ENST00000465095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99307442:99322741:1 gene:ENSG00000241962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000330305 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:2:99923905:99939204:1 Gene:OTTHUMG00000130635 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006063 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 41 (KLHL41), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:169509702:169526262:1 gene:ENSG00000239474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:169514262:169521007:1 gene:ENSG00000239474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006534 // GenBank // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:1367 IMAGE:2959774), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000255263 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:169509702:169526262:1 Gene:OTTHUMG00000132205 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000333280 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:169514220:169514950:1 Gene:OTTHUMG00000132205 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000333281 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:169514262:169521007:1 Gene:OTTHUMG00000132205 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002ueu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch-like family member 41 (KLHL41), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153689 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 69 (C2orf69), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:199911256:199928273:1 gene:ENSG00000178074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036456 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone MGC:33409 IMAGE:4825616), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000335446 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:199911256:199928273:1 Gene:OTTHUMG00000154480 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010zhb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 69 (C2orf69), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022134 // RefSeq // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2 (GAL3ST2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000192314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241776825:241804208:1 gene:ENSG00000154252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117293 // GenBank // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150902 IMAGE:40125844), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117295 // GenBank // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150904 IMAGE:40125846), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000322792 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:241776825:241804208:1 Gene:OTTHUMG00000151473 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002wcj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2 (GAL3ST2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020905 // RefSeq // Homo sapiens retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis) (RDH14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:18554723:18560680:-1 gene:ENSG00000240857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:18555122:18560679:-1 gene:ENSG00000240857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009830 // GenBank // Homo sapiens retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis), mRNA (cDNA clone MGC:15072 IMAGE:4053893), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000207394 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:18554723:18560680:-1 Gene:OTTHUMG00000090705 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000323830 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:18555122:18560679:-1 Gene:OTTHUMG00000090705 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002rcx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis) (RDH14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006794 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75 (GPR75), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:53852913:53859989:-1 gene:ENSG00000119737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067475 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:79309 IMAGE:6971705), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067476 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:79310 IMAGE:6971810), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251403 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:53852913:53859989:-1 Gene:OTTHUMG00000129280 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002rxo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75 (GPR75), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021vhn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75 (GPR75), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000945 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 3, regulatory subunit B, alpha (PPP3R1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000234310 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68178857:68252531:-1 gene:ENSG00000221823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409377 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:68180947:68251148:-1 gene:ENSG00000221823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409752 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:68180804:68256237:-1 gene:ENSG00000221823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027913 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 3 (formerly 2B), regulatory subunit B, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:34569 IMAGE:5210939), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000326765 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:68178857:68252531:-1 Gene:OTTHUMG00000129561 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000326786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:68180804:68256237:-1 Gene:OTTHUMG00000129561 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000326787 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:68180947:68251148:-1 Gene:OTTHUMG00000129561 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002sei.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 3, regulatory subunit B, alpha (PPP3R1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152792 // RefSeq // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1 (ASPRV1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC094000 // GenBank // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:121035 IMAGE:7939845), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320256 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2739:666713:667700:+ gene:ENSG00000244617 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000334161 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:69960089:69962265:-1 Gene:OTTHUMG00000129647 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002sfz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1 (ASPRV1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_053050 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L53 (MRPL53), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:74471986:74472687:-1 gene:ENSG00000204822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012163 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L53, mRNA (cDNA clone MGC:20402 IMAGE:4622995), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000328435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:74471986:74472687:-1 Gene:OTTHUMG00000129961 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000328436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:74471993:74472664:-1 Gene:OTTHUMG00000129961 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000328437 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:74471992:74472547:-1 Gene:OTTHUMG00000129961 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002sln.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L53 (MRPL53), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016466 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 39 (ANKRD39), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96847985:96858095:-1 gene:ENSG00000213337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031303 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 39, mRNA (cDNA clone MGC:41816 IMAGE:5284947), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252951 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:96847985:96858095:-1 Gene:OTTHUMG00000130530 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002sxd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 39 (ANKRD39), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_174898 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme G-like 1 (LYG1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99284238:99301176:-1 gene:ENSG00000144214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99284257:99304742:-1 gene:ENSG00000144214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY358988 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96867 SALW1939 (UNQ1939) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029126 // GenBank // Homo sapiens lysozyme G-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:35380 IMAGE:5184582), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:99284238:99301176:-1 Gene:OTTHUMG00000130639 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000330315 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:99284257:99304742:-1 Gene:OTTHUMG00000130639 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002szy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lysozyme G-like 1 (LYG1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010yvo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens lysozyme G-like 1 (LYG1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153836 // RefSeq // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (CREG2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101382079:101387140:-1 gene:ENSG00000175874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032949 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:33323 IMAGE:4814957), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047514 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:48471 IMAGE:5276849), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324768 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold60:177880:190822:+ gene:ENSG00000175874 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253188 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:101345551:101387595:-1 Gene:OTTHUMG00000130692 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:101382079:101387140:-1 Gene:OTTHUMG00000130692 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:101382926:101387466:-1 Gene:OTTHUMG00000130692 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002tba.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (CREG2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030923 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 163 (TMEM163), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000281924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:134455759:134719000:-1 gene:ENSG00000152128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537539 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:2:135308137:135471180:-1 gene:ENSG00000152128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AL122044 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566N034 (from clone DKFZp566N034). // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026170 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 163, mRNA (cDNA clone MGC:26919 IMAGE:4837567), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254631 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:134455759:134719000:-1 Gene:OTTHUMG00000131713 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000332268 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:134455764:134470036:-1 Gene:OTTHUMG00000131713 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000332269 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:134455760:134459274:-1 Gene:OTTHUMG00000131713 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002ttx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 163 (TMEM163), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002tty.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 163 (TMEM163), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040710 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 228, member A (FAM228A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:24175103:24191698:1 gene:ENSG00000186453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050462 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 84, mRNA (cDNA clone MGC:54292 IMAGE:5744344), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000324342 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:24175103:24191698:1 Gene:OTTHUMG00000151903 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000324343 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:24183542:24200849:1 Gene:OTTHUMG00000151903 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000324344 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:24175069:24190512:1 Gene:OTTHUMG00000151903 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000324345 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:2:24175485:24190527:1 Gene:OTTHUMG00000151903 // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002rfc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 228, member A (FAM228A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK055413 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30851 fis, clone FEBRA2002908. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010eyc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 228, member A (FAM228A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517240 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:3102913:3103015:1 gene:ENSG00000253049 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411104 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:3646456:3646578:1 gene:ENSG00000223036 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003670 // RefSeq // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40 (BHLHE40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:4979116:4985323:1 gene:ENSG00000134107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK293205 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58052 complete cds, weakly similar to Class B basic helix-loop-helix protein 2. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC082238 // GenBank // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40, mRNA (cDNA clone MGC:99681 IMAGE:4860809), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000239244 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:4979116:4985323:1 Gene:OTTHUMG00000119035 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338956 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:4979437:4983268:1 Gene:OTTHUMG00000119035 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338957 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:4980232:4981610:1 Gene:OTTHUMG00000119035 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bqf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40 (BHLHE40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011asw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40 (BHLHE40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000337644 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:6490479:6736129:1 Gene:OTTHUMG00000154923 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:6490479:6736129:1 gene:ENSG00000189229 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF279782 // GenBank // Homo sapiens clone P1 NTera2D1 teratocarcinoma mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bqj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone P1 NTera2D1 teratocarcinoma mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024065 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 312 (LINC00312), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:8571782:8573875:1 gene:ENSG00000237697 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337844 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:8571782:8573875:1 Gene:OTTHUMG00000154967 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hci.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 312 (LINC00312), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hci.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hci.2 cpcScore=2.6500900 cnci=-0.2972360 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001234 // RefSeq // Homo sapiens caveolin 3 (CAV3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_033337 // RefSeq // Homo sapiens caveolin 3 (CAV3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:8733800:8746765:1 gene:ENSG00000182533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:8733836:8841808:1 gene:ENSG00000182533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069368 // GenBank // Homo sapiens caveolin 3, mRNA (cDNA clone MGC:96959 IMAGE:7262168), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC102033 // GenBank // Homo sapiens caveolin 3, mRNA (cDNA clone MGC:126129 IMAGE:40033505), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397368 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold119:1754213:1766274:- gene:ENSG00000182533 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000207008 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:8733800:8746765:1 Gene:OTTHUMG00000090519 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338030 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:8733866:8746756:1 Gene:OTTHUMG00000090519 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338031 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:8733836:8841808:1 Gene:OTTHUMG00000090519 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bra.3 // UCSC Genes // Homo sapiens caveolin 3 (CAV3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003brb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens caveolin 3 (CAV3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362945 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:8931506:8931631:1 gene:ENSG00000199815 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000432981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9216895:9218087:1 gene:ENSG00000227929 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000546112 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:9258579:9261192:1 gene:ENSG00000227929 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338116 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9216895:9218087:1 Gene:OTTHUMG00000155028 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC171813 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:198528 IMAGE:9054467, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153635 // RefSeq // Homo sapiens copine family member IX (CPNE9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9703826:9727450:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9703807:9729908:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035735 // GenBank // Homo sapiens copine family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:46340 IMAGE:5729888), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130375 // GenBank // Homo sapiens copine family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:163247 IMAGE:40146406), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250205 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9703807:9729908:1 Gene:OTTHUMG00000128418 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250538 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9703826:9727450:1 Gene:OTTHUMG00000128418 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338486 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9703833:9705033:1 Gene:OTTHUMG00000128418 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338487 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9715340:9726713:1 Gene:OTTHUMG00000128418 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bsd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens copine family member IX (CPNE9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wst.1 // UCSC Genes // Homo sapiens copine family member IX (CPNE9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bsv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36707 fis, clone UTERU2009510. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032492 // RefSeq // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila) (JAGN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9890633:9892971:1 gene:ENSG00000171135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543379 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:9932291:9935532:1 gene:ENSG00000171135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032101 // GenBank // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20680 IMAGE:4554225), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307768 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold119:817795:820205:- gene:ENSG00000171135 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250335 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9890554:9894349:1 Gene:OTTHUMG00000128523 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339180 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9890633:9892971:1 Gene:OTTHUMG00000128523 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003btt.4 // UCSC Genes // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila) (JAGN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000326237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9986911:10005244:1 gene:ENSG00000180385 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK125558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43570 fis, clone PUAEN2009852, weakly similar to Homo sapiens serine/threonine protein kinase Kp78. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bup.1 // UCSC Genes // SubName: Full=cDNA FLJ35033 fis, clone OCBBF2016590, weakly similar to CELL SURFACE ANTIGEN 114/A10; // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003buq.1 // UCSC Genes // SubName: Full=cDNA FLJ35033 fis, clone OCBBF2016590, weakly similar to CELL SURFACE ANTIGEN 114/A10; // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:10037552:10037655:1 gene:ENSG00000201182 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018462 // RefSeq // Homo sapiens BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit (BRK1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256463 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:10157376:10168601:1 gene:ENSG00000254999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000530758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10115592:10127190:1 gene:ENSG00000254999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001067 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:2529 IMAGE:2823162), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007929 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:14130 IMAGE:3688264), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339900 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10115592:10127190:1 Gene:OTTHUMG00000155400 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bvb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit (BRK1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459242 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:10175069:10175172:1 gene:ENSG00000238642 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001570 // RefSeq // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase 2 (IRAK2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10164865:10243743:1 gene:ENSG00000134070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125184 // GenBank // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150550 IMAGE:40122282), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339623 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10164865:10243743:1 Gene:OTTHUMG00000155358 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bve.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase 2 (IRAK2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410416 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_6_CTG1:33890040:33890146:-1 gene:ENSG00000277091 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000222348 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026829 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 852 (LINC00852), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10284419:10285746:1 gene:ENSG00000231177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:10284419:10285745:1 gene:ENSG00000231177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339647 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10284419:10285746:1 Gene:OTTHUMG00000155362 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hcz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 852 (LINC00852), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hcz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hcz.2 cpcScore=3.5151600 cnci=-0.2513715 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459448 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:10481963:10482025:1 gene:ENSG00000239167 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014229 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 11 (SLC6A11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454147 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:10816201:10825498:1 gene:ENSG00000132164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036083 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5313099), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254488 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3130:103489:222895:+ gene:ENSG00000132164 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251927 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10816200:10940733:1 Gene:OTTHUMG00000129718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340195 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10816201:10825498:1 Gene:OTTHUMG00000129718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340196 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10933966:10935397:1 Gene:OTTHUMG00000129718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bvy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 11 (SLC6A11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bvz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 11 (SLC6A11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003042 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 1 (SLC6A1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10992734:11017876:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536032 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:11058802:11078834:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033904 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:33804 IMAGE:5264672), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000287766 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3768:54559:67599:+ gene:ENSG00000157103 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102767 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10992724:11039247:1 Gene:OTTHUMG00000044208 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340200 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10992728:11017327:1 Gene:OTTHUMG00000044208 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340201 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10992734:11017876:1 Gene:OTTHUMG00000044208 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340202 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:11017116:11022437:1 Gene:OTTHUMG00000044208 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340203 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:11033237:11037278:1 Gene:OTTHUMG00000044208 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hdq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1 (SLC6A1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bwe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36381 fis, clone THYMU2008452. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003178 // RefSeq // Homo sapiens synapsin II (SYN2), transcript variant IIb, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_133625 // RefSeq // Homo sapiens synapsin II (SYN2), transcript variant IIa, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:12161545:12185377:1 gene:ENSG00000157152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426379 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:12045876:12232900:1 gene:ENSG00000157152 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432424 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:12045880:12227228:1 gene:ENSG00000157152 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540660 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:12045862:12232907:1 gene:ENSG00000157152 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK091286 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33967 fis, clone DFNES2000913, highly similar to Synapsin-2. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051307 // GenBank // Homo sapiens synapsin II, mRNA (cDNA clone MGC:59674 IMAGE:5802100), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synapsin II (SYN2), transcript variant IIb, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapsin II (SYN2), transcript variant IIa, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapsin II (SYN2), transcript variant IIa, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515965 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:12514706:12514807:1 gene:ENSG00000251774 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014160 // RefSeq // Homo sapiens makorin ring finger protein 2 (MKRN2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000170447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12557014:12583713:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:12557087:12582503:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448482 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:12557090:12582626:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52346 complete cds, highly similar to Makorin-2. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015715 // GenBank // Homo sapiens makorin ring finger protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:16931 IMAGE:3916199), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339679 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:12557014:12583713:1 Gene:OTTHUMG00000155371 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339680 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:12557087:12582503:1 Gene:OTTHUMG00000155371 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339681 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:12557090:12582626:1 Gene:OTTHUMG00000155371 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxd.3 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011aus.2 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458821 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:12674233:12674333:1 gene:ENSG00000239140 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000499738 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499738 cpcScore=0.6045910 cnci=-0.1902520 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027103 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 620 (LINC00620), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:13650721:13746637:1 gene:ENSG00000224514 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:13650696:13746629:1 gene:ENSG00000224514 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13650721:13746637:1 Gene:OTTHUMG00000155508 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13650696:13746629:1 Gene:OTTHUMG00000155508 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 620 (LINC00620), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021wti.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTA) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036481 // RefSeq // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 pseudogene 1 (FGD5P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502451 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:13974553:13978444:1 gene:ENSG00000250439 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359661 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13933056:13936944:1 Gene:OTTHUMG00000160207 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 pseudogene 1 (FGD5P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024334 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 43 (TMEM43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14124940:14143679:1 gene:ENSG00000170876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK074073 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00144 protein. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003125 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:3222 IMAGE:3503636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011719 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:19834 IMAGE:4079766), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252030 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:14124940:14143679:1 Gene:OTTHUMG00000129802 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340433 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:14125015:14132921:1 Gene:OTTHUMG00000129802 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 43 (TMEM43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 43 (TMEM43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014463 // RefSeq // Homo sapiens LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (LSM3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14178358:14201119:1 gene:ENSG00000170860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007055 // GenBank // Homo sapiens LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:12477 IMAGE:3828636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252078 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:14178358:14201119:1 Gene:OTTHUMG00000129838 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (LSM3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34811 fis, clone NT2NE2007052. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:14394648:14394757:1 gene:ENSG00000199609 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458917 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:15358127:15358229:1 gene:ENSG00000238891 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364292 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15339749:15339855:1 gene:ENSG00000201162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033083 // RefSeq // Homo sapiens ELL associated factor 1 (EAF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:15427355:15442613:1 gene:ENSG00000144597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432764 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:15469105:15480847:1 gene:ENSG00000144597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK304697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57288 complete cds, highly similar to ELL-associated factor 1. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041329 // GenBank // Homo sapiens ELL associated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41764 IMAGE:5284115), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252100 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:15427355:15442613:1 Gene:OTTHUMG00000162544 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343949 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:15427598:15439340:1 Gene:OTTHUMG00000162544 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bzu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ELL associated factor 1 (EAF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011avq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ELL associated factor 1 (EAF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041363 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5273212. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003can.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003can.2 cpcScore=-0.1070410 cnci=-0.3911618 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003can.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5273212. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ582763 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-32875, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42965, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458759 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:17706455:17706517:1 gene:ENSG00000239088 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:19996803:19996925:1 gene:ENSG00000201545 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003884 // RefSeq // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B (KAT2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:20040023:20154404:1 gene:ENSG00000114166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:20040698:20101113:1 gene:ENSG00000114166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060823 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:71679 IMAGE:30336561), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070075 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:87369 IMAGE:30333414), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252880 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20040023:20154404:1 Gene:OTTHUMG00000130481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340005 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20040698:20101113:1 Gene:OTTHUMG00000130481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340006 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20111594:20122795:1 Gene:OTTHUMG00000130481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340007 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20127478:20146581:1 Gene:OTTHUMG00000130481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340008 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20148240:20149010:1 Gene:OTTHUMG00000130481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cbq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B (KAT2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002311 // RefSeq // Homo sapiens VENT homeobox pseudogene 7 (VENTXP7), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ccd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ccd.2 cpcScore=1.8199000 cnci=-0.1276016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ccd.3 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408457 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:21829738:21829837:1 gene:ENSG00000221384 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:22381945:22382929:1 gene:ENSG00000132967 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384001 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:23273807:23273910:1 gene:ENSG00000206728 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039621 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 548ac (MIR548AC), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 548ac (MIR548AC), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458993 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:23767611:23767704:1 gene:ENSG00000238672 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517076 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:25377484:25377549:1 gene:ENSG00000252885 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:27513871:27514032:1 gene:ENSG00000201033 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000545084 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:27674555:27675211:1 gene:ENSG00000213846 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038840 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 693 (LINC00693), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:28574791:28758340:1 gene:ENSG00000228214 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:28576411:28757537:1 gene:ENSG00000228214 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:28576428:28757595:1 gene:ENSG00000228214 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341375 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:28574791:28758340:1 Gene:OTTHUMG00000155718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341376 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:28576411:28757537:1 Gene:OTTHUMG00000155718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:28576428:28757595:1 Gene:OTTHUMG00000155718 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wur.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 693 (LINC00693), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hfp.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hfp.2 cpcScore=1.0444200 cnci=-0.1846091 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459261 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:29011242:29011336:1 gene:ENSG00000238470 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024847 // RefSeq // Homo sapiens transforming growth factor, beta receptor II (70/80kDa) (TGFBR2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003242 // RefSeq // Homo sapiens transforming growth factor, beta receptor II (70/80kDa) (TGFBR2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:30606502:30694134:1 gene:ENSG00000163513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383765 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:30648093:30733306:1 gene:ENSG00000163513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439925 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:30656056:30733384:1 gene:ENSG00000163513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359013 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold171:320302:370782:+ gene:ENSG00000163513 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252994 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:30606502:30694134:1 Gene:OTTHUMG00000130569 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341418 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:30606601:30694142:1 Gene:OTTHUMG00000130569 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cen.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transforming growth factor, beta receptor II (70/80kDa) (TGFBR2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ceo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transforming growth factor, beta receptor II (70/80kDa) (TGFBR2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wut.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transforming growth factor, beta receptor II (70/80kDa) (TGFBR2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:31228715:31228847:1 gene:ENSG00000222983 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459297 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:31395937:31396031:1 gene:ENSG00000238727 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001137674 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 860 (ZNF860), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:31981774:31991628:1 gene:ENSG00000197385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:31981771:31988925:1 gene:ENSG00000197385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341957 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:31981774:31991628:1 Gene:OTTHUMG00000155838 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341958 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:31981771:31988925:1 Gene:OTTHUMG00000155838 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011axg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 860 (ZNF860), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wuv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 860 (ZNF860), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364831 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:32037526:32037653:1 gene:ENSG00000201701 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:32045873:32045979:1 gene:ENSG00000252398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459453 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:32214148:32214252:1 gene:ENSG00000238646 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178868 // RefSeq // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (CMTM8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32238679:32370325:1 gene:ENSG00000170293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458535 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:32238679:32370321:1 gene:ENSG00000170293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY598783 // GenBank // Homo sapiens CKLFSF8-V2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041390 // GenBank // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:43963 IMAGE:5276695), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253253 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32238679:32370325:1 Gene:OTTHUMG00000130753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342069 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32238679:32370321:1 Gene:OTTHUMG00000130753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cex.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (CMTM8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hfu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (CMTM8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385122 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:32259728:32259819:1 gene:ENSG00000207857 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001039111 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 71, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32818018:32897826:1 gene:ENSG00000206557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341565 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32818018:32897826:1 Gene:OTTHUMG00000155778 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cff.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 71, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005508 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4 (CCR4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32951574:32956349:1 gene:ENSG00000183813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069139 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:95423 IMAGE:7216998), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071751 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:88293 IMAGE:30415446), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074935 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:103884 IMAGE:30915268), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253252 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32951574:32956349:1 Gene:OTTHUMG00000130752 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cfg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4 (CCR4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wuw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4 (CCR4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:33414150:33414211:1 gene:ENSG00000252700 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458918 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:37238232:37238335:1 gene:ENSG00000238929 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410276 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37341649:37341766:1 gene:ENSG00000222208 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029499 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 26a-1 (MIR26A1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362205 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37969404:37969480:1 gene:ENSG00000199075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ayg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 26a-1 (MIR26A1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ayg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011ayg.1 cpcScore=-1.3428800 cnci=-0.2145651 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363709 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38014568:38014669:1 gene:ENSG00000200579 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004256 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 13 (SLC22A13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38265812:38278315:1 gene:ENSG00000172940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450935 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:38307397:38317819:1 gene:ENSG00000172940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298375 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61150 complete cds, highly similar to Organic-cation transporter-like 3. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035973 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:32613 IMAGE:4609915), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253746 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38265812:38278315:1 Gene:OTTHUMG00000131086 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342713 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38265906:38276328:1 Gene:OTTHUMG00000131086 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003chz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 13 (SLC22A13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011aym.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 13 (SLC22A13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ayn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 13 (SLC22A13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001106 // RefSeq // Homo sapiens activin A receptor, type IIB (ACVR2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096243 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116906 IMAGE:40005760), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096245 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116909 IMAGE:40005763), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC099642 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116908 IMAGE:40005762), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000352511 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1146:235058:241416:+ gene:ENSG00000114739 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254059 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38453851:38493142:1 Gene:OTTHUMG00000131291 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000323855 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38454319:38483373:1 Gene:OTTHUMG00000131291 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000323856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38473446:38483374:1 Gene:OTTHUMG00000131291 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cif.3 // UCSC Genes // Homo sapiens activin A receptor, type IIB (ACVR2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cig.3 // UCSC Genes // Homo sapiens activin A receptor, type IIB (ACVR2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401122 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38907314:38907389:1 gene:ENSG00000215941 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383981 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39025987:39026093:1 gene:ENSG00000206708 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000403962 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:39255684:39256163:1 gene:ENSG00000215034 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017875 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 38 (SLC25A38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39383348:39397351:1 gene:ENSG00000144659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013194 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 38, mRNA (cDNA clone MGC:8852 IMAGE:3918744), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254057 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:39383348:39397351:1 Gene:OTTHUMG00000131289 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343664 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:39383389:39391620:1 Gene:OTTHUMG00000131289 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cjo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25, member 38 (SLC25A38), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39970125:39970266:1 gene:ENSG00000201570 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005875 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1B (EIF1B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:40309684:40312424:1 gene:ENSG00000114784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006996 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:12271 IMAGE:4044439), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254177 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40309684:40312424:1 Gene:OTTHUMG00000131388 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40310628:40311672:1 Gene:OTTHUMG00000131388 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342938 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40309826:40311795:1 Gene:OTTHUMG00000131388 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342939 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40309722:40311514:1 Gene:OTTHUMG00000131388 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1B (EIF1B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408410 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41649256:41649337:1 gene:ENSG00000221337 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016305 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 2 (SS18L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000011691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:42590806:42594998:1 gene:ENSG00000008324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42581840:42595114:1 gene:ENSG00000008324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017804 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:22369 IMAGE:4658643), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254730 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42581840:42595114:1 Gene:OTTHUMG00000131794 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343433 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42591274:42594660:1 Gene:OTTHUMG00000131794 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003clk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 2 (SS18L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145166 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47 (ZBTB47), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42653684:42665854:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457842 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:42695176:42709072:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505904 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:42658814:42665854:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542870 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:42695176:42707643:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021855 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:29994 IMAGE:4943271), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343485 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42653684:42665854:1 Gene:OTTHUMG00000156207 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000368709 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42658814:42665854:1 Gene:OTTHUMG00000156207 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003clu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47 (ZBTB47), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152393 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 40 (KLHL40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452129 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:42727029:42733612:1 gene:ENSG00000157119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110491 // GenBank // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:125350 IMAGE:40007554), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000287777 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1176:1221962:1228277:- gene:ENSG00000157119 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256651 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42685519:42692544:1 Gene:OTTHUMG00000133045 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003clv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch-like family member 40 (KLHL40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516002 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:43472477:43472596:1 gene:ENSG00000251811 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:44071087:44071186:1 gene:ENSG00000252980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ592230 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-59342, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cmy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ42786 fis, clone BRAWH3006761. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145030 // RefSeq // Homo sapiens testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (TOPAZ1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309765 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold119:153497:216221:+ gene:ENSG00000173769 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:44241886:44332098:1 Gene:OTTHUMG00000156172 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cna.4 // UCSC Genes // Homo sapiens testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (TOPAZ1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500374 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500374 cpcScore=0.5153400 cnci=-0.2395284 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144638 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 42 (TMEM42), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_030290 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 564 (MIR564), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44861869:44865670:1 gene:ENSG00000169964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385049 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:44861888:44861981:1 gene:ENSG00000207783 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019851 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:29956 IMAGE:5114515), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256750 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:44861869:44865670:1 Gene:OTTHUMG00000133092 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343889 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:44861904:44865670:1 Gene:OTTHUMG00000133092 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cnz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 42 (TMEM42), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wwr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 564 (MIR564), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014240 // RefSeq // Homo sapiens LIM domains containing 1 (LIMD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45594859:45686338:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440097 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45594324:45673898:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45555394:45673506:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117236 // GenBank // Homo sapiens LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:150845 IMAGE:40125787), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117238 // GenBank // Homo sapiens LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:150847 IMAGE:40125789), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45594859:45686338:1 Gene:OTTHUMG00000133453 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345079 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45594324:45673898:1 Gene:OTTHUMG00000133453 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45665675:45674566:1 Gene:OTTHUMG00000133453 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45555394:45673506:1 Gene:OTTHUMG00000133453 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003coq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LIM domains containing 1 (LIMD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516118 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:45592255:45592327:1 gene:ENSG00000251927 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364765 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:45903187:45903298:1 gene:ENSG00000201635 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031440 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 3 (RTP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46497491:46500949:1 gene:ENSG00000163825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131756 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:156227 IMAGE:40119315), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257379 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46497491:46500949:1 Gene:OTTHUMG00000133483 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cps.1 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 3 (RTP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516158 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:46650510:46650590:1 gene:ENSG00000251967 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_147196 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46701333:46710886:1 gene:ENSG00000181585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126258 // GenBank // Homo sapiens transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:161536 IMAGE:8991974), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126260 // GenBank // Homo sapiens transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:161538 IMAGE:8991976), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313853 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46701333:46710886:1 Gene:OTTHUMG00000149909 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hjj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hjk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024046 // RefSeq // Homo sapiens neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene (NRADDP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bas.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene (NRADDP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516129 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:47130098:47130169:1 gene:ENSG00000251938 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033373 // RefSeq // Homo sapiens KIF9 antisense RNA 1 (KIF9-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:47164497:47246601:1 gene:ENSG00000227398 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344527 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:47164497:47246601:1 Gene:OTTHUMG00000156533 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cqw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens KIF9 antisense RNA 1 (KIF9-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC067356 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6384488, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cri.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6384488, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459156 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:47507839:47507938:1 gene:ENSG00000238350 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363967 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:47542573:47542672:1 gene:ENSG00000200837 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517247 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:48180328:48180389:1 gene:ENSG00000253056 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004345 // RefSeq // Homo sapiens cathelicidin antimicrobial peptide (CAMP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48223347:48225491:1 gene:ENSG00000164047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC055089 // GenBank // Homo sapiens cathelicidin antimicrobial peptide, mRNA (cDNA clone MGC:61960 IMAGE:6457987), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257501 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48223347:48225491:1 Gene:OTTHUMG00000133526 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003csj.2 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362606 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:48288587:48288694:1 gene:ENSG00000199476 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015933 // RefSeq // Homo sapiens translation machinery associated 7 homolog (S. cerevisiae) (TMA7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48440257:48444208:1 gene:ENSG00000232112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC080531 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 72, mRNA (cDNA clone MGC:99630 IMAGE:4875991), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48440257:48444208:1 Gene:OTTHUMG00000156588 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48440257:48441034:1 Gene:OTTHUMG00000156588 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344691 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48440284:48444203:1 Gene:OTTHUMG00000156588 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens translation machinery associated 7 homolog (S. cerevisiae) (TMA7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362676 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:49270132:49270239:1 gene:ENSG00000199546 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022171 // RefSeq // Homo sapiens T-cell leukemia translocation altered (TCTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49412206:49416475:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49412400:49415442:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005157 // GenBank // Homo sapiens T-cell leukemia translocation altered gene, mRNA (cDNA clone MGC:4449 IMAGE:2959904), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346208 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412212:49413426:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346209 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412417:49413133:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412206:49416475:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346211 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412391:49413272:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346212 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412365:49415265:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49412400:49415442:1 Gene:OTTHUMG00000156846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cwv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens T-cell leukemia translocation altered (TCTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003458 // RefSeq // Homo sapiens bassoon presynaptic cytomatrix protein (BSN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49554489:49671545:1 gene:ENSG00000164061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000258164 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49554489:49671545:1 Gene:OTTHUMG00000133750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000258165 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49643029:49651349:1 Gene:OTTHUMG00000133750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cxe.4 // UCSC Genes // Homo sapiens bassoon presynaptic cytomatrix protein (BSN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203370 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member A (FAM212A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49803254:49805030:1 gene:ENSG00000185614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012170 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:20416 IMAGE:4642270), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350514 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49803254:49805030:1 Gene:OTTHUMG00000158268 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cxq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member A (FAM212A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000345525 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49903882:49906240:1 Gene:OTTHUMG00000156735 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345526 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49903845:49906237:1 Gene:OTTHUMG00000156735 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345527 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49903987:49916937:1 Gene:OTTHUMG00000156735 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:49903882:49906240:1 gene:ENSG00000228008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419183 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:49903987:49916937:1 gene:ENSG00000228008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424174 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:49903845:49906237:1 gene:ENSG00000228008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:50173326:50173419:1 gene:ENSG00000207922 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153215 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000316436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50279027:50288114:1 gene:ENSG00000179564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028000 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 45, mRNA (cDNA clone MGC:40187 IMAGE:5197901), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:50279027:50288114:1 Gene:OTTHUMG00000156938 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cyz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006010 // RefSeq // Homo sapiens mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (MANF), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51385409:51389344:1 gene:ENSG00000145050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000528157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51385047:51389397:1 gene:ENSG00000145050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113588 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone MGC:142148 IMAGE:8322640), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113590 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone MGC:142150 IMAGE:8322642), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346490 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51385047:51389397:1 Gene:OTTHUMG00000156897 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346491 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51385409:51389344:1 Gene:OTTHUMG00000156897 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346492 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51385357:51389262:1 Gene:OTTHUMG00000156897 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346493 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51387688:51389149:1 Gene:OTTHUMG00000156897 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (MANF), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013286 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 15B (RBM15B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536338 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:51430156:51431826:1 gene:ENSG00000179837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540284 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:51428781:51431933:1 gene:ENSG00000179837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541145 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:51428782:51431933:1 gene:ENSG00000179837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC139836 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 15B, mRNA (cDNA clone MGC:161922 IMAGE:40123447), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323686 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold980:128822:130576:- gene:ENSG00000179837 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346489 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51391268:51397908:1 Gene:OTTHUMG00000156896 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein 15B (RBM15B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203424 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F2 (IQCF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51861638:51863424:1 gene:ENSG00000184345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51861629:51863423:1 gene:ENSG00000184345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK128883 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46915 fis, clone TESTI2014474. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040047 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F2, mRNA (cDNA clone MGC:50809 IMAGE:5742210), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346594 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51861638:51863424:1 Gene:OTTHUMG00000156914 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346595 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51861629:51863423:1 Gene:OTTHUMG00000156914 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F2 (IQCF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F2 (IQCF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080865 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62 (GPR62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000322241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51955314:51957504:1 gene:ENSG00000180929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026357 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62, mRNA (cDNA clone MGC:26943 IMAGE:4812283), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348611 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51955314:51957504:1 Gene:OTTHUMG00000157367 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dca.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62 (GPR62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001124767 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 4 (SMIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307106 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:52536602:52540525:1 gene:ENSG00000168273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476842 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:52536605:52579237:1 gene:ENSG00000168273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52536605:52541891:1 gene:ENSG00000168273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52534525:52540526:1 gene:ENSG00000168273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351920 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52536605:52541891:1 Gene:OTTHUMG00000158726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351921 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52536602:52540525:1 Gene:OTTHUMG00000158726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351923 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52534525:52540526:1 Gene:OTTHUMG00000158726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52534013:52540526:1 Gene:OTTHUMG00000158726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351968 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52536605:52579237:1 Gene:OTTHUMG00000158726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dep.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small integral membrane protein 4 (SMIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003047 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 19 (SNORD19), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52689248:52689315:1 gene:ENSG00000212493 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dfg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 19 (SNORD19), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410413 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:52691378:52691453:1 gene:ENSG00000222345 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003057 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 69 (SNORD69), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391150 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52692736:52692812:1 gene:ENSG00000212452 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dfh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 69 (SNORD69), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014041 // RefSeq // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 1 homolog (S. cerevisiae) (SPCS1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423431 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:52704955:52708157:1 gene:ENSG00000114902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000884 // GenBank // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4899 IMAGE:3462307), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000233025 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1598:770467:771642:- gene:ENSG00000114902 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337681 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52705636:52711146:1 Gene:OTTHUMG00000154930 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337682 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52706109:52707384:1 Gene:OTTHUMG00000154930 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337683 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52706143:52708019:1 Gene:OTTHUMG00000154930 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337684 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52704955:52708157:1 Gene:OTTHUMG00000154930 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bei.2 // UCSC Genes // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 1 homolog (S. cerevisiae) (SPCS1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:76234402:76234489:-1 gene:ENSG00000252504 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384175 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:53324658:53324769:1 gene:ENSG00000206902 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzj.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00019 hit found at contig region AC097015.2/149666-149777 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC065373 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6215725, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6303122, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390195 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:55686404:55686532:1 gene:ENSG00000211529 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_181727 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 12 (SPATA12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57060441:57075432:1 gene:ENSG00000186451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033337 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 12, mRNA (cDNA clone MGC:43027 IMAGE:4838903), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126274 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 12, mRNA (cDNA clone MGC:161552 IMAGE:8991990), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57060441:57075432:1 Gene:OTTHUMG00000158862 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dij.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 12 (SPATA12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 12 (SPATA12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391090 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:57493667:57493780:1 gene:ENSG00000212392 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57512450:57512555:1 gene:ENSG00000206918 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57548838:57548945:1 gene:ENSG00000206815 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_177966 // RefSeq // Homo sapiens phosphodiesterase 12 (PDE12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57556277:57566844:1 gene:ENSG00000174840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57556276:57560937:1 gene:ENSG00000174840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034978 // GenBank HTC // Homo sapiens phosphodiesterase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823249), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351440 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57556277:57566844:1 Gene:OTTHUMG00000158599 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351441 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57556276:57560937:1 Gene:OTTHUMG00000158599 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003div.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphodiesterase 12 (PDE12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003diw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphodiesterase 12 (PDE12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000388106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57619447:57619572:1 gene:ENSG00000210841 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411260 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:57685500:57685575:1 gene:ENSG00000223192 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:62814382:62814491:1 gene:ENSG00000252449 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516853 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:63334787:63334867:1 gene:ENSG00000252662 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080537 // RefSeq // Homo sapiens sentan, cilia apical structure protein (SNTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:63652668:63664721:1 gene:ENSG00000188817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496807 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:63652698:63679020:1 gene:ENSG00000188817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352093 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:63652698:63679020:1 Gene:OTTHUMG00000158766 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352094 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:63652668:63664721:1 Gene:OTTHUMG00000158766 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352095 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:63652679:63664060:1 Gene:OTTHUMG00000158766 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dlr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sentan, cilia apical structure protein (SNTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026866 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 49 (C3orf49), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:63819362:63848636:1 gene:ENSG00000163632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352067 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:63819362:63848636:1 Gene:OTTHUMG00000158761 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352068 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:63823500:63832106:1 Gene:OTTHUMG00000158761 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dls.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 49 (C3orf49), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038286 // RefSeq // Homo sapiens PSMD6 antisense RNA 2 (PSMD6-AS2), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:64004022:64012148:1 gene:ENSG00000239653 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352069 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:64011964:64016246:1 Gene:OTTHUMG00000158762 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:64004022:64012148:1 Gene:OTTHUMG00000158764 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dly.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PSMD6 antisense RNA 2 (PSMD6-AS2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:64011964:64016246:1 gene:ENSG00000243410 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391038 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:64511755:64511857:1 gene:ENSG00000212340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390806 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:68634916:68635009:1 gene:ENSG00000212095 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384212 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:70808350:70808452:1 gene:ENSG00000206939 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018971 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 27 (GPR27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71754050:71756496:1 gene:ENSG00000170837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352303 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:71754050:71756496:1 Gene:OTTHUMG00000158810 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bge.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 27 (GPR27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038221 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 870 (LINC00870), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:72152759:72172099:1 gene:ENSG00000243083 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:72151257:72174332:1 gene:ENSG00000243083 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:72152893:72172250:1 gene:ENSG00000243083 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357039 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72151257:72174332:1 Gene:OTTHUMG00000159724 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357040 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72152893:72172250:1 Gene:OTTHUMG00000159724 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357041 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72152759:72172099:1 Gene:OTTHUMG00000159724 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 870 (LINC00870), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459245 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:72622116:72622219:1 gene:ENSG00000238568 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362599 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:72576691:72576854:1 gene:ENSG00000199469 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459135 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73027808:73027873:1 gene:ENSG00000238959 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018029 // RefSeq // Homo sapiens endogenous Bornavirus-like nucleoprotein 2 (EBLN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000533473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:73061659:73063337:1 gene:ENSG00000255423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051316 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ10213, mRNA (cDNA clone MGC:59764 IMAGE:6214587), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064501 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ10213, mRNA (cDNA clone MGC:71205 IMAGE:6215884), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens endogenous Bornavirus-like nucleoprotein 2 (EBLN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458782 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:73131138:73131241:1 gene:ENSG00000238416 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411315 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73110992:73111182:1 gene:ENSG00000223247 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391283 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:74215203:74215290:1 gene:ENSG00000212585 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000393361 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:75264592:75264783:1 gene:ENSG00000213300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584669 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408675 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:75549797:75549945:1 gene:ENSG00000221602 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001124759 // RefSeq // Homo sapiens FSHD region gene 2 family, member C (FRG2C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037925 // RefSeq // Homo sapiens FSHD region gene 2 family, member C pseudogene (FLJ20518), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:75664330:75667220:1 gene:ENSG00000172969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464571 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:75664330:75667220:1 gene:ENSG00000172969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352694 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:75664330:75667220:1 Gene:OTTHUMG00000158963 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:75664330:75667220:1 Gene:OTTHUMG00000158963 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpt.4 // UCSC Genes // Homo sapiens FSHD region gene 2 family, member C pseudogene (FLJ20518), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040004 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 960 (LINC00960), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_040005 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 960 (LINC00960), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75674413:75676625:1 gene:ENSG00000242516 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352691 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:75672391:75679303:1 Gene:OTTHUMG00000158961 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352692 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:75674413:75676625:1 Gene:OTTHUMG00000158961 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC401074 (LOC401074), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC401074 (LOC401074), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpu.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dpu.2 cpcScore=-1.0269000 cnci=-0.2249665 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dpv.2 cpcScore=-1.0032100 cnci=-0.1879524 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364540 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:86125216:86125287:1 gene:ENSG00000201410 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515964 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:86235321:86235424:1 gene:ENSG00000251773 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000866 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, G protein-coupled (HTR1F), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069125 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, mRNA (cDNA clone MGC:95405 IMAGE:7216980), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319595 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold804:1557927:1559027:+ gene:ENSG00000179097 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352890 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:87990696:87993835:1 Gene:OTTHUMG00000159008 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, G protein-coupled (HTR1F), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, G protein-coupled (HTR1F), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173824 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 38 (C3orf38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:88149743:88157968:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:88150604:88153346:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485219 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:88156889:88168729:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486971 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:88149987:88156944:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024188 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 38, mRNA (cDNA clone MGC:26717 IMAGE:4824439), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:88149743:88157968:1 Gene:OTTHUMG00000155752 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341514 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:88150604:88153346:1 Gene:OTTHUMG00000155752 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353437 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:88149987:88156944:1 Gene:OTTHUMG00000155752 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353443 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:88156889:88168729:1 Gene:OTTHUMG00000155752 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 38 (C3orf38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384586 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:88431191:88431309:1 gene:ENSG00000207316 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005233 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_182644 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:89107662:89400345:1 gene:ENSG00000044524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:89107676:89479659:1 gene:ENSG00000044524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026247 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4720840, containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063282 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A3, mRNA (cDNA clone MGC:71556 IMAGE:30347891), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000336596 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold804:2901544:3038001:+ gene:ENSG00000044524 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352995 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:89107524:89482134:1 Gene:OTTHUMG00000159040 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352996 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:89107676:89479659:1 Gene:OTTHUMG00000159040 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352997 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:89107662:89400345:1 Gene:OTTHUMG00000159040 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:90184634:90184733:1 gene:ENSG00000222490 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364469 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:93967926:93968020:1 gene:ENSG00000201339 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363496 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:93977029:93977135:1 gene:ENSG00000200366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_054106 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily AC, member 2 (OR5AC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98087173:98088102:1 gene:ENSG00000196578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359116 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98087173:98088102:1 Gene:OTTHUMG00000160083 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily AC, member 2 (OR5AC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005338 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 1 (OR5H1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98132698:98133639:1 gene:ENSG00000231192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359100 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98132698:98133639:1 Gene:OTTHUMG00000160070 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 1 (OR5H1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005514 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 14 (OR5H14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437310 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98149326:98150405:1 gene:ENSG00000236032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136984 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:168599 IMAGE:9020976), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359112 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98149326:98150405:1 Gene:OTTHUMG00000160079 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dsg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 14 (OR5H14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005515 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 15 (OR5H15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98168700:98169641:1 gene:ENSG00000233412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454529 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:97887544:97888577:1 gene:ENSG00000233412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359109 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98168700:98169641:1 Gene:OTTHUMG00000160076 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 15 (OR5H15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005479 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6 (OR5H6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137523 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:169146 IMAGE:9021523), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137524 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:169147 IMAGE:9021524), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383696 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3984:590037:591011:+ gene:ENSG00000230301 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359111 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98264285:98265262:1 Gene:OTTHUMG00000160078 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dsi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6 (OR5H6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005517 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 4 (OR5K4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98353854:98354819:1 gene:ENSG00000196098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359114 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98353854:98354819:1 Gene:OTTHUMG00000160081 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 4 (OR5K4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005516 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 3 (OR5K3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98390666:98391631:1 gene:ENSG00000206536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359110 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98390666:98391631:1 Gene:OTTHUMG00000160077 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 3 (OR5K3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004736 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1 (OR5K1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98469480:98470576:1 gene:ENSG00000232382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136918 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168532 IMAGE:9020909), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136919 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168533 IMAGE:9020910), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359019 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98469480:98470576:1 Gene:OTTHUMG00000160048 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dsm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1 (OR5K1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004737 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2 (OR5K2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98497604:98498663:1 gene:ENSG00000231861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136724 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168337 IMAGE:9020714), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136725 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168338 IMAGE:9020715), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359020 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98497604:98498663:1 Gene:OTTHUMG00000160049 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2 (OR5K2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:98908459:98908564:1 gene:ENSG00000207331 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517102 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:98706231:98706293:1 gene:ENSG00000252911 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF090939 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0641 PRO0641 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dtq.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dtq.2 cpcScore=-1.1240300 cnci=-0.3839292 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dtq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens clone HQ0641 PRO0641 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028357 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 30C (TMEM30C), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028358 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 30C (TMEM30C), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429523 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:99904531:99909036:1 gene:ENSG00000235156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:100185824:100194191:1 gene:ENSG00000235156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353079 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100185824:100194191:1 Gene:OTTHUMG00000159056 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100185824:100190339:1 Gene:OTTHUMG00000159056 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dtr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 30C (TMEM30C), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085451 // RefSeq // Homo sapiens leukemia NUP98 fusion partner 1 (LNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:100401193:100456319:1 gene:ENSG00000206535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489752 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:100401611:100456301:1 gene:ENSG00000206535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126362 // GenBank // Homo sapiens leukemia NUP98 fusion partner 1, mRNA (cDNA clone MGC:161640 IMAGE:8992078), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353232 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100401193:100456319:1 Gene:OTTHUMG00000159082 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353233 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100401532:100456188:1 Gene:OTTHUMG00000159082 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353235 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100401611:100456301:1 Gene:OTTHUMG00000159082 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dtx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens leukemia NUP98 fusion partner 1 (LNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517180 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:100646121:100646197:1 gene:ENSG00000252989 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459246 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:100920676:100920779:1 gene:ENSG00000238312 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364684 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101458530:101458626:1 gene:ENSG00000201554 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459410 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:101220999:101221101:1 gene:ENSG00000238525 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036433 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 172, member B, pseudogene (FAM172BP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003duy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 172, member B, pseudogene (FAM172BP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017819 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog C (S. cerevisiae) (TRMT10C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101561862:101566446:1 gene:ENSG00000174173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035967 // GenBank // Homo sapiens RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:32567 IMAGE:4719195), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353400 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101561862:101566446:1 Gene:OTTHUMG00000159114 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353401 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101562041:101565717:1 Gene:OTTHUMG00000159114 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003duz.3 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog C (S. cerevisiae) (TRMT10C), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516539 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:101615826:101615928:1 gene:ENSG00000252348 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101647421:101647522:1 gene:ENSG00000201511 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024407 // RefSeq // Homo sapiens ZBTB11 antisense RNA 1 (ZBTB11-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536865 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:101395274:101396431:1 gene:ENSG00000256628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353704 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101676475:101679217:1 Gene:OTTHUMG00000159176 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZBTB11 antisense RNA 1 (ZBTB11-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002941 // RefSeq // Homo sapiens phosducin-like 3 pseudogene 4 (PDCL3P4), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosducin-like 3 pseudogene 4 (PDCL3P4), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dvj.2 cpcScore=3.8623000 cnci=-0.2107567 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365307 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101955077:101955185:1 gene:ENSG00000202177 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175056 // RefSeq // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1 (ZPLD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:102435033:102477657:1 gene:ENSG00000170044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:102099244:102477677:1 gene:ENSG00000170044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031261 // GenBank // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:39721 IMAGE:5273136), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143817 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052332. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306176 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold463:121946:171900:+ gene:ENSG00000170044 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353984 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:102099244:102477677:1 Gene:OTTHUMG00000159229 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354023 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:102435015:102479841:1 Gene:OTTHUMG00000159229 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354026 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:102435033:102477657:1 Gene:OTTHUMG00000159229 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1 (ZPLD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1 (ZPLD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bhg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1 (ZPLD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:103159960:103160124:1 gene:ENSG00000201922 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC070396 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6614812, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6614812, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000544164 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000544164 cpcScore=-1.0231100 cnci=-0.2551307 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363740 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:106515897:106515998:1 gene:ENSG00000200610 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363491 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:106688678:106688779:1 gene:ENSG00000200361 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028301 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 883 (LINC00883), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028302 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 883 (LINC00883), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:107240692:107248348:1 gene:ENSG00000243701 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353691 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107240692:107326964:1 Gene:OTTHUMG00000159173 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353692 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107240692:107248348:1 Gene:OTTHUMG00000159173 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353693 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107240721:107245508:1 Gene:OTTHUMG00000159173 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353694 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107240692:107326701:1 Gene:OTTHUMG00000159173 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107241022:107285664:1 Gene:OTTHUMG00000159173 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dwg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 883 (LINC00883), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hpq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 883 (LINC00883), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408062 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:107365182:107365287:1 gene:ENSG00000220989 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015394 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 636 (LINC00636), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:107883248:107928907:1 gene:ENSG00000240423 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353792 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:107883248:107928907:1 Gene:OTTHUMG00000159197 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dws.4 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 636 (LINC00636), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408797 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:108320392:108320478:1 gene:ENSG00000221724 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365509 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:108574565:108574698:1 gene:ENSG00000202379 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:109225129:109225227:1 gene:ENSG00000252889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000508178 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000508178 cpcScore=-0.9999740 cnci=-0.2869213 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516732 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:109497645:109497729:1 gene:ENSG00000252541 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364556 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:110727021:110727121:1 gene:ENSG00000201426 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xcj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34317 fis, clone FEBRA2008475. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001130064 // RefSeq // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_002045 // RefSeq // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:115623324:115721490:1 gene:ENSG00000172020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007936 // GenBank // Homo sapiens growth associated protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:14099 IMAGE:4126520), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393780 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold662:1653559:1692743:- gene:ENSG00000172020 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000258216 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:115623324:115721490:1 Gene:OTTHUMG00000133758 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000258217 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:115623510:115721490:1 Gene:OTTHUMG00000133758 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:117544205:117544311:1 gene:ENSG00000206889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383994 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:120210320:120210421:1 gene:ENSG00000206721 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012659 // RefSeq // Homo sapiens arginine-fifty homeobox (ARGFX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:121570704:121586634:1 gene:ENSG00000186103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355096 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:121570704:121586634:1 Gene:OTTHUMG00000159395 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eef.3 // UCSC Genes // Homo sapiens arginine-fifty homeobox (ARGFX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459366 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:121310141:121310241:1 gene:ENSG00000238670 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000388 // RefSeq // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001178065 // RefSeq // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296154 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:121973009:122004134:1 gene:ENSG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:122183683:122285365:1 gene:ENSG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122184334:122286503:1 gene:ENSG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104999 // GenBank // Homo sapiens calcium-sensing receptor, mRNA (cDNA clone MGC:132659 IMAGE:8144002), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122183683:122285365:1 Gene:OTTHUMG00000159491 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122184334:122286503:1 Gene:OTTHUMG00000159491 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122254331:122257638:1 Gene:OTTHUMG00000159491 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eev.4 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eew.4 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408547 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:122281853:122281922:1 gene:ENSG00000221474 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005213 // RefSeq // Homo sapiens cystatin A (stefin A) (CSTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122325244:122341972:1 gene:ENSG00000121552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479204 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:122325262:122338270:1 gene:ENSG00000121552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010379 // GenBank // Homo sapiens cystatin A (stefin A), mRNA (cDNA clone MGC:13552 IMAGE:4063525), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355751 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122325244:122341972:1 Gene:OTTHUMG00000159488 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355752 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122325262:122338270:1 Gene:OTTHUMG00000159488 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eex.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cystatin A (stefin A) (CSTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459192 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:122469219:122469322:1 gene:ENSG00000238480 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032839 // RefSeq // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2 (DIRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK075158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90677 fis, clone PLACE1005725. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033738 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5179427), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039821 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA (cDNA clone MGC:48709 IMAGE:6062886), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000261038 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1862:114082:212052:+ gene:ENSG00000138463 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356180 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122794795:122881139:1 Gene:OTTHUMG00000159553 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:122795084:122879748:1 Gene:OTTHUMG00000159553 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003efw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2 (DIRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hrl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2 (DIRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hrm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2 (DIRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024618 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100129550 (LOC100129550), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hrn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100129550 (LOC100129550), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384275 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:123814077:123814207:1 gene:ENSG00000207002 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:124407691:124407783:1 gene:ENSG00000252751 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:125388934:125388997:1 gene:ENSG00000252953 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458897 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:125164905:125165007:1 gene:ENSG00000238992 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364930 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:125516979:125517086:1 gene:ENSG00000201800 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024250 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member J, pseudogene (FAM86JP), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024251 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member J, pseudogene (FAM86JP), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125916630:125930024:1 gene:ENSG00000171084 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eid.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member J, pseudogene (FAM86JP), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eif.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member J, pseudogene (FAM86JP), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152889 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (CHST13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126524283:126543291:1 gene:ENSG00000180767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383575 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:126243176:126261254:1 gene:ENSG00000180767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103895 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:119278 IMAGE:40005100), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103896 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:119279 IMAGE:40005101), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370201 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126524283:126543291:1 Gene:OTTHUMG00000162721 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eja.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (CHST13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034158 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa pseudogene 1 (NUP210P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126662081:126671939:1 gene:ENSG00000198284 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eje.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleoporin 210kDa pseudogene 1 (NUP210P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000398112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:127193131:127198185:1 gene:ENSG00000214324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137154 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:168774 IMAGE:9021151), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137155 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:168775 IMAGE:9021152), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:127193131:127198185:1 Gene:OTTHUMG00000159593 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eji.1 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative uncharacterized protein C3orf56; // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015720 // RefSeq // Homo sapiens podocalyxin-like 2 (PODXL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302192 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:127348024:127391614:1 gene:ENSG00000114631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:127629181:127672809:1 gene:ENSG00000114631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019330 // GenBank // Homo sapiens podocalyxin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:851 IMAGE:3502164), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052585 // GenBank // Homo sapiens podocalyxin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:59786 IMAGE:6264322), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356638 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:127629181:127672809:1 Gene:OTTHUMG00000159642 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ejq.2 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408486 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:127664704:127664810:1 gene:ENSG00000221413 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021937 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (EEFSEC), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128153454:128408646:1 gene:ENSG00000132394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483457 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:128153501:128408642:1 gene:ENSG00000132394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128336904:128341788:1 gene:ENSG00000132394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007933 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:14173 IMAGE:4120858), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356738 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128153454:128408646:1 Gene:OTTHUMG00000159659 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356940 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128153501:128408642:1 Gene:OTTHUMG00000159659 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356941 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128336904:128341788:1 Gene:OTTHUMG00000159659 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356942 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128153668:128341508:1 Gene:OTTHUMG00000159659 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eki.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (EEFSEC), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037890 // RefSeq // Homo sapiens DNAJB8 antisense RNA 1 (DNAJB8-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128463594:128472317:1 gene:ENSG00000242049 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356923 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128463594:128472317:1 Gene:OTTHUMG00000159687 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DNAJB8 antisense RNA 1 (DNAJB8-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026954 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC90246 (LOC90246), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bkp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC90246 (LOC90246), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bkp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bkp.1 cpcScore=0.2270730 cnci=-0.2494346 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583119 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50231, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eku.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eku.1 cpcScore=-1.3839900 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eku.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42114, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ598665 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-36731, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43203, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ570601 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-30713, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekw.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ekw.1 cpcScore=-1.2947100 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30713, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579267 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47379, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40464, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ572301 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-40413, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eky.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40413, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576681 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44793, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44791, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024768 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand and coiled-coil domain containing 1 (EFCC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:129001629:129040742:1 gene:ENSG00000114654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093800 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 48, mRNA (cDNA clone MGC:120835 IMAGE:7939645), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480450 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold383:45400:49114:+ gene:ENSG00000114654 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352832 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129001629:129040742:1 Gene:OTTHUMG00000158996 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129030449:129040740:1 Gene:OTTHUMG00000158996 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bkt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens EF-hand and coiled-coil domain containing 1 (EFCC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000174 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet) (GP9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129060767:129062406:1 gene:ENSG00000169704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030229 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet), mRNA (cDNA clone MGC:34594 IMAGE:5226377), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129060767:129062406:1 Gene:OTTHUMG00000159944 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003elm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet) (GP9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xdn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet) (GP9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516626 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:128792139:128792241:1 gene:ENSG00000252435 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459112 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:128792938:128793045:1 gene:ENSG00000238874 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000539 // RefSeq // Homo sapiens rhodopsin (RHO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129528640:129535169:1 gene:ENSG00000163914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112104 // GenBank // Homo sapiens rhodopsin, mRNA (cDNA clone MGC:138309 IMAGE:8327572), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356101 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129528640:129535169:1 Gene:OTTHUMG00000159542 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens rhodopsin (RHO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153833 // RefSeq // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1FOO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129543214:129551361:1 gene:ENSG00000178804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:129548386:129551467:1 gene:ENSG00000178804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047943 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific, mRNA (cDNA clone MGC:50807 IMAGE:5742122), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356100 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129543214:129551361:1 Gene:OTTHUMG00000159541 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356122 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129548386:129551467:1 Gene:OTTHUMG00000159541 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1FOO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1FOO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365542 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:129818932:129819033:1 gene:ENSG00000202412 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:129819777:129819876:1 gene:ENSG00000252786 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037893 // RefSeq // Homo sapiens TMCC1 antisense RNA 1 (head to head) (TMCC1-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003enb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100507032 (LOC100507032), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003enb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003enb.1 cpcScore=1.2500100 cnci=-0.3083315 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007117 // RefSeq // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone (TRH), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129974305:129977938:1 gene:ENSG00000170893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507066 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:129974688:129977935:1 gene:ENSG00000170893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069375 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:97018 IMAGE:7262227), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074888 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:103862 IMAGE:30915244), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110515 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:125964 IMAGE:40031770), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356592 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129974305:129977938:1 Gene:OTTHUMG00000159634 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356593 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129974688:129977935:1 Gene:OTTHUMG00000159634 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003enc.3 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136152 // RefSeq // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like 2 (ALG1L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:130081961:130098390:1 gene:ENSG00000251287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bld.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like 2 (ALG1L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127756 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40127789. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hth.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like 2 (ALG1L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408343 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:129902366:129902466:1 gene:ENSG00000221270 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027898 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 4 pseudogene 2 (COL6A4P2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:130214230:130245843:1 gene:ENSG00000228252 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011blf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 4 pseudogene 2 (COL6A4P2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011blf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011blf.1 cpcScore=3.4817400 cnci=-0.2748424 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002949 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027766 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:131361898:131365122:1 gene:ENSG00000246082 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eod.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eoe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eod.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eod.2 cpcScore=2.4053700 cnci=-0.2417679 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459132 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:131999462:131999522:1 gene:ENSG00000238701 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016557 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 4 (ACKR4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178445 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 4 (ACKR4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000249887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:132597237:132602215:1 gene:ENSG00000129048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424114 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:132316081:132320456:1 gene:ENSG00000129048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069438 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor-like 1, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:97099 IMAGE:7262320), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357238 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:132597237:132602215:1 Gene:OTTHUMG00000159768 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358320 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:132601388:132618967:1 Gene:OTTHUMG00000159768 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eow.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor-like 1 (CCRL1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eox.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor-like 1 (CCRL1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364957 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:133551186:133551315:1 gene:ENSG00000201827 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516832 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:133664926:133665034:1 gene:ENSG00000252641 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021203 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle receptor, B subunit (SRPRB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:133784033:133821492:1 gene:ENSG00000144867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063001 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle receptor, B subunit, mRNA (cDNA clone MGC:74809 IMAGE:5185997), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065299 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle receptor, B subunit, mRNA (cDNA clone MGC:74810 IMAGE:6146939), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133784033:133821492:1 Gene:OTTHUMG00000159753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357171 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133810262:133819909:1 Gene:OTTHUMG00000159753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357172 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133805615:133807774:1 Gene:OTTHUMG00000159753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357173 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133806553:133819603:1 Gene:OTTHUMG00000159753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357174 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133811124:133825772:1 Gene:OTTHUMG00000159753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003epx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens signal recognition particle receptor, B subunit (SRPRB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408386 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:134410044:134410140:-1 gene:ENSG00000221313 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363973 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:136307051:136307153:1 gene:ENSG00000200843 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515899 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:136351990:136352048:1 gene:ENSG00000251708 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003erk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33936 fis, clone CTONG2017939. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003erl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33936 fis, clone CTONG2017939. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026783 // RefSeq // Homo sapiens blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis, candidate 1 (non-protein coding) (BPESC1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139104185:139125171:1 gene:ENSG00000232416 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280431 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:139104185:139125171:1 Gene:OTTHUMG00000141266 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eta.3 // UCSC Genes // Homo sapiens blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis, candidate 1 (non-protein coding) (BPESC1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eta.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eta.2 cpcScore=3.0175600 cnci=-0.2318360 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516436 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:139388277:139388364:1 gene:ENSG00000252245 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022131 // RefSeq // Homo sapiens calsyntenin 2 (CLSTN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:139935185:140577397:1 gene:ENSG00000158258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK096432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39113 fis, clone NTONG2005897, highly similar to Calsyntenin-2 precursor. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103496 // GenBank // Homo sapiens calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119559 IMAGE:40008317), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103506 // GenBank // Homo sapiens calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119561 IMAGE:40008319), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359393 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:139935185:140577397:1 Gene:OTTHUMG00000160139 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359396 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:139935187:140557055:1 Gene:OTTHUMG00000160139 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003etm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens calsyntenin 2 (CLSTN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003etn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens calsyntenin 2 (CLSTN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152616 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 42 (TRIM42), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130472 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:163344 IMAGE:40146503), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130474 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:163346 IMAGE:40146505), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286349 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2958:94232:120963:+ gene:ENSG00000155890 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359531 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:140678039:140701150:1 Gene:OTTHUMG00000160170 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eto.2 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 42 (TRIM42), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080862 // RefSeq // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (SPSB4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507895 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:141077446:141147460:1 gene:ENSG00000175093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK056147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31585 fis, clone NT2RI2002179. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008324 // GenBank // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:15766 IMAGE:3501702), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310546 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2853:266914:340842:+ gene:ENSG00000175093 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359727 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:141051402:141148611:1 Gene:OTTHUMG00000160223 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359729 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:141066638:141148610:1 Gene:OTTHUMG00000160223 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359730 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:141077446:141147460:1 Gene:OTTHUMG00000160223 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:141076960:141080373:1 Gene:OTTHUMG00000160223 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ett.3 // UCSC Genes // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (SPSB4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hum.3 // UCSC Genes // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (SPSB4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_139209 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 7 (GRK7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:141778148:141818490:1 gene:ENSG00000114124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353168 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:141778148:141818490:1 Gene:OTTHUMG00000159068 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bnd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 7 (GRK7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383877 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142145454:142145555:1 gene:ENSG00000206604 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515978 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142801207:142801268:1 gene:ENSG00000251787 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000538741 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:142895127:142897307:1 gene:ENSG00000244171 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410418 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:145615074:145615160:1 gene:ENSG00000222350 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000422482 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:145782358:145784156:1 gene:ENSG00000232013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:146571477:146571583:1 gene:ENSG00000199812 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408530 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:148080833:148080922:-1 gene:ENSG00000221457 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036538 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC646903 (LOC646903), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC646903 (LOC646903), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024066 // RefSeq // Homo sapiens CLRN1 antisense RNA 1 (CLRN1-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:150972678:151079830:1 gene:ENSG00000239265 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:150852484:151080726:1 gene:ENSG00000239265 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK126442 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44478 fis, clone UTERU2031834. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150852484:151080726:1 Gene:OTTHUMG00000159846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357696 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150972678:151079830:1 Gene:OTTHUMG00000159846 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CLRN1 antisense RNA 1 (CLRN1-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bny.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CLRN1 antisense RNA 1 (CLRN1-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410147 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:150635484:150635582:1 gene:ENSG00000222079 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410901 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:151634350:151634463:1 gene:ENSG00000222833 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207365 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2 (AADACL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065724 // GenBank // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:72001 IMAGE:6663150), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX647585 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313M1119 (from clone DKFZp313M1119). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356517 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2318:587684:614074:- gene:ENSG00000197953 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342288 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151733927:151757766:1 Gene:OTTHUMG00000155914 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342289 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151733916:151761339:1 Gene:OTTHUMG00000155914 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ezc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2 (AADACL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hvn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2 (AADACL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033050 // RefSeq // Homo sapiens succinate receptor 1 (SUCNR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151873643:151884619:1 gene:ENSG00000198829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030948 // GenBank // Homo sapiens succinate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:32514 IMAGE:4594810), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357897 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151873643:151884619:1 Gene:OTTHUMG00000159880 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ezf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate receptor 1 (SUCNR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364347 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:152449272:152449384:1 gene:ENSG00000201217 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002563 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 1 (P2RY1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:152834693:152838051:1 gene:ENSG00000169860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074784 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 1, mRNA (cDNA clone MGC:103950 IMAGE:30915343), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356943 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:152834693:152838051:1 Gene:OTTHUMG00000159694 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ezq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 1 (P2RY1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002886 // RefSeq // Homo sapiens RAP2B, member of RAS oncogene family (RAP2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012362 // GenBank // Homo sapiens RAP2B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:20484 IMAGE:4650072), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323534 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold349:96309:96854:- gene:ENSG00000181467 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356707 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:153162270:153167173:1 Gene:OTTHUMG00000159655 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ezr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAP2B, member of RAS oncogene family (RAP2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001101337 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 79 (C3orf79), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:153484495:153502697:1 gene:ENSG00000237787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356570 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:153484495:153502697:1 Gene:OTTHUMG00000159629 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ezt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 79 (C3orf79), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363292 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:153607377:153607479:1 gene:ENSG00000200162 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458835 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:154047505:154047608:1 gene:ENSG00000238636 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364908 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:157153548:157153640:1 gene:ENSG00000201778 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001168214 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 80 (C3orf80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:160225636:160228212:1 gene:ENSG00000180044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352646 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:160225797:160228054:1 Gene:OTTHUMG00000158950 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xgp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 80 (C3orf80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:160225797:160228054:1 gene:ENSG00000180044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:antisense gene:ENSG00000244078 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029663 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 15b (MIR15B), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385045 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160404588:160404685:1 gene:ENSG00000207779 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011boz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 15b (MIR15B), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029525 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 16-2 (MIR16-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362117 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160404745:160404825:1 gene:ENSG00000198987 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fdk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 16-2 (MIR16-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fdk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fdk.2 cpcScore=-1.3157100 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000468527 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:160565447:160568199:1 gene:ENSG00000229320 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125159 // GenBank // Homo sapiens keratin 8 pseudogene 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:40121068). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fdp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens keratin 8 pseudogene 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:40121068). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384356 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:160696929:160697060:1 gene:ENSG00000207084 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408828 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:164059129:164059238:1 gene:ENSG00000221755 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000454471 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:166408976:166409503:1 gene:ENSG00000224962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401103 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:167025413:167025499:1 gene:ENSG00000215922 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000407723 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:166783553:166784113:1 gene:ENSG00000220343 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_021485 // RefSeq // Homo sapiens EGF-like and EMI domain containing 1, pseudogene (EGFEM1P), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:168807553:168830599:1 gene:ENSG00000206120 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF086185 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZC30F08. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105690 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 50, mRNA (cDNA clone IMAGE:40023176). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ffg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EGF-like and EMI domain containing 1, pseudogene (EGFEM1P), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ffh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens EGF-like and EMI domain containing 1, pseudogene (EGFEM1P), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bph.2 // UCSC Genes // Homo sapiens EGF-like and EMI domain containing 1, pseudogene (EGFEM1P), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410425 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:168475198:168475388:1 gene:ENSG00000222357 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xhc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon AAC) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080460 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (LRRIQ4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:169821922:169837775:1 gene:ENSG00000188306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000378698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169821922:169837775:1 Gene:OTTHUMG00000164420 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fgb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (LRRIQ4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182610 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7 (SAMD7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169911572:169939175:1 gene:ENSG00000187033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117339 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:150948 IMAGE:40125890), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143909 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052427. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX648534 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A2095 (from clone DKFZp686A2095). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335556 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2554:331281:347150:+ gene:ENSG00000187033 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351959 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169911572:169939175:1 Gene:OTTHUMG00000158730 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351960 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169911572:169939175:1 Gene:OTTHUMG00000158730 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351961 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169915411:169938587:1 Gene:OTTHUMG00000158730 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fgd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7 (SAMD7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fge.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7 (SAMD7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7 (SAMD7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364472 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:170057301:170057429:1 gene:ENSG00000201342 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:170149845:170149951:1 gene:ENSG00000199536 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516281 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:169878723:169878784:1 gene:ENSG00000252090 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363248 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:170244782:170244881:1 gene:ENSG00000200118 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xhf.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458788 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:171411001:171411104:1 gene:ENSG00000238359 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000366261 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:3:172034218:172039513:1 gene:ENSG00000203443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459353 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:175457059:175457164:1 gene:ENSG00000238779 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364582 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:175767558:175767661:1 gene:ENSG00000201452 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500519 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500519 cpcScore=-1.2035500 cnci=-0.3546409 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363746 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:179097731:179097840:1 gene:ENSG00000200616 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006218 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit alpha (PIK3CA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179148523:179240093:1 gene:ENSG00000121879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113601 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:142161 IMAGE:8322653), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113603 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:142163 IMAGE:8322655), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348409 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179148523:179240093:1 Gene:OTTHUMG00000157311 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348478 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179148114:179198888:1 Gene:OTTHUMG00000157311 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348479 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179149527:179199179:1 Gene:OTTHUMG00000157311 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348480 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179219551:179226017:1 Gene:OTTHUMG00000157311 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fjk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit alpha (PIK3CA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364940 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:180542701:180542836:1 gene:ENSG00000201810 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363116 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:180581057:180581163:1 gene:ENSG00000199986 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xhz.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003106 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 2 (SOX2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431565 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:181429714:181431102:1 gene:ENSG00000181449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013923 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 2, mRNA (cDNA clone MGC:2413 IMAGE:2823424), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000325404 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold31:115469:116098:+ gene:ENSG00000181449 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350419 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:181711924:181714436:1 Gene:OTTHUMG00000158222 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fkx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 2 (SOX2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571917 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-40029, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fkz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fkz.2 cpcScore=-1.1160400 cnci=-0.2992960 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fkz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I1925 (from clone DKFZp686I1925). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038301 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 888 (LINC00888), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038302 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 888 (LINC00888), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183447608:183456013:1 gene:ENSG00000240024 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003flq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 888 (LINC00888), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xid.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 888 (LINC00888), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364359 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183451857:183451988:1 gene:ENSG00000201229 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517283 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183452567:183452764:1 gene:ENSG00000253092 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362493 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183453814:183453944:1 gene:ENSG00000199363 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515921 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183454128:183454262:1 gene:ENSG00000251730 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445165 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:183884924:183887994:1 gene:ENSG00000234371 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_130770 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3C, ionotropic (HTR3C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184053047:184060671:1 gene:ENSG00000178084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131799 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3, family member C, mRNA (cDNA clone MGC:156912 IMAGE:40069671), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346296 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:184053047:184060671:1 Gene:OTTHUMG00000156862 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fmk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3C, ionotropic (HTR3C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003055 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 66 (SNORD66), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:184325696:184325771:1 gene:ENSG00000212158 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fnz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 66 (SNORD66), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fnz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fnz.2 cpcScore=-1.2544200 cnci=-0.6378292 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038990 // RefSeq // Homo sapiens EHHADH antisense RNA 1 (EHHADH-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185162901:185191955:1 gene:ENSG00000223358 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185162871:185180583:1 gene:ENSG00000223358 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345324 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:185162901:185191955:1 Gene:OTTHUMG00000156697 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:185162871:185180583:1 Gene:OTTHUMG00000156697 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fpe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EHHADH antisense RNA 1 (EHHADH-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459417 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:185160007:185160107:1 gene:ENSG00000239146 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033752 // RefSeq // Homo sapiens NmrA-like family domain containing 1 pseudogene (LOC344887), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hyo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens NmrA-like family domain containing 1 pseudogene (LOC344887), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185959943:185980872:1 gene:ENSG00000171658 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hyo.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hyo.1 cpcScore=2.4304200 cnci=-0.1913307 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000538831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:186596976:186597203:1 gene:ENSG00000090520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001622 // RefSeq // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein (AHSG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273784 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:186613066:186621300:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186612923:186621318:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541510 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:186330712:186338980:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56822 complete cds, highly similar to Alpha-2-HS-glycoprotein precursor. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC048198 // GenBank // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:52261 IMAGE:5798874), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052590 // GenBank // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:59866 IMAGE:6300060), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186612923:186621318:1 Gene:OTTHUMG00000156605 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186613066:186621300:1 Gene:OTTHUMG00000156605 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186613085:186617989:1 Gene:OTTHUMG00000156605 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fqj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein (AHSG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fqk.4 // UCSC Genes // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein (AHSG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000468154 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:186660216:186666181:1 gene:ENSG00000113905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344678 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186660216:186666181:1 Gene:OTTHUMG00000156578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000412 // RefSeq // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein (HRG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186665952:186678240:1 gene:ENSG00000113905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069574 // GenBank // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:97078 IMAGE:7262290), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150591 // GenBank // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:183501 IMAGE:9056961), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344655 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186665952:186678240:1 Gene:OTTHUMG00000156578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344656 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186668978:186678231:1 Gene:OTTHUMG00000156578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fqq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein (HRG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153708 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 1 (RTP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065202 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:70423 IMAGE:5179096), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000312295 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2410:24928:27671:- gene:ENSG00000175077 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187197486:187201465:1 Gene:OTTHUMG00000149886 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003frg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 1 (RTP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX648496 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P1863 (from clone DKFZp686P1863). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541007 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000541007 cpcScore=0.6460940 cnci=-0.2549968 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xin.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P1863 (from clone DKFZp686P1863). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022147 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 4 (RTP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000259030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187368332:187372076:1 gene:ENSG00000136514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013161 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:21535 IMAGE:3919961), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344260 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187368332:187372076:1 Gene:OTTHUMG00000156459 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003frm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 4 (RTP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:187423315:187423419:1 gene:ENSG00000239093 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024413 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC401105 (FLJ42393), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392468 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:187896331:187898598:1 gene:ENSG00000213132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC401105 (FLJ42393), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516924 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:190143656:190143743:1 gene:ENSG00000252733 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024343 // RefSeq // Homo sapiens small ILF3/NF90-associated RNA I (SNAR-I), small nuclear RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small ILF3/NF90-associated RNA I (SNAR-I), small nuclear RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198184 // RefSeq // Homo sapiens osteocrin (OSTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191212533:191250121:1 gene:ENSG00000188729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445281 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:191199241:191265615:1 gene:ENSG00000188729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128106 // GenBank // Homo sapiens osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:149188 IMAGE:40112103), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128107 // GenBank // Homo sapiens osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:149189 IMAGE:40112104), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343350 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191212533:191250121:1 Gene:OTTHUMG00000156190 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343351 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191199241:191265615:1 Gene:OTTHUMG00000156190 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens osteocrin (OSTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_174908 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178335 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191329077:191398670:1 gene:ENSG00000152492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065004 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:70346 IMAGE:6049272), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392456 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold725:944532:986989:+ gene:ENSG00000152492 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343315 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191329077:191398670:1 Gene:OTTHUMG00000156177 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343316 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191329085:191392175:1 Gene:OTTHUMG00000156177 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191361103:191370281:1 Gene:OTTHUMG00000156177 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fsv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fsw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001083308 // RefSeq // Homo sapiens pyrin domain containing 2 (PYDC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000518817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191461163:191461456:1 gene:ENSG00000253548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343231 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:191461163:191461456:1 Gene:OTTHUMG00000156167 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bso.2 // UCSC Genes // Homo sapiens pyrin domain containing 2 (PYDC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:169923460:169923514:-1 gene:ENSG00000216020 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408058 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:43073549:43073661:1 gene:ENSG00000266136 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026877 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein MGC2889 (MGC2889), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ftb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized protein MGC2889 (MGC2889), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384640 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:193624189:193624301:1 gene:ENSG00000207370 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005524 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 1 (HES1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194136145:194138732:1 gene:ENSG00000114315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300482 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57168 complete cds, moderately similar to Transcription factor HES-1. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039152 // GenBank // Homo sapiens hairy and enhancer of split 1, (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:21078 IMAGE:4749611), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342632 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194136145:194138732:1 Gene:OTTHUMG00000155984 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342633 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194136148:194137284:1 Gene:OTTHUMG00000155984 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ftq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy and enhancer of split 1, (Drosophila) (HES1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bst.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy and enhancer of split 1, (Drosophila) (HES1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033929 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 884 (LINC00884), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194487454:194518279:1 gene:ENSG00000233058 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK091527 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34208 fis, clone FCBBF3020232. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342809 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194487454:194518279:1 Gene:OTTHUMG00000156037 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342810 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194497959:194510647:1 Gene:OTTHUMG00000156037 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fua.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 884 (LINC00884), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xja.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 884 (LINC00884), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153690 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A (FAM43A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039689 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:29738 IMAGE:4906944), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064989 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:71447 IMAGE:5423287), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329759 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3253:554074:555254:+ gene:ENSG00000185112 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194686544:194689037:1 Gene:OTTHUMG00000156016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fuj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A (FAM43A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383873 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:195214787:195214893:1 gene:ENSG00000206600 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516365 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196072819:196072880:1 gene:ENSG00000252174 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034088 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 885 (LINC00885), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196142636:196160890:1 gene:ENSG00000224652 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144580 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053110. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC151150 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:168946 IMAGE:9021323, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341345 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196142636:196160890:1 Gene:OTTHUMG00000155713 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bts.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 885 (LINC00885), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011btt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 885 (LINC00885), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bts.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bts.1 cpcScore=4.0777600 cnci=-0.1732648 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000442941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196431385:196432530:1 gene:ENSG00000225822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341173 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196431385:196432530:1 Gene:OTTHUMG00000155674 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fwo.1 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative uncharacterized protein FLJ35645; // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024388 // RefSeq // Homo sapiens NCBP2 antisense RNA 2 (head to head) (NCBP2-AS2), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fxg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NCBP2 antisense RNA 2 (head to head) (NCBP2-AS2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040733 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5244300, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011buh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011buh.1 cpcScore=-1.0514000 cnci=-0.1713532 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xjv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ46075 fis, clone TESTI2001985. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362436 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:197894507:197894613:1 gene:ENSG00000199306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:282689:282792:-1 gene:ENSG00000252017 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004428 // RefSeq // Homo sapiens eosinophil granule ontogeny transcript (non-protein coding) (EGOT), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:4749192:4751590:-1 gene:ENSG00000235947 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343583 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:4749192:4751590:-1 Gene:OTTHUMG00000156235 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bqd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens eosinophil granule ontogeny transcript (non-protein coding) (EGOT), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459040 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:4920283:4920386:-1 gene:ENSG00000239126 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384553 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:5086178:5086279:-1 gene:ENSG00000207283 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198560 // RefSeq // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like 4 (LHFPL4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000287585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9498361:9553802:-1 gene:ENSG00000156959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9550612:9552307:-1 gene:ENSG00000156959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338298 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9498361:9553802:-1 Gene:OTTHUMG00000155066 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338300 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9550612:9552307:-1 Gene:OTTHUMG00000155066 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000338301 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9552572:9553795:-1 Gene:OTTHUMG00000155066 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bry.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like 4 (LHFPL4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391025 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:9919051:9919153:-1 gene:ENSG00000212327 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207351 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411976 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:9948580:9952390:-1 gene:ENSG00000163704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9945542:9952394:-1 gene:ENSG00000163704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY358158 // GenBank // Homo sapiens clone DNA145558 ASSP5823 (UNQ5823) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040508 // GenBank // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:33990 IMAGE:5300209), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC089447 // GenBank // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:105134 IMAGE:30563721), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339322 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9945542:9952394:-1 Gene:OTTHUMG00000155285 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339324 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9945542:9952374:-1 Gene:OTTHUMG00000155285 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9948580:9952390:-1 Gene:OTTHUMG00000155285 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003buk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bul.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bum.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003buu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector c pseudogene (CIDECP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wsx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ38802 fis, clone LIVER2005512. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027102 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 606 (LINC00606), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10759484:10764192:-1 gene:ENSG00000226567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10761706:10764181:-1 gene:ENSG00000226567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340198 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10759484:10764192:-1 Gene:OTTHUMG00000155455 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:10761706:10764181:-1 Gene:OTTHUMG00000155455 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bvx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 606 (LINC00606), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583118 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50230, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bwk.1 cpcScore=-1.3832300 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42114, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003256 // RefSeq // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 4 (TIMP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010553 // GenBank // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 4, mRNA (cDNA clone MGC:17099 IMAGE:4154090), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000287814 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold414:498448:503231:+ gene:ENSG00000157150 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251978 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:12153051:12159351:-1 Gene:OTTHUMG00000129763 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bwo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 4 (TIMP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515968 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:12543122:12543203:-1 gene:ENSG00000251777 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363244 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:12511095:12511213:-1 gene:ENSG00000200114 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195279 // RefSeq // Homo sapiens MKRN2 opposite strand (MKRN2OS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens MKRN2 antisense RNA 1 (C3orf83), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000447550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:12553768:12561020:-1 gene:ENSG00000225526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339669 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:12553768:12561020:-1 Gene:OTTHUMG00000155368 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ577646 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-45758, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxo.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bxo.2 cpcScore=-1.5025300 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-45758, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583118 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50230, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42114, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579436 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47548, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47548, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575652 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43764, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43764, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574002 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42114, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42114, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575653 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43765, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43764, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587889 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55001, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bxr.1 cpcScore=-1.4604100 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bxr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53025, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587809 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54921, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-48860, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ581328 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-49440, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wth.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-49440, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408341 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:13738060:13738131:-1 gene:ENSG00000238827 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004625 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7A (WNT7A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000285018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:13816258:13880121:-1 gene:ENSG00000154764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497808 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:13874946:13877220:-1 gene:ENSG00000154764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008811 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7A, mRNA (cDNA clone MGC:10346 IMAGE:3949579), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252031 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13816258:13880121:-1 Gene:OTTHUMG00000129803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340426 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13874946:13877220:-1 Gene:OTTHUMG00000129803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340427 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:13863668:13875113:-1 Gene:OTTHUMG00000129803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bye.1 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7A (WNT7A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000525575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14272373:14303845:-1 gene:ENSG00000255021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000502417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14348451:14352568:-1 gene:ENSG00000251576 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:14530982:14531088:-1 gene:ENSG00000207163 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408497 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:15134383:15134530:-1 gene:ENSG00000221424 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027927 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 4 pseudogene 1 (COL6A4P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:15165275:15205959:-1 gene:ENSG00000230524 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FN394065 // GenBank // Homo sapiens mRNA for truncated collagen type VI alpha 4 precursor (COL6A4 gene), cell line HEK293. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hel.1 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 4 pseudogene 1 (COL6A4P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011avo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 4 pseudogene 1 (COL6A4P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516276 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:15278507:15278600:-1 gene:ENSG00000252085 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384199 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15433110:15433216:-1 gene:ENSG00000206926 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ592427 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-59539, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59539, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001190811 // RefSeq // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001351 // RefSeq // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16586792:16605499:-1 gene:ENSG00000092345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027595 // GenBank // Homo sapiens deleted in azoospermia-like, mRNA (cDNA clone MGC:26406 IMAGE:4829381), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000250863 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3277:74133:87152:+ gene:ENSG00000092345 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000347261 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:16586792:16605499:-1 Gene:OTTHUMG00000157050 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000347262 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:16586792:16604790:-1 Gene:OTTHUMG00000157050 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000347389 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:16596750:16670306:-1 Gene:OTTHUMG00000157050 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cba.3 // UCSC Genes // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cbb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517167 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:17135650:17135722:-1 gene:ENSG00000252976 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021wtt.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon GCA) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001252657 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027694 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000389050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:19985380:20012330:-1 gene:ENSG00000183977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK058178 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25449 fis, clone TST08763. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:19985380:20012330:-1 Gene:OTTHUMG00000155393 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339834 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:19979961:20012267:-1 Gene:OTTHUMG00000155393 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339835 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:20000975:20012257:-1 Gene:OTTHUMG00000155393 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cbp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hez.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wtw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516633 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:20234274:20234366:-1 gene:ENSG00000252442 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362707 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:20268965:20269070:-1 gene:ENSG00000199577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:20507644:20507756:-1 gene:ENSG00000206807 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408732 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:21138263:21138341:-1 gene:ENSG00000221659 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516497 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:21388533:21388617:-1 gene:ENSG00000252306 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408579 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:23399500:23399569:-1 gene:ENSG00000221506 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:23613661:23613759:-1 gene:ENSG00000252562 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390967 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:23641489:23641592:-1 gene:ENSG00000212269 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026834 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 691 (LINC00691), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:24096269:24103223:-1 gene:ENSG00000224074 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341065 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:24099974:24103238:-1 Gene:OTTHUMG00000155662 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341066 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:24096269:24103223:-1 Gene:OTTHUMG00000155662 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ccv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 691 (LINC00691), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341064 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:24099975:24103247:-1 Gene:OTTHUMG00000155662 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ccu.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ccu.3 cpcScore=2.4046600 cnci=-0.3361145 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365092 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:25352284:25352392:-1 gene:ENSG00000201962 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458900 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:25597034:25597097:-1 gene:ENSG00000238944 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408511 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:26753937:26754076:-1 gene:ENSG00000221438 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384521 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:27265580:27265683:-1 gene:ENSG00000207251 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408646 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:27362566:27362658:-1 gene:ENSG00000221573 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391229 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:27547757:27547858:-1 gene:ENSG00000238912 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003cej.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33651 fis, clone BRAMY2024535. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401350 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:29369337:29369421:-1 gene:ENSG00000216169 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363057 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:30304320:30304536:-1 gene:ENSG00000199927 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017801 // RefSeq // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6 (CMTM6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000205636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32481312:32503408:-1 gene:ENSG00000091317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002797 // GenBank // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:3456 IMAGE:3633497), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32481312:32503408:-1 Gene:OTTHUMG00000130747 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342110 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32483739:32488381:-1 Gene:OTTHUMG00000130747 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342111 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:32487733:32502796:-1 Gene:OTTHUMG00000130747 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cfa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6 (CMTM6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015551 // RefSeq // Homo sapiens sushi domain containing 5 (SUSD5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:33150042:33219215:-1 gene:ENSG00000173705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:33150042:33219215:-1 Gene:OTTHUMG00000155829 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341903 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:33153710:33218793:-1 Gene:OTTHUMG00000155829 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cfo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sushi domain containing 5 (SUSD5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391140 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:35256840:35256946:-1 gene:ENSG00000212442 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033403 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin-like kinase 3 (DCLK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:36712422:36739861:-1 gene:ENSG00000163673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498047 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:36718093:36729795:-1 gene:ENSG00000163673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341727 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:36712422:36739861:-1 Gene:OTTHUMG00000155805 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341728 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:36718093:36729795:-1 Gene:OTTHUMG00000155805 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cgi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens doublecortin-like kinase 3 (DCLK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000424886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:36768725:36784167:-1 gene:ENSG00000230067 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341724 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:36768725:36784167:-1 Gene:OTTHUMG00000155803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000387446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:36968191:36968316:-1 gene:ENSG00000210181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014805 // RefSeq // Homo sapiens EPM2A (laforin) interacting protein 1 (EPM2AIP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064696 // GenBank // Homo sapiens EPM2A (laforin) interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:71663 IMAGE:30345499), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000322716 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold351:391865:393691:+ gene:ENSG00000178567 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cgk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EPM2A (laforin) interacting protein 1 (EPM2AIP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383918 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:37093133:37093234:-1 gene:ENSG00000206645 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37573151:37573213:-1 gene:ENSG00000239105 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362644 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:38303773:38303879:-1 gene:ENSG00000199514 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028389 // RefSeq // Homo sapiens ACVR2B antisense RNA 1 (ACVR2B-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38451027:38454820:-1 gene:ENSG00000229589 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38451027:38454820:-1 Gene:OTTHUMG00000156031 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cie.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ACVR2B antisense RNA 1 (ACVR2B-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384781 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38505480:38505581:-1 gene:ENSG00000207512 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006514 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (SCN10A), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38696802:38794010:-1 gene:ENSG00000185313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000109745 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:38696802:38794010:-1 Gene:OTTHUMG00000048245 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ciq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (SCN10A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410787 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38800296:38800394:-1 gene:ENSG00000222719 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033027 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (CSRNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39141855:39153575:-1 gene:ENSG00000144655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318290 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:39184546:39195102:-1 gene:ENSG00000144655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:39142338:39154562:-1 gene:ENSG00000144655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB063301 // GenBank // Homo sapiens TAIP-3 mRNA for TGF-beta induced apotosis protein 3, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038949 // GenBank // Homo sapiens AXIN1 up-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:47534 IMAGE:5547938), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254061 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:39141855:39153575:-1 Gene:OTTHUMG00000131293 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342527 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:39142338:39154562:-1 Gene:OTTHUMG00000131293 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cjg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (CSRNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cjh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (CSRNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033965 // RefSeq // Homo sapiens EIF1B antisense RNA 1 (EIF1B-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EIF1B antisense RNA 1 (EIF1B-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ckb.2 cpcScore=-1.1185700 cnci=-0.2393310 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040100 // RefSeq // Homo sapiens ENTPD3 antisense RNA 1 (ENTPD3-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:40390951:40453305:-1 gene:ENSG00000223797 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035465 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein FLJ36665, mRNA (cDNA clone IMAGE:4478746). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342935 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40390951:40453305:-1 Gene:OTTHUMG00000156074 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342936 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40313802:40453186:-1 Gene:OTTHUMG00000156074 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343147 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40446343:40453329:-1 Gene:OTTHUMG00000156074 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:40391850:40453180:-1 Gene:OTTHUMG00000156074 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cke.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ENTPD3 antisense RNA 1 (ENTPD3-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein FLJ36665, mRNA (cDNA clone IMAGE:4478906), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ckf.2 cpcScore=-0.8993700 cnci=-0.2750701 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363036 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:40498891:40499003:-1 gene:ENSG00000199906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516600 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41687868:41688033:-1 gene:ENSG00000252409 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516177 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41868998:41869095:-1 gene:ENSG00000251986 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000377407 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:3:41915024:41916531:-1 gene:ENSG00000204772 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343547 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:3:41915024:41916531:-1 Gene:OTTHUMG00000156220 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390843 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41899111:41899253:-1 gene:ENSG00000212145 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459012 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:42422146:42422238:-1 gene:ENSG00000239181 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401194 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:42469210:42469304:-1 gene:ENSG00000216013 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437102 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:42856005:42875898:-1 gene:ENSG00000180432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067434 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:79261 IMAGE:7002161), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344172 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42856005:42875898:-1 Gene:OTTHUMG00000133047 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410399 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:43210741:43210871:-1 gene:ENSG00000222331 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459037 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:44793015:44793105:-1 gene:ENSG00000238958 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:45034474:45034588:-1 gene:ENSG00000252410 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022842 // RefSeq // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178181 // RefSeq // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45110216:45146422:-1 gene:ENSG00000163814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45112337:45139595:-1 gene:ENSG00000163814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296129 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1372:547706:577034:- gene:ENSG00000163814 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256748 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45082278:45146422:-1 Gene:OTTHUMG00000133090 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343581 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45110216:45146422:-1 Gene:OTTHUMG00000133090 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343582 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45112337:45139595:-1 Gene:OTTHUMG00000133090 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003com.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003con.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015444 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) (TMEM158), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45224466:45226278:-1 gene:ENSG00000249992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC057390 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 158, mRNA (cDNA clone MGC:57838 IMAGE:6175193), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360190 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45224466:45226278:-1 Gene:OTTHUMG00000160317 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011baf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) (TMEM158), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365398 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:45255409:45255620:-1 gene:ENSG00000202268 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024513 // RefSeq // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1 (FYCO1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45917904:45995815:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438446 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:45921585:45958661:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:45917899:45995824:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101468 // GenBank // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126517 IMAGE:8068974), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143368 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:176890 IMAGE:9051873, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257320 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45917904:45995815:-1 Gene:OTTHUMG00000133447 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344603 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45917904:45958572:-1 Gene:OTTHUMG00000133447 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344605 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45984581:45995824:-1 Gene:OTTHUMG00000133447 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45921585:45958661:-1 Gene:OTTHUMG00000133447 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bal.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1 (FYCO1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cpb.4 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001295 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 (CCR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46201709:46208396:-1 gene:ENSG00000163823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051306 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:59862 IMAGE:5485097), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064991 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:71247 IMAGE:5483554), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46201709:46208396:-1 Gene:OTTHUMG00000133451 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cph.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 (CCR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wwy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 (CCR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024512 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2 (LRRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46515423:46566550:-1 gene:ENSG00000163827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496388 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:46545151:46566524:-1 gene:ENSG00000163827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029118 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:34065 IMAGE:5183639), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296144 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold134:778552:804354:- gene:ENSG00000163827 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257375 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46515423:46566550:-1 Gene:OTTHUMG00000133479 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344225 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46518349:46580099:-1 Gene:OTTHUMG00000133479 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344226 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46545151:46566524:-1 Gene:OTTHUMG00000133479 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344227 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46551108:46566234:-1 Gene:OTTHUMG00000133479 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cpu.4 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2 (LRRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hji.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2 (LRRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000258 // RefSeq // Homo sapiens myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow (MYL3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000292327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46857872:46863483:-1 gene:ENSG00000160808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46857872:46863442:-1 gene:ENSG00000160808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009790 // GenBank // Homo sapiens myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow, mRNA (cDNA clone MGC:13575 IMAGE:4292684), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257482 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46857872:46863483:-1 Gene:OTTHUMG00000133516 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000259165 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46857872:46863442:-1 Gene:OTTHUMG00000133516 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344362 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46860979:46882169:-1 Gene:OTTHUMG00000133516 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cql.1 // UCSC Genes // Homo sapiens myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow (MYL3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459492 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:47250523:47250626:-1 gene:ENSG00000239128 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000398957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:47601715:47604677:-1 gene:ENSG00000214773 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362721 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:47931808:47931914:-1 gene:ENSG00000199591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080525 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (putative) (SPINK8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48306842:48328341:-1 gene:ENSG00000229453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346123 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48306842:48328341:-1 Gene:OTTHUMG00000156832 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003csq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (putative) (SPINK8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:48316360:48316459:-1 gene:ENSG00000252466 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_031756 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 711 (MIR711), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000390201 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:48578902:48578977:-1 gene:ENSG00000211535 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ctz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VII, alpha 1 (COL7A1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 711 (MIR711), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001123040 // RefSeq // Homo sapiens ariadne homolog 2 opposite strand (ARIH2OS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48917788:48919385:-1 gene:ENSG00000221883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48917788:48919385:-1 Gene:OTTHUMG00000156672 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hkk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ariadne homolog 2 opposite strand (ARIH2OS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198880 // RefSeq // Homo sapiens glutamine-rich 1 (QRICH1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hkq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glutamine-rich 1 (QRICH1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glutamine-rich 1 (QRICH1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004405 // RefSeq // Homo sapiens laminin, beta 2 pseudogene 1 (LAMB2P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hkr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens laminin, beta 2 pseudogene 1 (LAMB2P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hkr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hkr.2 cpcScore=1.5406200 cnci=-0.2013663 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022903 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71 (CCDC71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49162535:49166321:-1 gene:ENSG00000177352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035516 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71, mRNA (cDNA clone MGC:34190 IMAGE:5229681), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345980 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49162535:49166321:-1 Gene:OTTHUMG00000156815 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cwg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71 (CCDC71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71 (CCDC71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080528 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 84 (C3orf84), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432035 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:49177636:49191822:-1 gene:ENSG00000236980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49177636:49190024:-1 gene:ENSG00000236980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49177632:49191858:-1 gene:ENSG00000236980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345985 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49177636:49190024:-1 Gene:OTTHUMG00000156816 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345986 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49177632:49191858:-1 Gene:OTTHUMG00000156816 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC646498 (LOC646498), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:49467115:49467228:-1 gene:ENSG00000201301 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038866 // RefSeq // Homo sapiens BSN antisense RNA 2 (head to head) (BSN-AS2), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49549306:49554366:-1 gene:ENSG00000226913 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346412 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49549306:49554366:-1 Gene:OTTHUMG00000156881 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49551295:49554340:-1 Gene:OTTHUMG00000156881 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cxd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens BSN antisense RNA 2 (head to head) (BSN-AS2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007024 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 115 (TMEM115), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000266025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50354749:50359610:-1 gene:ENSG00000126062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011948 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:18285 IMAGE:4178931), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017367 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:1238 IMAGE:3010216), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000102784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:50354749:50359610:-1 Gene:OTTHUMG00000044212 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dan.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 115 (TMEM115), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013324 // RefSeq // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145071 // RefSeq // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000348721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50606522:50611831:-1 gene:ENSG00000114737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031590 // GenBank // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:34375 IMAGE:5182644), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064354 // GenBank // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:75431 IMAGE:4804249), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443053 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold980:500736:501597:+ gene:ENSG00000114737 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:50606522:50611831:-1 Gene:OTTHUMG00000156853 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346246 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:50606496:50611772:-1 Gene:OTTHUMG00000156853 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:50606490:50611761:-1 Gene:OTTHUMG00000156853 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dax.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hlq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001171904 // RefSeq // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_014703 // RefSeq // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:51397842:51483838:-1 gene:ENSG00000145041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK023239 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13177 fis, clone NT2RP3003870, highly similar to Homo sapiens Vpr-binding protein (VprBP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022792 // GenBank // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:23092 IMAGE:4853730), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110371 // GenBank // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:102804 IMAGE:5547856), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346488 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51395867:51499994:-1 Gene:OTTHUMG00000156895 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000369828 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:3:51433298:51467664:-1 Gene:OTTHUMG00000156895 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wys.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:51611438:51611562:-1 gene:ENSG00000221015 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364725 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:51694465:51694582:-1 gene:ENSG00000201595 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001143833 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F6 (IQCF6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51778561:51779187:-1 gene:ENSG00000214686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wyv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F6 (IQCF6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bdv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F6 (IQCF6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152397 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F1 (IQCF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51894876:51903335:-1 gene:ENSG00000173389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535733 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:51843797:51937386:-1 gene:ENSG00000173389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029595 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F1, mRNA (cDNA clone MGC:39725 IMAGE:5273825), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034228 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5266078), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346568 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51894876:51903335:-1 Gene:OTTHUMG00000156908 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346570 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51894876:51903335:-1 Gene:OTTHUMG00000156908 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F1 (IQCF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbq.4 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004704 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (RRP9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51933430:51941941:-1 gene:ENSG00000114767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001113 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:1474 IMAGE:3050186), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009879 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:16472 IMAGE:3954043), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023662 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:29699 IMAGE:4898690), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346637 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:51933430:51941941:-1 Gene:OTTHUMG00000156930 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dbw.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001947 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7 (DUSP7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296483 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:52082939:52090461:-1 gene:ENSG00000164086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:52048919:52056550:-1 gene:ENSG00000164086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104880 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7, mRNA (cDNA clone MGC:132540 IMAGE:8143883), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128064 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40019369. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000349697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52048919:52056550:-1 Gene:OTTHUMG00000157819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000349698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52051632:52056165:-1 Gene:OTTHUMG00000157819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dct.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7 (DUSP7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hma.2 // UCSC Genes // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7 (DUSP7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027331 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 696 (LINC00696), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541313 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:52097076:52097567:-1 gene:ENSG00000256097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hmb.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029660 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7g (MIRLET7G), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52268267:52268377:-1 gene:ENSG00000199150 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bee.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA let-7g (MIRLET7G), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bee.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bee.1 cpcScore=-1.2642100 cnci=-0.3945158 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020163 // RefSeq // Homo sapiens sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3G (SEMA3G), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000231721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52433053:52445027:-1 gene:ENSG00000010319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098104 // GenBank // Homo sapiens sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3G, mRNA (cDNA clone MGC:119470 IMAGE:40007797), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52433053:52445027:-1 Gene:OTTHUMG00000158570 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351355 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52441865:52445085:-1 Gene:OTTHUMG00000158570 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351356 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:52440390:52444969:-1 Gene:OTTHUMG00000158570 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dea.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3G (SEMA3G), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516959 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52551846:52551943:-1 gene:ENSG00000252768 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX746575 // NONCODE // accn=AX746575 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1801 cpcScore=1.0278300 cnci=-0.1936019 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dfw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33368 fis, clone BRACE2005787. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458956 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:53317216:53317319:-1 gene:ENSG00000238565 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018403 // RefSeq // Homo sapiens decapping mRNA 1A (DCP1A), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294241 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:53287370:53347525:-1 gene:ENSG00000272886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000162290 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480258 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:53317448:53381637:-1 gene:ENSG00000162290 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494659 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:53321388:53381552:-1 gene:ENSG00000162290 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295205 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53884 complete cds, highly similar to mRNA decapping enzyme 1A (EC 3.-.-.-). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007439 // GenBank // Homo sapiens DCP1 decapping enzyme homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4252 IMAGE:3029175), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350374 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53283428:53347610:-1 Gene:OTTHUMG00000158193 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350476 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53287370:53347525:-1 Gene:OTTHUMG00000158193 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens decapping mRNA 1A (DCP1A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens decapping mRNA 1A (DCP1A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384381 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:53333060:53333128:-1 gene:ENSG00000207109 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516178 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:53530322:53530401:-1 gene:ENSG00000251987 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018397 // RefSeq // Homo sapiens choline dehydrogenase (CHDH), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53812335:53846390:-1 gene:ENSG00000016391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034502 // GenBank // Homo sapiens choline dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:26969 IMAGE:4824572), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53812335:53846390:-1 Gene:OTTHUMG00000158281 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350568 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53823631:53844769:-1 Gene:OTTHUMG00000158281 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350569 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53823544:53844617:-1 Gene:OTTHUMG00000158281 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dgz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens choline dehydrogenase (CHDH), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021237 // RefSeq // Homo sapiens selenoprotein K (SELK), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:53888395:53891885:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53884410:53891988:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:53885200:53891962:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013162 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein K, mRNA (cDNA clone MGC:17057 IMAGE:4345594), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351659 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53884410:53891988:-1 Gene:OTTHUMG00000158656 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351660 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53888395:53891885:-1 Gene:OTTHUMG00000158656 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351661 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53887996:53891855:-1 Gene:OTTHUMG00000158656 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351662 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:53885301:53891865:-1 Gene:OTTHUMG00000158656 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens selenoprotein K (SELK), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027122 // RefSeq // Homo sapiens embryonic stem cell related (non-protein coding) (ESRG), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens embryonic stem cell related (non-protein coding) (ESRG), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dhj.2 cpcScore=1.4096900 cnci=-0.1942580 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020678 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1 (LRTM1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:54918237:54928074:-1 gene:ENSG00000144771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:54918333:54967088:-1 gene:ENSG00000144771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040732 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:50257 IMAGE:5223743), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074741 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:103818 IMAGE:30915199), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351399 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:54918237:54928074:-1 Gene:OTTHUMG00000158578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351400 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:54918333:54967088:-1 Gene:OTTHUMG00000158578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1 (LRTM1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024615 // RefSeq // Homo sapiens ERC2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (ERC2-IT1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ERC2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (ERC2-IT1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dhs.2 cpcScore=4.1975200 cnci=-0.2454127 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003865 // RefSeq // Homo sapiens HESX homeobox 1 (HESX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57197843:57199987:-1 gene:ENSG00000163666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473921 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57197916:57199938:-1 gene:ENSG00000163666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069515 // GenBank // Homo sapiens HESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:96906 IMAGE:7262115), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093979 // GenBank // Homo sapiens HESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:121014 IMAGE:7939824), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351430 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57197843:57199987:-1 Gene:OTTHUMG00000158597 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351431 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57197916:57199938:-1 Gene:OTTHUMG00000158597 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003din.4 // UCSC Genes // Homo sapiens HESX homeobox 1 (HESX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001142733 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_130387 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000389601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57268351:57292682:-1 gene:ENSG00000239388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438870 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:57302379:57326710:-1 gene:ENSG00000239388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114953 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:138537 IMAGE:40004208), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487349 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1351:1949407:1962665:+ gene:ENSG00000239388 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351447 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57268347:57292682:-1 Gene:OTTHUMG00000158602 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000368599 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:57276550:57278952:-1 Gene:OTTHUMG00000158602 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dip.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003diq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459308 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:57455872:57455977:-1 gene:ENSG00000238905 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57536252:57536358:-1 gene:ENSG00000202428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF156973 // GenBank // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma down-regulated protein (NPCDRG) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dkz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma-related protein (NPCR) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dkz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dkz.2 cpcScore=3.0547300 cnci=-0.3341499 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516611 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:61739127:61739229:-1 gene:ENSG00000252420 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516375 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:62118300:62118510:-1 gene:ENSG00000252184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026582 // RefSeq // [retired] Homo sapiens inhibitor of DNA binding 2B, dominant negative helix-loop-helix protein (pseudogene) (ID2B), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bfh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bfh.1 cpcScore=1.6423300 cnci=-0.2776299 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bfh.2 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018008 // RefSeq // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2 (FEZF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000283268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:62369684:62373515:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:62369692:62373015:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:62369681:62374324:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF332890 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger FEZL (FKSG36) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022464 // GenBank // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:26179 IMAGE:4794121), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351813 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:62369684:62373515:-1 Gene:OTTHUMG00000158705 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:62369692:62373015:-1 Gene:OTTHUMG00000158705 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351816 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:62369681:62374324:-1 Gene:OTTHUMG00000158705 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dlh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2 (FEZF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dli.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2 (FEZF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000542336 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000542336 cpcScore=-1.0560600 cnci=-0.3185949 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000443346 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:63785986:63827445:-1 gene:ENSG00000224479 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:64071807:64072019:-1 gene:ENSG00000200222 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033978 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 994 (LINC00994), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:64078361:64087363:-1 gene:ENSG00000189196 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352220 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:64078361:64087363:-1 Gene:OTTHUMG00000158790 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wzz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100287879 (LOC100287879), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:66003839:66003940:-1 gene:ENSG00000202071 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384032 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:66293114:66293220:-1 gene:ENSG00000206759 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005527 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_182522 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:68731766:68932610:-1 gene:ENSG00000163377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031566 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4, mRNA (cDNA clone MGC:35479 IMAGE:5195201), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352002 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:68731766:68932610:-1 Gene:OTTHUMG00000158744 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352003 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:68752916:68932568:-1 Gene:OTTHUMG00000158744 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xag.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xah.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198271 // RefSeq // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:69106872:69122566:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69108724:69123032:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69108672:69122595:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54332 complete cds, highly similar to Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121019 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal), mRNA (cDNA clone MGC:149678 IMAGE:40117347), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352138 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:69106872:69122566:-1 Gene:OTTHUMG00000158774 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352139 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:69108672:69122595:-1 Gene:OTTHUMG00000158774 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352141 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:69108724:69123032:-1 Gene:OTTHUMG00000158774 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dns.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dnt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410683 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:70251643:70251745:-1 gene:ENSG00000222615 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408455 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:70878660:70878792:-1 gene:ENSG00000221382 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000498714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:71570255:71574457:-1 gene:ENSG00000242094 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK025793 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22140 fis, clone HEP20977. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352242 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:71570255:71574457:-1 Gene:OTTHUMG00000158796 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dou.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ12191 fis, clone MAMMA1000843. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dou.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dou.2 cpcScore=-1.1177300 cnci=-0.3934870 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001126128 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_021935 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71772101:71785061:-1 gene:ENSG00000163421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000353065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71771656:71785206:-1 gene:ENSG00000163421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069395 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:97442 IMAGE:7262718), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098162 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119784 IMAGE:40014096), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352301 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:71771656:71785206:-1 Gene:OTTHUMG00000158809 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352302 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:71772101:71785061:-1 Gene:OTTHUMG00000158809 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003doz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpa.4 // UCSC Genes // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390781 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:72262322:72262428:-1 gene:ENSG00000212070 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012234 // RefSeq // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein (RYBP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:72371825:72446918:-1 gene:ENSG00000163602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014959 // GenBank // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:23015 IMAGE:4902201), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036459 // GenBank // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:33492 IMAGE:4813939), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72371825:72446918:-1 Gene:OTTHUMG00000159190 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein (RYBP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410906 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:72691705:72691811:-1 gene:ENSG00000222838 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516842 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73092148:73092257:-1 gene:ENSG00000252651 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73241789:73241896:-1 gene:ENSG00000252937 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459279 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73593940:73594002:-1 gene:ENSG00000239119 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020872 // RefSeq // Homo sapiens contactin 3 (plasmacytoma associated) (CNTN3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:74262568:74521140:-1 gene:ENSG00000113805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:74264385:74267539:-1 gene:ENSG00000113805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150608 // GenBank // Homo sapiens contactin 3 (plasmacytoma associated), mRNA (cDNA clone MGC:183518 IMAGE:9056978), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352306 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:74262568:74521140:-1 Gene:OTTHUMG00000158813 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352307 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:74264385:74267539:-1 Gene:OTTHUMG00000158813 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens contactin 3 (plasmacytoma associated) (CNTN3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024241 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000459803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75421566:75435048:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043342 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5548009). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068011 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6168872, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068108 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4642458. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpr.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dps.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410951 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:75964980:75965069:-1 gene:ENSG00000222883 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390815 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:76417896:76417980:-1 gene:ENSG00000212104 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:77811741:77811844:-1 gene:ENSG00000206891 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401297 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:79584592:79584684:-1 gene:ENSG00000216116 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408453 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:84290112:84290253:-1 gene:ENSG00000221380 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000306 // RefSeq // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant alpha, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001122757 // RefSeq // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant beta, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:87259741:87276504:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000350375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:87259404:87276587:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000560656 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:87259897:87276462:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352827 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:87259404:87276587:-1 Gene:OTTHUMG00000158992 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352828 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:87259741:87276504:-1 Gene:OTTHUMG00000158992 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant alpha, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hoj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant beta, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:87742543:87742649:-1 gene:ENSG00000200703 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517253 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:93817351:93817410:-1 gene:ENSG00000253062 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbl.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00066 hit found at contig region AC130896.3/7653-7712 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000494840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:95654423:95683193:-1 gene:ENSG00000244681 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dro.1 // UCSC Genes // Homo sapiens methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene (LOC100287639), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408550 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:96166813:96166904:-1 gene:ENSG00000221477 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401317 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:114019651:114019752:1 gene:ENSG00000216136 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362416 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:96608814:96608917:-1 gene:ENSG00000199286 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390742 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:96666194:96666279:-1 gene:ENSG00000212031 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105580 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (GABRR3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR749263 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781O1955 (from clone DKFZp781O1955). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472788 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3984:406339:452735:- gene:ENSG00000183185 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (GABRR3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (GABRR3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:98804978:98805084:-1 gene:ENSG00000206712 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_031662 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 548g (MIR548G), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 548g (MIR548G), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459442 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:99940365:99940436:-1 gene:ENSG00000238377 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014820 // RefSeq // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae) (TOMM70A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544924 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:100084238:100120283:-1 gene:ENSG00000154174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003633 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:3766 IMAGE:3605218), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052994 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:60332 IMAGE:5549394), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284320 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2297:925669:949879:+ gene:ENSG00000154174 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353141 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100363431:100401398:-1 Gene:OTTHUMG00000159065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353230 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100377416:100381772:-1 Gene:OTTHUMG00000159065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353231 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:100372006:100373725:-1 Gene:OTTHUMG00000159065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dtw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae) (TOMM70A), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016247 // RefSeq // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (IMPG2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000193391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101222546:101320560:-1 gene:ENSG00000081148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417518 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:100948349:100951738:-1 gene:ENSG00000081148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF319972 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan IPM 200 (IMPG2) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144092 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052612, with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353256 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101222546:101320560:-1 Gene:OTTHUMG00000159091 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003duq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (IMPG2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hpj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (IMPG2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bhe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (IMPG2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ980602 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan-2 (IMPG2) mRNA, 5 UTR. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xbv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan-2 (IMPG2) mRNA, 5' UTR. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391017 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101628310:101628406:-1 gene:ENSG00000212319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014415 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11 (ZBTB11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000312938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101648889:101677495:-1 gene:ENSG00000066422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461821 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:101670613:101677118:-1 gene:ENSG00000066422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028062 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5189665), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111700 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:133303 IMAGE:40038346), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353441 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101648889:101677495:-1 Gene:OTTHUMG00000159133 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353470 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101670613:101677118:-1 Gene:OTTHUMG00000159133 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353912 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:101655841:101659923:-1 Gene:OTTHUMG00000159133 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dve.4 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11 (ZBTB11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dvf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11 (ZBTB11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364251 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101662060:101662164:-1 gene:ENSG00000201121 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364195 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:102755064:102755170:-1 gene:ENSG00000201065 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xby.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTC) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xca.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTG) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005459 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C (GUCA1C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108907792:108953762:-1 gene:ENSG00000138472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471108 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:108915940:108953766:-1 gene:ENSG00000138472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF110003 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activating protein 3 splice variant (GCAP3) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103993 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C, mRNA (cDNA clone MGC:120158 IMAGE:40022396), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000261047 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1368:212392:236325:- gene:ENSG00000138472 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353819 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:108907803:108953895:-1 Gene:OTTHUMG00000159204 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353820 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:108907792:108953762:-1 Gene:OTTHUMG00000159204 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353821 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:108915940:108953766:-1 Gene:OTTHUMG00000159204 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dxj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C (GUCA1C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dxk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C (GUCA1C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014429 // RefSeq // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000232603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108958239:109118142:-1 gene:ENSG00000114487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483760 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:108958845:109118103:-1 gene:ENSG00000114487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK302642 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57672 complete cds, highly similar to Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050307 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:48317 IMAGE:4838254), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353843 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:108958239:109118142:-1 Gene:OTTHUMG00000159209 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353844 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:108958845:109118103:-1 Gene:OTTHUMG00000159209 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dxl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bhn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408706 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:109018909:109019116:-1 gene:ENSG00000221633 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_138815 // RefSeq // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 (DPPA2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:109293788:109316517:-1 gene:ENSG00000163530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018070 // GenBank // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:26688 IMAGE:4817054), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353938 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:109293788:109316517:-1 Gene:OTTHUMG00000159227 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dxo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 (DPPA2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024508 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2 (ZBED2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003536 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:10796 IMAGE:3609995), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071956 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:88648 IMAGE:3928218), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317012 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1813:64287:64655:- gene:ENSG00000177494 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000157228 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:111592900:111595443:-1 Gene:OTTHUMG00000074061 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dxy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2 (ZBED2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xci.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2 (ZBED2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085357 // RefSeq // Homo sapiens B and T lymphocyte associated (BTLA), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_181780 // RefSeq // Homo sapiens B and T lymphocyte associated (BTLA), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:112466108:112499358:-1 gene:ENSG00000186265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474965 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:112465926:112470022:-1 gene:ENSG00000186265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107091 // GenBank // Homo sapiens B and T lymphocyte associated, mRNA (cDNA clone MGC:129743 IMAGE:40015588), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334529 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1813:925841:958810:- gene:ENSG00000186265 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354101 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112463968:112499561:-1 Gene:OTTHUMG00000159255 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354102 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112466108:112499358:-1 Gene:OTTHUMG00000159255 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354103 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112469756:112470453:-1 Gene:OTTHUMG00000159255 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354104 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112465926:112470022:-1 Gene:OTTHUMG00000159255 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dza.4 // UCSC Genes // Homo sapiens B and T lymphocyte associated (BTLA), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dzb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens B and T lymphocyte associated (BTLA), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001008784 // RefSeq // Homo sapiens CD200 receptor 1-like (CD200R1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001199215 // RefSeq // Homo sapiens CD200 receptor 1-like (CD200R1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:112815709:112845950:-1 gene:ENSG00000206531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000448932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:112818769:112845950:-1 gene:ENSG00000206531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488794 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:112815709:112846856:-1 gene:ENSG00000206531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144507 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053034, containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354365 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112815709:112845950:-1 Gene:OTTHUMG00000159283 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354366 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112815709:112846856:-1 Gene:OTTHUMG00000159283 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354367 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:112815788:112845943:-1 Gene:OTTHUMG00000159283 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dzi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD200 receptor 1-like (CD200R1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hqf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD200 receptor 1-like (CD200R1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bhw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD200 receptor 1-like (CD200R1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458853 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:113092444:113092525:-1 gene:ENSG00000238593 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517267 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:112856813:112856888:-1 gene:ENSG00000253076 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007136 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 80 (ZNF80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:114234631:114237101:-1 gene:ENSG00000174255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069606 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:97164 IMAGE:7262407), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069826 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:97175 IMAGE:7262419), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC129925 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:150535 IMAGE:40121991), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:114234636:114237578:-1 Gene:OTTHUMG00000159332 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354696 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:114234631:114237101:-1 Gene:OTTHUMG00000159332 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 80 (ZNF80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hqo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 80 (ZNF80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// X65233 // GenBank // H.sapiens mRNA for Zinc-finger protein (ZNFpT17). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030293 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 568 (MIR568), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385036 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:114316475:114316569:-1 gene:ENSG00000207770 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 568 (MIR568), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ebh.1 cpcScore=-1.1882800 cnci=-0.2165589 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408171 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:115401969:115402036:-1 gene:ENSG00000221098 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:116965112:116965227:-1 gene:ENSG00000200372 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:119341834:119341940:-1 gene:ENSG00000207310 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_199420 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed), theta (POLQ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:121431431:121546006:-1 gene:ENSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:121521571:121533210:-1 gene:ENSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543272 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:121150274:121240977:-1 gene:ENSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF052573 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase theta (POLQ) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355097 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:121431431:121546006:-1 Gene:OTTHUMG00000159396 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355100 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:121521571:121533210:-1 Gene:OTTHUMG00000159396 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355101 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:121440084:121481596:-1 Gene:OTTHUMG00000159396 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eed.3 // UCSC Genes // Homo sapiens polymerase (DNA directed), theta (POLQ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eee.4 // UCSC Genes // Homo sapiens polymerase (DNA directed), theta (POLQ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393672 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold7:950894:1052168:+ // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410125 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:121655475:121655604:-1 gene:ENSG00000222057 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365518 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:122025195:122025304:-1 gene:ENSG00000202388 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408284 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:122926996:122927121:-1 gene:ENSG00000221211 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198402 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (PTPLB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:123491554:123585185:-1 gene:ENSG00000206527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC049369 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:57203 IMAGE:5286864), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060839 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:71739 IMAGE:5273705), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:123491554:123585185:-1 Gene:OTTHUMG00000159529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356073 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:123499583:123502906:-1 Gene:OTTHUMG00000159529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356074 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:123499291:123500693:-1 Gene:OTTHUMG00000159529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356358 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:123500568:123584555:-1 Gene:OTTHUMG00000159529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003egj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (PTPLB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459309 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:124061994:124062084:-1 gene:ENSG00000238512 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ehp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34276 fis, clone FEBRA2003520. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517156 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:125528244:125528349:-1 gene:ENSG00000252965 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xdf.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408754 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:125551272:125551371:-1 gene:ENSG00000221681 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001015050 // RefSeq // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001195223 // RefSeq // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125929275:125937039:-1 gene:ENSG00000189366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC073816 // GenBank // Homo sapiens beta-1,4-mannosyltransferase-like, mRNA (cDNA clone MGC:88848 IMAGE:5419254), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:125929275:125937039:-1 Gene:OTTHUMG00000159588 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eig.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xdh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365106 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:125879126:125879288:-1 gene:ENSG00000201976 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014079 // RefSeq // Homo sapiens Kruppel-like factor 15 (KLF15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126342635:126357442:-1 gene:ENSG00000163884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509675 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:126352675:126354285:-1 gene:ENSG00000163884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036733 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 15, mRNA (cDNA clone MGC:45113 IMAGE:5526657), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370096 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126342635:126357442:-1 Gene:OTTHUMG00000162689 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370097 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126352675:126354285:-1 Gene:OTTHUMG00000162689 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bkk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Kruppel-like factor 15 (KLF15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040653 // RefSeq // Homo sapiens ZXD family zinc finger C (ZXDC), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_025112 // RefSeq // Homo sapiens ZXD family zinc finger C (ZXDC), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000336332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126461083:126475865:-1 gene:ENSG00000070476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000389709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126437601:126475919:-1 gene:ENSG00000070476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063713 // GenBank // Homo sapiens ZXD family zinc finger C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5110645). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126437601:126475919:-1 Gene:OTTHUMG00000162754 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370328 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126461083:126475865:-1 Gene:OTTHUMG00000162754 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370329 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126437619:126474987:-1 Gene:OTTHUMG00000162754 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126437601:126443409:-1 Gene:OTTHUMG00000162754 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eiv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZXD family zinc finger C (ZXDC), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eix.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ZXD family zinc finger C (ZXDC), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hsh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZXD family zinc finger C (ZXDC), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001165974 // RefSeq // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_144639 // RefSeq // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000290868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126481281:126517773:-1 gene:ENSG00000159650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:126481855:126517753:-1 gene:ENSG00000159650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC115405 // GenBank // Homo sapiens urocanase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:135007 IMAGE:40076084), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126481281:126517773:-1 Gene:OTTHUMG00000162753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370326 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126481855:126517753:-1 Gene:OTTHUMG00000162753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eiz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hsi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152533 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 22 (C3orf22), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126549673:126558965:-1 gene:ENSG00000180697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032025 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 22, mRNA (cDNA clone MGC:34728 IMAGE:5165128), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370231 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126549673:126558965:-1 Gene:OTTHUMG00000162731 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370232 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:126526999:126558965:-1 Gene:OTTHUMG00000162731 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ejb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 22 (C3orf22), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391254 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:127202372:127202473:-1 gene:ENSG00000212556 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364418 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:127240968:127241074:-1 gene:ENSG00000201288 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410695 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:128075073:128075249:-1 gene:ENSG00000222627 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391042 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:128141875:128141977:-1 gene:ENSG00000212344 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153330 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (DNAJB8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128462442:128467248:-1 gene:ENSG00000179407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128462439:128466968:-1 gene:ENSG00000179407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029521 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:33884 IMAGE:5296554), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050288 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:43650 IMAGE:5270636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356932 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128462442:128467248:-1 Gene:OTTHUMG00000159690 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356933 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128462439:128466968:-1 Gene:OTTHUMG00000159690 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekk.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xdk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (DNAJB8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007354 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 27 (C3orf27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128572000:128576086:-1 gene:ENSG00000198685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128572000:128576086:-1 Gene:OTTHUMG00000159688 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ekq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 27 (C3orf27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xdl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 27 (C3orf27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384401 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:128714571:128714705:-1 gene:ENSG00000207130 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000421542 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:128483309:128483860:-1 gene:ENSG00000242992 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034179 // RefSeq // Homo sapiens intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas) pseudogene (LOC653712), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128861546:128865604:-1 gene:ENSG00000231305 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128861313:128871540:-1 gene:ENSG00000231305 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357491 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128861313:128871540:-1 Gene:OTTHUMG00000159813 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357492 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:128861546:128865604:-1 Gene:OTTHUMG00000159813 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xdm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas) pseudogene (LOC653712), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000539989 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000539989 cpcScore=-1.2804300 cnci=-0.2122685 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006026 // RefSeq // Homo sapiens H1 histone family, member X (H1FX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129314771:129316277:-1 gene:ENSG00000184897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000426 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:8350 IMAGE:2819756), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010435 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:15959 IMAGE:3538400), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355455 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:129314771:129316277:-1 Gene:OTTHUMG00000159450 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003elx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens H1 histone family, member X (H1FX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002992 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 7B (SNORA7B), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003111 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L32 pseudogene 3 (RPL32P3), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384360 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:129397210:129397348:-1 gene:ENSG00000207088 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129391155:129399419:-1 gene:ENSG00000251474 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK093477 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36158 fis, clone TESTI2025757, weakly similar to Human mRNA for ribosomal protein L32. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053996 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L32 pseudogene 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5225426). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein L32 pseudogene 3 (RPL32P3), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 7B (SNORA7B), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ema.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ema.2 cpcScore=0.5407980 cnci=-0.2608400 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ema.3 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003emb.2 cpcScore=1.0124300 cnci=-0.2577402 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emd.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eme.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX641154 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B22123 (from clone DKFZp686B22123). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD54C10. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003emc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003emc.1 cpcScore=-0.4449350 cnci=-0.2352226 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024252 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member H, pseudogene (FAM86HP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500074 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:130102764:130111433:-1 gene:ENSG00000253540 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK124448 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42457 fis, clone BRACE2018700. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ene.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member H, pseudogene (FAM86HP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ble.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member H, pseudogene (FAM86HP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410751 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:130369227:130369344:-1 gene:ENSG00000222683 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517085 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:130914340:130914452:-1 gene:ENSG00000252894 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:131092821:131092927:-1 gene:ENSG00000201550 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390784 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:131111670:131111758:-1 gene:ENSG00000212073 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002985 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 58 (SNORA58), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384346 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:131197941:131198077:-1 gene:ENSG00000207074 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505219 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:131479097:131479233:-1 gene:ENSG00000249020 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356788 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:3:131197941:131198077:-1 Gene:OTTHUMG00000159670 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eoi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 58 (SNORA58), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eoi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eoi.1 cpcScore=-1.1438700 cnci=-0.1734864 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xee.1 // UCSC Genes // transfer RNA Cys (anticodon GCA) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xef.1 // UCSC Genes // transfer RNA Cys (anticodon GCA) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133429269:133455776:-1 gene:ENSG00000249993 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007984 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC2848, mRNA (cDNA clone IMAGE:2967248), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357035 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:133429269:133455776:-1 Gene:OTTHUMG00000159721 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003epo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein MGC2848, mRNA (cDNA clone IMAGE:2967248), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025041 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36 (C3orf36), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133928145:133929812:-1 gene:ENSG00000221972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104161 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36, mRNA (cDNA clone MGC:125760 IMAGE:40029559), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104162 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36, mRNA (cDNA clone MGC:125761 IMAGE:40029562), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003epz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36 (C3orf36), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000273411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:134351852:134356561:-1 gene:ENSG00000214289 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517195 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:135518536:135518622:-1 gene:ENSG00000253004 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:136430084:136430183:-1 gene:ENSG00000200571 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:136721394:136721495:-1 gene:ENSG00000252914 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016161 // RefSeq // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4GNT), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000236709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:138123718:138132387:-1 gene:ENSG00000118017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119639 // GenBank // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:149493 IMAGE:40115688), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:138123718:138132387:-1 Gene:OTTHUMG00000159820 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ers.2 // UCSC Genes // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4GNT), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023067 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box L2 (FOXL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138944224:138947140:-1 gene:ENSG00000183770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542203 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:138663068:138665801:-1 gene:ENSG00000183770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062549 // GenBank // Homo sapiens forkhead box L2, mRNA (cDNA clone MGC:71193 IMAGE:6572303), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357999 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:138944224:138947140:-1 Gene:OTTHUMG00000159889 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003esw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens forkhead box L2 (FOXL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001134659 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 23A (PRR23A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139005468:139006268:-1 gene:ENSG00000206260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361503 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:139005468:139006268:-1 Gene:OTTHUMG00000160635 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bms.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proline rich 23A (PRR23A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027070 // RefSeq // Homo sapiens polled intersex syndrome regulated transcript 1 (non-protein coding RNA) (PISRT1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bmu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens polled intersex syndrome regulated transcript 1 (non-protein coding RNA) (PISRT1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bmu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bmu.1 cpcScore=-1.0559800 cnci=-0.3681730 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401365 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:140490052:140490144:-1 gene:ENSG00000216184 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450495 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:141583849:141584121:-1 gene:ENSG00000228398 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363519 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:141902924:141903030:-1 gene:ENSG00000200389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003euj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36710 fis, clone UTERU2010115, weakly similar to NUCLEAR FACTOR NF-KAPPA-B P49 SUBUNIT. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142407657:142407737:-1 gene:ENSG00000251804 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365255 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142420205:142420369:-1 gene:ENSG00000202125 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198504 // RefSeq // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX (PAQR9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:142961231:142963682:-1 gene:ENSG00000188582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC118666 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:141692 IMAGE:40016554), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC122527 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:141693 IMAGE:40016555), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354538 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:142961231:142963682:-1 Gene:OTTHUMG00000159313 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003evg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX (PAQR9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034032 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100289361 (LOC100289361), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xew.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100289361 (LOC100289361), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085420 // RefSeq // Homo sapiens phospholipid scramblase family, member 5 (PLSCR5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:146585838:146606216:-1 gene:ENSG00000231213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:146576559:146605239:-1 gene:ENSG00000231213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157886 // GenBank // Homo sapiens phospholipid scramblase family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:189710 IMAGE:8862707), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171917 // GenBank // Homo sapiens phospholipid scramblase family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:198632 IMAGE:9054571), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492200 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2266:523041:538769:+ gene:ENSG00000231213 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355363 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:146576555:146605239:-1 Gene:OTTHUMG00000159437 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355364 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:146576559:146605239:-1 Gene:OTTHUMG00000159437 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000355365 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:146585838:146606216:-1 Gene:OTTHUMG00000159437 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hvb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipid scramblase family, member 5 (PLSCR5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hvc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipid scramblase family, member 5 (PLSCR5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515991 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:146671746:146671865:-1 gene:ENSG00000251800 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384427 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:146996607:146996713:-1 gene:ENSG00000207156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408504 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:147911406:147911501:-1 gene:ENSG00000221431 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xfh.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon AAG) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xfi.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364161 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:149094353:149094462:-1 gene:ENSG00000201031 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000471823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149229356:149241389:-1 gene:ENSG00000240216 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000482639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149275685:149291800:-1 gene:ENSG00000240216 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149275685:149291800:-1 Gene:OTTHUMG00000159584 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184723 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_138786 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:149318498:149333761:-1 gene:ENSG00000163762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014339 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18, mRNA (cDNA clone MGC:23935 IMAGE:3828466), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470080 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4769:1221:25519:- gene:ENSG00000163762 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356326 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149318498:149333761:-1 Gene:OTTHUMG00000159582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149322368:149334414:-1 Gene:OTTHUMG00000159582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356328 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149324804:149333635:-1 Gene:OTTHUMG00000159582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356329 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149321277:149333482:-1 Gene:OTTHUMG00000159582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356330 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:149329928:149333328:-1 Gene:OTTHUMG00000159582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003exa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516363 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:149917342:149917449:-1 gene:ENSG00000252172 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000438359 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:3:149699965:149701095:-1 gene:ENSG00000224831 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005067 // RefSeq // Homo sapiens siah E3 ubiquitin protein ligase 2 (SIAH2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000312960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:150741127:150763377:-1 gene:ENSG00000181788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472885 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:150762456:150763477:-1 gene:ENSG00000181788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013082 // GenBank // Homo sapiens seven in absentia homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:17169 IMAGE:4153095), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150741127:150763377:-1 Gene:OTTHUMG00000159847 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150762456:150763477:-1 Gene:OTTHUMG00000159847 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150742488:150763431:-1 Gene:OTTHUMG00000159847 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens siah E3 ubiquitin protein ligase 2 (SIAH2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013308 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:151197832:151203192:-1 gene:ENSG00000174946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036815 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171, mRNA (cDNA clone MGC:46113 IMAGE:5747378), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357793 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151197832:151203192:-1 Gene:OTTHUMG00000159861 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151199333:151203201:-1 Gene:OTTHUMG00000159861 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001081455 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_014879 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151212919:151249114:-1 gene:ENSG00000174944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034989 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14, mRNA (cDNA clone MGC:33042 IMAGE:5265592), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309170 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2318:1184307:1185320:+ gene:ENSG00000174944 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357789 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151212117:151278467:-1 Gene:OTTHUMG00000159859 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357790 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151212919:151249114:-1 Gene:OTTHUMG00000159859 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357791 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151214030:151278369:-1 Gene:OTTHUMG00000159859 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eys.1 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023915 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87 (GPR87), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000260843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151294103:151316952:-1 gene:ENSG00000138271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112941 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:131898 IMAGE:4500655), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132888 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:164519 IMAGE:40146910), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357788 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:151294103:151316952:-1 Gene:OTTHUMG00000159858 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87 (GPR87), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027037 // RefSeq // Homo sapiens MBNL1 antisense RNA 1 (MBNL1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027038 // RefSeq // Homo sapiens MBNL1 antisense RNA 1 (MBNL1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:152268184:152269546:-1 gene:ENSG00000229619 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011boe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens MBNL1 antisense RNA 1 (MBNL1-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bof.2 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001123228 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 14E (TMEM14E), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:152340527:152340904:-1 gene:ENSG00000221962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000356703 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:152340527:152340904:-1 Gene:OTTHUMG00000159652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hvo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 14E (TMEM14E), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:153471466:153471571:-1 gene:ENSG00000207323 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:154007367:154007502:-1 gene:ENSG00000201398 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001038705 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 149 (GPR149), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000389740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:154337672:154429715:-1 gene:ENSG00000174948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353430 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:154337672:154429715:-1 Gene:OTTHUMG00000159131 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003faa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 149 (GPR149), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000399242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155742142:155743726:-1 gene:ENSG00000214919 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173657 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33 (C3orf33), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155762617:155806351:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000534941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:155762618:155806272:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537385 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:155480553:155524076:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK289890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75973 complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064898 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33, mRNA (cDNA clone MGC:70365 IMAGE:6008321), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351167 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:155762617:155806351:-1 Gene:OTTHUMG00000158496 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351168 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:155762617:155806266:-1 Gene:OTTHUMG00000158496 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351169 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:155763787:155806251:-1 Gene:OTTHUMG00000158496 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:155763528:155806259:-1 Gene:OTTHUMG00000158496 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fal.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33 (C3orf33), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fam.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33 (C3orf33), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027954 // RefSeq // Homo sapiens TIPARP antisense RNA 1 (TIPARP-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011boq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens TIPARP antisense RNA 1 (TIPARP-AS1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003284 // RefSeq // Homo sapiens proliferation-associated 2G4 pseudogene 4 (PA2G4P4), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fay.1 // UCSC Genes // Homo sapiens proliferation-associated 2G4 pseudogene 4 (PA2G4P4), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034007 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 880 (LINC00880), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:157081667:157123004:-1 gene:ENSG00000243629 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351886 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:157081667:157123004:-1 Gene:OTTHUMG00000158717 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fbc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 880 (LINC00880), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002268 // RefSeq // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3) (KPNA4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:160494995:160565588:-1 gene:ENSG00000186432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469804 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:160564209:160565571:-1 gene:ENSG00000186432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028691 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3), mRNA (cDNA clone MGC:26508 IMAGE:4838709), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034493 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3), mRNA (cDNA clone MGC:26703 IMAGE:4821602), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352960 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:160494995:160565588:-1 Gene:OTTHUMG00000159033 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352961 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:160564209:160565571:-1 Gene:OTTHUMG00000159033 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352962 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:160504958:160521796:-1 Gene:OTTHUMG00000159033 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fdn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3) (KPNA4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003001 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 7 (SCARNA7), guide RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458797 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160514907:160515236:-1 gene:ENSG00000238741 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fdo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 7 (SCARNA7), guide RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040100 // RefSeq // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, small subunit B (SPTSSB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:161344792:161372880:-1 gene:ENSG00000196542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065208 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:70533 IMAGE:5207108), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107756 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:104229 IMAGE:6737276), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126236 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:161514 IMAGE:8991952), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497137 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1182:98331:98561:- gene:ENSG00000196542 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353181 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:161344792:161372880:-1 Gene:OTTHUMG00000159073 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353182 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:161359299:161371517:-1 Gene:OTTHUMG00000159073 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000353183 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:161345775:161371501:-1 Gene:OTTHUMG00000159073 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fee.3 // UCSC Genes // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, small subunit B (SPTSSB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xgx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, small subunit B (SPTSSB), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459413 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:162896662:162896763:-1 gene:ENSG00000238398 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408324 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:164171471:164171556:-1 gene:ENSG00000221251 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001041 // RefSeq // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase) (SI), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:164978898:165078495:-1 gene:ENSG00000090402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC115034 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:131624 IMAGE:7962025), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132834 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:164465 IMAGE:40146856), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132860 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:164491 IMAGE:40146882), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350116 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:164978898:165078495:-1 Gene:OTTHUMG00000158065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350117 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:165068719:165078495:-1 Gene:OTTHUMG00000158065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350118 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:165074425:165076014:-1 Gene:OTTHUMG00000158065 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fei.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase) (SI), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363182 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:165122713:165122823:-1 gene:ENSG00000200052 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014926 // RefSeq // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000241274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:165186722:165196852:-1 gene:ENSG00000121871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK290024 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78429 complete cds, highly similar to Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114621 // GenBank // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:138681 IMAGE:40036558), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475390 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3042:228345:231284:- gene:ENSG00000121871 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350125 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:165186722:165196852:-1 Gene:OTTHUMG00000158072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:165186720:165196002:-1 Gene:OTTHUMG00000158072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:165190343:165197109:-1 Gene:OTTHUMG00000158072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fej.4 // UCSC Genes // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fek.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xgy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014498 // RefSeq // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:168010235:168095344:-1 gene:ENSG00000173905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143232 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051733, containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143233 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051734, containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171748 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053249, containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470487 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2737:742333:824303:+ gene:ENSG00000173905 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351278 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:168008677:168095975:-1 Gene:OTTHUMG00000158554 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351279 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:168010235:168095344:-1 Gene:OTTHUMG00000158554 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351280 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:168041118:168044881:-1 Gene:OTTHUMG00000158554 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ffe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:169720187:169720293:-1 gene:ENSG00000206777 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001566 // RefSeq // Homo sapiens telomerase RNA component (TERC), telomerase RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000363312 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:169764610:169765047:-1 gene:ENSG00000277925 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000270141 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ffr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens telomerase RNA component (TERC), telomerase RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032487 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein T3 (ACTRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007289 // GenBank // Homo sapiens actin related protein M1, mRNA (cDNA clone MGC:15664 IMAGE:3349184), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330368 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2554:176433:178087:- gene:ENSG00000184378 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ffs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens actin-related protein T3 (ACTRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024409 // RefSeq // Homo sapiens four and a half LIM domains 1 pseudogene (LOC100128164), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027622 // RefSeq // Homo sapiens four and a half LIM domains 1 pseudogene (LOC100128164), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169943256:169966226:-1 gene:ENSG00000239219 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351955 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169943256:169966226:-1 Gene:OTTHUMG00000158728 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351956 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169954227:169966734:-1 Gene:OTTHUMG00000158728 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000351957 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:169939353:169966240:-1 Gene:OTTHUMG00000158728 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fgf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens four and a half LIM domains 1 pseudogene (LOC100128164), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens four and a half LIM domains 1 pseudogene (LOC100128164), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bpp.1 cpcScore=1.3008100 cnci=-0.2880534 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY940074 // GenBank // Homo sapiens breast cancer estrogen-induced apoptosis 3 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fgn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ12393 fis, clone MAMMA1002711. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020949 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7, member 14 (SLC7A14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000231706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:170459584:170586074:-1 gene:ENSG00000013293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466168 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:170570090:170586027:-1 gene:ENSG00000013293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352598 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:170459584:170586074:-1 Gene:OTTHUMG00000158941 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352599 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:170570090:170586027:-1 Gene:OTTHUMG00000158941 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fgz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 7 (orphan transporter), member 14 (SLC7A14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410479 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:3:170559884:170559961:-1 gene:ENSG00000222411 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384386 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:171504245:171504351:-1 gene:ENSG00000207114 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000331659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:171791790:171809924:-1 gene:ENSG00000075651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000183657 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427116 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000427116 cpcScore=-0.6313460 cnci=-0.2485766 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004122 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1b, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_198407 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1a, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:172447544:172448455:-1 gene:ENSG00000121853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069068 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:95342 IMAGE:7216881), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069374 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:96982 IMAGE:7262191), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113547 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:142107 IMAGE:8322599), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000241256 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2793:1523231:1526593:- gene:ENSG00000121853 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346728 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:172445133:172448456:-1 Gene:OTTHUMG00000156946 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346729 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:172447544:172448455:-1 Gene:OTTHUMG00000156946 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fib.2 // UCSC Genes // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1a, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bpv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1b, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363485 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:172771277:172771405:-1 gene:ENSG00000200355 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:172796429:172796558:-1 gene:ENSG00000201458 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031955 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 16 (SPATA16), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000351008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:172889358:173141268:-1 gene:ENSG00000144962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034496 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 16, mRNA (cDNA clone MGC:26729 IMAGE:4825905), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346322 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:172889358:173141268:-1 Gene:OTTHUMG00000156865 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fin.4 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 16 (SPATA16), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459193 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:172692932:172693032:-1 gene:ENSG00000239141 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:175397247:175397348:-1 gene:ENSG00000199792 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364473 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:177120691:177120800:-1 gene:ENSG00000201343 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364012 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:177126017:177126120:-1 gene:ENSG00000200882 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363418 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:177624282:177624409:-1 gene:ENSG00000200288 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022470 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152240 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179023739:179072215:-1 gene:ENSG00000172667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002896 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, matrin type 3, mRNA (cDNA clone MGC:10613 IMAGE:3943641), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000311417 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3558:427739:455054:+ gene:ENSG00000172667 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348336 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179017223:179072279:-1 Gene:OTTHUMG00000157290 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348337 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179023739:179072215:-1 Gene:OTTHUMG00000157290 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000348339 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:179027757:179071566:-1 Gene:OTTHUMG00000157290 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fjg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fji.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:179169083:179169210:-1 gene:ENSG00000201957 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459278 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:179614775:179614878:-1 gene:ENSG00000239096 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014398 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3 (LAMP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000265598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183122213:183162911:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466939 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:183123925:183162015:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183158113:183163838:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032940 // GenBank // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:26448 IMAGE:4829125), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350863 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:183122213:183162911:-1 Gene:OTTHUMG00000158387 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350864 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:183123925:183162015:-1 Gene:OTTHUMG00000158387 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350865 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:183153901:183163839:-1 Gene:OTTHUMG00000158387 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350866 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:183158113:183163838:-1 Gene:OTTHUMG00000158387 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000350867 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:183153940:183162882:-1 Gene:OTTHUMG00000158387 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003flh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3 (LAMP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401347 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183802475:183802553:-1 gene:ENSG00000216166 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fma.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33401 fis, clone BRACE2009886. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183896049:183904298:-1 gene:ENSG00000233441 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384621 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:184086791:184086903:-1 gene:ENSG00000207351 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033259 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2 (CAMK2N2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184259213:184261463:-1 gene:ENSG00000163888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105077 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:132737 IMAGE:8144080), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346010 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:184259213:184261463:-1 Gene:OTTHUMG00000156821 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fnj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2 (CAMK2N2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xij.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001025266 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70 (C3orf70), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137178 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:168798 IMAGE:9021175), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137179 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:168799 IMAGE:9021176), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150565 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:179716 IMAGE:40127634), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335012 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1379:418283:418837:+ gene:ENSG00000187068 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345323 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:185078050:185153014:-1 Gene:OTTHUMG00000156696 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fpd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70 (C3orf70), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017541 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma S (CRYGS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186538599:186544451:-1 gene:ENSG00000213139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186538441:186546702:-1 gene:ENSG00000213139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069478 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma S, mRNA (cDNA clone MGC:97060 IMAGE:7262271), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070241 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma S, mRNA (cDNA clone MGC:88225 IMAGE:30405628), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186538441:186546702:-1 Gene:OTTHUMG00000156615 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186538599:186544451:-1 Gene:OTTHUMG00000156615 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:186538599:186540520:-1 Gene:OTTHUMG00000156615 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fqe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens crystallin, gamma S (CRYGS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384774 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:186771841:186771947:-1 gene:ENSG00000207505 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052969 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L39-like (RPL39L), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187139523:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187180908:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187139484:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012328 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L39-like, mRNA (cDNA clone MGC:20168 IMAGE:4555759), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344282 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187120948:187139484:-1 Gene:OTTHUMG00000156465 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344283 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187120948:187139523:-1 Gene:OTTHUMG00000156465 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344284 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187120948:187180908:-1 Gene:OTTHUMG00000156465 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fre.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein L39-like (RPL39L), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xim.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein L39-like (RPL39L), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004312 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 2 (RTP2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068081 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:78665 IMAGE:6212901), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358241 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1387:432215:435522:- gene:ENSG00000198471 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344259 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:187698259:187702557:-1 Gene:OTTHUMG00000156458 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fro.1 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 2 (RTP2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036497 // RefSeq // Homo sapiens LPP antisense RNA 2 (LPP-AS2), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xip.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LPP antisense RNA 2 (LPP-AS2), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:190165417:190165523:-1 gene:ENSG00000212489 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207316 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 207 (TMEM207), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000354905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:190428655:190449876:-1 gene:ENSG00000198398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071780 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 207, mRNA (cDNA clone MGC:88422 IMAGE:4607584), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000343515 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:190428655:190449876:-1 Gene:OTTHUMG00000156213 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fsj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 207 (TMEM207), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363400 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:46660217:46660318:1 gene:ENSG00000275775 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000200270 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459180 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:192534009:192534112:-1 gene:ENSG00000238902 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178496 // RefSeq // Homo sapiens Mab-21 domain containing 2 (MB21D2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013123 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:21714 IMAGE:4471808), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036194 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:39517 IMAGE:5267040), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045582 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:57376 IMAGE:5262015), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392452 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3015:1217204:1218487:+ gene:ENSG00000180611 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000341543 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:192796815:192918161:-1 Gene:OTTHUMG00000155768 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Mab-21 domain containing 2 (MB21D2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027764 // RefSeq // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 (DPPA2P3), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bss.2 // UCSC Genes // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 (DPPA2P3), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bss.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bss.1 cpcScore=2.5875600 cnci=-0.3109794 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080513 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194340772:194351318:-1 gene:ENSG00000178772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031569 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:35415 IMAGE:5188827), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042334 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:48937 IMAGE:5190234), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137398 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:169019 IMAGE:9021396), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323830 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3253:227381:229231:- gene:ENSG00000178772 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194339765:194351328:-1 Gene:OTTHUMG00000156047 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000342857 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194340772:194351318:-1 Gene:OTTHUMG00000156047 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fts.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xix.1 // UCSC Genes // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004488 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein V (platelet) (GP5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323007 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:194115550:194119995:-1 gene:ENSG00000178732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194394821:194398354:-1 gene:ENSG00000178732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317710 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:194394821:194398354:-1 Gene:OTTHUMG00000150345 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ftv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycoprotein V (platelet) (GP5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xiz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycoprotein V (platelet) (GP5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408791 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:194387894:194387945:-1 gene:ENSG00000221718 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384638 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:195419436:195419546:-1 gene:ENSG00000207368 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC044310 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5171739, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bsy.1 cpcScore=-1.0658400 cnci=-0.1878029 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bsy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36096 fis, clone TESTI2020906. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:195928589:195928775:-1 gene:ENSG00000239122 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003264 // RefSeq // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein pseudogene 1 (SDHAP1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:195959921:195990279:-1 gene:ENSG00000185485 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF088032 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZC24D06. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300421 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56858 complete cds, highly similar to Succinate dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein subunit, mitochondrial precursor (EC 1.3.5.1). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK316025 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78924 complete cds, highly similar to Succinate dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein subunit, mitochondrial precursor (EC 1.3.5.1). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fvx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein pseudogene 1 (SDHAP1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fvy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein pseudogene 1 (SDHAP1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011btp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein pseudogene 1 (SDHAP1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011btq.1 // UCSC Genes // --- // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390844 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196341609:196341715:-1 gene:ENSG00000212146 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383917 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196393710:196393812:-1 gene:ENSG00000206644 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152617 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 168, E3 ubiquitin protein ligase (RNF168), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017442 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 168, mRNA (cDNA clone IMAGE:3946999). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033791 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:45398 IMAGE:5163887), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318037 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3612:407139:422269:- gene:ENSG00000163961 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340778 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196468783:196503768:-1 Gene:OTTHUMG00000155582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340779 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196471760:196503677:-1 Gene:OTTHUMG00000155582 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fwq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 168, E3 ubiquitin protein ligase (RNF168), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iah.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 168, E3 ubiquitin protein ligase (RNF168), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077657 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43 (C3orf43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196506877:196515366:-1 gene:ENSG00000214097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK291522 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77313 complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC118556 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:141735 IMAGE:40023903), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340776 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196506877:196515366:-1 Gene:OTTHUMG00000155581 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340777 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196506879:196515346:-1 Gene:OTTHUMG00000155581 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fwr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43 (C3orf43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fws.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43 (C3orf43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516386 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:196442094:196442148:-1 gene:ENSG00000252195 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365311 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:3:196474063:196474195:-1 gene:ENSG00000202181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384165 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196784980:196785086:-1 gene:ENSG00000206892 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025163 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (PIGZ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443835 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196948097:196968871:-1 gene:ENSG00000119227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC044640 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z, mRNA (cDNA clone MGC:52163 IMAGE:4871581), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412723 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1323:65673:69752:- gene:ENSG00000119227 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340486 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196946343:196968833:-1 Gene:OTTHUMG00000155522 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340487 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196946737:196951930:-1 Gene:OTTHUMG00000155522 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340488 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196951538:196969060:-1 Gene:OTTHUMG00000155522 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340489 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196948097:196968871:-1 Gene:OTTHUMG00000155522 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fxh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (PIGZ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445739 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196983890:196986942:-1 gene:ENSG00000233487 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458965 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:3:197066328:197066422:-1 gene:ENSG00000238491 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003266 // RefSeq // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein (Fp) pseudogene (LOC220729), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:197614027:197627906:-1 gene:ENSG00000214135 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299863 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60865 complete cds, highly similar to Succinate dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein subunit, mitochondrial precursor (EC 1.3.5.1). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK311713 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18755. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fxy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein (Fp) pseudogene (LOC220729), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iao.2 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein (Fp) pseudogene (LOC220729), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bug.2 // UCSC Genes // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein (Fp) pseudogene (LOC220729), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fxy.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fxy.2 cpcScore=3.4204300 cnci=-0.2184589 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iao.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iao.1 cpcScore=1.3270600 cnci=-0.2601805 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bug.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bug.1 cpcScore=2.0831200 cnci=-0.1551945 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ586768 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xjx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003291 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 18D, pseudogene (ANKRD18DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198057531:198080671:-1 gene:ENSG00000226435 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053879 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC348840, mRNA (cDNA clone IMAGE:5755091). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fyx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 18D, pseudogene (ANKRD18DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iat.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 18D, pseudogene (ANKRD18DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:198071311:198071417:-1 gene:ENSG00000212297 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408525 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:3:197846768:197846878:-1 gene:ENSG00000221452 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126307 // NONCODE // accn=AK126307 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4979 cpcScore=-1.0325700 cnci=-0.3769077 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442809 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000442809 cpcScore=-0.8113860 cnci=-0.3014820 gene:ENSG00000224957 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bpo.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bpo.1 cpcScore=-1.2030200 cnci=-0.4156206 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC012463 // NONCODE // accn=BC012463 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1662 cpcScore=-1.0889300 cnci=-0.3042138 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024022 // NONCODE // accn=NR_024022 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024022 cpcScore=4.1834100 cnci=-0.2745681 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010hci.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hci.2 cpcScore=2.6500900 cnci=-0.2972360 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1131 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1131 cpcScore=-1.5704700 cnci=-0.2269628 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003brl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003brl.2 cpcScore=-0.8986070 cnci=-0.2552841 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1132 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1132 cpcScore=-1.3048900 cnci=-0.3292658 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY545552 // NONCODE // accn=AY545552 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255366 cpcScore=1.8712100 cnci=-0.0602002 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB037880 // NONCODE // accn=AB037880 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000059202 cpcScore=1.0057800 cnci=-0.0108727 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB037882 // NONCODE // accn=AB037882 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000059204 cpcScore=1.3447400 cnci=-0.0355423 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037162 // NONCODE // accn=NR_037162 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037162 cpcScore=8.5780500 cnci=-0.1415761 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037807 // NONCODE // accn=NR_037807 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037807 cpcScore=17.2840000 cnci=-0.0612485 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC027957 // NONCODE // accn=BC027957 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000091419 cpcScore=-0.5730910 cnci=-0.0478364 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86972 // NONCODE // accn=D86972 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4981 cpcScore=7.0012800 cnci=-0.2001420 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010hcz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hcz.2 cpcScore=3.5151600 cnci=-0.2513715 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S75989 // NONCODE // accn=S75989 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1680 cpcScore=13.3284000 cnci=-0.1328570 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bwe.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bwe.1 cpcScore=-1.0281300 cnci=-0.2078556 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB097931 // NONCODE // accn=AB097931 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242193 cpcScore=0.4024240 cnci=-0.3225580 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB107271 // NONCODE // accn=AB107271 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242307 cpcScore=0.4491470 cnci=-0.2945049 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027107 // NONCODE // accn=AK027107 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1682 cpcScore=-1.0718700 cnci=-0.2886534 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086155 // NONCODE // accn=AF086155 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000067034 cpcScore=-1.0599700 cnci=-0.2340293 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002223 // NONCODE // accn=NR_002223 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002223 cpcScore=3.8605300 cnci=-0.2027004 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092130 // NONCODE // accn=AK092130 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1687 cpcScore=-0.2500840 cnci=-0.2997453 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003byo.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003byo.1 cpcScore=-0.0567330 cnci=-0.3410299 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038790 // NONCODE // accn=BC038790 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1688 cpcScore=-1.2729000 cnci=-0.2792755 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC005199 // NONCODE // accn=BC005199 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000086482 cpcScore=0.1922470 cnci=-0.3881398 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK091226 // NONCODE // accn=AK091226 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1691 cpcScore=-1.1905600 cnci=-0.3210384 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL133111 // NONCODE // accn=AL133111 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1694 cpcScore=-0.7685540 cnci=-0.2684131 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413977 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000413977 cpcScore=-1.2188700 cnci=-0.1980460 gene:ENSG00000224660 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436602 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000436602 cpcScore=-1.0096000 cnci=-0.2434137 gene:ENSG00000224660 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029294 // NONCODE // accn=BC029294 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000091723 cpcScore=-1.1952500 cnci=-0.1576884 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003can.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003can.2 cpcScore=-0.1070410 cnci=-0.3911618 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Y13808 // NONCODE // accn=Y13808 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325798 cpcScore=-1.1857800 cnci=-0.4087462 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF052160 // NONCODE // accn=AF052160 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1696 cpcScore=-1.2576100 cnci=-0.4223608 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026452 // NONCODE // accn=AK026452 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1698 cpcScore=-0.8454230 cnci=-0.3835216 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ccd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ccd.2 cpcScore=1.8199000 cnci=-0.1276016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ccf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ccf.2 cpcScore=-1.1670700 cnci=-0.4967439 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC150589 // NONCODE // accn=BC150589 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000435912 cpcScore=1.4029200 cnci=-0.1024887 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130231 // NONCODE // accn=AK130231 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1699 cpcScore=3.7885200 cnci=-0.2841465 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026937 // NONCODE // accn=NR_026937 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026937 cpcScore=4.9037800 cnci=-0.2304756 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR749370 // NONCODE // accn=CR749370 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4985 cpcScore=1.2876900 cnci=-0.4102766 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR608583 // NONCODE // accn=CR608583 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1705 cpcScore=-1.2699500 cnci=-0.3695039 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1744 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1744 cpcScore=-1.5900600 cnci=-0.2871857 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ786388 // NONCODE // accn=AJ786388 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000249409 cpcScore=1.2627600 cnci=-0.3353057 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085950 // NONCODE // accn=AF085950 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1706 cpcScore=-0.9394180 cnci=-0.2781603 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK021606 // NONCODE // accn=AK021606 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1707 cpcScore=-1.1687600 cnci=-0.4000331 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1682 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1682 cpcScore=-1.5733000 cnci=-0.2412531 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000115 // NONCODE // accn=AK000115 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1712 cpcScore=1.9400600 cnci=-0.2890536 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1134 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1134 cpcScore=-1.5552000 cnci=-0.3204855 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027235 // NONCODE // accn=AK027235 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1719 cpcScore=-0.6843180 cnci=-0.3290836 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1482 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1482 cpcScore=-1.6142300 cnci=-0.1459691 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027868 // NONCODE // accn=NR_027868 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027868 cpcScore=4.2442200 cnci=-0.3464170 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027867 // NONCODE // accn=NR_027867 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027867 cpcScore=10.4246000 cnci=-0.3394865 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86640 // NONCODE // accn=D86640 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1723 cpcScore=7.4889100 cnci=-0.1859263 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075021 // NONCODE // accn=AF075021 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1725 cpcScore=-0.5052340 cnci=-0.2447515 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1711 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1711 cpcScore=-1.5655300 cnci=-0.2354950 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1135 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1135 cpcScore=-1.4551200 cnci=-0.3670801 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1136 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1136 cpcScore=-1.3876600 cnci=-0.3144291 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY789462 // NONCODE // accn=AY789462 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332364 cpcScore=0.6928030 cnci=-0.2282850 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY789463 // NONCODE // accn=AY789463 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332365 cpcScore=1.2374500 cnci=-0.3577756 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1999 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1999 cpcScore=-1.2939300 cnci=-0.4318585 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003090 // NONCODE // accn=NR_003090 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003090 cpcScore=1.8616900 cnci=-0.2908802 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cjz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003cjz.2 cpcScore=-1.2424300 cnci=-0.3184514 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1588 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1588 cpcScore=-1.3970400 cnci=-0.2434398 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL110177 // NONCODE // accn=AL110177 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4680 cpcScore=-1.0980600 cnci=-0.3750696 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030084 // NONCODE // accn=BC030084 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000092017 cpcScore=-1.4159500 cnci=-0.4444819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026746 // NONCODE // accn=NR_026746 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026746 cpcScore=5.7218100 cnci=-0.2477036 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024114 // NONCODE // accn=NR_024114 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024114 cpcScore=4.5110300 cnci=-0.2988545 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1129 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1129 cpcScore=-1.6015200 cnci=-0.2891391 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC028133 // NONCODE // accn=BC028133 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1752 cpcScore=2.0267200 cnci=-0.1114553 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098828 // NONCODE // accn=AK098828 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1767 cpcScore=-1.0865800 cnci=-0.2813043 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038366 // NONCODE // accn=BC038366 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1768 cpcScore=-0.5838590 cnci=-0.1850875 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ229109 // NONCODE // accn=DQ229109 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000342509 cpcScore=0.9596040 cnci=-0.2438701 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124776 // NONCODE // accn=AK124776 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1771 cpcScore=-0.5664690 cnci=-0.2612166 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1126 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1126 cpcScore=-1.5497000 cnci=-0.2635588 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055655 // NONCODE // accn=AK055655 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1773 cpcScore=-1.3015700 cnci=-0.3389666 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023353 // NONCODE // accn=NR_023353 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_023353 cpcScore=3.7359500 cnci=-0.1612155 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF145207 // NONCODE // accn=AF145207 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000071306 cpcScore=-1.0623300 cnci=-0.1008978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036525 // NONCODE // accn=NR_036525 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036525 cpcScore=1.9407100 cnci=-0.2271794 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF224495 // NONCODE // accn=AF224495 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000074421 cpcScore=1.0066800 cnci=-0.3068210 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF262299 // NONCODE // accn=AF262299 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000075452 cpcScore=1.2256200 cnci=-0.1642631 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF262301 // NONCODE // accn=AF262301 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000075454 cpcScore=1.4234700 cnci=-0.1258703 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF262302 // NONCODE // accn=AF262302 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000075455 cpcScore=1.3271100 cnci=-0.2593056 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF262303 // NONCODE // accn=AF262303 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000075456 cpcScore=-1.0326500 cnci=-0.2486245 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF161921 // NONCODE // accn=AF161921 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000383868_03 cpcScore=4.0010300 cnci=-0.0963995 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024046 // NONCODE // accn=NR_024046 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024046 cpcScore=2.1279800 cnci=-0.1554860 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130922 // NONCODE // accn=AK130922 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1779 cpcScore=-0.9361180 cnci=-0.2624057 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC067356 // NONCODE // accn=BC067356 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1780 cpcScore=-0.9700270 cnci=-0.2004871 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC066333 // NONCODE // accn=BC066333 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4996 cpcScore=-0.4119090 cnci=-0.2636439 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL162034 // NONCODE // accn=AL162034 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1786 cpcScore=-1.0608000 cnci=-0.2109940 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK097846 // NONCODE // accn=AK097846 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1788 cpcScore=-0.9226470 cnci=-0.1007984 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130853 // NONCODE // accn=AK130853 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1790 cpcScore=0.0607527 cnci=-0.2307026 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036627 // NONCODE // accn=NR_036627 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036627 cpcScore=11.0460000 cnci=-0.1596394 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L17326 // NONCODE // accn=L17326 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000192305 cpcScore=-0.9243720 cnci=-0.2088428 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY545528 // NONCODE // accn=AY545528 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1792 cpcScore=1.1644400 cnci=-0.1691554 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF088021 // NONCODE // accn=AF088021 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4997 cpcScore=-1.3415400 cnci=-0.3993909 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024012 // NONCODE // accn=NR_024012 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024012 cpcScore=4.7013600 cnci=-0.1586644 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037192 // NONCODE // accn=NR_037192 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037192 cpcScore=7.0377400 cnci=-0.1222883 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1138 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1138 cpcScore=-1.3557400 cnci=-0.2409067 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ132083 // NONCODE // accn=AJ132083 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000244659 cpcScore=1.4184100 cnci=-0.1379109 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D87433 // NONCODE // accn=D87433 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1800 cpcScore=17.7564000 cnci=-0.0912541 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC127261 // NONCODE // accn=BC127261 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389239 cpcScore=3.1462200 cnci=-0.0817760 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024460 // NONCODE // accn=NR_024460 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024460 cpcScore=15.0299000 cnci=-0.3232742 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR603400 // NONCODE // accn=CR603400 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1806 cpcScore=-1.0007000 cnci=-0.2081951 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010911 // NONCODE // accn=BC010911 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000087563 cpcScore=1.9791200 cnci=-0.3320899 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029462 // NONCODE // accn=BC029462 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1809 cpcScore=-0.1625150 cnci=-0.2625507 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085898 // NONCODE // accn=AF085898 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1811 cpcScore=-0.7148320 cnci=-0.1347474 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR593615 // NONCODE // accn=CR593615 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1813 cpcScore=2.0916000 cnci=-0.1613734 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK090895 // NONCODE // accn=AK090895 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1814 cpcScore=-1.0971900 cnci=-0.4390876 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000465262 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000465262 cpcScore=-0.8844680 cnci=-0.2613203 gene:ENSG00000244342 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465684 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000465684 cpcScore=3.2740000 cnci=-0.2809055 gene:ENSG00000244342 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468072 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000468072 cpcScore=2.0595000 cnci=-0.2933606 gene:ENSG00000244342 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475886 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000475886 cpcScore=-0.9627000 cnci=-0.2542468 gene:ENSG00000244342 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497573 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000497573 cpcScore=1.0876100 cnci=-0.2424509 gene:ENSG00000244342 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_58 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_58 cpcScore=-1.4594500 cnci=-0.3051135 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00006041-XLOC_002682 // Rinn lincRNA // linc-SYNPR-1 chr3:+:63132058-63134472 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bfj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bfj.1 cpcScore=2.0712000 cnci=-0.2969056 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026866 // NONCODE // accn=NR_026866 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026866 cpcScore=7.8523100 cnci=-0.3265816 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK023371 // NONCODE // accn=AK023371 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1816 cpcScore=-1.0678500 cnci=-0.3191025 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL832189 // NONCODE // accn=AL832189 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1817 cpcScore=-1.0622500 cnci=-0.2680365 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125532 // NONCODE // accn=AK125532 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1818 cpcScore=-1.0034800 cnci=-0.3088309 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086538 // NONCODE // accn=AF086538 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000067417 cpcScore=-1.1321000 cnci=-0.2742982 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040632 // NONCODE // accn=BC040632 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1819 cpcScore=-0.8464670 cnci=-0.3884764 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460833 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000460833 cpcScore=-0.8617470 cnci=-0.2874129 gene:ENSG00000241684 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474768 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000474768 cpcScore=-1.0828800 cnci=-0.2752887 gene:ENSG00000241684 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485174 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000485174 cpcScore=-1.0570500 cnci=-0.2212501 gene:ENSG00000241684 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dml.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dml.2 cpcScore=-1.0763800 cnci=-0.3828005 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028475 // NONCODE // accn=NR_028475 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028475 cpcScore=1.8743400 cnci=-0.2608476 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000465742 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000465742 cpcScore=-0.0277519 cnci=-0.1799798 gene:ENSG00000244203 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040624 // NONCODE // accn=BC040624 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1823 cpcScore=0.2392930 cnci=-0.1553833 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041825 // NONCODE // accn=BC041825 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1824 cpcScore=1.8403600 cnci=-0.2549083 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128475 // NONCODE // accn=AK128475 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1825 cpcScore=-0.9915420 cnci=-0.3985349 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR618657 // NONCODE // accn=CR618657 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1828 cpcScore=-1.1946200 cnci=-0.3386973 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1140 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1140 cpcScore=-1.4882100 cnci=-0.1655056 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037925 // NONCODE // accn=NR_037925 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037925 cpcScore=2.3432000 cnci=-0.2818490 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1229 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1229 cpcScore=-1.3144600 cnci=-0.0972664 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093079 // NONCODE // accn=AK093079 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5001 cpcScore=0.0456407 cnci=-0.3587452 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hoi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hoi.1 cpcScore=-1.1536900 cnci=-0.4173529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC031255 // NONCODE // accn=BC031255 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1834 cpcScore=-1.0209400 cnci=-0.3200039 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494340 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000494340 cpcScore=-1.2316000 cnci=-0.2724027 gene:ENSG00000239440 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1352 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1352 cpcScore=-1.2474000 cnci=-0.2754430 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040985 // NONCODE // accn=BC040985 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1835 cpcScore=-1.2086100 cnci=-0.3711623 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dqm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dqm.1 cpcScore=-1.2099200 cnci=-0.3762285 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL357201 // NONCODE // accn=AL357201 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5002 cpcScore=-1.1436000 cnci=-0.6148993 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033427 // NONCODE // accn=NR_033427 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033427 cpcScore=5.4405000 cnci=-0.4809144 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000957 // NONCODE // accn=AK000957 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1837 cpcScore=-1.2506600 cnci=-0.3909080 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X64988 // NONCODE // accn=X64988 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5004 cpcScore=1.6375100 cnci=-0.3261041 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X64984 // NONCODE // accn=X64984 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5005 cpcScore=1.7108100 cnci=-0.2339393 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1251 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1251 cpcScore=-1.3044900 cnci=-0.3721694 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00005559-XLOC_002736 // Rinn lincRNA // linc-COL8A1-3 chr3:+:98699901-98701940 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dtq.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dtq.2 cpcScore=-1.1240300 cnci=-0.3839292 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055026 // NONCODE // accn=AK055026 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1838 cpcScore=-1.2096200 cnci=-0.2782726 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036433 // NONCODE // accn=NR_036433 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036433 cpcScore=2.7908400 cnci=-0.3461364 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086243 // NONCODE // accn=AF086243 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000067122 cpcScore=2.7425100 cnci=-0.3607680 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF155111 // NONCODE // accn=AF155111 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000071921 cpcScore=2.5655400 cnci=-0.2521696 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024407 // NONCODE // accn=NR_024407 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024407 cpcScore=1.2962000 cnci=-0.2775965 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dvj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dvj.2 cpcScore=3.8623000 cnci=-0.2107567 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147393 // NONCODE // accn=AF147393 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1839 cpcScore=-1.0138600 cnci=-0.3830114 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033544 // NONCODE // accn=BC033544 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1841 cpcScore=-1.2211000 cnci=-0.3317402 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dwh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dwh.1 cpcScore=0.1692120 cnci=-0.3332782 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015394 // NONCODE // accn=NR_015394 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_015394 cpcScore=-1.0445500 cnci=-0.2858432 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_46 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_46 cpcScore=-1.2951300 cnci=-0.3086626 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00006148-XLOC_002749 // Rinn lincRNA // linc-HHLA2-2 chr3:+:107853893-107857879 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK097806 // NONCODE // accn=AK097806 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1848 cpcScore=-0.9318720 cnci=-0.2974206 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033977 // NONCODE // accn=NR_033977 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033977 cpcScore=-1.0625900 cnci=-0.3581490 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042081 // NONCODE // accn=BC042081 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1850 cpcScore=-1.1806100 cnci=-0.3270689 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125090 // NONCODE // accn=AK125090 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1851 cpcScore=-1.1279100 cnci=-0.3209074 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF143877 // NONCODE // accn=AF143877 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1852 cpcScore=-0.8954120 cnci=-0.2805924 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027862 // NONCODE // accn=AK027862 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1853 cpcScore=-0.1746540 cnci=-0.2913407 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026734 // NONCODE // accn=NR_026734 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026734 cpcScore=4.0536800 cnci=-0.2273264 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092456 // NONCODE // accn=AK092456 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1854 cpcScore=-1.1842400 cnci=-0.2874685 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038936 // NONCODE // accn=NR_038936 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038936 cpcScore=-1.0743400 cnci=-0.2401704 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098102 // NONCODE // accn=AK098102 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1859 cpcScore=-0.7990970 cnci=-0.3834770 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147328 // NONCODE // accn=AF147328 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1860 cpcScore=-1.3802400 cnci=-0.4447500 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000481773 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000481773 cpcScore=3.1108500 cnci=-0.1748396 gene:ENSG00000241490 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493033 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000493033 cpcScore=-0.9184250 cnci=-0.2941468 gene:ENSG00000241490 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098660 // NONCODE // accn=AK098660 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1864 cpcScore=-0.8766580 cnci=-0.2551224 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF131782 // NONCODE // accn=AF131782 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1865 cpcScore=-1.1479300 cnci=-0.3405810 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR598744 // NONCODE // accn=CR598744 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1874 cpcScore=-1.2174800 cnci=-0.3441620 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042737 // NONCODE // accn=BC042737 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1886 cpcScore=-1.3036400 cnci=-0.3901473 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eca.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eca.2 cpcScore=-1.2966400 cnci=-0.3533976 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092064 // NONCODE // accn=AK092064 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1887 cpcScore=-1.0560800 cnci=-0.2959134 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024265 // NONCODE // accn=NR_024265 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024265 cpcScore=5.9046900 cnci=-0.3028048 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1992 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1992 cpcScore=-1.6188300 cnci=-0.2009995 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S67859 // NONCODE // accn=S67859 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1905 cpcScore=4.9438700 cnci=-0.1903046 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036879 // NONCODE // accn=BC036879 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1906 cpcScore=-1.0816000 cnci=-0.3406226 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024618 // NONCODE // accn=NR_024618 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024618 cpcScore=0.5959830 cnci=-0.2836712 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY524664 // NONCODE // accn=AY524664 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1910 cpcScore=-1.0676700 cnci=-0.2247265 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028444 // NONCODE // accn=NR_028444 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028444 cpcScore=2.9440200 cnci=-0.0979936 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042384 // NONCODE // accn=BC042384 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1916 cpcScore=-1.1568200 cnci=-0.2405318 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463408 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000463408 cpcScore=-1.0963300 cnci=-0.1792059 gene:ENSG00000239523 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485162 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000485162 cpcScore=-1.0237900 cnci=-0.2227863 gene:ENSG00000239523 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX648813 // NONCODE // accn=BX648813 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5024 cpcScore=0.3531140 cnci=-0.2538413 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028136 // NONCODE // accn=NR_028136 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028136 cpcScore=-1.0053400 cnci=-0.3206617 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ehd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ehd.2 cpcScore=-0.9904230 cnci=-0.3153501 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK096580 // NONCODE // accn=AK096580 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1921 cpcScore=-1.0163500 cnci=-0.3673631 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033434 // NONCODE // accn=NR_033434 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033434 cpcScore=4.0506000 cnci=-0.2357098 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024250 // NONCODE // accn=NR_024250 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024250 cpcScore=1.9870400 cnci=-0.1383932 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039521 // NONCODE // accn=BC039521 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1954 cpcScore=-1.0396600 cnci=-0.2066378 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500232 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500232 cpcScore=-1.0669400 cnci=-0.1934021 gene:ENSG00000246022 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500525 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500525 cpcScore=-1.0637300 cnci=-0.1724655 gene:ENSG00000246022 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502278 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000502278 cpcScore=-0.9922030 cnci=-0.2020297 gene:ENSG00000246022 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034158 // NONCODE // accn=NR_034158 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034158 cpcScore=2.0917700 cnci=-0.1260219 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126748 // NONCODE // accn=AK126748 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1961 cpcScore=-0.8176490 cnci=-0.1864722 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X87832 // NONCODE // accn=X87832 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1962 cpcScore=19.2526000 cnci=-0.1192334 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR607317 // NONCODE // accn=CR607317 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000286512 cpcScore=-1.1567100 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033429 // NONCODE // accn=NR_033429 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033429 cpcScore=7.8104200 cnci=-0.1312372 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000464242 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000464242 cpcScore=2.9029800 cnci=-0.0946255 gene:ENSG00000244300 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473958 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000473958 cpcScore=-1.2653900 cnci=-1.0000000 gene:ENSG00000244300 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR595360 // NONCODE // accn=CR595360 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1974 cpcScore=-1.0730500 cnci=-0.1686251 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bkp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bkp.1 cpcScore=0.2270730 cnci=-0.2494346 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_124 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_124 cpcScore=-1.3154600 cnci=-0.1689939 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033426 // NONCODE // accn=NR_033426 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033426 cpcScore=8.1831300 cnci=-0.1238826 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR594309 // NONCODE // accn=CR594309 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1978 cpcScore=-1.0771000 cnci=-0.2143632 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bkv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bkv.1 cpcScore=1.0583000 cnci=-0.1480202 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AX747004 // NONCODE // accn=AX747004 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5037 cpcScore=1.0306600 cnci=-0.1752145 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1221 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1221 cpcScore=-1.3131800 cnci=-0.1709997 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030741 // NONCODE // accn=BC030741 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1990 cpcScore=-0.1563520 cnci=-0.4390125 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_022012 // NONCODE // accn=NR_022012 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_022012 cpcScore=17.5057000 cnci=-0.3286454 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086237 // NONCODE // accn=AF086237 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1992 cpcScore=-1.2758800 cnci=-0.5104529 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093567 // NONCODE // accn=AK093567 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5039 cpcScore=-1.1237500 cnci=-0.3111664 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033268 // NONCODE // accn=NR_033268 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033268 cpcScore=2.7426600 cnci=-0.2811811 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085997 // NONCODE // accn=AF085997 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2007 cpcScore=0.1294730 cnci=-0.2607199 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033531 // NONCODE // accn=BC033531 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2043 cpcScore=-1.2682700 cnci=-0.3418847 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003erl.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003erl.1 cpcScore=0.1331760 cnci=-0.4016378 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1146 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1146 cpcScore=-1.5206300 cnci=-0.2802172 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627168 // NONCODE // accn=CR627168 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2045 cpcScore=-0.9200360 cnci=-0.3587815 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1147 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1147 cpcScore=-1.2837500 cnci=-0.1880172 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126672 // NONCODE // accn=AK126672 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2047 cpcScore=1.5170900 cnci=-0.2666026 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1246 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1246 cpcScore=-1.3149400 cnci=-0.2054516 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003eta.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eta.2 cpcScore=3.0175600 cnci=-0.2318360 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1354 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1354 cpcScore=-1.5523700 cnci=-0.4308465 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092200 // NONCODE // accn=AK092200 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2054 cpcScore=-1.1334300 cnci=-0.2834678 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056386 // NONCODE // accn=AK056386 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2060 cpcScore=-1.0456800 cnci=-0.2618717 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC019657 // NONCODE // accn=BC019657 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2064 cpcScore=1.3808900 cnci=-0.3910949 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX721161 // NONCODE // accn=AX721161 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2063 cpcScore=0.0613389 cnci=-0.2911995 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025305 // NONCODE // accn=AK025305 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2066 cpcScore=-1.2841400 cnci=-0.4174984 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037702 // NONCODE // accn=NR_037702 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037702 cpcScore=1.2130900 cnci=-0.3457895 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128163 // NONCODE // accn=AK128163 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2076 cpcScore=-1.0383400 cnci=-0.3633076 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1334 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1334 cpcScore=-1.6348200 cnci=-0.2540389 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1815 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1815 cpcScore=-1.3124800 cnci=-0.4304717 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003exi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003exi.1 cpcScore=0.0053742 cnci=-0.2186259 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036538 // NONCODE // accn=NR_036538 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036538 cpcScore=3.6857800 cnci=-0.3665629 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1501 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1501 cpcScore=-1.2999800 cnci=-0.2267142 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024066 // NONCODE // accn=NR_024066 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024066 cpcScore=-0.9317810 cnci=-0.3335967 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bny.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bny.1 cpcScore=-0.9085120 cnci=-0.3254883 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124913 // NONCODE // accn=AK124913 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2088 cpcScore=-1.1991500 cnci=-0.4554933 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026659 // NONCODE // accn=AK026659 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2090 cpcScore=-1.1970900 cnci=-0.3851256 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1149 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1149 cpcScore=-1.2977300 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1150 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1150 cpcScore=-1.5553200 cnci=-0.2348305 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024016 // NONCODE // accn=NR_024016 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024016 cpcScore=-0.7301680 cnci=-0.2864408 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fck.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fck.2 cpcScore=1.8186800 cnci=-0.3259333 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR612957 // NONCODE // accn=CR612957 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000292152 cpcScore=-0.3570400 cnci=-0.3821928 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130735 // NONCODE // accn=AK130735 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2105 cpcScore=0.3047170 cnci=-0.2670510 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fdp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fdp.1 cpcScore=6.2341400 cnci=-0.1456950 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035116 // NONCODE // accn=BC035116 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2112 cpcScore=-1.1693200 cnci=-0.3990787 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1154 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1154 cpcScore=-1.2960200 cnci=-0.2802895 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000473595 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000473595 cpcScore=-0.4445290 cnci=-0.3295257 gene:ENSG00000240567 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003feg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003feg.2 cpcScore=5.3113300 cnci=-0.3125842 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033702 // NONCODE // accn=NR_033702 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033702 cpcScore=4.2999400 cnci=-0.3888907 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137571 // NONCODE // accn=AL137571 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2122 cpcScore=-1.0170900 cnci=-0.4896082 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085852 // NONCODE // accn=AF085852 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5057 cpcScore=-0.9603710 cnci=-0.3261753 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC007040 // NONCODE // accn=BC007040 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000086729 cpcScore=2.1598500 cnci=-0.2035486 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041913 // NONCODE // accn=BC041913 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2127 cpcScore=-1.0567600 cnci=-0.5068348 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039437 // NONCODE // accn=BC039437 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2129 cpcScore=-1.0755200 cnci=-0.3113024 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1155 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1155 cpcScore=-1.3151000 cnci=-0.2899294 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042089 // NONCODE // accn=BC042089 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2130 cpcScore=0.2961870 cnci=-0.2604227 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR622110 // NONCODE // accn=CR622110 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2131 cpcScore=-1.1474100 cnci=-0.2504639 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126946 // NONCODE // accn=AK126946 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2137 cpcScore=-0.1720520 cnci=-0.2821181 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR622861 // NONCODE // accn=CR622861 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2138 cpcScore=-1.2622600 cnci=-0.4283804 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK021510 // NONCODE // accn=AK021510 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2146 cpcScore=1.2857700 cnci=-0.4677131 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF070579 // NONCODE // accn=AF070579 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2147 cpcScore=-0.6547060 cnci=-0.4018464 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035463 // NONCODE // accn=BC035463 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000093919 cpcScore=-1.2223000 cnci=-0.3618598 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010382 // NONCODE // accn=BC010382 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000087475 cpcScore=1.0551100 cnci=-0.4450412 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075028 // NONCODE // accn=AF075028 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2151 cpcScore=-1.0762400 cnci=-0.3235916 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1158 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1158 cpcScore=-1.3460000 cnci=-0.3733471 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003flo.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003flo.2 cpcScore=-1.0721500 cnci=-0.3046419 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038302 // NONCODE // accn=NR_038302 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038302 cpcScore=0.2139870 cnci=-0.3160317 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_348 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_348 cpcScore=-1.3685000 cnci=-0.2852518 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF002816 // NONCODE // accn=AF002816 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000061695 cpcScore=1.8525300 cnci=-0.0950907 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF244571 // NONCODE // accn=AF244571 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2166 cpcScore=-1.0899900 cnci=-0.3979875 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_324 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_324 cpcScore=-1.3561800 cnci=-0.3444551 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z25428 // NONCODE // accn=Z25428 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000326709 cpcScore=0.6784860 cnci=-0.2251490 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027317 // NONCODE // accn=NR_027317 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027317 cpcScore=5.1954000 cnci=-0.2540280 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U67849 // NONCODE // accn=U67849 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2176 cpcScore=-0.7812190 cnci=-0.1979732 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000541007 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000541007 cpcScore=0.6460940 cnci=-0.2549968 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK127405 // NONCODE // accn=AK127405 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2177 cpcScore=-1.2013600 cnci=-0.3986962 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034062 // NONCODE // accn=NR_034062 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034062 cpcScore=-0.7007690 cnci=-0.2126251 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1159 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1159 cpcScore=-1.3225500 cnci=-0.2934185 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bsh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bsh.1 cpcScore=2.2175900 cnci=-0.2286343 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX641108 // NONCODE // accn=BX641108 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2183 cpcScore=-1.1488800 cnci=-0.3507352 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1160 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1160 cpcScore=-1.3278300 cnci=-0.3500418 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR618967 // NONCODE // accn=CR618967 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2187 cpcScore=-1.0771700 cnci=-0.3460740 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055652 // NONCODE // accn=AK055652 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2188 cpcScore=-1.1308000 cnci=-0.3698997 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1543 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1543 cpcScore=-1.3125800 cnci=-0.1164828 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC005856 // NONCODE // accn=BC005856 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2189 cpcScore=-0.8382670 cnci=-0.3518084 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC005178 // NONCODE // accn=BC005178 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000086478 cpcScore=-1.1429900 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC022840 // NONCODE // accn=BC022840 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2193 cpcScore=3.4671400 cnci=-0.2461808 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033929 // NONCODE // accn=NR_033929 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033929 cpcScore=-1.1599000 cnci=-0.1248882 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fug.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fug.2 cpcScore=-0.9876670 cnci=-0.2575903 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147314 // NONCODE // accn=AF147314 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000071387 cpcScore=-1.1132300 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126698 // NONCODE // accn=AK126698 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2197 cpcScore=-0.3294560 cnci=-0.2728142 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458180 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000458180 cpcScore=2.1542500 cnci=-0.1207552 gene:ENSG00000224614 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024388 // NONCODE // accn=NR_024388 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024388 cpcScore=1.0202700 cnci=-0.1650580 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032042 // NONCODE // accn=BC032042 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2202 cpcScore=-1.1609900 cnci=-0.1436850 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414529 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000414529 cpcScore=1.8843300 cnci=-0.3054826 gene:ENSG00000227375 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430666 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000430666 cpcScore=-1.0327700 cnci=-0.3270446 gene:ENSG00000227375 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1895 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1895 cpcScore=-1.3860700 cnci=-0.1857564 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027840 // NONCODE // accn=NR_027840 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027840 cpcScore=3.4524300 cnci=-0.3558625 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125235 // NONCODE // accn=AK125235 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4682 cpcScore=-1.0823500 cnci=-0.3084260 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026786 // NONCODE // accn=NR_026786 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026786 cpcScore=3.9947600 cnci=-0.2471336 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029457 // NONCODE // accn=BC029457 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1660 cpcScore=-0.8959660 cnci=-0.3019054 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC051706 // NONCODE // accn=BC051706 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1661 cpcScore=-1.1157600 cnci=-0.3236485 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095224 // NONCODE // accn=AK095224 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1663 cpcScore=0.1985760 cnci=-0.2869369 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128230 // NONCODE // accn=BC128230 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389756 cpcScore=-0.8918500 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR004428 // NONCODE // accn=NR004428 class=mRNAlike lncRNA name=EGO ref=lncrnadb transcriptId=424045 cpcScore=-0.7375800 cnci=-0.3149661 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR601020 // NONCODE // accn=CR601020 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1665 cpcScore=1.1348900 cnci=-0.1983902 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1130 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1130 cpcScore=-1.6464700 cnci=-0.2876217 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC009905 // NONCODE // accn=BC009905 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1667 cpcScore=-1.1968600 cnci=-0.3269249 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130986 // NONCODE // accn=AK130986 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1676 cpcScore=-0.7574710 cnci=-0.2713338 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123966 // NONCODE // accn=AK123966 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1677 cpcScore=-0.9132660 cnci=-0.2927124 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003brm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003brm.2 cpcScore=0.0934059 cnci=-0.2959835 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003brp.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003brp.2 cpcScore=-1.0833500 cnci=-0.3770268 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003brr.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003brr.3 cpcScore=0.1880660 cnci=-0.3664563 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hcj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hcj.1 cpcScore=0.1765370 cnci=-0.2905652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029607 // NONCODE // accn=BC029607 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1678 cpcScore=-1.0454600 cnci=-0.2186727 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC113824 // NONCODE // accn=BC113824 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000387198 cpcScore=-1.2600500 cnci=-0.3986320 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003buu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003buu.1 cpcScore=1.7037200 cnci=-0.1497209 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bus.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bus.2 cpcScore=1.1801400 cnci=-0.1853374 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF549562 // NONCODE // accn=EF549562 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000469042 cpcScore=-1.0230400 cnci=-0.1602271 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// EF549565 // NONCODE // accn=EF549565 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000469045 cpcScore=-1.0122200 cnci=-0.1128251 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024132 // NONCODE // accn=NR_024132 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024132 cpcScore=1.8211400 cnci=-0.1639879 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024133 // NONCODE // accn=NR_024133 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024133 cpcScore=1.8035500 cnci=-0.1529100 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024134 // NONCODE // accn=NR_024134 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024134 cpcScore=1.8489100 cnci=-0.1189795 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024135 // NONCODE // accn=NR_024135 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024135 cpcScore=1.9459000 cnci=-0.1321689 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024136 // NONCODE // accn=NR_024136 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024136 cpcScore=2.0267300 cnci=-0.0780998 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EU789555 // NONCODE // accn=EU789555 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000558073 cpcScore=-0.1269770 cnci=-0.0478570 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024272 // NONCODE // accn=NR_024272 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024272 cpcScore=6.0903300 cnci=-0.1123855 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024273 // NONCODE // accn=NR_024273 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024273 cpcScore=5.7115200 cnci=-0.0901357 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR620379 // NONCODE // accn=CR620379 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000299574 cpcScore=-1.0599300 cnci=-0.1744922 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR614960 // NONCODE // accn=CR614960 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000294155 cpcScore=-1.1175600 cnci=-0.1839433 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094210 // NONCODE // accn=AK094210 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1681 cpcScore=-0.9249210 cnci=-0.2387337 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bwp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bwp.1 cpcScore=3.7973600 cnci=-0.2172661 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR591041 // NONCODE // accn=CR591041 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1685 cpcScore=-1.0390900 cnci=-0.1732118 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003byc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003byc.1 cpcScore=-0.0796128 cnci=-0.1323613 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR606596 // NONCODE // accn=CR606596 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1686 cpcScore=-1.0350800 cnci=-0.1857253 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027299 // NONCODE // accn=NR_027299 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027299 cpcScore=12.3111000 cnci=-0.2272134 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056398 // NONCODE // accn=AK056398 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1690 cpcScore=-0.8774780 cnci=-0.2568614 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bze.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bze.1 cpcScore=-1.0808300 cnci=-0.4297590 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003bzf.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bzf.3 cpcScore=1.7279700 cnci=-0.2775177 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bzh.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bzh.3 cpcScore=1.7134800 cnci=-0.2084245 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027927 // NONCODE // accn=NR_027927 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027927 cpcScore=5.6869700 cnci=-0.2154146 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098488 // NONCODE // accn=AK098488 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1695 cpcScore=0.8534360 cnci=-0.2518290 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027178 // NONCODE // accn=AK027178 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4982 cpcScore=-1.0515800 cnci=-0.2797980 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86965 // NONCODE // accn=D86965 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1697 cpcScore=6.3038200 cnci=-0.3014843 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027694 // NONCODE // accn=NR_027694 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027694 cpcScore=8.1625000 cnci=-0.2068881 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK131021 // NONCODE // accn=AK131021 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1701 cpcScore=-1.0133700 cnci=-0.3260323 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB114414 // NONCODE // accn=AB114414 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242351 cpcScore=1.7915100 cnci=-0.2853270 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB114415 // NONCODE // accn=AB114415 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242352 cpcScore=1.0034400 cnci=-0.2518230 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003cej.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003cej.1 cpcScore=-0.8661710 cnci=-0.3650000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1133 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1133 cpcScore=-1.5982800 cnci=-0.4876132 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627096 // NONCODE // accn=CR627096 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1710 cpcScore=-1.0650200 cnci=-0.3359952 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035064 // NONCODE // accn=BC035064 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1711 cpcScore=-0.9301950 cnci=-0.2552007 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035904 // NONCODE // accn=BC035904 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1722 cpcScore=-0.9976140 cnci=-0.2643931 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000449586 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000449586 cpcScore=-0.9448080 cnci=-0.2553683 gene:ENSG00000235257 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024071 // NONCODE // accn=NR_024071 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024071 cpcScore=13.3195000 cnci=-0.1159859 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024024 // NONCODE // accn=NR_024024 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024024 cpcScore=5.9530100 cnci=-0.1763651 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025619 // NONCODE // accn=AK025619 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1729 cpcScore=0.3039660 cnci=-0.2702380 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ310892 // NONCODE // accn=AJ310892 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000247078 cpcScore=2.6795200 cnci=-0.2038910 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AJ310893 // NONCODE // accn=AJ310893 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000247079 cpcScore=2.3961900 cnci=-0.0783379 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC045736 // NONCODE // accn=BC045736 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1750 cpcScore=-1.1121700 cnci=-0.2596997 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC118565 // NONCODE // accn=BC118565 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000387850 cpcScore=-1.4198800 cnci=-0.1978280 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ckb.2 cpcScore=-1.1185700 cnci=-0.2393310 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420850 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000420850 cpcScore=-1.0651900 cnci=-0.2790207 gene:ENSG00000223797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425156 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000425156 cpcScore=-0.1751640 cnci=-0.2595288 gene:ENSG00000223797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439293 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000439293 cpcScore=-1.1505300 cnci=-0.1849191 gene:ENSG00000223797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452768 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000452768 cpcScore=-0.6866880 cnci=-0.2008470 gene:ENSG00000223797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1522 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1522 cpcScore=-1.2999600 cnci=-0.2614677 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ckf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ckf.2 cpcScore=-0.8993700 cnci=-0.2750701 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR595799 // NONCODE // accn=CR595799 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1751 cpcScore=-1.1790300 cnci=-0.4063992 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027753 // NONCODE // accn=NR_027753 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027753 cpcScore=7.7226500 cnci=-0.0822803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC061594 // NONCODE // accn=BC061594 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4994 cpcScore=1.3089500 cnci=-0.3137037 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000447834 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000447834 cpcScore=-1.1492400 cnci=-0.2880781 gene:ENSG00000206552 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK057855 // NONCODE // accn=AK057855 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1770 cpcScore=-0.8119320 cnci=-0.2541323 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL832553 // NONCODE // accn=AL832553 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1772 cpcScore=1.3738200 cnci=-0.2723003 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026206 // NONCODE // accn=AK026206 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1774 cpcScore=3.7107100 cnci=-0.2279148 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427644 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000427644 cpcScore=3.2850000 cnci=-0.2955630 gene:ENSG00000230530 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429798 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000429798 cpcScore=1.1516800 cnci=-0.2187062 gene:ENSG00000230530 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR621874 // NONCODE // accn=CR621874 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1775 cpcScore=-0.1003410 cnci=-0.3230338 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003cpd.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003cpd.1 cpcScore=-0.5315110 cnci=-0.2295818 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB189434 // NONCODE // accn=AB189434 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242542 cpcScore=0.0419608 cnci=-0.1742376 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB189435 // NONCODE // accn=AB189435 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1776 cpcScore=0.1613660 cnci=-0.1387069 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033815 // NONCODE // accn=NR_033815 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033815 cpcScore=9.5968700 cnci=-0.1350098 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011ban.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011ban.1 cpcScore=1.4176500 cnci=-0.1368882 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bao.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bao.1 cpcScore=1.8801500 cnci=-0.1432316 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1127 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1127 cpcScore=-1.7553900 cnci=-0.3592797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036224 // NONCODE // accn=BC036224 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1781 cpcScore=-1.0408500 cnci=-0.2376351 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D83782 // NONCODE // accn=D83782 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1782 cpcScore=17.4385000 cnci=-0.1270985 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR619601 // NONCODE // accn=CR619601 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000298796 cpcScore=-0.8502660 cnci=-0.1398763 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC002903 // NONCODE // accn=BC002903 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1785 cpcScore=-0.9557470 cnci=-0.1318789 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027437 // NONCODE // accn=NR_027437 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027437 cpcScore=1.9461500 cnci=-0.1666596 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF099153 // NONCODE // accn=AF099153 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1787 cpcScore=-1.2567700 cnci=-0.2707258 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010hkr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hkr.2 cpcScore=1.5406200 cnci=-0.2013663 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028435 // NONCODE // accn=NR_028435 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028435 cpcScore=3.1460900 cnci=-0.1846873 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D87452 // NONCODE // accn=D87452 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1789 cpcScore=6.4536400 cnci=-0.1952810 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF470865 // NONCODE // accn=EF470865 class=mRNAlike lncRNA name=LUST ref=lncRNAdb transcriptId=343025 cpcScore=-1.2912500 cnci=-0.3683733 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125500 // NONCODE // accn=AK125500 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1794 cpcScore=-0.0204290 cnci=-0.2109042 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ844620 // NONCODE // accn=AJ844620 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000249424 cpcScore=1.1926800 cnci=-0.2542402 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094677 // NONCODE // accn=AK094677 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1795 cpcScore=0.4561300 cnci=-0.2499654 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027476 // NONCODE // accn=NR_027476 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027476 cpcScore=3.1673400 cnci=-0.1290555 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027331 // NONCODE // accn=NR_027331 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027331 cpcScore=1.5195200 cnci=-0.1526720 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK127918 // NONCODE // accn=AK127918 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1797 cpcScore=0.5958900 cnci=-0.1556658 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC044724 // NONCODE // accn=BC044724 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1798 cpcScore=-0.8172160 cnci=-0.2404307 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D87462 // NONCODE // accn=D87462 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1799 cpcScore=9.9077300 cnci=-0.1988318 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX746575 // NONCODE // accn=AX746575 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1801 cpcScore=1.0278300 cnci=-0.1936019 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dgd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dgd.2 cpcScore=-0.7511750 cnci=-0.2464797 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025344 // NONCODE // accn=AK025344 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4998 cpcScore=-0.3350680 cnci=-0.2725560 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095091 // NONCODE // accn=AK095091 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1802 cpcScore=-0.4658300 cnci=-0.2936101 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR620976 // NONCODE // accn=CR620976 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1803 cpcScore=-0.9982430 cnci=-0.3058790 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dhj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dhj.2 cpcScore=1.4096900 cnci=-0.1942580 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092143 // NONCODE // accn=AK092143 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1804 cpcScore=-0.9261670 cnci=-0.2543899 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dhs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dhs.2 cpcScore=4.1975200 cnci=-0.2454127 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC127807 // NONCODE // accn=BC127807 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389427 cpcScore=-1.1256600 cnci=-0.2824878 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U53532 // NONCODE // accn=U53532 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1807 cpcScore=4.0654000 cnci=-0.3280633 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147413 // NONCODE // accn=AF147413 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1810 cpcScore=-0.5565130 cnci=-0.2132609 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041347 // NONCODE // accn=BC041347 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1812 cpcScore=-0.7371720 cnci=-0.1952299 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033384 // NONCODE // accn=NR_033384 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033384 cpcScore=6.2535600 cnci=-0.3095605 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dkz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dkz.2 cpcScore=3.0547300 cnci=-0.3341499 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR623108 // NONCODE // accn=CR623108 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1815 cpcScore=-0.9948750 cnci=-0.3107767 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bfh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bfh.1 cpcScore=1.6423300 cnci=-0.2776299 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000469148 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000469148 cpcScore=-1.1466900 cnci=-0.3379711 gene:ENSG00000241472 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056866 // NONCODE // accn=AK056866 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1820 cpcScore=-0.1315310 cnci=-0.2760042 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX647714 // NONCODE // accn=BX647714 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1822 cpcScore=-1.0797900 cnci=-0.3266933 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017925 // NONCODE // accn=BC017925 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000089468 cpcScore=2.7551100 cnci=-0.2623250 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB006988 // NONCODE // accn=AB006988 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058120 cpcScore=-0.8420020 cnci=-0.1387668 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF143326 // NONCODE // accn=AF143326 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1826 cpcScore=-1.2763100 cnci=-0.3919819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY562502 // NONCODE // accn=AY562502 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1827 cpcScore=-0.9794160 cnci=-0.1804492 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003dou.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003dou.2 cpcScore=-1.1177300 cnci=-0.3934870 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1139 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1139 cpcScore=-1.5233000 cnci=-0.2866072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1128 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1128 cpcScore=-1.5442700 cnci=-0.2708368 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX648121 // NONCODE // accn=BX648121 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1831 cpcScore=-1.0068200 cnci=-0.2439979 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK021633 // NONCODE // accn=AK021633 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1832 cpcScore=-1.2666000 cnci=-0.2765594 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1654 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1654 cpcScore=-1.2875000 cnci=-0.2040222 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024241 // NONCODE // accn=NR_024241 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024241 cpcScore=5.9319800 cnci=-0.1365180 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1581 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1581 cpcScore=-1.3645400 cnci=-0.1281358 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1969 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1969 cpcScore=-1.5378900 cnci=-0.2569466 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB083192 // NONCODE // accn=AB083192 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000061404 cpcScore=4.4440300 cnci=-0.2448033 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1609 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1609 cpcScore=-1.3680000 cnci=-0.2774263 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC007117 // NONCODE // accn=BC007117 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000086746 cpcScore=1.5601900 cnci=-0.3065043 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1463 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1463 cpcScore=-1.2651900 cnci=-0.2992624 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00006568-XLOC_003195 // Rinn lincRNA // linc-RPL24-1 chr3:-:104536325-104626299 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627153 // NONCODE // accn=CR627153 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1840 cpcScore=-1.0581700 cnci=-0.4146319 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1141 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1141 cpcScore=-1.4738100 cnci=-0.4065723 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1596 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1596 cpcScore=-1.4283300 cnci=-0.3568232 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC045680 // NONCODE // accn=BC045680 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1844 cpcScore=-1.0030400 cnci=-0.3140401 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015772 // NONCODE // accn=BC015772 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1849 cpcScore=-1.1095100 cnci=-0.2522497 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1811 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1811 cpcScore=-1.3147100 cnci=-0.2170152 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_155 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_155 cpcScore=-1.3817900 cnci=-0.4070197 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095739 // NONCODE // accn=AK095739 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5007 cpcScore=-0.3675210 cnci=-0.3584245 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1142 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1142 cpcScore=-1.5197200 cnci=-0.3788230 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027794 // NONCODE // accn=NR_027794 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027794 cpcScore=5.0633500 cnci=-0.3369895 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124247 // NONCODE // accn=AK124247 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1862 cpcScore=-1.0325300 cnci=-0.3010856 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY228454 // NONCODE // accn=AY228454 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000085399 cpcScore=-1.3357000 cnci=-0.3162540 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY228457 // NONCODE // accn=AY228457 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000085402 cpcScore=-1.3100800 cnci=-0.2747943 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY228458 // NONCODE // accn=AY228458 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000085403 cpcScore=-1.3212600 cnci=-0.1975642 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL049423 // NONCODE // accn=AL049423 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1866 cpcScore=-1.1859700 cnci=-0.2572742 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1143 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1143 cpcScore=-1.2491200 cnci=-0.2846025 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ebh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ebh.1 cpcScore=-1.1882800 cnci=-0.2165589 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1724 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1724 cpcScore=-1.3737700 cnci=-0.2384927 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ebs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ebs.2 cpcScore=-1.2521600 cnci=-0.3504875 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1280 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1280 cpcScore=-1.5370900 cnci=-0.4047858 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1988 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1988 cpcScore=-1.4186100 cnci=-0.3291785 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003edb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003edb.1 cpcScore=-1.2924500 cnci=-0.4581095 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY123976 // NONCODE // accn=AY123976 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000084572 cpcScore=0.5135090 cnci=-0.1965516 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR615239 // NONCODE // accn=CR615239 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000294434 cpcScore=2.1296700 cnci=-0.2251051 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056809 // NONCODE // accn=AK056809 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1893 cpcScore=-0.5479550 cnci=-0.3828602 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026698 // NONCODE // accn=NR_026698 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026698 cpcScore=8.1665200 cnci=-0.3248800 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// S75295 // NONCODE // accn=S75295 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1908 cpcScore=9.7113900 cnci=-0.3053068 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042374 // NONCODE // accn=BC042374 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1909 cpcScore=-1.0350000 cnci=-0.3776535 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010hrq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010hrq.1 cpcScore=-1.1563600 cnci=-0.3114283 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033713 // NONCODE // accn=BC033713 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1917 cpcScore=-0.9051580 cnci=-0.3256371 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Y09530 // NONCODE // accn=Y09530 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325527 cpcScore=2.2339700 cnci=-0.0470985 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ642691 // NONCODE // accn=DQ642691 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000392990 cpcScore=1.1553000 cnci=-0.0913166 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ642692 // NONCODE // accn=DQ642692 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000392991 cpcScore=0.7861810 cnci=-0.0974509 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123736 // NONCODE // accn=AK123736 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1922 cpcScore=-1.0925600 cnci=-0.2737286 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016316 // NONCODE // accn=BC016316 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1951 cpcScore=-1.0507600 cnci=-0.4515793 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137447 // NONCODE // accn=AL137447 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1952 cpcScore=-1.2487500 cnci=-0.3855686 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033989 // NONCODE // accn=BC033989 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1955 cpcScore=-1.1263100 cnci=-0.2124229 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095149 // NONCODE // accn=AK095149 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1956 cpcScore=-1.2148000 cnci=-0.2270072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR602639 // NONCODE // accn=CR602639 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5035 cpcScore=-0.5561260 cnci=-0.1616991 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034179 // NONCODE // accn=NR_034179 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034179 cpcScore=3.0093000 cnci=-0.1534994 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_178 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_178 cpcScore=-1.3983200 cnci=-0.1156090 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1144 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1144 cpcScore=-1.4312200 cnci=-0.1652374 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003emc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003emc.1 cpcScore=-0.4449350 cnci=-0.2352226 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124746 // NONCODE // accn=AK124746 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1989 cpcScore=-1.1499600 cnci=-0.2284620 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033361 // NONCODE // accn=NR_033361 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033361 cpcScore=8.8137400 cnci=-0.2502908 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043572 // NONCODE // accn=BC043572 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=1993 cpcScore=-0.6737620 cnci=-0.2954289 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038976 // NONCODE // accn=NR_038976 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038976 cpcScore=-0.7193970 cnci=-0.3289949 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eoc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eoc.1 cpcScore=-0.7053850 cnci=-0.3233396 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123415 // NONCODE // accn=AK123415 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5040 cpcScore=-1.2573400 cnci=-0.4086837 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002985 // NONCODE // accn=NR_002985 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002985 cpcScore=-1.0492300 cnci=-0.3498407 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY257867 // NONCODE // accn=AY257867 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000251270 cpcScore=1.4576400 cnci=-0.3457126 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037804 // NONCODE // accn=NR_037804 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037804 cpcScore=14.2283000 cnci=-0.2590850 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037929 // NONCODE // accn=BC037929 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2004 cpcScore=-1.2923100 cnci=-0.3615244 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040919 // NONCODE // accn=BC040919 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2005 cpcScore=-0.9605290 cnci=-0.2286148 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC007984 // NONCODE // accn=BC007984 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2006 cpcScore=-1.1231600 cnci=-0.2942562 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D87448 // NONCODE // accn=D87448 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2008 cpcScore=14.6602000 cnci=-0.3807615 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL133627 // NONCODE // accn=AL133627 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2009 cpcScore=-1.0623900 cnci=-0.3929611 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026713 // NONCODE // accn=AK026713 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2017 cpcScore=-1.0374300 cnci=-0.2891481 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037842 // NONCODE // accn=BC037842 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2018 cpcScore=-0.9077850 cnci=-0.2217805 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL080075 // NONCODE // accn=AL080075 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2048 cpcScore=-1.1607700 cnci=-0.4079982 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128202 // NONCODE // accn=AK128202 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2051 cpcScore=-1.1622900 cnci=-0.2122555 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477059 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000477059 cpcScore=-0.7472250 cnci=-0.2144120 gene:ENSG00000244578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483650 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000483650 cpcScore=-1.0281300 cnci=-0.1753292 gene:ENSG00000244578 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC019896 // NONCODE // accn=BC019896 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000089996 cpcScore=3.6311400 cnci=-0.0168221 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bmu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bmu.1 cpcScore=-1.0559800 cnci=-0.3681730 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023350 // NONCODE // accn=NR_023350 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_023350 cpcScore=8.3753800 cnci=-0.2712886 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M36809 // NONCODE // accn=M36809 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000195697 cpcScore=1.6548500 cnci=-0.2196511 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL133103 // NONCODE // accn=AL133103 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2059 cpcScore=-1.0127900 cnci=-0.3463096 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL833512 // NONCODE // accn=AL833512 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5049 cpcScore=7.6318600 cnci=-0.3595492 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX537540 // NONCODE // accn=BX537540 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2065 cpcScore=1.3600800 cnci=-0.2417265 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003euj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003euj.1 cpcScore=-0.0638581 cnci=-0.1650067 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033289 // NONCODE // accn=NR_033289 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033289 cpcScore=4.3499400 cnci=-0.3539287 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ173461 // NONCODE // accn=DQ173461 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000342068 cpcScore=-1.1167200 cnci=-0.3693701 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093381 // NONCODE // accn=AK093381 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2074 cpcScore=2.1185900 cnci=-0.2555690 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040051 // NONCODE // accn=BC040051 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2075 cpcScore=-1.0894800 cnci=-0.2185685 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034032 // NONCODE // accn=NR_034032 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034032 cpcScore=-1.1025600 cnci=-0.2516589 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF132204 // NONCODE // accn=AF132204 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2077 cpcScore=-0.0346050 cnci=-0.4389568 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129941 // NONCODE // accn=AK129941 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2078 cpcScore=-1.0711200 cnci=-0.3916172 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL110176 // NONCODE // accn=AL110176 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2079 cpcScore=-1.0728200 cnci=-0.4042091 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY962470 // NONCODE // accn=AY962470 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000333393 cpcScore=-1.3047100 cnci=-0.3034218 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK095172 // NONCODE // accn=AK095172 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2080 cpcScore=-1.1303000 cnci=-0.3957269 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033118 // NONCODE // accn=NR_033118 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033118 cpcScore=0.5404500 cnci=-0.2717276 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029507 // NONCODE // accn=BC029507 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2082 cpcScore=3.5861500 cnci=-0.0554764 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U79264 // NONCODE // accn=U79264 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2083 cpcScore=-0.6134230 cnci=-0.1572870 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK027233 // NONCODE // accn=AK027233 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2084 cpcScore=2.5050000 cnci=-0.2153410 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037912 // NONCODE // accn=BC037912 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2085 cpcScore=-0.9065030 cnci=-0.3445473 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036355 // NONCODE // accn=BC036355 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2087 cpcScore=-0.8436170 cnci=-0.1105997 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1148 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1148 cpcScore=-1.4311400 cnci=-0.3545060 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003eye.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003eye.1 cpcScore=0.0933916 cnci=-0.3653085 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027037 // NONCODE // accn=NR_027037 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027037 cpcScore=3.6874300 cnci=-0.3450271 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF111846 // NONCODE // accn=AF111846 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2089 cpcScore=-1.3028000 cnci=-0.4626606 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ezu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ezu.1 cpcScore=1.8812000 cnci=-0.4152535 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094605 // NONCODE // accn=AK094605 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2091 cpcScore=-1.1892000 cnci=-0.4888095 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY255534 // NONCODE // accn=AY255534 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2092 cpcScore=5.8827700 cnci=-0.0708501 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_165 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_165 cpcScore=-1.5539000 cnci=-0.2399812 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK096620 // NONCODE // accn=AK096620 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2094 cpcScore=11.7467000 cnci=-0.2990515 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR605930 // NONCODE // accn=CR605930 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2095 cpcScore=-1.0205100 cnci=-0.3561868 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033324 // NONCODE // accn=BC033324 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2098 cpcScore=6.8873300 cnci=-0.2199824 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fay.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fay.1 cpcScore=7.3836600 cnci=-0.3083062 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1151 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1151 cpcScore=-1.3574000 cnci=-0.2127178 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1152 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1152 cpcScore=-1.2919400 cnci=-0.3782150 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1224 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1224 cpcScore=-1.3114800 cnci=-0.3439579 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF038199 // NONCODE // accn=AF038199 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2110 cpcScore=-0.4221420 cnci=-0.3089381 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1153 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1153 cpcScore=-1.3319200 cnci=-0.3722150 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY077740 // NONCODE // accn=AY077740 class=scaRNA name=U90 ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.6129707 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037882 // NONCODE // accn=BC037882 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2111 cpcScore=-1.0900500 cnci=-0.2779352 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF487423 // NONCODE // accn=AF487423 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000080568 cpcScore=-1.0580000 cnci=-0.3135748 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF047386 // NONCODE // accn=AF047386 class=telomerase RNA name=TR ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.3222800 cnci=-0.0863699 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U85256 // NONCODE // accn=U85256 class=telomerase RNA name=telomerase RNA ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.0705824 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U86046 // NONCODE // accn=U86046 class=telomerase RNA name=hTR ref=NONCODE v2.0 transcriptId=NULL cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.0853395 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC026001 // NONCODE // accn=BC026001 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2124 cpcScore=-1.0473100 cnci=-0.4294307 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fgn.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fgn.1 cpcScore=-0.1579910 cnci=-0.3729709 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027767 // NONCODE // accn=NR_027767 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027767 cpcScore=0.0147759 cnci=-0.1891186 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF116657 // NONCODE // accn=AF116657 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2132 cpcScore=1.4109400 cnci=-0.2221675 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033994 // NONCODE // accn=NR_033994 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033994 cpcScore=3.1503400 cnci=-0.3031873 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085992 // NONCODE // accn=AF085992 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2140 cpcScore=1.4816400 cnci=-0.3016567 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1156 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1156 cpcScore=-1.3492300 cnci=-0.3635993 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036682 // NONCODE // accn=BC036682 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5058 cpcScore=-1.2594700 cnci=-0.2783641 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_174 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_174 cpcScore=-1.5760500 cnci=-0.3682952 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00006710-XLOC_003330 // Rinn lincRNA // linc-SPATA16-2 chr3:-:176018235-176037166 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041880 // NONCODE // accn=BC041880 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2141 cpcScore=-0.5450680 cnci=-0.3456165 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fja.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fja.1 cpcScore=-0.8401570 cnci=-0.2176760 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF279780 // NONCODE // accn=AF279780 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2143 cpcScore=-1.2283300 cnci=-0.3444785 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421498 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000421498 cpcScore=-1.1427400 cnci=-0.5214889 gene:ENSG00000237978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425330 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000425330 cpcScore=-0.9201450 cnci=-0.3088799 gene:ENSG00000237978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432385 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000432385 cpcScore=-1.1003100 cnci=-0.3592766 gene:ENSG00000237978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437488 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000437488 cpcScore=-1.1971000 cnci=-0.2979167 gene:ENSG00000237978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451742 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000451742 cpcScore=-1.1810100 cnci=-0.3573903 gene:ENSG00000237978 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U61097 // NONCODE // accn=U61097 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000220665 cpcScore=-0.8577860 cnci=-0.4972154 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fjc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fjc.1 cpcScore=-1.1871100 cnci=-0.2785119 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1157 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1157 cpcScore=-1.3675000 cnci=-0.4221677 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036485 // NONCODE // accn=BC036485 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2144 cpcScore=-1.1767400 cnci=-0.4075087 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028135 // NONCODE // accn=NR_028135 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028135 cpcScore=4.1673500 cnci=-0.2030834 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL831863 // NONCODE // accn=AL831863 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2148 cpcScore=-1.1734200 cnci=-0.3944559 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR590377 // NONCODE // accn=CR590377 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2152 cpcScore=-1.0453800 cnci=-0.4487551 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017990 // NONCODE // accn=BC017990 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2155 cpcScore=0.4363470 cnci=-0.2949783 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1450 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1450 cpcScore=-1.3616500 cnci=-0.3405044 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB014683 // NONCODE // accn=AB014683 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058366 cpcScore=0.7157330 cnci=-1.0000000 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_225 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_225 cpcScore=-1.2765400 cnci=-0.3540006 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L36869 // NONCODE // accn=L36869 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000193275 cpcScore=1.3447700 cnci=-0.1210874 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039344 // NONCODE // accn=BC039344 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2174 cpcScore=-1.3453600 cnci=-0.2904803 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036509 // NONCODE // accn=BC036509 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2175 cpcScore=-0.0770275 cnci=-0.2782853 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033519 // NONCODE // accn=NR_033519 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033519 cpcScore=6.3545100 cnci=-0.1579155 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042414 // NONCODE // accn=BC042414 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2182 cpcScore=-0.9767840 cnci=-0.2668358 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1553 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1553 cpcScore=-1.4660100 cnci=-0.3214234 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bss.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bss.1 cpcScore=2.5875600 cnci=-0.3109794 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1161 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1161 cpcScore=-1.3098700 cnci=-0.3727178 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bsy.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bsy.1 cpcScore=-1.0658400 cnci=-0.1878029 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bsz.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bsz.1 cpcScore=-1.0351300 cnci=-0.2207574 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bta.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bta.1 cpcScore=2.1670400 cnci=-0.0894759 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR597873 // NONCODE // accn=CR597873 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5062 cpcScore=-1.1907800 cnci=-0.1984302 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF058804 // NONCODE // accn=AF058804 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000064809 cpcScore=-0.8819030 cnci=-0.0161171 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF177925 // NONCODE // accn=AF177925 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000072731_03 cpcScore=1.9245000 cnci=-0.0315219 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC024743 // NONCODE // accn=BC024743 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5064 cpcScore=0.1348470 cnci=-0.2655063 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1808 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1808 cpcScore=-1.6592400 cnci=-0.1468954 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC121820 // NONCODE // accn=BC121820 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000388413 cpcScore=-1.0171100 cnci=-0.2021941 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126102 // NONCODE // accn=AK126102 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5063 cpcScore=-0.8480160 cnci=-0.3063862 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003264 // NONCODE // accn=NR_003264 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003264 cpcScore=11.0178000 cnci=-0.1097604 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1452 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1452 cpcScore=-1.2992700 cnci=-0.1251462 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1669 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1669 cpcScore=-1.5271600 cnci=-0.1018072 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fwf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fwf.1 cpcScore=-0.4361260 cnci=-0.2981330 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015348 // NONCODE // accn=BC015348 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000088632 cpcScore=1.5305700 cnci=-0.0534326 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037950 // NONCODE // accn=NR_037950 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037950 cpcScore=3.4810300 cnci=-0.1570860 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010iag.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iag.1 cpcScore=-1.1948800 cnci=-0.4209976 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
K03200 // NONCODE // accn=K03200 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000191417 cpcScore=-1.1336600 cnci=-0.3071822 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fxi.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fxi.2 cpcScore=2.4174700 cnci=-0.1719687 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC011766 // NONCODE // accn=BC011766 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5065 cpcScore=-0.9379370 cnci=-0.3011501 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1387 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1387 cpcScore=-1.8400900 cnci=-0.1959485 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_2048 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2048 cpcScore=-1.3211400 cnci=-0.6215262 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00006773-XLOC_003406 // Rinn lincRNA // linc-BDH1-2 chr3:-:197374633-197381275 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86979 // NONCODE // accn=D86979 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2210 cpcScore=11.9829000 cnci=-0.2330352 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003fyx.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003fyx.3 cpcScore=3.5462200 cnci=-0.3542832 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iat.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iat.2 cpcScore=3.8585900 cnci=-0.3555227 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002786 // RefSeq // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector c pseudogene (CIDECP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10014238:10026357:-1 gene:ENSG00000186162 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043599 // GenBank // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector c, mRNA (cDNA clone IMAGE:5204770), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bus.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector c pseudogene (CIDECP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003buu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector c pseudogene (CIDECP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bus.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003bus.2 cpcScore=1.1801400 cnci=-0.1853374 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018447 // RefSeq // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 3 (EMC3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000245046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9962537:9987120:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9973506:9986682:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9969729:9978297:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK222953 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 30 kDa protein variant, clone: HSI00133. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022807 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 111, mRNA (cDNA clone MGC:39153 IMAGE:4897577), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250532 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9962537:9987120:-1 Gene:OTTHUMG00000128652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9968644:9986838:-1 Gene:OTTHUMG00000128652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339887 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9969729:9978297:-1 Gene:OTTHUMG00000128652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000339888 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:9973506:9986682:-1 Gene:OTTHUMG00000128652 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003bun.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 3 (EMC3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003buo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 3 (EMC3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000097 // RefSeq // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98579442:98593723:-1 gene:ENSG00000080819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299692 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56733 complete cds, highly similar to Coproporphyrinogen III oxidase, mitochondrial precursor (EC 1.3.3.3). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017210 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:10533 IMAGE:3956896), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023551 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:19660 IMAGE:3161428), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023554 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:19736 IMAGE:3607724), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358900 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98579442:98593723:-1 Gene:OTTHUMG00000160016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358901 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98590519:98593610:-1 Gene:OTTHUMG00000160016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98589662:98593648:-1 Gene:OTTHUMG00000160016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358903 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:98581408:98585862:-1 Gene:OTTHUMG00000160016 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dsx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bgz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001205272 // RefSeq // Homo sapiens KRAB box domain containing 1 (KRBOX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000383748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:42936360:42942792:1 gene:ENSG00000240747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418176 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:42936862:42942792:1 gene:ENSG00000240747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC118662 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 41, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022124). // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344234 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42936360:42942792:1 Gene:OTTHUMG00000186062 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344236 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42936862:42942792:1 Gene:OTTHUMG00000186062 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344255 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:42941193:42942789:1 Gene:OTTHUMG00000186062 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cmm.4 // UCSC Genes // Homo sapiens KRAB box domain containing 1 (KRBOX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cmn.4 // UCSC Genes // Homo sapiens KRAB box domain containing 1 (KRBOX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003278 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member B (CLEC3B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45026183:45036071:1 gene:ENSG00000163815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428034 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45030130:45036068:1 gene:ENSG00000163815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011024 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member B, mRNA (cDNA clone MGC:13592 IMAGE:4042921), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256745 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45026183:45036071:1 Gene:OTTHUMG00000133087 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346993 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:45030130:45036068:1 Gene:OTTHUMG00000133087 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cok.4 // UCSC Genes // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member B (CLEC3B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038213 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F5 pseudogene (IQCF4), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038214 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F5 pseudogene (IQCF4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038215 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F5 pseudogene (IQCF4), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51818032:51819635:1 gene:ENSG00000224792 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wyw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F5 pseudogene (IQCF4), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wyx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing F5 pseudogene (IQCF4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080393 // RefSeq // Homo sapiens glucoside xylosyltransferase 2 (GXYLT2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000389617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:72888073:72976926:1 gene:ENSG00000172986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127733 // GenBank // Homo sapiens glycosyltransferase 8 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:157837 IMAGE:40127813), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352318 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72888073:72976926:1 Gene:OTTHUMG00000158815 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352319 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:72908022:72955181:1 Gene:OTTHUMG00000158815 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003dpg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glucoside xylosyltransferase 2 (GXYLT2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198565 // RefSeq // Homo sapiens negative regulator of reactive oxygen species (NRROS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196639686:196662004:1 gene:ENSG00000174004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC044233 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:50789 IMAGE:5725567), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340676 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196639686:196662004:1 Gene:OTTHUMG00000155569 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000340677 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:196639757:196654993:1 Gene:OTTHUMG00000155569 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003fwv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 33 (LRRC33), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000419104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198110112:198111566:1 gene:ENSG00000232783 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033199 // RefSeq // Homo sapiens urocortin 2 (UCN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48561727:48563773:-1 gene:ENSG00000145040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002647 // GenBank // Homo sapiens urocortin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4274 IMAGE:3606964), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022096 // GenBank // Homo sapiens urocortin 2, mRNA (cDNA clone MGC:17394 IMAGE:3916164), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257510 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:48561727:48563773:-1 Gene:OTTHUMG00000133533 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cty.1 // UCSC Genes // Homo sapiens urocortin 2 (UCN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens urocortin 2 (UCN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198562 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62 (C3orf62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK096799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39480 fis, clone PROST2014422. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053629 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:61663 IMAGE:6204001), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC061697 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:62079 IMAGE:6737728), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000345991 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49268602:49274534:-1 Gene:OTTHUMG00000156819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346082 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:49271203:49276842:-1 Gene:OTTHUMG00000156819 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cwm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62 (C3orf62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cwn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62 (C3orf62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001174136 // RefSeq // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003212 // RefSeq // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:46574555:46582460:1 gene:ENSG00000241186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022393 // GenBank // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:24110 IMAGE:4615416), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067844 // GenBank // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:87434 IMAGE:5286020), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296145 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold134:824956:828526:+ gene:ENSG00000241186 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257378 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46577237:46582463:1 Gene:OTTHUMG00000133482 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344222 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46577765:46579642:1 Gene:OTTHUMG00000133482 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344223 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46579142:46579779:1 Gene:OTTHUMG00000133482 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344224 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46577748:46579936:1 Gene:OTTHUMG00000133482 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cpv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004267 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2 (CHST2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105010 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:132670 IMAGE:8144013), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309575 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold247:2200209:2201303:- gene:ENSG00000175040 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354850 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:143119331:143122958:1 Gene:OTTHUMG00000159351 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003evm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2 (CHST2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xex.1 // UCSC Genes // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2 (CHST2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001205271 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 46 (PRSS46), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_013270 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 50 (PRSS50), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:46712116:46717883:-1 gene:ENSG00000206549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455218 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:3:46753605:46777919:-1 gene:ENSG00000206549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:46719583:46736429:-1 gene:ENSG00000261603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033016 // GenBank // Homo sapiens testes-specific protease 50, mRNA (cDNA clone MGC:26854 IMAGE:4822455), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037775 // GenBank // Homo sapiens testes-specific protease 50, mRNA (cDNA clone MGC:41840 IMAGE:5272458), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000344502 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46719583:46736429:-1 Gene:OTTHUMG00000177121 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cqe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 50 (PRSS50), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021wxf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 46 (PRSS46), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK097666 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40347 fis, clone TESTI2033254, highly similar to Testis-specific protease-like protein 50 precursor. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003cqf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 50 (PRSS50), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_199183 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 45 (PRSS45), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46742350:46744755:-1 gene:ENSG00000188086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC133695 // GenBank // Homo sapiens testis serine protease 5, mRNA (cDNA clone MGC:156308 IMAGE:40126663), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000354558 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46742350:46744755:-1 Gene:OTTHUMG00000133480 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010hjl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 45 (PRSS45), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46809359:46812558:-1 gene:ENSG00000226074 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000336350 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46809359:46812558:-1 Gene:OTTHUMG00000154622 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000377050 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:46809498:46811341:-1 Gene:OTTHUMG00000154622 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005861 // RefSeq // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_002958 // RefSeq // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296084 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:133875978:133969494:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427044 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:133875978:133969689:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357158 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134157133:134250593:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357159 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134183002:134195339:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357160 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134175703:134183403:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357161 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134159283:134191916:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357162 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134202537:134207525:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357163 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:134157134:134181672:-1 Gene:OTTHUMG00000159750 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eqc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eqd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000490344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:146391363:146416603:-1 gene:ENSG00000241358 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000397891 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:3:150588832:150612089:-1 gene:ENSG00000214237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465419 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:150871045:150891060:-1 gene:ENSG00000214237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HM626137 // GenBank // Homo sapiens clarin-1 transcript variant 12 (CLRN1) mRNA, partial sequence, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HM626139 // GenBank // Homo sapiens clarin-1 transcript variant 14 (CLRN1) mRNA, partial sequence, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150871045:150891060:-1 Gene:OTTHUMG00000159843 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:3:150901154:150903394:-1 Gene:OTTHUMG00000159848 // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003eyj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens clarin 1 (CLRN1), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clarin 1 (CLRN1), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xfr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clarin 1 (CLRN1), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:150901154:150903394:-1 gene:ENSG00000244382 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384911 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:65125:65233:1 gene:ENSG00000207643 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:136461:136568:1 gene:ENSG00000211553 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027481 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 876, pseudogene (ZNF876P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:212610:255985:1 gene:ENSG00000198155 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iba.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iba.2 cpcScore=4.8969800 cnci=-0.3628406 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iba.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516807 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:224215:224323:1 gene:ENSG00000252616 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384910 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:350157:350252:1 gene:ENSG00000207642 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390148 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:409809:409915:1 gene:ENSG00000211482 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000542026 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000542026 cpcScore=-1.0180100 cnci=-0.2410020 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391156 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:1118884:1119013:1 gene:ENSG00000212458 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000373984 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:1356581:1358075:1 Gene:OTTHUMG00000163525 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1356581:1358075:1 gene:ENSG00000254094 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000373985 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:1358479:1359461:1 Gene:OTTHUMG00000163526 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1358479:1359461:1 gene:ENSG00000253399 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175918 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich PAK1 inhibitor (CRIPAK), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:1391552:1395989:1 gene:ENSG00000179979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382944 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:1388321:1389640:1 gene:ENSG00000179979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000241607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:1391552:1395989:1 Gene:OTTHUMG00000121131 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gdf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-rich PAK1 inhibitor (CRIPAK), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003004 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 22 (SCARNA22), guide RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503991 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:1974636:1974760:1 gene:ENSG00000249784 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516197 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:1976363:1976487:1 gene:ENSG00000252006 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366204 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:4:1976363:1976487:1 Gene:OTTHUMG00000161833 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gej.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 22 (SCARNA22), guide RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gej.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gej.2 cpcScore=-1.1794700 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001141936 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 48 (C4orf48), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001168243 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 48 (C4orf48), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382878 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:2043689:2045697:1 gene:ENSG00000243449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:2041993:2043970:1 gene:ENSG00000243449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409860 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:2042050:2043964:1 gene:ENSG00000243449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000335536 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:2041993:2043970:1 Gene:OTTHUMG00000154503 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000335537 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:2042050:2043964:1 Gene:OTTHUMG00000154503 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gep.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 48 (C4orf48), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xkn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 48 (C4orf48), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178557 // RefSeq // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative) (NAT8L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2059812:2069089:1 gene:ENSG00000185818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:2059512:2069088:1 gene:ENSG00000185818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093906 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:120941 IMAGE:7939751), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093908 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:120943 IMAGE:7939753), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103748 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:117272 IMAGE:6195512), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000241636 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:2059812:2069089:1 Gene:OTTHUMG00000121151 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003geq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative) (NAT8L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000360902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:2463797:2464124:1 Gene:OTTHUMG00000160511 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2463797:2464124:1 gene:ENSG00000248399 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362465 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:3044101:3044207:1 gene:ENSG00000199335 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042690 // RefSeq // Homo sapiens Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (MSANTD1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:3247476:3256303:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507492 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3244369:3256613:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510580 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3249159:3262541:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358238 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3244369:3256613:1 Gene:OTTHUMG00000159977 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358239 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3249040:3271738:1 Gene:OTTHUMG00000159977 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3247476:3256303:1 Gene:OTTHUMG00000159977 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000370925 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3249159:3262541:1 Gene:OTTHUMG00000159977 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ggs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (MSANTD1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001528 // RefSeq // Homo sapiens HGF activator (HGFAC), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:3441887:3449495:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511533 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3441975:3449419:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK314099 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94782. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112190 // GenBank // Homo sapiens HGF activator, mRNA (cDNA clone MGC:138395 IMAGE:8327658), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000206607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3441887:3449495:1 Gene:OTTHUMG00000090281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3444349:3449435:1 Gene:OTTHUMG00000090281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357911 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3445900:3448194:1 Gene:OTTHUMG00000090281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358375 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3441975:3449419:1 Gene:OTTHUMG00000090281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HGF activator (HGFAC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010icw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HGF activator (HGFAC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040045 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 955 (LINC00955), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514422 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:3576869:3590004:1 gene:ENSG00000216560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357538 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3576869:3590004:1 Gene:OTTHUMG00000159817 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357547 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3576934:3590711:1 Gene:OTTHUMG00000159817 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 955 (LINC00955), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000404649 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:3578596:3592712:1 gene:ENSG00000216560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000683 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 2C (ADRA2C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3766398:3768526:1 gene:ENSG00000184160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509482 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:3766348:3768491:1 gene:ENSG00000184160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC142625 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2C-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:164798 IMAGE:40147492), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3766348:3768491:1 Gene:OTTHUMG00000159830 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3766398:3768526:1 Gene:OTTHUMG00000159830 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens adrenoceptor alpha 2C (ADRA2C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584669 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bvt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408832 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:4038811:4038914:1 gene:ENSG00000264106 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408374 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:4084334:4084481:1 gene:ENSG00000221301 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002448 // RefSeq // Homo sapiens msh homeobox 1 (MSX1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4859666:4863936:1 gene:ENSG00000163132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4862428:4863028:1 gene:ENSG00000163132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021285 // GenBank // Homo sapiens msh homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:29576 IMAGE:5018103), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067353 // GenBank // Homo sapiens msh homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:78580 IMAGE:4893288), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000206700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:4859666:4863936:1 Gene:OTTHUMG00000090335 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000314055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:4862428:4863028:1 Gene:OTTHUMG00000090335 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gif.3 // UCSC Genes // Homo sapiens msh homeobox 1 (MSX1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005750 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6 (C4orf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000195455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5525156:5527801:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5524569:5527595:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117444 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6, mRNA (cDNA clone MGC:151053 IMAGE:40125995), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246818 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:5525156:5527801:1 Gene:OTTHUMG00000125492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358214 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:5524569:5527595:1 Gene:OTTHUMG00000125492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358215 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:5527152:5527801:1 Gene:OTTHUMG00000125492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358742 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:5525390:5527800:1 Gene:OTTHUMG00000125492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gii.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6 (C4orf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015433 // RefSeq // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 pseudogene (LOC93622), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6673451:6676047:1 gene:ENSG00000170846 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021542 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC93622, mRNA (cDNA clone IMAGE:3959248). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC073972 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein BC006130, mRNA (cDNA clone IMAGE:6184139), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246832 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6673451:6676047:1 Gene:OTTHUMG00000125505 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280445 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6673451:6676047:1 Gene:OTTHUMG00000125505 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gji.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 pseudogene (LOC93622), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gjk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 pseudogene (LOC93622), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlb.1 // UCSC Genes // SubName: Full=Putative uncharacterized protein LOC93622; SubName: Full=cDNA, FLJ95718; // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005980 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein P (S100P), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6693069:6697169:1 gene:ENSG00000163993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6693878:6697170:1 gene:ENSG00000163993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006819 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein P, mRNA (cDNA clone MGC:5028 IMAGE:3448490), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000206979 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6693069:6697169:1 Gene:OTTHUMG00000090491 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358908 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6693878:6697170:1 Gene:OTTHUMG00000090491 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gjl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens S100 calcium binding protein P (S100P), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018366 // RefSeq // Homo sapiens biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 4, cappuccino (BLOC1S4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6716055:6717671:1 gene:ENSG00000186222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067815 // GenBank // Homo sapiens cappuccino homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:87313 IMAGE:30349339), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6716055:6717671:1 Gene:OTTHUMG00000125510 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gjp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 4, cappuccino (BLOC1S4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gjt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34574 fis, clone KIDNE2008315. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000326788 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6995341:6998958:1 Gene:OTTHUMG00000152568 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6995341:6998958:1 gene:ENSG00000187904 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020777 // RefSeq // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (SORCS2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:7396278:7742836:1 gene:ENSG00000184985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7192538:7742827:1 gene:ENSG00000184985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7381898:7661529:1 gene:ENSG00000184985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51207 complete cds, highly similar to VPS10 domain-containing receptor SorCS2 precursor. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358685 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7192538:7742827:1 Gene:OTTHUMG00000159981 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358857 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7381898:7661529:1 Gene:OTTHUMG00000159981 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358858 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7734280:7740720:1 Gene:OTTHUMG00000159981 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gkb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (SORCS2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (SORCS2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026892 // RefSeq // Homo sapiens AFAP1 antisense RNA 1 (AFAP1-AS1), antisense RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gkd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens AFAP1 antisense RNA 1 (AFAP1-AS1), antisense RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:7939001:7940296:1 gene:ENSG00000228919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031673 // GenBank // Homo sapiens hypothetical gene supported by BC031673, mRNA (cDNA clone MGC:35057 IMAGE:5166037), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101519 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7939001:7940296:1 Gene:OTTHUMG00000043201 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_053044 // RefSeq // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3 (HTRA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:8269777:8296474:1 gene:ENSG00000170801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY280666 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-related serine protease HTRA3 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034390 // GenBank // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:35339 IMAGE:5180585), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035717 // GenBank // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46243 IMAGE:5588608), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307358 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2965:38521:53319:+ gene:ENSG00000170801 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092669 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:8269765:8307111:1 Gene:OTTHUMG00000090561 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359011 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:8269777:8296474:1 Gene:OTTHUMG00000090561 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gkz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3 (HTRA3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gla.3 // UCSC Genes // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3 (HTRA3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365184 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:8393015:8393124:1 gene:ENSG00000202054 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040071 // RefSeq // Homo sapiens seven transmembrane helix receptor (LOC650293), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens seven transmembrane helix receptor (LOC650293), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000432515 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:9174899:9177893:1 gene:ENSG00000229924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9170409:9176730:1 gene:ENSG00000229924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359419 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9170409:9176730:1 Gene:OTTHUMG00000160151 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000417945 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9210657:9212249:1 gene:ENSG00000231396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:9210657:9212608:1 gene:ENSG00000231396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000232399 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429667 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9224896:9226488:1 gene:ENSG00000232399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359420 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9224896:9226488:1 Gene:OTTHUMG00000160152 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9210657:9212249:1 Gene:OTTHUMG00000160160 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000415041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:9220152:9221744:1 gene:ENSG00000227551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359416 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9220152:9221744:1 Gene:OTTHUMG00000160148 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000456464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9234385:9235974:1 gene:ENSG00000223569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9234385:9235974:1 Gene:OTTHUMG00000160155 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504209 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9248630:9250222:1 gene:ENSG00000250844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY188990 // GenBank // Homo sapiens deubiquitinating enzyme 3 (DUB3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359421 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9248630:9250222:1 Gene:OTTHUMG00000160153 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 11 (USP17L11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515566 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9253378:9254970:1 gene:ENSG00000248920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9253378:9254970:1 Gene:OTTHUMG00000160146 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000506414 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9262872:9264464:1 gene:ENSG00000249811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9262872:9264464:1 Gene:OTTHUMG00000160149 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000506619 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9272364:9272914:1 gene:ENSG00000250913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9272364:9272914:1 Gene:OTTHUMG00000160156 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242328 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 26 (USP17L26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242330 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 27 (USP17L27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242331 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 28 (USP17L28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9325165:9326757:1 gene:ENSG00000232264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359621 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9325165:9326757:1 Gene:OTTHUMG00000160201 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xll.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 27 (USP17L27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105662 // RefSeq // [retired] Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17 (USP17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9329911:9331503:1 gene:ENSG00000230430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359612 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9329911:9331503:1 Gene:OTTHUMG00000160192 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 27 (USP17L27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242328 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 26 (USP17L26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9334658:9336250:1 gene:ENSG00000229579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359609 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9334658:9336250:1 Gene:OTTHUMG00000160189 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xln.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105662 // RefSeq // [retired] Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17 (USP17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507227 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:9339403:9340995:1 gene:ENSG00000227140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359602 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9339403:9340995:1 Gene:OTTHUMG00000160182 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242328 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 26 (USP17L26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9344148:9345740:1 gene:ENSG00000235780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9344148:9345740:1 Gene:OTTHUMG00000160186 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 28 (USP17L28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242328 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 26 (USP17L26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9348893:9350485:1 gene:ENSG00000231051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359611 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9348893:9350485:1 Gene:OTTHUMG00000160191 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 30 (USP17L30), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105662 // RefSeq // [retired] Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17 (USP17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242327 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 24 (USP17L24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242329 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 5 (USP17L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9353638:9355230:1 gene:ENSG00000231637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359603 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9353638:9355230:1 Gene:OTTHUMG00000160183 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 5 (USP17L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105662 // RefSeq // [retired] Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17 (USP17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25 (USP17L25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9363129:9364721:1 gene:ENSG00000228856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359619 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9363129:9364721:1 Gene:OTTHUMG00000160199 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xls.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242332 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 29 (USP17L29), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027279 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 6, pseudogene (USP17L6P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359620 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9367874:9369070:1 Gene:OTTHUMG00000160200 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bws.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 17-like family member 6, pseudogene (USP17L6P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040448 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 131 (DEFB131), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:9444534:9450514:1 gene:ENSG00000186146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:9444534:9450514:1 Gene:OTTHUMG00000160187 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens defensin, beta 131 (DEFB131), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB059369 // GenBank // Homo sapiens mRNA, HERV-K LTR element, isolate:HKL-FB12. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA, HERV-K LTR element, isolate:HKL-B10. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ589421 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-56533, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xma.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-56533, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583133 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50245, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32075, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ581767 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-49879, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-49879, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584082 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51194, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41677, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ573667 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-41779, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gmm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gmm.2 cpcScore=-1.2534700 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gmm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41779, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ591515 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-58627, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bww.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43554, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599898 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37964, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bwx.1 cpcScore=-1.3793600 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41254, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390980 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:12312588:12312690:1 gene:ENSG00000212282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516426 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:13051342:13051411:1 gene:ENSG00000252235 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003132 // RefSeq // [retired] Homo sapiens heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class B member 2, pseudogene (HSP90AB2P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gms.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gms.2 cpcScore=11.4661000 cnci=-0.2538351 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gms.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gny.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33631 fis, clone BRAMY2022532. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027696 // RefSeq // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027697 // RefSeq // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010030 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ39653, mRNA (cDNA clone IMAGE:3503500), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gox.1 // UCSC Genes // RecName: Full=Uncharacterized protein FLJ39653; // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440429 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000440429 cpcScore=1.8979100 cnci=-0.1760417 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459186 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:17530560:17530663:1 gene:ENSG00000238536 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025205 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 28 (MED28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000237380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:17614631:17634105:1 gene:ENSG00000118579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF317678 // GenBank // Homo sapiens putative angiogenesis-related mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011936 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 28, mRNA (cDNA clone MGC:20562 IMAGE:3936713), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:17614631:17634105:1 Gene:OTTHUMG00000161980 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360056 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:17614664:17628170:1 Gene:OTTHUMG00000161980 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360059 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:17614648:17620081:1 Gene:OTTHUMG00000161980 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mediator complex subunit 28 (MED28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mediator complex subunit 28 (MED28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR936688 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F09227 (from clone DKFZp686F09227). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O18109 (from clone DKFZp686O18109). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037876 // RefSeq // Homo sapiens SLIT2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (SLIT2-IT1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:20392189:20394856:1 gene:ENSG00000248228 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359840 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:20392189:20394856:1 Gene:OTTHUMG00000160239 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SLIT2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (SLIT2-IT1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpt.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gpt.2 cpcScore=-1.2999800 cnci=-0.2932123 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029631 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 218-1 (MIR218-1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:20528275:20528384:1 gene:ENSG00000207732 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 218-1 (MIR218-1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxl.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bxl.1 cpcScore=-1.5226700 cnci=-0.4896025 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000510705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:21949015:22330330:1 gene:ENSG00000250039 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:22118983:22119089:1 gene:ENSG00000239001 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459431 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:22351073:22351177:1 gene:ENSG00000238383 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001128432 // RefSeq // Homo sapiens glucosidase, beta, acid 3 (GBA3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020973 // RefSeq // Homo sapiens glucosidase, beta, acid 3 (GBA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22692925:22819575:1 gene:ENSG00000249948 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22692914:22819575:1 gene:ENSG00000249948 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22754413:22819282:1 gene:ENSG00000249948 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22714089:22819527:1 gene:ENSG00000249948 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298377 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55639 complete cds, highly similar to Cytosolic beta-glucosidase (EC 3.2.1.21). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101829 // GenBank // Homo sapiens glucosidase, beta, acid 3 (cytosolic), mRNA (cDNA clone MGC:126878 IMAGE:8069335), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gqp.4 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iep.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxo.2 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003102 // RefSeq // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular (SOD3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:24795463:24800842:1 gene:ENSG00000109610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014418 // GenBank // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular, mRNA (cDNA clone MGC:20077 IMAGE:4644224), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250416 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:24795463:24800842:1 Gene:OTTHUMG00000128565 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gqz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular (SOD3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular (SOD3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145432 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 20 (SMIM20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412980 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:25915528:25931433:1 gene:ENSG00000250317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:25914204:25929812:1 gene:ENSG00000250317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514384 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:25914309:25929813:1 gene:ENSG00000250317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:25861830:25929545:1 gene:ENSG00000250317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360256 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:25914204:25929812:1 Gene:OTTHUMG00000160330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360257 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:25914309:25929813:1 Gene:OTTHUMG00000160330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360258 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:25861830:25929545:1 Gene:OTTHUMG00000160330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000375937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:25928215:25929425:1 Gene:OTTHUMG00000160330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003grw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens small integral membrane protein 20 (SMIM20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:29510635:29510737:1 gene:ENSG00000252303 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390756 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:29750196:29750310:1 gene:ENSG00000212045 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515946 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:4:33786557:33786615:1 gene:ENSG00000251755 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:35495898:35496003:1 gene:ENSG00000206665 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001104629 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018302 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37584233:37591826:1 gene:ENSG00000154274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37453941:37591826:1 gene:ENSG00000154274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508175 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:37453988:37623495:1 gene:ENSG00000154274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037906 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19, mRNA (cDNA clone MGC:43960 IMAGE:5276648), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250432 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37584233:37591826:1 Gene:OTTHUMG00000128580 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250433 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37453941:37591826:1 Gene:OTTHUMG00000128580 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37453988:37623495:1 Gene:OTTHUMG00000128580 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gsw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gsy.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006607 // RefSeq // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2 (PTTG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:37960435:37961125:1 gene:ENSG00000250254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069114 // GenBank // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2, mRNA (cDNA clone MGC:95393 IMAGE:7216932), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069400 // GenBank // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2, mRNA (cDNA clone MGC:96925 IMAGE:7262134), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360541 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37960435:37961125:1 Gene:OTTHUMG00000160424 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bye.2 // UCSC Genes // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2 (PTTG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408568 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:38238613:38238696:1 gene:ENSG00000221495 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016531 // RefSeq // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic) (KLF3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000261438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38664196:38701042:1 gene:ENSG00000109787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514033 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:38664197:38690751:1 gene:ENSG00000109787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030662 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic), mRNA (cDNA clone MGC:33736 IMAGE:5262512), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051687 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic), mRNA (cDNA clone MGC:48279 IMAGE:5303520), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000215093 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38664196:38701042:1 Gene:OTTHUMG00000097821 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38664197:38690751:1 Gene:OTTHUMG00000097821 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360516 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38664344:38680985:1 Gene:OTTHUMG00000097821 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gtg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic) (KLF3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gth.4 // UCSC Genes // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic) (KLF3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410660 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39399149:39399248:1 gene:ENSG00000222592 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175737 // RefSeq // Homo sapiens klotho beta (KLB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000257408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:39406853:39451536:1 gene:ENSG00000134962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104871 // GenBank // Homo sapiens klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:132531 IMAGE:8143874), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143575 // GenBank // Homo sapiens klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:177103 IMAGE:9052086), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:39406853:39451536:1 Gene:OTTHUMG00000128577 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gua.3 // UCSC Genes // Homo sapiens klotho beta (KLB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011byj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens klotho beta (KLB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459360 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:39441665:39441764:1 gene:ENSG00000238797 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026854 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 5 pseudogene (LOC401127), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39480255:39481905:1 gene:ENSG00000224097 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011byn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WD repeat domain 5 pseudogene (LOC401127), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011byn.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011byn.1 cpcScore=0.7784280 cnci=-0.2789670 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412595 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:4:39549456:39551432:1 gene:ENSG00000238206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516987 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39621012:39621073:1 gene:ENSG00000252796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000529094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39639140:39651411:1 gene:ENSG00000255458 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000532680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39639181:39651314:1 gene:ENSG00000255458 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000533736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39639140:39652072:1 gene:ENSG00000255458 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040333 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4830514. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gup.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4830514. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000526807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39653204:39666644:1 gene:ENSG00000255458 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000529314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39653407:39666568:1 gene:ENSG00000255458 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39936753:39936855:1 gene:ENSG00000252970 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:40077884:40077982:1 gene:ENSG00000200455 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364993 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:40082983:40083106:1 gene:ENSG00000201863 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000510551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:40316485:40330419:1 gene:ENSG00000249241 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// JN120857 // GenBank // Homo sapiens GDCG4p14.1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// JN120858 // GenBank // Homo sapiens GDCG4p14.2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360481 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:40316485:40330419:1 Gene:OTTHUMG00000160407 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xnq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GDCG4p14.1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xnr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GDCG4p14.1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017581 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9 (neuronal) (CHRNA9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:40335329:40355217:1 gene:ENSG00000174343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:40337286:40348139:1 gene:ENSG00000174343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113549 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9, mRNA (cDNA clone MGC:142109 IMAGE:8322601), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000216822 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:40335329:40355217:1 Gene:OTTHUMG00000099375 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360448 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:40349587:40354094:1 Gene:OTTHUMG00000099375 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360449 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:40337286:40348139:1 Gene:OTTHUMG00000099375 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gva.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364866 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:40990154:40990273:1 gene:ENSG00000201736 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41084607:41084713:1 gene:ENSG00000199790 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384469 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41113942:41114045:1 gene:ENSG00000207198 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001029955 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 4-like 1 (DCAF4L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:41981696:41986467:1 gene:ENSG00000182308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035027 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:33663 IMAGE:4828469), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052943 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:51312 IMAGE:5268527), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104224 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:126021 IMAGE:40032133), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360958 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:41981696:41986467:1 Gene:OTTHUMG00000160527 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gwk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 4-like 1 (DCAF4L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080476 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin, cysteine rich 1 (GRXCR1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:42893267:43030658:1 gene:ENSG00000215203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360576 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:42893267:43030658:1 Gene:OTTHUMG00000160434 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gwt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glutaredoxin, cysteine rich 1 (GRXCR1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021927 // RefSeq // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000281543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:44678429:44700926:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44678427:44700759:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK001607 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10745 fis, clone NT2RP3001676. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308667 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98708. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036768 // GenBank // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:46045 IMAGE:5744283), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250469 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44678429:44700926:1 Gene:OTTHUMG00000128608 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360711 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44678427:44700759:1 Gene:OTTHUMG00000128608 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360714 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44678494:44689409:1 Gene:OTTHUMG00000128608 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361046 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44694409:44700679:1 Gene:OTTHUMG00000128608 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gww.4 // UCSC Genes // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ifz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bza.2 // UCSC Genes // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363850 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:45480030:45480136:1 gene:ENSG00000200720 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408837 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:47976216:47976327:1 gene:ENSG00000221764 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365144 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:48153434:48153535:1 gene:ENSG00000202014 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152679 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 10, member 4 (SLC10A4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48483343:48489196:1 gene:ENSG00000145248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012048 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:12990 IMAGE:3502817), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019066 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:29802 IMAGE:4897519), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000219926 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:48483343:48489196:1 Gene:OTTHUMG00000102092 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gyc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4 (SLC10A4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025087 // RefSeq // Homo sapiens cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (CWH43), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:48986639:49062076:1 gene:ENSG00000109182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK316307 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79206 complete cds, weakly similar to Calcofluor white hypersensitive protein precursor. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137387 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ21511, mRNA (cDNA clone MGC:169008 IMAGE:9021385), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226432 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1583:491917:541611:+ gene:ENSG00000109182 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250496 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:48986247:49062079:1 Gene:OTTHUMG00000128627 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361404 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:48986639:49062076:1 Gene:OTTHUMG00000128627 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:48986313:49062081:1 Gene:OTTHUMG00000128627 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000372004 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:49003609:49017329:1 Gene:OTTHUMG00000128627 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000372005 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:49028692:49031276:1 Gene:OTTHUMG00000128627 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gyv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (CWH43), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (CWH43), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410505 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49197203:49197284:1 gene:ENSG00000222437 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408820 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49198015:49198097:1 gene:ENSG00000221747 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408488 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49198207:49198289:1 gene:ENSG00000221415 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579288 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xod.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ593719 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-33831, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xog.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590589 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57701, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bzm.1 cpcScore=-1.2371500 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583161 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50273, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gza.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50272, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ596206 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-34272, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363054 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:52494849:52494952:1 gene:ENSG00000199924 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459377 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:53376179:53376282:1 gene:ENSG00000239068 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024031 // RefSeq // Homo sapiens differentiation antagonizing non-protein coding RNA (DANCR), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52712430:52714137:1 gene:ENSG00000226950 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000336530 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52712430:52714137:1 Gene:OTTHUMG00000154670 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000336531 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52712781:52714137:1 Gene:OTTHUMG00000154670 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000336532 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52712498:52713129:1 Gene:OTTHUMG00000154670 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000336533 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52712824:52720351:1 Gene:OTTHUMG00000154670 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens differentiation antagonizing non-protein coding RNA (DANCR), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003016 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 26 (SNORA26), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391286 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:52713249:52713370:1 gene:ENSG00000212588 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 26 (SNORA26), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391188 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:52748137:52748259:1 gene:ENSG00000212490 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363031 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:52786537:52786638:1 gene:ENSG00000199901 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023940 // RefSeq // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B (RASL11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000248706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:52862290:52866835:1 gene:ENSG00000128045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52864146:52866799:1 gene:ENSG00000128045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001087 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:2827 IMAGE:2964565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001846 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:4499 IMAGE:2964565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025694 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:34182 IMAGE:5209000), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000219931 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52862290:52866835:1 Gene:OTTHUMG00000102097 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361312 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52864146:52866799:1 Gene:OTTHUMG00000102097 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361313 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52862332:52863610:1 Gene:OTTHUMG00000102097 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B (RASL11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408333 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:12:82264943:82265044:1 gene:ENSG00000221260 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384112 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55294490:55294598:1 gene:ENSG00000206839 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024592 // RefSeq // Homo sapiens steroid 5 alpha-reductase 3 (SRD5A3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55346109:55373096:1 gene:ENSG00000128039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55359000:55369975:1 gene:ENSG00000128039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002480 // GenBank // Homo sapiens steroid 5 alpha-reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:3099 IMAGE:3350037), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250644 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55346109:55373096:1 Gene:OTTHUMG00000128733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361583 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55346412:55370310:1 Gene:OTTHUMG00000128733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361584 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55359000:55369975:1 Gene:OTTHUMG00000128733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hau.3 // UCSC Genes // Homo sapiens steroid 5 alpha-reductase 3 (SRD5A3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459077 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:55412636:55412738:1 gene:ENSG00000239040 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003935 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 1 pseudogene (LOC644145), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55820003:55837382:1 gene:ENSG00000250821 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361808 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55820003:55837382:1 Gene:OTTHUMG00000160694 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010igy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens exocyst complex component 1 pseudogene (LOC644145), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411022 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:55929982:55930073:1 gene:ENSG00000222954 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363871 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56097390:56097504:1 gene:ENSG00000200741 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000416157 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000416157 cpcScore=1.6990500 cnci=-0.3200316 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_206919 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56505343:56524448:1 gene:ENSG00000196503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hby.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459266 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:57860241:57860336:1 gene:ENSG00000238579 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362910 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:59533786:59533898:1 gene:ENSG00000199780 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364806 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:59833175:59833276:1 gene:ENSG00000201676 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364905 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:59834063:59834167:1 gene:ENSG00000201775 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039452 // GenBank // Homo sapiens latrophilin 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5311853). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hcu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ37384 fis, clone BRAMY2026347. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000507857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:63128311:63143881:1 gene:ENSG00000251055 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408636 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:66276824:66276928:1 gene:ENSG00000221563 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012108 // RefSeq // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000265404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67558728:67606898:1 gene:ENSG00000035720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67558728:67607337:1 gene:ENSG00000035720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014958 // GenBank // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:23010 IMAGE:4851485), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251434 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67558728:67606898:1 Gene:OTTHUMG00000129304 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67558728:67607337:1 Gene:OTTHUMG00000129304 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hde.4 // UCSC Genes // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365504 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:67747236:67747386:1 gene:ENSG00000202374 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:68003895:68004001:1 gene:ENSG00000207428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000440470 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:68904262:68905368:1 gene:ENSG00000227725 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015446 // RefSeq // Homo sapiens ferritin, light polypeptide pseudogene 10 (FTLP10), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68182292:68212470:1 gene:ENSG00000250426 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iho.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ferritin, light polypeptide pseudogene 10 (FTLP10), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014058 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E (TMPRSS11E), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68447449:68497604:1 gene:ENSG00000087128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113412 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E, mRNA (cDNA clone MGC:141972 IMAGE:8322464), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360584 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68447449:68497604:1 Gene:OTTHUMG00000160438 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360585 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68461821:68477630:1 Gene:OTTHUMG00000160438 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E (TMPRSS11E), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001075 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001144767 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000265403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68815993:68831196:1 gene:ENSG00000109181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458688 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:68815995:68830943:1 gene:ENSG00000109181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113649 // GenBank // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10, mRNA (cDNA clone MGC:142209 IMAGE:8322701), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365169 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68815993:68831196:1 Gene:OTTHUMG00000161505 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68815995:68830943:1 Gene:OTTHUMG00000161505 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hee.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cam.2 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001207004 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_053039 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69280499:69295050:1 gene:ENSG00000135226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69280499:69295050:1 gene:ENSG00000135226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69280499:69295050:1 Gene:OTTHUMG00000129401 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365537 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69280499:69295050:1 Gene:OTTHUMG00000129401 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hej.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000200 // RefSeq // Homo sapiens histatin 3 (HTN3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381057 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:70028459:70036529:1 gene:ENSG00000205649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000526767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70028413:70036538:1 gene:ENSG00000205649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000530128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70028455:70034412:1 gene:ENSG00000205649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009791 // GenBank // Homo sapiens histatin 3, mRNA (cDNA clone MGC:13578 IMAGE:4293405), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362584 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70028413:70036538:1 Gene:OTTHUMG00000160841 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hew.2 // UCSC Genes // Homo sapiens histatin 3 (HTN3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003720 // RefSeq // Homo sapiens casein alpha s2-like A, pseudogene (CSN1S2AP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70067386:70085273:1 gene:ENSG00000234124 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128173 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40113072. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hez.3 // UCSC Genes // Homo sapiens casein alpha s2-like A, pseudogene (CSN1S2AP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011car.2 // UCSC Genes // Homo sapiens casein alpha s2-like A, pseudogene (CSN1S2AP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152997 // RefSeq // Homo sapiens follicular dendritic cell secreted protein (FDCSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70226071:70235252:1 gene:ENSG00000181617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062213 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 7, mRNA (cDNA clone MGC:71894 IMAGE:30326274), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251549 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70226071:70235252:1 Gene:OTTHUMG00000129393 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens follicular dendritic cell secreted protein (FDCSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005212 // RefSeq // Homo sapiens casein kappa (CSN3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70242588:70251428:1 gene:ENSG00000171209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010935 // GenBank // Homo sapiens casein kappa, mRNA (cDNA clone MGC:13553 IMAGE:4279903), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251555 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70242588:70251428:1 Gene:OTTHUMG00000129399 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfe.4 // UCSC Genes // Homo sapiens casein kappa (CSN3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033122 // RefSeq // Homo sapiens calcium-binding protein, spermatid-specific 1 (CABS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70334966:70337116:1 gene:ENSG00000145309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046111 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 35, mRNA (cDNA clone MGC:57543 IMAGE:5171504), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251561 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70334966:70337116:1 Gene:OTTHUMG00000129405 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hff.3 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium-binding protein, spermatid-specific 1 (CABS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xoz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium-binding protein, spermatid-specific 1 (CABS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021225 // RefSeq // Homo sapiens proline rich, lacrimal 1 (PROL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:70397882:70410194:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70397931:70409892:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362639 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70397882:70410194:1 Gene:OTTHUMG00000160845 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362640 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70397931:70409892:1 Gene:OTTHUMG00000160845 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362641 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70397965:70409908:1 Gene:OTTHUMG00000160845 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proline rich, lacrimal 1 (PROL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_212557 // RefSeq // Homo sapiens amelotin (AMTN), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70518540:70532742:1 gene:ENSG00000187689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70518585:70532514:1 gene:ENSG00000187689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121812 // GenBank // Homo sapiens amelotin, mRNA (cDNA clone MGC:148133 IMAGE:40109020), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121817 // GenBank // Homo sapiens amelotin, mRNA (cDNA clone MGC:148132 IMAGE:40109016), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252157 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70518540:70532742:1 Gene:OTTHUMG00000129906 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362618 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70518585:70532514:1 Gene:OTTHUMG00000129906 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens amelotin (AMTN), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens amelotin (AMTN), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016519 // RefSeq // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein) (AMBN), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70592295:70606879:1 gene:ENSG00000178522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538728 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:71457993:71473002:1 gene:ENSG00000178522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC106931 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein), mRNA (cDNA clone MGC:126152 IMAGE:40033703), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC106932 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein), mRNA (cDNA clone MGC:126153 IMAGE:40033705), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000322937 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1609:276129:286205:+ gene:ENSG00000178522 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252165 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70592256:70607288:1 Gene:OTTHUMG00000129913 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362609 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70592295:70606879:1 Gene:OTTHUMG00000129913 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein) (AMBN), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020368 // RefSeq // Homo sapiens UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae) (UTP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004546 // GenBank // Homo sapiens UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:11290 IMAGE:3946633), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254803 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1609:376782:378206:+ gene:ENSG00000132467 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252163 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70688479:70690551:1 Gene:OTTHUMG00000129911 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae) (UTP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459111 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:71677963:71678063:1 gene:ENSG00000238318 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70852130:70852240:1 gene:ENSG00000207007 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:72965178:72965303:1 gene:ENSG00000252955 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000388104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:73026748:73026873:1 gene:ENSG00000210839 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408712 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:73263960:73264084:1 gene:ENSG00000221639 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000584 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 8 (CXCL8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73740506:73743716:1 gene:ENSG00000169429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401931 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73740541:73742330:1 gene:ENSG00000169429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013615 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8, mRNA (cDNA clone MGC:9211 IMAGE:3882471), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000322211 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73740506:73743716:1 Gene:OTTHUMG00000151316 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000322212 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73740541:73742330:1 Gene:OTTHUMG00000151316 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000322213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73740569:73741986:1 Gene:OTTHUMG00000151316 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 8 (IL8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002993 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (CXCL6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73836497:73838760:1 gene:ENSG00000124875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503446 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73837187:73849064:1 gene:ENSG00000124875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515050 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73836640:73837406:1 gene:ENSG00000124875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013744 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (granulocyte chemotactic protein 2), mRNA (cDNA clone MGC:21713 IMAGE:4471095), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252283 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73836497:73838760:1 Gene:OTTHUMG00000130010 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73836640:73837406:1 Gene:OTTHUMG00000130010 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362452 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73837187:73849064:1 Gene:OTTHUMG00000130010 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (CXCL6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002620 // RefSeq // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1 (PF4V1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73853189:73854155:1 gene:ENSG00000109272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130653 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:163525 IMAGE:40146684), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252495 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73853189:73854155:1 Gene:OTTHUMG00000130177 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1 (PF4V1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001511 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha) (CXCL1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73869404:73871242:1 gene:ENSG00000163739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509101 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73869393:73870177:1 gene:ENSG00000163739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011976 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha), mRNA (cDNA clone MGC:9049 IMAGE:3856841), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73869404:73871242:1 Gene:OTTHUMG00000160866 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362735 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73869393:73870177:1 Gene:OTTHUMG00000160866 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhh.2 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001432 // RefSeq // Homo sapiens epiregulin (EREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000244869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74365143:74388751:1 gene:ENSG00000124882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503689 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74382423:74384952:1 gene:ENSG00000124882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035806 // GenBank HTC // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5745333), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136404 // GenBank // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:168014 IMAGE:9020391), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136405 // GenBank // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:168015 IMAGE:9020392), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252276 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74365143:74388751:1 Gene:OTTHUMG00000130005 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362718 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74365173:74382013:1 Gene:OTTHUMG00000130005 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362719 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74382423:74384952:1 Gene:OTTHUMG00000130005 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hid.3 // UCSC Genes // Homo sapiens epiregulin (EREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hie.1 // UCSC Genes // Homo sapiens epiregulin (EREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362987 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:76402076:76402146:1 gene:ENSG00000199857 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006419 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (CXCL13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:77511753:77611834:1 gene:ENSG00000156234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012589 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 13, mRNA (cDNA clone MGC:13521 IMAGE:4246053), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252519 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:77511753:77611834:1 Gene:OTTHUMG00000130201 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362904 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:77605832:77610922:1 Gene:OTTHUMG00000130201 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hkr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (CXCL13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408256 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:78188336:78188423:1 gene:ENSG00000221183 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459422 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:79561254:79561356:1 gene:ENSG00000238816 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038826 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 989 (LINC00989), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79492416:79576460:1 gene:ENSG00000250334 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79492593:79576458:1 gene:ENSG00000250334 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362789 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79492416:79576460:1 Gene:OTTHUMG00000160884 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362790 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79492593:79576458:1 Gene:OTTHUMG00000160884 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506035 (LOC100506035), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hlv.2 cpcScore=-1.0793800 cnci=-0.2671374 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026555 // RefSeq // Homo sapiens prostate cancer associated transcript 4 (non-protein coding) (PCAT4), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79827471:79863247:1 gene:ENSG00000251321 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79827535:79877770:1 gene:ENSG00000251321 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365980 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79827471:79863247:1 Gene:OTTHUMG00000161746 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79827535:79877770:1 Gene:OTTHUMG00000161746 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens prostate cancer associated transcript 4 (non-protein coding) (PCAT4), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlw.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hlw.3 cpcScore=-0.3214100 cnci=-0.3580417 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391318 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:79843102:79843228:1 gene:ENSG00000212620 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001201 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3 (BMP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000282701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:81030965:81057531:1 gene:ENSG00000152785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395581 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:81958530:81974715:1 gene:ENSG00000152785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096269 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116934 IMAGE:40006302), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:81030965:81057531:1 Gene:OTTHUMG00000130292 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hmg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3 (BMP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384337 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:81334303:81334418:1 gene:ENSG00000207065 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516953 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:81928313:81928439:1 gene:ENSG00000252762 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021204 // RefSeq // Homo sapiens enolase-phosphatase 1 (ENOPH1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:82430562:82461091:1 gene:ENSG00000145293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456931 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:83351726:83382243:1 gene:ENSG00000145293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509635 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:82430648:82461055:1 gene:ENSG00000145293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001317 // GenBank // Homo sapiens enolase-phosphatase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3454565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065815 // GenBank // Homo sapiens enolase-phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:74944 IMAGE:6526329), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252638 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82430562:82461091:1 Gene:OTTHUMG00000130295 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363376 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82430648:82461055:1 Gene:OTTHUMG00000130295 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82430662:82461087:1 Gene:OTTHUMG00000130295 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hmv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens enolase-phosphatase 1 (ENOPH1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hmx.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517025 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:83870321:83870397:1 gene:ENSG00000252834 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:83003412:83003517:1 gene:ENSG00000251874 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363238 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:84233657:84233763:1 gene:ENSG00000200108 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001263 // RefSeq // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1 (CDS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY312584 // GenBank // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase 1 mRNA, partial sequence, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074833 // GenBank // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:104094 IMAGE:30915545), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074881 // GenBank // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:103857 IMAGE:30915239), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295887 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1606:1302132:1360014:+ gene:ENSG00000163624 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252817 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:84582979:84651338:1 Gene:OTTHUMG00000130428 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363041 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:84583269:84619511:1 Gene:OTTHUMG00000130428 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ccv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1 (CDS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ike.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1 (CDS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015359 // RefSeq // Homo sapiens WDFY3 antisense RNA 2 (WDFY3-AS2), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:84966385:85011277:1 gene:ENSG00000180769 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019264 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3502957). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280506 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:84966385:85011277:1 Gene:OTTHUMG00000141281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280507 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:84966793:85007015:1 Gene:OTTHUMG00000141281 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hpg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WDFY3 antisense RNA 2 (WDFY3-AS2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hph.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WDFY3 antisense RNA 2 (WDFY3-AS2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515907 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:4:88333380:88333498:1 gene:ENSG00000251716 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014208 // RefSeq // Homo sapiens dentin sialophosphoprotein (DSPP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000282478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:87610876:87616910:1 gene:ENSG00000152591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:87608529:87616873:1 gene:ENSG00000152591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363616 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87610876:87616910:1 Gene:OTTHUMG00000161061 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dentin sialophosphoprotein (DSPP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001079911 // RefSeq // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004407 // RefSeq // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000282479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87650307:87664361:1 gene:ENSG00000152592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130581 // GenBank // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:163453 IMAGE:40146612), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339673 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2939:86766:91265:- gene:ENSG00000152592 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253047 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87650307:87664361:1 Gene:OTTHUMG00000130598 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87650307:87664361:1 Gene:OTTHUMG00000130598 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004967 // RefSeq // Homo sapiens integrin-binding sialoprotein (IBSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87799581:87812435:1 gene:ENSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253050 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87799581:87812435:1 Gene:OTTHUMG00000130600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens integrin-binding sialoprotein (IBSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88000237:88000401:1 gene:ENSG00000202000 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364837 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88201703:88201810:1 gene:ENSG00000201707 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88226729:88226829:1 gene:ENSG00000199326 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002806 // RefSeq // Homo sapiens FAM13A antisense RNA 1 (FAM13A-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:88709789:88730103:1 gene:ENSG00000248019 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:88721715:88728686:1 gene:ENSG00000248019 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363503 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:88721715:88728686:1 Gene:OTTHUMG00000161035 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363504 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:88709789:88730103:1 Gene:OTTHUMG00000161035 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hry.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FAM13A antisense RNA 1 (FAM13A-AS1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hrz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FAM13A antisense RNA 1 (FAM13A-AS1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390924 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:89130852:89130953:1 gene:ENSG00000212226 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571524 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-31636, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cdr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cdr.1 cpcScore=-1.3022000 cnci=-0.1483783 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cdr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31636, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:93820171:93820280:1 gene:ENSG00000252342 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005172 // RefSeq // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila) (ATOH1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069145 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95430 IMAGE:7217005), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069594 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97152 IMAGE:7262394), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069604 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97163 IMAGE:7262406), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113623 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:142183 IMAGE:8322675), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113625 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:142185 IMAGE:8322677), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306011 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1909:9098:9298:- gene:ENSG00000172238 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253585 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:93828753:93830964:1 Gene:OTTHUMG00000130972 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hta.1 // UCSC Genes // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila) (ATOH1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005390 // RefSeq // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2 (PDHA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:95840019:95841474:1 gene:ENSG00000163114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030697 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:26632 IMAGE:4824350), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066953 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:87402 IMAGE:5273609), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119656 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:149517 IMAGE:40115940), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127637 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:157671 IMAGE:40115943), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253608 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:95840019:95841474:1 Gene:OTTHUMG00000130990 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003htr.4 // UCSC Genes // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2 (PDHA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401217 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:98407957:98408047:1 gene:ENSG00000216036 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363788 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:4:99094935:99095030:1 gene:ENSG00000200658 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410264 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:100129945:100130035:-1 gene:ENSG00000222196 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033874 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC90024 (FLJ20021), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000527564 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:101347780:101348883:1 gene:ENSG00000254531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hvw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC90024 (FLJ20021), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:101723876:101723980:1 gene:ENSG00000199529 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000541553 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:103883628:103884209:1 gene:ENSG00000249283 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516651 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:103924540:103924641:1 gene:ENSG00000252460 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410302 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:105412033:105412111:1 gene:ENSG00000222234 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516097 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:104974672:104974771:1 gene:ENSG00000251906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516327 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:105105987:105106094:1 gene:ENSG00000252136 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364047 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:105406997:105407092:1 gene:ENSG00000200917 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516661 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:107435118:107435220:1 gene:ENSG00000252470 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:108652150:108652256:1 gene:ENSG00000206601 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006583 // RefSeq // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog (RRH), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128120 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:149202 IMAGE:40112275), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128401 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:156162 IMAGE:40112297), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317735 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold103:3085935:3098865:- gene:ENSG00000180245 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000255066 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109827994:109844604:1 Gene:OTTHUMG00000132045 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hzv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog (RRH), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198506 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3 (LRIT3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000327908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109851330:109872315:1 gene:ENSG00000183423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409621 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:110786392:110793470:1 gene:ENSG00000183423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK126648 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44691 fis, clone BRACE3013874. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104037 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:120618 IMAGE:40026462), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379920 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold103:3063263:3076123:- gene:ENSG00000183423 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000255064 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109851330:109872315:1 Gene:OTTHUMG00000132043 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000335270 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109848202:109872315:1 Gene:OTTHUMG00000132043 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hzw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3 (LRIT3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hzx.4 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384530 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:109992325:109992431:1 gene:ENSG00000207260 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:110278185:110278291:1 gene:ENSG00000212160 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390775 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:111219640:111219706:1 gene:ENSG00000212064 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001977 // RefSeq // Homo sapiens glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) (ENPEP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000265162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:110476073:110565285:1 gene:ENSG00000138792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504100 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:110559108:110565057:1 gene:ENSG00000138792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC094770 // GenBank // Homo sapiens glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A), mRNA (cDNA clone MGC:104663 IMAGE:30528477), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000255747 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:110476073:110565285:1 Gene:OTTHUMG00000132546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363861 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:110365733:110506258:1 Gene:OTTHUMG00000132546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363862 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:110513489:110533427:1 Gene:OTTHUMG00000132546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363863 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:110549428:110553517:1 Gene:OTTHUMG00000132546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363864 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:110559108:110565057:1 Gene:OTTHUMG00000132546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iab.4 // UCSC Genes // Homo sapiens glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) (ENPEP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:111331412:111331518:1 gene:ENSG00000200963 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152400 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32 (C4orf32), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112145397:112195256:1 gene:ENSG00000174749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022534 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:26681 IMAGE:4815687), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:112145397:112195256:1 Gene:OTTHUMG00000132851 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iah.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32 (C4orf32), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041964 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone IMAGE:5302353), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iai.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone IMAGE:5302353), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410374 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:4:113195228:113195309:1 gene:ENSG00000222306 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000413930 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:113748299:113748760:1 gene:ENSG00000234841 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:113420323:113420486:1 gene:ENSG00000206820 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:116839279:116839385:1 gene:ENSG00000201752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004784 // RefSeq // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3 (NDST3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433996 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:118955649:119158291:1 gene:ENSG00000164100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295439 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60114 complete cds, highly similar to Bifunctional heparan sulfateN-deacetylase/N-sulfotransferase 3 (EC 2.8.2.8). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY358852 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96833 HSS3 (UNQ2544) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109309 // GenBank // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3, mRNA (cDNA clone MGC:130028 IMAGE:40035856), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296499 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2035:452658:613800:+ gene:ENSG00000164100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256517 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118034345:118258648:1 Gene:OTTHUMG00000132959 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364040 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118033618:118055645:1 Gene:OTTHUMG00000132959 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ibw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3 (NDST3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ibx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3 (NDST3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3 (NDST3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003584 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034010 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034011 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iby.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xqz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xra.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 8 (non-protein coding) (SNHG8), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500560 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500560 cpcScore=-1.2630500 cnci=-0.3233114 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002963 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 24 (SNORA24), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:118279190:118279320:1 gene:ENSG00000275994 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000269893 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ibz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 24 (SNORA24), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003135 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 170kDa pseudogene 1 (CEP170P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:118516340:118554204:1 gene:ENSG00000154608 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003icb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens centrosomal protein 170kDa pseudogene 1 (CEP170P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411293 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:118606450:118606553:1 gene:ENSG00000223225 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575010 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43122, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ14186 fis, clone NT2RP2005726. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016599 // RefSeq // Homo sapiens myozenin 2 (MYOZ2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:119135784:119187789:1 gene:ENSG00000172399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005195 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:12200 IMAGE:3934051), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017402 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:27163 IMAGE:4292715), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020932 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:24686 IMAGE:4271710), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256526 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:119135784:119187789:1 Gene:OTTHUMG00000132968 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003icp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens myozenin 2 (MYOZ2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:119367562:119367646:1 gene:ENSG00000201186 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000307499 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:120299287:120326749:1 gene:ENSG00000229450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK097701 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40382 fis, clone TESTI2035775. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003icx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ40382 fis, clone TESTI2035775. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037630 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC645513 (LOC645513), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119488643:119552024:1 gene:ENSG00000245958 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF085995 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YU26H08. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC645513 (LOC645513), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idi.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003idi.3 cpcScore=-1.0586000 cnci=-0.3074550 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens full length insert cDNA clone YU26H08. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408318 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:119569699:119569825:1 gene:ENSG00000221245 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX746903 // NONCODE // accn=AX746903 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2667 cpcScore=3.1126300 cnci=-0.2407100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33983 fis, clone DFNES2004684. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363683 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:119947131:119947232:1 gene:ENSG00000200553 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024365 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100192379 (PP12613), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121764585:121766814:1 gene:ENSG00000226757 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100192379 (PP12613), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001178007 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152618 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:122732702:122744942:1 gene:ENSG00000181004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC055426 // GenBank // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12, mRNA (cDNA clone MGC:48618 IMAGE:5262398), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000314218 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2561:204977:207112:+ gene:ENSG00000181004 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256710 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:122732702:122744943:1 Gene:OTTHUMG00000133070 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000316450 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:122732797:122742465:1 Gene:OTTHUMG00000133070 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ieu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145207 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:122923074:123319450:1 gene:ENSG00000145375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:122923101:123102293:1 gene:ENSG00000145375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC048217 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:47791 IMAGE:6052305), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256714 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:122923074:123319450:1 Gene:OTTHUMG00000133074 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363996 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:122923101:123102293:1 Gene:OTTHUMG00000133074 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iey.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iez.4 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027105 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1091 (LINC01091), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027106 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1091 (LINC01091), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:123650267:123666832:1 gene:ENSG00000249464 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364006 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:123650267:123666832:1 Gene:OTTHUMG00000161162 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364190 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:123650291:123930406:1 Gene:OTTHUMG00000161162 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364191 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:123650291:123930354:1 Gene:OTTHUMG00000161162 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364450 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:123774264:123865573:1 Gene:OTTHUMG00000161162 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285419 (LOC285419), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285419 (LOC285419), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AL833449 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P12109 (from clone DKFZp686P12109). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ifc.2 cpcScore=-0.4249850 cnci=-0.4129936 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285419 (LOC285419), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024582 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:125393936:125491768:1 gene:ENSG00000196159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:125316399:125492932:1 gene:ENSG00000196159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK096646 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39327 fis, clone OCBBF2015506, highly similar to Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 4 (Drosophila) (Fat4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY356402 // GenBank // Homo sapiens fat-like cadherin FATJ protein (FATJ) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256765 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:125316399:125492932:1 Gene:OTTHUMG00000133100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313530 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:125393936:125491768:1 Gene:OTTHUMG00000133100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363926 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:125446111:125448578:1 Gene:OTTHUMG00000133100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifj.4 // UCSC Genes // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364427 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:125362819:125362929:1 gene:ENSG00000201297 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031291 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31 (SLC25A31), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000281154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:127730378:127774299:1 gene:ENSG00000151475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022032 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31, mRNA (cDNA clone MGC:26955 IMAGE:4822384), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257094 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:127730378:127774299:1 Gene:OTTHUMG00000133300 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31 (SLC25A31), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK090904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33585 fis, clone BRAMY2012163. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ifn.2 cpcScore=-0.0305281 cnci=-0.3476600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33585 fis, clone BRAMY2012163. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000501498 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000501498 cpcScore=-0.7975540 cnci=-0.2929604 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459599 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:129677181:129677284:1 gene:ENSG00000238802 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:131273242:131273348:1 gene:ENSG00000206782 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516205 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:131768140:131768249:1 gene:ENSG00000252014 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020815 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032961 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:133149315:133194700:1 gene:ENSG00000138650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394248 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:134070470:134085193:1 gene:ENSG00000138650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111560 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 10, mRNA (cDNA clone MGC:133344 IMAGE:40068151), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:133149315:133194700:1 Gene:OTTHUMG00000161301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367740 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:133154893:133208606:1 Gene:OTTHUMG00000161301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003igz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iha.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410594 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:137228126:137228231:1 gene:ENSG00000222526 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012118 // RefSeq // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (CCRN4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000280614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139015789:139045752:1 gene:ENSG00000151014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC077723 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:2959976), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113494 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:142054 IMAGE:8322546), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257231 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139015789:139045752:1 Gene:OTTHUMG00000161271 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364337 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139043072:139045105:1 Gene:OTTHUMG00000161271 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ihk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (CCRN4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ihl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (CCRN4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516694 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139055475:139055578:1 gene:ENSG00000252503 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384654 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:139200395:139200513:1 gene:ENSG00000207384 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139318378:139318486:1 gene:ENSG00000200520 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031296 // RefSeq // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family (RAB33B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000305626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139453807:139476609:1 gene:ENSG00000172007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036064 // GenBank // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:33684 IMAGE:5288066), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111977 // GenBank // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:138182 IMAGE:8327445), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257235 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139453807:139476609:1 Gene:OTTHUMG00000133384 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ihv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family (RAB33B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032557 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143184945:143223830:1 gene:ENSG00000170185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510377 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:143184917:143215577:1 gene:ENSG00000170185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039115 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:43052 IMAGE:5258804), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068975 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:70375 IMAGE:6067501), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364869 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143184945:143223830:1 Gene:OTTHUMG00000161420 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364870 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143185694:143223830:1 Gene:OTTHUMG00000161420 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364871 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143184917:143215577:1 Gene:OTTHUMG00000161420 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ija.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ijb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ijc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000494591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143424753:143426013:1 gene:ENSG00000243175 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003601 // RefSeq // Homo sapiens SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (SMARCA5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535006 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:144434620:144474565:1 gene:ENSG00000153147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536484 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:144434617:144474471:1 gene:ENSG00000153147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023144 // GenBank // Homo sapiens SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:17104 IMAGE:4340921), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000283131 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2025:236076:270191:- gene:ENSG00000153147 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365077 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143513463:143557486:1 Gene:OTTHUMG00000161474 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365160 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143543633:143544356:1 Gene:OTTHUMG00000161474 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365162 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143547432:143548218:1 Gene:OTTHUMG00000161474 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ijg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (SMARCA5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003675 // RefSeq // Homo sapiens glucuronidase, beta pseudogene 5 (GUSBP5), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143559472:143561460:1 gene:ENSG00000236296 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iji.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chr.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011chr.1 cpcScore=2.3893100 cnci=-0.3151084 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chr.2 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000536295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:145375543:145376253:1 gene:ENSG00000251333 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069804 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7262595, with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ikf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7262571, with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384453 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:146580048:146580210:1 gene:ENSG00000207182 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459053 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:150209706:150209768:1 gene:ENSG00000238721 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000513425 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:4:152182570:152184119:1 gene:ENSG00000249012 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_183375 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 48 (PRSS48), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:151277171:151291453:1 gene:ENSG00000189099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:151277171:151291453:1 gene:ENSG00000189099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121109 // GenBank // Homo sapiens epidermis-specific serine protease-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:150407 IMAGE:40120369), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121110 // GenBank // Homo sapiens epidermis-specific serine protease-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:150408 IMAGE:40120371), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365685 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:151277171:151291453:1 Gene:OTTHUMG00000161673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:151277171:151291453:1 Gene:OTTHUMG00000161673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cif.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 48 (PRSS48), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cig.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 48 (PRSS48), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516735 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:151300518:151300613:1 gene:ENSG00000252544 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033797 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein DKFZP434I0714 (DKFZP434I0714), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_039658 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 4453 (MIR4453), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365030 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:152536264:152539263:1 Gene:OTTHUMG00000161466 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003imv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized protein DKFZP434I0714 (DKFZP434I0714), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516566 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:152900966:152901079:1 gene:ENSG00000252375 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033393 // RefSeq // Homo sapiens FH2 domain containing 1 (FHDC1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000260008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:152942983:152979696:1 gene:ENSG00000137460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152936352:152979686:1 gene:ENSG00000137460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:152936352:152979686:1 Gene:OTTHUMG00000161452 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003inf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens FH2 domain containing 1 (FHDC1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xti.1 // UCSC Genes // Annexin II and uses thereof. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154787118:154787278:1 gene:ENSG00000222582 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154790291:154790484:1 gene:ENSG00000252604 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000910 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2 (NPY2R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:155208629:155217076:1 gene:ENSG00000185149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:155208735:155217078:1 gene:ENSG00000185149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075052 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2, mRNA (cDNA clone MGC:103963 IMAGE:30915364), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365128 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:155208629:155217076:1 Gene:OTTHUMG00000161485 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365129 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:155208735:155217078:1 Gene:OTTHUMG00000161485 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// U32500 // GenBank // Human type 2 neuropeptide Y receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ioq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2 (NPY2R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ior.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2 (NPY2R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xtm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2 (NPY2R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xtn.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTG) // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516715 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:157064557:157064663:1 gene:ENSG00000252524 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390998 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:159621843:159622060:1 gene:ENSG00000212300 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401270 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:160216866:160216935:1 gene:ENSG00000216089 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006174 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5 (NPY5R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163343939:163351934:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163350219:163351636:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163344102:163351934:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042416 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5, mRNA (cDNA clone MGC:34438 IMAGE:5191617), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364633 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:163344102:163351934:1 Gene:OTTHUMG00000161353 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:163350219:163351636:1 Gene:OTTHUMG00000161353 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364683 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:163343939:163351934:1 Gene:OTTHUMG00000161353 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iqn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5 (NPY5R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xtw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5 (NPY5R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:164620732:164620837:1 gene:ENSG00000223037 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364180 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:164787290:164787396:1 gene:ENSG00000201050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153027 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 218, member A (FAM218A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:164956948:164959122:1 gene:ENSG00000250486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022381 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:24024 IMAGE:4248805), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364308 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:164956948:164959122:1 Gene:OTTHUMG00000161252 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iqx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 218, member A (FAM218A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:165252580:165252661:1 gene:ENSG00000200974 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xuc.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xue.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459352 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:169231843:169231946:1 gene:ENSG00000238744 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384442 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:168471409:168471539:1 gene:ENSG00000207171 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:168885355:168885461:1 gene:ENSG00000201176 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516152 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:170891467:170891597:1 gene:ENSG00000251961 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408499 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:11:39730809:39730903:1 gene:ENSG00000264020 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000504618 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:173369969:173371232:1 gene:ENSG00000164105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362361 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:173369969:173371232:1 Gene:OTTHUMG00000160798 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003864 // RefSeq // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 30kDa (SAP30), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:173370943:173377532:1 gene:ENSG00000164105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016757 // GenBank // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 30kDa, mRNA (cDNA clone MGC:13685 IMAGE:4074154), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362360 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:173370943:173377532:1 Gene:OTTHUMG00000160798 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003itd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 30kDa (SAP30), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xum.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xun.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408209 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:176394153:176394259:1 gene:ENSG00000221136 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408750 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:13:33041352:33041443:1 gene:ENSG00000221677 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021928 // RefSeq // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (SPCS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507001 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:176326956:176328353:1 gene:ENSG00000129128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047290 // GenBank // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:54142 IMAGE:5224927), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503362 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold775:317043:321047:+ gene:ENSG00000129128 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362329 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176319964:176332245:1 Gene:OTTHUMG00000160789 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362330 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176319991:176328406:1 Gene:OTTHUMG00000160789 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362331 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176320002:176327381:1 Gene:OTTHUMG00000160789 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362332 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176326956:176328353:1 Gene:OTTHUMG00000160789 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iur.4 // UCSC Genes // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (SPCS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028342 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1098 (LINC01098), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507870 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:177728757:177990750:1 gene:ENSG00000231171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361922 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:177728757:177990750:1 Gene:OTTHUMG00000160724 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iru.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285501 (LOC285501), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iru.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iru.2 cpcScore=3.4451700 cnci=-0.2088767 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516579 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:178752503:178752589:1 gene:ENSG00000252388 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000423200 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:182443813:182444154:1 gene:ENSG00000225356 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408259 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:182826228:182826365:1 gene:ENSG00000221186 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003612 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member A1 pseudogene 2 (FAM92A1P2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183037665:183040119:1 gene:ENSG00000230219 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member A1 pseudogene 2 (FAM92A1P2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivi.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ivi.3 cpcScore=4.2257900 cnci=-0.2826313 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458784 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:184250451:184250554:1 gene:ENSG00000238596 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001564 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2 (ING2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434682 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:184427360:184432105:1 gene:ENSG00000168556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB196793 // GenBank // Homo sapiens ING2b mRNA for ING2 splice variant 1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030128 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:10524 IMAGE:3941655), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302327 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold321:2225052:2225729:+ gene:ENSG00000168556 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000318652 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:183504994:183511096:1 Gene:OTTHUMG00000150502 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000318653 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:183506082:183510643:1 Gene:OTTHUMG00000150502 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2 (ING2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011ckk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2 (ING2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516069 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:184431966:184432049:1 gene:ENSG00000251878 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459026 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:186867237:186867340:1 gene:ENSG00000239034 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517204 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:186130021:186130155:1 gene:ENSG00000253013 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_174900 // RefSeq // Homo sapiens ZFP42 zinc finger protein (ZFP42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:187995771:188005045:1 gene:ENSG00000179059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK056719 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32157 fis, clone PLACE6000205, moderately similar to TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN YY1. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326866 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2518:609538:610428:- gene:ENSG00000179059 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:187995771:188005050:1 Gene:OTTHUMG00000160235 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:187995771:188005045:1 Gene:OTTHUMG00000160235 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003izh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP42 zinc finger protein (ZFP42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003izi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP42 zinc finger protein (ZFP42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xvm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP42 zinc finger protein (ZFP42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178556 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:188139419:188147622:1 gene:ENSG00000184108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:188143643:188147743:1 gene:ENSG00000184108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015684 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4650977), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113860 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138639 IMAGE:40033174), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359813 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:188139419:188147622:1 Gene:OTTHUMG00000160237 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:188143643:188147743:1 Gene:OTTHUMG00000160237 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359815 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:188143663:188147306:1 Gene:OTTHUMG00000160237 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003izm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003izn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000448646 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:189659506:189660648:1 gene:ENSG00000180015 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000378770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:189473147:189475190:1 gene:ENSG00000205100 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036692 // NONCODE // accn=NR_036692 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036692 cpcScore=8.6233200 cnci=-0.1497104 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xvo.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408788 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:190904420:190904530:1 gene:ENSG00000221715 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001127388 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 6 (DUX4L6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001127389 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 5 (DUX4L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001164467 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 3 (DUX4L3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001177376 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 4 (DUX4L4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000553598 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:190992087:190993703:1 gene:ENSG00000258755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000553820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:190071232:190072742:1 gene:ENSG00000277706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000258755 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554416 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:4:190992387:190993946:1 gene:ENSG00000258755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554906 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:190071232:190072742:1 gene:ENSG00000277706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000258755 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:190071232:190072742:1 Gene:OTTHUMG00000161314 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xvq.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001127386 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 2 (DUX4L2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001177376 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 4 (DUX4L4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012147 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 2 (DUX2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_033178 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 (DUX4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:190084412:190085922:1 gene:ENSG00000258389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000556625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:190084412:190085686:1 gene:ENSG00000258389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364516 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:4:191005567:191007067:1 Gene:OTTHUMG00000161317 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ist.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001127386 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 2 (DUX4L2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001177376 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 like 4 (DUX4L4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_012147 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 2 (DUX2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_033178 // RefSeq // [retired]Homo sapiens double homeobox 4 (DUX4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:190091005:190092279:1 gene:ENSG00000259128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000553702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:190091005:190092515:1 gene:ENSG00000259128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000554376 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:190091005:190092564:1 gene:ENSG00000259128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364515 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:190091005:190092515:1 Gene:OTTHUMG00000161316 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xvs.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001137608 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 732 (ZNF732), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:270675:305321:-1 gene:ENSG00000186777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:270675:305321:-1 Gene:OTTHUMG00000159883 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011buu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 732 (ZNF732), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xka.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 732 (ZNF732), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516341 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:467528:467636:-1 gene:ENSG00000252150 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000468356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:653059:655645:-1 gene:ENSG00000242686 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:653734:655477:-1 gene:ENSG00000242686 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358106 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:653059:655645:-1 Gene:OTTHUMG00000159908 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358107 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:653734:655477:-1 Gene:OTTHUMG00000159908 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020343 // GenBank HTC // Homo sapiens phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta (congenital stationary night blindness 3, autosomal dominant), mRNA (cDNA clone IMAGE:4157950). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gaq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta (congenital stationary night blindness 3, autosomal dominant), mRNA (cDNA clone IMAGE:4157950). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033768 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 11, pseudogene (TMED11P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1115197:1123164:-1 gene:ENSG00000215367 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xki.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 11, pseudogene (TMED11P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000422806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:1402932:1406331:-1 gene:ENSG00000235608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:1402932:1406331:-1 Gene:OTTHUMG00000160165 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384282 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:1683420:1683529:-1 gene:ENSG00000207009 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2342581:2343524:-1 gene:ENSG00000159733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360088 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:2342581:2343524:-1 Gene:OTTHUMG00000160292 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384011 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:2615124:2615224:-1 gene:ENSG00000206738 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045414 // RefSeq // Homo sapiens HTT antisense RNA (head to head) (HTT-AS), antisense RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3063471:3074514:-1 gene:ENSG00000251075 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358233 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:3063471:3074514:-1 Gene:OTTHUMG00000159915 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xku.1 // UCSC Genes // Homo sapiens HTT antisense RNA 1 (head to head) (HTT-AS1), antisense RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515934 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:4:3080209:3080270:-1 gene:ENSG00000251743 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024253 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member E, pseudogene (FAM86EP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000313946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3941760:3955415:-1 gene:ENSG00000251669 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC044637 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC348926, mRNA (cDNA clone IMAGE:4546485), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member E, pseudogene (FAM86EP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bvu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member E, pseudogene (FAM86EP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3915183:3955419:-1 gene:ENSG00000253917 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ghn.2 cpcScore=3.5020400 cnci=-0.1233583 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bvu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bvu.1 cpcScore=5.8523800 cnci=-0.1576228 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145725 // RefSeq // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_017816 // RefSeq // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4267701:4290169:-1 gene:ENSG00000145220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015796 // GenBank // Homo sapiens Ly1 antibody reactive homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:8861 IMAGE:3911275), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452476 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold862:2840764:2851891:- gene:ENSG00000145220 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246800 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:4267701:4290169:-1 Gene:OTTHUMG00000125477 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358646 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:4281783:4290038:-1 Gene:OTTHUMG00000125477 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359601 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:4267701:4268932:-1 Gene:OTTHUMG00000125477 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ght.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bvy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bvx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516457 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:5426885:5426984:-1 gene:ENSG00000252266 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000324058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:5897591:5989647:-1 gene:ENSG00000181215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000531445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5957118:5989818:-1 gene:ENSG00000181215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140710 // GenBank // Homo sapiens FLJ46481 protein, mRNA (cDNA clone MGC:176387 IMAGE:9021578), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000314647 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:5957118:5989818:-1 Gene:OTTHUMG00000149971 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX648674 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I0747 (from clone DKFZp686I0747). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003git.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ46481 fis, clone THYMU3025772. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203462 // RefSeq // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 (MRFAP1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6707701:6709880:-1 gene:ENSG00000178988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008087 // GenBank // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9651 IMAGE:3446352), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066897 // GenBank // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:86990 IMAGE:4818881), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246834 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6707701:6709880:-1 Gene:OTTHUMG00000125507 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358976 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:6707701:6709827:-1 Gene:OTTHUMG00000125507 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gjo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 (MRFAP1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xlc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 (MRFAP1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153376 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96 (CCDC96), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105055 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96, mRNA (cDNA clone MGC:132715 IMAGE:8144058), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112274 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96, mRNA (cDNA clone MGC:138479 IMAGE:8327742), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310085 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold366:376432:377571:- gene:ENSG00000173013 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000246838 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7040849:7042939:-1 Gene:OTTHUMG00000125511 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gjv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96 (CCDC96), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xlg.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTA) // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085382 // RefSeq // Homo sapiens prosaposin-like 1 (gene/pseudogene) (PSAPL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:7432258:7434945:-1 gene:ENSG00000178597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358859 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:7432258:7434945:-1 Gene:OTTHUMG00000160006 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bwj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens prosaposin-like 1 (gene/pseudogene) (PSAPL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ572409 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-40521, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xli.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31902, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:8005301:8005381:-1 gene:ENSG00000207807 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000359029 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:8355090:8358338:-1 Gene:OTTHUMG00000160053 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:8355090:8358338:-1 gene:ENSG00000251615 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AX746755 // NONCODE // accn=AX746755 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5073 cpcScore=-0.1411060 cnci=-0.2324567 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003glb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ11478 fis, clone HEMBA1001781. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000557144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:8858715:8860827:-1 gene:ENSG00000258507 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408553 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:9023333:9023480:-1 gene:ENSG00000238726 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459267 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:9601952:9602051:-1 gene:ENSG00000265901 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429096 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000429096 cpcScore=1.7977000 cnci=-0.1269760 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516498 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:9411178:9411253:-1 gene:ENSG00000252307 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584669 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010idl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-51781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:9792751:9792861:-1 gene:ENSG00000252002 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005114 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (HS3ST1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC057803 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:71699 IMAGE:5261530), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000002596 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold862:1180022:1180747:+ gene:ENSG00000002587 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000207073 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:11393150:11429765:-1 Gene:OTTHUMG00000090547 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360253 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:11399758:11429564:-1 Gene:OTTHUMG00000090547 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360254 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:11399758:11428597:-1 Gene:OTTHUMG00000090547 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gmq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (HS3ST1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (HS3ST1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410250 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:11414051:11414160:-1 gene:ENSG00000222182 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408867 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:12798705:12798791:-1 gene:ENSG00000221794 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034054 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1097 (LINC01097), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK311420 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18462. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010idp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285547 (LOC285547), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC285547 (LOC285547), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505835 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505835 cpcScore=-0.9168840 cnci=-0.2419733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536697 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000536697 cpcScore=-0.9137990 cnci=-0.2676937 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC070495 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6048715, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gnd.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gnd.3 cpcScore=1.5124400 cnci=-0.3846494 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gnd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens, clone IMAGE:3917723, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:14470465:14888169:-1 gene:ENSG00000248360 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359284 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:14628756:14716595:-1 Gene:OTTHUMG00000160121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360857 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:14474085:14888167:-1 Gene:OTTHUMG00000160121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360858 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:14474087:14888168:-1 Gene:OTTHUMG00000160121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360859 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:14470465:14888169:-1 Gene:OTTHUMG00000160121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036758 // GenBank // Homo sapiens similar to hypothetical protein (L1H 3 region) - human, mRNA (cDNA clone MGC:46671 IMAGE:5563071), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062308 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3547043, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gne.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gne.2 cpcScore=7.2836400 cnci=-0.2655209 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gne.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3604199, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gnf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gnf.2 cpcScore=7.3954400 cnci=-0.2672511 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gnf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3604199, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005130 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1 (FGFBP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:15935569:15938740:-1 gene:ENSG00000137440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003628 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:2568 IMAGE:3030037), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008910 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:15257 IMAGE:3689309), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000259988 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold306:78526:79230:- gene:ENSG00000137440 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000214974 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:15935569:15938740:-1 Gene:OTTHUMG00000097745 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gom.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1 (FGFBP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xml.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1 (FGFBP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384053 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:17320746:17320882:-1 gene:ENSG00000206780 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516007 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:19181814:19181856:-1 gene:ENSG00000251816 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002813 // RefSeq // Homo sapiens KCNIP4 intronic transcript 1 (non-protein coding) (KCNIP4-IT1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gqj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens KCNIP4 intronic transcript 1 (non-protein coding) (KCNIP4-IT1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410330 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:24421176:24421301:-1 gene:ENSG00000222262 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018176 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2 (LGI2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000282970 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:25003397:25028543:-1 gene:ENSG00000153012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000382114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:24998847:25030879:-1 gene:ENSG00000153012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101759 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126808 IMAGE:8069265), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101761 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126810 IMAGE:8069267), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000214978 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:24998847:25030879:-1 Gene:OTTHUMG00000097749 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:24999767:25030665:-1 Gene:OTTHUMG00000097749 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003grf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2 (LGI2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459120 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:25598564:25598625:-1 gene:ENSG00000238632 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000730 // RefSeq // Homo sapiens cholecystokinin A receptor (CCKAR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:26481400:26490462:-1 gene:ENSG00000163394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074987 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin A receptor, mRNA (cDNA clone MGC:104068 IMAGE:30915519), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250418 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:26481400:26490462:-1 Gene:OTTHUMG00000128567 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gse.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cholecystokinin A receptor (CCKAR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410274 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:27223319:27223427:-1 gene:ENSG00000222206 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408880 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:12:66091174:66091257:-1 gene:ENSG00000221807 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571874 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-31986, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bxv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31636, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458842 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:34966241:34966344:-1 gene:ENSG00000238694 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gsx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36345 fis, clone THYMU2006913. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085399 // RefSeq // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001085400 // RefSeq // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000314117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37590800:37686376:-1 gene:ENSG00000181826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37612901:37686376:-1 gene:ENSG00000181826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039540 // GenBank // Homo sapiens RELT-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:50583 IMAGE:5748847), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37590800:37686376:-1 Gene:OTTHUMG00000160389 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360485 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37612901:37686376:-1 Gene:OTTHUMG00000160389 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360486 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:37634887:37665381:-1 Gene:OTTHUMG00000160389 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gsz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ifc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026804 // RefSeq // Homo sapiens KLF3 antisense RNA 1 (KLF3-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38612701:38664628:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF289565 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp6414 unknown mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360420 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38612701:38664628:-1 Gene:OTTHUMG00000160386 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360422 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38625334:38664855:-1 Gene:OTTHUMG00000160386 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38625334:38664883:-1 Gene:OTTHUMG00000160386 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361345 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38619690:38624575:-1 Gene:OTTHUMG00000160386 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized FLJ13197 (FLJ13197), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gtf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized FLJ13197 (FLJ13197), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38626408:38664809:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000196355 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gtf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gtf.2 cpcScore=1.8595400 cnci=-0.1640576 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410298 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:38758791:38758892:-1 gene:ENSG00000222230 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024943 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 156 (TMEM156), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38998460:39032407:-1 gene:ENSG00000121895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38966744:39032421:-1 gene:ENSG00000121895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030803 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 156, mRNA (cDNA clone MGC:22165 IMAGE:4806992), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060512 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 156, mRNA (cDNA clone IMAGE:4104998). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38966744:39032421:-1 Gene:OTTHUMG00000128582 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317570 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:39028375:39032720:-1 Gene:OTTHUMG00000128582 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38993735:39032922:-1 Gene:OTTHUMG00000128582 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360607 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:38998460:39032407:-1 Gene:OTTHUMG00000128582 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gto.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 156 (TMEM156), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ifj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 156 (TMEM156), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39297605:39297711:-1 gene:ENSG00000206675 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517166 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:39710085:39710176:-1 gene:ENSG00000252975 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027277 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene (LOC344967), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:40042917:40057199:-1 gene:ENSG00000205794 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011byr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene (LOC344967), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:40377452:40377513:-1 gene:ENSG00000239010 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384466 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:40826655:40826765:-1 gene:ENSG00000207195 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459305 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:40870886:40870987:-1 gene:ENSG00000238351 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xnu.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon TTG) // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384750 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:41303237:41303337:-1 gene:ENSG00000207481 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41771945:41772103:-1 gene:ENSG00000200338 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198353 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 8 (KCTD8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132743 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:164374 IMAGE:40146765), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360029 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold202:474303:474990:- gene:ENSG00000183783 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000216868 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44173909:44448807:-1 Gene:OTTHUMG00000099409 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:44174955:44447613:-1 Gene:OTTHUMG00000099409 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gwu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 8 (KCTD8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC048420 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4795462. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gxa.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gxa.2 cpcScore=-1.2962100 cnci=-0.4462067 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gxa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5300502. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173536 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1 (GABRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:46035769:46124081:-1 gene:ENSG00000163285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540030 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:46042611:46126082:-1 gene:ENSG00000163285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031087 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:33838 IMAGE:5289008), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250470 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:46035769:46124081:-1 Gene:OTTHUMG00000128609 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gxb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1 (GABRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:46531237:46531342:-1 gene:ENSG00000252243 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000394695 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:46725793:46726625:-1 gene:ENSG00000249936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459312 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:47307951:47308054:-1 gene:ENSG00000238301 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017845 // RefSeq // Homo sapiens COMM domain containing 8 (COMMD8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:47450796:47463719:-1 gene:ENSG00000169019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008371 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:12221 IMAGE:4051246), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015145 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:24376 IMAGE:4052767), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019826 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:29946 IMAGE:4995315), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000216898 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:47450796:47463719:-1 Gene:OTTHUMG00000099435 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361689 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:47459847:47463665:-1 Gene:OTTHUMG00000099435 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gxi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens COMM domain containing 8 (COMMD8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517241 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48109353:48109410:-1 gene:ENSG00000253050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48574453:48574520:-1 gene:ENSG00000251722 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48932755:48932854:-1 gene:ENSG00000252913 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583161 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50273, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xoe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50272, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587539 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54651, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gyy.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gyy.2 cpcScore=-1.2371500 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gyy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579969 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-48081, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xof.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30781, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587539 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54651, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xoh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590126 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57238, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gzd.2 cpcScore=-1.5403900 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408329 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:49597008:49597090:-1 gene:ENSG00000221256 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408148 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49595610:49595692:-1 gene:ENSG00000221075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408285 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:49599821:49599903:-1 gene:ENSG00000221212 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408407 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49598423:49598505:-1 gene:ENSG00000221334 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408155 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49598615:49598697:-1 gene:ENSG00000221082 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411167 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:49599428:49599509:-1 gene:ENSG00000223099 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024611 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 66 (LRRC66), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:51993702:52017620:-1 gene:ENSG00000188993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361473 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:51993702:52017620:-1 Gene:OTTHUMG00000160623 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 66 (LRRC66), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000232 // RefSeq // Homo sapiens sarcoglycan, beta (43kDa dystrophin-associated glycoprotein) (SGCB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:52020706:52038482:-1 gene:ENSG00000163069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535450 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:52888225:52904425:-1 gene:ENSG00000163069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299765 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57888 complete cds, highly similar to Beta-sarcoglycan. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020709 // GenBank // Homo sapiens sarcoglycan, beta (43kDa dystrophin-associated glycoprotein), mRNA (cDNA clone MGC:22481 IMAGE:4770458), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250596 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52020706:52038482:-1 Gene:OTTHUMG00000128697 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361452 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52028771:52038245:-1 Gene:OTTHUMG00000128697 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361453 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52028829:52033640:-1 Gene:OTTHUMG00000128697 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sarcoglycan, beta (43kDa dystrophin-associated glycoprotein) (SGCB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sarcoglycan, beta (43kDa dystrophin-associated glycoprotein) (SGCB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152540 // RefSeq // Homo sapiens sec1 family domain containing 2 (SCFD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000388940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52873788:53366061:-1 gene:ENSG00000184178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52872982:53366075:-1 gene:ENSG00000184178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK096833 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39514 fis, clone PUAEN1000085. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021137 // GenBank // Homo sapiens sec1 family domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:32058 IMAGE:4866354), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032453 // GenBank // Homo sapiens sec1 family domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:40484 IMAGE:5176029), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361311 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52872982:53366075:-1 Gene:OTTHUMG00000160588 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361786 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:52873788:53366061:-1 Gene:OTTHUMG00000160588 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363943 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:53352598:53366066:-1 Gene:OTTHUMG00000160588 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gzu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sec1 family domain containing 2 (SCFD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010igm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sec1 family domain containing 2 (SCFD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384655 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:53265461:53265567:-1 gene:ENSG00000207385 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027153 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L21 pseudogene 44 (RPL21P44), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bzv.1 cpcScore=3.0276200 cnci=-0.3145687 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzv.2 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012110 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich hydrophobic domain 2 (CHIC2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:54009789:54064690:-1 gene:ENSG00000109220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512964 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:54009825:54064300:-1 gene:ENSG00000109220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034691 // GenBank // Homo sapiens cysteine-rich hydrophobic domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:21173 IMAGE:4747392), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000219937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:54009789:54064690:-1 Gene:OTTHUMG00000102101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361552 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:54009825:54064300:-1 Gene:OTTHUMG00000102101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361553 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:54048831:54064308:-1 Gene:OTTHUMG00000102101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361554 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:54009979:54064298:-1 Gene:OTTHUMG00000102101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003haj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-rich hydrophobic domain 2 (CHIC2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408292 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:54969747:54969823:-1 gene:ENSG00000221219 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459598 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:54989267:54989371:-1 gene:ENSG00000238753 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000508484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:54603211:54607131:-1 gene:ENSG00000250456 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC044946 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC339978, mRNA (cDNA clone IMAGE:5227409), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363888 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:54603211:54607131:-1 Gene:OTTHUMG00000161130 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hap.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein LOC339978, mRNA (cDNA clone IMAGE:5215216), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002253 // RefSeq // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) (KDR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131822 // GenBank // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase), mRNA (cDNA clone MGC:157715 IMAGE:40129287), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263923 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1444:1284918:1329778:- gene:ENSG00000128052 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FJ899739 // GenBank // Homo sapiens truncated soluble vascular endothelial growth factor receptor 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250645 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55078477:55125589:-1 Gene:OTTHUMG00000128734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361580 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55104593:55125293:-1 Gene:OTTHUMG00000128734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361581 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55094850:55096720:-1 Gene:OTTHUMG00000128734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003has.3 // UCSC Genes // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) (KDR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hat.1 // UCSC Genes // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) (KDR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011bzx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) (KDR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// X61656 // GenBank // H.sapiens mRNA for growth factor receptor tyrosine kinase. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037969 // RefSeq // Homo sapiens SRD5A3 antisense RNA 1 (SRD5A3-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55363971:55383396:-1 gene:ENSG00000249700 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55366601:55385580:-1 gene:ENSG00000249700 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047403 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5302137. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361585 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55363971:55383396:-1 Gene:OTTHUMG00000160655 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361586 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55366601:55385580:-1 Gene:OTTHUMG00000160655 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hav.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SRD5A3 antisense RNA 1 (SRD5A3-AS1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003haw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens SRD5A3 antisense RNA 1 (SRD5A3-AS1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003haw.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003haw.1 cpcScore=-0.8572150 cnci=-0.2975585 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459424 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:55501595:55501708:-1 gene:ENSG00000238585 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152401 // RefSeq // Homo sapiens phosducin-like 2 (PDCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55556525:55592212:-1 gene:ENSG00000163440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034431 // GenBank // Homo sapiens phosducin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:35083 IMAGE:5166825), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361659 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:55556525:55592212:-1 Gene:OTTHUMG00000160674 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hbb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosducin-like 2 (PDCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56288485:56288584:-1 gene:ENSG00000252489 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002703 // RefSeq // Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (PPAT), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56393362:56435615:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56401390:56408328:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004200 // GenBank // Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:3674 IMAGE:3533162), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250781 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56393362:56435615:-1 Gene:OTTHUMG00000128842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362437 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56393365:56400916:-1 Gene:OTTHUMG00000128842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362438 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56401390:56408328:-1 Gene:OTTHUMG00000128842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362439 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56403074:56435496:-1 Gene:OTTHUMG00000128842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362440 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56403063:56435508:-1 Gene:OTTHUMG00000128842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hbr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (PPAT), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021114 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (acrosin-trypsin inhibitor) (SPINK2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000248701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56809861:56821742:-1 gene:ENSG00000128040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504762 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:56809872:56821694:-1 gene:ENSG00000128040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:56809861:56821742:-1 gene:ENSG00000128040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022514 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (acrosin-trypsin inhibitor), mRNA (cDNA clone MGC:26562 IMAGE:4812189), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56809861:56821742:-1 Gene:OTTHUMG00000128769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362242 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56809861:56821742:-1 Gene:OTTHUMG00000128769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56809872:56821694:-1 Gene:OTTHUMG00000128769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362244 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:56809860:56811796:-1 Gene:OTTHUMG00000128769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hcg.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515990 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:56818218:56818314:-1 gene:ENSG00000251799 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459071 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:57972409:57972511:-1 gene:ENSG00000238541 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459458 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:58358435:58358539:-1 gene:ENSG00000238925 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401208 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:60663949:60664038:-1 gene:ENSG00000216027 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516295 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:64397694:64397787:-1 gene:ENSG00000252104 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:65807240:65807435:-1 gene:ENSG00000222765 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383902 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:67429591:67429754:-1 gene:ENSG00000206629 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000406 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001012763 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67739328:67754360:-1 gene:ENSG00000109163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67740480:67754335:-1 gene:ENSG00000109163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113546 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:142106 IMAGE:8322598), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251432 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67739328:67754360:-1 Gene:OTTHUMG00000129302 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362257 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67740480:67754335:-1 Gene:OTTHUMG00000129302 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001114387 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11A (TMPRSS11A), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_182606 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11A (TMPRSS11A), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67910301:67964140:-1 gene:ENSG00000187054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:67911327:67963473:-1 gene:ENSG00000187054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67909385:67963426:-1 gene:ENSG00000187054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111796 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11A, mRNA (cDNA clone MGC:133183 IMAGE:40026103), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251433 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67910301:67964140:-1 Gene:OTTHUMG00000129303 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67909385:67963426:-1 Gene:OTTHUMG00000129303 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362392 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:67911310:67946564:-1 Gene:OTTHUMG00000129303 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11A (TMPRSS11A), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hds.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11A (TMPRSS11A), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033737 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11G, pseudogene (TMPRSS11GP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67991812:67997487:-1 gene:ENSG00000229009 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207407 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11F (TMPRSS11F), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68053198:68129880:-1 gene:ENSG00000198092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251439 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68053198:68129880:-1 Gene:OTTHUMG00000129307 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11F (TMPRSS11F), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027094 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin XIV pseudogene 1 (SYT14P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144378 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052899, containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin XIV-like (SYT14L), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xou.1 // UCSC Genes // RecName: Full=Putative synaptotagmin-14-like protein; AltName: Full=Synaptotagmin XIV-derived protein; AltName: Full=Synaptotagmin XIV-like protein; // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010ihn.2 cpcScore=3.0631100 cnci=-0.3417910 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001129907 // RefSeq // [retired]Homo sapiens TMPRSS11B N terminal-like (TMPRSS11BNL), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432593 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:69054242:69083798:-1 gene:ENSG00000226894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68188524:68218080:-1 gene:ENSG00000250026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TMPRSS11B N-terminal like (TMPRSS11BNL), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182502 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11B (TMPRSS11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68226653:68245720:-1 gene:ENSG00000185873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126195 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11B, mRNA (cDNA clone MGC:161473 IMAGE:8991911), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251431 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68226653:68245720:-1 Gene:OTTHUMG00000129301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362412 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68231833:68245691:-1 Gene:OTTHUMG00000129301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362413 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68228742:68229678:-1 Gene:OTTHUMG00000129301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hdw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11B (TMPRSS11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B17 (UGT2B17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68537184:68568527:-1 gene:ENSG00000197888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68537184:68568527:-1 Gene:OTTHUMG00000129305 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xov.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B17 (UGT2B17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001076 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B15 (UGT2B15), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171879 // GenBank // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B15, mRNA (cDNA clone MGC:198594 IMAGE:9054533), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338206 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4215:41011:58871:- gene:ENSG00000196620 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365172 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68646630:68670628:-1 Gene:OTTHUMG00000161507 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xow.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B15 (UGT2B15), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000452537 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:69780640:69780918:-1 gene:ENSG00000198277 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024743 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (UGT2A3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024010 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (UGT2A3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000251566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68928463:68951791:-1 gene:ENSG00000135220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420231 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:69795175:69817079:-1 gene:ENSG00000135220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130533 // GenBank // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3, mRNA (cDNA clone MGC:163405 IMAGE:40146564), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251564 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68928463:68951791:-1 Gene:OTTHUMG00000129408 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365183 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:68929450:68951361:-1 Gene:OTTHUMG00000129408 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hef.2 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (UGT2A3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (UGT2A3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005420 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 (SULT1E1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69841212:69860152:-1 gene:ENSG00000109193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310845 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17887. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027956 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:34459 IMAGE:5210178), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251559 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69841212:69860152:-1 Gene:OTTHUMG00000129403 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362580 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69849126:69860145:-1 Gene:OTTHUMG00000129403 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362581 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69810780:69847786:-1 Gene:OTTHUMG00000129403 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003heo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 (SULT1E1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ihv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 (SULT1E1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001891 // RefSeq // Homo sapiens casein beta (CSN2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000353151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69955256:69961007:-1 gene:ENSG00000135222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069554 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:96987 IMAGE:7262196), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096194 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116846 IMAGE:40004178), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096195 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116847 IMAGE:40004179), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251565 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69955256:69961007:-1 Gene:OTTHUMG00000129409 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hes.4 // UCSC Genes // Homo sapiens casein beta (CSN2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003het.4 // UCSC Genes // Homo sapiens casein beta (CSN2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// X55739 // GenBank // Homo sapiens mRNA for beta-casein. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384330 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70703018:70703123:-1 gene:ENSG00000207058 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517071 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70848136:70848218:-1 gene:ENSG00000252880 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410304 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:71759518:71759616:-1 gene:ENSG00000222236 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014243 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3 (ADAMTS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:72441676:72568045:-1 gene:ENSG00000156140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019707 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4707162, containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130287 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:163159 IMAGE:40146318), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132735 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:164366 IMAGE:40146757), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286657 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4403:23923:312988:- gene:ENSG00000156140 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252164 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:72280969:72568799:-1 Gene:OTTHUMG00000129912 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362292 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:72441676:72568045:-1 Gene:OTTHUMG00000129912 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362293 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:72298225:72312255:-1 Gene:OTTHUMG00000129912 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hgk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3 (ADAMTS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hgl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3 (ADAMTS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002619 // RefSeq // Homo sapiens platelet factor 4 (PF4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73981077:73982124:-1 gene:ENSG00000163737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093965 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:121000 IMAGE:7939810), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112093 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:138298 IMAGE:8327561), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252282 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73981077:73982124:-1 Gene:OTTHUMG00000130009 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhi.2 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002704 // RefSeq // Homo sapiens pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7) (PPBP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028217 // GenBank // Homo sapiens pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7), mRNA (cDNA clone MGC:40008 IMAGE:5214257), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296028 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2224:416922:417713:+ gene:ENSG00000163736 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252281 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73987038:73988197:-1 Gene:OTTHUMG00000130008 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7) (PPBP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002994 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5 (CXCL5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73995642:73998779:-1 gene:ENSG00000163735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008376 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5, mRNA (cDNA clone MGC:12304 IMAGE:3826939), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:73995642:73998779:-1 Gene:OTTHUMG00000160871 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhk.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026769 // RefSeq // Homo sapiens pro-platelet basic protein pseudogene 2 (PPBPP2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74054038:74055399:-1 gene:ENSG00000248848 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iim.1 // UCSC Genes // Homo sapiens pro-platelet basic protein pseudogene 2 (PPBPP2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002089 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 2 (CXCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296031 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74097676:74099195:-1 gene:ENSG00000081041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74097035:74099293:-1 gene:ENSG00000081041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015753 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:23071 IMAGE:4875789), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74097035:74099293:-1 Gene:OTTHUMG00000160865 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74098531:74099196:-1 Gene:OTTHUMG00000160865 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362733 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74097676:74099195:-1 Gene:OTTHUMG00000160865 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hhm.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 2 (CXCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hhq.1 // UCSC Genes // SubName: Full=LOC541467 protein; Flags: Fragment; // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001729 // RefSeq // Homo sapiens betacellulin (BTC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74744759:74794686:-1 gene:ENSG00000174808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011618 // GenBank // Homo sapiens betacellulin, mRNA (cDNA clone MGC:10530 IMAGE:3952444), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252413 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74744759:74794686:-1 Gene:OTTHUMG00000130107 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362471 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74746379:74770156:-1 Gene:OTTHUMG00000130107 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hig.2 // UCSC Genes // Homo sapiens betacellulin (BTC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410712 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:75829454:75829589:-1 gene:ENSG00000222644 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001565 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 10 (CXCL10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76021117:76023497:-1 gene:ENSG00000169245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010954 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 10, mRNA (cDNA clone MGC:13622 IMAGE:4274617), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362817 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:76021117:76023497:-1 Gene:OTTHUMG00000160887 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hjl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 10 (CXCL10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005409 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (CXCL11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76033682:76036197:-1 gene:ENSG00000169248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503860 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:76034690:76041415:-1 gene:ENSG00000169248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005292 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:12356 IMAGE:3934139), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012532 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:13317 IMAGE:4096572), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110986 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:102770 IMAGE:5178174), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252407 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:76033682:76036197:-1 Gene:OTTHUMG00000130101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362816 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:76034690:76041415:-1 Gene:OTTHUMG00000130101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hjm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (CXCL11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:76356610:76356715:-1 gene:ENSG00000212368 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408191 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:76493247:76493386:-1 gene:ENSG00000221118 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:76532222:76532327:-1 gene:ENSG00000207307 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576800 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44912, complete sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hkh.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hkh.2 cpcScore=0.6086910 cnci=-0.2452744 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hkh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434B115 (from clone DKFZp434B115). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001029870 // RefSeq // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member B (SOWAHB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137241 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 56, mRNA (cDNA clone MGC:168861 IMAGE:9021238), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334306 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold216:1575085:1576614:+ gene:ENSG00000186212 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:76894928:76898147:-1 Gene:OTTHUMG00000160876 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hki.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member B (SOWAHB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429255 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:77880014:77880316:-1 gene:ENSG00000234036 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364771 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:77150328:77150437:-1 gene:ENSG00000201641 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408784 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:77702746:77702803:-1 gene:ENSG00000221711 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364128 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:78632273:78632385:-1 gene:ENSG00000200998 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032693 // RefSeq // Homo sapiens N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (NAA11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:79316653:79326050:-1 gene:ENSG00000156269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79225980:79325468:-1 gene:ENSG00000156269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362922 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79316653:79326050:-1 Gene:OTTHUMG00000160913 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362923 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79225694:79325523:-1 Gene:OTTHUMG00000160913 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:79225980:79325468:-1 Gene:OTTHUMG00000160913 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlt.4 // UCSC Genes // Homo sapiens N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (NAA11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xpl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (NAA11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365570 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:82402638:82402706:-1 gene:ENSG00000202440 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000488045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82494786:82496278:-1 gene:ENSG00000227304 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024087 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 575 (LINC00575), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024088 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 575 (LINC00575), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82613113:82621437:-1 gene:ENSG00000231782 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82613113:82621437:-1 gene:ENSG00000231782 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363866 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82613113:82621437:-1 Gene:OTTHUMG00000161121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363874 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82613113:82621437:-1 Gene:OTTHUMG00000161121 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ijs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 575 (LINC00575), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cck.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 575 (LINC00575), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cck.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cck.1 cpcScore=3.0043900 cnci=-0.2230511 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82909973:82928198:-1 gene:ENSG00000189308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363089 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:82909973:82928198:-1 Gene:OTTHUMG00000130287 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362660 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:82944738:82944845:-1 gene:ENSG00000199530 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364763 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:83636196:83636290:-1 gene:ENSG00000201633 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:84886386:84886486:-1 gene:ENSG00000252062 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_197965 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 6 (SLC10A6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:86823468:86849263:-1 gene:ENSG00000145283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107051 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:129575 IMAGE:40004572), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253043 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:86823468:86849263:-1 Gene:OTTHUMG00000130596 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:86825448:86849124:-1 Gene:OTTHUMG00000130596 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6 (SLC10A6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000444365 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:87870818:87871276:-1 gene:ENSG00000235043 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000506274 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:87219524:87240314:-1 gene:ENSG00000145332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363209 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87219524:87240314:-1 Gene:OTTHUMG00000130593 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363154 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:87743952:87744053:-1 gene:ENSG00000200024 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458772 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:88689637:88689733:-1 gene:ENSG00000238652 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88206427:88206552:-1 gene:ENSG00000221440 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384749 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:88330176:88330278:-1 gene:ENSG00000207480 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408152 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:88493933:88494017:1 gene:ENSG00000221079 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042616 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y (PIGY), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032906 // RefSeq // Homo sapiens PIGY upstream reading frame (PYURF), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:88520985:88523813:-1 gene:ENSG00000145337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000527353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:88521573:88521789:-1 gene:ENSG00000255072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007876 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y, mRNA (cDNA clone MGC:14156 IMAGE:3947944), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253550 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:88520985:88523813:-1 Gene:OTTHUMG00000130949 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hru.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xpz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y (PIGY), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384793 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88684848:88684954:-1 gene:ENSG00000207524 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153757 // RefSeq // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 5 (NAP1L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:88695915:88698235:-1 gene:ENSG00000177432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539293 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:89617074:89618964:-1 gene:ENSG00000177432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104883 // GenBank // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:132543 IMAGE:8143886), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253551 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:88695915:88698235:-1 Gene:OTTHUMG00000130950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hrx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 5 (NAP1L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF565118 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 isolate HA_003381 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:92268767:92277075:-1 Gene:OTTHUMG00000160917 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ikw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 isolate HA_003381 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:92268767:92277075:-1 gene:ENSG00000249152 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014485 // RefSeq // Homo sapiens hematopoietic prostaglandin D synthase (HPGDS), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:94303763:94342865:-1 gene:ENSG00000163106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020734 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin D2 synthase, hematopoietic, mRNA (cDNA clone MGC:22552 IMAGE:4731411), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295256 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2230:396577:412123:- gene:ENSG00000163106 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253587 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:94298535:94342876:-1 Gene:OTTHUMG00000130974 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362982 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:94334181:94342876:-1 Gene:OTTHUMG00000130974 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362983 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:94303763:94342865:-1 Gene:OTTHUMG00000130974 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hematopoietic prostaglandin D synthase (HPGDS), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:95868667:95868764:-1 gene:ENSG00000200622 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:96152297:96152403:-1 gene:ENSG00000201744 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_174952 // RefSeq // Homo sapiens sperm-tail PG-rich repeat containing 2 (STPG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000295268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:97558876:98143240:-1 gene:ENSG00000163116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:97235644:97893203:-1 gene:ENSG00000163116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036870 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 37, mRNA (cDNA clone MGC:46496 IMAGE:5226859), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253642 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:97558876:98143240:-1 Gene:OTTHUMG00000131009 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364068 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:97235644:97893203:-1 Gene:OTTHUMG00000131009 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000381036 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:97184093:97972354:-1 Gene:OTTHUMG00000131009 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003htt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens sperm-tail PG-rich repeat containing 2 (STPG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:98966815:98966873:-1 gene:ENSG00000252548 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028270 // RefSeq // Homo sapiens proliferating cell nuclear antigen pseudogene 1 (PCNAP1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cee.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proliferating cell nuclear antigen pseudogene 1 (PCNAP1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cee.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cee.1 cpcScore=1.7798400 cnci=-0.3496090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000667 // RefSeq // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide (ADH1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000209668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99276367:99291028:-1 gene:ENSG00000187758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511656 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:99286665:99290983:-1 gene:ENSG00000187758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309597 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99638. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074738 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:103814 IMAGE:30915195), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117442 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:151051 IMAGE:40125993), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253669 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:99276367:99291028:-1 Gene:OTTHUMG00000131026 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364679 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:99281815:99291003:-1 Gene:OTTHUMG00000131026 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364852 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:99286665:99290983:-1 Gene:OTTHUMG00000131026 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hur.2 // UCSC Genes // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide (ADH1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ilg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide (ADH1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ilf.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000669 // RefSeq // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide (ADH1C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510055 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:99342926:99352730:-1 gene:ENSG00000248144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062476 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:75464 IMAGE:30408761), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066227 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:79243 IMAGE:7002195), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074771 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:104013 IMAGE:30915457), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074786 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:103951 IMAGE:30915344), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515683 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2194:29075:44390:- gene:ENSG00000248144 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xqi.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145244 // RefSeq // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like (DDIT4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000273990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:100185870:100190468:-1 gene:ENSG00000145358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013592 // GenBank // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:9960 IMAGE:3877854), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:100185870:100190468:-1 Gene:OTTHUMG00000161019 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:100187875:100190782:-1 Gene:OTTHUMG00000161019 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363425 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:100187728:100190304:-1 Gene:OTTHUMG00000161019 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hvq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like (DDIT4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408338 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:101330302:101330414:-1 gene:ENSG00000221265 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458904 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:102565875:102565967:-1 gene:ENSG00000238553 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516930 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:102837047:102837099:-1 gene:ENSG00000252739 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458860 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:103780550:103780653:-1 gene:ENSG00000238948 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408595 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:104343257:104343353:-1 gene:ENSG00000221522 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195138 // RefSeq // Homo sapiens GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 (GIMD1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:106358398:106367202:-1 gene:ENSG00000250298 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363662 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:106358398:106367202:-1 Gene:OTTHUMG00000161071 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xqm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 (GIMD1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410401 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:106415706:106415785:-1 gene:ENSG00000222333 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516757 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:108038489:108038561:-1 gene:ENSG00000252566 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:107867807:107867910:-1 gene:ENSG00000222691 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030821 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIA (PLA2G12A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:109709989:109730077:-1 gene:ENSG00000123739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502283 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:109713917:109729974:-1 gene:ENSG00000123739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109717548:109718761:-1 gene:ENSG00000123739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF332892 // GenBank HTC // Homo sapiens FKSG38 (FKSG38) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017218 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIA, mRNA (cDNA clone MGC:12932 IMAGE:4304096), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000254868 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109709989:109730077:-1 Gene:OTTHUMG00000131915 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109713917:109729974:-1 Gene:OTTHUMG00000131915 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363796 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109717548:109718761:-1 Gene:OTTHUMG00000131915 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363797 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:109714262:109729956:-1 Gene:OTTHUMG00000131915 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hzp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIA (PLA2G12A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010img.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIA (PLA2G12A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363024 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:110433109:110433188:-1 gene:ENSG00000199894 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515999 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:110853376:110853470:-1 gene:ENSG00000251808 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401142 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:110860582:110860647:-1 gene:ENSG00000215961 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052864 // RefSeq // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (TIFA), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112274542:112285903:-1 gene:ENSG00000145365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438746 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:113197177:113207043:-1 gene:ENSG00000145365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112277759:112281773:-1 gene:ENSG00000145365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014259 // GenBank // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, mRNA (cDNA clone MGC:20791 IMAGE:4763971), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363647 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:112274542:112285903:-1 Gene:OTTHUMG00000161066 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363648 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:112277759:112281773:-1 Gene:OTTHUMG00000161066 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ial.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (TIFA), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xqt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (TIFA), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024019 // RefSeq // Homo sapiens neurogenin 2 (NEUROG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000313341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112513516:112516172:-1 gene:ENSG00000178403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036847 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:46562 IMAGE:5247719), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:112513516:112516172:-1 Gene:OTTHUMG00000132907 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ias.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neurogenin 2 (NEUROG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xqu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neurogenin 2 (NEUROG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365666 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:112755816:112755917:-1 gene:ENSG00000202536 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000356247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:113214260:113217170:-1 gene:ENSG00000196656 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022569 // RefSeq // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (NDST4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113075 // GenBank // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40028507), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264363 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3293:272792:433551:+ gene:ENSG00000138653 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256427 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:114827763:115113876:-1 Gene:OTTHUMG00000132916 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365978 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:114935048:115113849:-1 Gene:OTTHUMG00000132916 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365979 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:114827786:115113777:-1 Gene:OTTHUMG00000132916 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ibu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (NDST4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010imw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (NDST4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152402 // RefSeq // Homo sapiens translocation associated membrane protein 1-like 1 (TRAM1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030831 // GenBank // Homo sapiens translocation associated membrane protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:26568 IMAGE:4796626), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310754 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4678:61609:62751:+ gene:ENSG00000174599 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:117083554:117085576:-1 Gene:OTTHUMG00000132956 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ibv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens translocation associated membrane protein 1-like 1 (TRAM1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000441170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:117574512:117576174:-1 gene:ENSG00000213492 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003619 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin) (PRSS12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:118280038:118353003:-1 gene:ENSG00000164099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510903 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:118282939:118298775:-1 gene:ENSG00000164099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007761 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin), mRNA (cDNA clone MGC:12722 IMAGE:4126901), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256516 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118280038:118353003:-1 Gene:OTTHUMG00000161166 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364748 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118312946:118318555:-1 Gene:OTTHUMG00000161166 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118303278:118313276:-1 Gene:OTTHUMG00000161166 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364750 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:118282939:118298775:-1 Gene:OTTHUMG00000161166 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ica.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin) (PRSS12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001701 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001170330 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:119297052:119304445:-1 gene:ENSG00000164096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119298699:119300921:-1 gene:ENSG00000164096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017399 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:24558 IMAGE:4108498), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364576 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:119298699:119300921:-1 Gene:OTTHUMG00000161333 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364577 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:119297052:119304445:-1 Gene:OTTHUMG00000161333 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003icv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000134 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal (FABP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069466 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97202 IMAGE:7262448), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069617 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97180 IMAGE:7262424), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069625 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97191 IMAGE:7262436), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111791 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:133132 IMAGE:40017872), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274024 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1304:532695:535615:+ gene:ENSG00000145384 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256531 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:119317250:119322390:-1 Gene:OTTHUMG00000132972 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003icw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal (FABP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037596 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1061 (LINC01061), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003idb.2 cpcScore=-1.2767300 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idb.3 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411276 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:119434005:119434108:-1 gene:ENSG00000223208 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC070391 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4671554, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4671554, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001237 // RefSeq // Homo sapiens cyclin A2 (CCNA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:121816444:121823932:-1 gene:ENSG00000145386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104783 // GenBank // Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone MGC:132443 IMAGE:8143786), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000256712 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:121816444:121823932:-1 Gene:OTTHUMG00000133072 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iec.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cyclin A2 (CCNA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024041 // RefSeq // Homo sapiens centrin EF-hand protein 4, pseudogene (CETN4P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens centrin EF-hand protein 4, pseudogene (CETN4P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401335 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:123007572:123007663:-1 gene:ENSG00000216154 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xrp.1 // UCSC Genes // transfer RNA Cys (anticodon GCA) // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001167882 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020337 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:124667359:124712732:-1 gene:ENSG00000151458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024725 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50, mRNA (cDNA clone MGC:30046 IMAGE:4943808), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504087 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4445:410084:440790:- gene:ENSG00000151458 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364774 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:124667359:124712732:-1 Gene:OTTHUMG00000161398 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:124664052:124712732:-1 Gene:OTTHUMG00000161398 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010inw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362992 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:127028107:127028219:-1 gene:ENSG00000199862 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000544812 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:128990172:128990729:-1 gene:ENSG00000241651 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410929 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:4:130781577:130781655:-1 gene:ENSG00000222861 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000507172 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507172 cpcScore=-0.2284020 cnci=-0.2707625 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408710 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:133560856:133560934:-1 gene:ENSG00000221637 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001114734 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like (PABPC4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000529122 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:135117488:135122903:-1 gene:ENSG00000254535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ioe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like (PABPC4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384459 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:135315418:135315522:-1 gene:ENSG00000207188 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385114 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:135371590:135371681:-1 gene:ENSG00000207849 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:135995929:135996092:-1 gene:ENSG00000207322 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014331 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (SLC7A11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012087 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 11, mRNA (cDNA clone MGC:20026 IMAGE:4562994), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000280612 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold337:2403766:2481297:- gene:ENSG00000151012 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257251 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:138164097:138242349:-1 Gene:OTTHUMG00000133396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364387 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:138171844:138223244:-1 Gene:OTTHUMG00000133396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xrw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (SLC7A11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408086 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:138811678:138811766:-1 gene:ENSG00000238971 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000509033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139114930:139115374:-1 gene:ENSG00000179967 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516553 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139231026:139231119:-1 gene:ENSG00000252362 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139256657:139256760:-1 gene:ENSG00000206722 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139436368:139436494:-1 gene:ENSG00000239005 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018717 // RefSeq // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila) (MAML3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000327122 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:140809739:140812121:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:139889183:139890052:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139716753:140154184:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538400 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:140640434:140651821:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296891 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52323 complete cds, highly similar to Mastermind-like protein 3 (Mam-3). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137130 // GenBank // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168750 IMAGE:9021127), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364934 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139716753:140154184:-1 Gene:OTTHUMG00000161441 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364935 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139720212:140152969:-1 Gene:OTTHUMG00000161441 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila) (MAML3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xsg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila) (MAML3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516491 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:141196195:141196266:-1 gene:ENSG00000252300 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033939 // RefSeq // Homo sapiens SCOC antisense RNA 1 (SCOC-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140283724:140373360:-1 gene:ENSG00000196951 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071807 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6387017, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364723 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140283724:140373360:-1 Gene:OTTHUMG00000161377 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iic.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100129858 (LOC100129858), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iie.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100129858 (LOC100129858), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001130675 // RefSeq // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_004362 // RefSeq // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000325617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140388455:140427968:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:140388455:140427661:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537281 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:141309912:141348544:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545667 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:141310293:141348795:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028357 // GenBank // Homo sapiens calmegin, mRNA (cDNA clone MGC:26321 IMAGE:4830135), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257272 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140388455:140427968:-1 Gene:OTTHUMG00000133414 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364715 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140400512:140427610:-1 Gene:OTTHUMG00000133414 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iii.3 // UCSC Genes // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021833 // RefSeq // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (UCP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096736 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119953 IMAGE:40016003), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098168 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119952 IMAGE:40016002), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098258 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119951 IMAGE:40016001), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098352 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119950 IMAGE:40016000), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262999 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2152:58816:64811:+ gene:ENSG00000109424 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000257273 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140559434:140568805:-1 Gene:OTTHUMG00000133415 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (UCP1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011chk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (UCP1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015130 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain) (TBC1D9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140620765:140756120:-1 gene:ENSG00000109436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146758 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain), mRNA (cDNA clone MGC:166826 IMAGE:9007196), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364806 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140620765:140756120:-1 Gene:OTTHUMG00000161405 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364884 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140670594:140677101:-1 Gene:OTTHUMG00000161405 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364885 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:140659417:140661963:-1 Gene:OTTHUMG00000161405 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ioj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain) (TBC1D9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384426 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:140700835:140700942:-1 gene:ENSG00000207155 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410681 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:140779039:140779141:-1 gene:ENSG00000222613 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459515 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:142218928:142219032:-1 gene:ENSG00000238695 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000512366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143555124:143555583:-1 gene:ENSG00000248924 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002102 // RefSeq // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_198682 // RefSeq // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143870867:143905559:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428604 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:144799802:144826716:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143875313:143905563:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017864 // GenBank // Homo sapiens glycophorin E, mRNA (cDNA clone MGC:22629 IMAGE:4686481), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364780 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143870867:143905559:-1 Gene:OTTHUMG00000161402 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364781 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143870896:143905519:-1 Gene:OTTHUMG00000161402 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364782 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:143875313:143905563:-1 Gene:OTTHUMG00000161402 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ijj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ijk.4 // UCSC Genes // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459374 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:145149537:145149649:-1 gene:ENSG00000238713 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408442 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:147344629:147344717:-1 gene:ENSG00000221369 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458836 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:148991572:148991633:-1 gene:ENSG00000239168 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408308 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:150639756:150639866:-1 gene:ENSG00000221235 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408730 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:153741852:153741939:-1 gene:ENSG00000221657 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145720 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 4 (TIGD4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:152769354:152779764:-1 gene:ENSG00000169989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037869 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 4, mRNA (cDNA clone MGC:43837 IMAGE:5273281), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365028 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:152769354:152779764:-1 Gene:OTTHUMG00000161464 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003imy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tigger transposable element derived 4 (TIGD4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xtf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tigger transposable element derived 4 (TIGD4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364916 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:153266909:153267010:-1 gene:ENSG00000201786 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001562 // RefSeq // Homo sapiens annexin A2 pseudogene 1 (ANXA2P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003inj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens annexin A2 pseudogene 1 (ANXA2P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003013 // RefSeq // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 2 (SFRP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008666 // GenBank // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:9395 IMAGE:3874262), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274063 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2395:750833:758142:+ gene:ENSG00000145423 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365296 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:153780592:153789120:-1 Gene:OTTHUMG00000161559 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003inv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 2 (SFRP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516372 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:153873367:153873451:-1 gene:ENSG00000252181 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154543933:154544037:-1 gene:ENSG00000200350 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000508 // RefSeq // Homo sapiens fibrinogen alpha chain (FGA), transcript variant alpha-E, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_021871 // RefSeq // Homo sapiens fibrinogen alpha chain (FGA), transcript variant alpha, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000403106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:154585260:154590766:-1 gene:ENSG00000171560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457487 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:155506636:155511897:-1 gene:ENSG00000171560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020764 // GenBank // Homo sapiens fibrinogen alpha chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:4767540), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098280 // GenBank // Homo sapiens fibrinogen alpha chain, mRNA (cDNA clone MGC:119424 IMAGE:40007214), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302053 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold930:143686:149636:- gene:ENSG00000171560 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317592 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:154585260:154590766:-1 Gene:OTTHUMG00000150330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317593 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:154583126:154590766:-1 Gene:OTTHUMG00000150330 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iod.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fibrinogen alpha chain (FGA), transcript variant alpha-E, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ioe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fibrinogen alpha chain (FGA), transcript variant alpha, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iof.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fibrinogen alpha chain (FGA), transcript variant alpha, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021xto.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon TAA) // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017419 // RefSeq // Homo sapiens acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (ASIC5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:155829729:155866273:-1 gene:ENSG00000256394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366464 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:155829729:155866273:-1 Gene:OTTHUMG00000161941 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ipe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (ASIC5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408262 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:156296561:156296646:-1 gene:ENSG00000221189 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:156986372:156986693:-1 gene:ENSG00000252350 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362989 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:157201562:157201668:-1 gene:ENSG00000199859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408691 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:157588148:157588235:-1 gene:ENSG00000221618 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363651 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:157768013:157768113:-1 gene:ENSG00000200521 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383976 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:158794590:158794696:-1 gene:ENSG00000206703 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152543 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 45 (C4orf45), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158893134:159035181:-1 gene:ENSG00000164123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:158893544:159038760:-1 gene:ENSG00000164123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307319 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97267. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366636 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:158893134:159035181:-1 Gene:OTTHUMG00000161988 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366637 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:158893544:159038760:-1 Gene:OTTHUMG00000161988 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367385 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:158915180:158973131:-1 Gene:OTTHUMG00000161988 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iqf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 45 (C4orf45), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010iqt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 45 (C4orf45), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408387 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:159000146:159000290:-1 gene:ENSG00000221314 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384251 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:159064297:159064398:-1 gene:ENSG00000206978 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516170 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:160428047:160428180:-1 gene:ENSG00000251979 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408435 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:161003877:161003958:-1 gene:ENSG00000221362 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032136 // RefSeq // Homo sapiens transketolase-like 2 (TKTL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000280605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163471093:163473746:-1 gene:ENSG00000151005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028707 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:26975 IMAGE:4825223), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125101 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:149780 IMAGE:40118304), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC142943 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:166992 IMAGE:8860325), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365207 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:163471093:163473746:-1 Gene:OTTHUMG00000161527 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iqp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens transketolase-like 2 (TKTL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012403 // RefSeq // Homo sapiens acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member C (ANP32C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cjk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member C (ANP32C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012414 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 61 (TRIM61), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:164954446:164977668:-1 gene:ENSG00000183439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC089393 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 61, mRNA (cDNA clone MGC:102996 IMAGE:30378540), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364331 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:164954446:164977668:-1 Gene:OTTHUMG00000161266 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iqw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 61 (TRIM61), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000167 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase (GK), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026575 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase 3 pseudogene (GK3P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ird.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glycerol kinase 3 pseudogene (GK3P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459508 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:166321814:166321889:-1 gene:ENSG00000238346 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xub.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383984 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:166312935:166313034:-1 gene:ENSG00000206711 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408649 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:7:19719388:19719451:1 gene:ENSG00000221576 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383886 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:168686608:168686716:-1 gene:ENSG00000206613 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017867 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 27 (C4orf27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:169729465:169757953:-1 gene:ENSG00000056050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010367 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 27, mRNA (cDNA clone MGC:13432 IMAGE:4334172), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363140 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:169729465:169757953:-1 Gene:OTTHUMG00000160960 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363141 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:169750472:169757904:-1 Gene:OTTHUMG00000160960 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363142 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:169729477:169732018:-1 Gene:OTTHUMG00000160960 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003isl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 27 (C4orf27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000425338 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:170712371:170712853:-1 gene:ENSG00000229204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000325407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:170581470:170604984:-1 gene:ENSG00000181359 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036751 // NONCODE // accn=NR_036751 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036751 cpcScore=2.6429600 cnci=-0.1785607 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xuk.1 // UCSC Genes // --- // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038759 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269957. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003isw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269957. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003isw.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003isw.3 cpcScore=-0.8188650 cnci=-0.3188688 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:173268160:173268233:1 gene:ENSG00000221296 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007281 // RefSeq // Homo sapiens stimulator of chondrogenesis 1 (SCRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:173384701:173399536:-1 gene:ENSG00000164106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067829 // GenBank HTC // Homo sapiens scrapie responsive protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5270255), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364304 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:173384701:173399536:-1 Gene:OTTHUMG00000161249 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364305 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:173388162:173406380:-1 Gene:OTTHUMG00000161249 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ite.3 // UCSC Genes // Homo sapiens stimulator of chondrogenesis 1 (SCRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003itf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens stimulator of chondrogenesis 1 (SCRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517089 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:173446603:173446704:-1 gene:ENSG00000252898 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000434007 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:174537087:174537794:-1 gene:ENSG00000234801 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042543 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_006529 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:174642487:174829227:-1 gene:ENSG00000145451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436738 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:174722624:174728698:-1 gene:ENSG00000145451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036086 // GenBank // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:33772 IMAGE:5286731), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274093 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold958:1384644:1578446:- gene:ENSG00000145451 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313427 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:174636914:174829314:-1 Gene:OTTHUMG00000149816 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:174642487:174829227:-1 Gene:OTTHUMG00000149816 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:174722624:174728698:-1 Gene:OTTHUMG00000149816 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ity.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003itz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144644 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 4 (SPATA4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000280191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176184638:176195671:-1 gene:ENSG00000150628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515234 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:176184660:176194877:-1 gene:ENSG00000150628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021731 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:33432 IMAGE:5269042), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362326 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176184638:176195671:-1 Gene:OTTHUMG00000160788 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176184660:176194877:-1 Gene:OTTHUMG00000160788 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362328 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176192972:176195541:-1 Gene:OTTHUMG00000160788 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iuo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 4 (SPATA4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005429 // RefSeq // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C (VEGFC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000280193 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:177604689:177713881:-1 gene:ENSG00000150630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:176689300:176729592:-1 gene:ENSG00000150630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035212 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C, mRNA (cDNA clone MGC:24887 IMAGE:4753457), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063685 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C, mRNA (cDNA clone MGC:74703 IMAGE:4513934), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361991 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176683538:176792727:-1 Gene:OTTHUMG00000160734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361992 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:176689300:176729592:-1 Gene:OTTHUMG00000160734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ius.1 // UCSC Genes // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C (VEGFC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:177544477:177544564:-1 gene:ENSG00000221499 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:178116721:178116861:-1 gene:ENSG00000253000 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390889 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:178685886:178685956:-1 gene:ENSG00000212191 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033918 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 290 (LINC00290), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:181064089:181159149:-1 gene:ENSG00000248197 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361848 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:181064089:181159149:-1 Gene:OTTHUMG00000160706 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iuz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 290 (LINC00290), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024008 // RefSeq // Homo sapiens WWC2 antisense RNA 2 (WWC2-AS2), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506413 // ENSEMBL // [retired]ensembl:lincRNA chromosome:GRCh37:4:184018188:184020352:-1 gene:ENSG00000251359 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361702 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:183097017:183099199:-1 Gene:OTTHUMG00000160677 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens WWC2 antisense RNA 2 (WWC2-AS2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516239 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:184097914:184098084:-1 gene:ENSG00000252048 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000511846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183233628:183240634:-1 gene:ENSG00000251128 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361704 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:183233628:183240634:-1 Gene:OTTHUMG00000160679 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX537950 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H1186 (from clone DKFZp686H1186). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ivm.2 cpcScore=-1.0118000 cnci=-0.3537014 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H1186 (from clone DKFZp686H1186). // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459437 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:184195614:184195717:-1 gene:ENSG00000238319 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033995 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC389247 (LOC389247), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183494938:183504494:-1 gene:ENSG00000232648 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361497 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:183494938:183504494:-1 Gene:OTTHUMG00000160630 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC389247 (LOC389247), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ivr.2 cpcScore=1.5634900 cnci=-0.1524850 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459504 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:4:184503348:184503454:-1 gene:ENSG00000239116 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153343 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 (ENPP6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:184088706:184217961:-1 gene:ENSG00000164303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035035 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:33971 IMAGE:5259487), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361428 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184088706:184217961:-1 Gene:OTTHUMG00000160617 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361429 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184116863:184221230:-1 Gene:OTTHUMG00000160617 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361430 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184216562:184217702:-1 Gene:OTTHUMG00000160617 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361431 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184112592:184117821:-1 Gene:OTTHUMG00000160617 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iwc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 (ENPP6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408596 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:184267357:184267431:-1 gene:ENSG00000221523 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430005 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:185220282:185220800:-1 gene:ENSG00000227765 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000361423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184365183:184369870:-1 Gene:OTTHUMG00000160613 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512674 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:4:185286341:185291024:-1 gene:ENSG00000249096 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK126253 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44265 fis, clone TLIVE2003737, weakly similar to Homo sapiens beta glucuronidase isoform. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iwe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ44265 fis, clone TLIVE2003737, weakly similar to Homo sapiens beta glucuronidase isoform. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003542 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 3 pseudogene (SLED1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:184798296:184799046:-1 gene:ENSG00000249138 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iwx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens proteoglycan 3 pseudogene (SLED1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037867 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC731424 (LOC731424), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:184844585:184855751:-1 gene:ENSG00000251230 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016366 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein LOC731424, mRNA (cDNA clone IMAGE:4133286), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361376 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184844585:184855751:-1 Gene:OTTHUMG00000160604 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000361377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:184846278:184855682:-1 Gene:OTTHUMG00000160604 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iwy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein LOC731424, mRNA (cDNA clone IMAGE:4133286), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xvf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC731424 (LOC731424), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384502 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:185415973:185416086:-1 gene:ENSG00000207231 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384766 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:185709873:185709967:-1 gene:ENSG00000207497 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516573 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:4:187778529:187778610:-1 gene:ENSG00000252382 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:188121531:188121634:-1 gene:ENSG00000201085 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516466 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:188716665:188716725:-1 gene:ENSG00000252275 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:189709539:189709714:-1 gene:ENSG00000202215 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011clg.2 // UCSC Genes // SubName: Full=Beta-tubulin 4Q isoform 1; Flags: Fragment; // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:190060380:190060475:-1 gene:ENSG00000221407 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1170 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1170 cpcScore=-1.3428300 cnci=-0.1568157 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF143886 // NONCODE // accn=AF143886 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2215 cpcScore=-1.1818700 cnci=-0.2449188 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000239196 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000239196 cpcScore=-0.9984780 cnci=-0.2396978 gene:OTTHUMG00000118999 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX747592 // NONCODE // accn=AX747592 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2233 cpcScore=0.0713238 cnci=-0.1311628 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033339 // NONCODE // accn=NR_033339 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033339 cpcScore=0.9971020 cnci=-0.1674840 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL512751 // NONCODE // accn=AL512751 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2238 cpcScore=-0.7874510 cnci=-0.0902394 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128524 // NONCODE // accn=BC128524 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000389889 cpcScore=-0.8747590 cnci=-0.0806788 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL390128 // NONCODE // accn=AL390128 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2237 cpcScore=1.5004800 cnci=-0.1660220 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF369211 // NONCODE // accn=AF369211 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000078517 cpcScore=2.7257000 cnci=-0.0837706 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF369212 // NONCODE // accn=AF369212 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000078518 cpcScore=2.3795500 cnci=-0.0792178 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF369213 // NONCODE // accn=AF369213 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000078519 cpcScore=2.0329800 cnci=-0.0840649 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1172 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1172 cpcScore=-1.3169300 cnci=-0.2343698 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR622423 // NONCODE // accn=CR622423 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2253 cpcScore=1.0339600 cnci=-0.1738879 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB000465 // NONCODE // accn=AB000465 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2255 cpcScore=-1.0087100 cnci=-0.1548850 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505731 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505731 cpcScore=-0.9016390 cnci=-0.1639092 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507702 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507702 cpcScore=-1.3083300 cnci=-0.2297000 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507999 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507999 cpcScore=-0.8604810 cnci=-0.1061825 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512712 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512712 cpcScore=-0.9530390 cnci=-0.2142323 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512802 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512802 cpcScore=-1.0332900 cnci=-0.1720187 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000515194 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000515194 cpcScore=-0.8881160 cnci=-0.2420035 gene:ENSG00000249673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X75897 // NONCODE // accn=X75897 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323550 cpcScore=0.0667417 cnci=-0.3658354 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC028154 // NONCODE // accn=BC028154 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2257 cpcScore=10.2030000 cnci=-0.1695580 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086001 // NONCODE // accn=AF086001 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000066880 cpcScore=-1.3046100 cnci=-0.3309763 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000503960 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000503960 cpcScore=2.8753700 cnci=-0.1840843 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC025734 // NONCODE // accn=BC025734 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2262 cpcScore=-1.2620400 cnci=-0.3048104 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499430 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499430 cpcScore=-1.2656100 cnci=-0.2466299 gene:ENSG00000247708 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502693 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000502693 cpcScore=-1.0960400 cnci=-0.2760999 gene:ENSG00000247708 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507244 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507244 cpcScore=-1.3515700 cnci=-0.1806308 gene:ENSG00000247708 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512438 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512438 cpcScore=-1.2730800 cnci=-0.2460024 gene:ENSG00000247708 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514763 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000514763 cpcScore=-0.8893060 cnci=-0.4228720 gene:ENSG00000247708 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129535 // NONCODE // accn=AK129535 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2263 cpcScore=1.1860000 cnci=-0.3450283 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR618310 // NONCODE // accn=CR618310 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2264 cpcScore=-1.0598300 cnci=-0.2825896 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D82070 // NONCODE // accn=D82070 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2270 cpcScore=3.1011100 cnci=-0.2303497 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gjt.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gjt.1 cpcScore=0.2648000 cnci=-0.2746937 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF286190 // NONCODE // accn=AF286190 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000076303 cpcScore=4.5682300 cnci=-0.0840960 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC004397 // NONCODE // accn=BC004397 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2293 cpcScore=-1.0423300 cnci=-0.2073841 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026892 // NONCODE // accn=NR_026892 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026892 cpcScore=-0.9666250 cnci=-0.2540893 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR594181 // NONCODE // accn=CR594181 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2292 cpcScore=-0.7853090 cnci=-0.2003959 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027279 // NONCODE // accn=NR_027279 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027279 cpcScore=4.2575600 cnci=-0.0492218 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1626 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1626 cpcScore=-1.2946300 cnci=-0.1619927 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00020404-XLOC_l2_010569 // Broad TUCP // linc-DRD5-5 chr4:+:9533594-9534258 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF073924 // NONCODE // accn=AF073924 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5074 cpcScore=4.7619800 cnci=-0.0824939 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1175 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1175 cpcScore=-1.5060100 cnci=-0.3311443 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1176 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1176 cpcScore=-1.3157400 cnci=-0.3141791 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00007471-XLOC_003452 // Rinn lincRNA // linc-CPEB2-14 chr4:+:10686626-10699285 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1789 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1789 cpcScore=-1.6031600 cnci=-0.1949508 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gms.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gms.2 cpcScore=11.4661000 cnci=-0.2538351 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1177 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1177 cpcScore=-1.3181800 cnci=-0.3772364 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130568 // NONCODE // accn=AK130568 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2320 cpcScore=-0.9572520 cnci=-0.2582116 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1858 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1858 cpcScore=-1.3218100 cnci=-0.2109306 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX750575 // NONCODE // accn=AX750575 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5006 cpcScore=-0.8923130 cnci=-0.2805875 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000440429 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000440429 cpcScore=1.8979100 cnci=-0.1760417 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1163 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1163 cpcScore=-1.3057600 cnci=-0.3424170 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gpk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gpk.1 cpcScore=-1.1615000 cnci=-0.3316093 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037915 // NONCODE // accn=BC037915 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2326 cpcScore=-0.2609180 cnci=-0.2683600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041440 // NONCODE // accn=BC041440 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2328 cpcScore=-1.0521700 cnci=-0.2507676 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gpt.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gpt.2 cpcScore=-1.2999800 cnci=-0.2932123 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125392 // NONCODE // accn=AK125392 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2334 cpcScore=-1.1593800 cnci=-0.3197907 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1178 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1178 cpcScore=-1.3214400 cnci=-0.5326170 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1179 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1179 cpcScore=-1.3165400 cnci=-0.3046805 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124473 // NONCODE // accn=AK124473 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2340 cpcScore=-0.9548880 cnci=-0.2448882 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1180 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1180 cpcScore=-1.3177800 cnci=-0.2580050 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00008011-XLOC_003475 // Rinn lincRNA // linc-SOD3-1 chr4:+:24667010-24670951 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037934 // NONCODE // accn=NR_037934 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037934 cpcScore=0.1181980 cnci=-0.3386016 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L07872 // NONCODE // accn=L07872 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5078 cpcScore=8.8381200 cnci=-0.0746992 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086058 // NONCODE // accn=AF086058 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000066937 cpcScore=-1.2006500 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gsd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gsd.2 cpcScore=-1.2533400 cnci=-0.3467799 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130936 // NONCODE // accn=AK130936 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2346 cpcScore=-1.1744900 cnci=-0.4429763 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037904 // NONCODE // accn=BC037904 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2351 cpcScore=-1.1905700 cnci=-0.3073230 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502245 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000502245 cpcScore=2.9908900 cnci=-0.3143299 gene:ENSG00000247193 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK131492 // NONCODE // accn=AK131492 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2352 cpcScore=12.5647000 cnci=-0.2947140 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147397 // NONCODE // accn=AF147397 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2363 cpcScore=-1.3241300 cnci=-0.3518470 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR605864 // NONCODE // accn=CR605864 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2364 cpcScore=-1.0883400 cnci=-0.3610105 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033290 // NONCODE // accn=NR_033290 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033290 cpcScore=4.8885600 cnci=-0.2154990 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gum.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gum.1 cpcScore=5.0254300 cnci=-0.2496724 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gup.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gup.1 cpcScore=1.1647400 cnci=-0.1609931 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR620977 // NONCODE // accn=CR620977 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2397 cpcScore=-1.1669800 cnci=-0.3676923 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC014384 // NONCODE // accn=BC014384 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2420 cpcScore=-1.2777800 cnci=-0.4982155 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098597 // NONCODE // accn=AK098597 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2421 cpcScore=-1.2198800 cnci=-0.3710022 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1182 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1182 cpcScore=-1.3203700 cnci=-0.4578143 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1831 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1831 cpcScore=-1.5339700 cnci=-0.2444383 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033335 // NONCODE // accn=BC033335 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2424 cpcScore=-1.1067900 cnci=-0.2094100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041979 // NONCODE // accn=BC041979 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2435 cpcScore=-1.0240200 cnci=-0.3649678 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126494 // NONCODE // accn=AK126494 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2436 cpcScore=-1.0113300 cnci=-0.3524037 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041434 // NONCODE // accn=BC041434 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2440 cpcScore=-1.1340500 cnci=-0.2485223 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC012067 // NONCODE // accn=BC012067 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000087777 cpcScore=1.7290800 cnci=-0.0784715 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR624294 // NONCODE // accn=CR624294 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5100 cpcScore=-0.9501880 cnci=-0.3087259 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC045566 // NONCODE // accn=BC045566 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2504 cpcScore=1.2499800 cnci=-0.2344202 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411630 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000411630 cpcScore=2.3994300 cnci=-0.2198900 gene:ENSG00000226950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425653 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000425653 cpcScore=-1.0200900 cnci=-0.2892545 gene:ENSG00000226950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441504 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000441504 cpcScore=0.2146130 cnci=-0.1282697 gene:ENSG00000226950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444958 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000444958 cpcScore=0.8821910 cnci=-0.2341139 gene:ENSG00000226950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_356 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_356 cpcScore=-1.3564700 cnci=-0.2927013 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042091 // NONCODE // accn=BC042091 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5101 cpcScore=-1.0160200 cnci=-0.2463908 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129970 // NONCODE // accn=AK129970 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2506 cpcScore=-0.7956890 cnci=-0.2596346 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF090902 // NONCODE // accn=AF090902 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2507 cpcScore=-1.1442400 cnci=-0.3749266 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000203 // NONCODE // accn=AK000203 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2508 cpcScore=-0.8143810 cnci=-0.3283620 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003935 // NONCODE // accn=NR_003935 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003935 cpcScore=1.4933200 cnci=-0.4367830 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB175891 // NONCODE // accn=AB175891 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000242487 cpcScore=-0.9967500 cnci=-0.1796578 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094703 // NONCODE // accn=AK094703 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2525 cpcScore=-1.3550600 cnci=-0.4654673 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039430 // NONCODE // accn=BC039430 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2532 cpcScore=-0.0786145 cnci=-0.3527570 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015446 // NONCODE // accn=NR_015446 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_015446 cpcScore=1.7513100 cnci=-0.1728004 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124272 // NONCODE // accn=AK124272 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5105 cpcScore=-1.1588800 cnci=-0.3546227 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003720 // NONCODE // accn=NR_003720 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003720 cpcScore=-0.6558870 cnci=-0.3205656 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1187 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1187 cpcScore=-1.2880200 cnci=-0.3509349 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L35486 // NONCODE // accn=L35486 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000193228 cpcScore=-0.1640870 cnci=-0.3090505 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ227913 // NONCODE // accn=AJ227913 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000245062 cpcScore=-1.2482000 cnci=-0.5958696 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Y08770 // NONCODE // accn=Y08770 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000325480 cpcScore=0.2414760 cnci=-0.2311932 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000322216 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000322216 cpcScore=-1.0824000 cnci=-0.3167787 gene:OTTHUMG00000151319 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025205 // NONCODE // accn=AK025205 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2579 cpcScore=-1.0155900 cnci=-0.3048818 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1190 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1190 cpcScore=-1.1875800 cnci=-0.2700204 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1191 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1191 cpcScore=-1.3101000 cnci=-0.3282950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY543657 // NONCODE // accn=AY543657 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255353 cpcScore=-1.0550500 cnci=-0.1235644 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY543658 // NONCODE // accn=AY543658 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255354 cpcScore=-0.8746550 cnci=-0.1182335 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY543660 // NONCODE // accn=AY543660 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255356 cpcScore=0.1406590 cnci=-0.3270985 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011cby.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cby.1 cpcScore=-1.0701600 cnci=-0.1372010 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR542200 // NONCODE // accn=CR542200 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000269069 cpcScore=4.3181600 cnci=-0.2509626 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010ijm.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010ijm.1 cpcScore=-1.2965300 cnci=-0.4023579 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR607602 // NONCODE // accn=CR607602 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2593 cpcScore=-0.8768750 cnci=-0.2876008 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hlv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hlv.2 cpcScore=-1.0793800 cnci=-0.2671374 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hlw.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hlw.3 cpcScore=-0.3214100 cnci=-0.3580417 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC101196 // NONCODE // accn=BC101196 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000336604 cpcScore=2.0390100 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318186 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000318186 cpcScore=-1.1325300 cnci=-0.3007352 gene:ENSG00000180769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451762 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000451762 cpcScore=1.0943500 cnci=-0.3707672 gene:ENSG00000180769 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hpg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hpg.2 cpcScore=-1.1407400 cnci=-0.2779226 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038746 // NONCODE // accn=BC038746 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2618 cpcScore=-0.6263300 cnci=-0.3277029 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D21211 // NONCODE // accn=D21211 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5112 cpcScore=16.5493000 cnci=-0.1473824 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017432 // NONCODE // accn=BC017432 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2620 cpcScore=5.7767200 cnci=-0.2172858 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147419 // NONCODE // accn=AF147419 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2621 cpcScore=-0.9887390 cnci=-0.3396130 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036694 // NONCODE // accn=NR_036694 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036694 cpcScore=14.2313000 cnci=-0.1055754 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_236 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_236 cpcScore=-1.3272100 cnci=-0.1805387 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1756 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1756 cpcScore=-1.3553100 cnci=-0.3092514 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY956318 // NONCODE // accn=AY956318 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000333296 cpcScore=0.3543570 cnci=-0.3343817 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002806 // NONCODE // accn=NR_002806 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002806 cpcScore=3.4265200 cnci=-0.3541463 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1225 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1225 cpcScore=-1.3139200 cnci=-0.2925157 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1194 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1194 cpcScore=-1.7559000 cnci=-0.3360418 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00008164-XLOC_003608 // Rinn lincRNA // linc-MMRN1-2 chr4:+:90412097-90412901 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123890 // NONCODE // accn=AK123890 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2642 cpcScore=3.9169000 cnci=-0.3501349 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513653 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000513653 cpcScore=4.3868100 cnci=-0.1815860 gene:ENSG00000247775 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055271 // NONCODE // accn=AK055271 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2643 cpcScore=-1.2290800 cnci=-0.4726301 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024179 // NONCODE // accn=NR_024179 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024179 cpcScore=3.4073400 cnci=-0.3328091 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041657 // NONCODE // accn=BC041657 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2644 cpcScore=1.0112200 cnci=-0.2585018 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK127031 // NONCODE // accn=AK127031 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2647 cpcScore=-1.0542600 cnci=-0.3510595 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX647987 // NONCODE // accn=BX647987 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2648 cpcScore=0.2216690 cnci=-0.3667064 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499178 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499178 cpcScore=-1.2022800 cnci=-0.2885620 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506160 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000506160 cpcScore=-0.8831300 cnci=-0.2793719 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506454 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000506454 cpcScore=-0.7320410 cnci=-0.2956902 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509295 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000509295 cpcScore=-0.9909820 cnci=-0.2370743 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509939 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000509939 cpcScore=-0.9752460 cnci=-0.2262035 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510764 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000510764 cpcScore=-1.0246000 cnci=-0.3293265 gene:ENSG00000246090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hul.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hul.1 cpcScore=-1.2136200 cnci=-0.2255898 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hvp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hvp.1 cpcScore=-0.1533430 cnci=-0.3160553 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000028 // NONCODE // accn=AK000028 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2650 cpcScore=2.8063400 cnci=-0.0931017 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1195 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1195 cpcScore=-1.3033500 cnci=-0.2672994 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK098632 // NONCODE // accn=AK098632 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5115 cpcScore=-1.0392400 cnci=-0.2845740 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093356 // NONCODE // accn=AK093356 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2654 cpcScore=-1.2640000 cnci=-0.2636701 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000501133 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000501133 cpcScore=-1.2757000 cnci=-0.2602639 gene:ENSG00000246560 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2082 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2082 cpcScore=-1.3008000 cnci=-0.2620475 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC020624 // NONCODE // accn=BC020624 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2659 cpcScore=-0.7773790 cnci=-0.2488603 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hyx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hyx.2 cpcScore=3.0510200 cnci=-0.1867605 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038206 // NONCODE // accn=BC038206 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2660 cpcScore=-0.7654870 cnci=-0.2459269 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC062457 // NONCODE // accn=BC062457 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2662 cpcScore=-1.2342900 cnci=-0.3509294 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075091 // NONCODE // accn=AF075091 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2663 cpcScore=-0.3019370 cnci=-0.1287562 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ925692 // NONCODE // accn=DQ925692 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468698 cpcScore=-0.3517600 cnci=-0.4494564 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ925693 // NONCODE // accn=DQ925693 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000468699 cpcScore=-0.1666730 cnci=-0.2774744 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000132190 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000132190 cpcScore=-1.1929000 cnci=-0.3524872 gene:OTTHUMG00000059445 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000291362 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000291362 cpcScore=-1.0892500 cnci=-0.4126185 gene:OTTHUMG00000059450 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000132194 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000132194 cpcScore=-1.1229000 cnci=-0.4753235 gene:OTTHUMG00000059447 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017993 // NONCODE // accn=BC017993 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2664 cpcScore=-1.2469600 cnci=-0.3269338 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034010 // NONCODE // accn=NR_034010 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034010 cpcScore=-1.2087100 cnci=-0.2936702 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034011 // NONCODE // accn=NR_034011 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034011 cpcScore=-1.0736900 cnci=-0.3161261 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1880 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1880 cpcScore=-1.4682800 cnci=-0.1103701 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003135 // NONCODE // accn=NR_003135 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003135 cpcScore=7.1376700 cnci=-0.1667953 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1358 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1358 cpcScore=-1.2710200 cnci=-0.2993194 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00008209-XLOC_003665 // Rinn lincRNA // linc-SYNPO2-2 chr4:+:119763228-119772488 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000774 // NONCODE // accn=AK000774 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2665 cpcScore=-0.7992850 cnci=-0.3891109 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC063381 // NONCODE // accn=BC063381 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000260843 cpcScore=-1.2733200 cnci=-0.3139506 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037630 // NONCODE // accn=NR_037630 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037630 cpcScore=0.8196800 cnci=-0.2719812 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR610292 // NONCODE // accn=CR610292 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2666 cpcScore=-1.1360000 cnci=-0.2443396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1197 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1197 cpcScore=-1.3146200 cnci=-0.3494960 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003idi.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003idi.3 cpcScore=-1.0586000 cnci=-0.3074550 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX746903 // NONCODE // accn=AX746903 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2667 cpcScore=3.1126300 cnci=-0.2407100 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1198 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1198 cpcScore=-1.3114800 cnci=-0.3760562 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030136 // NONCODE // accn=BC030136 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2668 cpcScore=-1.1312300 cnci=-0.1380668 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024365 // NONCODE // accn=NR_024365 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024365 cpcScore=2.0263200 cnci=-0.1897797 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC044923 // NONCODE // accn=BC044923 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2672 cpcScore=0.0898322 cnci=-0.2899763 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1200 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1200 cpcScore=-1.3210000 cnci=-0.1963491 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129931 // NONCODE // accn=AK129931 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2673 cpcScore=-1.1289300 cnci=-0.4086162 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S47380 // NONCODE // accn=S47380 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000215648 cpcScore=1.0556200 cnci=-0.1202912 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033378 // NONCODE // accn=BC033378 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2676 cpcScore=-1.0934500 cnci=-0.2738756 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508111 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000508111 cpcScore=-0.8966290 cnci=-0.2407611 gene:ENSG00000249464 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511919 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000511919 cpcScore=-0.8754530 cnci=-0.2411774 gene:ENSG00000249464 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514823 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000514823 cpcScore=-1.1170900 cnci=-0.4123329 gene:ENSG00000249464 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cgn.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cgn.1 cpcScore=-0.8624970 cnci=-0.2338315 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_102 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_102 cpcScore=-1.4895300 cnci=-0.3671434 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ifc.2 cpcScore=-0.4249850 cnci=-0.4129936 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1202 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1202 cpcScore=-1.6173300 cnci=-0.3872868 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ifn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ifn.2 cpcScore=-0.0305281 cnci=-0.3476600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1166 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1166 cpcScore=-1.3161100 cnci=-0.2659045 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042524 // NONCODE // accn=BC042524 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2683 cpcScore=-1.2545000 cnci=-0.4649616 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041865 // NONCODE // accn=BC041865 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5122 cpcScore=-1.2549300 cnci=-0.3415438 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039411 // NONCODE // accn=BC039411 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2684 cpcScore=-1.2843800 cnci=-0.3883824 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038380 // NONCODE // accn=NR_038380 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038380 cpcScore=-0.1436720 cnci=-0.3198187 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY029324 // NONCODE // accn=AY029324 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2690 cpcScore=-1.1629100 cnci=-0.4008008 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035328 // NONCODE // accn=BC035328 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2691 cpcScore=-0.8987930 cnci=-0.3234838 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040304 // NONCODE // accn=BC040304 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2692 cpcScore=4.7625300 cnci=-0.2754882 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128168 // NONCODE // accn=AK128168 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2698 cpcScore=-1.0193000 cnci=-0.3023937 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR596650 // NONCODE // accn=CR596650 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000275845 cpcScore=3.0441300 cnci=-0.2686503 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC029602 // NONCODE // accn=BC029602 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2700 cpcScore=-0.8130610 cnci=-0.2450584 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR542007 // NONCODE // accn=CR542007 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000268876 cpcScore=1.6442600 cnci=-0.3504152 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037840 // NONCODE // accn=NR_037840 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037840 cpcScore=3.7349600 cnci=-0.2700297 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505000 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505000 cpcScore=-1.0727400 cnci=-0.3238115 gene:ENSG00000251600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510536 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000510536 cpcScore=-0.9244130 cnci=-0.1554789 gene:ENSG00000251600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029578 // NONCODE // accn=BC029578 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5123 cpcScore=-1.1728500 cnci=-0.3269323 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC047543 // NONCODE // accn=BC047543 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2703 cpcScore=-1.0259500 cnci=-0.3810018 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK024689 // NONCODE // accn=AK024689 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2704 cpcScore=-1.3639500 cnci=-0.3983439 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR591858 // NONCODE // accn=CR591858 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5124 cpcScore=-1.1101300 cnci=-0.2464352 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094722 // NONCODE // accn=AK094722 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2708 cpcScore=-1.3040900 cnci=-0.4221166 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093177 // NONCODE // accn=AK093177 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2712 cpcScore=-1.2269600 cnci=-0.3044572 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL162033 // NONCODE // accn=AL162033 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2713 cpcScore=-1.2894300 cnci=-0.3879073 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L10123 // NONCODE // accn=L10123 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2714 cpcScore=11.2326000 cnci=-0.3322200 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D90348 // NONCODE // accn=D90348 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5125 cpcScore=4.3886300 cnci=-0.2427078 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_028596 // NONCODE // accn=NR_028596 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028596 cpcScore=4.0763600 cnci=-0.2869226 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX537573 // NONCODE // accn=BX537573 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2715 cpcScore=-0.8829010 cnci=-0.3407828 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036614 // NONCODE // accn=NR_036614 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036614 cpcScore=8.4366800 cnci=-0.1876477 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000507934 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507934 cpcScore=1.1561800 cnci=-0.3025167 gene:ENSG00000249690 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1203 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1203 cpcScore=-1.4521800 cnci=-0.2781139 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF088025 // NONCODE // accn=AF088025 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2717 cpcScore=-0.8770110 cnci=-0.1631029 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137273 // NONCODE // accn=AL137273 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2719 cpcScore=3.6577000 cnci=-0.2799367 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1204 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1204 cpcScore=-1.6147900 cnci=-0.3406264 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR599924 // NONCODE // accn=CR599924 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2720 cpcScore=-1.1370000 cnci=-0.3438388 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF424049 // NONCODE // accn=AF424049 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000079420 cpcScore=-1.1433100 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF424051 // NONCODE // accn=AF424051 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000079422 cpcScore=-1.1013900 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF424052 // NONCODE // accn=AF424052 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000079423 cpcScore=-1.2352200 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF424053 // NONCODE // accn=AF424053 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000079424 cpcScore=-1.0802800 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003iol.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003iol.2 cpcScore=-1.1622100 cnci=-0.2990632 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039414 // NONCODE // accn=BC039414 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2723 cpcScore=-1.3063400 cnci=-0.3995270 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016638 // NONCODE // accn=BC016638 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2726 cpcScore=11.1604000 cnci=-0.2871751 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1167 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1167 cpcScore=-1.3440200 cnci=-0.4104422 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR595965 // NONCODE // accn=CR595965 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2727 cpcScore=-1.1710000 cnci=-0.4537145 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011cji.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cji.1 cpcScore=-0.2536440 cnci=-0.2658806 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003iqu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003iqu.1 cpcScore=1.2045500 cnci=-0.3026570 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR599612 // NONCODE // accn=CR599612 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5126 cpcScore=-1.2420500 cnci=-0.3283020 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1763 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1763 cpcScore=-1.2975600 cnci=-0.2404788 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129829 // NONCODE // accn=AK129829 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2729 cpcScore=-1.0995900 cnci=-0.3407571 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK091193 // NONCODE // accn=AK091193 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2730 cpcScore=-1.0956700 cnci=-0.3407653 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK057697 // NONCODE // accn=AK057697 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2731 cpcScore=-1.2221700 cnci=-0.3634950 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003isk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003isk.1 cpcScore=-0.4713400 cnci=-0.3678720 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_40 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_40 cpcScore=-1.3125500 cnci=-0.2669776 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130566 // NONCODE // accn=AK130566 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2739 cpcScore=-0.8493070 cnci=-0.3296552 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003679 // NONCODE // accn=NR_003679 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003679 cpcScore=-1.1057300 cnci=-0.3184927 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR603271 // NONCODE // accn=CR603271 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000282466 cpcScore=-1.2858100 cnci=-0.4226532 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR620690 // NONCODE // accn=CR620690 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2741 cpcScore=-1.3112700 cnci=-0.3710084 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038536 // NONCODE // accn=BC038536 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2745 cpcScore=-0.9320620 cnci=-0.3149864 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1205 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1205 cpcScore=-1.3114800 cnci=-0.1791926 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF195420 // NONCODE // accn=AF195420 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2748 cpcScore=6.9530900 cnci=-0.1006420 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1206 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1206 cpcScore=-1.3139200 cnci=-0.3620414 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086200 // NONCODE // accn=AF086200 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2749 cpcScore=3.2421600 cnci=-0.1794696 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1207 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1207 cpcScore=-1.2655200 cnci=-0.3784961 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL512713 // NONCODE // accn=AL512713 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2751 cpcScore=-1.0870500 cnci=-0.3110594 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003iwb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003iwb.1 cpcScore=-1.2145300 cnci=-0.2927861 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1208 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1208 cpcScore=-1.2661600 cnci=-0.2257206 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00008951-XLOC_003807 // Rinn lincRNA // linc-CCDC111-2 chr4:+:185395861-185398943 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF052119 // NONCODE // accn=AF052119 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2755 cpcScore=-1.2313800 cnci=-0.2818083 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069025 // NONCODE // accn=BC069025 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2757 cpcScore=-1.0614800 cnci=-0.3048459 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ470079 // NONCODE // accn=DQ470079 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000343452 cpcScore=1.5316600 cnci=-0.5112933 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC020617 // NONCODE // accn=BC020617 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000090184 cpcScore=-1.3169800 cnci=-0.4466706 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2039 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2039 cpcScore=-1.4433300 cnci=-0.2906308 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038377 // NONCODE // accn=NR_038377 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038377 cpcScore=-1.0528800 cnci=-0.3697067 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00030030 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name=Human lincRNA ref=BodyMapLinc transcriptId=TCONS_00030030 cpcScore=-1.0453700 cnci=-0.3636101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00030031 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name=Human lincRNA ref=BodyMapLinc transcriptId=TCONS_00030031 cpcScore=-0.2463400 cnci=-0.2760141 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1168 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1168 cpcScore=-1.3382700 cnci=-0.3289288 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1169 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1169 cpcScore=-1.3112100 cnci=-0.3381178 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00020981-XLOC_l2_011011 // Broad TUCP // linc-ZNF732 chr4:-:301143-331029 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040413 // NONCODE // accn=BC040413 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000096154 cpcScore=-0.2143540 cnci=-0.2557261 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060316 // NONCODE // accn=BC060316 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000260041 cpcScore=1.2237200 cnci=-0.2056878 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002451 // NONCODE // accn=NR_002451 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002451 cpcScore=3.3560500 cnci=-0.2506742 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024010 // NONCODE // accn=NR_024010 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024010 cpcScore=0.0242179 cnci=-0.2691826 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC020343 // NONCODE // accn=BC020343 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2216 cpcScore=-0.4959200 cnci=-0.0964727 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039412 // NONCODE // accn=BC039412 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2217 cpcScore=-0.7824040 cnci=-0.0497568 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033743 // NONCODE // accn=NR_033743 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033743 cpcScore=-0.7209450 cnci=-0.1772790 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR600243 // NONCODE // accn=CR600243 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000279438 cpcScore=2.3170700 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR625372 // NONCODE // accn=CR625372 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2218 cpcScore=5.3385700 cnci=-0.1059271 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130823 // NONCODE // accn=AK130823 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2219 cpcScore=-0.9092710 cnci=-0.1476540 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036511 // NONCODE // accn=NR_036511 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036511 cpcScore=-1.0752400 cnci=-0.1889676 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_036512 // NONCODE // accn=NR_036512 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036512 cpcScore=-1.2883400 cnci=-0.1862062 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1576 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1576 cpcScore=-1.5743800 cnci=-0.2988533 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032898 // NONCODE // accn=BC032898 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2220 cpcScore=-0.6879350 cnci=-0.1232784 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1171 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1171 cpcScore=-1.2882700 cnci=-0.3716256 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK122772 // NONCODE // accn=AK122772 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2226 cpcScore=-0.8594580 cnci=-0.1903309 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024569 // NONCODE // accn=NR_024569 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024569 cpcScore=1.0055400 cnci=-0.1776737 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1982 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1982 cpcScore=-1.7566900 cnci=-0.1911073 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF161361 // NONCODE // accn=AF161361 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000072091 cpcScore=2.5771700 cnci=-0.3021520 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL365520 // NONCODE // accn=AL365520 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2258 cpcScore=-0.7376820 cnci=-0.2827683 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR601277 // NONCODE // accn=CR601277 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000280472 cpcScore=-1.3223400 cnci=-0.2136873 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ghh.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ghh.3 cpcScore=-1.1018900 cnci=-0.1897357 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR595839 // NONCODE // accn=CR595839 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000275034 cpcScore=3.0504800 cnci=-0.1345406 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1402 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1402 cpcScore=-1.2912200 cnci=-0.3073445 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1933 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1933 cpcScore=-1.2969500 cnci=-0.0541073 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1173 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1173 cpcScore=-1.3169300 cnci=-0.2570423 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032036 // NONCODE // accn=BC032036 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2281 cpcScore=-1.2999900 cnci=-0.1924770 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035129 // NONCODE // accn=BC035129 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2282 cpcScore=-1.0722200 cnci=-0.2846977 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500031 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500031 cpcScore=3.3402200 cnci=-0.2218484 gene:ENSG00000245748 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC063708 // NONCODE // accn=BC063708 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2285 cpcScore=2.7236800 cnci=-0.1411400 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX746755 // NONCODE // accn=AX746755 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5073 cpcScore=-0.1411060 cnci=-0.2324567 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1174 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1174 cpcScore=-1.6762500 cnci=-0.2385930 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025887 // NONCODE // accn=AK025887 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2304 cpcScore=-0.9104450 cnci=-0.2699400 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL713660 // NONCODE // accn=AL713660 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2305 cpcScore=-0.9804380 cnci=-0.2728356 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L32559 // NONCODE // accn=L32559 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000193048 cpcScore=-1.3089200 cnci=-0.3566946 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040874 // NONCODE // accn=BC040874 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5075 cpcScore=-0.8681600 cnci=-0.3065858 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1162 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1162 cpcScore=-1.3274200 cnci=-0.3773318 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK001995 // NONCODE // accn=AK001995 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2309 cpcScore=-1.2481400 cnci=-0.4119595 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505835 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505835 cpcScore=-0.9168840 cnci=-0.2419733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536697 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000536697 cpcScore=-0.9137990 cnci=-0.2676937 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015450 // NONCODE // accn=NR_015450 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_015450 cpcScore=-1.0460800 cnci=-0.1953926 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR614809 // NONCODE // accn=CR614809 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2311 cpcScore=5.3085600 cnci=-0.2920674 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gnd.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gnd.3 cpcScore=1.5124400 cnci=-0.3846494 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036464 // NONCODE // accn=NR_036464 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036464 cpcScore=8.9697800 cnci=-0.3612971 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026407 // NONCODE // accn=AK026407 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2321 cpcScore=-1.0813100 cnci=-0.2210202 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK024979 // NONCODE // accn=AK024979 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2322 cpcScore=-1.0942200 cnci=-0.3760119 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC062661 // NONCODE // accn=BC062661 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000260552 cpcScore=3.4366800 cnci=-0.1248478 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC070479 // NONCODE // accn=BC070479 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2335 cpcScore=0.5528180 cnci=-0.2677481 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY072607 // NONCODE // accn=AY072607 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2336 cpcScore=-1.2254600 cnci=-0.3623037 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR002813 // NONCODE // accn=NR002813 class=mRNAlike lncRNA name=UM9-5 ref=lncRNAdb transcriptId=342987 cpcScore=-1.2773300 cnci=-0.3966569 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035645 // NONCODE // accn=BC035645 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5077 cpcScore=9.4530500 cnci=-0.2458159 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_242 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_242 cpcScore=-1.5480700 cnci=-0.3232083 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00008449-XLOC_003908 // Rinn lincRNA // linc-PPARGC1A chr4:-:24473714-24474219 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123271 // NONCODE // accn=AK123271 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2341 cpcScore=-0.9275910 cnci=-0.2619836 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1181 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1181 cpcScore=-1.3202200 cnci=-0.2162626 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1843 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1843 cpcScore=-1.6050400 cnci=-0.2096229 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gsn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gsn.2 cpcScore=-0.7431720 cnci=-0.3508516 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026804 // NONCODE // accn=NR_026804 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026804 cpcScore=0.1437460 cnci=-0.2326943 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gtf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gtf.2 cpcScore=1.8595400 cnci=-0.1640576 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040211 // NONCODE // accn=BC040211 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2374 cpcScore=-1.1526600 cnci=-0.2569992 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF049126 // NONCODE // accn=AF049126 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000064173 cpcScore=1.4308300 cnci=-0.3322806 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gun.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gun.1 cpcScore=-0.0083373 cnci=-0.3063932 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC006419 // NONCODE // accn=BC006419 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2394 cpcScore=1.4155700 cnci=-0.1629600 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR615359 // NONCODE // accn=CR615359 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000294554 cpcScore=-1.1804900 cnci=-0.3436612 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027277 // NONCODE // accn=NR_027277 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027277 cpcScore=4.0291100 cnci=-0.1527842 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC034402 // NONCODE // accn=BC034402 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2402 cpcScore=9.7729900 cnci=-0.1347462 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D82344 // NONCODE // accn=D82344 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2417 cpcScore=2.4541800 cnci=-0.1702527 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092951 // NONCODE // accn=AK092951 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2422 cpcScore=-1.1185200 cnci=-0.4320703 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1532 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1532 cpcScore=-1.3651100 cnci=-0.3143326 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003gxa.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003gxa.2 cpcScore=-1.2962100 cnci=-0.4462067 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086092 // NONCODE // accn=AF086092 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2430 cpcScore=-1.3444200 cnci=-0.6264007 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S62907 // NONCODE // accn=S62907 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2432 cpcScore=7.2955900 cnci=-0.2181214 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036474 // NONCODE // accn=BC036474 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2433 cpcScore=-0.9772850 cnci=-0.3569391 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125335 // NONCODE // accn=AK125335 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2441 cpcScore=-1.1996800 cnci=-0.4306226 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X64802 // NONCODE // accn=X64802 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2442 cpcScore=2.1720600 cnci=-0.1273038 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK096470 // NONCODE // accn=AK096470 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5085 cpcScore=-0.9640520 cnci=-0.2303827 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040987 // NONCODE // accn=BC040987 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2443 cpcScore=-0.8397840 cnci=-0.3630650 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1516 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1516 cpcScore=-1.6263200 cnci=-0.2580042 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR625178 // NONCODE // accn=CR625178 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5086 cpcScore=-0.8685250 cnci=-0.2650931 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_291 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_291 cpcScore=-1.3139400 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011bzv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011bzv.1 cpcScore=3.0276200 cnci=-0.3145687 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1183 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1183 cpcScore=-1.3227000 cnci=-0.4318137 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1979 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1979 cpcScore=-1.3415200 cnci=-0.3748186 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003haw.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003haw.1 cpcScore=-0.8572150 cnci=-0.2975585 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX538337 // NONCODE // accn=BX538337 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2510 cpcScore=-1.1497500 cnci=-0.4165113 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hay.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hay.2 cpcScore=-1.1487400 cnci=-0.3979733 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR604878 // NONCODE // accn=CR604878 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2511 cpcScore=2.0383300 cnci=-0.1847820 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1184 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1184 cpcScore=-1.3191600 cnci=-0.3351893 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC034324 // NONCODE // accn=BC034324 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2512 cpcScore=-1.2152500 cnci=-0.2969900 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB019573 // NONCODE // accn=AB019573 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058617 cpcScore=0.2031480 cnci=-0.2713903 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF540057 // NONCODE // accn=AF540057 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000081460 cpcScore=1.5107300 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039448 // NONCODE // accn=BC039448 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2529 cpcScore=-0.8806890 cnci=-0.3595105 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC031013 // NONCODE // accn=BC031013 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2533 cpcScore=-1.0940500 cnci=-0.4522461 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1185 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1185 cpcScore=-1.5640300 cnci=-0.3791837 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123376 // NONCODE // accn=AK123376 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2534 cpcScore=0.1618990 cnci=-0.2732798 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S60587 // NONCODE // accn=S60587 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2535 cpcScore=3.8653700 cnci=-0.2542365 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010ihn.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010ihn.2 cpcScore=3.0631100 cnci=-0.3417910 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF143878 // NONCODE // accn=AF143878 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2547 cpcScore=-1.2425200 cnci=-0.4870205 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030809 // NONCODE // accn=BC030809 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2548 cpcScore=-0.6719220 cnci=-0.1899856 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1188 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1188 cpcScore=-1.2886600 cnci=-0.4281916 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026546 // NONCODE // accn=AK026546 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5109 cpcScore=-1.3051500 cnci=-0.3672404 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L10403 // NONCODE // accn=L10403 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5110 cpcScore=0.7518020 cnci=-0.2378570 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016361 // NONCODE // accn=BC016361 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2576 cpcScore=-1.0151900 cnci=-0.2997408 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1189 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1189 cpcScore=-1.1738700 cnci=-0.3424756 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hii.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hii.3 cpcScore=1.1806200 cnci=-0.2682148 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086310 // NONCODE // accn=AF086310 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2580 cpcScore=-1.0341300 cnci=-0.2972704 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037913 // NONCODE // accn=NR_037913 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037913 cpcScore=3.0582400 cnci=-0.3848093 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010iiy.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010iiy.2 cpcScore=-1.2322300 cnci=-0.2928419 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF352781 // NONCODE // accn=AF352781 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000078245 cpcScore=0.5944250 cnci=-0.4559965 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1192 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1192 cpcScore=-1.3232700 cnci=-0.3105908 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hkh.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hkh.2 cpcScore=0.6086910 cnci=-0.2452744 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037340 // NONCODE // accn=BC037340 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2588 cpcScore=-0.9792380 cnci=-0.3226910 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043279 // NONCODE // accn=BC043279 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2592 cpcScore=-1.2890000 cnci=-0.3331779 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR597213 // NONCODE // accn=CR597213 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2594 cpcScore=-0.9543100 cnci=-0.2827217 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003249 // NONCODE // accn=NR_003249 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003249 cpcScore=3.2500400 cnci=-0.3287940 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// X75683 // NONCODE // accn=X75683 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323535 cpcScore=-1.4435700 cnci=-0.3329293 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034075 // NONCODE // accn=NR_034075 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034075 cpcScore=3.4368100 cnci=-0.3033780 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1193 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1193 cpcScore=-1.6787300 cnci=-0.2974226 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hoi.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hoi.2 cpcScore=-0.1808360 cnci=-0.3469591 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000508406 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000508406 cpcScore=-1.0645400 cnci=-0.3631563 gene:ENSG00000250546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510016 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000510016 cpcScore=-1.1284500 cnci=-0.2555494 gene:ENSG00000250546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513489 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000513489 cpcScore=-1.0270900 cnci=-0.2985500 gene:ENSG00000250546 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005018 // NONCODE // accn=BC005018 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2611 cpcScore=-1.0446600 cnci=-0.2829940 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF052141 // NONCODE // accn=AF052141 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2619 cpcScore=-0.9023420 cnci=-0.3603650 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hqf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hqf.1 cpcScore=-0.2896790 cnci=-0.2989203 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hqg.1 cpcScore=-0.4120000 cnci=-0.2723483 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC010383 // NONCODE // accn=BC010383 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000087476 cpcScore=0.8111230 cnci=-0.1074495 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF094508 // NONCODE // accn=AF094508 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000068406 cpcScore=6.8551300 cnci=-0.0396781 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ459608 // NONCODE // accn=DQ459608 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000343439 cpcScore=0.8545510 cnci=-0.3100911 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hrl.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hrl.1 cpcScore=0.5576720 cnci=-0.2986633 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003hsl.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hsl.1 cpcScore=-0.9024690 cnci=-0.4013622 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF565117 // NONCODE // accn=EF565117 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000395606 cpcScore=-1.4233500 cnci=-0.4845422 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX538341 // NONCODE // accn=BX538341 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2645 cpcScore=-0.9569270 cnci=-0.2985598 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003huc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003huc.1 cpcScore=-0.0978752 cnci=-0.2945695 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc011cee.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc011cee.1 cpcScore=1.7798400 cnci=-0.3496090 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S77168 // NONCODE // accn=S77168 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000216715 cpcScore=1.0340200 cnci=-0.1698855 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024170 // NONCODE // accn=NR_024170 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024170 cpcScore=2.2617500 cnci=-0.4031734 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056803 // NONCODE // accn=AK056803 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5114 cpcScore=1.2174400 cnci=-0.2639898 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL133118 // NONCODE // accn=AL133118 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2649 cpcScore=-1.1997700 cnci=-0.4169501 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL358312 // NONCODE // accn=AL358312 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2651 cpcScore=-1.2502800 cnci=-0.3416345 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038734 // NONCODE // accn=BC038734 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2652 cpcScore=-1.0868300 cnci=-0.3570179 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB020969 // NONCODE // accn=AB020969 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058648 cpcScore=-0.9503770 cnci=-0.4333654 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033876 // NONCODE // accn=BC033876 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000093257 cpcScore=-1.0994500 cnci=-0.1829072 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033876 // NONCODE // accn=BC033876 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2653 cpcScore=-0.9721680 cnci=-0.2258917 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY429526 // NONCODE // accn=AY429526 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000254614 cpcScore=1.0569100 cnci=-0.3333869 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S86388 // NONCODE // accn=S86388 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000398645 cpcScore=0.5571520 cnci=-0.1135544 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627201 // NONCODE // accn=CR627201 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2655 cpcScore=-0.9697260 cnci=-0.3759112 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hxf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003hxf.1 cpcScore=-1.2171600 cnci=-0.3781603 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1164 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1164 cpcScore=-1.3358400 cnci=-0.3567007 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1675 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1675 cpcScore=-1.3048900 cnci=-0.5150892 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00007807-XLOC_004032 // Rinn lincRNA // linc-CXXC4-1 chr4:-:106058436-106061776 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1196 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1196 cpcScore=-1.3066100 cnci=-0.4555729 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z48605 // NONCODE // accn=Z48605 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000327430 cpcScore=1.9612100 cnci=-0.2916952 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1741 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1741 cpcScore=-1.3005200 cnci=-0.2271055 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR605402 // NONCODE // accn=CR605402 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2657 cpcScore=-0.3501230 cnci=-0.3934266 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123292 // NONCODE // accn=AK123292 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2658 cpcScore=-0.8485930 cnci=-0.2446139 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000506795 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000506795 cpcScore=2.7288500 cnci=-0.2294433 gene:ENSG00000234492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509984 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000509984 cpcScore=3.9522700 cnci=-0.2824497 gene:ENSG00000234492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510212 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000510212 cpcScore=-0.9749850 cnci=-0.2436816 gene:ENSG00000234492 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450161 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000450161 cpcScore=0.9225970 cnci=-0.3408877 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR591422 // NONCODE // accn=CR591422 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5116 cpcScore=-0.8702780 cnci=-0.2585519 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026192 // NONCODE // accn=AK026192 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2661 cpcScore=-0.9532140 cnci=-0.2579000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037784 // NONCODE // accn=BC037784 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5117 cpcScore=-1.1680700 cnci=-0.3683625 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1417 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1417 cpcScore=-1.2822500 cnci=-0.2215239 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00021247-XLOC_l2_011225 // Broad TUCP // linc-C4orf21-2 chr4:-:113614023-113627873 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF139846 // NONCODE // accn=EF139846 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000394905 cpcScore=-0.0138366 cnci=-0.2421080 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_139 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_139 cpcScore=-1.2988600 cnci=-0.2714923 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000132196 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000132196 cpcScore=-1.1569200 cnci=-0.4487757 gene:OTTHUMG00000059449 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF155192 // NONCODE // accn=AF155192 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000071938 cpcScore=0.2251800 cnci=-0.0639922 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC047115 // NONCODE // accn=BC047115 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2669 cpcScore=-0.8581570 cnci=-0.3902005 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL049990 // NONCODE // accn=AL049990 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2670 cpcScore=-1.0378000 cnci=-0.3237726 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093732 // NONCODE // accn=AK093732 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2671 cpcScore=-1.1545400 cnci=-0.3782680 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1199 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1199 cpcScore=-1.3139200 cnci=-0.3950923 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR608990 // NONCODE // accn=CR608990 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000288185 cpcScore=-1.4203400 cnci=-0.4516572 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X89068 // NONCODE // accn=X89068 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000324343 cpcScore=1.4102200 cnci=-0.4300164 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S77834 // NONCODE // accn=S77834 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2674 cpcScore=2.2418400 cnci=-0.4969211 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1201 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1201 cpcScore=-1.7080600 cnci=-0.3383436 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128052 // NONCODE // accn=AK128052 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2678 cpcScore=-0.3375120 cnci=-0.3029079 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032916 // NONCODE // accn=BC032916 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2685 cpcScore=-1.0156500 cnci=-0.4273783 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504728 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000504728 cpcScore=-1.1464800 cnci=-0.2804269 gene:ENSG00000251199 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506638 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000506638 cpcScore=-1.1889500 cnci=-0.3158665 gene:ENSG00000251199 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC071818 // NONCODE // accn=BC071818 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2686 cpcScore=-1.2841900 cnci=-0.4003222 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR615110 // NONCODE // accn=CR615110 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2693 cpcScore=-1.1561000 cnci=-0.3200539 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130325 // NONCODE // accn=AK130325 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2695 cpcScore=0.2636910 cnci=-0.3130131 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR610181 // NONCODE // accn=CR610181 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2696 cpcScore=-0.5802580 cnci=-0.1381845 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000512692 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512692 cpcScore=4.7454400 cnci=-0.2997759 gene:ENSG00000196951 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
D86322 // NONCODE // accn=D86322 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2697 cpcScore=8.3169100 cnci=-0.3863954 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069556 // NONCODE // accn=BC069556 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2699 cpcScore=2.3270100 cnci=-0.1637893 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK001013 // NONCODE // accn=AK001013 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2701 cpcScore=-1.1462500 cnci=-0.2925176 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EU338227 // NONCODE // accn=EU338227 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000557635 cpcScore=-0.8884770 cnci=-0.1700070 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L07251 // NONCODE // accn=L07251 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000191812 cpcScore=1.1035500 cnci=-0.3481074 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// L07253 // NONCODE // accn=L07253 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000191813 cpcScore=0.3117540 cnci=-0.2654631 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039450 // NONCODE // accn=BC039450 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2705 cpcScore=-1.2213100 cnci=-0.1887892 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503066 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000503066 cpcScore=-1.2381400 cnci=-0.1792890 gene:ENSG00000248890 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512359 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000512359 cpcScore=-0.9592010 cnci=-0.2456904 gene:ENSG00000248890 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042377 // NONCODE // accn=BC042377 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2707 cpcScore=-1.1759500 cnci=-0.2983101 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL117519 // NONCODE // accn=AL117519 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2709 cpcScore=-1.1763300 cnci=-0.3074703 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033879 // NONCODE // accn=BC033879 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000093258 cpcScore=-1.0791200 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL832220 // NONCODE // accn=AL832220 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2710 cpcScore=-1.0433800 cnci=-0.2808823 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X75686 // NONCODE // accn=X75686 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000323538 cpcScore=0.0364289 cnci=-0.1292128 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK024235 // NONCODE // accn=AK024235 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2721 cpcScore=-0.4614920 cnci=-0.3757562 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039551 // NONCODE // accn=BC039551 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2722 cpcScore=-1.0343600 cnci=-0.3041437 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003inj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003inj.2 cpcScore=4.7343400 cnci=-0.3211689 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC105803 // NONCODE // accn=BC105803 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000338284 cpcScore=3.5890000 cnci=-0.3955338 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
X00086 // NONCODE // accn=X00086 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000320849 cpcScore=0.4180570 cnci=-0.2497241 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036641 // NONCODE // accn=NR_036641 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036641 cpcScore=5.1651100 cnci=-0.2439899 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026575 // NONCODE // accn=NR_026575 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_026575 cpcScore=9.5071400 cnci=-0.1615799 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK021429 // NONCODE // accn=AK021429 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2732 cpcScore=7.4456300 cnci=-0.1607548 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043512 // NONCODE // accn=BC043512 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2734 cpcScore=-0.9450140 cnci=-0.4090214 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003isw.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003isw.3 cpcScore=-0.8188650 cnci=-0.3188688 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003isx.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003isx.1 cpcScore=-0.9730570 cnci=-0.3101553 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040577 // NONCODE // accn=BC040577 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2735 cpcScore=-1.1670600 cnci=-0.1583731 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499322 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499322 cpcScore=-1.2063900 cnci=-0.3170106 gene:ENSG00000245213 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510523 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000510523 cpcScore=-1.0479200 cnci=-0.2988550 gene:ENSG00000245213 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124206 // NONCODE // accn=AK124206 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2736 cpcScore=0.3630860 cnci=-0.3705173 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR596087 // NONCODE // accn=CR596087 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2737 cpcScore=-1.1902500 cnci=-0.3614654 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123211 // NONCODE // accn=AK123211 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2738 cpcScore=-1.0476500 cnci=-0.3040805 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF130075 // NONCODE // accn=AF130075 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2740 cpcScore=-0.4737100 cnci=-0.3209843 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027332 // NONCODE // accn=NR_027332 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027332 cpcScore=1.7151100 cnci=-0.3673435 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC032904 // NONCODE // accn=BC032904 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000092860 cpcScore=-1.0757500 cnci=-0.2818722 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1664 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1664 cpcScore=-1.3867300 cnci=-0.2673293 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033655 // NONCODE // accn=NR_033655 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033655 cpcScore=4.2986700 cnci=-0.2911443 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024008 // NONCODE // accn=NR_024008 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024008 cpcScore=2.7879700 cnci=-0.1266353 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX537950 // NONCODE // accn=BX537950 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000054734 cpcScore=-1.0282600 cnci=-0.4119917 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX537950 // NONCODE // accn=BX537950 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2750 cpcScore=-0.8329120 cnci=-0.3091041 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ivm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ivm.2 cpcScore=-1.0118000 cnci=-0.3537014 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003ivr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003ivr.2 cpcScore=1.5634900 cnci=-0.1524850 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1456 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1456 cpcScore=-1.3433700 cnci=-0.3732298 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2090 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2090 cpcScore=-1.2841500 cnci=-0.2412503 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075048 // NONCODE // accn=AF075048 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2752 cpcScore=-0.9300800 cnci=-0.1770674 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1932 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1932 cpcScore=-1.3052300 cnci=-0.2628595 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00021455-XLOC_l2_011399 // Broad TUCP // linc-IRF2-2 chr4:-:185545504-185546918 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc003iwx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc003iwx.2 cpcScore=1.2984400 cnci=-0.2604297 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_028085 // NONCODE // accn=NR_028085 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_028085 cpcScore=4.9241200 cnci=-0.2997475 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC022048 // NONCODE // accn=BC022048 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2756 cpcScore=-1.2811300 cnci=-0.4026773 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF049885 // NONCODE // accn=AF049885 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2758 cpcScore=6.5841200 cnci=-0.0747497 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
EF139845 // NONCODE // accn=EF139845 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000394904 cpcScore=1.1616700 cnci=-0.2153239 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016998 // NONCODE // accn=BC016998 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2759 cpcScore=-0.9707520 cnci=-0.3086488 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U83111 // NONCODE // accn=U83111 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000221810_03 cpcScore=-1.2663800 cnci=-1.0000000 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001075 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001144767 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011can.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cao.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (UGT2B10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425704 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:4:69870574:69870852:-1 gene:ENSG00000251685 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001073 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B11 (UGT2B11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:69199951:69214731:-1 gene:ENSG00000213759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069441 // GenBank // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B11, mRNA (cDNA clone MGC:97110 IMAGE:7262335), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251551 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69199951:69214731:-1 Gene:OTTHUMG00000129395 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362227 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:69204304:69205693:-1 Gene:OTTHUMG00000129395 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003heh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B11 (UGT2B11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012390 // RefSeq // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3A (SMR3A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000226460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70360761:70367158:1 gene:ENSG00000109208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140927 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3A, mRNA (cDNA clone MGC:176604 IMAGE:9056739), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362574 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70360761:70367158:1 Gene:OTTHUMG00000160839 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3A (SMR3A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006685 // RefSeq // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B (SMR3B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70383078:70390244:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000381030 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:4:71248795:71255816:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70370093:70389906:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015327 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B, mRNA (cDNA clone MGC:21182 IMAGE:4397938), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC094707 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B, mRNA (cDNA clone MGC:104379 IMAGE:30350039), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000251552 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70383078:70390244:1 Gene:OTTHUMG00000129396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362613 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70383131:70385090:1 Gene:OTTHUMG00000129396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364117 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:70370093:70389906:1 Gene:OTTHUMG00000129396 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hfh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B (SMR3B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031950 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2 (FGFBP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000259989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:15960243:15963236:-1 gene:ENSG00000137441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025720 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34108 IMAGE:5228917), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000250324 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:15960243:15963236:-1 Gene:OTTHUMG00000128513 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003gon.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2 (FGFBP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xmm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2 (FGFBP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136230 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (HSD17B13), transcript variant B, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178135 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (HSD17B13), transcript variant A, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87303789:87322886:-1 gene:ENSG00000170509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112303 // GenBank // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13, mRNA (cDNA clone MGC:138508 IMAGE:8327771), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328546 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2939:431123:447646:+ gene:ENSG00000170509 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000253052 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87303789:87322906:-1 Gene:OTTHUMG00000130602 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000363595 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:87303789:87322886:-1 Gene:OTTHUMG00000130602 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003hqo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (HSD17B13), transcript variant A, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ikk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (HSD17B13), transcript variant B, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032623 // RefSeq // Homo sapiens mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (MGARP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139266163:139280338:-1 gene:ENSG00000137463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104173 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:125827 IMAGE:40030666), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000364536 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:139266163:139280338:-1 Gene:OTTHUMG00000161325 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003ihr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (MGARP), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005958 // RefSeq // Homo sapiens melatonin receptor 1A (MTNR1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074946 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:104051 IMAGE:30915497), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074947 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:103890 IMAGE:30915274), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126297 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:161575 IMAGE:8992013), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126299 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:161577 IMAGE:8992015), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307161 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold799:402456:425093:+ gene:ENSG00000168412 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000360189 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:186533655:186555567:-1 Gene:OTTHUMG00000185575 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003izd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens melatonin receptor 1A (MTNR1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001657 // RefSeq // Homo sapiens amphiregulin (AREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264487 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:4:75310853:75318354:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74445134:74455009:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502307 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74445302:74455005:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511560 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74448639:74450532:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009799 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:13647 IMAGE:4277616), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146953 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:182056 IMAGE:9056881), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000252277 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74445134:74455009:1 Gene:OTTHUMG00000130006 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362727 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74445302:74455005:1 Gene:OTTHUMG00000130006 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000362728 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:4:74448639:74450532:1 Gene:OTTHUMG00000130006 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000498917 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000498917 cpcScore=-1.2761700 cnci=-0.2668281 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506606 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000506606 cpcScore=-1.1133600 cnci=-0.2782348 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514109 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000514109 cpcScore=-1.0569300 cnci=-0.1947627 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1186 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1186 cpcScore=-1.2885400 cnci=-0.2322760 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000502758 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000502758 cpcScore=-1.1941900 cnci=-0.3262793 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041902 // NONCODE // accn=BC041902 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=5103 cpcScore=-1.2778900 cnci=-0.3951005 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499180 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499180 cpcScore=-0.9939890 cnci=-0.2737179 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511571 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000511571 cpcScore=-0.9137710 cnci=-0.3103872 gene:ENSG00000248049 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000505537 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505537 cpcScore=-1.2361100 cnci=-0.2430742 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507869 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000507869 cpcScore=-0.2648720 cnci=-0.2305635 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509012 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000509012 cpcScore=-1.3107400 cnci=-0.2736879 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1817 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1817 cpcScore=-1.5157500 cnci=-0.1821108 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094166 // NONCODE // accn=AK094166 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=2747 cpcScore=-1.3139500 cnci=-0.2983042 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315302 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000315302 cpcScore=3.8616900 cnci=-0.2490014 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505873 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000505873 cpcScore=3.9692500 cnci=-0.1497084 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508968 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000508968 cpcScore=-1.1575600 cnci=-0.1877691 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511052 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000511052 cpcScore=-1.1154800 cnci=-0.1605368 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513752 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000513752 cpcScore=-1.1833000 cnci=-0.1906014 gene:ENSG00000177822 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027107 // NONCODE // accn=NR_027107 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027107 cpcScore=3.8007500 cnci=-0.2611009 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1617 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1617 cpcScore=-1.6677000 cnci=-0.1613676 // chr4 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052909 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4B (PLEKHG4B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000283426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140258:189970:1 gene:ENSG00000153404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365359 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:140258:189970:1 Gene:OTTHUMG00000161570 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365360 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:140566:157110:1 Gene:OTTHUMG00000161570 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365361 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:169053:182589:1 Gene:OTTHUMG00000161570 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jak.2 // UCSC Genes // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4B (PLEKHG4B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000431004 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:5:478238:479604:1 gene:ENSG00000225138 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000534918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:478123:480884:1 gene:ENSG00000225138 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013821 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4346813, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011cly.2 // UCSC Genes // --- // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018140 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa (CEP72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:612272:653553:1 gene:ENSG00000112877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444221 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:5:612405:653664:1 gene:ENSG00000112877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:655455:667168:1 gene:ENSG00000112877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299072 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57567 complete cds, highly similar to Centrosomal protein of 72 kDa. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000132 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa, mRNA (cDNA clone MGC:5307 IMAGE:2899944), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365967 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:612272:653553:1 Gene:OTTHUMG00000161745 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:655455:667168:1 Gene:OTTHUMG00000161745 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367601 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:644138:653243:1 Gene:OTTHUMG00000161745 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367602 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:653026:657093:1 Gene:OTTHUMG00000161745 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jbf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa (CEP72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc011clz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa (CEP72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000367449 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:979365:981300:1 Gene:OTTHUMG00000162131 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511936 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:979365:981300:1 gene:ENSG00000250173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408317 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:5:1004302:1004392:1 gene:ENSG00000221244 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000502737 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000502737 cpcScore=-1.0262400 cnci=-0.1452679 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001003841 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 19 (SLC6A19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1201595:1225117:1 gene:ENSG00000174358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1201595:1225117:1 Gene:OTTHUMG00000161636 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365558 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1201595:1223270:1 Gene:OTTHUMG00000161636 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jbw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 19 (SLC6A19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182632 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (SLC6A18), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296821 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:5:1225470:1244492:1 gene:ENSG00000164363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000324642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1225355:1246189:1 gene:ENSG00000164363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC056757 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:50843 IMAGE:5758770), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000206728 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1225355:1246189:1 Gene:OTTHUMG00000090356 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365556 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1225409:1232839:1 Gene:OTTHUMG00000090356 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jby.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6, member 18 (SLC6A18), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ598099 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-36165, complete sequence. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xwf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-55752, complete sequence. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004553 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000274137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1801400:1816605:1 gene:ENSG00000145494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469176 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:1801415:1814699:1 gene:ENSG00000145494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:1801421:1802279:1 gene:ENSG00000145494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038664 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:40334 IMAGE:5204222), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046155 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:57685 IMAGE:6047460), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000206744 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1801400:1816605:1 Gene:OTTHUMG00000090372 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000314003 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1801415:1814699:1 Gene:OTTHUMG00000090372 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365553 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:1801421:1802279:1 Gene:OTTHUMG00000090372 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jcy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS6), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364156 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:2184710:2184820:1 gene:ENSG00000201026 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000559599 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:5:3609099:3612053:1 gene:ENSG00000259491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015325 // RefSeq // Homo sapiens interactor of little elongator complex ELL subunit 1 (ICE1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:5422694:5490234:1 gene:ENSG00000164151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:5420664:5454615:1 gene:ENSG00000164151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365575 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:5422694:5490234:1 Gene:OTTHUMG00000161639 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365578 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:5422742:5437836:1 Gene:OTTHUMG00000161639 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365579 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:5420664:5454615:1 Gene:OTTHUMG00000161639 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jdm.4 // UCSC Genes // --- // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:6112111:6112200:1 gene:ENSG00000221568 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145161 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family-like 1 (UBE2QL1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000399816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:6448623:6494909:1 gene:ENSG00000215218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365717 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:6448623:6494909:1 Gene:OTTHUMG00000161683 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jdp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family-like 1 (UBE2QL1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024423 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1018 (LINC01018), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_024424 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1018 (LINC01018), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:6582138:6588499:1 gene:ENSG00000250056 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365709 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:6582138:6588499:1 Gene:OTTHUMG00000161680 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365710 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:6583276:6587670:1 Gene:OTTHUMG00000161680 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365711 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:6582136:6583723:1 Gene:OTTHUMG00000161680 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365712 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:6582146:6585898:1 Gene:OTTHUMG00000161680 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jdq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC255167 (LOC255167), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc003jdr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC255167 (LOC255167), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390956 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:7047227:7047336:1 gene:ENSG00000212258 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000513693 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:7685091:7692271:1 gene:ENSG00000078295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366311 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:7685091:7692271:1 Gene:OTTHUMG00000090476 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:7980146:7980304:1 gene:ENSG00000199773 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045196 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 18 (non-protein coding) (SNHG18), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:9546200:9550609:1 gene:ENSG00000250786 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:9546290:9549590:1 gene:ENSG00000250786 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366000 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:9546200:9550609:1 Gene:OTTHUMG00000161753 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366001 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:5:9546290:9549590:1 Gene:OTTHUMG00000161753 // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021xwm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100505806 (LOC100505806), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 0 // --- // 0