00000224075 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099590 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9801153:9813245:1 Gene:OTTHUMG00000041601 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 22 (non-protein coding) (TTTY22), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001540 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23 (non-protein coding) (TTTY23), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003593 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23B (non-protein coding) (TTTY23B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9910798:9911962:1 gene:ENSG00000239225 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9910798:9911962:1 Gene:OTTHUMG00000046234 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fso.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23 (non-protein coding) (TTTY23), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516157 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:10196372:10196484:1 gene:ENSG00000251966 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515896 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:10200155:10200306:1 gene:ENSG00000251705 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cjg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32678, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590589 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57701, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fsq.1 cpcScore=-1.2785100 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450309 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:Y:14093473:14100009:1 gene:ENSG00000235649 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:12345077:12347495:1 gene:ENSG00000224060 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088553 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:14465804:14468226:1 Gene:OTTHUMG00000036381 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516777 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:Y:14482123:14482230:1 gene:ENSG00000252586 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001545 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 15 (non-protein coding) (TTTY15), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:12662537:12688255:1 gene:ENSG00000233864 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:12662334:12692233:1 gene:ENSG00000233864 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:12662334:12690441:1 gene:ENSG00000233864 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543097 // ENSEMBL // [retired]ensembl:lincRNA chromosome:GRCh37:Y:14774284:14776614:1 gene:ENSG00000233864 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:12662334:12692233:1 Gene:OTTHUMG00000036468 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088701 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:12662334:12690441:1 Gene:OTTHUMG00000036468 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088702 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:12662537:12688255:1 Gene:OTTHUMG00000036468 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fss.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 15 (non-protein coding) (TTTY15), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004202 // RefSeq // Homo sapiens thymosin beta 4, Y-linked (TMSB4Y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:13703567:13706024:1 gene:ENSG00000154620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119763 // GenBank // Homo sapiens thymosin beta 4, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:149887 IMAGE:40119344), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088534 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:13703567:13706024:1 Gene:OTTHUMG00000036366 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens thymosin beta 4, Y-linked (TMSB4Y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:13751793:13858594:1 gene:ENSG00000241859 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:13753098:13871706:1 gene:ENSG00000241859 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088535 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:15863673:15970474:1 Gene:OTTHUMG00000036367 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004679 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, Y-linked (VCY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_181880 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, Y-linked 1B (VCY1B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:14056217:14056958:1 gene:ENSG00000129862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC056508 // GenBank // Homo sapiens variable charge, Y-linked 1B, mRNA (cDNA clone MGC:61936 IMAGE:6450744), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096729 // GenBank // Homo sapiens variable charge, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:119817 IMAGE:40014422), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088593 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:14056217:14056958:1 Gene:OTTHUMG00000036402 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens variable charge, Y-linked (VCY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516855 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:16062766:16062829:1 gene:ENSG00000252664 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516364 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:16248935:16249041:1 gene:ENSG00000252173 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028083 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 1 (FAM41AY1), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028084 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 2 (FAM41AY2), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:17500958:17515018:1 gene:ENSG00000224989 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nat.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 2 (FAM41AY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100026 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:17500958:17516741:1 Gene:OTTHUMG00000041970 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nat.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011nat.1 cpcScore=0.0954122 cnci=-0.2263830 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:17557864:17557976:1 gene:ENSG00000252315 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516203 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:17559774:17559889:1 gene:ENSG00000252012 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001722 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B (CDY2B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004825 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2A (CDY2A), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:18025787:18027740:1 gene:ENSG00000182415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:18025789:18028597:1 gene:ENSG00000182415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069087 // GenBank // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B, mRNA (cDNA clone MGC:95362 IMAGE:7216901), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130426 // GenBank // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B, mRNA (cDNA clone MGC:163298 IMAGE:40146457), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099658 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18025787:18027740:1 Gene:OTTHUMG00000041657 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2A (CDY2A), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516357 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:18116848:18117007:1 gene:ENSG00000252166 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002906 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked 2 (XKRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004677 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked (XKRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132883 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:164514 IMAGE:40146905), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked (XKRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516630 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:18282853:18282947:1 gene:ENSG00000252439 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002160 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member B (non-protein coding) (FAM224B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002161 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member A (non-protein coding) (FAM224A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:18326253:18353210:1 gene:ENSG00000233522 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100025 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18326253:18353210:1 Gene:OTTHUMG00000041969 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fto.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member B (non-protein coding) (FAM224B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516400 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:18486511:18486672:1 gene:ENSG00000252209 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001530 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9A (non-protein coding) (TTTY9A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002159 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding) (TTTY9B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:18729882:18739197:1 gene:ENSG00000242153 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099999 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:20891768:20901083:1 Gene:OTTHUMG00000041946 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding) (TTTY9B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001039567 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 2 (RPS4Y2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000288666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:20756164:20781032:1 gene:ENSG00000157828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088873 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:20756164:20781032:1 Gene:OTTHUMG00000036540 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 2 (RPS4Y2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001527 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002175 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6B (non-protein coding) (TTTY6B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000253848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22144966:22146831:1 gene:ENSG00000131548 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545808 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:24291169:24292831:1 gene:ENSG00000131548 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY597808 // GenBank // Homo sapiens chromosome Y testis-specific Y-linked 6 (TTTY6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101920 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22144966:22146831:1 Gene:OTTHUMG00000043580 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cog.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002758 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked 2 (PRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004676 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000303728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:22490397:22514637:1 gene:ENSG00000169789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338793 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:24636544:24658815:1 gene:ENSG00000169789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22490397:22514637:1 gene:ENSG00000169789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF517635 // GenBank // Homo sapiens testis-specific PTP-BL related Y protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113548 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142108 IMAGE:8322600), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102233 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22490397:22514637:1 Gene:OTTHUMG00000043845 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102234 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22490397:22514637:1 Gene:OTTHUMG00000043845 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000400578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22649291:22654778:1 gene:ENSG00000224657 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102241 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:24795438:24800925:1 Gene:OTTHUMG00000043853 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001526 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002179 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17C (non-protein coding) (TTTY17C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002180 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17B (non-protein coding) (TTTY17B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22851584:22852715:1 gene:ENSG00000228240 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102242 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22851584:22852715:1 Gene:OTTHUMG00000043854 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvi.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fvi.2 cpcScore=-0.9525080 cnci=-0.2279663 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001525 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002177 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4C (non-protein coding) (TTTY4C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002178 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4B (non-protein coding) (TTTY4B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22936455:22973284:1 gene:ENSG00000226906 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105049 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22936455:22973284:1 Gene:OTTHUMG00000045294 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002760 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2B (BPY2B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001002761 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2C (BPY2C), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004678 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22984263:23005465:1 gene:ENSG00000183753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:22992344:22998268:1 gene:ENSG00000183753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171796 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054450. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000130135 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22984263:23005465:1 Gene:OTTHUMG00000058899 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ582680 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-32792, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022coq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44172, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ581594 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-49706, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cot.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597149 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35215, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cou.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50911, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579249 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47361, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwe.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fwe.1 cpcScore=-1.5339000 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41091, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ593032 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-33144, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cov.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31176, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575010 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43122, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cow.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43121, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001526 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002179 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17C (non-protein coding) (TTTY17C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002180 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17B (non-protein coding) (TTTY17B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:24485332:24486463:1 gene:ENSG00000227439 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106564 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:24485332:24486463:1 Gene:OTTHUMG00000046228 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fwg.2 cpcScore=-0.9525080 cnci=-0.2289875 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001525 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002177 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4C (non-protein coding) (TTTY4C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002178 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4B (non-protein coding) (TTTY4B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:24570202:24607025:1 gene:ENSG00000235412 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105051 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:24570202:24607025:1 Gene:OTTHUMG00000045296 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002760 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2B (BPY2B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001002761 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2C (BPY2C), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004678 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:24618004:24639207:1 gene:ENSG00000183795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171796 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054450. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104781 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:24618004:24639207:1 Gene:OTTHUMG00000045101 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001555 // RefSeq // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 2, Y-linked (GOLGA2P2Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002195 // RefSeq // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 3, Y-linked (GOLGA2P3Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF332229 // GenBank // Homo sapiens golgi autoantigen golgin subfamily a2-like mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 2, Y-linked (GOLGA2P2Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 2, Y-linked (GOLGA2P2Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516662 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:25460010:25460092:1 gene:ENSG00000252471 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571386 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-31498, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31498, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ585964 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-53076, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53076, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001554 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 1, Y-linked (CSPG4P1Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:25482908:25486705:1 gene:ENSG00000240450 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105037 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25482908:25486705:1 Gene:OTTHUMG00000045282 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 1, Y-linked (CSPG4P1Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ581594 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-49706, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fxd.2 cpcScore=-1.3022500 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ600137 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-38203, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nby.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011nby.1 cpcScore=-1.2957400 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nby.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-46014, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:25723342:25723495:1 gene:ENSG00000252426 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001524 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3 (non-protein coding) (TTTY3), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002176 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3B (non-protein coding) (TTTY3B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:25728490:25733388:1 gene:ENSG00000231141 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105011 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25728490:25733388:1 Gene:OTTHUMG00000045256 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3 (non-protein coding) (TTTY3), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516816 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:25928979:25929142:1 gene:ENSG00000252625 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004676 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:25975549:25988069:1 gene:ENSG00000172283 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338673 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:28121660:28132811:1 gene:ENSG00000172283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113548 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142108 IMAGE:8322600), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113550 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142110 IMAGE:8322602), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25975549:25988069:1 Gene:OTTHUMG00000045269 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000400476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:26123720:26129207:1 gene:ENSG00000215507 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000105034 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:28269867:28275354:1 Gene:OTTHUMG00000045279 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515987 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:26247384:26247521:1 gene:ENSG00000251796 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517139 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:26360989:26361092:1 gene:ENSG00000252948 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpe.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00026 hit found at contig region AC013734.4/10137-10240 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005840 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369437 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:X:154997474:155006702:1 gene:ENSG00000168939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069609 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97072 IMAGE:7262284), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074972 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103904 IMAGE:30915293), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302805 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2458:883677:884543:+ gene:ENSG00000168939 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sprouty homolog 3 (Drosophila) (SPRY3), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012227 // RefSeq // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:304760:318787:-1 gene:ENSG00000178605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:304529:312463:-1 gene:ENSG00000178605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296003 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56662 complete cds, highly similar to Homo sapiens GTP binding protein 6 (GTPBP6), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014636 // GenBank // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:1170 IMAGE:3528598), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004for.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011naf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GTP binding protein 6 (putative) (GTPBP6), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013239 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B, beta (PPP2R3B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:333963:386710:-1 gene:ENSG00000167393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK293506 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60425 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein phosphatase 2A 48 kDa regulatory subunit B. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009032 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit B, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4214447), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063429 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit B, beta, mRNA (cDNA clone MGC:75042 IMAGE:5239974), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fos.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B'', beta (PPP2R3B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fot.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B'', beta (PPP2R3B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nah.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B'', beta (PPP2R3B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:1300256:1300375:-1 gene:ENSG00000223274 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1397025:1399402:1 gene:ENSG00000236871 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1396427:1398958:1 gene:ENSG00000236871 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2334295:2336410:-1 gene:ENSG00000223571 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:2612988:2615347:-1 gene:ENSG00000230542 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003140 // RefSeq // Homo sapiens sex determining region Y (SRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:2786855:2787699:-1 gene:ENSG00000184895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000525526 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:2655049:2655644:-1 gene:ENSG00000184895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000534739 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:2655145:2655644:-1 gene:ENSG00000184895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074923 // GenBank // Homo sapiens sex determining region Y, mRNA (cDNA clone MGC:103878 IMAGE:30915260), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087931 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:2786855:2787699:-1 Gene:OTTHUMG00000036084 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sex determining region Y (SRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517091 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:4174985:4175090:-1 gene:ENSG00000252900 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000545933 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:Y:5205788:5206981:-1 gene:ENSG00000235001 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cix.1 // UCSC Genes // Sequence 264 from Patent WO2004076622. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516070 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:5874246:5874338:1 gene:ENSG00000251879 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001540 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23 (non-protein coding) (TTTY23), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003593 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23B (non-protein coding) (TTTY23B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6242446:6243610:-1 gene:ENSG00000237069 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087748 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6242446:6243610:-1 Gene:OTTHUMG00000036006 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 23 (non-protein coding) (TTTY23), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6256267:6263953:-1 gene:ENSG00000234830 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098300 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:6126374:6131976:-1 Gene:OTTHUMG00000040945 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098301 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:6124308:6131994:-1 Gene:OTTHUMG00000040945 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000417585 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:Y:6182796:6184282:-1 gene:ENSG00000234659 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098308 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:Y:6182796:6184282:-1 Gene:OTTHUMG00000040952 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001536 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2 (non-protein coding) (TTTY2), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003590 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2B (non-protein coding) (TTTY2B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6406244:6424145:-1 gene:ENSG00000212856 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098348 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6406244:6424145:-1 Gene:OTTHUMG00000040980 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 2 (non-protein coding) (TTTY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001533 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8 (non-protein coding) (TTTY8), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003591 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8B (non-protein coding) (TTTY8B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:6471031:6473630:-1 gene:ENSG00000185700 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:6470773:6473630:-1 gene:ENSG00000185700 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098352 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6471031:6473630:-1 Gene:OTTHUMG00000040982 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098353 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6470773:6473630:-1 Gene:OTTHUMG00000040982 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 8 (non-protein coding) (TTTY8), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001143 // RefSeq // Homo sapiens amelogenin, Y-linked (AMELY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000215479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:6865918:6874027:-1 gene:ENSG00000099721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:6866073:6872608:-1 gene:ENSG00000099721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383037 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:6736078:6740649:-1 gene:ENSG00000099721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY487421 // GenBank // Homo sapiens amelogenin precursor (AMELY) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069138 // GenBank // Homo sapiens amelogenin, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:95422 IMAGE:7216997), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074976 // GenBank // Homo sapiens amelogenin, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:104065 IMAGE:30915513), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085358 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6865918:6874027:-1 Gene:OTTHUMG00000035297 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100214 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:6866073:6872608:-1 Gene:OTTHUMG00000035297 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens amelogenin, Y-linked (AMELY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fra.1 // UCSC Genes // Homo sapiens amelogenin, Y-linked (AMELY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516663 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:7423054:7423158:-1 gene:ENSG00000252472 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001552 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 16 (non-protein coding) (TTTY16), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:7699357:7701247:-1 gene:ENSG00000225520 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098420 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:7699357:7701247:-1 Gene:OTTHUMG00000041019 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 16 (non-protein coding) (TTTY16), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000442584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:7742595:7809261:-1 gene:ENSG00000234795 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041884 // GenBank // Homo sapiens raftlin, lipid raft linker 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5298352). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens raftlin, lipid raft linker 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5298352). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098416 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:7610636:7690901:-1 Gene:OTTHUMG00000041015 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frg.2 cpcScore=0.8787020 cnci=-0.2611502 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022ciz.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTG) // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001550 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 18 (non-protein coding) (TTTY18), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:8683370:8683878:-1 gene:ENSG00000233699 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098862 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:8683370:8683878:-1 Gene:OTTHUMG00000041267 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fri.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 18 (non-protein coding) (TTTY18), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001548 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 11 (non-protein coding) (TTTY11), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000253470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:8783310:8817382:-1 gene:ENSG00000180910 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098854 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:8783310:8817382:-1 Gene:OTTHUMG00000041259 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 11 (non-protein coding) (TTTY11), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001547 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A3 pseudogene (RBMY1A3P), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A3 pseudogene (RBMY1A3P), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001546 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 20 (non-protein coding) (TTTY20), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9329880:9334832:-1 gene:ENSG00000232808 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099510 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9329880:9334832:-1 Gene:OTTHUMG00000041537 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 20 (non-protein coding) (TTTY20), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001553 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9347511:9355401:-1 gene:ENSG00000225560 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9349579:9355182:-1 gene:ENSG00000225560 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099494 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9349579:9355182:-1 Gene:OTTHUMG00000187512 gene:OTTHUMG00000041530 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099495 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9347511:9355401:-1 Gene:OTTHUMG00000187512 gene:OTTHUMG00000041530 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cjb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frp.1 cpcScore=2.0916900 cnci=-0.1256268 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001553 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:9463852:9465974:-1 gene:ENSG00000225516 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:10070131:10070409:1 gene:ENSG00000278478 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSG00000225516 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9354846:9356814:-1 gene:ENSG00000225560 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene gene:ENSG00000225516 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516423 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:Y:9323878:9323934:-1 gene:ENSG00000252232 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516467 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:Y:9344161:9344217:-1 gene:ENSG00000252276 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frv.1 cpcScore=2.0031400 cnci=-0.1384026 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517130 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:Y:9303568:9303624:-1 gene:ENSG00000252939 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001553 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9519666:9525268:-1 gene:ENSG00000234803 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9517599:9525487:-1 gene:ENSG00000234803 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099480 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9519666:9525268:-1 Gene:OTTHUMG00000041523 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099481 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9517599:9525487:-1 Gene:OTTHUMG00000041523 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fry.3 // UCSC Genes // --- // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9499341:9504941:-1 gene:ENSG00000230066 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9497287:9505159:-1 gene:ENSG00000230066 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099477 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9499341:9504941:-1 Gene:OTTHUMG00000041521 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099478 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9497287:9505159:-1 Gene:OTTHUMG00000041521 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516928 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:Y:9364491:9364547:-1 gene:ENSG00000252737 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000421178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9544917:9547147:-1 gene:ENSG00000224336 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001573 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 3, member A pseudogene (RBMY3AP), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U94385 // GenBank // Homo sapiens Y chromosome spermatogenesis candidate protein (RBM) pseudogene mRNA, partial cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 3, member A pseudogene (RBMY3AP), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 3, member A pseudogene (RBMY3AP), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001535 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21 (non-protein coding) (TTTY21), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003588 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21B (non-protein coding) (TTTY21B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9717653:9721296:-1 gene:ENSG00000228890 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106566 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9717653:9721296:-1 Gene:OTTHUMG00000046232 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 21 (non-protein coding) (TTTY21), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001538 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1 (non-protein coding) (TTTY1), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003589 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1B (non-protein coding) (TTTY1B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9753156:9774289:-1 gene:ENSG00000129845 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106563 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9753156:9774289:-1 Gene:OTTHUMG00000046226 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 1B (non-protein coding) (TTTY1B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000456541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:10066554:10067386:-1 gene:ENSG00000225685 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:10090410:10090528:-1 gene:ENSG00000251766 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:10092875:10092993:-1 gene:ENSG00000252289 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590126 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57238, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517046 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:11184875:11184957:-1 gene:ENSG00000252855 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000331172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:11340579:11385687:-1 gene:ENSG00000183704 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc022cjh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone 136c08 anti-tetanus toxoid immunoglobulin light chain variable region (IGL@) mRNA, partial cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:13159273:13161549:-1 gene:ENSG00000235462 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516885 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:13667960:13668056:-1 gene:ENSG00000252694 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004679 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, Y-linked (VCY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_181880 // RefSeq // Homo sapiens variable charge, Y-linked 1B (VCY1B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:13985772:13986513:-1 gene:ENSG00000129864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC056508 // GenBank // Homo sapiens variable charge, Y-linked 1B, mRNA (cDNA clone MGC:61936 IMAGE:6450744), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096729 // GenBank // Homo sapiens variable charge, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:119817 IMAGE:40014422), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088592 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:13985772:13986513:-1 Gene:OTTHUMG00000036401 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens variable charge, Y-linked (VCY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516880 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:16138248:16138379:-1 gene:ENSG00000252689 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516514 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:16336283:16336389:-1 gene:ENSG00000252323 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002160 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member B (non-protein coding) (FAM224B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002161 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member A (non-protein coding) (FAM224A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:17552800:17579754:-1 gene:ENSG00000230663 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088613 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:17552800:17579754:-1 Gene:OTTHUMG00000036416 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 224, member B (non-protein coding) (FAM224B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ftj.2 cpcScore=-0.9824060 cnci=-0.3169258 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516229 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:17623061:17623155:-1 gene:ENSG00000252038 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002906 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked 2 (XKRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004677 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked (XKRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132883 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:164514 IMAGE:40146905), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related, Y-linked (XKRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516704 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:17789003:17789162:-1 gene:ENSG00000252513 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001722 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B (CDY2B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004825 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2A (CDY2A), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:17878267:17880220:-1 gene:ENSG00000129873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:17877410:17880218:-1 gene:ENSG00000129873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069087 // GenBank // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B, mRNA (cDNA clone MGC:95362 IMAGE:7216901), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130426 // GenBank // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2B, mRNA (cDNA clone MGC:163298 IMAGE:40146457), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099653 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:17878267:17880220:-1 Gene:OTTHUMG00000041652 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromodomain protein, Y-linked, 2A (CDY2A), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:18346123:18346238:-1 gene:ENSG00000251953 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:18348035:18348147:-1 gene:ENSG00000252667 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028083 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 1 (FAM41AY1), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028084 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 2 (FAM41AY2), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458627 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:18390994:18405046:-1 gene:ENSG00000226362 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nau.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member A, Y-linked 2 (FAM41AY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100029 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18389270:18405046:-1 Gene:OTTHUMG00000041973 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001530 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9A (non-protein coding) (TTTY9A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002159 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding) (TTTY9B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:18581206:18590521:-1 gene:ENSG00000131007 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:18581206:18588712:-1 gene:ENSG00000131007 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100006 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:20743092:20752407:-1 Gene:OTTHUMG00000041950 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fts.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding) (TTTY9B), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:18833729:18833890:-1 gene:ENSG00000251970 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001543 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 14 (non-protein coding) (TTTY14), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_001544 // RefSeq // Homo sapiens non-protein coding RNA 185 (NCRNA00185), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:18872501:18878228:-1 gene:ENSG00000176728 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18872501:18878228:-1 Gene:OTTHUMG00000036505 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18872503:19077118:-1 Gene:OTTHUMG00000036505 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18932317:19075996:-1 Gene:OTTHUMG00000036505 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088787 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:19041498:19077395:-1 Gene:OTTHUMG00000036505 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090864 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:18932699:19077416:-1 Gene:OTTHUMG00000036505 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens non-protein coding RNA 185 (NCRNA00185), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fty.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 14 (non-protein coding) (TTTY14), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fty.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fty.2 cpcScore=-1.1286700 cnci=-0.2476180 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013230 // RefSeq // Homo sapiens CD24 molecule (CD24), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064619 // GenBank // Homo sapiens CD24 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:75043 IMAGE:5591617), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004ftz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD24 molecule (CD24), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:19018983:19019087:-1 gene:ENSG00000252766 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002923 // RefSeq // Homo sapiens BCL6 corepressor pseudogene 1 (BCORP1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033732 // RefSeq // Homo sapiens BCL6 corepressor pseudogene 1 (BCORP1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:19455431:19503153:-1 gene:ENSG00000215580 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303164 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59804 complete cds, moderately similar to BCoR protein. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088801 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:19455431:19503153:-1 Gene:OTTHUMG00000036498 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088802 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:19456312:19503136:-1 Gene:OTTHUMG00000036498 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fua.1 // UCSC Genes // Homo sapiens BCL6 corepressor pseudogene 1 (BCORP1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fub.1 // UCSC Genes // Homo sapiens BCL6 corepressor pseudogene 1 (BCORP1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nav.1 // UCSC Genes // Homo sapiens BCL6 corepressor pseudogene 1 (BCORP1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001542 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 10 (non-protein coding) (TTTY10), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:20507254:20518407:-1 gene:ENSG00000229236 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:20465668:20519228:-1 gene:ENSG00000229236 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088633 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:20507254:20518407:-1 Gene:OTTHUMG00000036431 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:20465668:20519228:-1 Gene:OTTHUMG00000036431 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fuj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 10 (non-protein coding) (TTTY10), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000527562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:21038289:21044724:-1 gene:ENSG00000254488 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000382764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:21382954:21386360:-1 gene:ENSG00000183146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100103 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:21382954:21386360:-1 Gene:OTTHUMG00000042036 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330758 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:Y:23544872:23613732:-1 gene:ENSG00000183146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001574 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 2, member E pseudogene (RBMY2EP), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:21395148:21401562:-1 gene:ENSG00000223637 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100104 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:23557034:23563448:-1 Gene:OTTHUMG00000042037 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fun.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein, Y-linked, family 2, member E pseudogene (RBMY2EP), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001537 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 13 (non-protein coding) (TTTY13), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:21583600:21594666:-1 gene:ENSG00000184991 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101923 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:21583600:21594666:-1 Gene:OTTHUMG00000043583 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fus.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 13 (non-protein coding) (TTTY13), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002758 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked 2 (PRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004676 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000303804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:22071756:22096007:-1 gene:ENSG00000169807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341740 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:24219875:24242154:-1 gene:ENSG00000169807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22071756:22096007:-1 gene:ENSG00000169807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF517635 // GenBank // Homo sapiens testis-specific PTP-BL related Y protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113548 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142108 IMAGE:8322600), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101926 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22071756:22096007:-1 Gene:OTTHUMG00000043586 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101927 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22071756:22096007:-1 Gene:OTTHUMG00000043586 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fuy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked 2 (PRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked 2 (PRY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001541 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 5 (non-protein coding) (TTTY5), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22296798:22298876:-1 gene:ENSG00000215560 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101917 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22296798:22298876:-1 Gene:OTTHUMG00000043578 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 5 (non-protein coding) (TTTY5), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001527 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002175 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6B (non-protein coding) (TTTY6B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000253838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:22439593:22441458:-1 gene:ENSG00000131538 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538537 // ENSEMBL // [retired]ensembl:lincRNA chromosome:GRCh37:Y:24585887:24587549:-1 gene:ENSG00000131538 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY597808 // GenBank // Homo sapiens chromosome Y testis-specific Y-linked 6 (TTTY6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000106557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:22439593:22441458:-1 Gene:OTTHUMG00000046220 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022coj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 6 (non-protein coding) (TTTY6), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516116 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:23423099:23423236:-1 gene:ENSG00000251925 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000102479 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:25687556:25693043:-1 Gene:OTTHUMG00000044058 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:23541409:23546896:-1 gene:ENSG00000215540 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004676 // RefSeq // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000303593 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:Y:25829559:25840710:-1 gene:ENSG00000169763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:23681440:23694579:-1 gene:ENSG00000169763 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113548 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142108 IMAGE:8322600), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113550 // GenBank // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:142110 IMAGE:8322602), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104549 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:23682007:23694527:-1 Gene:OTTHUMG00000044998 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PTPN13-like, Y-linked (PRY), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:23740942:23741105:-1 gene:ENSG00000252681 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001524 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3 (non-protein coding) (TTTY3), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002176 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3B (non-protein coding) (TTTY3B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fvy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 3 (non-protein coding) (TTTY3), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:23946618:23946771:-1 gene:ENSG00000251917 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ577902 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-46014, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-46014, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574758 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cop.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001554 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 1, Y-linked (CSPG4P1Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:24183434:24187231:-1 gene:ENSG00000244231 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:24183434:24187231:-1 Gene:OTTHUMG00000045073 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 1, Y-linked (CSPG4P1Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ585964 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-53076, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cor.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53076, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571386 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-31498, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cos.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31498, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001555 // RefSeq // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 2, Y-linked (GOLGA2P2Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002195 // RefSeq // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 3, Y-linked (GOLGA2P3Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:24209967:24214831:-1 gene:ENSG00000239533 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516761 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:Y:24210050:24210132:-1 gene:ENSG00000278686 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000239533 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104735 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:24209967:24214831:-1 Gene:OTTHUMG00000045076 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens golgin A2 pseudogene 2, Y-linked (GOLGA2P2Y), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fwd.2 cpcScore=3.3454900 cnci=-0.1400353 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001002760 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2B (BPY2B), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001002761 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2C (BPY2C), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004678 // RefSeq // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:25030901:25052104:-1 gene:ENSG00000185894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171796 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054450. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104944 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25030901:25052104:-1 Gene:OTTHUMG00000045199 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fws.3 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens basic charge, Y-linked, 2 (BPY2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001525 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002177 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4C (non-protein coding) (TTTY4C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002178 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4B (non-protein coding) (TTTY4B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:25063083:25099892:-1 gene:ENSG00000228296 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104945 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25063083:25099892:-1 Gene:OTTHUMG00000045200 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 4 (non-protein coding) (TTTY4), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001526 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002179 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17C (non-protein coding) (TTTY17C), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002180 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17B (non-protein coding) (TTTY17B), long non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:25183643:25184773:-1 gene:ENSG00000223641 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104952 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:25183643:25184773:-1 Gene:OTTHUMG00000045207 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 17A (non-protein coding) (TTTY17A), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwt.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fwt.2 cpcScore=-0.9525080 cnci=-0.2313558 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587965 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55077, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43121, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ598729 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-36795, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31176, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ596138 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-34204, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011nbx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30247, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ578199 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-46311, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41091, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597149 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35215, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50911, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574758 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fwz.2 cpcScore=-1.3363500 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fwz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42870, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576060 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44172, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44172, complete sequence. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000399966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:156014623:156016837:-1 gene:ENSG00000185203 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AM992879 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like (DDX11L1 gene). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ncc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens partial mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like (DDX11L1 gene). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z48520 // NONCODE // accn=Z48520 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1855 cpcScore=0.2785670 cnci=-0.1846082 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137603 // NONCODE // accn=AL137603 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1856 cpcScore=-1.1882600 cnci=-0.4961384 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ564948 // NONCODE // accn=AJ564948 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000248828 cpcScore=-1.1828800 cnci=-1.0000000 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124410 // NONCODE // accn=AK124410 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5013 cpcScore=0.1283500 cnci=-0.3000394 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028062 // NONCODE // accn=NR_028062 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028062 cpcScore=5.0576100 cnci=-0.2625938 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Y10484 // NONCODE // accn=Y10484 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325587 cpcScore=1.1806700 cnci=-0.0278687 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028319 // NONCODE // accn=NR_028319 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028319 cpcScore=9.0967800 cnci=-0.1742680 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011nat.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011nat.1 cpcScore=0.0954122 cnci=-0.2263830 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003509 // NONCODE // accn=NR_003509 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003509 cpcScore=2.8632400 cnci=-0.2482883 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ297964 // NONCODE // accn=AJ297964 class=TTY2 RNA name=TTY2 ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.2085425 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002193 // NONCODE // accn=NR_002193 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002193 cpcScore=1.3722800 cnci=-0.3859493 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF248482 // NONCODE // accn=AF248482 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000074978_06 cpcScore=2.7681600 cnci=-0.2203641 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR597100 // NONCODE // accn=CR597100 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000276295_04 cpcScore=-1.2192300 cnci=-0.1666457 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ297963 // NONCODE // accn=AJ297963 class=TTY2 RNA name=TTY2 ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.1881518 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004frk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frk.2 cpcScore=1.6974800 cnci=-0.2411760 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF527832 // NONCODE // accn=AF527832 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5016 cpcScore=-0.9100590 cnci=-0.1955282 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004frp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frp.1 cpcScore=2.0916900 cnci=-0.1256268 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033667 // NONCODE // accn=NR_033667 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033667 cpcScore=0.2127910 cnci=-0.2316889 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF491796 // NONCODE // accn=EF491796 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000395523 cpcScore=0.5815490 cnci=-0.2316349 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004ftj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004ftj.2 cpcScore=-0.9824060 cnci=-0.3169258 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001530 // NONCODE // accn=NR_001530 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_001530 cpcScore=-0.1383800 cnci=-0.3449212 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002923 // NONCODE // accn=NR_002923 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002923 cpcScore=5.4309300 cnci=-0.3113923 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033732 // NONCODE // accn=NR_033732 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033732 cpcScore=5.9160100 cnci=-0.2703522 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX648634 // NONCODE // accn=BX648634 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1863 cpcScore=-0.8346690 cnci=-0.4029700 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U36217 // NONCODE // accn=U36217 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000219446_10 cpcScore=-1.3762900 cnci=-0.5510800 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc004fvy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004fvy.1 cpcScore=-1.1200000 cnci=-0.1982206 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001554 // NONCODE // accn=NR_001554 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_001554 cpcScore=4.1541100 cnci=-0.0535067 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012288 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_022148 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1187549:1212637:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:X:1190897:1212634:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1196780:1212723:-1 gene:ENSG00000205755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK223303 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cytokine receptor-like factor 2 variant, clone: TMS01248. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fox.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004foy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022ciq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178129 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1462572:1537107:-1 gene:ENSG00000182162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1466437:1494353:-1 gene:ENSG00000182162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043610 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8, mRNA (cDNA clone MGC:50878 IMAGE:5787268), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cit.1 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 8 (P2RY8), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005088 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027383 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1591625:1600303:1 gene:ENSG00000197976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028151 // GenBank // Homo sapiens splicing factor, arginine/serine-rich 17A, mRNA (cDNA clone MGC:39904 IMAGE:5217247), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110496 // GenBank // Homo sapiens splicing factor, arginine/serine-rich 17A, mRNA (cDNA clone MGC:125365 IMAGE:40007662), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000313871 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold818:752407:753102:+ gene:ENSG00000197976 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nvx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 17A (AKAP17A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171038 // RefSeq // Homo sapiens acetylserotonin O-methyltransferase (ASMT), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001171039 // RefSeq // Homo sapiens acetylserotonin O-methyltransferase (ASMT), transcript variant 3, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1615164:1643027:1 gene:ENSG00000196433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1615175:1643081:1 gene:ENSG00000196433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:1615001:1643081:1 gene:ENSG00000196433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:1627746:1636463:1 gene:ENSG00000196433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001620 // GenBank // Homo sapiens acetylserotonin O-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:2145 IMAGE:3356470), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fpr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens acetylserotonin O-methyltransferase (ASMT), transcript variant 3, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nvy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens acetylserotonin O-methyltransferase (ASMT), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001008 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 1 (RPS4Y1), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:Y:2841486:2867268:1 gene:ENSG00000129824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:2854096:2866956:1 gene:ENSG00000129824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:2854730:2932000:1 gene:ENSG00000129824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010286 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:5070 IMAGE:3048929), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC100905 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:119100 IMAGE:40003602), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088052 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:2841486:2867268:1 Gene:OTTHUMG00000036152 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088053 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:2841920:2866862:1 Gene:OTTHUMG00000036152 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088054 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:2854096:2866956:1 Gene:OTTHUMG00000036152 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088057 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:Y:2722771:2800041:1 Gene:OTTHUMG00000036155 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein S4, Y-linked 1 (RPS4Y1), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003254 // RefSeq // Homo sapiens Xg pseudogene, Y-linked 2 (XGY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Xg pseudogene, Y-linked 2 (XGPY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Z48513 // GenBank // H.sapiens XG mRNA (clone PEP7). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fqc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Xg pseudogene, Y-linked 2 (XGPY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Xg pseudogene, Y-linked 2 (XGPY2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Z48520 // GenBank // H.sapiens XG mRNA (clone RACE6). // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000253320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:19592450:19606274:1 gene:ENSG00000131002 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382832 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:Y:21758442:21767698:1 gene:ENSG00000131002 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:19590753:19593651:1 gene:ENSG00000131002 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035312 // GenBank // Homo sapiens chromosome Y open reading frame 15B, mRNA (cDNA clone MGC:21662 IMAGE:4747440), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088781 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:19592450:19606274:1 Gene:OTTHUMG00000036509 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088782 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:19590753:19593651:1 Gene:OTTHUMG00000036509 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182905 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein family homolog 1 (WASH1), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000285718 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:X:155250706:155255299:1 gene:ENSG00000182484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:156020961:156025374:1 gene:ENSG00000182484 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:156021328:156025663:1 gene:ENSG00000182484 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK292759 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77647 complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041177 // GenBank // Homo sapiens CXYorf1-related protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6042646), partial cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cpg.1 // UCSC Genes // RecName: Full=WAS protein family homolog 6; AltName: Full=Protein FAM39A; // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fxo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens WAS protein family homolog 1 (WASH1), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001553 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 2 (FAM197Y2), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9374969:9377092:-1 gene:ENSG00000228383 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9367803:9375681:-1 gene:ENSG00000228383 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9369857:9375462:-1 gene:ENSG00000228383 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099500 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9369857:9375462:-1 Gene:OTTHUMG00000041532 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099501 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9367803:9375681:-1 Gene:OTTHUMG00000041532 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cjd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 197, Y-linked, member 5 (FAM197Y5), non-coding RNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frp.1 cpcScore=2.0916900 cnci=-0.1256268 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9395315:9397438:-1 gene:ENSG00000237802 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene gene:ENSG00000228383 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9388122:9396027:-1 gene:ENSG00000237802 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9390191:9395808:-1 gene:ENSG00000237802 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF527835 // GenBank // Homo sapiens CYorf16 protein (CYorf16) mRNA, partial cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099503 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9390191:9395808:-1 Gene:OTTHUMG00000041534 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099504 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:Y:9388122:9396027:-1 Gene:OTTHUMG00000041534 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc022cje.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CYorf16 protein (CYorf16) mRNA, partial cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383010 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:Y:9215731:9238832:1 gene:ENSG00000228927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075016 // GenBank // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:103998 IMAGE:30915406), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121113 // GenBank // Homo sapiens similar to testis specific protein, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:150413 IMAGE:40120433), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121114 // GenBank // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:150414 IMAGE:40120435), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// M98525 // GenBank // Homo sapiens testicular protein (TSPY) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 4 (TSPY4), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc004frs.2 cpcScore=4.3784400 cnci=-0.1393806 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nwm.1 cpcScore=3.8941700 cnci=-0.2237565 // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nwm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 4 (TSPY4), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001197242 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003308 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:9466955:9469748:1 gene:ENSG00000258992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121113 // GenBank // Homo sapiens similar to testis specific protein, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:150413 IMAGE:40120433), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004frx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 1 (TSPY1), transcript variant 2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC075016 // GenBank // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:103998 IMAGE:30915406), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121113 // GenBank // Homo sapiens similar to testis specific protein, Y-linked 1, mRNA (cDNA clone MGC:150413 IMAGE:40120433), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// M98525 // GenBank // Homo sapiens testicular protein (TSPY) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36094 fis, clone TESTI2020717, highly similar to Human testis-specific protein (TSPY) mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc004fsc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36094 fis, clone TESTI2020717, highly similar to Human testis-specific protein (TSPY) mRNA. // chrY // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408830 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:10:93769:93877:1 gene:ENSG00000221757 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027151 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 26 (PRR26), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027152 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 26 (PRR26), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381489 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:650077:665169:1 gene:ENSG00000180525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:649948:652655:1 gene:ENSG00000180525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046384 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:709498:712562:1 Gene:OTTHUMG00000017528 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046385 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:650077:665169:1 Gene:OTTHUMG00000017529 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046386 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:649948:652655:1 Gene:OTTHUMG00000017529 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ifr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proline rich 26 (PRR26), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qab.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proline rich 26 (PRR26), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:663558:666622:1 gene:ENSG00000242357 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015376 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 200 (LINC00200), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1159768:1164672:1 gene:ENSG00000229205 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:1159768:1164672:1 Gene:OTTHUMG00000017539 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qag.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 200 (LINC00200), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033387 // RefSeq // Homo sapiens ADARB2 antisense RNA 1 (ADARB2-AS1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1526763:1535673:1 gene:ENSG00000205696 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1526637:1556984:1 gene:ENSG00000205696 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:1526763:1535673:1 Gene:OTTHUMG00000017542 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046425 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:1526637:1556984:1 Gene:OTTHUMG00000017542 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ign.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADARB2 antisense RNA 1 (ADARB2-AS1), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000046434 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:2071845:2081097:1 Gene:OTTHUMG00000017544 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:2071845:2081097:1 gene:ENSG00000226694 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450757 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:2114124:2114923:1 gene:ENSG00000226694 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046433 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000046433 cpcScore=-1.0114800 cnci=-0.3469526 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517189 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:2098167:2098269:1 gene:ENSG00000252998 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390854 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:2199387:2199488:1 gene:ENSG00000212156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000446337 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:3026556:3027331:1 gene:ENSG00000225430 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046449 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000046449 cpcScore=-1.3842200 cnci=-0.3171512 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038284 // RefSeq // Homo sapiens PITRM1 antisense RNA 1 (PITRM1-AS1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:3141672:3148622:1 gene:ENSG00000237399 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:3134566:3145166:1 gene:ENSG00000278419 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense gene:ENSG00000237399 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452662 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:3185207:3204580:1 gene:ENSG00000237399 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046474 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:3183864:3187425:1 Gene:OTTHUMG00000017558 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046475 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:3141672:3148622:1 Gene:OTTHUMG00000017558 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001igv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PITRM1 antisense RNA 1 (PITRM1-AS1), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046473 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:3185207:3204580:1 Gene:OTTHUMG00000017558 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000421821 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:3247908:3248816:1 gene:ENSG00000227575 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046476 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000046476 cpcScore=-0.2085280 cnci=-0.1975674 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517145 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:10:3276655:3276792:1 gene:ENSG00000252954 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000046502 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:3934519:3935813:1 Gene:OTTHUMG00000017569 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:3934519:3935813:1 gene:ENSG00000226005 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450152 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:3974896:3978004:1 gene:ENSG00000226005 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046503 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000046503 cpcScore=-0.2801520 cnci=-0.3215767 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015425 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 705 (LINC00705), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:4655427:4662419:1 gene:ENSG00000225269 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046511 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:4655427:4662419:1 Gene:OTTHUMG00000017575 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ihg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 705 (LINC00705), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459141 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:5004710:5004842:1 gene:ENSG00000239148 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001818 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C4 (AKR1C4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:5196835:5218947:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5195463:5218949:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397357 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:5238798:5246612:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5195462:5196922:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020744 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C4 (chlordecone reductase; 3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase, type I; dihydrodiol dehydrogenase 4), mRNA (cDNA clone MGC:22581 IMAGE:4734943), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046543 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:5195463:5218949:1 Gene:OTTHUMG00000017591 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046544 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:5195462:5196922:1 Gene:OTTHUMG00000017591 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ihw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C4 (AKR1C4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_053049 // RefSeq // Homo sapiens urocortin 3 (UCN3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000380433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5365009:5374692:1 gene:ENSG00000178473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069530 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:96972 IMAGE:7262181), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC100867 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:119002 IMAGE:40002991), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046547 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:5365009:5374692:1 Gene:OTTHUMG00000017594 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ihx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens urocortin 3 (UCN3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005185 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin-like 3 (CALML3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5524009:5526771:1 gene:ENSG00000178363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031889 // GenBank // Homo sapiens calmodulin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:30093 IMAGE:4777524), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046555 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:5524009:5526771:1 Gene:OTTHUMG00000017597 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iie.1 // UCSC Genes // Homo sapiens calmodulin-like 3 (CALML3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000438246 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:10:6221120:6222152:1 gene:ENSG00000224502 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046632 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:6221120:6222152:1 Gene:OTTHUMG00000017617 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:6350316:6352762:1 gene:ENSG00000212743 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036502 // RefSeq // Homo sapiens PRKCQ antisense RNA 1 (PRKCQ-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036503 // RefSeq // Homo sapiens PRKCQ antisense RNA 1 (PRKCQ-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:6580419:6584299:1 gene:ENSG00000237943 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046661 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:6580425:6584028:1 Gene:OTTHUMG00000017622 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046662 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:6583676:6585679:1 Gene:OTTHUMG00000017622 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046663 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:6583679:6584298:1 Gene:OTTHUMG00000017622 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046664 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:6580419:6584299:1 Gene:OTTHUMG00000017622 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ijl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRKCQ antisense RNA 1 (PRKCQ-AS1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pmt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRKCQ antisense RNA 1 (PRKCQ-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ijl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ijl.2 cpcScore=3.4609000 cnci=-0.1949980 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038291 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 707 (LINC00707), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:6779598:6842906:1 gene:ENSG00000238266 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046670 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:6779598:6842906:1 Gene:OTTHUMG00000017627 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ijm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 707 (LINC00707), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000535221 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000535221 cpcScore=-0.8752730 cnci=-0.2572810 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031923 // RefSeq // Homo sapiens TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 140kDa (TAF3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:7818504:8016627:1 gene:ENSG00000165632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542889 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:7860501:8017059:1 gene:ENSG00000165632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046725 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:7818504:8016627:1 Gene:OTTHUMG00000017643 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qbd.2 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010qbh.1 // UCSC Genes // new regulatory genes for hTERT gene expression. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000535261 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:10:10216193:10216528:1 gene:ENSG00000229919 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363979 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:10232611:10232712:1 gene:ENSG00000200849 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF007147 // GenBank // Homo sapiens clone 23712 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ikr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone 23712 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429092 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:10:11495945:11497386:1 gene:ENSG00000229763 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046763 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000046763 cpcScore=-1.1704000 cnci=-0.3290163 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037281 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC439951, mRNA (cDNA clone MGC:33041 IMAGE:4838780), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024693 // RefSeq // Homo sapiens enoyl CoA hydratase domain containing 3 (ECHDC3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:11742366:11764070:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11742366:11764070:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF289604 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp8332 unknown mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009617 // GenBank // Homo sapiens enoyl Coenzyme A hydratase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:16831 IMAGE:3893103), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046771 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:11742366:11764070:1 Gene:OTTHUMG00000017675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046772 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:11742366:11764070:1 Gene:OTTHUMG00000017675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046773 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:11747450:11755730:1 Gene:OTTHUMG00000017675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046774 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:11742446:11755581:1 Gene:OTTHUMG00000017675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:11747275:11763351:1 Gene:OTTHUMG00000017675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ikw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens enoyl CoA hydratase domain containing 3 (ECHDC3), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xix.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516148 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:11923181:11923288:1 gene:ENSG00000251957 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458754 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:12187662:12187765:1 gene:ENSG00000238900 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516629 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:12415928:12416000:1 gene:ENSG00000252438 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:12456483:12456631:1 gene:ENSG00000252118 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384716 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:10:13259269:13259375:1 gene:ENSG00000207447 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410303 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:13704978:13705072:1 gene:ENSG00000222235 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000512032 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512032 cpcScore=-0.1569780 cnci=-0.2511185 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459622 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:15928357:15928464:1 gene:ENSG00000239130 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516728 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:16005808:16005923:1 gene:ENSG00000252537 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516150 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:17721187:17721296:1 gene:ENSG00000251959 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098844 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338221 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:17794260:17842160:1 gene:ENSG00000148483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17752252:17800868:1 gene:ENSG00000148483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300456 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59050 complete cds, highly similar to Protein FAM23A. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157856 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 23, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189751 IMAGE:9057075), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047053 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:17752252:17800868:1 Gene:OTTHUMG00000017753 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qcg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xjx.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001098844 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457860 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:18041227:18089148:1 gene:ENSG00000184040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480516 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:18041218:18089855:1 gene:ENSG00000184040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300456 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59050 complete cds, highly similar to Protein FAM23A. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157856 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 23, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189751 IMAGE:9057075), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047055 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:18041218:18089855:1 Gene:OTTHUMG00000017755 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qci.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xjy.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178815 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5B (ARL5B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:18659405:18681639:1 gene:ENSG00000165997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK022915 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12853 fis, clone NT2RP2003456. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024163 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5B, mRNA (cDNA clone MGC:22841 IMAGE:3931095), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047078 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:18659405:18681639:1 Gene:OTTHUMG00000017765 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iqd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5B (ARL5B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iqe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ12853 fis, clone NT2RP2003456. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iqe.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001iqe.2 cpcScore=-1.2488100 cnci=-0.4433531 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ600701 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-38767, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pnq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-60732, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363675 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:19598247:19598463:1 gene:ENSG00000200545 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:21321961:21322067:1 gene:ENSG00000207264 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:21481716:21481817:1 gene:ENSG00000199222 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515940 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:21774567:21774666:1 gene:ENSG00000251749 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pog.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon GGG) // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:22787393:22787499:1 gene:ENSG00000206842 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012228 // RefSeq // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2 (MSRB2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23095506:23122013:1 gene:ENSG00000148450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:23119144:23120893:1 gene:ENSG00000148450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018030 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:26104 IMAGE:4799583), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117471 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:151080 IMAGE:40126022), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047205 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:23095506:23122013:1 Gene:OTTHUMG00000017812 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047206 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:23104144:23120954:1 Gene:OTTHUMG00000017812 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047207 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:23119144:23120893:1 Gene:OTTHUMG00000017812 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iro.3 // UCSC Genes // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2 (MSRB2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430957 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:10:23425852:23426154:1 gene:ENSG00000229932 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178161 // RefSeq // Homo sapiens pancreas specific transcription factor, 1a (PTF1A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23192327:23194252:1 gene:ENSG00000168267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:23192327:23194252:1 Gene:OTTHUMG00000017815 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001irp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens pancreas specific transcription factor, 1a (PTF1A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145373 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 1 (OTUD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23439458:23442390:1 gene:ENSG00000165312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047215 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:23439458:23442390:1 Gene:OTTHUMG00000017819 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001irr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens OTU domain containing 1 (OTUD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445438 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:10:24604218:24621071:1 gene:ENSG00000235229 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047219 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:24604218:24621071:1 Gene:OTTHUMG00000017823 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408159 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:10:25239333:25239409:1 gene:ENSG00000221086 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024838 // RefSeq // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae) (THNSL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000524413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:25016658:25026664:1 gene:ENSG00000185875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035132 // GenBank // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:43231 IMAGE:5263853), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376356 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1074:325618:327849:+ gene:ENSG00000185875 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047242 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:25016658:25026664:1 Gene:OTTHUMG00000017828 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001isi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae) (THNSL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pol.1 // UCSC Genes // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae) (THNSL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020752 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 158 (GPR158), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:25175062:25602226:1 gene:ENSG00000151025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:25594213:25602226:1 gene:ENSG00000151025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB032962 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1136 protein, partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047248 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:25175062:25602226:1 Gene:OTTHUMG00000017832 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047249 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:25466190:25475949:1 Gene:OTTHUMG00000017832 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047251 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:25594213:25602226:1 Gene:OTTHUMG00000017832 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001isj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 158 (GPR158), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001isk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 158 (GPR158), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450270 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:25940704:25971574:1 gene:ENSG00000228690 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK123440 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41446 fis, clone BRSTN2003590. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001isl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ41446 fis, clone BRSTN2003590. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047252 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000047252 cpcScore=-1.1365300 cnci=-0.1967077 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026793 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 264 (LINC00264), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:26589865:26594330:1 gene:ENSG00000233261 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047265 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:26589865:26594330:1 Gene:OTTHUMG00000017839 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ist.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 264 (LINC00264), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411095 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:26789017:26789157:1 gene:ENSG00000223027 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458804 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:27157094:27157193:1 gene:ENSG00000238414 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:27315120:27315226:1 gene:ENSG00000200369 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410442 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:28310853:28310959:1 gene:ENSG00000222374 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28652630:28652755:1 gene:ENSG00000252401 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28667919:28668025:1 gene:ENSG00000207483 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012342 // RefSeq // Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor (BAMBI), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542444 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:28966452:28971695:1 gene:ENSG00000095739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019252 // GenBank // Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:1111 IMAGE:3503549), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375533 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold570:2386952:2388423:- gene:ENSG00000095739 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047374 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:28677342:28682939:1 Gene:OTTHUMG00000017874 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000324589 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:28677510:28682677:1 Gene:OTTHUMG00000017874 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iuj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor homolog (Xenopus laevis) (BAMBI), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ius.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35060 fis, clone OCBBF2018828. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391109 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:29575306:29575381:1 gene:ENSG00000212411 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410160 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:29711915:29712008:1 gene:ENSG00000222092 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ589067 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-56179, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ive.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44600, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ593032 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-33144, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ivg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ivg.1 cpcScore=-1.2409400 cnci=-1.0000000 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ivg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31176, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517117 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:10:30725515:30725576:1 gene:ENSG00000252926 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000435645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:30693662:30698463:1 gene:ENSG00000234814 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK302694 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59642 complete cds, highly similar to Supervillin. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qdx.1 // UCSC Genes // SubName: Full=cDNA FLJ59642, highly similar to Supervillin; // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516673 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:32173684:32173744:1 gene:ENSG00000252482 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ixf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ixf.2 cpcScore=-1.1654400 cnci=-0.2479311 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ixf.3 // UCSC Genes // Sequence 35 from Patent WO02055706. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:34926775:34926882:1 gene:ENSG00000223047 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:34942969:34943075:1 gene:ENSG00000222909 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517245 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:35135443:35135502:1 gene:ENSG00000253054 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153368 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, delta 4, 40.1kDa (GJD4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:35605410:35608935:1 gene:ENSG00000177291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047576 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:35605410:35608935:1 Gene:OTTHUMG00000017957 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iyy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, delta 4, 40.1kDa (GJD4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052997 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30A (ANKRD30A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:37125857:37232567:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:37125857:37232567:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:37184442:37193208:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047588 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:37125857:37384111:1 Gene:OTTHUMG00000017968 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047589 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:37125857:37232567:1 Gene:OTTHUMG00000017968 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047590 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:37184442:37193208:1 Gene:OTTHUMG00000017968 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iza.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30A (ANKRD30A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30A (ANKRD30A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:37135237:37135343:1 gene:ENSG00000206796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384113 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:37994863:37994975:1 gene:ENSG00000206840 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024524 // RefSeq // Homo sapiens cyclin Y-like 1 pseudogene (LOC100129055), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047618 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:38164648:38178030:1 Gene:OTTHUMG00000017984 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047629 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:38175668:38212357:1 Gene:OTTHUMG00000017991 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001izn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclin Y-like pseudogene (LOC100129055), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:38164648:38178030:1 gene:ENSG00000241125 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:38175668:38212357:1 gene:ENSG00000224761 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001izn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001izn.2 cpcScore=1.9623000 cnci=-0.3281501 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024497 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 999 (LINC00999), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xme.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC399744 (LOC399744), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447412 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:38692117:38737700:1 gene:ENSG00000225119 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047650 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:38692117:38737700:1 Gene:OTTHUMG00000017995 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410382 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:38423625:38423728:1 gene:ENSG00000222314 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045000 // RefSeq // Homo sapiens ACTR3B pseudogene 5 (ACTR3BP5), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541147 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:10:38990037:38991356:1 gene:ENSG00000227264 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ARP3 actin-related protein 3 homolog B (yeast) pseudogene 5 (ACTR3BP5), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026827 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 839 (LINC00839), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332123 // ENSEMBL // [retired] ensembl_havana_lincrna:lincRNA chromosome:GRCh37:10:42970991:42990784:1 gene:ENSG00000185904 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007394 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC84856, mRNA (cDNA clone IMAGE:3834089). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047672 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:42475543:42495336:1 Gene:OTTHUMG00000018010 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047673 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:42475628:42495336:1 Gene:OTTHUMG00000018010 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001izy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 839 (LINC00839), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xmf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 839 (LINC00839), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001izz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 839 (LINC00839), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xmf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009xmf.2 cpcScore=1.6679400 cnci=-0.2294675 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:42605158:42605263:1 gene:ENSG00000251783 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014753 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:42782801:42834937:1 gene:ENSG00000165733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043345 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:49890 IMAGE:6062924), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150252 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:166808 IMAGE:9007274), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:42782801:42834937:1 Gene:OTTHUMG00000018020 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jaj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:43341786:43341910:1 gene:ENSG00000221468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184963 // RefSeq // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4 (FXYD4), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_173160 // RefSeq // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4 (FXYD4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374451 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:43867090:43871780:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458363 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:43867090:43871781:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43371642:43376332:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC054876 // GenBank // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:62088 IMAGE:4610529), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43371642:43376332:1 Gene:OTTHUMG00000018027 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43371653:43376332:1 Gene:OTTHUMG00000018027 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43374469:43376335:1 Gene:OTTHUMG00000018027 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jaq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4 (FXYD4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090546 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:43867090:43871780:1 Gene:OTTHUMG00000018027 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010qfa.1 // UCSC Genes // Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023469 3' read HNRPF mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516723 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:43458065:43458129:1 gene:ENSG00000252532 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145312 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 485 (ZNF485), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:43606407:43617903:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43606426:43617903:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374437 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:44101855:44113035:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57580 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 485. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014161 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 485, mRNA (cDNA clone MGC:20847 IMAGE:4543606), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047719 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43606407:43617903:1 Gene:OTTHUMG00000018040 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047720 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43606426:43617903:1 Gene:OTTHUMG00000018040 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346855 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43606419:43616395:1 Gene:OTTHUMG00000018040 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43606419:43607400:1 Gene:OTTHUMG00000018040 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qfc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 485 (ZNF485), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qfd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 485 (ZNF485), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038867 // RefSeq // Homo sapiens ZNF32 antisense RNA 3 (ZNF32-AS3), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43628817:43674703:1 gene:ENSG00000223910 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047716 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43628817:43674703:1 Gene:OTTHUMG00000018037 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jba.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ZNF32 antisense RNA 3 (ZNF32-AS3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033923 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 619 (LINC00619), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43845306:43850622:1 gene:ENSG00000204187 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43845306:43850622:1 Gene:OTTHUMG00000018048 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 619 (LINC00619), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038268 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 840 (LINC00840), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43859411:43895433:1 gene:ENSG00000226808 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43859411:43895433:1 Gene:OTTHUMG00000018049 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 840 (LINC00840), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033846 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 841 (LINC00841), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43939003:43944466:1 gene:ENSG00000233395 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047736 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:43939003:43944466:1 Gene:OTTHUMG00000018053 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 841 (LINC00841), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AX747950 // NONCODE // accn=AX747950 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5094 cpcScore=-1.0511800 cnci=-0.2557048 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jbe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 841 (LINC00841), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459472 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:44034540:44034611:1 gene:ENSG00000238957 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006963 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 22 (ZNF22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:45000475:45005326:1 gene:ENSG00000165512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010642 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:9735 IMAGE:3852749), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041139 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:47687 IMAGE:5751460), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053687 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:61583 IMAGE:5214077), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:45000475:45005326:1 Gene:OTTHUMG00000018064 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jbw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 22 (ZNF22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 22 (ZNF22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033891 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B pseudogene 3 (ANKRD30BP3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:45147394:45171389:1 gene:ENSG00000243349 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK098688 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25822 fis, clone TST07893. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043208 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC338579, mRNA (cDNA clone IMAGE:5295086). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047773 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:45642842:45645173:1 Gene:OTTHUMG00000018074 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jca.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B pseudogene 3 (ANKRD30BP3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jcb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B pseudogene 3 (ANKRD30BP3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xmr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B pseudogene 3 (ANKRD30BP3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qfm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014696 // RefSeq // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (GPRIN2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46549044:46555530:-1 gene:ENSG00000204175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011672 // GenBank // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2, mRNA (cDNA clone MGC:15171 IMAGE:4300443), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047836 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:46549044:46555530:-1 Gene:OTTHUMG00000018107 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jec.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (GPRIN2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (GPRIN2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000374314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:46549049:46550744:-1 gene:ENSG00000204175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005972 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y4 (NPY4R), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:46461099:46465881:-1 gene:ENSG00000204174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46461099:46463755:-1 gene:ENSG00000204174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY649986 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 pancreatic polypeptide receptor 1 (PPYR1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096238 // GenBank // Homo sapiens pancreatic polypeptide receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:116895 IMAGE:40005502), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:46461099:46463755:-1 Gene:OTTHUMG00000018108 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jee.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y4 (NPY4R), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xna.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y4 (NPY4R), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ppu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y4 (NPY4R), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qfx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027634 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 35, member D, pseudogene (FAM35DP), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK294120 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59018 complete cds, highly similar to Protein FAM35A. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qfz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 35, member D, pseudogene (FAM35DP), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qga.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 35, member D, pseudogene (FAM35DP), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000453605 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:47556165:47566804:1 gene:ENSG00000229577 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047857 // NONCODE // accn=NULL class=Non-protein coding transcript name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000047857 cpcScore=-0.9150660 cnci=-0.0785347 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033407 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin L pseudogene 2 (CTSLP2), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jer.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cathepsin L1 pseudogene 2 (CTSL1P2), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001137548 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member C (FAM25C), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001137549 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member G (FAM25G), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001137556 // RefSeq // [retired]Homo sapiens family with sequence similarity 25, member B (FAM25B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357539 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:48247652:48252143:1 gene:ENSG00000197910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466209 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:48248922:48252143:1 gene:ENSG00000197910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146955 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182058 IMAGE:9056883), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146972 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182075 IMAGE:9056900), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147026 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182129 IMAGE:9056954), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047878 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:48247669:48252143:1 Gene:OTTHUMG00000018140 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047879 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:48248922:48252143:1 Gene:OTTHUMG00000018140 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qge.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 25, member C (FAM25C), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jga.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410474 // ENSEMBL // [retired]ncrna:rRNA chromosome:GRCh37:10:48931789:48931904:1 gene:ENSG00000222406 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000438010 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:48952569:48980343:1 gene:ENSG00000227781 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047909 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:48952569:48980343:1 Gene:OTTHUMG00000018156 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jge.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003055 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine transporter), member 3 (SLC18A3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49610301:49612720:1 gene:ENSG00000187714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007765 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:12716 IMAGE:4136084), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000047995 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:49610301:49612720:1 Gene:OTTHUMG00000018196 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jhw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine), member 3 (SLC18A3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000311663 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:51187938:51192032:1 gene:ENSG00000174196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039561 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 21, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5123514). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048027 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:10:51187938:51192032:1 Gene:OTTHUMG00000018206 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jii.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 21, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5123514). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jil.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410168 // ENSEMBL // [retired]ncrna:rRNA chromosome:GRCh37:10:51255380:51255495:1 gene:ENSG00000222100 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588224 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55336, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pqk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003631 // RefSeq // Homo sapiens poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK294819 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60508 complete cds, moderately similar to Poly(ADP-ribose) glycohydrolase (EC 3.2.1.143). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307788 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97736. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xop.2 // UCSC Genes // Homo sapiens poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qhh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ60508 complete cds, moderately similar to Poly(ADP-ribose) glycohydrolase (EC 3.2.1.143). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077665 // RefSeq // Homo sapiens ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 6 (AGAP6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:49988318:50010499:1 gene:ENSG00000204149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49988644:50010425:1 gene:ENSG00000204149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048058 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:49988644:50010425:1 Gene:OTTHUMG00000018220 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jix.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 6 (AGAP6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000048079 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:50655967:50660268:1 Gene:OTTHUMG00000018236 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:50655967:50660268:1 gene:ENSG00000231345 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079516 // RefSeq // Homo sapiens N-acylsphingosine amidohydrolase (non-lysosomal ceramidase) 2B (ASAH2B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000185907 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:10:52499696:52515125:1 gene:ENSG00000204147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:50739318:50757188:1 gene:ENSG00000204147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:50739952:50816495:1 gene:ENSG00000204147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK294369 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52679 complete cds, highly similar to Neutral ceramidase (EC 3.5.1.23). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374006 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1211:1394969:1400626:- gene:ENSG00000204147 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048082 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:50739952:50816495:1 Gene:OTTHUMG00000018239 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048083 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:50739318:50757188:1 Gene:OTTHUMG00000018239 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048084 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:50739948:50754809:1 Gene:OTTHUMG00000018239 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qhm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens N-acylsphingosine amidohydrolase (non-lysosomal ceramidase) 2B (ASAH2B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jjg.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364326 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:52852607:52852703:1 gene:ENSG00000201196 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459340 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:57327499:57327602:1 gene:ENSG00000238355 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001190478 // RefSeq // Homo sapiens MT-RNR2-like 5 (MTRNR2L5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:55599303:55600041:1 gene:ENSG00000249860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pra.1 // UCSC Genes // Homo sapiens MT-RNR2-like 5 (MTRNR2L5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001204880 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003338 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58334975:58370753:1 gene:ENSG00000072401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:58364456:58369043:1 gene:ENSG00000072401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005980 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:14673 IMAGE:4106710), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015997 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:27216 IMAGE:4305900), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048143 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58334975:58370753:1 Gene:OTTHUMG00000018269 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048144 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58364456:58369043:1 Gene:OTTHUMG00000018269 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jke.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021prc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003201 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor A, mitochondrial (TFAM), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58385434:58395288:1 gene:ENSG00000108064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:58385345:58395184:1 gene:ENSG00000108064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58385022:58399221:1 gene:ENSG00000108064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029815 // GenBank HTC // Homo sapiens transcription factor A, mitochondrial, mRNA (cDNA clone IMAGE:5170491), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126366 // GenBank // Homo sapiens transcription factor A, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:161644 IMAGE:8992082), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048145 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58385604:58394539:1 Gene:OTTHUMG00000018270 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048146 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58385022:58399221:1 Gene:OTTHUMG00000018270 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048147 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58385345:58395184:1 Gene:OTTHUMG00000018270 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:58385434:58395288:1 Gene:OTTHUMG00000018270 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jkf.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jkg.3 // UCSC Genes // --- // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027508 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 133, member C, pseudogene (FAM133CP), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qic.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 133, member C, pseudogene (FAM133CP), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qic.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010qic.1 cpcScore=0.9299430 cnci=-0.3545568 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001244638 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032199 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000279873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:61901300:62096944:1 gene:ENSG00000150347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62049211:62093064:1 gene:ENSG00000150347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296921 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60664 complete cds, highly similar to AT-rich interactive domain-containing protein5B. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048233 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:61901300:62096944:1 Gene:OTTHUMG00000018298 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048234 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:62049211:62093064:1 Gene:OTTHUMG00000018298 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jlt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jlu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qil.2 // UCSC Genes // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408345 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:61926936:61927018:-1 gene:ENSG00000221272 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408167 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:62116215:62116301:1 gene:ENSG00000221094 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032804 // RefSeq // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase (ADO), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62804857:62808483:1 gene:ENSG00000181915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018660 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:24535 IMAGE:4104391), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028589 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:27038 IMAGE:4838951), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067740 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:86991 IMAGE:5295674), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:62804857:62808483:1 Gene:OTTHUMG00000018306 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jmg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase (ADO), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:63110139:63110246:1 gene:ENSG00000199446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030759 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2 (NRBF2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000277746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:63133290:63155026:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395241 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:64893050:64913978:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63133247:63155031:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK301656 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52920 complete cds, highly similar to Nuclear receptor-binding factor 2. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011707 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:19778 IMAGE:3687848), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:63133290:63155026:1 Gene:OTTHUMG00000018309 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jmj.4 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2 (NRBF2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qip.2 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2 (NRBF2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439942 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:10:65187057:65187713:1 gene:ENSG00000235816 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027182 // RefSeq // Homo sapiens JMJD1C antisense RNA 1 (JMJD1C-AS1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qir.2 // UCSC Genes // Homo sapiens JMJD1C antisense RNA 1 (JMJD1C-AS1), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001330 // RefSeq // Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000298249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:63521363:63625123:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438249 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:65322332:65384883:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY562241 // GenBank // Homo sapiens receptor expression enhancing protein 3 (REEP3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068557 // GenBank // Homo sapiens receptor accessory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:87479 IMAGE:30339865), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373758 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2401:1235263:1282974:- gene:ENSG00000165476 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048263 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:63521363:63625123:1 Gene:OTTHUMG00000018318 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jmt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xpl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517203 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:65710060:65710144:1 gene:ENSG00000253012 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384707 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:68503152:68503259:1 gene:ENSG00000207438 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030625 // RefSeq // Homo sapiens tet methylcytosine dioxygenase 1 (TET1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545846 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:70406730:70433244:1 gene:ENSG00000138336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373644 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold34:3365988:3486526:+ gene:ENSG00000138336 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FM165197 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for TET1-MLL fusion transcript in acute lymphoblastic leukemia, patient 3811. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:68560656:68694482:1 Gene:OTTHUMG00000018359 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jok.4 // UCSC Genes // Homo sapiens tet methylcytosine dioxygenase 1 (TET1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xpw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tet methylcytosine dioxygenase 1 (TET1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516117 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:70472715:70472835:1 gene:ENSG00000251926 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408257 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68759318:68759414:1 gene:ENSG00000221184 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68846805:68846911:1 gene:ENSG00000200218 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002727 // RefSeq // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036430 // RefSeq // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69088106:69104541:1 gene:ENSG00000122862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015516 // GenBank // Homo sapiens serglycin, mRNA (cDNA clone MGC:9289 IMAGE:3883161), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022313 // GenBank // Homo sapiens serglycin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4688573). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000242465 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold34:3920482:3925417:+ gene:ENSG00000122862 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048379 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69088118:69104811:1 Gene:OTTHUMG00000018369 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048380 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69088106:69104541:1 Gene:OTTHUMG00000018369 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001joz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jpa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens serglycin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4688573). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021prx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145306 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35 (C10orf35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69630258:69633599:1 gene:ENSG00000171224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69630251:69633112:1 gene:ENSG00000171224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013587 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35, mRNA (cDNA clone MGC:9596 IMAGE:3896656), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048454 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69630258:69633599:1 Gene:OTTHUMG00000018383 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048455 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69630251:69633112:1 Gene:OTTHUMG00000018383 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048456 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69630544:69632877:1 Gene:OTTHUMG00000018383 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jpq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35 (C10orf35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000048466 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:69684899:69692452:1 Gene:OTTHUMG00000018393 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416265 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:10:71426992:71477999:1 gene:ENSG00000235645 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434931 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:69684899:69692452:1 gene:ENSG00000235645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048467 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000048467 cpcScore=0.4220620 cnci=-0.3230762 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437376 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:10:72149182:72149937:1 gene:ENSG00000224725 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004096 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 (EIF4EBP2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005057 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:12944 IMAGE:2823322), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050633 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:60113 IMAGE:5555034), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373218 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1816:162007:163181:+ gene:ENSG00000148730 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70404379:70428618:1 Gene:OTTHUMG00000018409 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 (EIF4EBP2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420338 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:10:72194585:72196314:1 gene:ENSG00000197604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014431 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase domain containing, paladin 1 (PALD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70478821:70568449:1 gene:ENSG00000107719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373214 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:72238577:72328205:1 gene:ENSG00000107719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC048195 // GenBank // Homo sapiens KIAA1274, mRNA (cDNA clone IMAGE:3946235). // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136375 // GenBank // Homo sapiens KIAA1274, mRNA (cDNA clone MGC:167985 IMAGE:9020362), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048515 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70478821:70568449:1 Gene:OTTHUMG00000018411 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatase domain containing, paladin 1 (PALD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jre.4 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatase domain containing, paladin 1 (PALD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048516 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:72299470:72326644:1 Gene:OTTHUMG00000018411 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000432960 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:10:72307689:72316552:1 gene:ENSG00000227918 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048514 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:72307689:72316552:1 Gene:OTTHUMG00000018410 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080722 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_139155 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70672803:70762441:1 gene:ENSG00000138316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70672803:70762441:1 gene:ENSG00000138316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK128469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46613 fis, clone TKIDN2011160. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048521 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70672803:70762441:1 Gene:OTTHUMG00000018414 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048522 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70672803:70762441:1 Gene:OTTHUMG00000018414 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jri.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010qjl.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003901 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate lyase 1 (SGPL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70815970:70881173:1 gene:ENSG00000166224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70815961:70820484:1 gene:ENSG00000166224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308610 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98651. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052991 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate lyase 1, mRNA (cDNA clone MGC:60255 IMAGE:6150776), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068061 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6110411, partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048533 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70815970:70881173:1 Gene:OTTHUMG00000018421 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048534 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70815961:70820484:1 Gene:OTTHUMG00000018421 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048536 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70844497:70860486:1 Gene:OTTHUMG00000018421 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048538 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:70854706:70859605:1 Gene:OTTHUMG00000018421 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate lyase 1 (SGPL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate lyase 1 (SGPL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xqk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate lyase 1 (SGPL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000454400 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:10:72577323:72577968:1 gene:ENSG00000233104 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048531 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:72577323:72577968:1 Gene:OTTHUMG00000018419 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000558852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70939133:70944144:1 gene:ENSG00000259267 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000560700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70939053:70955641:1 gene:ENSG00000259267 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001244889 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_170744 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71212570:71302864:1 gene:ENSG00000107731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71212927:71302864:1 gene:ENSG00000107731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048540 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:71212927:71302864:1 Gene:OTTHUMG00000018422 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048541 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:71212570:71302864:1 Gene:OTTHUMG00000018422 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jro.3 // UCSC Genes // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jrp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459444 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:10:73085085:73085188:1 gene:ENSG00000238918 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004273 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3 (CHST3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71964365:72013564:1 gene:ENSG00000122863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093690 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:120725 IMAGE:7939535), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048563 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:71964365:72013564:1 Gene:OTTHUMG00000018431 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jsn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3 (CHST3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363424 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72180858:72180989:1 gene:ENSG00000200294 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363300 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72220752:72220852:1 gene:ENSG00000200170 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:72391964:72392069:1 gene:ENSG00000202513 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000443299 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:10:74461207:74463097:1 gene:ENSG00000228673 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048592 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:10:74461207:74463097:1 Gene:OTTHUMG00000018442 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152635 // RefSeq // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3 (OIT3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415725 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:10:74653339:74673443:1 gene:ENSG00000138315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126440 // GenBank // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3, mRNA (cDNA clone MGC:161718 IMAGE:8992156), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334011 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3601:97701:119353:- gene:ENSG00000138315 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000048596 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:10:72893581:72933033:1 Gene:OTTHUMG00000018444 // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001jte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3 (OIT3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xqs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3 (OIT3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 0 // --- // 0