NR_046018 // RefSeq // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 like 1 (DDX11L1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11869:14409:1 gene:ENSG00000223972 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM992878 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like 12 (DDX11L12 gene). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM992880 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DEAD/H box polypeptide 11 like 9 (DDX11L9 gene). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032353 // GenBank HTC // Homo sapiens DEAD/H box polypeptide 11 like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5218741), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aaa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 like 1 (DDX11L1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 like 1 (DDX11L1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 like 1 (DDX11L1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408384 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:30366:30503:1 gene:ENSG00000221311 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30267:31109:1 gene:ENSG00000243485 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:29554:31097:1 gene:ENSG00000243485 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002840 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:29554:31097:1 Gene:OTTHUMG00000000959 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002841 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:30267:31109:1 Gene:OTTHUMG00000000959 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005484 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:69091:70008:1 gene:ENSG00000186092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003223 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:69091:70008:1 Gene:OTTHUMG00000001094 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aal.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597235 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35301, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aaq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001aaq.1 cpcScore=-1.3748600 cnci=-0.2595055 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aaq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59592, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599768 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37834, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aar.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42430, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aar.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001aar.1 cpcScore=-1.2232100 cnci=-0.0342249 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000455464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:476531:497259:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005221 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001005224 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 (OR4F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001005277 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 (OR4F16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:450740:451678:-1 gene:ENSG00000278566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000235249 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137547 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169170 IMAGE:9021547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137568 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169191 IMAGE:9021568), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007999 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:450740:451678:-1 Gene:OTTHUMG00000002860 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M37726 // GenBank // Human mitochondrial Lys-tRNA-aaa. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abb.2 cpcScore=-1.2886200 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abb.3 // UCSC Genes // Method for predicting functional sites of RNA from its sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000358533 // ENSEMBL // [retired]ensembl:lincRNA chromosome:GRCh37:1:721320:722513:1 gene:ENSG00000237491 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1059734:1066456:1 gene:ENSG00000217801 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310350 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17392. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033949 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5286066. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5286066. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vjs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA, FLJ17392. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038869 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1342 (LINC01342), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1137017:1144056:1 gene:ENSG00000223823 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002221 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1137017:1144056:1 Gene:OTTHUMG00000000827 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC254099 (LOC254099), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029639 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200b (MIR200B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167092:1167202:1 gene:ENSG00000207730 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 200b (MIR200B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029834 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200a (MIR200A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384875 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167846:1167956:1 gene:ENSG00000207607 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nye.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 200a (MIR200A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080605 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 (B3GALT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1232265:1235041:1 gene:ENSG00000176022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005071 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1232265:1235041:1 Gene:OTTHUMG00000001813 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 (B3GALT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001029885 // RefSeq // Homo sapiens ceramide-1-phosphate transfer protein (CPTP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1324767:1328897:1 gene:ENSG00000224051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1324756:1327994:1 gene:ENSG00000224051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008742 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1324767:1328897:1 Gene:OTTHUMG00000003171 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008743 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1324756:1327994:1 Gene:OTTHUMG00000003171 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008744 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1325241:1327471:1 Gene:OTTHUMG00000003171 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aeo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens glycolipid transfer protein domain containing 1 (GLTPD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152228 // RefSeq // Homo sapiens taste receptor, type 1, member 3 (TAS1R3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1331314:1335306:1 gene:ENSG00000169962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008493 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1331314:1335306:1 Gene:OTTHUMG00000003071 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens taste receptor, type 1, member 3 (TAS1R3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015434 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC148413 (LOC148413), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444362 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1399527:1402046:1 gene:ENSG00000224870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1400419:1402046:1 gene:ENSG00000224870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068600 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC148413, mRNA (cDNA clone IMAGE:5264910). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1399527:1402046:1 Gene:OTTHUMG00000002908 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008128 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1399530:1402026:1 Gene:OTTHUMG00000002908 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099684 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1399522:1401087:1 Gene:OTTHUMG00000002908 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001afm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC148413 (LOC148413), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vkd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC148413 (LOC148413), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001146685 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 88B (TMEM88B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:1426128:1427787:1 gene:ENSG00000205116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000331012 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1426128:1427787:1 Gene:OTTHUMG00000153395 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 88B (TMEM88B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000366395 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000366395 cpcScore=-0.2368650 cnci=-0.1673231 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001039211 // RefSeq // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 3C (ATAD3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1449689:1470158:1 gene:ENSG00000215915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475091 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:1449914:1455902:1 gene:ENSG00000215915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001279 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1449689:1470158:1 Gene:OTTHUMG00000000531 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1449914:1455902:1 Gene:OTTHUMG00000000531 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100304 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1462483:1468663:1 Gene:OTTHUMG00000000531 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aft.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 3C (ATAD3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000366221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1574975:1577075:1 gene:ENSG00000215014 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oer.1 // UCSC Genes // Homo sapiens HP08716 mRNA, partial sequence, clone: HP08716-RBd88H07. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002946 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 23A (pseudogene) (MMP23A), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF057062 // GenBank // Homo sapiens metalloprotease mmp21/22C (MMP21/22C) mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ahi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens matrix metallopeptidase 23A (pseudogene) (MMP23A), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vko.1 // UCSC Genes // Homo sapiens matrix metallopeptidase 23A (pseudogene) (MMP23A), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000100213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1732554:1735975:1 Gene:OTTHUMG00000000825 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1732554:1735975:1 gene:ENSG00000227775 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000815 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (GABRD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033801 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta, mRNA (cDNA clone MGC:45284 IMAGE:5171119), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378585 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1183:35996:56862:- gene:ENSG00000187730 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098493 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:2019341:2030753:1 Gene:OTTHUMG00000041064 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aip.2 // UCSC Genes // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (GABRD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001aiu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35090 fis, clone PLACE6005691. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420406 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:2357419:2362089:1 gene:ENSG00000229813 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004637 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004637 cpcScore=-0.9628890 cnci=-0.1366037 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080431 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein T2 (ACTRT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3021483:3022903:1 gene:ENSG00000169717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543312 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:2938251:2939308:1 gene:ENSG00000169717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029499 // GenBank // Homo sapiens actin-related protein T2, mRNA (cDNA clone MGC:33234 IMAGE:5270604), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001331 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3021483:3022903:1 Gene:OTTHUMG00000000562 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ajz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens actin-related protein T2 (ACTRT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182752 // RefSeq // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like (TPRG1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3625050:3630127:1 gene:ENSG00000158109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456805 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:3541588:3545493:1 gene:ENSG00000158109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019034 // GenBank // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:20946 IMAGE:4576259), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378344 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3474:39180:41095:+ gene:ENSG00000158109 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001466 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3625002:3630127:1 Gene:OTTHUMG00000000609 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001467 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3625050:3630127:1 Gene:OTTHUMG00000000609 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001akm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like (TPRG1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vlj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like (TPRG1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152492 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27 (CCDC27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3752445:3771645:1 gene:ENSG00000162592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112108 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:138313 IMAGE:8327576), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112112 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:138317 IMAGE:8327580), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294600 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3304:133251:148981:- gene:ENSG00000162592 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009740 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3752398:3771644:1 Gene:OTTHUMG00000003504 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009741 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3752445:3771645:1 Gene:OTTHUMG00000003504 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001akv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27 (CCDC27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001163724 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 1 (Vel blood group) (SMIM1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:3772788:3775982:1 gene:ENSG00000235169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452264 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:3772825:3775388:1 gene:ENSG00000235169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009742 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3772788:3775982:1 Gene:OTTHUMG00000003505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009743 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3772825:3775388:1 Gene:OTTHUMG00000003505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001akw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens small integral membrane protein 1 (SMIM1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024455 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1134 (LINC01134), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3900404:3917225:1 gene:ENSG00000236423 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK130173 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26663 fis, clone MPG02628. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062787 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4762621, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098606 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3900416:3915447:1 Gene:OTTHUMG00000041129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158499 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3900372:3905532:1 Gene:OTTHUMG00000041129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158500 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3900404:3917225:1 Gene:OTTHUMG00000041129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133612 (LOC100133612), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133612 (LOC100133612), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nzo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100133612 (LOC100133612), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alh.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001alh.3 cpcScore=-1.1431900 cnci=-0.1880743 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nzo.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nzo.1 cpcScore=-0.9995770 cnci=-0.1055192 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040065 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1346 (LINC01346), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3940617:3955262:1 gene:ENSG00000233304 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3940613:3949351:1 gene:ENSG00000233304 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001241 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3940617:3955262:1 Gene:OTTHUMG00000000499 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001801 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3940613:3949351:1 Gene:OTTHUMG00000000499 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ali.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC728716 (LOC728716), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ali.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ali.1 cpcScore=1.3822300 cnci=-0.1749106 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027088 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC284661 (LOC284661), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:4412051:4424687:1 gene:ENSG00000235054 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:4412051:4424687:1 Gene:OTTHUMG00000000733 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC284661 (LOC284661), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042478 // RefSeq // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018836 // RefSeq // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:4654732:4777794:1 gene:ENSG00000196581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:4711155:4712165:1 gene:ENSG00000196581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378191 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold811:231123:290611:+ gene:ENSG00000196581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001542 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:4655045:4792534:1 Gene:OTTHUMG00000000645 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001543 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:4654732:4777794:1 Gene:OTTHUMG00000000645 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001645 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:4711155:4712165:1 Gene:OTTHUMG00000000645 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aln.3 // UCSC Genes // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401226 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:5815871:5815959:-1 gene:ENSG00000216045 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6237771:6239444:1 gene:ENSG00000225077 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6236240:6238940:1 gene:ENSG00000225077 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030279 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 211, mRNA (cDNA clone MGC:40168 IMAGE:5141008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003686 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:6237771:6239444:1 Gene:OTTHUMG00000001255 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003710 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:6236240:6238940:1 Gene:OTTHUMG00000001255 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001amm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 211, mRNA (cDNA clone MGC:40168 IMAGE:5141008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001amm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001amm.2 cpcScore=3.6138000 cnci=-0.1345563 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024598 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 3 (HES3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6244192:6245578:1 gene:ENSG00000173673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003716 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:6244192:6245578:1 Gene:OTTHUMG00000001271 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vly.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (HES3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517213 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:6540854:6540964:1 gene:ENSG00000253022 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153812 // RefSeq // Homo sapiens PHD finger protein 13 (PHF13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6613685:6624033:1 gene:ENSG00000116273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6613762:6622645:1 gene:ENSG00000116273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038516 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:43399 IMAGE:5266750), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004201 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:6613685:6624033:1 Gene:OTTHUMG00000001439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004202 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:6613762:6622645:1 Gene:OTTHUMG00000001439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aob.4 // UCSC Genes // Homo sapiens PHD finger protein 13 (PHF13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459253 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:6812779:6812881:1 gene:ENSG00000239166 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384328 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:7219360:7219524:1 gene:ENSG00000207056 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000427317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:7368942:7370270:1 gene:ENSG00000237402 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003610 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7368942:7370270:1 Gene:OTTHUMG00000001217 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004781 // RefSeq // Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 3 (VAMP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000054666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:7771269:7781432:1 gene:ENSG00000049245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470357 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:7772707:7779806:1 gene:ENSG00000049245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003570 // GenBank // Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 3 (cellubrevin), mRNA (cDNA clone MGC:2110 IMAGE:3544610), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005941 // GenBank // Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 3 (cellubrevin), mRNA (cDNA clone MGC:14563 IMAGE:4069433), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007050 // GenBank // Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 3 (cellubrevin), mRNA (cDNA clone MGC:12463 IMAGE:3681914), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003625 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7771269:7781432:1 Gene:OTTHUMG00000001225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003626 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7772707:7779806:1 Gene:OTTHUMG00000001225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099330 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7777097:7778169:1 Gene:OTTHUMG00000001225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aol.3 // UCSC Genes // Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 3 (VAMP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516445 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:8328067:8328179:1 gene:ENSG00000252254 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038351 // RefSeq // Homo sapiens ENO1 antisense RNA 1 (ENO1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8878835:8879894:1 gene:ENSG00000230679 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004954 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8878835:8879894:1 Gene:OTTHUMG00000001779 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oft.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ENO1 antisense RNA 1 (ENO1-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000437767 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:8953568:8953840:1 gene:ENSG00000238249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516595 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:9082696:9082879:1 gene:ENSG00000252404 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004285 // RefSeq // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6PD), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9234775:9271337:1 gene:ENSG00000049239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9265530:9271337:1 gene:ENSG00000049239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC081559 // GenBank // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase), mRNA (cDNA clone MGC:87643 IMAGE:5266232), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004928 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9234775:9271337:1 Gene:OTTHUMG00000001768 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004929 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9265530:9271337:1 Gene:OTTHUMG00000001768 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001apt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6PD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517032 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:9338450:9338592:1 gene:ENSG00000252841 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032315 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier), member 33 (SLC25A33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9539482:9585179:1 gene:ENSG00000171612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004991 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:4399 IMAGE:2905957), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC073135 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:87888 IMAGE:6172562), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003851 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9539482:9585179:1 Gene:OTTHUMG00000001322 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001apw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier), member 33 (SLC25A33), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000453140 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:9961518:9962174:1 gene:ENSG00000234374 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005036 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:9961518:9962174:1 Gene:OTTHUMG00000001803 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000005042 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9942923:9949974:1 Gene:OTTHUMG00000001805 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9942923:9949974:1 gene:ENSG00000228150 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052960 // RefSeq // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular (RBP7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9997216:10016020:1 gene:ENSG00000162444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9997206:10016020:1 gene:ENSG00000162444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033883 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular, mRNA (cDNA clone IMAGE:5555132), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063013 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:70641 IMAGE:5224517), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005027 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9997216:10016020:1 Gene:OTTHUMG00000001798 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005028 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9997206:10016020:1 Gene:OTTHUMG00000001798 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aqq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular (RBP7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vms.3 // UCSC Genes // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular (RBP7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:10163268:10163374:1 gene:ENSG00000201746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:10298966:10299072:1 gene:ENSG00000199562 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11152350:11152452:1 gene:ENSG00000253086 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384720 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11226254:11226360:1 gene:ENSG00000207451 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013319 // RefSeq // Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1 (UBIAD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11273528:11295164:1 gene:ENSG00000120942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11273206:11288434:1 gene:ENSG00000120942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483738 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:11273934:11296049:1 gene:ENSG00000120942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004468 // GenBank // Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:10310 IMAGE:3936638), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005773 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11273206:11288434:1 Gene:OTTHUMG00000002075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005774 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11273934:11296049:1 Gene:OTTHUMG00000002075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005775 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11273528:11295164:1 Gene:OTTHUMG00000002075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005776 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11273889:11295183:1 Gene:OTTHUMG00000002075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001asg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1 (UBIAD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198545 // RefSeq // Homo sapiens dorsal inhibitory axon guidance protein (DRAXIN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11691729:11725857:1 gene:ENSG00000162490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111064 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 187, mRNA (cDNA clone MGC:117222 IMAGE:5769984), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11691729:11725857:1 Gene:OTTHUMG00000002227 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001asr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens dorsal inhibitory axon guidance protein (DRAXIN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK125437 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43448 fis, clone OCBBF2032611. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ass.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362477 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11908152:11908271:1 gene:ENSG00000199347 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003022 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59B (SNORA59B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003025 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59A (SNORA59A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000459326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12507246:12507397:1 gene:ENSG00000239149 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001atz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59B (SNORA59B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001103169 // RefSeq // [retired]Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001103170 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:12716115:12728759:1 gene:ENSG00000188984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12716143:12728400:1 gene:ENSG00000188984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005323 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12716115:12728759:1 Gene:OTTHUMG00000001887 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005324 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12716143:12728400:1 Gene:OTTHUMG00000001887 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aug.1 // UCSC Genes // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458803 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:12799693:12799796:1 gene:ENSG00000238771 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152290 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158 (C1orf158), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000288048 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:12806163:12823847:1 gene:ENSG00000157330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376210 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:12746425:12761169:1 gene:ENSG00000157330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:12746387:12753926:1 gene:ENSG00000157330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298760 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56581 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029894 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158, mRNA (cDNA clone MGC:35194 IMAGE:5171302), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005325 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12746215:12763699:1 Gene:OTTHUMG00000001888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005326 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12746425:12761169:1 Gene:OTTHUMG00000001888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12746387:12753926:1 Gene:OTTHUMG00000001888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158 (C1orf158), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158 (C1orf158), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080830 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 12 (PRAMEF12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12774841:12777906:1 gene:ENSG00000116726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12774841:12777906:1 Gene:OTTHUMG00000001927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aui.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 12 (PRAMEF12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023013 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 1 (PRAMEF1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12794691:12796485:1 gene:ENSG00000116721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144199 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:177736 IMAGE:9052719), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332296 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3473:304061:307098:- gene:ENSG00000116721 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005458 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12791397:12796628:1 Gene:OTTHUMG00000001928 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005459 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12794691:12796485:1 Gene:OTTHUMG00000001928 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 1 (PRAMEF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023014 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 2 (PRAMEF2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000240189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12857086:12861909:1 gene:ENSG00000120952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075008 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:104155 IMAGE:30915615), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005517 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12857086:12861909:1 Gene:OTTHUMG00000001986 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aum.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 2 (PRAMEF2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012276 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001012277 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 7 (PRAMEF7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361079 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:12976450:12980569:1 gene:ENSG00000204510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140755 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:176432 IMAGE:9021623), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144565 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:178110 IMAGE:9053093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12917625:12920480:1 Gene:OTTHUMG00000001982 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aup.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12922554:12922660:1 gene:ENSG00000207434 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001100631 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 22 (PRAMEF22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376187 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13035543:13038381:1 gene:ENSG00000204508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158511 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13035543:13038381:1 Gene:OTTHUMG00000074726 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 22 (PRAMEF22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010889 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 6 (PRAMEF6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001013407 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 5 (PRAMEF5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376168 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13359819:13369057:1 gene:ENSG00000204502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101342 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 6, mRNA (cDNA clone MGC:120473 IMAGE:40025149), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101344 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:120475 IMAGE:40025152), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130274 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:163146 IMAGE:40146305), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026271 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13359819:13369057:1 Gene:OTTHUMG00000009505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 5 (PRAMEF5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010890 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 9 (PRAMEF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001098376 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 15 (PRAMEF15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13315581:13322598:1 gene:ENSG00000204501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101343 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:120474 IMAGE:40025151), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137391 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:169012 IMAGE:9021389), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022041 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13315581:13322598:1 Gene:OTTHUMG00000008035 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 9 (PRAMEF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001045480 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 16 (PRAMEF16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376121 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13495254:13498260:1 gene:ENSG00000204488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144662 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 16, mRNA (cDNA clone MGC:178210 IMAGE:9053193), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008178 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13495254:13498260:1 Gene:OTTHUMG00000002933 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aux.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 16 (PRAMEF16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099852 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001100114 // RefSeq // [retired]Homo sapiens PRAME family member 21 (PRAMEF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000327795 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:1:13521973:13526873:1 gene:ENSG00000204486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332192 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13516066:13526943:1 gene:ENSG00000204486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008157 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13521973:13526873:1 Gene:OTTHUMG00000002919 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC112208 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 10, mRNA (cDNA clone MGC:138413 IMAGE:8327676), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112210 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 10, mRNA (cDNA clone MGC:138415 IMAGE:8327678), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 10, mRNA (cDNA clone MGC:138413 IMAGE:8327676), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auz.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001auz.3 cpcScore=7.0577600 cnci=-0.1997406 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010890 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 9 (PRAMEF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001098376 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 15 (PRAMEF15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330087 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13641973:13648988:1 gene:ENSG00000157358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332913 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:13641973:13648988:1 gene:ENSG00000157358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101343 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:120474 IMAGE:40025151), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137391 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:169012 IMAGE:9021389), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021796 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13641973:13648988:1 Gene:OTTHUMG00000007921 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ava.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 9 (PRAMEF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000417907 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:1:13650431:13650910:1 gene:ENSG00000236652 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021789 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021789 cpcScore=-0.1453790 cnci=-0.2076816 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099851 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 17 (PRAMEF17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13389632:13392629:1 gene:ENSG00000204479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144662 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 16, mRNA (cDNA clone MGC:178210 IMAGE:9053193), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021780 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13389632:13392629:1 Gene:OTTHUMG00000007909 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 17 (PRAMEF17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099852 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001100114 // RefSeq // [retired]Homo sapiens PRAME family member 21 (PRAMEF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000316412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:13410450:13421328:1 gene:ENSG00000204478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021782 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13416351:13421328:1 Gene:OTTHUMG00000007911 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009voa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412667 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:14219052:14507087:1 gene:ENSG00000218328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022032 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:14219052:14507087:1 Gene:OTTHUMG00000008026 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024329 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2 (EFHD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375975 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:15736433:15756826:1 gene:ENSG00000142634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15409895:15430343:1 gene:ENSG00000142634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007233 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:15408 IMAGE:2961350), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014923 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:17894 IMAGE:3909362), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023611 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:23298 IMAGE:4638660), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068473 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:87102 IMAGE:5267148), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006433 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15409895:15430343:1 Gene:OTTHUMG00000002254 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006434 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15410265:15429081:1 Gene:OTTHUMG00000002254 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001awh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2 (EFHD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007272 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin) (CTRC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:15438442:15449242:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15438439:15446654:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15440350:15446654:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015118 // GenBank // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone MGC:23991 IMAGE:3950170), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC059779 // GenBank // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone IMAGE:5225798). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15438439:15446654:1 Gene:OTTHUMG00000002255 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15440350:15446654:1 Gene:OTTHUMG00000002255 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006437 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15438453:15443540:1 Gene:OTTHUMG00000002255 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001awi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin) (CTRC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001awj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin) (CTRC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516057 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:15542165:15542304:1 gene:ENSG00000251866 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000420030 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:15931077:15931538:1 gene:ENSG00000235084 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015164 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (PLEKHM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15684390:15734769:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15684332:15734769:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15729845:15734115:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008463 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15684332:15734769:1 Gene:OTTHUMG00000003062 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008464 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15684390:15734769:1 Gene:OTTHUMG00000003062 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008465 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15729845:15734115:1 Gene:OTTHUMG00000003062 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008466 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15684541:15719869:1 Gene:OTTHUMG00000003062 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (PLEKHM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207348 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 34 (SLC25A34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15736405:15741396:1 gene:ENSG00000162461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15737783:15739335:1 gene:ENSG00000162461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027998 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:40185 IMAGE:5189944), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008467 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15736405:15741396:1 Gene:OTTHUMG00000003063 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008468 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15737783:15739335:1 Gene:OTTHUMG00000003063 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008469 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15739035:15739562:1 Gene:OTTHUMG00000003063 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 25, member 34 (SLC25A34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013641 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 82 (TMEM82), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15742422:15747982:1 gene:ENSG00000162460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15742547:15744580:1 gene:ENSG00000162460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127706 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:157801 IMAGE:40127826), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127707 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:157802 IMAGE:40127833), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137239 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:168859 IMAGE:9021236), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008471 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15742422:15747982:1 Gene:OTTHUMG00000003065 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008472 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15742547:15744580:1 Gene:OTTHUMG00000003065 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axc.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015001 // RefSeq // Homo sapiens spen family transcriptional repressor (SPEN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375753 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:16200610:16255713:1 gene:ENSG00000065526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15847864:15940460:1 gene:ENSG00000065526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15873502:15876711:1 gene:ENSG00000065526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025993 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15847864:15940460:1 Gene:OTTHUMG00000009376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025994 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15873502:15911301:1 Gene:OTTHUMG00000009376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025995 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15873502:15876711:1 Gene:OTTHUMG00000009376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025996 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15876576:15920906:1 Gene:OTTHUMG00000009376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025997 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15938583:15939544:1 Gene:OTTHUMG00000009376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spen homolog, transcriptional regulator (Drosophila) (SPEN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens spen homolog, transcriptional regulator (Drosophila) (SPEN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459258 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:16237392:16237492:1 gene:ENSG00000238818 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178840 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 64 (C1orf64), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000329454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16004236:16008807:1 gene:ENSG00000183888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017946 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone MGC:24047 IMAGE:4295881), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16004236:16008807:1 Gene:OTTHUMG00000009523 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 64 (C1orf64), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000501442 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000501442 cpcScore=0.5346410 cnci=-0.2114474 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000434336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16673003:16673512:1 gene:ENSG00000237847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogz.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oha.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon CCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:16740516:16740679:1 gene:ENSG00000207389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohd.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohe.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon CCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohh.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:16895980:16896143:1 gene:ENSG00000207005 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohi.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016233 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III (PADI3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:17249098:17284233:1 gene:ENSG00000142619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041592 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:52193 IMAGE:5431445), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109091 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:126307 IMAGE:40034659), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109092 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:126308 IMAGE:40034660), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006805 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:17249098:17284233:1 Gene:OTTHUMG00000002373 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bai.3 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III (PADI3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207421 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type VI (PADI6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000434762 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:17698691:17728195:1 gene:ENSG00000256049 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bak.1 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type VI (PADI6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458798 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:17776259:17776359:1 gene:ENSG00000239020 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032880 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21 (IGSF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000251296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:18107746:18378482:1 gene:ENSG00000117154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18361367:18378483:1 gene:ENSG00000117154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK123172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41177 fis, clone BRACE2042628, highly similar to Immunoglobulin superfamily member 21 precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007618 // GenBank // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:15730 IMAGE:3355289), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:18107746:18378482:1 Gene:OTTHUMG00000002432 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006925 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:18278845:18376367:1 Gene:OTTHUMG00000002432 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006926 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:18361367:18378483:1 Gene:OTTHUMG00000002432 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006927 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:18375957:18376920:1 Gene:OTTHUMG00000002432 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bau.2 // UCSC Genes // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21 (IGSF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bav.2 // UCSC Genes // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21 (IGSF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001baw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35299 fis, clone PROST2009347. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152375 // RefSeq // Homo sapiens kelch domain containing 7A (KLHDC7A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540290 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:18807665:18812534:1 gene:ENSG00000179023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC151205 // GenBank // Homo sapiens kelch domain containing 7A, mRNA (cDNA clone IMAGE:40147105), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400664 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1986:167276:169585:+ gene:ENSG00000179023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006923 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:18480982:18486126:1 Gene:OTTHUMG00000002431 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bax.3 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch domain containing 7A (KLHDC7A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vpg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens kelch domain containing 7A (KLHDC7A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016183 // RefSeq // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae) (MRTO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19251539:19260128:1 gene:ENSG00000053372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:19251835:19256052:1 gene:ENSG00000053372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003013 // GenBank // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4041 IMAGE:2821148), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007075 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19251539:19260128:1 Gene:OTTHUMG00000002496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007160 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19251835:19256052:1 Gene:OTTHUMG00000002496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007161 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19257712:19258739:1 Gene:OTTHUMG00000002496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bbs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae) (MRTO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:19510593:19510733:1 gene:ENSG00000201609 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000871 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, G protein-coupled (HTR6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074995 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:103988 IMAGE:30915396), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289753 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold956:58280:69888:- gene:ENSG00000158748 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007704 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19665287:19679562:1 Gene:OTTHUMG00000002713 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bcl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, G protein-coupled (HTR6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022819 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IIF (PLA2G2F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20139326:20150386:1 gene:ENSG00000158786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20139326:20150386:1 Gene:OTTHUMG00000002704 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20139330:20144080:1 Gene:OTTHUMG00000002704 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vpp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipase A2, group IIF (PLA2G2F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207334 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B (FAM43B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC142610 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B, mRNA (cDNA clone MGC:164761 IMAGE:40147211), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC142686 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B, mRNA (cDNA clone MGC:164996 IMAGE:40148591), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332947 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1467:290853:291032:- gene:ENSG00000183114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127759 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20552439:20555010:1 Gene:OTTHUMG00000057491 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B (FAM43B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001785 // RefSeq // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20589086:20618903:1 gene:ENSG00000158825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY634312 // GenBank // Homo sapiens small cytidine deaminase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC048284 // GenBank // Homo sapiens cytidine deaminase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5213873). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC054036 // GenBank // Homo sapiens cytidine deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:64975 IMAGE:5403243), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375071 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1467:233707:244629:- gene:ENSG00000158825 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007965 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20588948:20618908:1 Gene:OTTHUMG00000002845 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007966 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20589086:20618903:1 Gene:OTTHUMG00000002845 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vpv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032409 // RefSeq // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1 (PINK1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20633455:20651511:1 gene:ENSG00000158828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20638129:20651316:1 gene:ENSG00000158828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK075225 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90744 fis, clone PLACE1011364, weakly similar to MYOTONIN-PROTEIN KINASE (EC 2.7.1.-). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028215 // GenBank // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:39860 IMAGE:5214483), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007954 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20633455:20651511:1 Gene:OTTHUMG00000002841 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007955 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20638129:20651316:1 Gene:OTTHUMG00000002841 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007956 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20645508:20651510:1 Gene:OTTHUMG00000002841 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1 (PINK1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1 (PINK1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:20841241:20841302:1 gene:ENSG00000251914 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000537790 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:21724480:21724833:1 gene:ENSG00000236216 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC127868 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40133403, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001beq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40133403, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013693 // RefSeq // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (LDLRAD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:21812265:21825221:1 gene:ENSG00000187942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21821497:21822548:1 gene:ENSG00000187942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:21812363:21823963:1 gene:ENSG00000187942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043362 // GenBank HTC // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4476294), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146860 // GenBank // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:181963 IMAGE:9056788), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007601 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:21812265:21825221:1 Gene:OTTHUMG00000002675 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007602 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:21821497:21822548:1 Gene:OTTHUMG00000002675 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (LDLRAD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (LDLRAD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000398929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG5:36299388:36299830:-1 gene:ENSG00000278476 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSG00000232037 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365049 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:21987816:21987919:1 gene:ENSG00000201919 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364403 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:22010985:22011088:1 gene:ENSG00000201273 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001006943 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_020526 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000166244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22563564:22603594:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22563564:22589621:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22563577:22589610:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008085 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22563564:22603594:1 Gene:OTTHUMG00000002892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008086 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22563564:22589621:1 Gene:OTTHUMG00000002892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015991 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain (C1QA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339353 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:22963118:22966175:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22636506:22639608:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000402322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22637580:22639608:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030153 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain, mRNA (cDNA clone MGC:29490 IMAGE:4850418), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071986 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain, mRNA (cDNA clone MGC:88683 IMAGE:6300836), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008087 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22636506:22639608:1 Gene:OTTHUMG00000002893 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096526 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22636762:22639331:1 Gene:OTTHUMG00000002893 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317635 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22637580:22639608:1 Gene:OTTHUMG00000002893 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain (C1QA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001114101 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_172369 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22643653:22647887:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22643633:22648110:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22643630:22648110:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009016 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:17279 IMAGE:4212772), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008083 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22643633:22648110:1 Gene:OTTHUMG00000002891 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008084 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22643653:22647887:1 Gene:OTTHUMG00000002891 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096530 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22643630:22648110:1 Gene:OTTHUMG00000002891 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bga.4 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bgc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000491 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, B chain (C1QB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000314933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22653189:22661536:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22652981:22661538:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008983 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, B chain, mRNA (cDNA clone MGC:17227 IMAGE:4212848), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008092 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22652981:22661538:1 Gene:OTTHUMG00000002896 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008093 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22653189:22661316:1 Gene:OTTHUMG00000002896 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000359669 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22652762:22661090:1 Gene:OTTHUMG00000002896 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bgd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, B chain (C1QB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401338 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:22748817:22748911:-1 gene:ENSG00000216157 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:23162704:23162810:1 gene:ENSG00000206935 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bhf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36246 fis, clone THYMU2001900. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027042 // RefSeq // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (MDS2), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23627334:23640568:1 gene:ENSG00000197880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23581495:23640568:1 gene:ENSG00000197880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041472 // GenBank // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:5229269). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008172 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23627334:23640568:1 Gene:OTTHUMG00000002927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008173 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23581495:23640568:1 Gene:OTTHUMG00000002927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (MDS2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (MDS2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003198 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (110kDa, elongin A) (TCEB3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23744034:23750944:1 gene:ENSG00000011007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002883 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (110kDa, elongin A), mRNA (cDNA clone MGC:10488 IMAGE:3941728), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418390 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold977:566037:574208:+ gene:ENSG00000011007 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008230 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23743155:23762059:1 Gene:OTTHUMG00000002957 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008231 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23744034:23750944:1 Gene:OTTHUMG00000002957 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bho.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (110kDa, elongin A) (TCEB3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020362 // RefSeq // Homo sapiens PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (PITHD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23785192:23788232:1 gene:ENSG00000057757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60641 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017208 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 128, mRNA (cDNA clone MGC:10673 IMAGE:3943360), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000246151 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold977:584656:591264:+ gene:ENSG00000057757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008243 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23778405:23788232:1 Gene:OTTHUMG00000002960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008244 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23785192:23788232:1 Gene:OTTHUMG00000002960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096559 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23779357:23786378:1 Gene:OTTHUMG00000002960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (PITHD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oeb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (PITHD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458849 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:24208745:24208842:1 gene:ENSG00000238538 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_039615 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 378f (MIR378F), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oik.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 378f (MIR378F), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010980 // RefSeq // Homo sapiens noncompact myelin associated protein (NCMAP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:24556111:24609325:1 gene:ENSG00000184454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24589464:24609328:1 gene:ENSG00000184454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127785 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:157901 IMAGE:40134460), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147014 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:182117 IMAGE:9056942), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147015 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:182118 IMAGE:9056943), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009288 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:24556111:24609325:1 Gene:OTTHUMG00000003317 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009289 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:24589464:24609328:1 Gene:OTTHUMG00000003317 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bjk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens noncompact myelin associated protein (NCMAP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410560 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR7_1_CTG4_4:103167741:103167831:-1 gene:ENSG00000222492 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516706 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148739379:148739479:1 gene:ENSG00000252515 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000541879 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:25725203:25725771:1 gene:ENSG00000238084 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:25877496:25877605:1 gene:ENSG00000207302 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384508 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:25964197:25964300:1 gene:ENSG00000207237 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516381 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26006006:26006130:1 gene:ENSG00000252190 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516882 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26006216:26006299:1 gene:ENSG00000252691 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004455 // RefSeq // Homo sapiens exostosin-like glycosyltransferase 1 (EXTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26021780:26036464:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26023189:26031555:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065528 // GenBank // Homo sapiens exostoses (multiple)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:70794 IMAGE:6150218), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019746 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26023189:26031555:1 Gene:OTTHUMG00000007509 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019747 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26019884:26031547:1 Gene:OTTHUMG00000007509 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019748 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26032130:26035004:1 Gene:OTTHUMG00000007509 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26021780:26036464:1 Gene:OTTHUMG00000007509 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001blf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens exostosin-like glycosyltransferase 1 (EXTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024869 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 110, member D (FAM110D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26159020:26162628:1 gene:ENSG00000197245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025658 // GenBank // Homo sapiens glycine/arginine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:34152 IMAGE:5198480), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019841 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26159020:26162628:1 Gene:OTTHUMG00000007537 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001blk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 110, member D (FAM110D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ojo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 110, member D (FAM110D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198137 // RefSeq // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4 (CATSPER4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26190561:26202968:1 gene:ENSG00000188782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128138 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:149223 IMAGE:40112485), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128139 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:149224 IMAGE:40112493), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144663 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053194. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019849 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26190561:26202968:1 Gene:OTTHUMG00000003383 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000381673 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26190561:26201603:1 Gene:OTTHUMG00000003383 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000381674 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26190628:26202968:1 Gene:OTTHUMG00000003383 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vsf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4 (CATSPER4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oey.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4 (CATSPER4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oez.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4 (CATSPER4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26225320:26229840:1 gene:ENSG00000236155 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030768 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4813089. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001blq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4813089. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001blq.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001blq.2 cpcScore=-0.1944830 cnci=-0.2238156 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031286 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain binding glutamate-rich protein like 3 (SH3BGRL3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000270792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26279176:26281522:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000319041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26280122:26281450:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374243 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:26605667:26608007:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030135 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3, mRNA (cDNA clone MGC:19619 IMAGE:4040656), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009498 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26279176:26281522:1 Gene:OTTHUMG00000003381 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009499 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26280122:26281450:1 Gene:OTTHUMG00000003381 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001blu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3 (SH3BGRL3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024674 // RefSeq // Homo sapiens lin-28 homolog A (C. elegans) (LIN28A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26410817:26429719:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26410778:26429722:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK022519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12457 fis, clone NT2RM1000666, weakly similar to DNA-BINDING PROTEIN A. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028566 // GenBank // Homo sapiens lin-28 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:15037 IMAGE:3841184), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009891 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26410778:26429722:1 Gene:OTTHUMG00000003550 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bmi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens lin-28 homolog A (C. elegans) (LIN28A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bmj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lin-28 homolog A (C. elegans) (LIN28A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032283 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18 (ZDHHC18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374141 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26832004:26853963:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26826710:26857601:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26851129:26853211:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298683 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59953 complete cds, highly similar to Palmitoyltransferase ZDHHC18 (EC 2.3.1.-). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066776 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:71808 IMAGE:30342061), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011706 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26826710:26857601:1 Gene:OTTHUMG00000004092 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011707 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26851129:26853211:1 Gene:OTTHUMG00000004092 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bnb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18 (ZDHHC18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ofh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18 (ZDHHC18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006142 // RefSeq // Homo sapiens stratifin (SFN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26863138:26864457:1 gene:ENSG00000175793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538651 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:27189704:27190450:1 gene:ENSG00000175793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000329 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:8516 IMAGE:2822397), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000995 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:5018 IMAGE:3445915), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001550 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:5019 IMAGE:3457665), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023552 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:19713 IMAGE:3534328), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011709 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26863138:26864457:1 Gene:OTTHUMG00000004093 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bnc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens stratifin (SFN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013642 // RefSeq // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1 (TRNP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000522111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26993707:27000898:1 gene:ENSG00000253368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069216 // GenBank // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:78739 IMAGE:6376829), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012346 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26993707:27000898:1 Gene:OTTHUMG00000004277 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bnj.4 // UCSC Genes // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1 (TRNP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// trnP // GenBank // gi|7525012|ref|NC_000932.1|66490:66563:-1 product=tRNA-Pro, Chloroplast [Arabidopsis thaliana] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ojr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1 (TRNP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ojs.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033926 // RefSeq // Homo sapiens actin, gamma 1 pseudogene (LOC644961), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27325219:27325325:1 gene:ENSG00000206888 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oju.1 // UCSC Genes // Homo sapiens actin, gamma 1 pseudogene (LOC644961), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384367 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27693731:27693835:1 gene:ENSG00000207095 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27824538:27824643:1 gene:ENSG00000223062 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002997 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 1 (SCARNA1), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000517138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27834401:27834566:1 gene:ENSG00000252947 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001boy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 1 (SCARNA1), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018053 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (XKR8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27959462:27968096:1 gene:ENSG00000158156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27963637:27966710:1 gene:ENSG00000158156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013379 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:16520 IMAGE:4025274), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011175 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:27959462:27968096:1 Gene:OTTHUMG00000003912 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011176 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:27963637:27966710:1 Gene:OTTHUMG00000003912 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bph.1 // UCSC Genes // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (XKR8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408289 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28481362:28481480:1 gene:ENSG00000221216 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363217 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28508559:28508762:1 gene:ENSG00000200087 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459072 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:28843988:28844087:1 gene:ENSG00000238821 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001193532 // RefSeq // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152304 // RefSeq // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28592200:28595443:1 gene:ENSG00000188060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28592515:28594300:1 gene:ENSG00000188060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033175 // GenBank // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:45806 IMAGE:4561064), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010371 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:28592200:28595443:1 Gene:OTTHUMG00000003656 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010372 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:28592515:28594300:1 Gene:OTTHUMG00000003656 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bqu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bqv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021okd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004407 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U11 small nuclear (RNU11), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000387069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28648600:28648733:1 gene:ENSG00000274978 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000270103 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vtj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA, U11 small nuclear (RNU11), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383977 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28985710:28985810:1 gene:ENSG00000206704 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410855 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:29884902:29885005:1 gene:ENSG00000222787 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034112 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1225 (LINC01225), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418618 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:31971841:31974167:1 gene:ENSG00000228682 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104454 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40030264. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011054 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:31971841:31974167:1 Gene:OTTHUMG00000003880 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bsw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ornithine decarboxylase 1 pseudogene (LOC149086), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021okn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ornithine decarboxylase 1 pseudogene (LOC149086), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000527035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31789130:31791322:1 gene:ENSG00000254545 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391369 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:32379174:32380745:1 gene:ENSG00000212673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175852 // RefSeq // Homo sapiens taxilin alpha (TXLNA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32180065:32198285:1 gene:ENSG00000084652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32179686:32198285:1 gene:ENSG00000084652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427320 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:32645917:32661407:1 gene:ENSG00000084652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF516206 // GenBank // Homo sapiens taxilin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC080578 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:99831 IMAGE:6598234), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103823 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:118870 IMAGE:40001224), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012843 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32179686:32198285:1 Gene:OTTHUMG00000004423 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012844 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32180065:32198285:1 Gene:OTTHUMG00000004423 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bui.3 // UCSC Genes // Homo sapiens taxilin alpha (TXLNA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001buj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens taxilin alpha (TXLNA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001160042 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018134 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000291358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32205661:32208687:1 gene:ENSG00000160051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32205671:32208682:1 gene:ENSG00000160051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299235 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60335 complete cds, highly similar to Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098260 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone MGC:120342 IMAGE:40024457), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000015731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32205661:32208687:1 Gene:OTTHUMG00000005739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bum.2 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vua.2 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ogz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032648 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 167, member B (FAM167B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004269 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 167, member B, mRNA (cDNA clone MGC:10820 IMAGE:3613742), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373582 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1880:351302:352234:- gene:ENSG00000183615 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019615 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32247233:32248856:1 Gene:OTTHUMG00000007462 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001buw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 167, member B (FAM167B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000421153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32351521:32353541:1 gene:ENSG00000162526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32351521:32353541:1 Gene:OTTHUMG00000007585 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052841 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific serine kinase 3 (TSSK3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32362197:32364312:1 gene:ENSG00000162526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035354 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:34807 IMAGE:5171736), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020049 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32362197:32364312:1 Gene:OTTHUMG00000007585 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bvf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis-specific serine kinase 3 (TSSK3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363721 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:32639951:32640052:1 gene:ENSG00000200591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408496 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:33391895:33392000:1 gene:ENSG00000221423 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000011865 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32987075:33032469:1 Gene:OTTHUMG00000004129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32987075:33032469:1 gene:ENSG00000236065 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036308 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4825059, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bwn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4825059, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:34112949:34113063:1 gene:ENSG00000201148 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001134734 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032884 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34166883:34219131:1 gene:ENSG00000142698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34177670:34219131:1 gene:ENSG00000142698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007637 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94, mRNA (cDNA clone MGC:15882 IMAGE:3529463), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064845 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94, mRNA (cDNA clone MGC:75454 IMAGE:30390219), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011463 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34166883:34219131:1 Gene:OTTHUMG00000004012 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036845 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34177670:34219131:1 Gene:OTTHUMG00000004012 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bxs.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bxt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002060 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543143 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:35259815:35260844:1 gene:ENSG00000187513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310985 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18027. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK313477 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94024. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027889 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa, mRNA (cDNA clone MGC:34596 IMAGE:5222521), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC072389 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa, mRNA (cDNA clone MGC:88029 IMAGE:5722834), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342280 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1305:435385:436269:- gene:ENSG00000187513 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011556 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34792998:34795747:1 Gene:OTTHUMG00000004050 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34792999:34795090:1 Gene:OTTHUMG00000004050 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bya.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vul.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vum.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021olb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516919 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:35409357:35409425:1 gene:ENSG00000252728 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364998 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:35195969:35196062:1 gene:ENSG00000201868 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364672 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:35310274:35310425:1 gene:ENSG00000201542 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178548 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon) (TFAP2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041175 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:49007 IMAGE:5786430), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373235 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:288168:292698:+ gene:ENSG00000116819 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35573370:35595328:1 Gene:OTTHUMG00000004388 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ohy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon) (TFAP2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017629 // RefSeq // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 4 (AGO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35808172:35857890:1 gene:ENSG00000134698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35841673:35851195:1 gene:ENSG00000134698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC152450 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2C, 4, mRNA (cDNA clone MGC:176703 IMAGE:8862582), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35808172:35857890:1 Gene:OTTHUMG00000004243 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091358 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35853488:35854758:1 Gene:OTTHUMG00000004243 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091359 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35841673:35851195:1 Gene:OTTHUMG00000004243 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 4 (AGO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012199 // RefSeq // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 1 (AGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35883209:35929610:1 gene:ENSG00000092847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35869808:35920958:1 gene:ENSG00000092847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK001622 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10760 fis, clone NT2RP3004618, highly similar to Eukaryotic translation initiation factor 2C 1. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063275 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2C, 1, mRNA (cDNA clone MGC:71487 IMAGE:30344513), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR936823 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M13167 (from clone DKFZp686M13167). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019336 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35869808:35920958:1 Gene:OTTHUMG00000007381 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019337 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35883209:35929610:1 Gene:OTTHUMG00000007381 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 1 (AGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 1 (AGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vuy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 1 (AGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017825 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2 (ADPRHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36088875:36093932:1 gene:ENSG00000116863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468594 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:36554511:36558779:1 gene:ENSG00000116863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540867 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:36554490:36559342:1 gene:ENSG00000116863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543954 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:36554493:36559208:1 gene:ENSG00000116863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014169 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:20733 IMAGE:4552006), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36088875:36093932:1 Gene:OTTHUMG00000007628 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2 (ADPRHL2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023451 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:36554511:36558779:1 Gene:OTTHUMG00000007628 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37203610:37203716:1 gene:ENSG00000207328 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459008 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:38215874:38215974:1 gene:ENSG00000238871 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37885023:37885117:1 gene:ENSG00000222282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391239 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37991462:37991569:1 gene:ENSG00000212541 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:38396659:38396765:1 gene:ENSG00000200796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:38926870:38926977:1 gene:ENSG00000199963 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136275 // RefSeq // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_024595 // RefSeq // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:38991288:39004854:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38991223:39006059:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38991288:39004761:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54126 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119745 // GenBank // Homo sapiens akirin 1, mRNA (cDNA clone MGC:149866 IMAGE:40119229), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:38991223:39006059:1 Gene:OTTHUMG00000007496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ccw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oip.2 // UCSC Genes // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oiq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372975 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:3475329:3479165:+ // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_181809 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8a (BMP8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39491646:39525935:1 gene:ENSG00000183682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131617 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8a, mRNA (cDNA clone MGC:149599 IMAGE:40116584), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023079 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:39491646:39525935:1 Gene:OTTHUMG00000008394 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8a (BMP8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021olx.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC072388 // GenBank // Homo sapiens 3-oxoacid CoA transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:87924 IMAGE:5588771), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000536963 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:40183700:40183828:1 gene:ENSG00000225333 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012421 // RefSeq // Homo sapiens rearranged L-myc fusion (RLF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40161373:40240921:1 gene:ENSG00000117000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487606 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:40656470:40668189:1 gene:ENSG00000117000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535839 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:40697159:40706592:1 gene:ENSG00000117000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB209099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for rearranged L-myc fusion sequence variant protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113666 // GenBank // Homo sapiens rearranged L-myc fusion, mRNA (cDNA clone MGC:142226 IMAGE:8322718), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000015767 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40161373:40240921:1 Gene:OTTHUMG00000005763 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000015768 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:40656470:40668189:1 Gene:OTTHUMG00000005763 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens rearranged L-myc fusion (RLF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens rearranged L-myc fusion (RLF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384777 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40177843:40177949:1 gene:ENSG00000207508 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001008740 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane and coiled-coil domains 2 (TMCO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40247901:40251691:1 gene:ENSG00000188800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40245947:40251683:1 gene:ENSG00000188800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108666 // GenBank // Homo sapiens transmembrane and coiled-coil domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:131705 IMAGE:5743890), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000015769 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40247901:40251691:1 Gene:OTTHUMG00000005764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000015770 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40245947:40251683:1 Gene:OTTHUMG00000005764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane and coiled-coil domains 2 (TMCO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198494 // RefSeq // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40477630:40496288:1 gene:ENSG00000187815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40477215:40496343:1 gene:ENSG00000187815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40489146:40491156:1 gene:ENSG00000187815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041873 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 642, mRNA (cDNA clone MGC:43732 IMAGE:5271835), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144174 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052694. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019082 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40477215:40496343:1 Gene:OTTHUMG00000007303 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019083 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40477630:40496288:1 Gene:OTTHUMG00000007303 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019084 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40489146:40491156:1 Gene:OTTHUMG00000007303 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vwb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ojk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029846 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30e (MIR30E), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40754351:40754463:1 gene:ENSG00000198974 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cgf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 30e (MIR30E), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cgf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001cgf.1 cpcScore=-1.4336000 cnci=-0.3089330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029833 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30c-1 (MIR30C1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40757284:40757372:1 gene:ENSG00000207962 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cgg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 30c-1 (MIR30C1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cgg.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001cgg.2 cpcScore=-1.4488600 cnci=-0.2814682 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037868 // RefSeq // Homo sapiens SLFNL1 antisense RNA 1 (SLFNL1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021omd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SLFNL1 antisense RNA 1 (SLFNL1-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007102 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin) (GUCA2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42153421:42155824:1 gene:ENSG00000044012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069301 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:97480 IMAGE:7262756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093779 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:120814 IMAGE:7939624), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093781 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:120816 IMAGE:7939626), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000018307 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42153421:42155824:1 Gene:OTTHUMG00000007024 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin) (GUCA2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173642 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal modification protein rimK-like family member A (RIMKLA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039737 // GenBank // Homo sapiens ribosomal modification protein rimK-like family member A, mRNA (cDNA clone MGC:47816 IMAGE:6021672), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431473 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1367:597633:614385:- gene:ENSG00000177181 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019174 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42380806:42422578:1 Gene:OTTHUMG00000007335 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019175 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42380795:42410165:1 Gene:OTTHUMG00000007335 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal modification protein rimK-like family member A (RIMKLA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363384 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:42569033:42569139:1 gene:ENSG00000200254 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000019785 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42678735:42681659:1 Gene:OTTHUMG00000007522 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42678735:42681659:1 gene:ENSG00000234917 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF086102 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YZ92E04. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001chr.2 cpcScore=-1.0738800 cnci=-0.2909232 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens full length insert cDNA clone YZ92E04. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384526 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:42991438:42991544:1 gene:ENSG00000207256 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362370 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:43196417:43196536:1 gene:ENSG00000199240 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005373 // RefSeq // Homo sapiens MPL proto-oncogene, thrombopoietin receptor (MPL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372468 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:43803475:43815208:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43337807:43352772:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43337849:43349537:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ234353 // GenBank // Homo sapiens myeloproliferative leukemia virus oncogene mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// M90103 // GenBank // Human (clones 18, 23, 27, 24) c-myeloproliferative leukemia virus type K (c-mpl-K) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019522 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:43337807:43352772:1 Gene:OTTHUMG00000007429 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019523 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:43337849:43349537:1 Gene:OTTHUMG00000007429 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001civ.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myeloproliferative leukemia virus oncogene (MPL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ciw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myeloproliferative leukemia virus oncogene (MPL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vwr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myeloproliferative leukemia virus oncogene (MPL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362515 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44390722:44390823:1 gene:ENSG00000199385 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_000024 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 46 (SNORD46), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000364043 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44776490:44776593:1 gene:ENSG00000200913 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cmk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 46 (SNORD46), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517230 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44932323:44932431:1 gene:ENSG00000253039 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024270 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1144 (LINC01144), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010olk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC400752 (LOC400752), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010olk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010olk.1 cpcScore=1.3149500 cnci=-0.1718927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032756 // RefSeq // Homo sapiens 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like (HPDL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45326905:45328533:1 gene:ENSG00000186603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007293 // GenBank // Homo sapiens 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:15668 IMAGE:3349473), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020527 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:45326905:45328533:1 Gene:OTTHUMG00000007681 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cne.3 // UCSC Genes // Homo sapiens 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like (HPDL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015506 // RefSeq // Homo sapiens methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria (MMACHC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45500053:45513382:1 gene:ENSG00000132763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477188 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:45509433:45510505:1 gene:ENSG00000132763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006122 // GenBank // Homo sapiens methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria, mRNA (cDNA clone MGC:13015 IMAGE:3535453), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020864 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:45500053:45513382:1 Gene:OTTHUMG00000007742 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020867 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:45509433:45510505:1 Gene:OTTHUMG00000007742 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020868 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:45974805:45975817:1 Gene:OTTHUMG00000007742 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vxv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria (MMACHC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020865 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:45500184:45513216:1 Gene:OTTHUMG00000007742 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013615 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich adaptor protein 1 (LURAP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46203334:46221261:1 gene:ENSG00000171357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034422 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 190, mRNA (cDNA clone MGC:34658 IMAGE:5163612), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020154 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46203334:46221261:1 Gene:OTTHUMG00000007605 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oma.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich adaptor protein 1 (LURAP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045483 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase pseudogene 1 (FAAHP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46436145:46445521:1 gene:ENSG00000232022 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ona.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase pseudogene (LOC729041), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_147192 // RefSeq // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_172225 // RefSeq // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46506997:46514226:1 gene:ENSG00000197587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371956 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2205:415023:420150:- gene:ENSG00000197587 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021895 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46506997:46514226:1 Gene:OTTHUMG00000007982 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cpw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cpx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038403 // RefSeq // Homo sapiens MKNK1 antisense RNA 1 (MKNK1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021onb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens MKNK1 antisense RNA 1 (MKNK1-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001145474 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 38 (TEX38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46671828:46673594:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:46671859:46673476:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144026 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:177563 IMAGE:9052546), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144027 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:177564 IMAGE:9052547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021929 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46671828:46673594:1 Gene:OTTHUMG00000007991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021930 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46671859:46673476:1 Gene:OTTHUMG00000007991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 38 (TEX38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010omi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens testis expressed 38 (TEX38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038827 // RefSeq // Homo sapiens EFCAB14 antisense RNA 1 (EFCAB14-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038828 // RefSeq // Homo sapiens EFCAB14 antisense RNA 1 (EFCAB14-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46674128:46692097:1 gene:ENSG00000228237 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46674036:46692098:1 gene:ENSG00000228237 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021936 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46674036:46692098:1 Gene:OTTHUMG00000007993 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021937 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46674128:46692097:1 Gene:OTTHUMG00000007993 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ond.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EFCAB14 antisense RNA 1 (EFCAB14-AS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021one.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EFCAB14 antisense RNA 1 (EFCAB14-AS1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178033 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1 (CYP4X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47023568:47050751:1 gene:ENSG00000186377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47036108:47039723:1 gene:ENSG00000186377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538609 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:47427036:47516422:1 gene:ENSG00000186377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK131355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16384 fis, clone TLIVE2007607, weakly similar to CYTOCHROME P450 4A4 (EC 1.14.14.1). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028102 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:40051 IMAGE:5243005), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022017 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47023568:47050751:1 Gene:OTTHUMG00000008017 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022018 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47036108:47039723:1 Gene:OTTHUMG00000008017 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1 (CYP4X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1 (CYP4X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1 (CYP4X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178134 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 1 (CYP4Z1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47067488:47118319:1 gene:ENSG00000186160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47115439:47118064:1 gene:ENSG00000186160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022020 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47067488:47118319:1 Gene:OTTHUMG00000008019 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47115439:47118064:1 Gene:OTTHUMG00000008019 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 1 (CYP4Z1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012186 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box E3 (FOXE3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47416072:47418052:1 gene:ENSG00000186790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021836 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47416072:47418052:1 Gene:OTTHUMG00000007954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001crk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens forkhead box E3 (FOXE3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004474 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box D2 (FOXD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47436017:47440691:1 gene:ENSG00000186564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021831 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47436017:47440691:1 Gene:OTTHUMG00000007950 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001crm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens forkhead box D2 (FOXD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408419 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:47502504:47502639:1 gene:ENSG00000221346 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383973 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:48344209:48344315:1 gene:ENSG00000206700 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411243 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:48447936:48448042:1 gene:ENSG00000223175 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458796 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:49617064:49617175:1 gene:ENSG00000239144 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408819 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:49982215:49982295:1 gene:ENSG00000221746 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000448346 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:50459990:50461874:1 gene:ENSG00000227839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000414530 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:50791942:50792682:1 gene:ENSG00000234080 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517016 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:51215968:51216025:1 gene:ENSG00000252825 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363392 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:51107222:51107331:1 gene:ENSG00000200262 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459498 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:51188463:51188551:1 gene:ENSG00000239101 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408565 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:16897425:16897489:1 gene:ENSG00000221492 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:51382308:51382414:1 gene:ENSG00000206595 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390872 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:52331305:52331381:1 gene:ENSG00000212174 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:51973410:51973535:1 gene:ENSG00000200839 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC057844 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:71846 IMAGE:5313492, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032864 // RefSeq // Homo sapiens pre-mRNA processing factor 38A (PRPF38A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000257181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52404564:52420839:1 gene:ENSG00000134748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52404628:52417022:1 gene:ENSG00000134748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000777 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510134), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105004 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, mRNA (cDNA clone MGC:132664 IMAGE:8144007), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022459 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52404564:52420839:1 Gene:OTTHUMG00000008199 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022460 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52404628:52417022:1 Gene:OTTHUMG00000008199 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022461 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52404620:52409074:1 Gene:OTTHUMG00000008199 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ctv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A (PRPF38A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ctw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A (PRPF38A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458879 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:52877114:52877194:1 gene:ENSG00000239063 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042693 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A (FAM159A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52633394:52669683:1 gene:ENSG00000182183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000517870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52633344:52657065:1 gene:ENSG00000182183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK128236 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46370 fis, clone TESTI4051858. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041608 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5484285). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022931 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52633394:52669683:1 Gene:OTTHUMG00000008330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022932 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52633344:52669121:1 Gene:OTTHUMG00000008330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022933 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52633593:52667688:1 Gene:OTTHUMG00000008330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022934 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52633344:52657065:1 Gene:OTTHUMG00000008330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cuf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A (FAM159A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cug.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A (FAM159A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cuh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A (FAM159A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024646 // RefSeq // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443756 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:53192126:53287401:1 gene:ENSG00000162378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:52726467:52816638:1 gene:ENSG00000162378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK023518 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13456 fis, clone PLACE1003258, weakly similar to EARLY EMBRYOGENESIS ZYG-11 PROTEIN. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61304 complete cds, highly similar to Homo sapiens zyg-11 homolog B-like (ZYG11BL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ646393 // GenBank // Homo sapiens ZYG11B (ZYG11B) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294353 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold75:3017344:3061731:+ gene:ENSG00000162378 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52726509:52827342:1 Gene:OTTHUMG00000008938 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cuj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vzg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vzh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010onj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:52754322:52754462:1 gene:ENSG00000252018 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004339 // RefSeq // Homo sapiens zyg-11 family member A, cell cycle regulator (ZYG11A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52842511:52894998:1 gene:ENSG00000203995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY271826 // GenBank // Homo sapiens ZYG-11A early embryogenesis protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371528 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold75:3079364:3146337:+ gene:ENSG00000203995 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024710 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52881216:52881730:-1 Gene:OTTHUMG00000008926 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52842736:52894998:1 Gene:OTTHUMG00000008923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000157345 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52842511:52894998:1 Gene:OTTHUMG00000008923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cuk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member A, cell cycle regulator (ZYG11A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cul.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zyg-11 family member A, cell cycle regulator (ZYG11A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52881216:52881730:-1 gene:ENSG00000242391 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000024709 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53114576:53118609:1 Gene:OTTHUMG00000008925 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53114576:53118609:1 gene:ENSG00000235563 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AX748428 // NONCODE // accn=AX748428 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=318 cpcScore=-0.7435180 cnci=-0.2083030 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cva.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36729 fis, clone UTERU2012581. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000098 // RefSeq // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2 (CPT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53196429:53214197:1 gene:ENSG00000157184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53196859:53202736:1 gene:ENSG00000157184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002445 // GenBank // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:1771 IMAGE:3346025), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024757 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53196429:53214197:1 Gene:OTTHUMG00000008942 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024758 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53196859:53202736:1 Gene:OTTHUMG00000008942 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cvb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2 (CPT2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033067 // RefSeq // Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (DMRTB1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431335 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:53925483:53933052:1 gene:ENSG00000143006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53459976:53464679:1 gene:ENSG00000143006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029566 // GenBank // Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1, mRNA (cDNA clone MGC:39572 IMAGE:4836894), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371445 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold816:615809:622659:+ gene:ENSG00000143006 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022110 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53459399:53467488:1 Gene:OTTHUMG00000008080 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022111 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53459976:53464679:1 Gene:OTTHUMG00000008080 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cvq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (DMRTB1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54104295:54106082:1 gene:ENSG00000212670 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516837 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:54991059:54991126:1 gene:ENSG00000252646 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001110533 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152607 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54806063:54842252:1 gene:ENSG00000162398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54806102:54842252:1 gene:ENSG00000162398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039109 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone MGC:42925 IMAGE:4837126), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064142 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone MGC:75422 IMAGE:30390069), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027673 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54806063:54842252:1 Gene:OTTHUMG00000009986 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027674 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54806102:54842252:1 Gene:OTTHUMG00000009986 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cya.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_057176 // RefSeq // Homo sapiens barttin CLCNK-type chloride channel accessory beta subunit (BSND), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54998933:55010883:1 gene:ENSG00000162399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103898 // GenBank // Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:119283 IMAGE:40005137), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54998933:55010883:1 Gene:OTTHUMG00000008112 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cye.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin) (BSND), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516353 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:55398514:55398620:1 gene:ENSG00000252162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006252 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit (PRKAA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56645322:56715335:1 gene:ENSG00000162409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069680 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:97288 IMAGE:7262537), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022753 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56645322:56715335:1 Gene:OTTHUMG00000008282 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyk.4 // UCSC Genes // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit (PRKAA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000562 // RefSeq // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide (C8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56854806:56918221:1 gene:ENSG00000157131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132911 // GenBank // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:164542 IMAGE:40146933), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132913 // GenBank // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:164544 IMAGE:40146935), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022890 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56854806:56918221:1 Gene:OTTHUMG00000008306 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide (C8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408664 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:56966280:56966362:1 gene:ENSG00000221591 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459042 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:57757084:57757176:1 gene:ENSG00000238773 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000457412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:57862455:57880905:1 gene:ENSG00000226759 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410236 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:59187951:59188044:1 gene:ENSG00000222168 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034014 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1135 (LINC01135), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034015 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1135 (LINC01135), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:58785160:58899594:1 gene:ENSG00000234807 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001czf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100131060 (LOC100131060), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oop.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100131060 (LOC100131060), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023043 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:58785160:58900996:1 Gene:OTTHUMG00000008377 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363705 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:61816419:61816522:1 gene:ENSG00000200575 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:61852499:61852602:1 gene:ENSG00000212360 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164835 // RefSeq // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_019079 // RefSeq // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62194831:62212328:1 gene:ENSG00000240563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111559 // GenBank // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:133253 IMAGE:40035707), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:62194831:62212328:1 Gene:OTTHUMG00000008914 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dae.4 // UCSC Genes // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ooc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000363304 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:62211557:62211666:1 gene:ENSG00000200174 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001017415 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001017416 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003368 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62436655:62451804:1 gene:ENSG00000162607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050525 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:57511 IMAGE:6473568), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371146 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2918:1054545:1063270:- gene:ENSG00000162607 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024881 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:62436655:62451804:1 Gene:OTTHUMG00000008972 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025014 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:62436297:62443320:1 Gene:OTTHUMG00000008972 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025015 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:62436298:62441580:1 Gene:OTTHUMG00000008972 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001daj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dak.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dal.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 1 (USP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012183 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box D3 (FOXD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:63323041:63325126:1 gene:ENSG00000187140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025331 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:63323041:63325126:1 Gene:OTTHUMG00000009141 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dax.2 // UCSC Genes // Homo sapiens forkhead box D3 (FOXD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516975 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:63338263:63338372:1 gene:ENSG00000252784 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002771 // RefSeq // Homo sapiens deleted in lymphocytic leukemia 2-like (DLEU2L), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340052 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:63548977:63549112:-1 gene:ENSG00000276884 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000116652 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63547082:63550636:1 gene:ENSG00000116652 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024916 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:63547082:63550636:1 Gene:OTTHUMG00000008984 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024917 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:64014638:64015405:1 Gene:OTTHUMG00000008984 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens deleted in lymphocytic leukemia 2-like (DLEU2L), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152489 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (UBE2U), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:64203807:64244344:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:64203627:64260694:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64215453:64244340:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029895 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mRNA (cDNA clone MGC:35130 IMAGE:5168406), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025005 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:64203807:64244344:1 Gene:OTTHUMG00000009023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025006 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:64203627:64260694:1 Gene:OTTHUMG00000009023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025007 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:64215453:64244340:1 Gene:OTTHUMG00000009023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (UBE2U), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018211 // RefSeq // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (RAVER2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64745095:64833232:1 gene:ENSG00000162437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430964 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:65243747:65296743:1 gene:ENSG00000162437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK299228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57423 complete cds, highly similar to Ribonucleoprotein PTB-binding 2. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065303 // GenBank // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6156321), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294428 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold481:1800679:1909805:- gene:ENSG00000162437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025240 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:64745095:64833232:1 Gene:OTTHUMG00000009102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025241 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:64778066:64816509:1 Gene:OTTHUMG00000009102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (RAVER2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (RAVER2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010opb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (RAVER2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459362 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:66037232:66037335:1 gene:ENSG00000238931 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67417214:67417318:1 gene:ENSG00000223263 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384773 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67541127:67541233:1 gene:ENSG00000207504 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023916 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 (PIN1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:69919322:69920317:1 gene:ENSG00000229359 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wbh.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000441830 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:70147121:70151945:1 gene:ENSG00000033122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025917 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:70147121:70151945:1 Gene:OTTHUMG00000059194 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038420 // RefSeq // Homo sapiens ZRANB2 antisense RNA 1 (ZRANB2-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:71058323:71066958:1 gene:ENSG00000235079 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:71048855:71067184:1 gene:ENSG00000235079 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:71048855:71067184:1 Gene:OTTHUMG00000009659 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026635 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:71058323:71066958:1 Gene:OTTHUMG00000009659 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dfr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ZRANB2 antisense RNA 1 (ZRANB2-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026418 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:73635216:73709581:1 Gene:OTTHUMG00000009567 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:73635216:73709581:1 gene:ENSG00000223479 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:73709368:73715214:1 gene:ENSG00000223479 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026419 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026419 cpcScore=-1.1271100 cnci=-0.2378002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516196 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:73883714:73883822:1 gene:ENSG00000252005 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001933 // RefSeq // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001256114 // RefSeq // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75128434:75161533:1 gene:ENSG00000162624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75134882:75161533:1 gene:ENSG00000162624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036423 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4797854, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040321 // GenBank // Homo sapiens LIM homeobox 8, mRNA (cDNA clone MGC:43046 IMAGE:4839343), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:75128434:75161533:1 Gene:OTTHUMG00000009692 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026701 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:75134882:75161533:1 Gene:OTTHUMG00000009692 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dgo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dgq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oou.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75183045:75183147:1 gene:ENSG00000206999 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002440 // RefSeq // Homo sapiens mutS homolog 4 (MSH4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75796882:75913238:1 gene:ENSG00000057468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033030 // GenBank // Homo sapiens mutS homolog 4 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:33143 IMAGE:5266997), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026983 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:75796882:75913238:1 Gene:OTTHUMG00000009788 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dhd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens mutS homolog 4 (E. coli) (MSH4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:76753135:76753240:1 gene:ENSG00000199921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:77420325:77420386:1 gene:ENSG00000251767 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515976 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:77614869:77614952:1 gene:ENSG00000251785 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027310 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized MGC27382 (MGC27382), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:78229599:78293890:1 gene:ENSG00000237413 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098556 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:78229599:78293890:1 Gene:OTTHUMG00000041107 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:78229622:78369464:1 Gene:OTTHUMG00000041107 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized MGC27382 (MGC27382), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dil.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized MGC27382 (MGC27382), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009wcc.2 cpcScore=-0.9131450 cnci=-0.2658211 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390749 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:149737309:149737400:-1 gene:ENSG00000263825 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000446227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:83446053:83454771:1 gene:ENSG00000231364 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026942 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:83446053:83454771:1 Gene:OTTHUMG00000009772 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC043544 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5171093, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001diy.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001diy.2 cpcScore=-1.2530000 cnci=-0.3665271 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001diy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5171093, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411299 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:84259560:84259653:1 gene:ENSG00000223231 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ooy.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ooz.1 // UCSC Genes // A nucleics Acid regulating cell growth. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021233 // RefSeq // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_058248 // RefSeq // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84408230:84415008:1 gene:ENSG00000137976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84398532:84415018:1 gene:ENSG00000137976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065182 // GenBank // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4858894). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126136 // GenBank // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta, mRNA (cDNA clone MGC:161414 IMAGE:8991852), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027248 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84398532:84415018:1 Gene:OTTHUMG00000009860 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027249 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84408230:84415008:1 Gene:OTTHUMG00000009860 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001djt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dju.1 // UCSC Genes // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wch.1 // UCSC Genes // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_025065 // RefSeq // Homo sapiens ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (RPF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84479259:84483330:1 gene:ENSG00000117133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016051 // GenBank // Homo sapiens brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:22954 IMAGE:4853072), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370654 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1432:462889:479072:- gene:ENSG00000117133 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027238 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84479267:84497790:1 Gene:OTTHUMG00000009857 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027239 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84479259:84483330:1 Gene:OTTHUMG00000009857 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001djv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (RPF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411322 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85264296:85264402:1 gene:ENSG00000223254 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363064 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85592280:85592356:1 gene:ENSG00000199934 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006536 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 2 (CLCA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86424086:86456558:1 gene:ENSG00000137975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439777 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:86889769:86894218:1 gene:ENSG00000137975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86448134:86453602:1 gene:ENSG00000137975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041096 // GenBank // Homo sapiens chloride channel accessory 2, mRNA (cDNA clone MGC:46036 IMAGE:5752653), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028284 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:86424086:86456558:1 Gene:OTTHUMG00000010256 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028285 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:86440280:86445519:1 Gene:OTTHUMG00000010256 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028286 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:86448134:86453602:1 Gene:OTTHUMG00000010256 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dlr.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride channel accessory 2 (CLCA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001285 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000234701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86468368:86500259:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:86468843:86500289:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495894 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:86934611:86965771:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539889 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:86934611:86965771:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK097057 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39738 fis, clone SMINT2016412, highly similar to Homo sapiens chloride channel, calcium activated, family member 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028277 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:86468368:86500259:1 Gene:OTTHUMG00000010254 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dls.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride channel accessory 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dlt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride channel accessory 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028278 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:86468928:86500088:1 Gene:OTTHUMG00000010254 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408775 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:86606273:86606361:-1 gene:ENSG00000221702 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024604 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 3, pseudogene (CLCA3P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86634276:86655376:1 gene:ENSG00000153923 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010osh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chloride channel accessory 3, pseudogene (CLCA3P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010osh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010osh.1 cpcScore=11.7999000 cnci=-0.2871314 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408295 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:87151298:87151445:1 gene:ENSG00000221222 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384505 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:88816779:88816885:1 gene:ENSG00000207234 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003133 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein 1, interferon-inducible pseudogene 1 (GBP1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000513638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89407679:89424934:1 gene:ENSG00000225492 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate binding protein 1, interferon-inducible pseudogene 1 (GBP1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032270 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C (LRRC8C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89633072:89719533:1 gene:ENSG00000171488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89633072:89764518:1 gene:ENSG00000171488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113973 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:138551 IMAGE:40007964), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89633072:89719533:1 Gene:OTTHUMG00000010305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029206 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89763545:89769903:1 Gene:OTTHUMG00000010305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097360 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89633181:89708648:1 Gene:OTTHUMG00000010305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097361 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89633072:89764518:1 Gene:OTTHUMG00000010305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dnl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C (LRRC8C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001134479 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D (LRRC8D), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018103 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D (LRRC8D), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000337338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89821032:89936611:1 gene:ENSG00000171492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024159 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:16497 IMAGE:3958069), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394593 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2946:1344987:1347563:- gene:ENSG00000171492 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029203 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89821032:89936611:1 Gene:OTTHUMG00000010583 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029204 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89821921:89936001:1 Gene:OTTHUMG00000010583 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89843048:89933418:1 Gene:OTTHUMG00000010583 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dnm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D (LRRC8D), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dnn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D (LRRC8D), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021opq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member D (LRRC8D), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362796 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:90657750:90657964:1 gene:ENSG00000199666 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384090 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:91261625:91261724:1 gene:ENSG00000206817 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_183242 // RefSeq // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8 (BTBD8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92080305:92139946:1 gene:ENSG00000189195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540648 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:92546095:92613310:1 gene:ENSG00000189195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296516 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60117 complete cds, highly similar to BTB/POZ domain-containing protein 8. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013922 // GenBank // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:24000 IMAGE:4048340), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342818 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold644:569271:633194:- gene:ENSG00000189195 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028371 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:92080305:92139946:1 Gene:OTTHUMG00000010289 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028372 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:92080336:92147836:1 Gene:OTTHUMG00000010289 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001doo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8 (BTBD8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010otc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8 (BTBD8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024813 // RefSeq // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2 (RPAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000394482 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:92764605:92829329:1 gene:ENSG00000122484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92299085:92324084:1 gene:ENSG00000122484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031070 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:33693 IMAGE:5313284), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039014 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:47579 IMAGE:5744281), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028368 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:92298965:92402056:1 Gene:OTTHUMG00000010288 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028369 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:92299085:92324084:1 Gene:OTTHUMG00000010288 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028370 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:92333242:92387233:1 Gene:OTTHUMG00000010288 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dot.2 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2 (RPAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wdh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2 (RPAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370343 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold644:350926:433600:- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515986 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:93303575:93303627:1 gene:ENSG00000251795 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021opt.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00155 hit found at contig region AL162740.13/6246-6298 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384295 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:92846059:92846182:1 gene:ENSG00000207022 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516943 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:93010257:93010351:1 gene:ENSG00000252752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384649 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:93385711:93385817:1 gene:ENSG00000207379 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oqb.1 // UCSC Genes // transfer RNA Arg (anticodon TCT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001dqe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ33492 fis, clone BRAMY2003681. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458933 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:94616974:94617077:1 gene:ENSG00000238389 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033966 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC440594 (FLJ31662), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:95474737:95479356:1 gene:ENSG00000233907 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030074 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:95474737:95479356:1 Gene:OTTHUMG00000010909 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC440594 (FLJ31662), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408871 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:95886540:95886626:1 gene:ENSG00000221798 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363930 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:96225901:96226060:1 gene:ENSG00000200800 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390750 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:96902699:96902792:1 gene:ENSG00000212039 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408850 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:98373385:98373499:1 gene:ENSG00000221777 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001166252 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 4 (LPPR4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_014839 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 4 (LPPR4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263178 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:99729848:99772111:1 gene:ENSG00000117600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:99298864:99309590:1 gene:ENSG00000117600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:99264292:99309580:1 gene:ENSG00000117600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370185 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold904:87802:138802:- gene:ENSG00000117600 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029670 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:99263953:99309590:1 Gene:OTTHUMG00000010763 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:99298864:99309590:1 Gene:OTTHUMG00000010763 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dse.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 4 (LPPR4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oue.2 // UCSC Genes // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 4 (LPPR4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017734 // RefSeq // Homo sapiens palmdelphin (PALMD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037516 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 548aa-1 (MIR548AA1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:99645943:99694541:1 gene:ENSG00000099260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:99683266:99694541:1 gene:ENSG00000099260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012570 // GenBank // Homo sapiens palmdelphin, mRNA (cDNA clone MGC:13440 IMAGE:4245261), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029672 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:99645943:99694541:1 Gene:OTTHUMG00000010764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029673 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:99683266:99694541:1 Gene:OTTHUMG00000010764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dsg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens palmdelphin (PALMD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 548aa-1 (MIR548AA1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365384 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:99791662:99791753:1 gene:ENSG00000202254 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516417 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:99829465:99829537:1 gene:ENSG00000252226 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390946 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:99978939:99979045:1 gene:ENSG00000212248 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001144884 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_133496 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:100896076:100981753:1 gene:ENSG00000162695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064692 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:71576 IMAGE:30330665), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357650 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold229:1725893:1818640:- gene:ENSG00000162695 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032711 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100896076:100981753:1 Gene:OTTHUMG00000011815 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032712 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100896254:100974998:1 Gene:OTTHUMG00000011815 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032713 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100961828:100972658:1 Gene:OTTHUMG00000011815 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dtn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dto.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516956 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:101133153:101133339:1 gene:ENSG00000252765 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516908 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:101859851:101859957:1 gene:ENSG00000252717 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033424 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 pseudogene 5 (DNAJA1P5), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 pseudogene 5 (DNAJA1P5), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000099059 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099059 cpcScore=-1.0128700 cnci=-0.2906632 gene:OTTHUMG00000041346 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424955 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:103817769:103828355:1 gene:ENSG00000232753 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000699 // RefSeq // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic) (AMY2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103617377:103625780:1 gene:ENSG00000243480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103621562:103625605:1 gene:ENSG00000243480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007060 // GenBank // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic), mRNA (cDNA clone MGC:12504 IMAGE:3949799), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146997 // GenBank // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic), mRNA (cDNA clone MGC:182100 IMAGE:9056925), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030315 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:103617377:103625780:1 Gene:OTTHUMG00000011023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030316 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:103617446:103620668:1 Gene:OTTHUMG00000011023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:103621562:103625605:1 Gene:OTTHUMG00000011023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dut.3 // UCSC Genes // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic) (AMY2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ouq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic) (AMY2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000699 // RefSeq // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic) (AMY2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010our.1 // UCSC Genes // Homo sapiens amylase, alpha 2A (pancreatic) (AMY2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033990 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 pseudogene (LOC100129138), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:104073023:104077087:1 gene:ENSG00000215869 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:104073023:104077087:1 Gene:OTTHUMG00000011047 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 pseudogene (LOC100129138), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018137 // RefSeq // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6 (PRMT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361318 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:107599267:107601905:1 gene:ENSG00000198890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540389 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:107599326:107601290:1 gene:ENSG00000198890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002729 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:3421 IMAGE:3629812), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC063446 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:74997 IMAGE:5501091), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC073866 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:90294 IMAGE:5212478), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370078 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2393:848293:849402:- gene:ENSG00000198890 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030185 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:107056679:107059294:1 Gene:OTTHUMG00000010964 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ous.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6 (PRMT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010883 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B (FAM102B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000405454 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:108560089:108644900:1 gene:ENSG00000162636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437902 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:109102971:109173747:1 gene:ENSG00000162636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127898 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:158036 IMAGE:40132918), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140863 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:176540 IMAGE:9021731), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370035 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold21:666684:736690:+ gene:ENSG00000162636 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030188 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108560089:108639327:1 Gene:OTTHUMG00000010967 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000323367 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108624665:108639322:1 Gene:OTTHUMG00000010967 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000323368 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108560089:108644900:1 Gene:OTTHUMG00000010967 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ouy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B (FAM102B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001144937 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7 (FNDC7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108712657:108742740:1 gene:ENSG00000143107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130421 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:163293 IMAGE:40146452), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144218 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052738, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271311 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold21:807359:836074:+ gene:ENSG00000143107 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030589 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108712657:108742740:1 Gene:OTTHUMG00000011120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346718 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108722411:108742056:1 Gene:OTTHUMG00000011120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dvx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7 (FNDC7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ova.2 // UCSC Genes // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7 (FNDC7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034168 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 42 (non-protein coding) (SPATA42), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108857217:108858524:1 gene:ENSG00000203897 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:108857244:108858340:1 gene:ENSG00000203897 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032403 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108857217:108858524:1 Gene:OTTHUMG00000011731 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032404 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108857244:108858340:1 Gene:OTTHUMG00000011731 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dwc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spermatogenesis associated 42 (non-protein coding) (SPATA42), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dwc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dwc.2 cpcScore=-1.0786300 cnci=-0.2897045 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003023 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 2 (SCARNA2), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458748 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:109100193:109100612:1 gene:ENSG00000278249 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000270066 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dwo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 2 (SCARNA2), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000513461 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000513461 cpcScore=0.0607274 cnci=-0.3277679 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031936 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 61 (GPR61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000286603 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:110082494:110088455:1 gene:ENSG00000156097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000526744 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:109545311:109547259:1 gene:ENSG00000156097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000527748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109539872:109547260:1 gene:ENSG00000156097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067464 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 61, mRNA (cDNA clone MGC:79297 IMAGE:6971762), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032149 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109539921:109548406:1 Gene:OTTHUMG00000011633 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dxy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 61 (GPR61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109539887:109545833:1 Gene:OTTHUMG00000011633 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021orh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 61 (GPR61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006496 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3 (GNAI3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109548611:109618321:1 gene:ENSG00000065135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025285 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:39207 IMAGE:5433334), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032222 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109548611:109618321:1 Gene:OTTHUMG00000189112 gene:OTTHUMG00000011648 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dxz.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000032199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109596225:109597781:1 Gene:OTTHUMG00000011648 gene:OTTHUMG00000011643 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436416 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:109596225:109597781:1 gene:ENSG00000225113 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000554749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110058340:110062555:1 gene:ENSG00000258634 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ574855 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42967, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021orl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ43956 fis, clone TESTI4015681. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000554808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110082688:110109719:1 gene:ENSG00000258673 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203412 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-like 4B (UBL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110112468:110113945:1 gene:ENSG00000186150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC058929 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:65142 IMAGE:5741847), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-like 4B (UBL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010898 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 17 (SLC6A17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110150486:110202202:1 gene:ENSG00000197106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450985 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:110693132:110744821:1 gene:ENSG00000197106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110192568:110194988:1 gene:ENSG00000197106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140908 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:176585 IMAGE:9056720), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032550 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110150486:110202202:1 Gene:OTTHUMG00000011761 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032551 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110192568:110194988:1 Gene:OTTHUMG00000011761 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wfq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6, member 17 (SLC6A17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dze.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 6, member 17 (SLC6A17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001201545 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 15 (RBM15), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_022768 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 15 (RBM15), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110338506:110346677:1 gene:ENSG00000162775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110339323:110346677:1 gene:ENSG00000162775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK025596 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21943 fis, clone HEP04547. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098140 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:119583 IMAGE:40008573), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000031114 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110338506:110346677:1 Gene:OTTHUMG00000011284 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035930 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110339323:110346677:1 Gene:OTTHUMG00000011284 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein 15 (RBM15), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein 15 (RBM15), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021orn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA binding motif protein 15 (RBM15), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032414 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 1 (PROK1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110451200:110457354:1 gene:ENSG00000143125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025399 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 1, mRNA (cDNA clone MGC:27084 IMAGE:4826496), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000031969 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110451200:110457354:1 Gene:OTTHUMG00000011569 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059078 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:110999127:110999976:1 Gene:OTTHUMG00000011569 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens prokineticin 1 (PROK1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110456505:110457354:-1 gene:ENSG00000270380 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003599 // RefSeq // Homo sapiens chymosin pseudogene (CYMP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110488529:110491270:1 gene:ENSG00000240194 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310315 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17357. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035934 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110488529:110491270:1 Gene:OTTHUMG00000022784 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wft.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chymosin pseudogene (CYMP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wfu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chymosin pseudogene (CYMP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003928 // RefSeq // Homo sapiens chitinase, acidic pseudogene 2 (CHIAP2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111280059:111286108:1 gene:ENSG00000203878 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033667 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111280059:111286108:1 Gene:OTTHUMG00000012173 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033668 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111280060:111284238:1 Gene:OTTHUMG00000012173 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034452 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111283349:111286116:1 Gene:OTTHUMG00000012173 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wgb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chitinase, acidic pseudogene 2 (CHIAP2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wgb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009wgb.2 cpcScore=5.4355500 cnci=-0.2849650 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363020 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:111446798:111446908:1 gene:ENSG00000199890 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038951 // RefSeq // Homo sapiens FAM212B antisense RNA 1 (FAM212B-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038952 // RefSeq // Homo sapiens FAM212B antisense RNA 1 (FAM212B-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111739841:111747798:1 gene:ENSG00000227811 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033061 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111739841:111747798:1 Gene:OTTHUMG00000011954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ebq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506343 (LOC100506343), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ort.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506343 (LOC100506343), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459606 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:112738124:112738228:1 gene:ENSG00000239111 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000502356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112414717:112416287:1 gene:ENSG00000143079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030689 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:112957339:112958909:-1 Gene:OTTHUMG00000011155 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006135 // RefSeq // Homo sapiens capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1 (CAPZA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:112619173:112671619:1 gene:ENSG00000116489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112619819:112670383:1 gene:ENSG00000116489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000144 // GenBank // Homo sapiens capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:5240 IMAGE:3047937), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112619173:112671619:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032875 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112619805:112650013:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032876 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112619819:112670383:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032877 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112619832:112667085:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032878 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112659329:112670170:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032879 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:112666920:112669594:1 Gene:OTTHUMG00000011769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ecj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1 (CAPZA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459345 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:113195210:113195310:1 gene:ENSG00000238975 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002796 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A2 pseudogene 1 (AKR7A2P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eda.1 // UCSC Genes // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A2 pseudogene 1 (AKR7A2P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022836 // RefSeq // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (DCLRE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113905409:113914086:1 gene:ENSG00000118655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF306691 // GenBank // Homo sapiens clone P60-1a mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029687 // GenBank // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (PSO2 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29835 IMAGE:5001181), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR936679 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C24187 (from clone DKFZp686C24187). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369563 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2895:18232:24183:+ gene:ENSG00000118655 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033020 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:113905141:113914086:1 Gene:OTTHUMG00000011937 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:113905409:113914086:1 Gene:OTTHUMG00000011937 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eeg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (DCLRE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eeh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (DCLRE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eei.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (DCLRE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364244 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:114490724:114490832:1 gene:ENSG00000201114 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365030 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:114727720:114727824:1 gene:ENSG00000201900 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000549 // RefSeq // Homo sapiens thyroid stimulating hormone, beta (TSHB), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:115029824:115034309:1 gene:ENSG00000134200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115033363:115034284:1 gene:ENSG00000134200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069298 // GenBank // Homo sapiens thyroid stimulating hormone, beta, mRNA (cDNA clone MGC:97444 IMAGE:7262720), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032833 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:115033363:115034284:1 Gene:OTTHUMG00000011881 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001efs.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018420 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115976614:116031890:1 gene:ENSG00000163393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115976498:116070054:1 gene:ENSG00000163393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:116032677:116037527:1 gene:ENSG00000163393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY358258 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175711 trans-like protein (UNQ9429) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026358 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:26945 IMAGE:4814675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033220 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:115976498:116070054:1 Gene:OTTHUMG00000012008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033221 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116032677:116037527:1 Gene:OTTHUMG00000012008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097502 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:115976614:116031890:1 Gene:OTTHUMG00000012008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ega.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001egb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000369482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116694112:116706603:1 gene:ENSG00000203864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059045 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116694112:116706603:1 Gene:OTTHUMG00000022754 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001767 // RefSeq // Homo sapiens CD2 molecule (CD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:116754467:116755021:1 gene:ENSG00000116824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK301154 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59767 complete cds, highly similar to T-cell surface antigen CD2 precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51428 complete cds, highly similar to T-cell surface antigen CD2 precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033583 // GenBank // Homo sapiens CD2 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:34621 IMAGE:5227138), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369478 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold683:3690497:3704371:- gene:ENSG00000116824 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059039 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116754385:116769228:1 Gene:OTTHUMG00000022750 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059112 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116754467:116755021:1 Gene:OTTHUMG00000022750 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001egu.4 // UCSC Genes // Homo sapiens CD2 molecule (CD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010owz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD2 molecule (CD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oxa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD2 molecule (CD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408498 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:116905150:116905294:1 gene:ENSG00000221425 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020440 // RefSeq // Homo sapiens prostaglandin F2 receptor inhibitor (PTGFRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000393203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116910057:116990358:1 gene:ENSG00000134247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:116967060:116974497:1 gene:ENSG00000134247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544471 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:117452739:117532972:1 gene:ENSG00000134247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC152454 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin F2 receptor negative regulator, mRNA (cDNA clone MGC:176708 IMAGE:8862587), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033271 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116910057:116990358:1 Gene:OTTHUMG00000012028 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033272 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116967060:116974497:1 Gene:OTTHUMG00000012028 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033273 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:116987040:116990350:1 Gene:OTTHUMG00000012028 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001egv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens prostaglandin F2 receptor inhibitor (PTGFRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017709 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C (FAM46C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036516 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:33007 IMAGE:5267660), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131726 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:150652 IMAGE:40123993), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369448 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold683:2792802:2793976:- gene:ENSG00000183508 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038424 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:117605934:117628372:1 Gene:OTTHUMG00000013703 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ehe.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C (FAM46C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021osq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C (FAM46C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000504345 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000504345 cpcScore=-1.1624800 cnci=-0.4106321 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500821 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500821 cpcScore=-0.4623850 cnci=-0.3664997 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006784 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000349139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117929768:117966542:1 gene:ENSG00000065183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:117929720:117941788:1 gene:ENSG00000065183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:117929775:117938529:1 gene:ENSG00000065183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC058836 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6745281), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC148244 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40123299. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033720 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:117929768:117966542:1 Gene:OTTHUMG00000012197 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033721 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:117929724:117938558:1 Gene:OTTHUMG00000012197 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033722 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:117929775:117938529:1 Gene:OTTHUMG00000012197 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ehh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oxe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ehi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459311 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:119801664:119801764:1 gene:ENSG00000238679 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000862 // RefSeq // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 (HSD3B1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235547 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:120049826:120057681:1 gene:ENSG00000203857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:119507203:119515054:1 gene:ENSG00000203857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000528909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119507318:119514800:1 gene:ENSG00000203857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031999 // GenBank // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:21365 IMAGE:4755300), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034993 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:119507203:119515054:1 Gene:OTTHUMG00000012525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099267 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:119507213:119511952:1 Gene:OTTHUMG00000012525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099268 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:119507240:119508024:1 Gene:OTTHUMG00000012525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ehv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 (HSD3B1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033781 // RefSeq // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta, pseudogene 4 (HSD3BP4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335580 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:120113918:120114734:1 gene:ENSG00000203855 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021osu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta, pseudogene 4 (HSD3BP4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450675 // ENSEMBL // [retired] cdna:putative chromosome:GRCh37:1:120143780:120145118:1 gene:ENSG00000242959 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036344 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:120143780:120145118:1 Gene:OTTHUMG00000012959 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120126974:120127074:1 gene:ENSG00000207149 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027337 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2ba (pseudogene) (HIST2H2BA), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:121108210:121117257:-1 gene:ENSG00000223345 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099688 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:121108210:121117257:-1 Gene:OTTHUMG00000040899 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eio.2 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2ba (pseudogene) (HIST2H2BA), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001042758 // RefSeq // [retired] Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2 (SRGAP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112927 // GenBank // Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2 pseudogene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5399626). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eis.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000036739 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000036739 cpcScore=2.7430600 cnci=-0.3297327 gene:OTTHUMG00000013092 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:121396754:121463129:1 gene:ENSG00000227082 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003955 // RefSeq // Homo sapiens embigin pseudogene 1 (EMBP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127741 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40127596. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eiu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens embigin pseudogene 1 (EMBP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wht.1 // UCSC Genes // Homo sapiens embigin pseudogene 1 (EMBP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459390 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:142653718:142653799:1 gene:ENSG00000239012 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459257 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:142656014:142656096:1 gene:ENSG00000238937 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579288 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eiy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579288 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ota.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590589 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57701, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021otc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC071797 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4618441, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ejc.2 cpcScore=3.6387700 cnci=-0.2825879 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejc.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ592442 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-59554, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009whu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35140 fis, clone PLACE6009524. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ579288 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590589 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57701, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ejj.2 cpcScore=-1.2785100 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ596206 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-34272, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ote.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383967 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:143687359:143687519:1 gene:ENSG00000206694 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021otf.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459198 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:145132157:145132253:1 gene:ENSG00000263497 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000467933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145092987:145094979:-1 gene:ENSG00000196369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034178 // NONCODE // accn=NR_034178 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034178 cpcScore=4.2279500 cnci=-0.1831380 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oxm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B (SRGAP2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oty.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000538264 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:144339738:144521058:1 gene:ENSG00000231360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150590 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:183500 IMAGE:9056960, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ouc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364829 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:149162783:149162944:-1 gene:ENSG00000201699 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000524505 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:144858211:144865740:1 gene:ENSG00000255148 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000532137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149018671:149026269:-1 gene:ENSG00000255148 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000531288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149006309:149009527:-1 gene:ENSG00000254913 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148939739:148939817:-1 gene:ENSG00000222788 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC065231 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5548407, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001emi.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001emi.3 cpcScore=-0.2494520 cnci=-0.3161189 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001emi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4642241. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX647792 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N0886 (from clone DKFZp686N0886). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001emj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N0886 (from clone DKFZp686N0886). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004892 // RefSeq // Homo sapiens SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae) (gene/pseudogene) (SEC22B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453618 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:145096220:145116922:1 gene:ENSG00000223380 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000500203 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:145096531:145100984:1 gene:ENSG00000223380 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001364 // GenBank // Homo sapiens SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:1960 IMAGE:3051087), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eml.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:146052081:146052244:-1 gene:ENSG00000201558 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ous.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001184795 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 11 beta (PEX11B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003846 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 11 beta (PEX11B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145911350:145918837:-1 gene:ENSG00000131779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:145911351:145918529:-1 gene:ENSG00000131779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011963 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 11 beta, mRNA (cDNA clone MGC:9103 IMAGE:3866690), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038549 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145911350:145918837:-1 Gene:OTTHUMG00000013756 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100454 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145911350:145912406:-1 Gene:OTTHUMG00000013756 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eny.2 // UCSC Genes // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 11 beta (PEX11B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oyu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 11 beta (PEX11B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144698 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35 (ANKRD35), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145866560:145885845:-1 gene:ENSG00000198483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453670 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:145549227:145568521:1 gene:ENSG00000198483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:145866560:145885866:-1 gene:ENSG00000198483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57392 complete cds, highly similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 35. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101618 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:126667 IMAGE:8069124), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038515 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145866560:145885845:-1 Gene:OTTHUMG00000013743 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eob.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35 (ANKRD35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oyx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35 (ANKRD35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ova.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovi.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovj.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:147079746:147079870:1 gene:ENSG00000201142 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002305 // RefSeq // Homo sapiens protein disulfide isomerase family A, member 3 pseudogene 1 (PDIA3P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001epg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protein disulfide isomerase family A, member 3 pseudogene (PDIA3P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000101759 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000101759 cpcScore=-1.3313500 cnci=-0.2831895 gene:OTTHUMG00000043433 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101760 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000101760 cpcScore=-1.3084800 cnci=-0.2541596 gene:OTTHUMG00000043433 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422157 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:147496676:147498172:1 gene:ENSG00000229952 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446766 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:147494090:147498172:1 gene:ENSG00000229952 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovn.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000503154 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000503154 cpcScore=-1.1228900 cnci=-0.1769372 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovq.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon ATT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363009 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148263476:148263632:1 gene:ENSG00000199879 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovs.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516935 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:148330271:148330394:1 gene:ENSG00000252744 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovw.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364313 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148402715:148402875:1 gene:ENSG00000201183 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovx.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC150590 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:183500 IMAGE:9056960, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391154 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:147994146:147994313:1 gene:ENSG00000212456 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovy.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000545938 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:148193172:148193875:1 gene:ENSG00000223612 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384770 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:145281116:145281279:1 gene:ENSG00000207501 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021owi.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001144032 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4E (PPIAL4E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010paz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4E (PPIAL4E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001102663 // RefSeq // [retired]Homo sapiens neuroblastoma breakpoint family, member 16 (NBPF16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417839 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:148739443:148758311:1 gene:ENSG00000203827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY894562 // GenBank // Homo sapiens clone IVg7 NBPF8 isoform 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097693 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:148739443:148758311:1 Gene:OTTHUMG00000040624 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wkt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuroblastoma breakpoint family, member 16 (NBPF16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pba.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuroblastoma breakpoint family, member 16 (NBPF16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254372 // ENSEMBL // [retired] Neuroblastoma breakpoint family member 16 gene:ENSG00000203827 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164261 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4D (PPIAL4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001164262 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4F (PPIAL4F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4F (PPIAL4F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxd.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027002 // RefSeq // [retired]Homo sapiens uncharacterized LOC388692 (LOC388692), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433084 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:149287451:149291743:1 gene:ENSG00000235999 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452637 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:149284645:149287106:1 gene:ENSG00000226067 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC023516 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4298402, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099630 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:143790010:143797108:1 Gene:OTTHUMG00000041568 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099633 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145164099:145168712:-1 Gene:OTTHUMG00000041632 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001esg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4298402, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099546 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099546 cpcScore=-0.6513140 cnci=-0.2711382 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbf.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390755 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:212349978:212350069:1 gene:ENSG00000212044 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxn.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027484 // RefSeq // Homo sapiens Fc fragment of IgG, high affinity Ic, receptor (CD64), pseudogene (FCGR1C), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:121087345:121093021:1 gene:ENSG00000198019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000253193 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgG, high affinity Ic, receptor (CD64), pseudogene (FCGR1C), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK311303 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18345. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wkz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgG, high affinity Ic, receptor (CD64), pseudogene (FCGR1C), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgG, high affinity Ic, receptor (CD64), pseudogene (FCGR1C), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pbh.1 cpcScore=2.9628600 cnci=-0.2087722 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001135789 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4C (PPIAL4C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001143883 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178230 // RefSeq // [retired]Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A (PPIAL4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_4_CTG31:144592865:144593649:1 gene:ENSG00000275974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000198161 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130376 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A, mRNA (cDNA clone MGC:163248 IMAGE:40146407), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039136 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:149552657:149556510:1 Gene:OTTHUMG00000013954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001esj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB074166 // GenBank // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla04072, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wle.2 // UCSC Genes // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla04072, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365626 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:149605917:149606079:1 gene:ENSG00000202496 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxq.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000039135 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000039135 cpcScore=-1.2501800 cnci=-0.3937051 gene:OTTHUMG00000013953 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443602 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000443602 cpcScore=1.5681000 cnci=-0.2038484 gene:ENSG00000223759 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000369173 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:149675978:149676609:1 gene:ENSG00000203815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390764 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:41759141:41759227:1 gene:ENSG00000264896 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxx.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040874 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4 (HIST2H2AA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003516 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa3 (HIST2H2AA3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149842188:149842736:-1 gene:ENSG00000203812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096705 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4, mRNA (cDNA clone MGC:120083 IMAGE:40021705), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149851061:149851624:1 Gene:OTTHUMG00000012097 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001esx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4 (HIST2H2AA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410290 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150236967:150237156:1 gene:ENSG00000222222 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012113 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150257159:150265078:1 gene:ENSG00000118298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150258094:150263376:1 gene:ENSG00000118298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308964 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99005. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034412 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV, mRNA (cDNA clone MGC:34392 IMAGE:5175251), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035064 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150257159:150265078:1 Gene:OTTHUMG00000012549 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035065 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150258094:150263376:1 Gene:OTTHUMG00000012549 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001etx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wln.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458929 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:150234093:150234196:1 gene:ENSG00000238526 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024579 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369098 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:150272780:150280914:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150272699:150280916:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150268200:150280916:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017761 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:22166 IMAGE:4617936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035053 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150272699:150280916:1 Gene:OTTHUMG00000012546 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035054 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150272780:150280914:1 Gene:OTTHUMG00000012546 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150268200:150280916:1 Gene:OTTHUMG00000012546 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001euc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eud.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eue.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018997 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_031901 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309092 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:150266289:150281414:1 gene:ENSG00000187145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004566 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21, mRNA (cDNA clone MGC:14148 IMAGE:3633098), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006554 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21, mRNA (cDNA clone MGC:2680 IMAGE:2819715), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369084 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:611900:625013:+ gene:ENSG00000187145 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035046 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150293720:150308979:1 Gene:OTTHUMG00000012544 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035813 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150293920:150308979:1 Gene:OTTHUMG00000012544 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001euk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eul.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500237 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500237 cpcScore=0.3339630 cnci=-0.2212362 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150701866:150701972:1 gene:ENSG00000206931 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000560481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150965245:150965963:1 gene:ENSG00000259357 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000561111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150965249:150966256:1 gene:ENSG00000259357 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003568 // RefSeq // Homo sapiens annexin A9 (ANXA9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150982017:150995634:1 gene:ENSG00000143412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150982249:150984371:1 gene:ENSG00000143412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005830 // GenBank // Homo sapiens annexin A9, mRNA (cDNA clone MGC:1925 IMAGE:2959488), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084895 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150982017:150995634:1 Gene:OTTHUMG00000035063 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084896 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150982249:150984371:1 Gene:OTTHUMG00000035063 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ewa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens annexin A9 (ANXA9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459254 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151439000:151439095:1 gene:ENSG00000238711 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383908 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151629324:151629430:1 gene:ENSG00000206635 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000389897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151790842:151794402:1 gene:ENSG00000203288 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000533481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151790804:151791545:1 gene:ENSG00000203288 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036640 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:151790842:151794402:1 Gene:OTTHUMG00000013060 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC038201 // GenBank HTC // Homo sapiens, Similar to hypothetical protein FLJ20378, clone IMAGE:4179392, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eze.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001eze.2 cpcScore=0.3160430 cnci=-0.2478401 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eze.3 // UCSC Genes // Homo sapiens, Similar to hypothetical protein FLJ20378, clone IMAGE:4179392, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178438 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 5A (LCE5A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152510844:152512177:1 gene:ENSG00000186207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040059 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152510844:152512177:1 Gene:OTTHUMG00000014401 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 5A (LCE5A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oyx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 5A (LCE5A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019060 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1 (CRCT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152514502:152516010:1 gene:ENSG00000169509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119710 // GenBank // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1, mRNA (cDNA clone MGC:149658 IMAGE:40117182), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034511 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152514502:152516010:1 Gene:OTTHUMG00000012391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1 (CRCT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oyy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1 (CRCT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178434 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3C (LCE3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152600662:152601086:1 gene:ENSG00000244057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130365 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:163237 IMAGE:40146396), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130367 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:163239 IMAGE:40146398), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040061 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152600662:152601086:1 Gene:OTTHUMG00000014403 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fac.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3C (LCE3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178433 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3B (LCE3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:152613811:152614098:1 gene:ENSG00000187238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034515 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152613811:152614098:1 Gene:OTTHUMG00000012395 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pds.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3B (LCE3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178430 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2D (LCE2D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152663396:152664659:1 gene:ENSG00000187223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130603 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 2D, mRNA (cDNA clone MGC:163475 IMAGE:40146634), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040058 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152663396:152664659:1 Gene:OTTHUMG00000014400 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fag.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 2D (LCE2D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178428 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2A (LCE2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152698364:152699442:1 gene:ENSG00000187173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC119707 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 2A, mRNA (cDNA clone MGC:149654 IMAGE:40117159), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034512 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152698364:152699442:1 Gene:OTTHUMG00000012392 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001faj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 2A (LCE2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oze.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 2A (LCE2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178356 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 4A (LCE4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:152709047:152709434:1 gene:ENSG00000187170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152708160:152709491:1 gene:ENSG00000187170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113446 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 4A, mRNA (cDNA clone MGC:142006 IMAGE:8322498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113448 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 4A, mRNA (cDNA clone MGC:142008 IMAGE:8322500), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040048 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152708160:152709491:1 Gene:OTTHUMG00000014394 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fak.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 4A (LCE4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024679 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 68 (C1orf68), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362017 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152691082:152692946:1 gene:ENSG00000198854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152719522:152720470:1 gene:ENSG00000198854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034521 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152719522:152720470:1 Gene:OTTHUMG00000012401 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pdu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 68 (C1orf68), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001025231 // RefSeq // Homo sapiens keratinocyte proline-rich protein (KPRP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368773 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152730506:152734529:1 gene:ENSG00000203786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034522 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152759561:152762052:1 Gene:OTTHUMG00000012402 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fal.1 // UCSC Genes // Homo sapiens keratinocyte proline-rich protein (KPRP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens keratinocyte proline-rich protein (KPRP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178354 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1F (LCE1F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152776372:152776728:1 gene:ENSG00000240386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034523 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152776372:152776728:1 Gene:OTTHUMG00000012403 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pdv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1F (LCE1F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178353 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1E (LCE1E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152786277:152788426:1 gene:ENSG00000186226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152786214:152787702:1 gene:ENSG00000186226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034525 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152786277:152788426:1 Gene:OTTHUMG00000012405 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034656 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152786214:152787702:1 Gene:OTTHUMG00000012405 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fan.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1E (LCE1E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1E (LCE1E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178352 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1D (LCE1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152796751:152798181:1 gene:ENSG00000172155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034657 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152796751:152798181:1 Gene:OTTHUMG00000012444 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wnp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1D (LCE1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1D (LCE1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178349 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1B (LCE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152811971:152813109:1 gene:ENSG00000196734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439693 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152784923:152785279:1 gene:ENSG00000196734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104232 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 1B, mRNA (cDNA clone MGC:126041 IMAGE:40032247), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104233 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 1B, mRNA (cDNA clone MGC:126042 IMAGE:40032251), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040060 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152811971:152813109:1 Gene:OTTHUMG00000014402 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001faq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1B (LCE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178348 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1A (LCE1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152827473:152827894:1 gene:ENSG00000186844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368766 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152798523:152800665:1 gene:ENSG00000186844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034660 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152827473:152827894:1 Gene:OTTHUMG00000012447 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pdw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1A (LCE1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030663 // RefSeq // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (SMCP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152878317:152885047:1 gene:ENSG00000163206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014593 // GenBank // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:26305 IMAGE:4824172), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016744 // GenBank // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:26519 IMAGE:4829283), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034665 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152878317:152885047:1 Gene:OTTHUMG00000012452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fat.3 // UCSC Genes // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (SMCP), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (SMCP), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005547 // RefSeq // Homo sapiens involucrin (IVL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152908545:152911886:1 gene:ENSG00000163207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392667 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152881023:152884360:1 gene:ENSG00000163207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046391 // GenBank // Homo sapiens involucrin, mRNA (cDNA clone MGC:25201 IMAGE:4749952), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034664 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152908545:152911886:1 Gene:OTTHUMG00000012451 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fau.3 // UCSC Genes // Homo sapiens involucrin (IVL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens involucrin (IVL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173080 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 4 (SPRR4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152970666:152972574:1 gene:ENSG00000184148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069445 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:97451 IMAGE:7262727), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112170 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:138375 IMAGE:8327638), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112172 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:138377 IMAGE:8327640), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034663 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152970666:152972574:1 Gene:OTTHUMG00000012450 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fav.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 4 (SPRR4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 4 (SPRR4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001199828 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_005987 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307122 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152956557:152958289:1 gene:ENSG00000169474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152985231:152985500:1 gene:ENSG00000169474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105081 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:132741 IMAGE:8144084), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105083 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:132743 IMAGE:8144086), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143782 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177313 IMAGE:9052296, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040062 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152985231:152985500:1 Gene:OTTHUMG00000014404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001faw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wnu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003125 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1B (SPRR1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153031202:153032900:1 gene:ENSG00000169469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392661 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:153004822:153005091:1 gene:ENSG00000169469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038906 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153031202:153032900:1 Gene:OTTHUMG00000013869 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fba.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 1B (SPRR1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 1B (SPRR1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010857 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1 (LELP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC087854 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:102979 IMAGE:30387074), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130507 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:163379 IMAGE:40146538), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368747 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold934:4661040:4661314:- gene:ENSG00000203784 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039104 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153203443:153205120:1 Gene:OTTHUMG00000013935 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbl.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1 (LELP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001195571 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 9 (PRR9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153217584:153219317:1 gene:ENSG00000203783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039105 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153217584:153219317:1 Gene:OTTHUMG00000013936 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens proline rich 9 (PRR9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000427 // RefSeq // Homo sapiens loricrin (LOR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153259700:153262122:1 gene:ENSG00000203782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392652 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:153233402:153234593:1 gene:ENSG00000203782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034690 // GenBank // Homo sapiens loricrin, mRNA (cDNA clone MGC:21357 IMAGE:4752776), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108290 // GenBank // Homo sapiens loricrin, mRNA (cDNA clone MGC:111513 IMAGE:4754528), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039107 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153259700:153262122:1 Gene:OTTHUMG00000013938 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens loricrin (LOR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens loricrin (LOR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384591 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:153331622:153331728:1 gene:ENSG00000207321 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002965 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A9 (S100A9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153357854:153361027:1 gene:ENSG00000163220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047681 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A9, mRNA (cDNA clone MGC:51841 IMAGE:6060124), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036793 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153357854:153361027:1 Gene:OTTHUMG00000013125 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens S100 calcium binding protein A9 (S100A9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021paa.1 // UCSC Genes // transfer RNA Met (anticodon CAT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517008 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:154254444:154254522:1 gene:ENSG00000252817 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516873 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:154288460:154288527:1 gene:ENSG00000252682 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390990 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154295503:154295601:1 gene:ENSG00000212292 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154297650:154297748:1 gene:ENSG00000222457 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459540 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154338743:154338802:1 gene:ENSG00000238365 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000748 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal) (CHRNB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075040 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal), mRNA (cDNA clone MGC:103958 IMAGE:30915357), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368476 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold56:1414272:1421745:- gene:ENSG00000160716 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:154567781:154580026:1 Gene:OTTHUMG00000037262 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ffg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal) (CHRNB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018655 // RefSeq // Homo sapiens lens epithelial protein (LENEP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069140 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:95424 IMAGE:7216999), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096714 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118969 IMAGE:40002566), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098148 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118968 IMAGE:40002565), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392487 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold56:1019604:1019789:- gene:ENSG00000163352 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091101 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:154993586:154994315:1 Gene:OTTHUMG00000037417 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fgi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lens epithelial protein (LENEP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pak.1 // UCSC Genes // Homo sapiens lens epithelial protein (LENEP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365157 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:155120490:155120598:1 gene:ENSG00000202027 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515971 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:155115747:155115808:1 gene:ENSG00000251780 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000406836 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:155121020:155121295:1 gene:ENSG00000223452 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030281 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 92b (MIR92B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385276 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:155164968:155165063:1 gene:ENSG00000208011 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pas.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 92b (MIR92B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ786325 // GenBank // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_878406 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pav.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_878406 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384415 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155419397:155419500:1 gene:ENSG00000207144 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034180 // RefSeq // Homo sapiens POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 (POU5F1P4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pgd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 (POU5F1P4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152280 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin XI (SYT11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539162 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:155829347:155851946:1 gene:ENSG00000132718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296378 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50786 complete cds, highly similar to Synaptotagmin-11. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004291 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:10881 IMAGE:3621175), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013690 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:17226 IMAGE:4179089), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039205 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:26698 IMAGE:4819614), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368324 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold56:295615:305458:- gene:ENSG00000132718 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039597 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:155859509:155885199:1 Gene:OTTHUMG00000014105 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fmg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin XI (SYT11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pgq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptotagmin XI (SYT11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155894281:155894386:1 gene:ENSG00000201614 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_181885 // RefSeq // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4 (RXFP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101507 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:126556 IMAGE:8069013), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368318 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold56:236637:237713:- gene:ENSG00000173080 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046203 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:155941710:155942949:1 Gene:OTTHUMG00000017463 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pgs.2 // UCSC Genes // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4 (RXFP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410679 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:156077373:156077454:1 gene:ENSG00000222611 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458777 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:156499122:156499221:1 gene:ENSG00000238843 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144702 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 71 (LRRC71), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000337428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156920650:156933094:1 gene:ENSG00000160838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156920912:156933088:1 gene:ENSG00000160838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK057446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32884 fis, clone TESTI2004229. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033790 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 92, mRNA (cDNA clone MGC:45468 IMAGE:5163973), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098961 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156920650:156933094:1 Gene:OTTHUMG00000041298 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098962 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156920912:156933088:1 Gene:OTTHUMG00000041298 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098963 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156927362:156933085:1 Gene:OTTHUMG00000041298 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098964 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156932098:156933089:1 Gene:OTTHUMG00000041298 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fql.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 71 (LRRC71), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fqm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 71 (LRRC71), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_001560 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c, somatic pseudogene 52 (CYCSP52), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fqs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome c, somatic pseudogene 52 (CYCSP52), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fqs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001fqs.2 cpcScore=2.1485000 cnci=-0.0959974 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000452528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157925974:157949071:1 gene:ENSG00000236957 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK057438 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32876 fis, clone TESTI2004073. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ32876 fis, clone TESTI2004073. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001766 // RefSeq // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158179947:158184896:1 gene:ENSG00000158473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK225996 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CD1D antigen, d polypeptide variant, clone: FCC110C02. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310541 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17583. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310749 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17791. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027926 // GenBank // Homo sapiens CD1d molecule, mRNA (cDNA clone MGC:34622 IMAGE:5229534), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058340 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158179947:158184896:1 Gene:OTTHUMG00000022436 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wsr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wss.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wst.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001763 // RefSeq // Homo sapiens CD1a molecule (CD1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158254137:158258269:1 gene:ENSG00000158477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031645 // GenBank // Homo sapiens CD1a molecule, mRNA (cDNA clone MGC:35168 IMAGE:5170038), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046349 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158254137:158258269:1 Gene:OTTHUMG00000017512 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1a molecule (CD1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1a molecule (CD1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// X79309 // GenBank // H.sapiens CD1A mRNA, 66bp. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004473 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1 (OR10K1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137323 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168943 IMAGE:9021320), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137324 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168944 IMAGE:9021321), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289451 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1217:385077:386008:+ gene:ENSG00000173285 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046367 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158465562:158466503:1 Gene:OTTHUMG00000017517 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pij.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1 (OR10K1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004472 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily R, member 2 (OR10R2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158479878:158480885:1 gene:ENSG00000198965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000051847 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158479878:158480885:1 Gene:OTTHUMG00000019632 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pik.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily R, member 2 (OR10R2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005184 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 6 (OR6K6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140743 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:176420 IMAGE:9021611), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368144 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2558:122497:123498:- gene:ENSG00000180433 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059065 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158754720:158755891:1 Gene:OTTHUMG00000022772 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fsw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 6 (OR6K6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002432 // RefSeq // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen (MNDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158831317:158849504:1 gene:ENSG00000163563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491210 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:158831351:158842723:1 gene:ENSG00000163563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032319 // GenBank // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen, mRNA (cDNA clone MGC:40350 IMAGE:5223430), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059069 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158831317:158849504:1 Gene:OTTHUMG00000022776 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059070 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158831351:158842723:1 Gene:OTTHUMG00000022776 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059071 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158845901:158849506:1 Gene:OTTHUMG00000022776 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fsz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen (MNDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002001 // RefSeq // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide (FCER1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368114 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:159302336:159307993:1 gene:ENSG00000179639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159289714:159308224:1 gene:ENSG00000179639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005912 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:14507 IMAGE:4294467), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015195 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:14717 IMAGE:4251469), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090328 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159289714:159308224:1 Gene:OTTHUMG00000037176 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090329 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159302336:159307993:1 Gene:OTTHUMG00000037176 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ftq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide (FCER1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012351 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1 (OR10J1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069150 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:95435 IMAGE:7217010), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112290 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:138495 IMAGE:8327758), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423932 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1160:452528:453481:- gene:ENSG00000196184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059020 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159439722:159440811:1 Gene:OTTHUMG00000022737 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010piv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1 (OR10J1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001639 // RefSeq // Homo sapiens amyloid P component, serum (APCS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000255040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159587825:159588865:1 gene:ENSG00000132703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007039 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum, mRNA (cDNA clone MGC:12419 IMAGE:3935086), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007058 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum, mRNA (cDNA clone MGC:12497 IMAGE:3934872), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159587825:159588865:1 Gene:OTTHUMG00000022741 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ftv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens amyloid P component, serum (APCS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038849 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1133 (LINC01133), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159961224:159979061:1 gene:ENSG00000224259 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159961218:159977112:1 gene:ENSG00000224259 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060638 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159961224:159979061:1 Gene:OTTHUMG00000024077 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060639 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159961218:159977112:1 Gene:OTTHUMG00000024077 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fuu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100505633 (LOC100505633), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fuu.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001fuu.2 cpcScore=-1.0048400 cnci=-0.1771197 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004983 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160081570:160090563:1 gene:ENSG00000162728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117517 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40010263. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117519 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40010267. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060628 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160081570:160090563:1 Gene:OTTHUMG00000024072 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fuy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fux.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wte.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001231 // RefSeq // Homo sapiens calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle) (CASQ1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368079 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:160160285:160171674:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441151 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:160160693:160171674:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467691 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:160198210:160201493:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022289 // GenBank // Homo sapiens calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle), mRNA (cDNA clone MGC:22462 IMAGE:4338020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368078 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1649:198220:206778:- gene:ENSG00000143318 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000077412 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160190556:160201886:1 Gene:OTTHUMG00000031607 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000077413 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160192638:160199053:1 Gene:OTTHUMG00000031607 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352448 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160198210:160201493:1 Gene:OTTHUMG00000031607 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pja.2 // UCSC Genes // Homo sapiens calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle) (CASQ1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002190 // RefSeq // Homo sapiens SUMO1 pseudogene 3 (functional) (SUMO1P3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fvw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SUMO1 pseudogene 3 (SUMO1P3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fvw.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001fvw.2 cpcScore=1.7808200 cnci=-0.3468214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005598 // RefSeq // Homo sapiens nescient helix loop helix 1 (NHLH1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160367067:160372848:1 gene:ENSG00000171786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013789 // GenBank // Homo sapiens nescient helix loop helix 1, mRNA (cDNA clone MGC:17696 IMAGE:3866861), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080676 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160367067:160372848:1 Gene:OTTHUMG00000033121 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fwa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens nescient helix loop helix 1 (NHLH1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nescient helix loop helix 1 (NHLH1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020335 // RefSeq // Homo sapiens VANGL planar cell polarity protein 2 (VANGL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160400586:160428678:1 gene:ENSG00000162738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160419493:160424147:1 gene:ENSG00000162738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080677 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160400586:160428678:1 Gene:OTTHUMG00000033122 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080678 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160419493:160424147:1 Gene:OTTHUMG00000033122 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fwc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens VANGL planar cell polarity protein 2 (VANGL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103919 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40006963. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fwb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens VANGL planar cell polarity protein 2 (VANGL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004106 // RefSeq // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide (FCER1G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161215279:161220699:1 gene:ENSG00000158869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161215234:161219248:1 gene:ENSG00000158869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033872 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:45270 IMAGE:5219148), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289902 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3308:189394:192239:- gene:ENSG00000158869 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083012 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161215297:161219248:1 Gene:OTTHUMG00000034343 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083013 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161215279:161220699:1 Gene:OTTHUMG00000034343 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083014 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161215234:161219248:1 Gene:OTTHUMG00000034343 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fyz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide (FCER1G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fza.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide (FCER1G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001102566 // RefSeq // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1 (PCP4L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161258727:161285450:1 gene:ENSG00000248485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147003 // GenBank // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:182106 IMAGE:9056931), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082986 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161258727:161285450:1 Gene:OTTHUMG00000034340 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gad.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1 (PCP4L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384194 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:161401289:161401395:1 gene:ENSG00000206921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pby.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon ???) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcd.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pce.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pci.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcj.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcn.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pco.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcs.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pct.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcx.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcy.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdb.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002155 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B) (HSPA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000309758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161524540:161526910:1 gene:ENSG00000173110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545155 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:161494335:161496582:1 gene:ENSG00000173110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035665 // GenBank // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B), mRNA (cDNA clone MGC:46216 IMAGE:5723718), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083308 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161524540:161526910:1 Gene:OTTHUMG00000034461 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gaq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B') (HSPA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pde.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdf.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdk.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024151 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 7 (HSP70B) (HSPA7), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pkp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 7 (HSP70B) (HSPA7), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdm.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdn.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362725 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:161699506:161699607:1 gene:ENSG00000199595 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007348 // RefSeq // Homo sapiens activating transcription factor 6 (ATF6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161766294:161964070:1 gene:ENSG00000118217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161840075:161860244:1 gene:ENSG00000118217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB208929 // GenBank // Homo sapiens mRNA for activating transcription factor 6 variant protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060304 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161766294:161964070:1 Gene:OTTHUMG00000023961 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060500 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:161840075:161860244:1 Gene:OTTHUMG00000023961 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens activating transcription factor 6 (ATF6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens activating transcription factor 6 (ATF6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000457671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161890833:161892196:1 gene:ENSG00000229808 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF268386 // GenBank HTC // Homo sapiens clone DPDP-3 dental pulp-derived protein 3, mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gch.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone DPDP-3 dental pulp-derived protein 3, mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516931 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:163355655:163355726:1 gene:ENSG00000252740 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391236 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:163923670:163923873:1 gene:ENSG00000212538 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362979 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:164351273:164351388:1 gene:ENSG00000199849 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384354 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:164639565:164639671:1 gene:ENSG00000207082 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365117 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:164854231:164854332:1 gene:ENSG00000201987 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021peb.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036683 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14) pseudogene (LOC440700), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165698750:165709968:1 gene:ENSG00000215838 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14) pseudogene (LOC440700), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083897 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:165667987:165679205:1 Gene:OTTHUMG00000034675 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdi.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gdi.2 cpcScore=0.6470190 cnci=-0.1327290 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000423121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165768929:165775176:1 gene:ENSG00000224358 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071770 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4271293, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083935 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:165768929:165775176:1 Gene:OTTHUMG00000034703 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ42974 fis, clone BRTHA2002565. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdo.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gdo.2 cpcScore=0.3423440 cnci=-0.3801737 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002925 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 9 pseudogene (FMO9P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166603675:166625238:1 gene:ENSG00000215834 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pld.2 // UCSC Genes // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 9 pseudogene (FMO9P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459393 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:167010672:167010773:1 gene:ENSG00000238325 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pej.1 // UCSC Genes // transfer RNA Pro (anticodon CGG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408618 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:167998660:167998726:1 gene:ENSG00000221545 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001031800 // RefSeq // Homo sapiens TOR signaling pathway regulator (TIPRL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_152902 // RefSeq // Homo sapiens TOR signaling pathway regulator (TIPRL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168179055:168192395:1 gene:ENSG00000143155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168178933:168202114:1 gene:ENSG00000143155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009506 // GenBank // Homo sapiens TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:3794 IMAGE:3532344), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083822 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:168178933:168202114:1 Gene:OTTHUMG00000034646 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083823 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:168179055:168192395:1 Gene:OTTHUMG00000034646 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gff.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (TIPRL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gfg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (TIPRL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002995 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 1 (XCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168576473:168582077:1 gene:ENSG00000143184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069817 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:97432 IMAGE:7262708), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070309 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:88311 IMAGE:30416260), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083612 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:168576473:168582077:1 Gene:OTTHUMG00000034548 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gfo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 1 (XCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024160 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 626 (LINC00626), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168786939:168792886:1 gene:ENSG00000225826 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083615 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:168786939:168792886:1 Gene:OTTHUMG00000034551 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gfq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 626 (LINC00626), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001677 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide (ATP1B1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367813 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:169079836:169101254:1 gene:ENSG00000143153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169106323:169132019:1 gene:ENSG00000143153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494797 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:169107907:169127399:1 gene:ENSG00000143153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000499679 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:169077186:169101553:1 gene:ENSG00000143153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000006 // GenBank // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:1798 IMAGE:3506311), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367816 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold164:780482:802903:+ gene:ENSG00000143153 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169106323:169132019:1 Gene:OTTHUMG00000034590 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083696 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169105697:169132722:1 Gene:OTTHUMG00000034590 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169107907:169127399:1 Gene:OTTHUMG00000034590 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gfr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide (ATP1B1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136107 // RefSeq // Homo sapiens methyltransferase like 11B (METTL11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:170157969:170167563:1 gene:ENSG00000203740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157860 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase like 11B, mRNA (cDNA clone MGC:189755 IMAGE:9057079), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171858 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase like 11B, mRNA (cDNA clone MGC:198573 IMAGE:9054512), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000439373 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold164:1799658:1806099:+ gene:ENSG00000203740 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087586 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:170146001:170167790:1 Gene:OTTHUMG00000035959 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wvv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens methyltransferase like 11B (METTL11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001163629 // RefSeq // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_025063 // RefSeq // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:170935526:170998806:1 gene:ENSG00000117501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:170935471:171064765:1 gene:ENSG00000117501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK027203 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23550 fis, clone LNG08970. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099327 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:170935526:170998806:1 Gene:OTTHUMG00000041456 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099328 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:170992317:171015143:1 Gene:OTTHUMG00000041456 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ghg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wvy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010plz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002601 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 6 pseudogene (FMO6P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000529822 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:171123330:171130707:1 gene:ENSG00000117507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000236166 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold164:2721040:2746331:+ gene:ENSG00000117507 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086215 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:171137740:171161568:1 Gene:OTTHUMG00000035503 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ghj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 6 pseudogene (FMO6P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002719 // RefSeq // Homo sapiens topoisomerase (DNA) I pseudogene 1 (TOP1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pmf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens topoisomerase (DNA) I pseudogene 1 (TOP1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pmf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pmf.1 cpcScore=4.4957600 cnci=-0.3425887 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459496 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:171451046:171451148:1 gene:ENSG00000238859 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517251 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:171768070:171768175:1 gene:ENSG00000253060 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516325 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:171783652:171783766:1 gene:ENSG00000252134 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516545 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:172317283:172317357:1 gene:ENSG00000252354 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:172366540:172366646:1 gene:ENSG00000206684 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000639 // RefSeq // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (FASLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:172659144:172666075:1 gene:ENSG00000117560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:172659018:172666874:1 gene:ENSG00000117560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF288573 // GenBank // Homo sapiens FasL isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017502 // GenBank // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6), mRNA (cDNA clone MGC:23109 IMAGE:4849770), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084276 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:172659018:172666874:1 Gene:OTTHUMG00000034841 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gis.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (FASLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001git.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (FASLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516008 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:173250216:173250309:1 gene:ENSG00000251817 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516548 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:173808489:173808622:1 gene:ENSG00000252357 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018122 // RefSeq // Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (DARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000239457 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:173793797:173827682:1 gene:ENSG00000117593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173824503:173858546:1 gene:ENSG00000117593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173840913:173857838:1 gene:ENSG00000117593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045173 // GenBank // Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:43833 IMAGE:5273243), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084220 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173824503:173858546:1 Gene:OTTHUMG00000034803 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084221 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173850370:173852018:1 Gene:OTTHUMG00000034803 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084241 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173840913:173857838:1 Gene:OTTHUMG00000034803 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gjh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (DARS2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037605 // RefSeq // Homo sapiens GAS5 antisense RNA 1 (GAS5-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416578 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:173831290:173833079:1 gene:ENSG00000231792 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pfa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GAS5 antisense RNA 1 (GAS5-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090606 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000090606 cpcScore=-1.1960400 cnci=-0.5003126 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ593451 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-33563, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pfb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32215, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005684 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52 (GPR52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174448111:174449198:1 gene:ENSG00000203737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067456 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79289 IMAGE:6971753), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC095532 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:111751 IMAGE:7002024), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084511 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:174448111:174449198:1 Gene:OTTHUMG00000034901 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gka.1 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52 (GPR52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:174996524:174996629:1 gene:ENSG00000252552 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000426030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:176017277:176018760:1 gene:ENSG00000228686 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000084827 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:176477904:176478979:1 Gene:OTTHUMG00000035042 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454327 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:176477904:176478979:1 gene:ENSG00000230220 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pfh.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon ???) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014864 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B (FAM20B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179025896:179076562:1 gene:ENSG00000116199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046441 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B, mRNA (cDNA clone MGC:34351 IMAGE:5197154), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051794 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B, mRNA (cDNA clone MGC:57628 IMAGE:5492043), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084922 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179025896:179076562:1 Gene:OTTHUMG00000035073 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098157 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179025804:179050316:1 Gene:OTTHUMG00000035073 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B (FAM20B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000438080 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:179070798:179074885:1 gene:ENSG00000228449 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391036 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:179196473:179196579:1 gene:ENSG00000212338 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364749 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:179201487:179201627:1 gene:ENSG00000201619 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:179576268:179576349:1 gene:ENSG00000251875 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173509 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179743163:179816198:1 gene:ENSG00000143340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK292432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78583 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310711 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17753. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009382 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A, mRNA (cDNA clone MGC:16664 IMAGE:4124490), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085298 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179730217:179742697:1 Gene:OTTHUMG00000035261 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085299 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179742009:179742697:1 Gene:OTTHUMG00000035261 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085300 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179743163:179816198:1 Gene:OTTHUMG00000035262 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wxj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wxk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179730217:179742697:1 gene:ENSG00000243062 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500152 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500152 cpcScore=0.0335338 cnci=-0.2568987 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384026 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:180727858:180727953:1 gene:ENSG00000206753 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000457152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:932565:964366:1 gene:ENSG00000116017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000234237 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016545 // RefSeq // Homo sapiens immediate early response 5 (IER5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:181088712:181090838:1 gene:ENSG00000162783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545568 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:181057836:181059324:1 gene:ENSG00000162783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000128 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 5, mRNA (cDNA clone MGC:5355 IMAGE:3048356), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108253 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 5, mRNA (cDNA clone MGC:102760 IMAGE:6025403), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085142 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:181088712:181090838:1 Gene:OTTHUMG00000035178 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001got.4 // UCSC Genes // Homo sapiens immediate early response 5 (IER5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384037 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:182327068:182327174:1 gene:ENSG00000206764 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445515 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:182305137:182305475:1 gene:ENSG00000231684 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034131 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 272 (LINC00272), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182407621:182414815:1 gene:ENSG00000203729 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140780 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 120, mRNA (cDNA clone MGC:176457 IMAGE:9021648), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091036 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:182407621:182414815:1 Gene:OTTHUMG00000037402 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wxv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 272 (LINC00272), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036490 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC284648 (LOC284648), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pfy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC284648 (LOC284648), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:184315658:184315765:1 gene:ENSG00000207080 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030806 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 21 (C1orf21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:184387058:184629020:1 gene:ENSG00000116667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:184590748:184599609:1 gene:ENSG00000116667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:184539993:184592248:1 gene:ENSG00000116667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028567 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:16172 IMAGE:3635521), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085784 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:184387058:184629020:1 Gene:OTTHUMG00000035386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086146 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:184539993:184592248:1 Gene:OTTHUMG00000035386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086147 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:184568399:184619936:1 Gene:OTTHUMG00000035386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:184590748:184599609:1 Gene:OTTHUMG00000035386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gqv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 21 (C1orf21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516981 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:184647068:184647141:1 gene:ENSG00000252790 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001gqz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35351 fis, clone PUAEN1000087. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105518 // RefSeq // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_017673 // RefSeq // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:185157159:185291765:1 gene:ENSG00000116668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030781 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:26704 IMAGE:4821611), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367501 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1857:138196:239434:+ gene:ENSG00000116668 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085790 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:185157159:185291765:1 Gene:OTTHUMG00000035390 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085791 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:185157080:185291007:1 Gene:OTTHUMG00000035390 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085792 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:185157482:185174626:1 Gene:OTTHUMG00000035390 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001grg.4 // UCSC Genes // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001grh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364551 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185251313:185251411:1 gene:ENSG00000201421 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pgd.1 // UCSC Genes // Novel nucleic acids. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516803 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185266535:185266627:1 gene:ENSG00000252612 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:185434244:185434305:1 gene:ENSG00000252407 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:185558372:185565631:-1 gene:ENSG00000228309 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086351 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086351 cpcScore=-1.0677900 cnci=-0.4918777 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022375 // RefSeq // Homo sapiens oculomedin (OCLM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069096 // GenBank // Homo sapiens oculomedin, mRNA (cDNA clone MGC:95371 IMAGE:7216910), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093987 // GenBank // Homo sapiens oculomedin, mRNA (cDNA clone MGC:121022 IMAGE:7939832), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gry.3 // UCSC Genes // Homo sapiens oculomedin (OCLM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000429725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:187641226:187643860:1 gene:ENSG00000230426 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040856 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 99, mRNA (cDNA clone MGC:50356 IMAGE:5526465), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086446 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:187641226:187643860:1 Gene:OTTHUMG00000035624 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 99, mRNA (cDNA clone MGC:50356 IMAGE:5526465), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001039152 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 21 (RGS21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:192316992:192367285:1 gene:ENSG00000253148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086387 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192316992:192367285:1 Gene:OTTHUMG00000035594 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 21 (RGS21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002922 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 1 (RGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:192575727:192580031:1 gene:ENSG00000090104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303138 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57687 complete cds, highly similar to Regulator of G-protein signaling 1. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015510 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 1, mRNA (cDNA clone MGC:9198 IMAGE:3916789), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192575727:192580031:1 Gene:OTTHUMG00000035598 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086392 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192575775:192579941:1 Gene:OTTHUMG00000035598 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086393 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192575763:192577276:1 Gene:OTTHUMG00000035598 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313737 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192575773:192578955:1 Gene:OTTHUMG00000035598 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313738 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192575773:192576766:1 Gene:OTTHUMG00000035598 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 1 (RGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pou.1 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 1 (RGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002923 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 2 (RGS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:192809041:192812283:1 gene:ENSG00000116741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:192809039:192810899:1 gene:ENSG00000116741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007049 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 2, 24kDa, mRNA (cDNA clone MGC:12460 IMAGE:3681138), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086396 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192809041:192812283:1 Gene:OTTHUMG00000035600 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086397 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192809039:192810899:1 Gene:OTTHUMG00000035600 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086398 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192809042:192811239:1 Gene:OTTHUMG00000035600 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086399 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:192809143:192811032:1 Gene:OTTHUMG00000035600 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 2, 24kDa (RGS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024529 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 73 (CDC73), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:193122017:193253901:1 gene:ENSG00000134371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445394 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:193091229:193202199:1 gene:ENSG00000134371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:193233026:193251168:1 gene:ENSG00000134371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065037 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:74779 IMAGE:6170851), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086696 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:193122017:193253901:1 Gene:OTTHUMG00000035676 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:193122470:193138173:1 Gene:OTTHUMG00000035676 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:193233026:193251168:1 Gene:OTTHUMG00000035676 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gtb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cell division cycle 73 (CDC73), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030787 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 5 (CFHR5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196977556:197009674:1 gene:ENSG00000134389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367414 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:196946667:196978804:1 gene:ENSG00000134389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111773 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 5, mRNA (cDNA clone MGC:133240 IMAGE:40034462), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088814 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:196977556:197009674:1 Gene:OTTHUMG00000036517 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gts.4 // UCSC Genes // Homo sapiens complement factor H-related 5 (CFHR5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024594 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53 (C1orf53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:197902647:197907367:1 gene:ENSG00000203724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:197905517:197907364:1 gene:ENSG00000203724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130608 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:163480 IMAGE:40146639), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086555 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197902647:197907367:1 Gene:OTTHUMG00000035659 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086556 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197902778:197907367:1 Gene:OTTHUMG00000035659 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086557 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197905517:197907364:1 Gene:OTTHUMG00000035659 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001guh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53 (C1orf53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:199888159:199888261:1 gene:ENSG00000200139 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408476 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:200144834:200144935:1 gene:ENSG00000221403 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001105517 // RefSeq // [retired] Homo sapiens family with sequence similarity 58, member B, pseudogene (FAM58BP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wzi.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005298 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25 (GPR25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200873038:200874123:1 gene:ENSG00000170128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126386 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:161664 IMAGE:8992102), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126388 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:161666 IMAGE:8992104), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087056 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200873038:200874123:1 Gene:OTTHUMG00000035788 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gvn.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001142569 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106 (C1orf106), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_018265 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106 (C1orf106), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200891341:200915735:1 gene:ENSG00000163362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200894821:200913728:1 gene:ENSG00000163362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200911959:200915728:1 gene:ENSG00000163362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC106877 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:125608 IMAGE:40026425), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087057 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200891341:200915735:1 Gene:OTTHUMG00000035789 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087058 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200894821:200913728:1 Gene:OTTHUMG00000035789 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087059 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200911959:200915728:1 Gene:OTTHUMG00000035789 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ppm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106 (C1orf106), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gvo.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ983818 // GenBank // Homo sapiens C1orf81 mRNA, partial sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gvp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens C1orf81 mRNA, partial sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:201733406:201733505:1 gene:ENSG00000200942 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198149 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 4 (SHISA4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_030775 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 4 (SHISA4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201888680:201892137:1 gene:ENSG00000198892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104444 // GenBank // Homo sapiens shisa homolog 4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:129812 IMAGE:40022864), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111855 // GenBank // Homo sapiens shisa homolog 4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:102893 IMAGE:5762600), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362011 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold295:166421:168029:+ gene:ENSG00000198892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087096 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201888708:201892306:1 Gene:OTTHUMG00000035807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087097 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201888680:201892137:1 Gene:OTTHUMG00000035807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087098 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201888934:201890493:1 Gene:OTTHUMG00000035807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxa.3 // UCSC Genes // Homo sapiens shisa homolog 4 (Xenopus laevis) (SHISA4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021phk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens shisa homolog 4 (Xenopus laevis) (SHISA4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383910 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:201978461:201978595:1 gene:ENSG00000206637 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004767 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 37 like 1 (GPR37L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202122858:202133592:1 gene:ENSG00000170075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541334 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:202091972:202098079:1 gene:ENSG00000170075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050334 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 37 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:49917 IMAGE:5174449), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087496 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202122858:202133592:1 Gene:OTTHUMG00000035924 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens G protein-coupled receptor 37 like 1 (GPR37L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002930 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202168051:202189353:1 gene:ENSG00000243323 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY819761 // GenBank // Homo sapiens PTPRV isoform 1 (PTPRV) pseudogene mRNA, partial sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY819762 // GenBank // Homo sapiens PTPRV isoform 2 (PTPRV) pseudogene mRNA, partial sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY819763 // GenBank // Homo sapiens PTPRV isoform 3 (PTPRV) pseudogene mRNA, partial sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xaa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ppz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pqa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, receptor type, V, pseudogene (PTPRVP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458967 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:202200792:202200892:1 gene:ENSG00000239046 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038135 // RefSeq // Homo sapiens alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein pseudogene (LOC641515), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202820266:202827225:1 gene:ENSG00000184774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000549576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202823257:202827225:1 gene:ENSG00000184774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032956 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC641515, mRNA (cDNA clone MGC:33633 IMAGE:4827085), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099140 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202820266:202827225:1 Gene:OTTHUMG00000041380 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gyh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical protein LOC641515, mRNA (cDNA clone MGC:33633 IMAGE:4827085), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021php.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC641515 (LOC641515), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gyh.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gyh.2 cpcScore=4.3959300 cnci=-0.2416214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006763 // RefSeq // Homo sapiens BTG family, member 2 (BTG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000290551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203305536:203309602:1 gene:ENSG00000159388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105948 // GenBank // Homo sapiens BTG family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126064 IMAGE:40032676), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105949 // GenBank // Homo sapiens BTG family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126063 IMAGE:40032675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087168 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203305536:203309602:1 Gene:OTTHUMG00000035834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087169 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203305491:203309569:1 Gene:OTTHUMG00000035834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens BTG family, member 2 (BTG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002725 // RefSeq // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_201348 // RefSeq // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203475828:203491352:1 gene:ENSG00000188783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032498 // GenBank // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein, mRNA (cDNA clone MGC:45323 IMAGE:5222817), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087474 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203475828:203491352:1 Gene:OTTHUMG00000035911 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzs.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003019 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 77 (SNORA77), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408716 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:203729581:203729705:1 gene:ENSG00000221643 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 77 (SNORA77), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC000988 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 217, mRNA (cDNA clone MGC:5457 IMAGE:3450898), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021phv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Lys (anticodon TTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516052 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:204727991:204728106:1 gene:ENSG00000251861 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038425 // RefSeq // Homo sapiens LEMD1 antisense RNA 1 (LEMD1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205373252:205387440:1 gene:ENSG00000226235 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090400 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:205373252:205387440:1 Gene:OTTHUMG00000037200 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hch.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LEMD1 antisense RNA 1 (LEMD1-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pib.1 // UCSC Genes // transfer RNA Lys (anticodon TTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517288 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:205566716:205566799:1 gene:ENSG00000253097 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000500756 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000500756 cpcScore=-1.3426800 cnci=-0.4534933 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_046097 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC284581 (LOC284581), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK055746 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31184 fis, clone KIDNE2000328. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hdk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC284581 (LOC284581), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000448613 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:206576565:206577294:1 gene:ENSG00000224900 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088498 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:206576565:206577294:1 Gene:OTTHUMG00000036349 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517044 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:206855308:206855380:1 gene:ENSG00000252853 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013371 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_153758 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000270218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206828877:206842622:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206798870:206842981:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// FJ380053 // GenBank // Homo sapiens interleukin 19 isoform 3 precursor (IL19) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088566 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206798870:206842981:1 Gene:OTTHUMG00000036387 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206828877:206842622:1 Gene:OTTHUMG00000036387 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000357843 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206836663:206840614:1 Gene:OTTHUMG00000036387 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001heo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hep.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010prx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018724 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 20 (IL20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206865809:206868914:1 gene:ENSG00000162891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:206865809:206869217:1 gene:ENSG00000162891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY876922 // GenBank // Homo sapiens interleukin 20 short form (IL20) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069311 // GenBank // Homo sapiens interleukin 20, mRNA (cDNA clone MGC:96907 IMAGE:7262116), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074948 // GenBank // Homo sapiens interleukin 20, mRNA (cDNA clone MGC:104052 IMAGE:30915498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117386 // GenBank // Homo sapiens interleukin 20, mRNA (cDNA clone MGC:150995 IMAGE:40125937), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367098 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2061:1321761:1324706:+ gene:ENSG00000162891 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088675 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206865809:206868914:1 Gene:OTTHUMG00000036456 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088676 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206865354:206869223:1 Gene:OTTHUMG00000036456 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001her.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 20 (IL20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xby.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 20 (IL20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517235 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:207688630:207688688:1 gene:ENSG00000253044 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175710 // RefSeq // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like (CR1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444269 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:207818458:207875074:1 gene:ENSG00000197721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207645174:207723703:1 gene:ENSG00000197721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000530905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207669439:207710818:1 gene:ENSG00000197721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY114160 // GenBank // Homo sapiens complement C4b binding protein CR-1 like mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109190 // GenBank // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40000722), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088509 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:207677460:207738416:1 Gene:OTTHUMG00000036354 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088510 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:207669439:207710818:1 Gene:OTTHUMG00000036354 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hfz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like (CR1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hga.4 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like (CR1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hgb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like (CR1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026817 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC148696 (LOC148696), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010psi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC148696 (LOC148696), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010psi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010psi.1 cpcScore=3.0259300 cnci=-0.2365904 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014388 // RefSeq // Homo sapiens digestive organ expansion factor homolog (zebrafish) (DIEXF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209828007:209857565:1 gene:ENSG00000117597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK314061 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94727. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022964 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 107, mRNA (cDNA clone MGC:29875 IMAGE:5110673), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:209828007:209857565:1 Gene:OTTHUMG00000036654 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089128 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:209838805:209844632:1 Gene:OTTHUMG00000036654 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hhr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens digestive organ expansion factor homolog (zebrafish) (DIEXF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xcu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens digestive organ expansion factor homolog (zebrafish) (DIEXF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019605 // RefSeq // Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:210232799:210246255:1 gene:ENSG00000082497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:210237282:210242165:1 gene:ENSG00000082497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK315386 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96433, Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012083 // GenBank // Homo sapiens SERTA domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:19998 IMAGE:4564813), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088577 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210232799:210246255:1 Gene:OTTHUMG00000036391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088578 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210237978:210246631:1 Gene:OTTHUMG00000036391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088579 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210237282:210242165:1 Gene:OTTHUMG00000036391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088580 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210237943:210246628:1 Gene:OTTHUMG00000036391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hhy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xcw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000397651 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:211380389:211381286:1 gene:ENSG00000226986 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026761 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 467 (LINC00467), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211382803:211435333:1 gene:ENSG00000153363 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089831 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211382803:211435333:1 Gene:OTTHUMG00000036998 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089832 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211382837:211391976:1 Gene:OTTHUMG00000036998 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hil.4 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 467 (LINC00467), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390903 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:211803017:211803104:1 gene:ENSG00000212205 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390885 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:212025561:212025682:1 gene:ENSG00000212187 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004389 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 16B (SNORA16B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000364674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:212352816:212352950:1 gene:ENSG00000201544 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xdf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 16B (SNORA16B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013349 // RefSeq // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026598 // RefSeq // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212432973:212446372:1 gene:ENSG00000117691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008823 // GenBank // Homo sapiens neuron derived neurotrophic factor, mRNA (cDNA clone MGC:12619 IMAGE:4303614), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366988 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2363:136621:139287:- gene:ENSG00000117691 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089291 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212432887:212446379:1 Gene:OTTHUMG00000036744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089292 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212432923:212446372:1 Gene:OTTHUMG00000036744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089293 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212432973:212446372:1 Gene:OTTHUMG00000036744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098528 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212432991:212435033:1 Gene:OTTHUMG00000036744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hjd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ptf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153606 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member A (FAM71A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212624474:212626778:1 gene:ENSG00000162771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000545975 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:212797789:212800114:1 gene:ENSG00000162771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035007 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member A, mRNA (cDNA clone MGC:33363 IMAGE:5267155), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098529 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212624474:212626778:1 Gene:OTTHUMG00000041084 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hjk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member A (FAM71A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384760 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:212692264:212692367:1 gene:ENSG00000207491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_046189 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 538 (LINC00538), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000443830 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:214167446:214168426:1 gene:ENSG00000223365 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098643 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:214167446:214168426:1 Gene:OTTHUMG00000041156 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364623 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:218129795:218129952:1 gene:ENSG00000201493 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016052 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae) (RRP15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:218285287:218337983:1 gene:ENSG00000067533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:218285342:218302671:1 gene:ENSG00000067533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020641 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:22291 IMAGE:4772128), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095284 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:218285287:218337983:1 Gene:OTTHUMG00000039494 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:218285342:218302671:1 Gene:OTTHUMG00000039494 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hlj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae) (RRP15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410702 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:242897870:242897953:-1 gene:ENSG00000264972 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516431 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:219836719:219836809:1 gene:ENSG00000252240 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002753 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5F small nuclear 1 (RNU5F-1), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pjd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RNA, U5F small nuclear 1 (RNU5F-1), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408746 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:219962652:219962865:1 gene:ENSG00000221673 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018060 // RefSeq // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (IARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220094102:220148041:1 gene:ENSG00000067704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220140181:220143344:1 gene:ENSG00000067704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137438 // GenBank // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:169059 IMAGE:9021436), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302637 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2047:189731:235206:+ gene:ENSG00000067704 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220094102:220148041:1 Gene:OTTHUMG00000037287 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090762 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220137642:220140218:1 Gene:OTTHUMG00000037287 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220114451:220134846:1 Gene:OTTHUMG00000037287 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090764 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220140181:220143344:1 Gene:OTTHUMG00000037287 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hmc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (IARS2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459443 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:220310506:220310608:1 gene:ENSG00000238576 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021958 // RefSeq // Homo sapiens H2.0-like homeobox (HLX), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220879400:220885059:1 gene:ENSG00000136630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000549319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220879431:220885056:1 gene:ENSG00000136630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007294 // GenBank // Homo sapiens H2.0-like homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:15670 IMAGE:3349581), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033808 // GenBank // Homo sapiens H2.0-like homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:44994 IMAGE:5184776), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220879400:220885059:1 Gene:OTTHUMG00000037352 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090903 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:220881069:220884493:1 Gene:OTTHUMG00000037352 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hmv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens H2.0-like homeobox (HLX), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390805 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:222013007:222013090:-1 gene:ENSG00000212094 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pjh.1 // UCSC Genes // transfer RNA Thr (anticodon TGT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515980 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:223373822:223373956:1 gene:ENSG00000251789 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152610 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 185 (CCDC185), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:223393417:223395470:1 gene:ENSG00000178395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030026 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33402 IMAGE:4822648), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031066 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33445 IMAGE:5272765), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092718 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:223393417:223395470:1 Gene:OTTHUMG00000037987 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hoa.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 65 (C1orf65), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:223690051:223690114:1 gene:ENSG00000212398 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000540997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224008727:224010612:1 gene:ENSG00000185495 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003676 // RefSeq // Homo sapiens delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 (DEGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000323699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:224183171:224193441:1 gene:ENSG00000143753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:224183266:224193157:1 gene:ENSG00000143753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000465848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224183675:224190052:1 gene:ENSG00000143753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000961 // GenBank // Homo sapiens degenerative spermatocyte homolog 1, lipid desaturase (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:5079 IMAGE:3450936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091285 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:224183171:224193441:1 Gene:OTTHUMG00000037496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:224190136:224192440:1 Gene:OTTHUMG00000037496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:224183675:224190052:1 Gene:OTTHUMG00000037496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091731 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:224175756:224192353:1 Gene:OTTHUMG00000037496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hoj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 (DEGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365028 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:224179641:224179767:1 gene:ENSG00000201898 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384160 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:224305380:224305483:1 gene:ENSG00000206887 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459357 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:224524493:224524591:1 gene:ENSG00000238856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516124 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:224722467:224722541:1 gene:ENSG00000251933 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000366845 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:225600404:225602040:1 gene:ENSG00000203691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411374 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:225741275:225741380:1 gene:ENSG00000223306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_031944 // RefSeq // Homo sapiens Mix paired-like homeobox (MIXL1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226223618:226227054:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:226223618:226225864:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000557734 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:226225503:226226389:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111974 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:138179 IMAGE:8327442), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113441 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:142001 IMAGE:8322493), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143784 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:177315 IMAGE:9052298), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091526 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:226223618:226227054:1 Gene:OTTHUMG00000037558 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvm.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Mix paired-like homeobox (MIXL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458942 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:226491963:226492064:1 gene:ENSG00000238545 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_183062 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 38 (PRSS38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227815693:227846470:1 gene:ENSG00000185888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130400 // GenBank // Homo sapiens marapsin 2, mRNA (cDNA clone MGC:163272 IMAGE:40146431), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227815693:227846470:1 Gene:OTTHUMG00000037701 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protease, serine, 38 (PRSS38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597235 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35301, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hrj.2 cpcScore=-1.3748600 cnci=-0.2682617 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59592, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599768 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37834, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42430, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hrk.2 cpcScore=-1.1926700 cnci=-0.0767414 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590432 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57544, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pka.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42618, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574660 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42772, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pkb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42770, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584939 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-52051, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-52050, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599799 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37865, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvu.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pvu.1 cpcScore=-1.2749800 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59586, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575010 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43122, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43121, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575955 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44067, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pkc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41282, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033131 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A (WNT3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228007051:228061260:1 gene:ENSG00000154342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366753 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:228194783:228248168:1 gene:ENSG00000154342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103921 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119418 IMAGE:40007188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103922 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119419 IMAGE:40007189), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103923 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119420 IMAGE:40007191), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091648 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228007051:228061260:1 Gene:OTTHUMG00000037593 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A (WNT3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A (WNT3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020435 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa (GJC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228149852:228159826:1 gene:ENSG00000198835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC089439 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa, mRNA (cDNA clone MGC:105119 IMAGE:30558819), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095985 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228149852:228159826:1 Gene:OTTHUMG00000039771 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hsk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa (GJC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pkg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa (GJC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010867 // RefSeq // Homo sapiens IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (IBA57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228165815:228182257:1 gene:ENSG00000181873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228171178:228182257:1 gene:ENSG00000181873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000546123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228174550:228175575:1 gene:ENSG00000181873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303837 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57476 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095980 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228165815:228182257:1 Gene:OTTHUMG00000039769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095981 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228171178:228182257:1 Gene:OTTHUMG00000039769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hsl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (IBA57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (IBA57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC114461 // GenBank // Homo sapiens obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024804), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hso.3 // UCSC Genes // SubName: Full=OBSCN protein; // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384151 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:228652436:228652560:1 gene:ENSG00000206878 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:229383128:229383188:1 gene:ENSG00000252506 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014777 // RefSeq // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (URB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000258243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:229626234:229660199:1 gene:ENSG00000135763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114559 // GenBank // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:138837 IMAGE:40082897), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC114963 // GenBank // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:138838 IMAGE:40082900), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095232 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:229626234:229660199:1 Gene:OTTHUMG00000039464 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095233 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:229650847:229659126:1 Gene:OTTHUMG00000039464 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hts.1 // UCSC Genes // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (URB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xfd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (URB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004342 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 67 (TRIM67), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366652 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:231298674:231355698:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:231162970:231217024:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444294 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:231162112:231221556:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231162970:231215440:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092649 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231162970:231217024:1 Gene:OTTHUMG00000037958 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092650 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231162970:231215440:1 Gene:OTTHUMG00000037958 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092851 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231162112:231221556:1 Gene:OTTHUMG00000037958 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xfn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 67 (TRIM67), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000381382 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231162928:231221568:1 Gene:OTTHUMG00000037958 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411054 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:231670635:231670750:1 gene:ENSG00000222986 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459179 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:232700204:232700308:1 gene:ENSG00000238382 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019090 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 10 (MAP10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:232804892:232808407:1 gene:ENSG00000212916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036663 // GenBank // Homo sapiens KIAA1383 protein, mRNA (cDNA clone MGC:33261 IMAGE:5266476), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC109122 // GenBank // Homo sapiens KIAA1383, mRNA (cDNA clone MGC:126466 IMAGE:40036000), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092317 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:232804892:232808407:1 Gene:OTTHUMG00000037819 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hvh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microtubule-associated protein 10 (MAP10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173508 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3 (SLC35F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:234214271:234324511:1 gene:ENSG00000183780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366618 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:233904933:234324516:1 gene:ENSG00000183780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037878 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3, mRNA (cDNA clone MGC:43868 IMAGE:5273868), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092579 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:233904933:234324516:1 Gene:OTTHUMG00000037929 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000128322 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234214271:234324511:1 Gene:OTTHUMG00000037929 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hvy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3 (SLC35F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hwa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3 (SLC35F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390842 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:234593275:234593402:1 gene:ENSG00000212144 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033927 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 184 (LINC00184), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234629311:234634780:1 gene:ENSG00000224939 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234629311:234634780:1 Gene:OTTHUMG00000037979 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pkr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 184 (LINC00184), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038856 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1132 (LINC01132), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234724042:234731643:1 gene:ENSG00000227630 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092806 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234724042:234731643:1 Gene:OTTHUMG00000038017 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hwj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506810 (LOC100506810), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:234837976:234838069:1 gene:ENSG00000201638 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pku.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34187 fis, clone FCBBF3017233. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384076 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:235915415:235915521:1 gene:ENSG00000206803 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517013 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:236060677:236060772:1 gene:ENSG00000252822 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001hxp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34584 fis, clone KIDNE2008697. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410718 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:236267780:236267958:1 gene:ENSG00000222650 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516829 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:236464280:236464351:1 gene:ENSG00000252638 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080738 // RefSeq // Homo sapiens EDAR-associated death domain (EDARADD), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_145861 // RefSeq // Homo sapiens EDAR-associated death domain (EDARADD), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:236394278:236482692:1 gene:ENSG00000186197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:236395416:236484914:1 gene:ENSG00000186197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128082 // GenBank // Homo sapiens EDAR-associated death domain, mRNA (cDNA clone MGC:149066 IMAGE:40006675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096368 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:236394278:236482692:1 Gene:OTTHUMG00000039954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096369 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:236395416:236484914:1 Gene:OTTHUMG00000039954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096370 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:236348262:236482319:1 Gene:OTTHUMG00000039954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hxu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EDAR-associated death domain (EDARADD), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hxv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens EDAR-associated death domain (EDARADD), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516017 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:237766512:237766585:1 gene:ENSG00000251826 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027247 // RefSeq // Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member F pseudogene (LOC100130331), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237862175:237928321:1 gene:ENSG00000237250 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095477 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:237862175:237928321:1 Gene:OTTHUMG00000039587 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pyc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member F pseudogene (LOC100130331), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pla.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TGG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036695 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S7 pseudogene 5 (RPS7P5), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pld.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein S7 pseudogene 5 (RPS7P5), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516508 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:240341385:240341477:1 gene:ENSG00000252317 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515941 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:240653367:240653477:1 gene:ENSG00000251750 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362371 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:240698320:240698429:1 gene:ENSG00000199241 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006352 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 18 (ZBTB18), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_205768 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 18 (ZBTB18), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244051283:244057476:1 gene:ENSG00000179456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366538 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:244214583:244219243:1 gene:ENSG00000179456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310634 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17676. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036677 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone MGC:33778 IMAGE:5259205), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:244051283:244057476:1 Gene:OTTHUMG00000040013 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iad.4 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iae.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iaf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA, FLJ17676. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:244954858:244954963:1 gene:ENSG00000252073 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516473 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245023015:245023118:1 gene:ENSG00000252282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515945 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245043928:245044032:1 gene:ENSG00000251754 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408238 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:245370334:245370419:1 gene:ENSG00000221165 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016002 // RefSeq // Homo sapiens saccharopine dehydrogenase (putative) (SCCPDH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366509 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:246887378:246931437:1 gene:ENSG00000143653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:246724047:246768137:1 gene:ENSG00000143653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026185 // GenBank // Homo sapiens saccharopine dehydrogenase (putative), mRNA (cDNA clone MGC:33173 IMAGE:4798194), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096902 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:246724047:246768137:1 Gene:OTTHUMG00000040221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ibr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens saccharopine dehydrogenase (putative) (SCCPDH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_173858 // RefSeq // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5 (gene/pseudogene) (VN1R5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126341 // GenBank // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:161619 IMAGE:8992057), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pyu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5 (gene/pseudogene) (VN1R5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:247294835:247294941:1 gene:ENSG00000202079 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004698 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5 (OR2W5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000522351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247491068:247492147:1 gene:ENSG00000203664 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137203 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168823 IMAGE:9021200), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137204 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168824 IMAGE:9021201), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001icz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5 (OR2W5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26890 fis, clone PRS09675. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001idc.2 cpcScore=-0.7727030 cnci=-0.2497985 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ26890 fis, clone PRS09675. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001915 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 2 (OR2G2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247588360:247589313:1 gene:ENSG00000177489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097623 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247588360:247589313:1 Gene:OTTHUMG00000040575 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pyy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 2 (OR2G2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001914 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3 (OR2G3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247605586:247606515:1 gene:ENSG00000177476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136712 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168325 IMAGE:9020702), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136713 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168326 IMAGE:9020703), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097624 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247605586:247606515:1 Gene:OTTHUMG00000040576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pyz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3 (OR2G3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001957 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3 (OR2W3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_015431 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 58 (TRIM58), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247895587:247896531:1 gene:ENSG00000238243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537741 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:248031277:248060449:1 gene:ENSG00000238243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146848 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:181951 IMAGE:9056776), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX537432 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N09198 (from clone DKFZp686N09198); complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366481 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold809:31495:46345:+ gene:ENSG00000162722 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096860 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247857199:247878205:1 Gene:OTTHUMG00000040203 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096861 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247895587:247896531:1 Gene:OTTHUMG00000040204 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ido.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 58 (TRIM58), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tripartite motif containing 58 (TRIM58), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3 (OR2W3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175911 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13 (OR2L13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248098649:248100922:1 gene:ENSG00000196071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:247937191:248100921:1 gene:ENSG00000196071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028158 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:40047 IMAGE:5240594), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097342 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248098649:248100922:1 Gene:OTTHUMG00000040446 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ids.3 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13 (OR2L13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pmc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13 (OR2L13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001963 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 8 (OR2L8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247948858:247949796:1 gene:ENSG00000196936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140751 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:176428 IMAGE:9021619), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096853 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247948858:247949796:1 Gene:OTTHUMG00000040196 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 8 (OR2L8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004491 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily AK, member 2 (OR2AK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136816 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily AK, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168430 IMAGE:9020807), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366480 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold809:190814:191725:+ gene:ENSG00000187080 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096858 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247965233:247966339:1 Gene:OTTHUMG00000040201 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily AK, member 2 (OR2AK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002145 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 1 pseudogene (OR2L1P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 1 pseudogene (OR2L1P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:247997000:247997096:1 gene:ENSG00000199442 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363215 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:248029120:248029221:1 gene:ENSG00000200085 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004686 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2 (OR2L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248038268:248039206:1 gene:ENSG00000203663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104792 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132452 IMAGE:8143795), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104794 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132454 IMAGE:8143797), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096871 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248038268:248039206:1 Gene:OTTHUMG00000040214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2 (OR2L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364112 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:248045788:248045889:1 gene:ENSG00000200982 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004687 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3 (OR2L3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248060682:248061620:1 gene:ENSG00000198128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137039 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168658 IMAGE:9021035), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096852 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248060682:248061620:1 Gene:OTTHUMG00000040195 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3 (OR2L3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002141 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 1 pseudogene (OR2M1P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 1 pseudogene (OR2M1P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004690 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 5 (OR2M5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248145148:248146086:1 gene:ENSG00000162727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097343 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248145148:248146086:1 Gene:OTTHUMG00000040447 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pze.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 5 (OR2M5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004688 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 2 (OR2M2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248179986:248181029:1 gene:ENSG00000198601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097356 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248179986:248181029:1 Gene:OTTHUMG00000040460 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 2 (OR2M2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004689 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3 (OR2M3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248203068:248204006:1 gene:ENSG00000228198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136970 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168585 IMAGE:9020962), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136971 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168586 IMAGE:9020963), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097355 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248203068:248204006:1 Gene:OTTHUMG00000040459 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3 (OR2M3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017504 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 4 (OR2M4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000306687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248238929:248239864:1 gene:ENSG00000171180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097352 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248238929:248239864:1 Gene:OTTHUMG00000040456 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 4 (OR2M4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001918 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily C, member 36 (OR14C36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248348775:248349713:1 gene:ENSG00000177174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097359 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248348775:248349713:1 Gene:OTTHUMG00000040463 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily C, member 36 (OR14C36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005471 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 6 (OR2T6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248387609:248388535:1 gene:ENSG00000198104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097344 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248387609:248388535:1 Gene:OTTHUMG00000040448 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iei.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 6 (OR2T6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004136 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 2 (OR2T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248452798:248453772:1 gene:ENSG00000196240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136961 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168576 IMAGE:9020953), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136962 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168577 IMAGE:9020954), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097421 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248452798:248453772:1 Gene:OTTHUMG00000040480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iek.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 2 (OR2T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005495 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 3 (OR2T3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136915 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168529 IMAGE:9020906), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136916 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168530 IMAGE:9020907), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359594 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold55:32004:32951:- gene:ENSG00000196539 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097348 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248473351:248474307:1 Gene:OTTHUMG00000040452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iel.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 3 (OR2T3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004697 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5 (OR2T5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248488589:248489536:1 gene:ENSG00000203661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140747 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176424 IMAGE:9021615), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140915 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176592 IMAGE:9056727), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097422 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248488589:248489536:1 Gene:OTTHUMG00000040481 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iem.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5 (OR2T5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013355 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6 (OR2G6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248521647:248522597:1 gene:ENSG00000188558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137245 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168865 IMAGE:9021242), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137266 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168886 IMAGE:9021263), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097358 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248521647:248522597:1 Gene:OTTHUMG00000040462 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ien.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6 (OR2G6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pmf.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAA) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pmg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026818 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 138, member A (FAM138A), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026820 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 138, member F (FAM138F), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34554:36081:-1 gene:ENSG00000237613 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35245:36073:-1 gene:ENSG00000237613 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002842 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34554:36081:-1 Gene:OTTHUMG00000000960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002843 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35245:36073:-1 Gene:OTTHUMG00000000960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aak.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 138, member F (FAM138F), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aak.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001aak.2 cpcScore=2.0818100 cnci=-0.1835329 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000484859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:141474:149707:-1 gene:ENSG00000241860 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:142808:146831:-1 gene:ENSG00000241860 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007035 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:141474:149707:-1 Gene:OTTHUMG00000002480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007036 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:142808:146831:-1 Gene:OTTHUMG00000002480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410691 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:157784:157887:-1 gene:ENSG00000222623 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000466557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:146386:173862:-1 gene:ENSG00000241860 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165889:168767:-1 gene:ENSG00000241860 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007037 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:146386:173862:-1 Gene:OTTHUMG00000002480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007168 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:165889:168767:-1 Gene:OTTHUMG00000002480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005221 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001005224 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 (OR4F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001005277 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 (OR4F16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:685716:686654:-1 gene:ENSG00000273547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000185097 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137547 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169170 IMAGE:9021547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137568 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169191 IMAGE:9021568), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007334 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:685716:686654:-1 Gene:OTTHUMG00000002581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575786 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43898, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abi.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abi.1 cpcScore=-1.2232100 cnci=-0.0313611 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42430, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599872 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37938, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abj.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abj.2 cpcScore=-1.3748600 cnci=-0.2560654 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59592, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575786 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-43898, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxw.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010nxw.1 cpcScore=-1.2232100 cnci=-0.0325668 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42430, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599872 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37938, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abl.2 cpcScore=-1.3748600 cnci=-0.2768238 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59592, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411249 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:758233:758336:-1 gene:ENSG00000223181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033908 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100288069 (LOC100288069), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:764857:778626:-1 gene:ENSG00000228327 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006889 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:764857:778626:-1 Gene:OTTHUMG00000002406 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006892 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:759032:764925:-1 Gene:OTTHUMG00000002409 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens general transcription factor IIi pseudogene (LOC100288069), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:759032:764925:-1 gene:ENSG00000240618 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006886 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:800879:810161:-1 Gene:OTTHUMG00000002403 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007014 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:810109:817712:-1 Gene:OTTHUMG00000002467 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000435300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:810109:817712:-1 gene:ENSG00000240453 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:800879:810161:-1 gene:ENSG00000230092 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024321 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 115 (LINC00115), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:826206:827522:-1 gene:ENSG00000225880 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536430 // ENSEMBL // [retired]ensembl:lincRNA chromosome:GRCh37:1:761589:762886:-1 gene:ENSG00000225880 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000280398 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:826206:827522:-1 Gene:OTTHUMG00000141258 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nxx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 115 (LINC00115), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027055 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member C (FAM41C), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000427857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:868403:876802:-1 gene:ENSG00000230368 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000432963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:868240:870201:-1 gene:ENSG00000230368 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:868071:876903:-1 gene:ENSG00000230368 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:868071:876903:-1 Gene:OTTHUMG00000002469 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007022 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:868403:876802:-1 Gene:OTTHUMG00000002469 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007023 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:868240:870201:-1 Gene:OTTHUMG00000002469 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abt.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 41, member C (FAM41C), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abt.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abt.3 cpcScore=0.0733139 cnci=-0.2695126 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408219 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:808847:808957:-1 gene:ENSG00000221146 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000341290 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:975204:982093:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:975205:981029:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:975205:976641:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006300 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 170, mRNA (cDNA clone IMAGE:4080218), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027693 // NONCODE // accn=NR_027693 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027693 cpcScore=7.9722500 cnci=-0.0625829 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097943 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:975204:982093:-1 Gene:OTTHUMG00000040757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000101761 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:975205:976641:-1 Gene:OTTHUMG00000040757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 170 (C1orf170), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ach.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 170 (C1orf170), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003327 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (TNFRSF4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1211326:1214132:-1 gene:ENSG00000186827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1211340:1214138:-1 gene:ENSG00000186827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040257 // GenBank HTC // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5180287), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC105070 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:132730 IMAGE:8144073), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004086 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1211326:1214132:-1 Gene:OTTHUMG00000001415 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004087 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1211340:1214138:-1 Gene:OTTHUMG00000001415 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004088 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1212019:1213498:-1 Gene:OTTHUMG00000001415 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ade.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (TNFRSF4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (TNFRSF4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001014980 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 132, member A (FAM132A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1242453:1246722:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1242446:1243463:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC089443 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 132, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105127 IMAGE:30554756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004080 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1242453:1246722:-1 Gene:OTTHUMG00000001412 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1243266:1244418:-1 Gene:OTTHUMG00000001412 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005164 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1243981:1244724:-1 Gene:OTTHUMG00000001412 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005165 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1242446:1243463:-1 Gene:OTTHUMG00000001412 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005166 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1242449:1243158:-1 Gene:OTTHUMG00000001412 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 132, member A (FAM132A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000439191 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:1360832:1363179:-1 gene:ENSG00000230270 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008136 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000008136 cpcScore=-1.0436900 cnci=-0.2385414 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000428781 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:1363502:1365635:-1 gene:ENSG00000236239 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008137 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000008137 cpcScore=-1.1864700 cnci=-0.2626476 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001114748 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 240 (TMEM240), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1535174:1540357:-1 gene:ENSG00000205090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:1535207:1540453:-1 gene:ENSG00000205090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147018 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:182121 IMAGE:9056946), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC147020 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:182123 IMAGE:9056948), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1535174:1540357:-1 Gene:OTTHUMG00000042193 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vkf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 240 (TMEM240), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242659 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 233 (C1orf233), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1598012:1600096:-1 gene:ENSG00000228594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000337408 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:1598012:1600096:-1 Gene:OTTHUMG00000154864 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oes.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 233 (C1orf233), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC104661 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle 2-like 2 (PITSLRE proteins), mRNA (cDNA clone IMAGE:4731476), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ahc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cell division cycle 2-like 1 (PITSLRE proteins), mRNA (cDNA clone IMAGE:4121554), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000545087 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:2143360:2145620:-1 gene:ENSG00000203301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024489 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N pseudogene (LOC100129534), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ajc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N pseudogene (LOC100129534), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010926 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 5 (HES5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:2528745:2530245:-1 gene:ENSG00000197921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC087840 // GenBank // Homo sapiens hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102848 IMAGE:6204648), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002102 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:2528745:2530245:-1 Gene:OTTHUMG00000000793 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ajn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy and enhancer of split 5 (Drosophila) (HES5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001242672 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 34 (TTC34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401094 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:2635976:2801721:-1 gene:ENSG00000215912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:2641368:2789665:-1 gene:ENSG00000215912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001290 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:2783726:2789715:-1 Gene:OTTHUMG00000000539 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oey.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 34 (TTC34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030277 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 551a (MIR551A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385042 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:3560695:3560790:-1 gene:ENSG00000207776 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ofa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 551a (MIR551A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020710 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 47 (LRRC47), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3778558:3796504:-1 gene:ENSG00000130764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3781135:3784175:-1 gene:ENSG00000130764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031301 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:39317 IMAGE:4330114), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009744 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3778558:3796504:-1 Gene:OTTHUMG00000003506 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009745 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3781135:3784175:-1 Gene:OTTHUMG00000003506 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009746 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3781290:3784047:-1 Gene:OTTHUMG00000003506 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001akx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 47 (LRRC47), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207356 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174 (C1orf174), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3889125:3900285:-1 gene:ENSG00000198912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3889125:3900293:-1 gene:ENSG00000198912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC047611 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174, mRNA (cDNA clone IMAGE:5758800), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC067302 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174, mRNA (cDNA clone MGC:75526 IMAGE:30409047), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010539 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3889125:3900285:-1 Gene:OTTHUMG00000003739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010540 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3889125:3900293:-1 Gene:OTTHUMG00000003739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010541 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:3889125:3900247:-1 Gene:OTTHUMG00000003739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001alf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174 (C1orf174), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vls.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174 (C1orf174), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001561 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9 (TNFRSF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:7933127:7938304:-1 gene:ENSG00000049249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006196 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:2172 IMAGE:2924109), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377507 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold858:52391:58625:- gene:ENSG00000049249 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003622 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7919847:7940866:-1 Gene:OTTHUMG00000001223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003623 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7933127:7938304:-1 Gene:OTTHUMG00000001223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083600 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:7921800:7935100:-1 Gene:OTTHUMG00000001223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aot.3 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9 (TNFRSF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ofs.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon ???) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363474 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:7982881:7982983:-1 gene:ENSG00000200344 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018948 // RefSeq // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1 (ERRFI1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467067 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:8013427:8015633:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012839 // GenBank HTC // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4178738), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025337 // GenBank // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:39368 IMAGE:4810371), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377482 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold858:136524:139068:- gene:ENSG00000116285 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003617 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8011719:8026308:-1 Gene:OTTHUMG00000001221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003618 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8013427:8015633:-1 Gene:OTTHUMG00000001221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003619 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8004404:8026283:-1 Gene:OTTHUMG00000001221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003620 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8013739:8026296:-1 Gene:OTTHUMG00000001221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083597 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:8014040:8026296:-1 Gene:OTTHUMG00000001221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aoz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1 (ERRFI1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001apa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1 (ERRFI1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000423628 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:8066074:8066784:-1 gene:ENSG00000225820 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003621 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000003621 cpcScore=1.2229800 cnci=-0.1463129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8206434:8206597:-1 gene:ENSG00000200975 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516168 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8292157:8292263:-1 gene:ENSG00000251977 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC113958 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC54744, mRNA (cDNA clone IMAGE:40021985). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001apg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens hypothetical LOC54744, mRNA (cDNA clone IMAGE:4607730), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408156 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8511795:8511919:-1 gene:ENSG00000221083 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410579 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:8796571:8796673:-1 gene:ENSG00000222511 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364855 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8883427:8883533:-1 gene:ENSG00000201725 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207420 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (SLC2A7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9003300:9026345:-1 gene:ENSG00000197241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127768 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9003300:9026345:-1 Gene:OTTHUMG00000057499 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vmo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (SLC2A7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029610 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 34a (MIR34A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:9151668:9151777:-1 gene:ENSG00000207865 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// EF609116 // GenBank // Homo sapiens precursor microRNA mir-34a, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004910 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9182007:9202619:-1 Gene:OTTHUMG00000001762 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vmq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA mir-34. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ofw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 34a (MIR34A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9182007:9202619:-1 gene:ENSG00000228526 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027045 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 200 (C1orf200), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000377320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9652610:9654586:-1 gene:ENSG00000179840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:9652610:9654586:-1 Gene:OTTHUMG00000001452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aqc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 200 (C1orf200), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC130506 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC645010, mRNA (cDNA clone MGC:163378 IMAGE:40146537), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384484 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:11059919:11060002:-1 gene:ENSG00000207213 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458795 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:11229564:11229670:-1 gene:ENSG00000238547 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006172 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide A (NPPA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11845879:11848345:-1 gene:ENSG00000175206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11845709:11847783:-1 gene:ENSG00000175206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005893 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor A, mRNA (cDNA clone MGC:14467 IMAGE:4273949), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006852 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11845709:11847783:-1 Gene:OTTHUMG00000002388 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006853 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11845879:11848345:-1 Gene:OTTHUMG00000002388 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ati.3 // UCSC Genes // Homo sapiens natriuretic peptide A (NPPA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002521 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide B (NPPB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11857464:11858931:-1 gene:ENSG00000120937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474547 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:11917522:11918957:-1 gene:ENSG00000120937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025785 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor B, mRNA (cDNA clone MGC:34579 IMAGE:5229356), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006854 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:11857464:11858931:-1 Gene:OTTHUMG00000002389 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001atj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens natriuretic peptide B (NPPB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006855 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:11917522:11918957:-1 Gene:OTTHUMG00000002389 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364931 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11909808:11909927:-1 gene:ENSG00000201801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365591 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:12024012:12024124:-1 gene:ENSG00000202461 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12077881:12077984:-1 gene:ENSG00000201135 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517160 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:12221148:12221271:-1 gene:ENSG00000252969 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408413 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12569972:12570072:-1 gene:ENSG00000221340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001146344 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 11 (PRAMEF11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331684 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:12884469:12888648:-1 gene:ENSG00000204513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535591 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:12884468:12891264:-1 gene:ENSG00000204513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144426 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:177964 IMAGE:9052947), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005460 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12824605:12831410:-1 Gene:OTTHUMG00000001929 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 11 (PRAMEF11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013631 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1 (HNRNPCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001146181 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like (LOC649330), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12847408:12848725:-1 gene:ENSG00000179172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137258 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:168878 IMAGE:9021255), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171859 // GenBank // Homo sapiens similar to Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like dJ845O24.4 (hnRNP core protein C-like), mRNA (cDNA clone MGC:198574 IMAGE:9054513), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171865 // GenBank // Homo sapiens similar to Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like dJ845O24.4 (hnRNP core protein C-like), mRNA (cDNA clone MGC:198580 IMAGE:9054519), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005462 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12847408:12848725:-1 Gene:OTTHUMG00000001931 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vno.2 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like (LOC649330), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1 (HNRNPCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001009611 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 4 (PRAMEF4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12879224:12886201:-1 gene:ENSG00000243073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005518 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12879224:12886201:-1 Gene:OTTHUMG00000001987 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aun.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 4 (PRAMEF4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001039361 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 10 (PRAMEF10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12892896:12898270:-1 gene:ENSG00000187545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112208 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 10, mRNA (cDNA clone MGC:138413 IMAGE:8327676), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005512 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:12892896:12898270:-1 Gene:OTTHUMG00000001981 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 10 (PRAMEF10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000158512 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13049476:13056491:-1 Gene:OTTHUMG00000074727 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:13049476:13056491:-1 gene:ENSG00000274764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000239810 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000434606 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:13129793:13131409:1 gene:ENSG00000229978 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136561 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 (HNRNPCL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144551 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like, mRNA (cDNA clone MGC:178095 IMAGE:9053078), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157858 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like, mRNA (cDNA clone MGC:189753 IMAGE:9057077), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like (LOC440563), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013692 // RefSeq // [retired]Homo sapiens PRAME family member 3 (PRAMEF3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001100631 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 22 (PRAMEF22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000353410 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13328196:13331692:-1 gene:ENSG00000204503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376173 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13328196:13331692:-1 gene:ENSG00000204503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026088 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13328196:13331692:-1 Gene:OTTHUMG00000009404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aut.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 3 (PRAMEF3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:13279125:13279231:-1 gene:ENSG00000207511 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012276 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:13281035:13285154:-1 gene:ENSG00000182330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140755 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:176432 IMAGE:9021623), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144565 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:178110 IMAGE:9053093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022043 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13281035:13285154:-1 Gene:OTTHUMG00000008037 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010obh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099790 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 19 (PRAMEF19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001099850 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member-like (LOC391003), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376126 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:1:13474689:13477522:-1 gene:ENSG00000204491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008177 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:13474689:13477522:-1 Gene:OTTHUMG00000002932 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 19 (PRAMEF19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001012276 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001012277 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 7 (PRAMEF7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140755 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:176432 IMAGE:9021623), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144565 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:178110 IMAGE:9053093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001auy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 8 (PRAMEF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099854 // RefSeq // [retired] Homo sapiens PRAME family member 14 (PRAMEF14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:13342366:13347134:-1 gene:ENSG00000204481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344998 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:13668269:13673511:-1 gene:ENSG00000204481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021791 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13342366:13347134:-1 Gene:OTTHUMG00000007916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vnw.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001099790 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 19 (PRAMEF19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001099850 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member-like (LOC391003), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13369067:13371693:-1 gene:ENSG00000204480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13241275:13244713:-1 gene:ENSG00000277853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000204480 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13369067:13371693:-1 Gene:OTTHUMG00000007919 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vny.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRAME family member 19 (PRAMEF19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010847 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 38 (LRRC38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000376085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13474977:13514048:-1 gene:ENSG00000162494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021793 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:13474977:13514048:-1 Gene:OTTHUMG00000007918 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001avb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 38 (LRRC38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411020 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:13623184:13623284:-1 gene:ENSG00000222952 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517276 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:13696070:13696199:-1 gene:ENSG00000253085 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:14124233:14124335:-1 gene:ENSG00000252151 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027136 // RefSeq // Homo sapiens TMEM51 antisense RNA 1 (TMEM51-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000310916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15115953:15152464:-1 gene:ENSG00000175147 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK074283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23703 fis, clone HEP10820. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005695 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15115953:15152464:-1 Gene:OTTHUMG00000002043 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092380 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15115952:15152402:-1 Gene:OTTHUMG00000002043 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001avv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens TMEM51 antisense RNA 1 (TMEM51-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009voh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens TMEM51 antisense RNA 1 (TMEM51-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000376005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15168474:15171317:-1 gene:ENSG00000204464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:15164344:15171317:-1 gene:ENSG00000204464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092383 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15168474:15171317:-1 Gene:OTTHUMG00000037852 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024758 // RefSeq // Homo sapiens agmatine ureohydrolase (agmatinase) (AGMAT), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15572353:15585110:-1 gene:ENSG00000116771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005090 // GenBank // Homo sapiens agmatine ureohydrolase (agmatinase), mRNA (cDNA clone MGC:13078 IMAGE:3837251), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006763 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15572353:15585110:-1 Gene:OTTHUMG00000002357 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001awv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens agmatine ureohydrolase (agmatinase) (AGMAT), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:15608078:15608145:-1 gene:ENSG00000252417 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001089591 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein-like (UQCRHL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vol.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein-like (UQCRHL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024279 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC729614 (FLJ37453), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15834479:15848147:-1 gene:ENSG00000179743 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025992 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:15834479:15848147:-1 Gene:OTTHUMG00000009375 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC729614 (FLJ37453), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576383 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44495, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44494, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182623 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C (FAM131C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16057769:16073626:-1 gene:ENSG00000185519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16058279:16073632:-1 gene:ENSG00000185519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016848 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:10240 IMAGE:3913592), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037394 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:35515 IMAGE:5198517), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026319 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16057769:16073626:-1 Gene:OTTHUMG00000009525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026320 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16058279:16073632:-1 Gene:OTTHUMG00000009525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001axz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C (FAM131C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004431 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16124337:16156087:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16148378:16156052:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037166 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A2, mRNA (cDNA clone MGC:29717 IMAGE:5090654), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// EU826606 // GenBank // Homo sapiens soluble EPHA2 variant 1 (EPHA2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026322 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16124337:16156087:-1 Gene:OTTHUMG00000009527 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026323 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16148378:16156052:-1 Gene:OTTHUMG00000009527 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026324 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16134560:16146450:-1 Gene:OTTHUMG00000009527 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085366 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16133013:16133562:-1 Gene:OTTHUMG00000009527 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aya.2 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oca.2 // UCSC Genes // Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000442385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16215909:16217160:-1 gene:ENSG00000237276 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16216457:16217328:-1 gene:ENSG00000237276 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006295 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16216457:16217328:-1 Gene:OTTHUMG00000002221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092470 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16215909:16217160:-1 Gene:OTTHUMG00000002221 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030907 // RefSeq // Homo sapiens REM2 and RAB-like small GTPase 1 (RSG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16231700:16237162:-1 gene:ENSG00000132881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375605 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:16555368:16556038:-1 gene:ENSG00000204377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488510 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:16555170:16563495:-1 gene:ENSG00000132881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC002946 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 89, mRNA (cDNA clone MGC:10731 IMAGE:3955163), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008702 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 89, mRNA (cDNA clone MGC:15466 IMAGE:2966866), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006279 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16231700:16237162:-1 Gene:OTTHUMG00000002214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092463 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:16232281:16236659:-1 Gene:OTTHUMG00000002214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ayd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens REM2 and RAB-like small GTPase 1 (RSG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006280 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:16555170:16563495:-1 Gene:OTTHUMG00000002214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023386 // RefSeq // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 3 (CROCCP3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033082 // GenBank // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:2960715). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ays.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 3 (CROCCP3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ayt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 3 (CROCCP3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383925 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:16514122:16514285:-1 gene:ENSG00000206652 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogp.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogq.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogs.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon CCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogt.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000535991 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000535991 cpcScore=-1.4332400 cnci=-0.1791463 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:16666785:16666948:-1 gene:ENSG00000207513 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogw.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon CCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ogx.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026567 // RefSeq // Homo sapiens espin pseudogene (ESPNP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000414828 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:16687339:16692309:-1 gene:ENSG00000268869 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16691218:16720157:-1 gene:ENSG00000268869 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK294247 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60011 complete cds, moderately similar to Homo sapiens espin (ESPN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001azn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens espin pseudogene (ESPNP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ocj.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000389184 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:17081405:17087579:-1 gene:ENSG00000186715 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16757232:16764480:-1 gene:ENSG00000186715 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307907 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97855. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_002729 // NONCODE // accn=NR_002729 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002729 cpcScore=4.0029800 cnci=-0.2061064 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334998 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:17081603:17090975:-1 gene:ENSG00000186715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001azp.4 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ock.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ohb.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000356370 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:17196254:17198668:-1 gene:ENSG00000196690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408735 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:18897071:18897148:-1 gene:ENSG00000221662 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040288 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_040289 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:19267130:19274151:-1 gene:ENSG00000211454 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:19267103:19274194:-1 gene:ENSG00000211454 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007163 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19267103:19274194:-1 Gene:OTTHUMG00000002520 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127796 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19265982:19273941:-1 Gene:OTTHUMG00000002520 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000346740 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19270533:19271269:-1 Gene:OTTHUMG00000002520 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ohn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oho.1 // UCSC Genes // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012067 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase) (AKR7A3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19282558:19289250:-1 gene:ENSG00000162482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025709 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34394 IMAGE:5224626), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031562 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34393 IMAGE:5184829), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC042420 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34818 IMAGE:5186889), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007166 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19282558:19289250:-1 Gene:OTTHUMG00000002523 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bbv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase) (AKR7A3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037847 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100506730 (LOC100506730), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ohp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506730 (LOC100506730), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:19305076:19305182:-1 gene:ENSG00000200403 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458906 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:19858664:19858768:-1 gene:ENSG00000239027 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019062 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 186 (RNF186), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19814029:19815278:-1 gene:ENSG00000178828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030960 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:32566 IMAGE:4592873), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC051880 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:60270 IMAGE:5224608), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007694 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19814029:19815278:-1 Gene:OTTHUMG00000002709 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bcr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 186 (RNF186), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014589 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IIE (PLA2G2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19920009:19923617:-1 gene:ENSG00000188784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007684 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:19920009:19923617:-1 Gene:OTTHUMG00000002702 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bct.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phospholipase A2, group IIE (PLA2G2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018584 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 1 (CAMK2N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000375078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20482391:20486220:-1 gene:ENSG00000162545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20483187:20484645:-1 gene:ENSG00000162545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007949 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20482391:20486220:-1 Gene:OTTHUMG00000002837 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007950 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20483187:20484645:-1 Gene:OTTHUMG00000002837 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 1 (CAMK2N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024544 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 (MUL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20499448:20508161:-1 gene:ENSG00000090432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC010101 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19697 IMAGE:3508192), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014010 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19881 IMAGE:4026435), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007951 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:20499448:20508161:-1 Gene:OTTHUMG00000002838 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bdi.4 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 (MUL1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408881 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:20988314:20988432:-1 gene:ENSG00000221808 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ben.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35532 fis, clone SPLEN2002343. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408854 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:21592411:21592548:-1 gene:ENSG00000221781 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030761 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4 (WNT4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000290167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22117305:22142966:-1 gene:ENSG00000162552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374655 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:22453760:22469519:-1 gene:ENSG00000162552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542383 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:22446521:22470385:-1 gene:ENSG00000162552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296058 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57881 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC057781 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:71587 IMAGE:30330746), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008088 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22117305:22142966:-1 Gene:OTTHUMG00000002894 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008089 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22127038:22129851:-1 Gene:OTTHUMG00000002894 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008090 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:22127474:22143969:-1 Gene:OTTHUMG00000002894 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bfs.4 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4 (WNT4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010odt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4 (WNT4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000314113 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:23516993:23520755:-1 gene:ENSG00000179546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000864 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, G protein-coupled (HTR1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007720 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, mRNA (cDNA clone MGC:12645 IMAGE:4299633), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374619 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold977:58479:59612:- gene:ENSG00000179546 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23191895:23194729:-1 Gene:OTTHUMG00000003235 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bgn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, G protein-coupled (HTR1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077195 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_030634 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000314011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23359448:23369442:-1 gene:ENSG00000125945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23359975:23368386:-1 gene:ENSG00000125945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374609 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:23686467:23694831:-1 gene:ENSG00000125945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC056400 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 436, mRNA (cDNA clone MGC:50766 IMAGE:5244536), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008908 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23359448:23369442:-1 Gene:OTTHUMG00000003232 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008910 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23359975:23368386:-1 Gene:OTTHUMG00000003232 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bgt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bgu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008909 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23359974:23368338:-1 Gene:OTTHUMG00000003232 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038455 // GenBank HTC // Homo sapiens, Similar to hypothetical protein FLJ20489, clone IMAGE:4509288, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bhd.2 cpcScore=0.5086580 cnci=-0.2237828 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhd.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004091 // RefSeq // Homo sapiens E2F transcription factor 2 (E2F2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23506430:23531220:-1 gene:ENSG00000007968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23516359:23519396:-1 gene:ENSG00000007968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053676 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:61488 IMAGE:6170186), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008885 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23506430:23531220:-1 Gene:OTTHUMG00000003223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008886 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23516359:23519396:-1 Gene:OTTHUMG00000003223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens E2F transcription factor 2 (E2F2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002167 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein (ID3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23557918:23559794:-1 gene:ENSG00000117318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23558445:23559443:-1 gene:ENSG00000117318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003107 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein, mRNA (cDNA clone MGC:1988 IMAGE:3543936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008904 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23557918:23559794:-1 Gene:OTTHUMG00000003229 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008905 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23558445:23559443:-1 Gene:OTTHUMG00000003229 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091255 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23557934:23559075:-1 Gene:OTTHUMG00000003229 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhh.4 // UCSC Genes // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein (ID3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000147 // RefSeq // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue (FUCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374475 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:24171998:24194780:-1 gene:ENSG00000179163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23845077:23868294:-1 gene:ENSG00000179163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295535 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56770 complete cds, highly similar to Tissue alpha-L-fucosidase precursor (EC 3.2.1.51). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310143 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17185. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017338 // GenBank // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:29579 IMAGE:4871788), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008259 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23845077:23868294:-1 Gene:OTTHUMG00000002965 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bie.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue (FUCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vqt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue (FUCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oed.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue (FUCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001841 // RefSeq // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage) (CNR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536471 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:24197017:24285549:-1 gene:ENSG00000188822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069722 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:97279 IMAGE:7262528), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074767 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:103805 IMAGE:30915186), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374472 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold977:670394:671492:- gene:ENSG00000188822 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038949 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:23870526:23913362:-1 Gene:OTTHUMG00000013892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bif.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage) (CNR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oij.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage) (CNR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ588542 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55654, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oit.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-30091, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021258 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK226001 // GenBank // Homo sapiens mRNA for interleukin 22 receptor, alpha 1 variant, clone: FCC109E09. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK304454 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51773 complete cds, highly similar to Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308522 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98563. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029273 // GenBank // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:34232 IMAGE:4347189), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000270800 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold977:927477:955372:- gene:ENSG00000142677 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008412 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:24119771:24143121:-1 Gene:OTTHUMG00000003041 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001biq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vrb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oeg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oeh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597487 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35553, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oiu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-35553, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ601330 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-39396, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oiv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43071, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459063 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:24796844:24796929:-1 gene:ENSG00000238757 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_045407 // RefSeq // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 2, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_045408 // RefSeq // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 1, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_045409 // RefSeq // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 3, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HQ317425 // GenBank // Homo sapiens RCAN3 antisense isoform 1,3 (RCAN3AS) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oiy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 3, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oiz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 1, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oja.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 2, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ojb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens RCAN3 antisense (RCAN3AS), transcript variant 3, antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445805 // ENSEMBL // [retired] ensembl_havana_lincrna:lincRNA chromosome:GRCh37:1:24863138:24865371:-1 gene:ENSG00000231779 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459380 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:24625411:24625513:-1 gene:ENSG00000239106 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459464 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:24993474:24993578:-1 gene:ENSG00000238986 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:24777873:24777979:-1 gene:ENSG00000238482 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451939 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:25451544:25451870:-1 gene:ENSG00000233419 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bkd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34506 fis, clone HLUNG2005924. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459565 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:25672765:25672868:-1 gene:ENSG00000238889 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024498 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC646471 (LOC646471), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oeu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC646471 (LOC646471), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:25818491:25820797:-1 gene:ENSG00000228172 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense gene:ENSG00000223474 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024037 // RefSeq // Homo sapiens aurora kinase A and ninein interacting protein (AUNIP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25834006:25859412:-1 gene:ENSG00000127423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481602 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:25834006:25837547:-1 gene:ENSG00000127423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000538789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:25831913:25859458:-1 gene:ENSG00000127423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000209 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 135, mRNA (cDNA clone MGC:2603 IMAGE:3350471), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019309 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:25834006:25859412:-1 Gene:OTTHUMG00000007372 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019311 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:25834006:25837547:-1 Gene:OTTHUMG00000007372 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bkw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens aurora kinase A and ninein interacting protein (AUNIP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178422 // RefSeq // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25861210:25871253:-1 gene:ENSG00000182749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034015 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII, mRNA (cDNA clone MGC:22013 IMAGE:4400504), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019312 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:25861210:25871253:-1 Gene:OTTHUMG00000007373 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bkx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ojm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032588 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 63, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM63), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26051304:26067633:-1 gene:ENSG00000158022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26061244:26068436:-1 gene:ENSG00000158022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC080529 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 63, mRNA (cDNA clone MGC:99548 IMAGE:4862321), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019750 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26051304:26067633:-1 Gene:OTTHUMG00000007510 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019751 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26061244:26068436:-1 Gene:OTTHUMG00000007510 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bli.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516993 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26593940:26594041:-1 gene:ENSG00000252802 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26642286:26642389:-1 gene:ENSG00000238316 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010ofi.1 // UCSC Genes // Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016887 3' read SFN mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515362 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:27218269:27219052:-1 gene:ENSG00000251020 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012184 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:27218269:27219052:-1 Gene:OTTHUMG00000004230 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021969 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (NR0B2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000254227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26911489:26913966:-1 gene:ENSG00000131910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030207 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:34176 IMAGE:5222402), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012185 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26911489:26913966:-1 Gene:OTTHUMG00000004231 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bnf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (NR0B2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152365 // RefSeq // Homo sapiens keratinocyte differentiation factor 1 (KDF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000320567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26949562:26960406:-1 gene:ENSG00000175707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000374109 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:27276056:27286876:-1 gene:ENSG00000175707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033143 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 172, mRNA (cDNA clone MGC:45763 IMAGE:3960220), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012340 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:26949562:26960406:-1 Gene:OTTHUMG00000004272 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bni.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 172 (C1orf172), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052943 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B (FAM46B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012790 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:16491 IMAGE:3957388), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014160 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:20845 IMAGE:4542896), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000289166 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold14:469758:470402:- gene:ENSG00000158246 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:27005020:27012836:-1 Gene:OTTHUMG00000004278 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ofj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B (FAM46B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516289 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:27255464:27255567:-1 gene:ENSG00000252098 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001201404 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_006990 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000430629 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:27730730:27816669:-1 gene:ENSG00000158195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27408197:27490051:-1 gene:ENSG00000158195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040943 // GenBank // Homo sapiens WAS protein family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:48747 IMAGE:4385298), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009516 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:27404226:27490158:-1 Gene:OTTHUMG00000003393 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bof.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ofl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384040 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27675603:27675709:-1 gene:ENSG00000206767 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000450821 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:28356225:28357423:-1 gene:ENSG00000237895 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011177 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:28356225:28357423:-1 Gene:OTTHUMG00000003913 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014752 // RefSeq // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 2 homolog (S. cerevisiae) (SPCS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027268 // NONCODE // accn=NR_027268 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027268 cpcScore=4.5312200 cnci=-0.3889910 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543748 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:28421582:28422833:-1 gene:ENSG00000228589 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ofv.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517196 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28142737:28142841:-1 gene:ENSG00000253005 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516620 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:26602369:26602432:-1 gene:ENSG00000252429 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384052 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28422555:28422655:-1 gene:ENSG00000206779 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000499627 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000499627 cpcScore=-1.3368300 cnci=-0.2728058 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003077 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 99 (SNORD99), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408612 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28578749:28578822:-1 gene:ENSG00000221539 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bqq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 99 (SNORD99), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362886 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28881726:28881835:-1 gene:ENSG00000199756 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408623 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:29253573:29253672:-1 gene:ENSG00000221550 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408199 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:29644545:29644678:-1 gene:ENSG00000221126 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006762 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 5 (LAPTM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:30732469:30757820:-1 gene:ENSG00000162511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424259 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:31206300:31230621:-1 gene:ENSG00000162511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30741689:30757757:-1 gene:ENSG00000162511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC106896 // GenBank // Homo sapiens lysosomal multispanning membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:125860 IMAGE:40030918), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010463 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:30732469:30757820:-1 Gene:OTTHUMG00000003707 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010464 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:30741689:30757757:-1 Gene:OTTHUMG00000003707 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010465 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:30733889:30746229:-1 Gene:OTTHUMG00000003707 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bsc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 5 (LAPTM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004054 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103A (SNORD103A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033295 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103B (SNORD103B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000363284 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:31408535:31408620:-1 gene:ENSG00000200154 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021okk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103A (SNORD103A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vts.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009vts.1 cpcScore=-1.3013600 cnci=-0.4604189 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_004054 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103A (SNORD103A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033295 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103B (SNORD103B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000365237 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:31421964:31422049:-1 gene:ENSG00000202107 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021okl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103A (SNORD103A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vts.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009vts.1 cpcScore=-1.3013600 cnci=-0.4604189 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003066 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 85 (SNORD85), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000363311 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:31441011:31441083:-1 gene:ENSG00000200181 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bsl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 85 (SNORD85), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024522 // RefSeq // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 1 (NKAIN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263693 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:31652593:31661000:-1 gene:ENSG00000084628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:31179745:31239554:-1 gene:ENSG00000084628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000398657 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:31653559:31661000:-1 gene:ENSG00000084628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000528449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31180540:31181676:-1 gene:ENSG00000084628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298874 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51944 complete cds, moderately similar to Homo sapiens T-cell lymphoma breakpoint associated target 1 (TCBA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096707 // GenBank // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 1, mRNA (cDNA clone MGC:120143 IMAGE:40022279), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010655 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:31179745:31239554:-1 Gene:OTTHUMG00000003788 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ogc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 1 (NKAIN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ogd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 1 (NKAIN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004102 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor) (FABP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31365721:31373073:-1 gene:ENSG00000121769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007021 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor), mRNA (cDNA clone MGC:12366 IMAGE:3934295), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373713 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold475:502606:509900:+ gene:ENSG00000121769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010683 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:31365625:31373076:-1 Gene:OTTHUMG00000003797 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010684 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:31365721:31373073:-1 Gene:OTTHUMG00000003797 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010685 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:31365891:31376850:-1 Gene:OTTHUMG00000003797 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091362 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:31365713:31369590:-1 Gene:OTTHUMG00000003797 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bss.1 // UCSC Genes // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor) (FABP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384254 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:31497577:31497683:-1 gene:ENSG00000206981 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026850 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 9-like, pseudogene (MTMR9LP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32231660:32241620:-1 gene:ENSG00000220785 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AL833686 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667B148 (from clone DKFZp667B148). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001buv.4 // UCSC Genes // Homo sapiens myotubularin related protein 9-like, pseudogene (MTMR9LP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ohb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens myotubularin related protein 9-like, pseudogene (MTMR9LP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015407 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4391776, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001but.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001but.2 cpcScore=2.1466300 cnci=-0.1644404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001but.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myotubularin related protein 9-like, pseudogene (MTMR9LP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001buv.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001buv.3 cpcScore=1.5696300 cnci=-0.1314746 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ohb.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010ohb.1 cpcScore=2.5457500 cnci=-0.1216966 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:32286452:32286561:-1 gene:ENSG00000252450 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458147 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:32786799:32788162:-1 gene:ENSG00000235359 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001161708 // RefSeq // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_030786 // RefSeq // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32681491:32702756:-1 gene:ENSG00000162520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000409190 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1880:17106:25063:+ gene:ENSG00000162520 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022129 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32680360:32703119:-1 Gene:OTTHUMG00000008087 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000327141 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32695565:32703596:-1 Gene:OTTHUMG00000008087 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000327142 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:32695623:32703079:-1 Gene:OTTHUMG00000008087 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bvt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ohl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bxa.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34247 fis, clone FCBBF4000192. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408298 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:33442025:33442111:-1 gene:ENSG00000221225 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408126 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:34175866:34175949:-1 gene:ENSG00000221053 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000385206 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:34669599:34669694:-1 gene:ENSG00000207941 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000542839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34761426:34788097:-1 gene:ENSG00000255811 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080418 // RefSeq // Homo sapiens discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 3 (DLGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:34865436:34905383:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34865436:34929585:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34905165:34925494:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000542913 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:35331535:35370984:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011554 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34865436:34929585:-1 Gene:OTTHUMG00000004049 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000011555 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:34905165:34925494:-1 Gene:OTTHUMG00000004049 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001byc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 3 (DLGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365259 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:35893417:35893494:-1 gene:ENSG00000202129 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152374 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216 (C1orf216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000270815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35713875:35719472:-1 gene:ENSG00000142686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422623 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:36181069:36184423:-1 gene:ENSG00000142686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:35716160:35716911:-1 gene:ENSG00000142686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026909 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216, mRNA (cDNA clone MGC:24981 IMAGE:4932944), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012013 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35713875:35719472:-1 Gene:OTTHUMG00000004167 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023219 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35716198:35718894:-1 Gene:OTTHUMG00000004167 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000368175 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:35716160:35716911:-1 Gene:OTTHUMG00000004167 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216 (C1orf216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oli.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216 (C1orf216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408105 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:24227917:24228030:1 gene:ENSG00000221032 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000023454 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36081111:36082322:-1 Gene:OTTHUMG00000008497 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36081111:36082322:-1 gene:ENSG00000232862 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005202 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2 (COL8A2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373172 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:36563108:36565850:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36095236:36125220:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36097507:36100249:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096296 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:116972 IMAGE:40007335), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC099645 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40007334), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000303143 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:739172:742288:- gene:ENSG00000171812 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020390 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36095236:36100249:-1 Gene:OTTHUMG00000007665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000308994 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36097507:36100249:-1 Gene:OTTHUMG00000007665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000313674 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36095236:36125220:-1 Gene:OTTHUMG00000007665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2 (COL8A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bzw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2 (COL8A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018166 // RefSeq // Homo sapiens eva-1 homolog B (C. elegans) (EVA1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000270824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36322031:36324154:-1 gene:ENSG00000142694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36322281:36323615:-1 gene:ENSG00000142694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006241 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:11318 IMAGE:3951625), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071697 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:87957 IMAGE:4371667), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021689 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36322031:36324154:-1 Gene:OTTHUMG00000007867 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021690 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36322281:36323615:-1 Gene:OTTHUMG00000007867 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cai.1 // UCSC Genes // Homo sapiens eva-1 homolog B (C. elegans) (EVA1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001caj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens eva-1 homolog B (C. elegans) (EVA1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032881 // RefSeq // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated (LSM10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36393430:36397892:-1 gene:ENSG00000181817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36391238:36397887:-1 gene:ENSG00000181817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007623 // GenBank // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone MGC:15749 IMAGE:3357043), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022294 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36393430:36397892:-1 Gene:OTTHUMG00000008140 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022295 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36394014:36397878:-1 Gene:OTTHUMG00000008140 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022296 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:36391238:36397887:-1 Gene:OTTHUMG00000008140 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cao.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated (LSM10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021olj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated (LSM10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:36402721:36402859:-1 gene:ENSG00000222821 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364578 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:36418450:36418578:-1 gene:ENSG00000201448 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37264677:37264786:-1 gene:ENSG00000252368 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038842 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1137 (LINC01137), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000424989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37454879:37474411:-1 gene:ENSG00000233621 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012168 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37454879:37474411:-1 Gene:OTTHUMG00000004224 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021olm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC728431 (LOC728431), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024700 // RefSeq // Homo sapiens Smad nuclear interacting protein 1 (SNIP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37534449:37554302:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436196 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:38003155:38019905:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37540500:37554248:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK297176 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57163 complete cds, moderately similar to Smad nuclear-interacting protein 1. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC027040 // GenBank // Homo sapiens Smad nuclear interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:30036 IMAGE:4540112), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012169 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37534449:37554302:-1 Gene:OTTHUMG00000004225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37552487:37554290:-1 Gene:OTTHUMG00000004225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012171 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37540500:37554248:-1 Gene:OTTHUMG00000004225 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cbi.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oid.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363551 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:37737955:37738054:-1 gene:ENSG00000200421 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024640 // RefSeq // Homo sapiens yrdC N(6)-threonylcarbamoyltransferase domain containing (YRDC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC080186 // GenBank // Homo sapiens yrdC domain containing (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:87915 IMAGE:6147134), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373044 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:2347482:2349429:- gene:ENSG00000196449 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012470 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37802944:37808185:-1 Gene:OTTHUMG00000004318 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cca.1 // UCSC Genes // Homo sapiens yrdC domain containing (E. coli) (YRDC), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005955 // RefSeq // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1 (MTF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37809567:37859620:-1 gene:ENSG00000188786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37857349:37858539:-1 gene:ENSG00000188786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543396 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:38300341:38306170:-1 gene:ENSG00000188786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309584 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99625. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014454 // GenBank // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:23036 IMAGE:4901099), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012984 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37809567:37859620:-1 Gene:OTTHUMG00000004439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012985 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:37857349:37858539:-1 Gene:OTTHUMG00000004439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cce.1 // UCSC Genes // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1 (MTF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vvj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1 (MTF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000448796 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:38292232:38293886:-1 gene:ENSG00000230610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002699 // RefSeq // Homo sapiens POU class 3 homeobox 1 (POU3F1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000373012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38043827:38046794:-1 gene:ENSG00000185668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001213 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:38043827:38046794:-1 Gene:OTTHUMG00000000485 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ccp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens POU class 3 homeobox 1 (POU3F1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038928 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1343 (LINC01343), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:38209034:38214767:-1 gene:ENSG00000237290 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001202 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:38209034:38214767:-1 Gene:OTTHUMG00000000479 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021olp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC339442 (LOC339442), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384735 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:38950825:38950925:-1 gene:ENSG00000207466 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383927 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39120940:39121043:-1 gene:ENSG00000206654 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002983 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 55 (SNORA55), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000364587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39567374:39567508:-1 gene:ENSG00000201457 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 55 (SNORA55), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014571 // RefSeq // Homo sapiens hes-related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535435 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:40092154:40098672:-1 gene:ENSG00000163909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52278 complete cds, highly similar to Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006087 // GenBank // Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like, mRNA (cDNA clone MGC:12623 IMAGE:2964729), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372852 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:4020662:4026351:- gene:ENSG00000163909 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001179 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:39624153:39639945:-1 Gene:OTTHUMG00000000458 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oiw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032526 // RefSeq // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA (NT5C1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39659121:39672038:-1 gene:ENSG00000116981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103879 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:119199 IMAGE:40004489), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC103880 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:119201 IMAGE:40004491), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025626 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:39659121:39672038:-1 Gene:OTTHUMG00000009244 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens 5'-nucleotidase, cytosolic IA (NT5C1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016257 // RefSeq // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450300 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:40144662:40150275:-1 gene:ENSG00000116983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK294813 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50758 complete cds, moderately similar to Hippocalcin-like protein 4. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030827 // GenBank // Homo sapiens hippocalcin like 4, mRNA (cDNA clone MGC:26229 IMAGE:4811834), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372844 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold29:4081665:4083799:- gene:ENSG00000116983 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025640 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:39678648:39691689:-1 Gene:OTTHUMG00000009246 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oix.2 // UCSC Genes // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516604 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39723566:39723627:-1 gene:ENSG00000252413 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001720 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8b (BMP8B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39757182:39788861:-1 gene:ENSG00000116985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000397360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:39763551:39788849:-1 gene:ENSG00000116985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB075489 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma cDNA, clone:Nbla00124, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108678 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8b, mRNA (cDNA clone MGC:131757 IMAGE:6045180), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025641 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:39757182:39788861:-1 Gene:OTTHUMG00000009247 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cdz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8b (BMP8B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cea.1 // UCSC Genes // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8b (BMP8B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oly.1 // UCSC Genes // Homo sapiens neuroblastoma cDNA, clone:Nbla00124, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:39881566:39881678:-1 gene:ENSG00000202222 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384626 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:39944890:39944998:-1 gene:ENSG00000207356 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014747 // RefSeq // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3 (RIMS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40626214:40665445:-1 gene:ENSG00000117016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40620679:40665657:-1 gene:ENSG00000117016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003103 // GenBank // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3, mRNA (cDNA clone MGC:1884 IMAGE:3503630), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019585 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40620679:40665657:-1 Gene:OTTHUMG00000007453 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019586 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40626214:40665445:-1 Gene:OTTHUMG00000007453 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3 (RIMS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cfv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3 (RIMS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024567 // RefSeq // Homo sapiens NFYC antisense RNA 1 (NFYC-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ojl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100130557 (LOC100130557), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_133467 // RefSeq // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4 (CITED4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40861051:40862366:-1 gene:ENSG00000179862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035496 // GenBank // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:19748 IMAGE:3622207), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC052559 // GenBank // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:59904 IMAGE:6250908), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000020795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:40861051:40862366:-1 Gene:OTTHUMG00000007728 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cgj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4 (CITED4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000018314 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42335386:42338376:-1 Gene:OTTHUMG00000007027 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000436207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42335386:42338376:-1 gene:ENSG00000227527 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001146192 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032257 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:42430335:42456267:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42432860:42435522:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024186 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:26592 IMAGE:4826255), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372565 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1367:541818:576229:+ gene:ENSG00000066185 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42430329:42456267:-1 Gene:OTTHUMG00000007333 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019171 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42432860:42435522:-1 Gene:OTTHUMG00000007333 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019172 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42436421:42456011:-1 Gene:OTTHUMG00000007333 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ojt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001123395 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001185117 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_148960 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000296387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42733093:42740254:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42734995:42740140:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:42733093:42740254:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030524 // GenBank // Homo sapiens claudin 19, mRNA (cDNA clone MGC:40523 IMAGE:5207628), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019788 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42733093:42740254:-1 Gene:OTTHUMG00000007524 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019789 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42734995:42740140:-1 Gene:OTTHUMG00000007524 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cht.1 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001chu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ojv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_199342 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 23 (CCDC23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42807056:42817252:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42807052:42816804:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42813410:42817252:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537227 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:43272841:43282954:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029427 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:32681 IMAGE:4809776), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019997 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42807056:42817252:-1 Gene:OTTHUMG00000007566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019998 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42807052:42816804:-1 Gene:OTTHUMG00000007566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019999 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:42813410:42817252:-1 Gene:OTTHUMG00000007566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cib.2 // UCSC Genes // Homo sapiens coiled-coil domain containing 23 (CCDC23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164829 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_182517 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43282661:43285617:-1 gene:ENSG00000253313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000523677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43281883:43285579:-1 gene:ENSG00000253313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041633 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210, mRNA (cDNA clone MGC:52423 IMAGE:4868093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019035 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:43281883:43285579:-1 Gene:OTTHUMG00000007289 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000019036 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:43282661:43285617:-1 Gene:OTTHUMG00000007289 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cit.4 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021omn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363301 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:44153385:44153480:-1 gene:ENSG00000200171 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516337 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:44333105:44333178:-1 gene:ENSG00000252146 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000511004 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000511004 cpcScore=0.6454280 cnci=-0.2850931 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44721786:44721902:-1 gene:ENSG00000199377 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44731055:44731170:-1 gene:ENSG00000200169 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001013632 // RefSeq // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4 (TCTEX1D4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:44805913:44806675:-1 gene:ENSG00000188396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC092499 // GenBank // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:104730 IMAGE:30531412), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000372200 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2138:54965:55621:+ gene:ENSG00000188396 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023733 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:44805913:44806675:-1 Gene:OTTHUMG00000008586 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cmp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4 (TCTEX1D4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021omu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4 (TCTEX1D4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459207 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:45824324:45824420:-1 gene:ENSG00000238945 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026768 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S15a pseudogene 10 (RPS15AP10), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010olu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein S15a pseudogene 10 (RPS15AP10), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401325 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:8:21494028:21494116:1 gene:ENSG00000266713 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001097611 // RefSeq // Homo sapiens kinocilin (KNCN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000396314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46547428:46551215:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46547380:46551527:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000524908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46547349:46549733:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101298 // GenBank // Homo sapiens kinocilin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024579), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021919 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46545644:46550012:-1 Gene:OTTHUMG00000007987 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000316334 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:46547380:46551527:-1 Gene:OTTHUMG00000007987 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cpy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens kinocilin (KNCN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vyh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens kinocilin (KNCN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002788 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 2, pseudogene (CYP4Z2P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46843095:46900437:-1 gene:ENSG00000154198 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY696295 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450 (CYP4Z2P) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vyn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 2, pseudogene (CYP4Z2P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cqo.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001crj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ36201 fis, clone TESTI2028290. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026878 // RefSeq // Homo sapiens FOXD2 antisense RNA 1 (head to head) (FOXD2-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47432133:47434641:-1 gene:ENSG00000237424 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021830 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47432133:47434641:-1 Gene:OTTHUMG00000007949 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001crl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens FOXD2 antisense RNA 1 (head to head) (FOXD2-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408520 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:47621093:47621177:-1 gene:ENSG00000221447 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001194986 // RefSeq // Homo sapiens TraB domain containing 2B (TRABD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371865 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:48231308:48462567:-1 gene:ENSG00000204018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000438589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47761132:47765547:-1 gene:ENSG00000223814 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021840 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47761132:47765547:-1 Gene:OTTHUMG00000007958 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021842 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:47760528:47996895:-1 Gene:OTTHUMG00000007960 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ong.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TraB domain containing 2B (TRABD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026749 // RefSeq // Homo sapiens Skint-like, pseudogene (SKINTL), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:48101715:48161871:-1 gene:ENSG00000242267 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:48164710:48182428:-1 gene:ENSG00000242267 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010omr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Skint-like, pseudogene (SKINTL), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021845 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021845 cpcScore=-1.1918400 cnci=-0.2412391 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365270 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:50965430:50965529:-1 gene:ENSG00000202140 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459356 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:51696925:51697028:-1 gene:ENSG00000238618 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391322 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:51724775:51724896:-1 gene:ENSG00000212624 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002867 // RefSeq // Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family (RAB3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537650 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:52382848:52456415:-1 gene:ENSG00000169213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005035 // GenBank // Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:12720 IMAGE:4040566), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371655 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold75:2195693:2253424:- gene:ENSG00000169213 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023816 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:51907956:51990764:-1 Gene:OTTHUMG00000008627 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cth.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family (RAB3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015913 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum) (TXNDC12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52020131:52056171:-1 gene:ENSG00000117862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52020914:52055176:-1 gene:ENSG00000117862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001493 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:1825 IMAGE:3506109), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008913 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:15395 IMAGE:3659407), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008953 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:3735 IMAGE:2959502), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023818 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52020131:52056171:-1 Gene:OTTHUMG00000008629 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023819 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52020914:52055176:-1 Gene:OTTHUMG00000008629 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023820 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52020131:52023574:-1 Gene:OTTHUMG00000008629 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091263 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52023069:52024656:-1 Gene:OTTHUMG00000008629 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cti.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_138417 // RefSeq // Homo sapiens KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae) (KTI12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012173 // GenBank // Homo sapiens KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:20419 IMAGE:4643409), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371614 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold75:2297201:2298196:- gene:ENSG00000198841 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023821 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52032103:52033816:-1 Gene:OTTHUMG00000008630 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ctj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae) (KTI12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_023077 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) (COA7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52684451:52698366:-1 gene:ENSG00000162377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52687562:52698068:-1 gene:ENSG00000162377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015313 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 163, mRNA (cDNA clone MGC:21050 IMAGE:4430419), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023462 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52684451:52698366:-1 Gene:OTTHUMG00000008505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092198 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:52687562:52698068:-1 Gene:OTTHUMG00000008505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cui.2 // UCSC Genes // Homo sapiens Sel1 repeat containing 1 (SELRC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383900 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:52805108:52805212:-1 gene:ENSG00000206627 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000442174 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:53458868:53459251:-1 gene:ENSG00000236360 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002314 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 3 pseudogene 1 (SLC25A3P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vzj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009vzj.1 cpcScore=3.4782200 cnci=-0.0894224 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vzj.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_147193 // RefSeq // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1 (GLIS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000312233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53506237:53734204:-1 gene:ENSG00000174332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101799 // GenBank // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:126848 IMAGE:8069305), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104911 // GenBank // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:132571 IMAGE:8143914), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022109 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:53506237:53734204:-1 Gene:OTTHUMG00000008079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cvr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1 (GLIS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:53688749:53688812:-1 gene:ENSG00000239007 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364133 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:53771018:53771153:-1 gene:ENSG00000201003 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000530059 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:54133074:54139849:-1 gene:ENSG00000157211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000536061 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:54635333:54637997:-1 gene:ENSG00000248835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000023025 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000023025 cpcScore=-0.9829180 cnci=-0.1076804 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_176782 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A (FAM151A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294370 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:55074941:55089229:-1 gene:ENSG00000162391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000302250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54609182:54623556:-1 gene:ENSG00000162391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54609182:54623556:-1 gene:ENSG00000162391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015993 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:27169 IMAGE:4614435), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020874 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:24088 IMAGE:4608844), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027342 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54609182:54623556:-1 Gene:OTTHUMG00000009888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027343 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54609182:54623556:-1 Gene:OTTHUMG00000009888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cxn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A (FAM151A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000027344 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54621477:54628438:-1 Gene:OTTHUMG00000009889 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54621477:54628438:-1 gene:ENSG00000230728 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152268 // RefSeq // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (PARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54756898:54764514:-1 gene:ENSG00000162396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007956 // GenBank // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:14416 IMAGE:4301987), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011758 // GenBank // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:19467 IMAGE:3530065), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54756898:54764514:-1 Gene:OTTHUMG00000009915 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cxy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (PARS2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ont.1 // UCSC Genes // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (PARS2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001114108 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_017904 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54784551:54801198:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371276 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold4259:32680:54513:+ gene:ENSG00000006555 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027437 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54784551:54801198:-1 Gene:OTTHUMG00000009916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027438 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54779712:54801267:-1 Gene:OTTHUMG00000009916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027670 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54784554:54787792:-1 Gene:OTTHUMG00000009916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54781596:54787995:-1 Gene:OTTHUMG00000009916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027672 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:54786643:54787905:-1 Gene:OTTHUMG00000009916 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cxz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vzt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000097389 // Havana transcript // [retired] cdna:all chromosome:VEGA50:1:55314138:55316072:-1 Gene:OTTHUMG00000040471 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000458389 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:55314138:55316072:-1 gene:ENSG00000244324 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021onv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Lys (anticodon CTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516036 // ENSEMBL // [retired]ncrna:misc_RNA chromosome:GRCh37:1:55950544:55950645:-1 gene:ENSG00000251845 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ooa.1 // UCSC Genes // Rfam model RF00019 hit found at contig region AL109742.12/67202-67303 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003713 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2B (PPAP2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56494747:56579568:-1 gene:ENSG00000162407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000459962 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:56496434:56513771:-1 gene:ENSG00000162407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009196 // GenBank // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2B, mRNA (cDNA clone MGC:15306 IMAGE:3960223), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000022334 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56494747:56579568:-1 Gene:OTTHUMG00000008160 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095575 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56496434:56513771:-1 Gene:OTTHUMG00000008160 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095576 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56496276:56517006:-1 Gene:OTTHUMG00000008160 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095577 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56524308:56645301:-1 Gene:OTTHUMG00000008160 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095578 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:56579168:56645272:-1 Gene:OTTHUMG00000008160 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2B (PPAP2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002353 // RefSeq // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2 (TACSTD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009409 // GenBank // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2, mRNA (cDNA clone MGC:10655 IMAGE:3611756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371225 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1507:811252:811821:- gene:ENSG00000184292 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027818 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:58575423:58577773:-1 Gene:OTTHUMG00000010067 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyz.4 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2 (TACSTD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002228 // RefSeq // Homo sapiens jun proto-oncogene (JUN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:58780788:58784327:-1 gene:ENSG00000177606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006175 // GenBank // Homo sapiens jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:13254 IMAGE:4053956), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068522 // GenBank // Homo sapiens jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:87323 IMAGE:5267423), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023042 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:58780788:58784327:-1 Gene:OTTHUMG00000008376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cze.3 // UCSC Genes // Homo sapiens jun proto-oncogene (JUN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000775 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 2, subfamily J, polypeptide 2 (CYP2J2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000371204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:59893308:59926790:-1 gene:ENSG00000134716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59893316:59913238:-1 gene:ENSG00000134716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032594 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 2, subfamily J, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:44831 IMAGE:5527808), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024940 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:59893308:59926790:-1 Gene:OTTHUMG00000008991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024941 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:59893316:59913238:-1 Gene:OTTHUMG00000008991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000024942 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:59893320:59926761:-1 Gene:OTTHUMG00000008991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095352 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:59909911:59926755:-1 Gene:OTTHUMG00000008991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095353 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:59893320:59926761:-1 Gene:OTTHUMG00000008991 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001czq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cytochrome P450, family 2, subfamily J, polypeptide 2 (CYP2J2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364283 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:62298149:62298256:-1 gene:ENSG00000201153 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516450 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:63186336:63186450:-1 gene:ENSG00000252259 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000515911 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:63536711:63536770:-1 gene:ENSG00000251720 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000430203 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:64308862:64309347:-1 gene:ENSG00000228056 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:64028894:64029000:-1 gene:ENSG00000207190 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363638 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:64066640:64066741:-1 gene:ENSG00000200508 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:64384398:64384459:-1 gene:ENSG00000238653 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029516 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 101-1 (MIR101-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:65058434:65058508:-1 gene:ENSG00000199135 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 101-1 (MIR101-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dbx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dbx.2 cpcScore=-1.0975000 cnci=-0.2834158 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000502413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:66665864:66677027:-1 gene:ENSG00000248458 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK298300 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59040 complete cds, highly similar to LINE-1 reverse transcriptase homolog. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ope.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ59040 complete cds, highly similar to LINE-1 reverse transcriptase homolog. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_015139 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-GlcA/UDP-GalNAc transporter), member D1 (SLC35D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000235345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:66999332:67054099:-1 gene:ENSG00000116704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506472 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:67473197:67518730:-1 gene:ENSG00000116704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK296449 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51485 complete cds, highly similar to UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine transporter. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093786 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1, mRNA (cDNA clone MGC:120821 IMAGE:7939631), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025948 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:66999332:67054099:-1 Gene:OTTHUMG00000009360 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ddk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1 (SLC35D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010oph.2 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1 (SLC35D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516624 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:67102645:67102779:-1 gene:ENSG00000252433 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408806 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:67239440:67239527:-1 gene:ENSG00000221733 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516307 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67267601:67267726:-1 gene:ENSG00000252116 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018841 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12 (GNG12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:67701466:67833467:-1 gene:ENSG00000172380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:67777138:67833436:-1 gene:ENSG00000172380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005940 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12, mRNA (cDNA clone MGC:14561 IMAGE:4049838), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026355 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:67701466:67833467:-1 Gene:OTTHUMG00000009545 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095853 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:67777138:67833436:-1 Gene:OTTHUMG00000009545 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dea.2 // UCSC Genes // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12 (GNG12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004675 // RefSeq // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3 (DIRAS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:68045962:68051631:-1 gene:ENSG00000162595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000395201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:68045964:68050777:-1 gene:ENSG00000162595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005362 // GenBank // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:12468 IMAGE:3686616), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:68045962:68051631:-1 Gene:OTTHUMG00000009544 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ded.3 // UCSC Genes // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3 (DIRAS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ooq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3 (DIRAS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000329 // RefSeq // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa (RPE65), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075035 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa, mRNA (cDNA clone MGC:104166 IMAGE:30915627), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC075036 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa, mRNA (cDNA clone MGC:104010 IMAGE:30915421), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000262340 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold805:110377:131612:- gene:ENSG00000116745 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025509 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:68428822:68449959:-1 Gene:OTTHUMG00000009208 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dei.1 // UCSC Genes // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa (RPE65), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017768 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 40 (LRRC40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:70144805:70205620:-1 gene:ENSG00000066557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008586 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:16864 IMAGE:2900193), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000025914 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:70144805:70205620:-1 Gene:OTTHUMG00000009348 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001der.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leucine rich repeat containing 40 (LRRC40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:72717663:72717769:-1 gene:ENSG00000212366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:73749517:73749623:-1 gene:ENSG00000200601 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000449696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:74750123:74752375:1 gene:ENSG00000162623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026579 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:74750123:74752375:1 Gene:OTTHUMG00000009641 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75538015:75538119:-1 gene:ENSG00000252338 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000092545 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:75710003:75724011:-1 Gene:OTTHUMG00000037911 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000433521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75710003:75724011:-1 gene:ENSG00000178193 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR936677 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J0423 (from clone DKFZp686J0423). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dgv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dgv.2 cpcScore=4.7458800 cnci=-0.3206452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dgv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J0423 (from clone DKFZp686J0423). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_080868 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_026546 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75918873:75932431:-1 gene:ENSG00000154007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036573 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:41944 IMAGE:5297837), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026982 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:75918873:75932431:-1 Gene:OTTHUMG00000009787 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dhe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dhf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408737 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:77391422:77391528:-1 gene:ENSG00000221664 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000406534 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:78276507:78277621:-1 gene:ENSG00000219201 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516149 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:78088988:78089083:-1 gene:ENSG00000251958 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:78375164:78375268:-1 gene:ENSG00000212308 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022159 // RefSeq // Homo sapiens EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1 (ELTD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:78889764:79006718:-1 gene:ENSG00000162618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC025721 // GenBank // Homo sapiens EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:34204 IMAGE:5229055), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026859 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:78889764:79006718:-1 Gene:OTTHUMG00000009738 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026860 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:78889764:78917885:-1 Gene:OTTHUMG00000009738 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001diq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1 (ELTD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003927 // RefSeq // Homo sapiens urate oxidase, pseudogene (UOX), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84367661:84384752:-1 gene:ENSG00000240520 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens urate oxidase, pseudogene (UOX), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005274 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (GNG5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84498329:84506565:-1 gene:ENSG00000174021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84498325:84506565:-1 gene:ENSG00000174021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84498325:84503833:-1 gene:ENSG00000174021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003563 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5, mRNA (cDNA clone MGC:1969 IMAGE:3502879), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027240 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84498329:84506565:-1 Gene:OTTHUMG00000009858 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027444 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84498325:84506565:-1 Gene:OTTHUMG00000009858 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092671 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84498325:84503833:-1 Gene:OTTHUMG00000009858 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001djw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (GNG5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027379 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 180 (C1orf180), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000327308 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:85093913:85097431:-1 gene:ENSG00000180869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84628230:84635020:-1 gene:ENSG00000180869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171792 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 180, mRNA (cDNA clone IMAGE:9054446). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027461 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84628230:84635020:-1 Gene:OTTHUMG00000009923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ory.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 180 (C1orf180), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dke.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516090 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:84793068:84793199:-1 gene:ENSG00000251899 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012152 // RefSeq // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3 (LPAR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:84813404:84893213:-1 gene:ENSG00000171517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84813916:84866144:-1 gene:ENSG00000171517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AF127138 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid G protein-coupled receptor (EDG7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126268 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:161546 IMAGE:8991984), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440886 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1432:78714:133971:+ gene:ENSG00000171517 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027467 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84811602:84866159:-1 Gene:OTTHUMG00000009925 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027468 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84813916:84866144:-1 Gene:OTTHUMG00000009925 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dkl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3 (LPAR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3 (LPAR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_153259 // RefSeq // Homo sapiens mucolipin 2 (MCOLN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000284027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:84926685:84997112:-1 gene:ENSG00000153898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84925583:84996940:-1 gene:ENSG00000153898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000531325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84937460:84997113:-1 gene:ENSG00000153898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104891 // GenBank // Homo sapiens mucolipin 2, mRNA (cDNA clone MGC:132551 IMAGE:8143894), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027567 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84925583:84996940:-1 Gene:OTTHUMG00000009954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027568 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:84925908:84997113:-1 Gene:OTTHUMG00000009954 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dkm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mucolipin 2 (MCOLN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dkn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mucolipin 2 (MCOLN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032184 // RefSeq // Homo sapiens synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (SYDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:85156873:85201046:-1 gene:ENSG00000097096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AL834286 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667B2411 (from clone DKFZp667B2411). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027574 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:85181159:85200513:-1 Gene:OTTHUMG00000009956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000127989 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:85156873:85201046:-1 Gene:OTTHUMG00000009956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dku.4 // UCSC Genes // Homo sapiens synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (SYDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wcm.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (SYDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85435175:85435284:-1 gene:ENSG00000199459 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001170670 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_017953 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:85649423:85708433:-1 gene:ENSG00000117174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026236 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:22219 IMAGE:4664103), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110898 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:131963 IMAGE:6012059), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370574 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3382:57211:115616:+ gene:ENSG00000117174 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029186 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:85652808:85708418:-1 Gene:OTTHUMG00000010576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dlh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010osc.2 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364750 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:85883680:85883798:-1 gene:ENSG00000201620 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038324 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1364 (LINC01364), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:87353524:87371655:-1 gene:ENSG00000227290 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028275 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:87353524:87371655:-1 Gene:OTTHUMG00000010252 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dmk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100505768 (LOC100505768), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365515 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:89020246:89020365:-1 gene:ENSG00000202385 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052941 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein 4 (GBP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89181148:89198932:-1 gene:ENSG00000162654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89181773:89185398:-1 gene:ENSG00000162654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC070055 // GenBank // Homo sapiens guanylate binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:87193 IMAGE:30345441), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029409 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89181148:89198932:-1 Gene:OTTHUMG00000010663 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029410 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89182498:89186526:-1 Gene:OTTHUMG00000010663 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029411 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89181773:89185398:-1 Gene:OTTHUMG00000010663 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dnb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens guanylate binding protein 4 (GBP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033981 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC400761 (FLJ27354), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89624850:89632894:-1 gene:ENSG00000231999 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000443562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89583241:89632191:-1 gene:ENSG00000231999 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000526694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89626261:89632747:-1 gene:ENSG00000231999 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000528692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89631876:89632761:-1 gene:ENSG00000231999 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028010 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89583241:89632191:-1 Gene:OTTHUMG00000010130 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028432 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:89624850:89632894:-1 Gene:OTTHUMG00000010130 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dnk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC400761 (FLJ27354), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459015 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:90233771:90233877:-1 gene:ENSG00000239176 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445845 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:90421225:90422281:-1 gene:ENSG00000237081 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029425 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029425 cpcScore=-1.2515200 cnci=-0.2219780 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002830 // RefSeq // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 8 pseudogene 4 (GEMIN8P4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dno.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 8 pseudogene 4 (GEMIN8P4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dno.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dno.2 cpcScore=3.5792000 cnci=-0.1839296 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391157 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:90253456:90253559:-1 gene:ENSG00000212459 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020063 // RefSeq // Homo sapiens BarH-like homeobox 2 (BARHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:90711539:90717237:-1 gene:ENSG00000143032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126439 // GenBank // Homo sapiens BarH-like homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:161717 IMAGE:8992155), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000027728 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:90711539:90717237:-1 Gene:OTTHUMG00000010020 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dns.3 // UCSC Genes // Homo sapiens BarH-like homeobox 2 (BARHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516420 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:91852862:91852949:-1 gene:ENSG00000252229 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364447 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92700819:92700934:-1 gene:ENSG00000201317 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92969604:92969710:-1 gene:ENSG00000252121 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408239 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:92982237:92982308:-1 gene:ENSG00000238787 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516028 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:93027410:93027506:-1 gene:ENSG00000251837 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517042 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:93569673:93569759:-1 gene:ENSG00000252851 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:93488333:93488452:-1 gene:ENSG00000212601 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021opz.1 // UCSC Genes // transfer RNA Cys (anticodon GCA) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000433544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:93752924:93775444:-1 gene:ENSG00000230439 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ080207 // GenBank // Homo sapiens MIG7 (MIG7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000028417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:93752924:93775444:-1 Gene:OTTHUMG00000010300 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dqd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens MIG7 (MIG7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002061 // RefSeq // Homo sapiens glutamate-cysteine ligase, modifier subunit (GCLM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:93885205:93909410:-1 gene:ENSG00000023909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:93894644:93908790:-1 gene:ENSG00000023909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041809 // GenBank // Homo sapiens glutamate-cysteine ligase, modifier subunit, mRNA (cDNA clone MGC:41886 IMAGE:5311598), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029169 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:93885205:93909410:-1 Gene:OTTHUMG00000010562 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:93894644:93908790:-1 Gene:OTTHUMG00000010562 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029171 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:93904266:93908924:-1 Gene:OTTHUMG00000010562 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dqg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glutamate-cysteine ligase, modifier subunit (GCLM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_144988 // RefSeq // Homo sapiens ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (ALG14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:95035821:95072874:-1 gene:ENSG00000172339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:94983550:95027203:-1 gene:ENSG00000172339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC011706 // GenBank // Homo sapiens asparagine-linked glycosylation 14 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:19780 IMAGE:3689162), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370205 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3053:108989:206637:- gene:ENSG00000172339 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:94974407:95072945:-1 Gene:OTTHUMG00000010781 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:95035821:95072874:-1 Gene:OTTHUMG00000010781 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029701 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:95449106:95492759:-1 Gene:OTTHUMG00000010782 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dra.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (ALG14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383952 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:95125511:95125609:-1 gene:ENSG00000206679 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010861 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001037317 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:98890972:99004893:-1 gene:ENSG00000117598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:98890245:99005032:-1 gene:ENSG00000117598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000534652 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:98990856:99004484:-1 gene:ENSG00000117598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136350 // GenBank // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2, mRNA (cDNA clone MGC:167960 IMAGE:9020337), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144000 // GenBank // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2, mRNA (cDNA clone MGC:177535 IMAGE:9052518), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029635 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:98890245:99005032:-1 Gene:OTTHUMG00000010738 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dsb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dsc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:99784740:99784885:-1 gene:ENSG00000201491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365389 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:100000637:100000739:-1 gene:ENSG00000202259 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_194292 // RefSeq // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (SASS6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:100083563:100132955:-1 gene:ENSG00000156876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000535161 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:100550677:100598444:-1 gene:ENSG00000156876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539329 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:100550364:100598511:-1 gene:ENSG00000156876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307824 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97772. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101026 // GenBank // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:119440 IMAGE:40007432), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000287482 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2522:91693:130955:+ gene:ENSG00000156876 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029656 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100083563:100132955:-1 Gene:OTTHUMG00000010754 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029912 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100083563:100132955:-1 Gene:OTTHUMG00000010754 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dsu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (SASS6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wdz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (SASS6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401248 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:100378682:100378775:-1 gene:ENSG00000216067 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038914 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1349 (LINC01349), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:100627049:100640613:-1 gene:ENSG00000230402 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097435 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:100627049:100640613:-1 Gene:OTTHUMG00000040491 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100128787 (LOC100128787), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459166 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:101694220:101694321:-1 gene:ENSG00000238296 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:101728642:101728737:-1 gene:ENSG00000252530 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000099060 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099060 cpcScore=0.1001090 cnci=-0.1057606 gene:OTTHUMG00000041347 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099061 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099061 cpcScore=-0.8324240 cnci=-0.1336295 gene:OTTHUMG00000041347 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451705 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:103821644:103835986:-1 gene:ENSG00000234037 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455771 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:103820969:103835986:-1 gene:ENSG00000234037 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459420 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:107448469:107448555:-1 gene:ENSG00000238883 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516385 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:108113461:108113552:-1 gene:ENSG00000252194 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oqx.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon ???) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_013386 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 24 (SLC25A24), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_213651 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 24 (SLC25A24), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108134823:108192818:-1 gene:ENSG00000085491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014519 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone MGC:10669 IMAGE:3842039), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068010 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone IMAGE:6168676). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC068561 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone MGC:87498 IMAGE:5259336), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264128 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold21:370686:421562:- gene:ENSG00000085491 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030280 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108134036:108200358:-1 Gene:OTTHUMG00000011013 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030281 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:108134823:108192818:-1 Gene:OTTHUMG00000011013 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dvm.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dvn.4 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oqy.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005645 // RefSeq // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa (TAF13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121180 // GenBank // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa, mRNA (cDNA clone MGC:150596 IMAGE:40123243), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338366 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2249:597558:603562:- gene:ENSG00000197780 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100608 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109062486:109075971:-1 Gene:OTTHUMG00000042363 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100609 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109064140:109076002:-1 Gene:OTTHUMG00000042363 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dwm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa (TAF13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459200 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:109750416:109750470:-1 gene:ENSG00000238310 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010985 // RefSeq // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109292365:109307041:-1 gene:ENSG00000221986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109292515:109306995:-1 gene:ENSG00000221986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC108664 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6153256. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132900 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:164531 IMAGE:40146922), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC144471 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:178015 IMAGE:9052998), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033197 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109292365:109307041:-1 Gene:OTTHUMG00000012002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033198 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109292515:109306995:-1 Gene:OTTHUMG00000012002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033199 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109292365:109296353:-1 Gene:OTTHUMG00000012002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dxk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dxl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ovh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021orf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313H0240 (from clone DKFZp313H0240). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020703 // RefSeq // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1 (AMIGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109507068:109509738:-1 gene:ENSG00000181754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109504175:109509682:-1 gene:ENSG00000181754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC040879 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:50479 IMAGE:5725643), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032247 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109504175:109509682:-1 Gene:OTTHUMG00000011653 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032248 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109507068:109509738:-1 Gene:OTTHUMG00000011653 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dxx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1 (AMIGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021org.1 // UCSC Genes // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1 (AMIGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000526411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109539906:109543837:-1 gene:ENSG00000254942 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:109591534:109591640:-1 gene:ENSG00000206832 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005272 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2 (GNAT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000351050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109603267:109613057:-1 gene:ENSG00000134183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000233 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:2232 IMAGE:3350818), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032181 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:109603267:109613057:-1 Gene:OTTHUMG00000011639 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dya.3 // UCSC Genes // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2 (GNAT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069739 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7262512, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PRO1575 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006402 // RefSeq // Homo sapiens late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5 (LAMTOR5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000256644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110401253:110407942:-1 gene:ENSG00000134248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474861 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:110401249:110407671:-1 gene:ENSG00000134248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483260 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:110401249:110407668:-1 gene:ENSG00000134248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC062619 // GenBank // Homo sapiens hepatitis B virus x interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:71071 IMAGE:5190406), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000031966 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110401253:110407942:-1 Gene:OTTHUMG00000011568 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000031967 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110401249:110407694:-1 Gene:OTTHUMG00000011568 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000031968 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110401249:110407671:-1 Gene:OTTHUMG00000011568 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000035929 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110401249:110407668:-1 Gene:OTTHUMG00000011568 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5 (LAMTOR5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005549 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10 (KCNA10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074990 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:103916 IMAGE:30915306), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369771 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3120:790935:792470:- gene:ENSG00000143105 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059081 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110517251:110518838:-1 Gene:OTTHUMG00000022785 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10 (KCNA10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408611 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:110652942:110653031:-1 gene:ENSG00000221538 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002232 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3 (KCNA3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110672465:110675033:-1 gene:ENSG00000177272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035059 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:41884 IMAGE:5261639), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083391 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:110672465:110675033:-1 Gene:OTTHUMG00000034493 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dzv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3 (KCNA3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362840 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:110764408:110764506:-1 gene:ENSG00000199710 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029429 // RefSeq // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C) pseudogene 1 (PGCP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000411951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111384519:111389851:-1 gene:ENSG00000227179 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021orp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C) pseudogene 1 (PGCP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364158 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:111650431:111650537:-1 gene:ENSG00000201028 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_019099 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_198926 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000444059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111726506:111755824:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000534365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:111722351:111739363:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031558 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 183, mRNA (cDNA clone MGC:34271 IMAGE:5181834), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357260 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1644:390382:405352:- gene:ENSG00000197852 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033060 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111722064:111739424:-1 Gene:OTTHUMG00000011953 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ebo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ebp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111745299:111755509:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC041890 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5298552. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033062 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:111745299:111755509:-1 Gene:OTTHUMG00000011953 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ebr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5298552. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ebr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ebr.2 cpcScore=-0.8208950 cnci=-0.2450113 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516941 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:112634719:112634784:-1 gene:ENSG00000252750 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038846 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC643441 (LOC643441), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001edg.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC643441 (LOC643441), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018364 // RefSeq // Homo sapiens round spermatid basic protein 1 (RSBN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000261441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:113761832:113812476:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113766145:113768034:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC026155 // GenBank // Homo sapiens round spermatid basic protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:26157 IMAGE:4827655), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033022 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:113761832:113812476:-1 Gene:OTTHUMG00000011938 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033023 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:113764616:113812293:-1 Gene:OTTHUMG00000011938 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001edq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens round spermatid basic protein 1 (RSBN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001edr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens round spermatid basic protein 1 (RSBN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000036 // RefSeq // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001172626 // RefSeq // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000353928 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:115215735:115238239:-1 gene:ENSG00000116748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:114673101:114695618:-1 gene:ENSG00000116748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000520113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114673098:114695586:-1 gene:ENSG00000116748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032860 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:114673098:114695586:-1 Gene:OTTHUMG00000011892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032861 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:114673101:114695618:-1 Gene:OTTHUMG00000011892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032862 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:114679689:114686999:-1 Gene:OTTHUMG00000011892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001efe.2 // UCSC Genes // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eff.2 // UCSC Genes // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002524 // RefSeq // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog (NRAS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114704469:114716894:-1 gene:ENSG00000213281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005219 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:12238 IMAGE:3826638), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033395 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:114704469:114716894:-1 Gene:OTTHUMG00000012059 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wgu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog (NRAS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002506 // RefSeq // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide) (NGF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126148 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:161426 IMAGE:8991864), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126150 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:161428 IMAGE:8991866), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369512 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2391:448430:449139:+ gene:ENSG00000134259 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000032832 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:115285918:115338236:-1 Gene:OTTHUMG00000011880 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001efu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide) (NGF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021osd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide) (NGF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384771 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:115621872:115622005:-1 gene:ENSG00000207502 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390964 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:117688621:117688742:-1 gene:ENSG00000212266 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000347264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:119331397:119331525:-1 gene:ENSG00000194297 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036540 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 622 (LINC00622), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021osv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 622 (LINC00622), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001080470 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 697 (ZNF697), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:119619422:119647773:-1 gene:ENSG00000143067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036349 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:119619422:119647773:-1 Gene:OTTHUMG00000012962 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ehy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 697 (ZNF697), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021794 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30 (ADAM30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543066 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:120436587:120438959:-1 gene:ENSG00000134249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC028372 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30, mRNA (cDNA clone MGC:27020 IMAGE:4831258), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369400 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold683:605216:607354:+ gene:ENSG00000134249 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033678 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:119893533:119896495:-1 Gene:OTTHUMG00000012176 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eij.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30 (ADAM30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ586768 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eiz.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001eiz.1 cpcScore=-1.5300000 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eiz.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ583161 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-50273, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021otb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50272, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000423385 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:1:142803224:142816004:-1 gene:ENSG00000234978 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000193203 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:142803224:142816004:-1 Gene:OTTHUMG00000085413 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029473 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4723680, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053679 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6165535, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA: FLJ22715 fis, clone HSI13726. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4723680, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590126 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57238, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eje.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001eje.2 cpcScore=-1.5403900 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eje.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ586768 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-53880, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587539 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54651, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021otd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590126 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57238, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejk.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ejk.2 cpcScore=-1.5403900 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587539 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54651, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32372, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590126 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57238, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002zkn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-47400, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459294 // ENSEMBL // [retired]ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:143437327:143437409:-1 gene:ENSG00000238439 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458828 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:143438382:143438463:-1 gene:ENSG00000239165 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459096 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:143647014:143647177:-1 gene:ENSG00000238603 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148385829:148385963:-1 gene:ENSG00000252135 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148388490:148388651:-1 gene:ENSG00000238825 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001123068 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4G (PPIAL4G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130376 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A, mRNA (cDNA clone MGC:163248 IMAGE:40146407), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419275 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold856:292488:292979:+ gene:ENSG00000236334 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000037969 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:148479824:148483679:-1 Gene:OTTHUMG00000013629 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ejt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4G (PPIAL4G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021otg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207418 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 72, member D (FAM72D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145096000:145112696:1 gene:ENSG00000215784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK307197 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97145. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158589 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145096000:145112696:1 Gene:OTTHUMG00000074801 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc002qvn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 72, member D (FAM72D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010evy.1 // UCSC Genes // Homo sapiens family with sequence similarity 72, member D (FAM72D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021otz.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384378 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:144311213:144311376:-1 gene:ENSG00000207106 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001135789 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4C (PPIAL4C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001143883 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178230 // RefSeq // [retired]Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A (PPIAL4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540273 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:144363462:144364246:-1 gene:ENSG00000255854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130376 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A, mRNA (cDNA clone MGC:163248 IMAGE:40146407), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038336 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:144360739:144364592:-1 Gene:OTTHUMG00000013667 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ekw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oud.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384101 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:149636766:149636929:1 gene:ENSG00000206828 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094156 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36837 fis, clone ASTRO2011422. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001elb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla04072, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001elb.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001elb.3 cpcScore=-1.2080400 cnci=-0.3648869 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003242 // RefSeq // Homo sapiens profilin 1 pseudogene 2 (PFN1P2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001elf.4 // UCSC Genes // Homo sapiens profilin 1 pseudogene 2 (PFN1P2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001elf.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001elf.3 cpcScore=1.6265100 cnci=-0.1116328 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001els.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34374 fis, clone FEBRA2017502. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oug.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:146288596:146288696:1 gene:ENSG00000201789 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000421937 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:145373054:145375672:-1 gene:ENSG00000227280 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100473 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000100473 cpcScore=-0.2506100 cnci=-0.1917885 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eng.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34374 fis, clone FEBRA2017502. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001enh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34374 fis, clone FEBRA2017502. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021our.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021out.1 // UCSC Genes // transfer RNA Lys (anticodon CTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ouu.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ouv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ouw.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032305 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (32kD)-like (POLR3GL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369313 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:145964703:145978570:1 gene:ENSG00000121851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145964703:145978848:1 gene:ENSG00000121851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004355 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (32kD)-like, mRNA (cDNA clone MGC:3200 IMAGE:3357827), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038510 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145964703:145978848:1 Gene:OTTHUMG00000013739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000038511 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145964702:145978848:1 Gene:OTTHUMG00000013739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100456 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145964716:145978519:1 Gene:OTTHUMG00000013739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100457 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:145964703:145978570:1 Gene:OTTHUMG00000013739 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001enp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (32kD)-like (POLR3GL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001201326 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 1 (PDZK1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401011 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:145924388:145942619:-1 gene:ENSG00000215860 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_003377 // NONCODE // accn=NR_003377 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003377 cpcScore=3.2927000 cnci=-0.2781953 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eov.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PDZ domain containing 1 pseudogene 1 (PDZK1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ozf.2 // UCSC Genes // Homo sapiens PDZ domain containing 1 pseudogene 1 (PDZK1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364235 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:145944938:145945104:-1 gene:ENSG00000201105 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384687 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:145969270:145969433:-1 gene:ENSG00000207418 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovb.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovh.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024442 // RefSeq // Homo sapiens phosphodiesterase 4D interacting protein pseudogene (LOC728989), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001epd.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038423 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 624 (LINC00624), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437831 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:146986158:146989699:-1 gene:ENSG00000234610 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:147258885:147517875:-1 Gene:OTTHUMG00000041476 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ovk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 624 (LINC00624), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:147420199:147420300:-1 gene:ENSG00000207209 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005266 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_181703 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271348 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:147228332:147245484:-1 gene:ENSG00000143140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369237 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:147229306:147232685:-1 gene:ENSG00000143140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013313 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa, mRNA (cDNA clone MGC:11185 IMAGE:3844139), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039422 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:147756199:147760606:-1 Gene:OTTHUMG00000014020 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039423 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:147758484:147773354:-1 Gene:OTTHUMG00000014020 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eps.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ept.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ovl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003377 // NONCODE // accn=NR_003377 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003377 cpcScore=3.2927000 cnci=-0.2781953 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039109 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:147993862:148012099:-1 Gene:OTTHUMG00000013940 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001epz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens PDZ domain containing 1 pseudogene 1 (PDZK1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000401008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:147993862:148012099:-1 gene:ENSG00000215859 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148014417:148014583:-1 gene:ENSG00000206791 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148038753:148038916:-1 gene:ENSG00000206585 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovo.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovr.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gln (anticodon CTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovt.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021ovu.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365538 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148334612:148334767:-1 gene:ENSG00000202408 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384610 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148362370:148362533:-1 gene:ENSG00000207340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517033 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:147857985:147858119:-1 gene:ENSG00000252842 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365194 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:147860642:147860803:-1 gene:ENSG00000202064 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094156 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36837 fis, clone ASTRO2011422. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wka.2 // UCSC Genes // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla04072, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001143883 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_178230 // RefSeq // [retired]Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A (PPIAL4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000539781 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:147954635:147955419:-1 gene:ENSG00000255963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130376 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4A, mRNA (cDNA clone MGC:163248 IMAGE:40146407), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039085 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:147951911:147955750:-1 Gene:OTTHUMG00000013920 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eqp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4B (PPIAL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164261 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4D (PPIAL4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001164262 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4F (PPIAL4F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145241630:145242124:-1 gene:ENSG00000256374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pag.2 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)-like 4D (PPIAL4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxb.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:144412576:144412740:1 gene:ENSG00000207205 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384241 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:148766938:148767102:-1 gene:ENSG00000206968 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365297 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143652050:143652215:-1 gene:ENSG00000202167 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxe.1 // UCSC Genes // transfer RNA His (anticodon GTG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxf.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143699456:143699619:-1 gene:ENSG00000207349 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxh.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143720510:143720644:-1 gene:ENSG00000252826 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143729407:143729570:-1 gene:ENSG00000206737 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxi.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxj.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516296 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143791542:143791687:-1 gene:ENSG00000252105 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxk.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxl.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000099634 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:143811359:143825837:-1 Gene:OTTHUMG00000041633 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:143811359:143825837:-1 gene:ENSG00000233430 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxm.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxo.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CCT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024599 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2bf (HIST2H2BF), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:143905555:143905966:-1 gene:ENSG00000203818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110793 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2bf, mRNA (cDNA clone MGC:131639 IMAGE:5224812), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098436 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:143905555:143905966:-1 Gene:OTTHUMG00000041033 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbi.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391242 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:149514090:149514256:-1 gene:ENSG00000212544 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000039131 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000039131 cpcScore=0.1502080 cnci=-0.1633343 gene:OTTHUMG00000013949 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000447883 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:149576594:149577296:-1 gene:ENSG00000233368 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000039132 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000039132 cpcScore=-1.1947900 cnci=-0.3052560 gene:OTTHUMG00000013950 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428508 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:149590752:149591762:-1 gene:ENSG00000229801 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxr.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxs.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxt.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517116 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:149671723:149671868:-1 gene:ENSG00000252925 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxu.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxw.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oxy.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon CCT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001123375 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H3d (HIST2H3D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149813271:149813681:-1 gene:ENSG00000183598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033452 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149813271:149813681:-1 Gene:OTTHUMG00000012092 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pbl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H3d (HIST2H3D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005464 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H3a (HIST2H3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_021059 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H3c (HIST2H3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149839538:149841193:-1 gene:ENSG00000203811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074969 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:104061 IMAGE:30915509), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130635 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:163507 IMAGE:40146666), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130637 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:163509 IMAGE:40146668), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149839538:149841193:-1 Gene:OTTHUMG00000012190 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001esv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H3c (HIST2H3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001040874 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4 (HIST2H2AA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_003516 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa3 (HIST2H2AA3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369161 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:149813505:149814478:-1 gene:ENSG00000183558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096705 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4, mRNA (cDNA clone MGC:120083 IMAGE:40021705), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033698 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:149813505:149814478:-1 Gene:OTTHUMG00000012191 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001esw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2aa4 (HIST2H2AA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036461 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2bc (pseudogene) (HIST2H2BC), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oxz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2bc (pseudogene) (HIST2H2BC), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003528 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2be (HIST2H2BE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC005827 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:1729 IMAGE:2989788), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069193 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:78419 IMAGE:3936695), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC096121 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:116767 IMAGE:40002353), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC098112 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:119802 IMAGE:40014245), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107084 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:129733 IMAGE:40014260), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369155 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:231803:232183:- gene:ENSG00000184678 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033455 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149884459:149886652:-1 Gene:OTTHUMG00000012095 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001etc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2be (HIST2H2BE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175065 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2ab (HIST2H2AB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000331128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149887524:149887916:-1 gene:ENSG00000184270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132811 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:164442 IMAGE:40146833, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033440 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149887524:149887916:-1 Gene:OTTHUMG00000012085 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ete.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 2, H2ab (HIST2H2AB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014849 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369145 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:149905472:149917841:-1 gene:ENSG00000159164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK075480 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0174 fis, clone NT2RP2002760, highly similar to SYNAPTIC VESICLE PROTEIN 2. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303161 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57689 complete cds, highly similar to Synaptic vesicle glycoprotein 2A. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045111 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:52199 IMAGE:5804662), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369146 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:247979:256425:- gene:ENSG00000159164 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033754 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149903318:149917882:-1 Gene:OTTHUMG00000012209 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033755 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149905472:149917841:-1 Gene:OTTHUMG00000012209 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001etg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eth.2 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wlk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005850 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa (SF3B4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149923317:149928344:-1 gene:ENSG00000143368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310495 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17537. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004273 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, mRNA (cDNA clone MGC:10828 IMAGE:3615080), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC090883 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, mRNA (cDNA clone MGC:102968 IMAGE:30386953), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033753 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149923317:149928344:-1 Gene:OTTHUMG00000012208 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095842 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149926382:149927591:-1 Gene:OTTHUMG00000012208 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001etk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa (SF3B4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wll.1 // UCSC Genes // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa (SF3B4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020205 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 7B (OTUD7B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369135 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:149912231:149982625:-1 gene:ENSG00000163113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479905 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:149932851:149943189:-1 gene:ENSG00000163113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543330 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:149915756:149982686:-1 gene:ENSG00000163113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC072681 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 7B, mRNA (cDNA clone MGC:87939 IMAGE:6170513), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX641079 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G11129 (from clone DKFZp686G11129). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034146 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149937812:150010676:-1 Gene:OTTHUMG00000012291 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034147 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149960927:149971261:-1 Gene:OTTHUMG00000012291 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034148 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:149947291:150010675:-1 Gene:OTTHUMG00000012291 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001etn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens OTU domain containing 7B (OTUD7B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001eto.3 // UCSC Genes // Homo sapiens OTU domain containing 7B (OTUD7B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021oyb.1 // UCSC Genes // transfer RNA Ala (anticodon AGC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000366377 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:150273648:150277452:-1 gene:ENSG00000215857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000369035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:150561004:150561493:-1 gene:ENSG00000203804 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132992 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 138, mRNA (cDNA clone MGC:164623 IMAGE:40147014), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084401 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150560202:150562115:-1 Gene:OTTHUMG00000034866 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517238 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:150600539:150600659:-1 gene:ENSG00000253047 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018178 // RefSeq // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150646225:150697024:-1 gene:ENSG00000143457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150694512:150697108:-1 gene:ENSG00000143457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000540514 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:150620687:150669630:-1 gene:ENSG00000143457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57598 complete cds, highly similar to Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013870 // GenBank // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:10290 IMAGE:3837466), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150646225:150697024:-1 Gene:OTTHUMG00000035009 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084735 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150648437:150697144:-1 Gene:OTTHUMG00000035009 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084736 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150694512:150697108:-1 Gene:OTTHUMG00000035009 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001evj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pci.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000369003 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:876389:923192:- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000396 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin K (CTSK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150796208:150808323:-1 gene:ENSG00000143387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150804012:150806768:-1 gene:ENSG00000143387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY429530 // GenBank // Homo sapiens CTSKv_1 mRNA sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC016058 // GenBank // Homo sapiens cathepsin K, mRNA (cDNA clone MGC:23107 IMAGE:4860926), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084732 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150796208:150808323:-1 Gene:OTTHUMG00000035008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084733 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150804041:150807434:-1 Gene:OTTHUMG00000035008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095841 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:150804012:150806768:-1 Gene:OTTHUMG00000035008 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001evp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cathepsin K (CTSK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wma.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cathepsin K (CTSK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000391210 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202070841:202070943:1 gene:ENSG00000212512 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136543 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_212551 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000440902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151160585:151165948:-1 gene:ENSG00000163155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC031649 // GenBank // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:35223 IMAGE:5172124), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368908 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:1305735:1311872:- gene:ENSG00000163155 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034070 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:151159748:151165919:-1 Gene:OTTHUMG00000012260 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ewy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pcr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517031 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:151527831:151527938:-1 gene:ENSG00000252840 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151747597:151747700:-1 gene:ENSG00000206980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001136003 // RefSeq // Homo sapiens C2 calcium-dependent domain containing 4D (C2CD4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC157847 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:189742 IMAGE:9057066, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC171843 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC100191040, mRNA (cDNA clone MGC:198558 IMAGE:9054497), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454109 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold609:2019645:2019908:- gene:ENSG00000225556 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pdq.1 // UCSC Genes // Homo sapiens C2 calcium-dependent domain containing 4D (C2CD4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oyv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens C2 calcium-dependent domain containing 4D (C2CD4D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364264 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:151841736:151841837:-1 gene:ENSG00000201134 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182578 // RefSeq // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5 (THEM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151847263:151853697:-1 gene:ENSG00000196407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101610 // GenBank // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:126659 IMAGE:8069116), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036678 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:151847263:151853697:-1 Gene:OTTHUMG00000013070 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036679 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:151819577:151824898:-1 Gene:OTTHUMG00000013070 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oyw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5 (THEM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005620 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11 (S100A11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152032506:152037035:-1 gene:ENSG00000163191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152032506:152047907:-1 gene:ENSG00000163191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001410 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11, mRNA (cDNA clone MGC:2149 IMAGE:3140092), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014354 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11, mRNA (cDNA clone MGC:24205 IMAGE:3685742), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036676 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152032506:152037035:-1 Gene:OTTHUMG00000013069 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036677 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152032506:152047907:-1 Gene:OTTHUMG00000013069 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11 (S100A11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001008536 // RefSeq // Homo sapiens trichohyalin-like 1 (TCHHL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152084144:152089064:-1 gene:ENSG00000182898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137493 // GenBank // Homo sapiens trichohyalin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169116 IMAGE:9021493), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036638 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152084144:152089064:-1 Gene:OTTHUMG00000013058 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens trichohyalin-like 1 (TCHHL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001122965 // RefSeq // Homo sapiens repetin (RPTN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000316073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152153595:152159228:-1 gene:ENSG00000215853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541545 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152126075:152128549:-1 gene:ENSG00000215853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000333867 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152153595:152159228:-1 Gene:OTTHUMG00000154095 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens repetin (RPTN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002016 // RefSeq // Homo sapiens filaggrin (FLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271820 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152280126:152282066:-1 gene:ENSG00000143631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368796 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152277210:152279147:-1 gene:ENSG00000143631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152302175:152325203:-1 gene:ENSG00000143631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000392689 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152284017:152285957:-1 gene:ENSG00000143631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033742 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152302175:152325203:-1 Gene:OTTHUMG00000012202 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens filaggrin (FLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001014342 // RefSeq // Homo sapiens filaggrin family member 2 (FLG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000388718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152348735:152360006:-1 gene:ENSG00000143520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034018 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152348735:152360006:-1 Gene:OTTHUMG00000012245 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezw.4 // UCSC Genes // Homo sapiens filaggrin family member 2 (FLG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_016190 // RefSeq // Homo sapiens cornulin (CRNN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152409243:152414263:-1 gene:ENSG00000143536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451038 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:152382638:152386739:-1 gene:ENSG00000143536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030807 // GenBank // Homo sapiens cornulin, mRNA (cDNA clone MGC:22281 IMAGE:4271624), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034503 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152409243:152414263:-1 Gene:OTTHUMG00000012383 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ezx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens cornulin (CRNN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178435 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3E (LCE3E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152565654:152566772:-1 gene:ENSG00000185966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131716 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3E, mRNA (cDNA clone MGC:150591 IMAGE:40123193), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034513 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152565654:152566772:-1 Gene:OTTHUMG00000012393 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001faa.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oyz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3E (LCE3E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032563 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3D (LCE3D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152579381:152580504:-1 gene:ENSG00000163202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069291 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3D, mRNA (cDNA clone MGC:97441 IMAGE:7262717), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101784 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3D, mRNA (cDNA clone MGC:126833 IMAGE:8069290), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC120935 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3D, mRNA (cDNA clone MGC:149411 IMAGE:40115032), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034504 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152579381:152580504:-1 Gene:OTTHUMG00000012384 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fab.3 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3D (LCE3D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021oza.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3D (LCE3D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178431 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3A (LCE3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152622834:152623103:-1 gene:ENSG00000185962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034517 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152622834:152623103:-1 Gene:OTTHUMG00000012397 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pdt.2 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 3A (LCE3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178351 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1C (LCE1C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368768 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:152777311:152779107:-1 gene:ENSG00000197084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034658 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:152804835:152805478:-1 Gene:OTTHUMG00000012445 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fap.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1C (LCE1C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens late cornified envelope 1C (LCE1C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517111 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:153012482:153012614:-1 gene:ENSG00000252920 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024209 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2E (SPRR2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153093135:153094525:-1 gene:ENSG00000203785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153093135:153106184:-1 gene:ENSG00000203785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040054 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153093135:153106184:-1 Gene:OTTHUMG00000014397 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040055 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153093135:153094525:-1 Gene:OTTHUMG00000014397 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 2E (SPRR2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021ozs.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 2E (SPRR2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001014291 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2G (SPRR2G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153149582:153150869:-1 gene:ENSG00000159516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000040057 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153149582:153150869:-1 Gene:OTTHUMG00000014399 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wod.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small proline-rich protein 2G (SPRR2G), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_052891 // RefSeq // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3 (PGLYRP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000290722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153297862:153310718:-1 gene:ENSG00000159527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069741 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:97229 IMAGE:7262478), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069798 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:97241 IMAGE:7262490), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC128114 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:149196 IMAGE:40112227), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000039488 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153297862:153310718:-1 Gene:OTTHUMG00000014044 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3 (PGLYRP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002963 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7 (S100A7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153457744:153459874:-1 gene:ENSG00000143556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153457744:153460701:-1 gene:ENSG00000143556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034687 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7, mRNA (cDNA clone MGC:21353 IMAGE:4751685), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036789 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153457744:153460701:-1 Gene:OTTHUMG00000013123 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000036790 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153457744:153459874:-1 Gene:OTTHUMG00000013123 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fbv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7 (S100A7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:153726252:153726353:-1 gene:ENSG00000199565 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458994 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:153726600:153726703:-1 gene:ENSG00000238511 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384312 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:153785720:153785821:-1 gene:ENSG00000207039 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_020699 // RefSeq // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B (GATAD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069419 // GenBank // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:97079 IMAGE:7262291), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112052 // GenBank // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:138257 IMAGE:8327520), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368655 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold246:349118:359350:- gene:ENSG00000143614 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090305 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153804725:153922975:-1 Gene:OTTHUMG00000037162 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fdb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B (GATAD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001159484 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_207308 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:153992694:154155116:-1 gene:ENSG00000143552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153992690:154056866:-1 gene:ENSG00000143552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BX648132 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L0440 (from clone DKFZp686L0440). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368559 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold246:490520:583620:- gene:ENSG00000143552 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087270 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153992685:154155116:-1 Gene:OTTHUMG00000035852 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088746 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:153992690:154056866:-1 Gene:OTTHUMG00000035852 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fdw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009woq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010peh.2 // UCSC Genes // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516860 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:153970517:153970627:-1 gene:ENSG00000252669 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154039916:154040022:-1 gene:ENSG00000200220 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001010846 // RefSeq // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000304760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154479481:154502113:-1 gene:ENSG00000169291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117210 // GenBank // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E, mRNA (cDNA clone MGC:150819 IMAGE:40125761), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143765 // GenBank // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E, mRNA (cDNA clone MGC:177296 IMAGE:9052279), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR936667 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D1511 (from clone DKFZp451D1511). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087910 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:154479481:154502113:-1 Gene:OTTHUMG00000036072 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090676 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:154469772:154486044:-1 Gene:OTTHUMG00000036072 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ffb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ffc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006556 // RefSeq // Homo sapiens phosphomevalonate kinase (PMVK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154924734:154936991:-1 gene:ENSG00000163344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006089 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:12661 IMAGE:3604167), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC007694 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:11362 IMAGE:3954909), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091088 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:154924734:154936991:-1 Gene:OTTHUMG00000037415 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ffq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphomevalonate kinase (PMVK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040772 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100505666 (LOC100505666), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_040773 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100505666 (LOC100505666), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000452962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155045191:155046118:-1 gene:ENSG00000232093 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099010 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:155045191:155046118:-1 Gene:OTTHUMG00000041316 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pam.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100505666 (LOC100505666), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pan.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401290 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:155236749:155236837:-1 gene:ENSG00000216109 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155358712:155358818:-1 gene:ENSG00000207134 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458873 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:155385349:155385453:-1 gene:ENSG00000238805 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
FM178012 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4, clone UVSC-TAKA-14_AS. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pgc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens partial mRNA for POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4, clone BM-TAKA-09_AS. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041646 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5454236, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001flf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001flf.2 cpcScore=1.0674900 cnci=-0.2118847 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001flf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens, clone IMAGE:5454236, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002974 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 80E (SNORA80E), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155919909:155920045:-1 gene:ENSG00000207475 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fmk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 42 (SNORA42), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003005 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 4 (SCARNA4), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000516999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155925958:155926086:-1 gene:ENSG00000252808 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fmn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 4 (SCARNA4), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001093725 // RefSeq // Homo sapiens mex-3 RNA binding family member A (MEX3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442784 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:156077066:156081704:-1 gene:ENSG00000254726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000532414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156072013:156081998:-1 gene:ENSG00000254726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046218 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156072013:156081998:-1 Gene:OTTHUMG00000017465 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046219 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156077066:156081704:-1 Gene:OTTHUMG00000017465 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fnd.4 // UCSC Genes // Homo sapiens mex-3 homolog A (C. elegans) (MEX3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516427 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:156192063:156192203:-1 gene:ENSG00000252236 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004319 // RefSeq // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like (VHLL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC130596 // GenBank // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like, mRNA (cDNA clone MGC:163468 IMAGE:40146627), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fok.3 // UCSC Genes // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like (VHLL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470154 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:156268415:156269090:-1 gene:ENSG00000189030 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178229 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3 (IQGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000361170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156525405:156572540:-1 gene:ENSG00000183856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498755 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:156537176:156539465:-1 gene:ENSG00000183856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033549 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4826963, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131536 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:141847 IMAGE:40082932), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080657 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156525405:156572540:-1 Gene:OTTHUMG00000033114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080658 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156525405:156572604:-1 Gene:OTTHUMG00000033114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080659 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156537176:156539465:-1 Gene:OTTHUMG00000033114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000080660 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156536831:156538861:-1 Gene:OTTHUMG00000033114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fpf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3 (IQGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wsb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3 (IQGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC005081 // GenBank HTC // Homo sapiens brevican, mRNA (cDNA clone IMAGE:3618761), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens brevican, mRNA (cDNA clone IMAGE:3618761), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006617 // RefSeq // Homo sapiens nestin (NES), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000255024 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:156642155:156647189:-1 gene:ENSG00000132688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156668763:156677397:-1 gene:ENSG00000132688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK025494 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21841 fis, clone HEP01831. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082844 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156668763:156677397:-1 Gene:OTTHUMG00000034299 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fpq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nestin (NES), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbh.1 // UCSC Genes // Homo sapiens nestin (NES), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001199723 // RefSeq // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 2 (CRABP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001878 // RefSeq // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 2 (CRABP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156699756:156705747:-1 gene:ENSG00000143320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156699606:156705601:-1 gene:ENSG00000143320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001109 // GenBank // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:1183 IMAGE:2988143), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098966 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156699606:156705601:-1 Gene:OTTHUMG00000041300 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098967 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156700875:156705816:-1 Gene:OTTHUMG00000041300 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098968 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156699756:156705747:-1 Gene:OTTHUMG00000041300 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fpr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 2 (CRABP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 2 (CRABP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014215 // RefSeq // Homo sapiens insulin receptor-related receptor (INSRR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156840063:156859018:-1 gene:ENSG00000027644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK310760 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17802. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098929 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:156840063:156859018:-1 Gene:OTTHUMG00000041291 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wsj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens insulin receptor-related receptor (INSRR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pht.2 // UCSC Genes // Homo sapiens insulin receptor-related receptor (INSRR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004341 // RefSeq // Homo sapiens ets variant 3-like (ETV3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157092044:157099808:-1 gene:ENSG00000253831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099024 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:157092044:157099808:-1 Gene:OTTHUMG00000041325 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fqq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ets variant 3-like (ETV3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000457799 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:157674321:157676732:-1 gene:ENSG00000160856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000051424 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:157644111:157646522:-1 Gene:OTTHUMG00000019401 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005894 // RefSeq // Homo sapiens CD5 molecule-like (CD5L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157830914:157841798:-1 gene:ENSG00000073754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157835946:157898256:-1 gene:ENSG00000073754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033586 // GenBank // Homo sapiens CD5 molecule-like, mRNA (cDNA clone MGC:34443 IMAGE:5225975), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058346 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:157830914:157841798:-1 Gene:OTTHUMG00000022440 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000058347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:157835946:157898256:-1 Gene:OTTHUMG00000022440 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frk.4 // UCSC Genes // Homo sapiens CD5 molecule-like (CD5L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001764 // RefSeq // Homo sapiens CD1b molecule (CD1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158327951:158331531:-1 gene:ENSG00000158485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK303329 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56727 complete cds, highly similar to T-cell surface glycoprotein CD1b precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069481 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:97106 IMAGE:7262331), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074747 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:103825 IMAGE:30915207), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104216 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:125990 IMAGE:40031984), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104217 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:125991 IMAGE:40031985), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046350 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158327951:158331531:-1 Gene:OTTHUMG00000017513 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089860 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158327951:158331025:-1 Gene:OTTHUMG00000017513 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1b molecule (CD1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pic.1 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1b molecule (CD1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001frw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens CD1b molecule (CD1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004475 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily T, member 2 (OR10T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158398522:158399466:-1 gene:ENSG00000186306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000046371 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158398522:158399466:-1 Gene:OTTHUMG00000017521 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pih.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily T, member 2 (OR10T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001160325 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily P, member 1 (OR6P1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158562651:158563604:-1 gene:ENSG00000186440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000051848 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158562651:158563604:-1 Gene:OTTHUMG00000019633 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pim.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily P, member 1 (OR6P1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004477 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily X, member 1 (OR10X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158578919:158579899:-1 gene:ENSG00000186400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000051850 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158578919:158579899:-1 Gene:OTTHUMG00000019635 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pin.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily X, member 1 (OR10X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005279 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2 (OR6K2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137022 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168638 IMAGE:9021015), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137023 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168639 IMAGE:9021016), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359610 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2558:183183:184127:+ gene:ENSG00000196171 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059061 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158699678:158700652:-1 Gene:OTTHUMG00000022768 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fsu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2 (OR6K2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005327 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 3 (OR6K3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158717168:158718115:-1 gene:ENSG00000203757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:158717168:158718163:-1 gene:ENSG00000203757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059063 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158717168:158718115:-1 Gene:OTTHUMG00000022770 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pbn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 3 (OR6K3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005185 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 1 (OR6N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158765744:158766682:-1 gene:ENSG00000197403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC146847 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:181950 IMAGE:9056775), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059067 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158765744:158766682:-1 Gene:OTTHUMG00000022774 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010piq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 1 (OR6N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005278 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 2 (OR6N2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158776682:158777635:-1 gene:ENSG00000188340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059068 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:158776682:158777635:-1 Gene:OTTHUMG00000022775 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pir.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 2 (OR6N2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004469 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5 (OR10J5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137025 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168643 IMAGE:9021020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137026 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168644 IMAGE:9021021), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000334857 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1160:360306:361235:+ gene:ENSG00000184155 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000059021 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:159535078:159536007:-1 Gene:OTTHUMG00000022738 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010piw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5 (OR10J5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390859 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:159851906:159851972:-1 gene:ENSG00000212161 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_145167 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M (PIGM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC001803 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:3194 IMAGE:3357207), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC019865 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:29896 IMAGE:4931239), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368090 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1649:371202:372473:+ gene:ENSG00000143315 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060643 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160027673:160031991:-1 Gene:OTTHUMG00000024081 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fuv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M (PIGM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002241 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (KCNJ10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000509700 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:160040471:160042295:-1 gene:ENSG00000177807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC131627 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:149802 IMAGE:40118533), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000368089 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1649:359425:360564:+ gene:ENSG00000177807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060629 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160037467:160070248:-1 Gene:OTTHUMG00000024073 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000060641 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:160010261:160012085:-1 Gene:OTTHUMG00000024079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fuw.2 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (KCNJ10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364738 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:160392768:160392909:-1 gene:ENSG00000201608 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411077 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:80599705:80599793:-1 gene:ENSG00000223009 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_017625 // RefSeq // Homo sapiens intelectin 1 (galactofuranose binding) (ITLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000326245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160876539:160885170:-1 gene:ENSG00000179914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160879312:160881521:-1 gene:ENSG00000179914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC020664 // GenBank // Homo sapiens intelectin 1 (galactofuranose binding), mRNA (cDNA clone MGC:22348 IMAGE:4693329), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000071462 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160876539:160885170:-1 Gene:OTTHUMG00000028604 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000071463 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160879312:160881521:-1 Gene:OTTHUMG00000028604 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000071464 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:160881154:160882295:-1 Gene:OTTHUMG00000028604 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001fxc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens intelectin 1 (galactofuranose binding) (ITLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459014 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:161141208:161141336:-1 gene:ENSG00000238934 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pbx.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon CAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pbz.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pca.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asn (anticodon GTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcb.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcf.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcg.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pch.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pck.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcl.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcm.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcp.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcq.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcr.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcu.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon CTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcv.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon TCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pcw.1 // UCSC Genes // transfer RNA Asp (anticodon GTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdc.1 // UCSC Genes // transfer RNA Gly (anticodon GCC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdd.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pdl.1 // UCSC Genes // transfer RNA Leu (anticodon CAA) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000449604 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:161607438:161608218:-1 gene:ENSG00000231813 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083315 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000083315 cpcScore=-0.2631430 cnci=-0.2541105 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002595 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L31 pseudogene 11 (RPL31P11), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161683695:161685252:-1 gene:ENSG00000213075 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ribosomal protein L31 pseudogene 11 (RPL31P11), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gbc.2 cpcScore=1.8853300 cnci=-0.2918607 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_182581 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111 (C1orf111), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162373203:162376870:-1 gene:ENSG00000171722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162374444:162376808:-1 gene:ENSG00000171722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC032957 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111, mRNA (cDNA clone MGC:33651 IMAGE:4827863), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000076791 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162373203:162376870:-1 Gene:OTTHUMG00000031375 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000076792 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162374444:162376808:-1 Gene:OTTHUMG00000031375 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111 (C1orf111), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_053282 // RefSeq // Homo sapiens SH2 domain containing 1B (SH2D1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359567 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:162365373:162381916:-1 gene:ENSG00000198574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162402477:162412138:-1 gene:ENSG00000198574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022407 // GenBank // Homo sapiens SH2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:24157 IMAGE:4717041), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC066595 // GenBank // Homo sapiens SH2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:74501 IMAGE:5755414), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367929 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold444:1236498:1263144:- gene:ENSG00000198574 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000076794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162395266:162412126:-1 Gene:OTTHUMG00000031377 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000076795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162402477:162412138:-1 Gene:OTTHUMG00000031377 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gbz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SH2 domain containing 1B (SH2D1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gca.1 // UCSC Genes // Homo sapiens SH2 domain containing 1B (SH2D1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_178550 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162854297:162868761:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:162854297:162859664:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367912 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:162851316:162868815:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000524691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162824458:162855783:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK123573 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41579 fis, clone CTONG2019704. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309620 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99661. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083210 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162851316:162868815:-1 Gene:OTTHUMG00000034421 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083211 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:162854297:162868761:-1 Gene:OTTHUMG00000034421 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gck.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wux.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wuw.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364400 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:164980035:164980137:-1 gene:ENSG00000201270 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390797 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:164983902:164983992:-1 gene:ENSG00000212086 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516550 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:165041710:165041781:-1 gene:ENSG00000252359 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006917 // RefSeq // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma (RXRG), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033824 // RefSeq // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma (RXRG), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165410750:165424972:-1 gene:ENSG00000143171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB593016 // GenBank // Homo sapiens RXRG mRNA for retinoic acid receptor RXR-gamma, complete cds, clone: HP03153-RBd66G08. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012063 // GenBank // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:19909 IMAGE:4635470), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359842 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold254:316618:351499:- gene:ENSG00000143171 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083794 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:165400917:165445196:-1 Gene:OTTHUMG00000034626 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083795 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:165410750:165424972:-1 Gene:OTTHUMG00000034626 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083796 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:165436928:165445172:-1 Gene:OTTHUMG00000034626 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gda.3 // UCSC Genes // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma (RXRG), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdb.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma (RXRG), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pea.1 // UCSC Genes // Homo sapiens retinoid X receptor, gamma (RXRG), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_053053 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (TADA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166856510:166863216:-1 gene:ENSG00000152382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309250 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99291. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015401 // GenBank // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone MGC:21805 IMAGE:4182025), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC036497 // GenBank HTC // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5264296), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367874 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold486:40763:54979:+ gene:ENSG00000152382 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082881 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:166856510:166876327:-1 Gene:OTTHUMG00000034321 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000082882 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:166856510:166863216:-1 Gene:OTTHUMG00000034321 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (TADA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gdw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (TADA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wve.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (TADA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005814 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane) (GPA33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000527955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:167052836:167078719:-1 gene:ENSG00000143167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069705 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:97280 IMAGE:7262529), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069789 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:97233 IMAGE:7262482), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC074830 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:104092 IMAGE:30915543), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107164 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:129986 IMAGE:40034324), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC107165 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:129987 IMAGE:40034331), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367868 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1085:895240:933019:+ gene:ENSG00000143167 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083245 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:167052836:167090631:-1 Gene:OTTHUMG00000034435 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gea.1 // UCSC Genes // Homo sapiens glycoprotein A33 (transmembrane) (GPA33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003851 // RefSeq // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (CREG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:167529677:167546180:-1 gene:ENSG00000143162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006786 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1, mRNA (cDNA clone MGC:5274 IMAGE:2900817), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000370509 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1085:344956:354488:+ gene:ENSG00000143162 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083911 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:167541013:167553767:-1 Gene:OTTHUMG00000034682 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083912 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:167529677:167546180:-1 Gene:OTTHUMG00000034682 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gel.3 // UCSC Genes // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (CREG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pek.1 // UCSC Genes // transfer RNA Pro (anticodon AGG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_026844 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 (ANKRD36BP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000358576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168245565:168247343:-1 gene:ENSG00000214262 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097975 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:168245788:168247204:-1 Gene:OTTHUMG00000040770 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010plo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 (ANKRD36BP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010plo.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010plo.1 cpcScore=3.6008900 cnci=-0.3451138 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384153 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:168263375:168263481:-1 gene:ENSG00000206880 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408651 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:168747796:168747882:-1 gene:ENSG00000221578 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_006996 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2 (SLC19A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367802 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:169433147:169455146:-1 gene:ENSG00000117479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169463929:169485931:-1 gene:ENSG00000117479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018514 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:17044 IMAGE:3872233), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000236137 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold164:1111945:1136440:- gene:ENSG00000117479 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086106 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169463909:169486003:-1 Gene:OTTHUMG00000035452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086107 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169463929:169485931:-1 Gene:OTTHUMG00000035452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086108 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:169433147:169455146:-1 Gene:OTTHUMG00000035452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gge.4 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2 (SLC19A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ggf.4 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2 (SLC19A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000130 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor V (proaccelerin, labile factor) (F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169514166:169586588:-1 gene:ENSG00000198734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169514166:169515745:-1 gene:ENSG00000198734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000546081 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:169515727:169555719:-1 gene:ENSG00000198734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50218 complete cds, highly similar to Coagulation factor V precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367796 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold164:1174773:1250502:- gene:ENSG00000198734 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083712 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169514166:169586588:-1 Gene:OTTHUMG00000034595 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083713 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169514166:169586588:-1 Gene:OTTHUMG00000034595 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000083714 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:169514166:169515745:-1 Gene:OTTHUMG00000034595 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ggg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor V (proaccelerin, labile factor) (F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010plr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor V (proaccelerin, labile factor) (F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401105 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:171041347:171041440:-1 gene:ENSG00000215924 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365212 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:171418644:171418750:-1 gene:ENSG00000202082 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364256 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:171519816:171519913:-1 gene:ENSG00000201126 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000261 // RefSeq // Homo sapiens myocilin, trabecular meshwork inducible glucocorticoid response (MYOC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000037502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:171635417:171652683:-1 gene:ENSG00000034971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357746 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:171604559:171621857:-1 gene:ENSG00000034971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000536591 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:171604559:171621811:-1 gene:ENSG00000034971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000537133 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:171604559:171621773:-1 gene:ENSG00000034971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300924 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54172 complete cds, highly similar to Myocilin precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029261 // GenBank // Homo sapiens myocilin, trabecular meshwork inducible glucocorticoid response, mRNA (cDNA clone MGC:34504 IMAGE:5179076), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084178 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:171635417:171652683:-1 Gene:OTTHUMG00000034789 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ghu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens myocilin, trabecular meshwork inducible glucocorticoid response (MYOC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pmk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens myocilin, trabecular meshwork inducible glucocorticoid response (MYOC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pex.1 // UCSC Genes // transfer RNA Glu (anticodon TTC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516134 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:172613428:172613534:-1 gene:ENSG00000251943 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_005092 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (TNFSF18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000239468 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:173009100:173020056:-1 gene:ENSG00000120337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069319 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:96898 IMAGE:7262107), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC093986 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:121021 IMAGE:7939831), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC112032 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:138237 IMAGE:8327500), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000404377 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2130:659314:667538:- gene:ENSG00000120337 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084268 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173039960:173050963:-1 Gene:OTTHUMG00000034835 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001giu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (TNFSF18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037845 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100506023 (LOC100506023), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gix.1 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC100506023 (LOC100506023), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000421168 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000421168 cpcScore=-0.1535860 cnci=-0.3044137 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198493 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45 (ANKRD45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000333279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173609561:173669862:-1 gene:ENSG00000183831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC094694 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30390156. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126353 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45, mRNA (cDNA clone MGC:161631 IMAGE:8992069), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126355 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45, mRNA (cDNA clone MGC:161633 IMAGE:8992071), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097580 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173609561:173669862:-1 Gene:OTTHUMG00000040546 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gja.1 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45 (ANKRD45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453299 // ENSEMBL // [retired] cdna:novel chromosome:GRCh37:1:173626484:173644582:-1 gene:ENSG00000228394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gjb.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45 (ANKRD45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459202 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:173629236:173629339:-1 gene:ENSG00000238430 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003944 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 78 (SNORD78), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385582 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:173834760:173834824:-1 gene:ENSG00000208317 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wwl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 78 (SNORD78), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wwl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009wwl.2 cpcScore=-1.1982900 cnci=-1.0932185 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003941 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 75 (SNORD75), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385575 // ENSEMBL // [retired] ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:173836017:173836076:-1 gene:ENSG00000208310 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wwo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 75 (SNORD75), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000488 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1 (SERPINC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000351522 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:173872948:173886496:-1 gene:ENSG00000117601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173903809:173917378:-1 gene:ENSG00000117601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000494024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173911980:173917316:-1 gene:ENSG00000117601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022309 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:22579 IMAGE:4734914), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090734 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173903809:173917378:-1 Gene:OTTHUMG00000037276 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090735 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173911980:173917316:-1 Gene:OTTHUMG00000037276 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090736 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:173909730:173914665:-1 Gene:OTTHUMG00000037276 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gjt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1 (SERPINC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459580 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:174169267:174169368:-1 gene:ENSG00000238872 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010pmu.1 // UCSC Genes // Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022628 3' read GPR52 mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022100 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037606 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:175012958:175023425:-1 gene:ENSG00000120333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009788 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:13571 IMAGE:4132323), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084416 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:175012958:175023425:-1 Gene:OTTHUMG00000034878 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084417 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:175014245:175023415:-1 Gene:OTTHUMG00000034878 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gkk.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wwr.3 // UCSC Genes // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383932 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:175022479:175022580:-1 gene:ENSG00000206659 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003285 // RefSeq // Homo sapiens tenascin R (TNR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000263525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:175322799:175743616:-1 gene:ENSG00000116147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367673 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:175291935:175712752:-1 gene:ENSG00000116147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:175315194:175743770:-1 gene:ENSG00000116147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK295823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60578 complete cds, highly similar to Tenascin-R precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC129830 // GenBank // Homo sapiens tenascin R (restrictin, janusin), mRNA (cDNA clone MGC:149328 IMAGE:40114168), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084414 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:175315194:175743770:-1 Gene:OTTHUMG00000034876 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098116 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:175391428:175406364:-1 Gene:OTTHUMG00000034876 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gkp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tenascin R (TNR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wwu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tenascin R (TNR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pmz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens tenascin R (TNR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// Z67996 // GenBank // H.sapiens mRNA for tenascin-R (restrictin). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002998 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 3 (SCARNA3), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000517097 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:175968398:175968540:-1 gene:ENSG00000252906 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gkx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 3 (SCARNA3), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517216 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:176243862:176244029:-1 gene:ENSG00000253025 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000422603 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:176585404:176585925:-1 gene:ENSG00000237514 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410817 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:177186360:177186452:-1 gene:ENSG00000222749 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000445098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178495896:178499634:-1 gene:ENSG00000188585 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084757 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:178493899:178499634:-1 Gene:OTTHUMG00000035021 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364921 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:178753654:178753772:-1 gene:ENSG00000201791 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_004673 // RefSeq // Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178850624:178871022:-1 gene:ENSG00000116194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415564 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:178819761:178838445:-1 gene:ENSG00000116194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300218 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51304 complete cds, highly similar to Angiopoietin-related protein 1 precursor. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC050640 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:60131 IMAGE:5725751), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000234816 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold377:825542:842369:- gene:ENSG00000116194 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000084924 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:178849705:178871052:-1 Gene:OTTHUMG00000035075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098158 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:178865434:178869278:-1 Gene:OTTHUMG00000035075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098159 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:178850624:178871022:-1 Gene:OTTHUMG00000035075 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gma.3 // UCSC Genes // Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pnc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014625 // RefSeq // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179550539:179575933:-1 gene:ENSG00000116218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179550539:179575952:-1 gene:ENSG00000116218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC029141 // GenBank // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin), mRNA (cDNA clone MGC:34362 IMAGE:5187188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085283 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179550539:179575933:-1 Gene:OTTHUMG00000035252 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085284 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:179550539:179575952:-1 Gene:OTTHUMG00000035252 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmq.4 // UCSC Genes // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wxi.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ592690 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-59802, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pfk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40099, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ571986 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-40098, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmt.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gmt.2 cpcScore=-1.2758300 cnci=-0.1859764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40092, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ600552 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-38618, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pnm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-46569, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ595741 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-61853, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmu.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gmu.2 cpcScore=-1.2741900 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-32011, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ601755 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-39821, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmv.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gmv.2 cpcScore=-1.3073800 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-39819, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ592269 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-59381, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmw.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gmw.2 cpcScore=-1.1461200 cnci=-0.5254478 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31766, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ577099 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-45211, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmx.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gmx.2 cpcScore=-1.4402900 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-40724, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587855 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-54967, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pfl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44943, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ578106 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-46218, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gmz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-46218, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576856 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44968, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gna.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gna.2 cpcScore=-1.3199400 cnci=-0.1925491 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gna.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31763, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ590691 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-57803, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gnb.2 cpcScore=-1.2657100 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42338, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576653 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44765, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31699, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599950 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-38016, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pnn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-51155, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ594459 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-60571, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gnd.2 cpcScore=-1.2941900 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gnd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-31689, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ591798 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-58910, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gne.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gne.2 cpcScore=-1.4534500 cnci=-0.2823971 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gne.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-50151, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ578586 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-46698, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pno.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pno.1 cpcScore=-1.3624500 cnci=-0.2276622 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pno.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-46698, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408620 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:179710250:179710346:-1 gene:ENSG00000221547 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pfo.1 // UCSC Genes // transfer RNA Val (anticodon AAC) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384178 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:180519016:180519119:-1 gene:ENSG00000206905 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002928 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16 (RGS16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK301261 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57620 complete cds, highly similar to Regulator of G-protein signaling 16. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC006243 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16, mRNA (cDNA clone MGC:10379 IMAGE:3946461), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367558 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold450:2072857:2076709:+ gene:ENSG00000143333 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000085188 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:182598623:182604408:-1 Gene:OTTHUMG00000035212 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gpl.4 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16 (RGS16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pnv.1 // UCSC Genes // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16 (RGS16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000444141 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000444141 cpcScore=1.1919700 cnci=-0.2669481 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384741 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:182982212:182982318:-1 gene:ENSG00000207472 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC071857 // GenBank // Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa, mRNA (cDNA clone MGC:88523 IMAGE:5922521), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203454 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (APOBEC4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183647567:183653316:-1 gene:ENSG00000173627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC021711 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:26594 IMAGE:4826920), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308641 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold450:1021217:1022311:+ gene:ENSG00000173627 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086126 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:183646404:183653313:-1 Gene:OTTHUMG00000035459 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086127 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:183647567:183653316:-1 Gene:OTTHUMG00000035459 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gqn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (APOBEC4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pgc.1 // UCSC Genes // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (APOBEC4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362970 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:184171714:184171823:-1 gene:ENSG00000199840 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516413 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:184821428:184821489:-1 gene:ENSG00000252222 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000383913 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185257911:185258015:-1 gene:ENSG00000206640 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384380 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185630428:185630528:-1 gene:ENSG00000207108 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364726 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185634073:185634182:-1 gene:ENSG00000201596 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002597 // RefSeq // Homo sapiens phosducin (PDC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_022576 // RefSeq // Homo sapiens phosducin (PDC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000340129 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:186413111:186418591:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186443566:186461122:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000456239 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:186413020:186415637:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186443582:186448724:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086347 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:186443566:186461122:-1 Gene:OTTHUMG00000035575 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086348 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:186443582:186448724:-1 Gene:OTTHUMG00000035575 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001grz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens phosducin (PDC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsa.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000963 // RefSeq // Homo sapiens prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase) (PTGS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:186672893:186680423:-1 gene:ENSG00000073756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AJ634912 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative cyclooxygenase-2 (COX-2 gene), splice variant COX-2a. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC013734 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase), mRNA (cDNA clone MGC:9576 IMAGE:3880850), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367468 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1361:2943003:2947837:+ gene:ENSG00000073756 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086157 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:186671791:186680427:-1 Gene:OTTHUMG00000035473 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086158 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:186672893:186680423:-1 Gene:OTTHUMG00000035473 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086159 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:186674496:186675869:-1 Gene:OTTHUMG00000035473 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gsb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase) (PTGS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wyo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase) (PTGS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// cox2 // GenBank // gi|26556996|ref|NC_001284.2|40502:42628:-1 product=cytochrome c oxidase subunit 2, Mitochondrion [Arabidopsis thaliana] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000086268 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000086268 cpcScore=-1.3566000 cnci=-0.3931984 gene:OTTHUMG00000035527 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000450681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:189868001:189868528:-1 gene:ENSG00000238270 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408218 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:192491128:192491220:-1 gene:ENSG00000221145 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003783 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3GALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:193179045:193186654:-1 gene:ENSG00000162630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022507 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:26499 IMAGE:4792498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086759 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:193179045:193186654:-1 Gene:OTTHUMG00000035687 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gtc.4 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3GALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pgr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3GALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516432 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:193700988:193701074:-1 gene:ENSG00000252241 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516004 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:194488103:194488205:-1 gene:ENSG00000251813 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001994 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor XIII, B polypeptide (F13B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:197039191:197067267:-1 gene:ENSG00000143278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000490002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:197040145:197050845:-1 gene:ENSG00000143278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088821 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197039191:197067267:-1 Gene:OTTHUMG00000036519 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088822 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197040145:197050845:-1 Gene:OTTHUMG00000036519 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gtt.1 // UCSC Genes // Homo sapiens coagulation factor XIII, B polypeptide (F13B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_194314 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41 (ZBTB41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:197158442:197200521:-1 gene:ENSG00000177888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK128549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46708 fis, clone TRACH3015951, weakly similar to Zinc finger protein 151. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132818 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:164449 IMAGE:40146840), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136600 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:168213 IMAGE:9020590), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367405 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2905:433590:471011:- gene:ENSG00000177888 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088249 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197153680:197200542:-1 Gene:OTTHUMG00000036275 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088250 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:197158442:197200521:-1 Gene:OTTHUMG00000036275 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gtx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41 (ZBTB41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009wyz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41 (ZBTB41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384410 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:197685640:197685740:-1 gene:ENSG00000207139 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029626 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 181a-1 (MIR181A1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000385026 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:198859044:198859153:-1 gene:ENSG00000207759 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001guy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 181a-1 (MIR181A1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001guy.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001guy.2 cpcScore=-1.2530800 cnci=-0.3627061 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410741 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:143828767:143828863:-1 gene:ENSG00000239006 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200008505:200008607:-1 gene:ENSG00000202491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365459 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200014689:200014795:-1 gene:ENSG00000202329 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040064 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 862 (LINC00862), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200342544:200373792:-1 gene:ENSG00000203721 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200342544:200374354:-1 gene:ENSG00000203721 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000086877 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200342544:200373792:-1 Gene:OTTHUMG00000035722 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098709 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:200342544:200374354:-1 Gene:OTTHUMG00000035722 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gvd.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 862 (LINC00862), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200933345:200933447:-1 gene:ENSG00000201032 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000069 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (CACNA1S), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000362061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201039514:201112566:-1 gene:ENSG00000081248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:201039512:201112451:-1 gene:ENSG00000081248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC133671 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit, mRNA (cDNA clone MGC:149103 IMAGE:40073990), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087049 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201039514:201112566:-1 Gene:OTTHUMG00000035784 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087050 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201039512:201112451:-1 Gene:OTTHUMG00000035784 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gvv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (CACNA1S), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000412995 // ENSEMBL // [retired] havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:201084904:201096312:-1 gene:ENSG00000237688 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012134 // RefSeq // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle) (LMOD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201896452:201946587:-1 gene:ENSG00000163431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400965 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:201865699:201915716:-1 gene:ENSG00000163431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000412469 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:201867236:201915635:-1 gene:ENSG00000163431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK304852 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53443 complete cds, highly similar to Leiomodin-1. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC080187 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle), mRNA (cDNA clone MGC:87977 IMAGE:6177902), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087085 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:201896452:201946587:-1 Gene:OTTHUMG00000035802 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ppu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle) (LMOD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021phl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle) (LMOD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021phm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle) (LMOD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001256129 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A (ARL8A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_138795 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A (ARL8A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000272217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202133404:202144741:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202135202:202138034:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015408 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A, mRNA (cDNA clone MGC:21954 IMAGE:4391821), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087493 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202133404:202144741:-1 Gene:OTTHUMG00000035923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087494 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202134383:202135608:-1 Gene:OTTHUMG00000035923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087495 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202135202:202138034:-1 Gene:OTTHUMG00000035923 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxk.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458934 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:202166756:202166859:-1 gene:ENSG00000238571 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014176 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (UBE2T), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202331657:202341980:-1 gene:ENSG00000077152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC004152 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative), mRNA (cDNA clone MGC:2385 IMAGE:2821806), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099163 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202331657:202341980:-1 Gene:OTTHUMG00000041392 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099164 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202331837:202341980:-1 Gene:OTTHUMG00000041392 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099165 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202333010:202335818:-1 Gene:OTTHUMG00000041392 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gxx.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (UBE2T), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517233 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202527310:202527427:-1 gene:ENSG00000253042 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002871 // RefSeq // Homo sapiens RAB interacting factor (RABIF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC018488 // GenBank // Homo sapiens RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:21266 IMAGE:4475846), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037392 // GenBank // Homo sapiens RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:34651 IMAGE:5191960), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367262 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2953:103652:103822:+ gene:ENSG00000183155 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099183 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:202878957:202889135:-1 Gene:OTTHUMG00000041400 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gyl.3 // UCSC Genes // Homo sapiens RAB interacting factor (RABIF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362601 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202914880:202914980:-1 gene:ENSG00000199471 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036557 // RefSeq // Homo sapiens alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog (LOC100506747), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021phr.1 // UCSC Genes // Homo sapiens 4933406M09Rik pseudogene (LOC401980), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000417729 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:202987277:202988482:-1 gene:ENSG00000234761 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002479 // RefSeq // Homo sapiens myogenin (myogenic factor 4) (MYOG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000241651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203083132:203086036:-1 gene:ENSG00000122180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC053899 // GenBank // Homo sapiens myogenin (myogenic factor 4), mRNA (cDNA clone MGC:61433 IMAGE:6170028), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100279 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203083132:203086036:-1 Gene:OTTHUMG00000042127 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzd.3 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034150 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1136 (LINC01136), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034151 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1136 (LINC01136), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000457348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:203298758:203305309:-1 gene:ENSG00000233791 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087170 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203298758:203305309:-1 Gene:OTTHUMG00000035835 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098780 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203300514:203304548:-1 Gene:OTTHUMG00000035835 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098781 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:203301166:203305259:-1 Gene:OTTHUMG00000035835 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC730227 (LOC730227), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xao.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC730227 (LOC730227), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001gzp.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001gzp.1 cpcScore=-0.2552290 cnci=-0.2218808 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xao.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009xao.1 cpcScore=-0.2713710 cnci=-0.2277458 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365430 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:203318996:203319099:-1 gene:ENSG00000202300 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002256 // RefSeq // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor (KISS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204190341:204196486:-1 gene:ENSG00000170498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC022819 // GenBank // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor, mRNA (cDNA clone MGC:39258 IMAGE:5443510), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087892 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:204190341:204196486:-1 Gene:OTTHUMG00000036060 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001har.3 // UCSC Genes // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor (KISS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198447 // RefSeq // Homo sapiens golgi transport 1A (GOLT1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000308302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204198160:204214092:-1 gene:ENSG00000174567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:204198942:204201701:-1 gene:ENSG00000174567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB075871 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of HMFN1187, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC058832 // GenBank // Homo sapiens golgi transport 1 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62027 IMAGE:6458279), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087887 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:204198160:204214092:-1 Gene:OTTHUMG00000036056 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087888 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:204198942:204201701:-1 Gene:OTTHUMG00000036056 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001has.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi transport 1A (GOLT1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hat.1 // UCSC Genes // Homo sapiens golgi transport 1A (GOLT1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027022 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 628 (LINC00628), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pqu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 628 (LINC00628), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_032833 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (PPP1R15B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000543650 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:204375080:204380945:-1 gene:ENSG00000158615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065280 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15B, mRNA (cDNA clone MGC:74824 IMAGE:6172811), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367188 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold1850:117586:122374:- gene:ENSG00000158615 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087974 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:204403387:204411791:-1 Gene:OTTHUMG00000036105 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hav.4 // UCSC Genes // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (PPP1R15B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021phw.1 // UCSC Genes // transfer RNA Lys (anticodon TTT) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516922 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:198369297:198369385:1 gene:ENSG00000252731 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000517137 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:204873875:204873946:-1 gene:ENSG00000252946 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001hbp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ34019 fis, clone FCBBF2002898. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_203376 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 81 (TMEM81), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205083129:205084460:-1 gene:ENSG00000174529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC061592 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:75217 IMAGE:6202253), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090076 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:205083129:205084460:-1 Gene:OTTHUMG00000037103 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hbt.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 81 (TMEM81), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_030952 // RefSeq // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (NUAK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205302059:205321755:-1 gene:ENSG00000163545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309520 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99561. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017306 // GenBank // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:29812 IMAGE:5088037), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090390 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:205302059:205321755:-1 Gene:OTTHUMG00000037196 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hce.3 // UCSC Genes // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (NUAK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xbj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (NUAK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027086 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC284578 (LOC284578), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hcu.2 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC284578 (LOC284578), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022731 // RefSeq // Homo sapiens nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (NUCKS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264531 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:205687523:205719293:-1 gene:ENSG00000069275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205712819:205750276:-1 gene:ENSG00000069275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464938 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:205718452:205719726:-1 gene:ENSG00000069275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000805 // GenBank // Homo sapiens nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:5494 IMAGE:3452665), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087729 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:205712819:205750276:-1 Gene:OTTHUMG00000035996 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087730 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:205718452:205719726:-1 Gene:OTTHUMG00000035996 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hdb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (NUCKS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365074 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:205731221:205731352:-1 gene:ENSG00000201944 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516883 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:206080239:206080324:1 gene:ENSG00000252692 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362479 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:206747980:206748092:-1 gene:ENSG00000199349 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000572 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 10 (IL10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000423557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206767602:206772494:-1 gene:ENSG00000136634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206768695:206771199:-1 gene:ENSG00000136634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC104252 // GenBank // Homo sapiens interleukin 10, mRNA (cDNA clone MGC:126450 IMAGE:40035920), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// EU751619 // GenBank // Homo sapiens clone 2 interleukin 10 (IL10) mRNA, 5 UTR and partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088564 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206767602:206772494:-1 Gene:OTTHUMG00000036386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088565 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206768695:206771199:-1 Gene:OTTHUMG00000036386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000358154 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206769621:206771189:-1 Gene:OTTHUMG00000036386 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hen.1 // UCSC Genes // Homo sapiens interleukin 10 (IL10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xbx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens clone 1 interleukin 10 (IL10) mRNA, 5' UTR and partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002644 // RefSeq // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor (PIGR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000356495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206928518:206946466:-1 gene:ENSG00000162896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487208 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:206931434:206931833:-1 gene:ENSG00000162896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC110494 // GenBank // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:125361 IMAGE:40007650), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR749533 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I21225 (from clone DKFZp686I21225). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088975 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206928518:206946466:-1 Gene:OTTHUMG00000036581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088976 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206937546:206939466:-1 Gene:OTTHUMG00000036581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088977 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:206931434:206931833:-1 Gene:OTTHUMG00000036581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hez.3 // UCSC Genes // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor (PIGR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xbz.3 // UCSC Genes // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor (PIGR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021pih.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TGG) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001083924 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_023938 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:207020695:207032756:-1 gene:ENSG00000182795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC000765 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116, mRNA (cDNA clone MGC:2742 IMAGE:2822914), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359470 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2061:1502625:1507853:- gene:ENSG00000182795 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088973 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:207018521:207032747:-1 Gene:OTTHUMG00000036580 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hfd.2 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xcb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pii.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459582 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:207212039:207212145:-1 gene:ENSG00000238401 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018566 // RefSeq // Homo sapiens YOD1 deubiquitinase (YOD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207043849:207052980:-1 gene:ENSG00000180667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391927 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:207217194:207225580:-1 gene:ENSG00000180667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK128014 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46133 fis, clone TESTI2051742. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137166 // GenBank // Homo sapiens YOD1 OTU deubiquinating enzyme 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168786 IMAGE:9021163), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000315927 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2061:1539535:1541792:- gene:ENSG00000180667 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087836 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:207043849:207052980:-1 Gene:OTTHUMG00000036032 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000087837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:207043849:207051077:-1 Gene:OTTHUMG00000036032 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hfe.1 // UCSC Genes // Homo sapiens YOD1 deubiquitinase (YOD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hff.1 // UCSC Genes // Homo sapiens YOD1 deubiquitinase (YOD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000401318 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:208300571:208300640:-1 gene:ENSG00000216137 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152485 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74 (C1orf74), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC039719 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74, mRNA (cDNA clone MGC:47797 IMAGE:5770046), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000294811 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold679:317063:317872:+ gene:ENSG00000162757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088745 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:209779208:209784559:-1 Gene:OTTHUMG00000036483 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hhp.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74 (C1orf74), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pio.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74 (C1orf74), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000425218 // ENSEMBL // [retired]cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:210440225:210440587:-1 gene:ENSG00000228110 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364102 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:210374154:210374267:-1 gene:ENSG00000200972 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002238 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_172362 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000271751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:210678315:211133973:-1 gene:ENSG00000143473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:210683238:211134115:-1 gene:ENSG00000143473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113709 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:142269 IMAGE:8322761), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC143599 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:177128 IMAGE:9052111), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088332 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210678315:211133973:-1 Gene:OTTHUMG00000036309 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000088568 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:210683238:211134115:-1 Gene:OTTHUMG00000036309 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hib.2 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hic.2 // UCSC Genes // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408561 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:211210989:211211082:-1 gene:ENSG00000221488 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001164688 // RefSeq // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_183059 // RefSeq // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211476522:211492031:-1 gene:ENSG00000198570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035651 // GenBank HTC // Homo sapiens retinal degeneration 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5578431), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC065541 // GenBank // Homo sapiens retinal degeneration 3, mRNA (cDNA clone MGC:75344 IMAGE:6140075), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367002 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2363:990689:993978:+ gene:ENSG00000198570 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089837 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211476522:211492917:-1 Gene:OTTHUMG00000037002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089838 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211476522:211492031:-1 Gene:OTTHUMG00000037002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001him.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hin.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xda.2 // UCSC Genes // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021194 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (SLC30A1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000367001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:211571568:211578742:-1 gene:ENSG00000170385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC121015 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:149645 IMAGE:40117054), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000104738 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211571568:211578742:-1 Gene:OTTHUMG00000036995 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hio.1 // UCSC Genes // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (SLC30A1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410148 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:211653456:211653549:-1 gene:ENSG00000222080 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_014873 // RefSeq // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (LPGAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:211749793:211830238:-1 gene:ENSG00000123684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:211743457:211830772:-1 gene:ENSG00000123684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211829179:211830722:-1 gene:ENSG00000123684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034621 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:43049 IMAGE:4839400), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090150 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211743457:211830772:-1 Gene:OTTHUMG00000037120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090151 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211749793:211830238:-1 Gene:OTTHUMG00000037120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090152 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211829179:211830722:-1 Gene:OTTHUMG00000037120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090153 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:211779000:211793326:-1 Gene:OTTHUMG00000037120 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hiu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (LPGAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hiv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (LPGAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_018664 // RefSeq // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (BATF3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000243440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212686418:212699985:-1 gene:ENSG00000123685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212686418:212698755:-1 gene:ENSG00000123685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117489 // GenBank // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:151098 IMAGE:40126040), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089389 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212686418:212698755:-1 Gene:OTTHUMG00000036807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089390 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212686418:212687509:-1 Gene:OTTHUMG00000036807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089403 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212686418:212699985:-1 Gene:OTTHUMG00000036807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hjl.2 // UCSC Genes // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (BATF3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001024601 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 45 (SPATA45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000332912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212830141:212847649:-1 gene:ENSG00000185523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035742 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC149643, mRNA (cDNA clone MGC:46250 IMAGE:5744157), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089672 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:212830141:212847649:-1 Gene:OTTHUMG00000036920 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hjq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 227 (C1orf227), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408099 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:213609696:213609840:-1 gene:ENSG00000221026 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000451396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:213965894:213986153:-1 gene:ENSG00000230461 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC171896 // GenBank // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:9054550). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010ptz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:8862705). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408793 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:77007744:77007815:1 gene:ENSG00000221720 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_007123 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_206933 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:215622894:216423396:-1 gene:ENSG00000042781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:216173946:216423396:-1 gene:ENSG00000042781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366943 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold258:3763029:4572033:+ gene:ENSG00000042781 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000089986 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:216083370:216089139:-1 Gene:OTTHUMG00000037079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000090016 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:216173946:216423396:-1 Gene:OTTHUMG00000037079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000128138 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:215622894:216423396:-1 Gene:OTTHUMG00000037079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000128313 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:216083380:216085108:-1 Gene:OTTHUMG00000037079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hku.1 // UCSC Genes // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hkv.3 // UCSC Genes // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365628 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:215630026:215630117:-1 gene:ENSG00000202498 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038845 // RefSeq // Homo sapiens LYPLAL1 antisense RNA 1 (head to head) (LYPLAL1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098809 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:219086602:219173961:-1 Gene:OTTHUMG00000041228 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hlp.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC643723 (LOC643723), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000441331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:219086602:219173961:-1 gene:ENSG00000228063 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hlp.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hlp.2 cpcScore=-1.1113400 cnci=-0.3586741 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459217 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:220160853:220160956:-1 gene:ENSG00000238798 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029628 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 215 (MIR215), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220117853:220117962:-1 gene:ENSG00000207590 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pui.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 215 (MIR215), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pui.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pui.1 cpcScore=-1.4699300 cnci=-0.5112485 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_029711 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 194-1 (MIR194-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384892 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220118157:220118241:-1 gene:ENSG00000207624 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010puj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microRNA 194-1 (MIR194-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010puj.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010puj.1 cpcScore=-1.2283400 cnci=-0.1649137 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002994 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 36B (SNORA36B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_031705 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 664a (MIR664A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000410438 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220200546:220200676:-1 gene:ENSG00000222370 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pul.2 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 36B (SNORA36B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pul.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010pul.1 cpcScore=-1.4524000 cnci=-0.4791871 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000416839 // ENSEMBL // [retired]cdna:novel chromosome:GRCh37:1:220603286:220608023:-1 gene:ENSG00000224867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000552026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220832763:220880140:-1 gene:ENSG00000257551 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:221837334:221837437:-1 gene:ENSG00000200033 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ587965 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-55077, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010puo.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-43121, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ573170 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-41282, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hna.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41282, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576410 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44522, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnb.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hnb.2 cpcScore=-1.4178500 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44522, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584993 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-52105, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pup.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-52105, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584971 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-52083, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pji.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-41965, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ575983 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44095, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hnd.2 cpcScore=-1.2774400 cnci=-0.1952544 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44095, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ597892 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-35958, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pjj.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-52050, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ574659 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-42771, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010puq.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010puq.1 cpcScore=-1.3055200 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010puq.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42770, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ584609 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-51721, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pjk.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42618, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ600234 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-38300, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnf.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hnf.2 cpcScore=-1.2232100 cnci=-0.0319886 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hnf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-42430, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599872 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37938, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hng.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hng.1 cpcScore=-1.3748600 cnci=-0.2562582 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hng.2 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-59592, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000410467 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:222503632:222503735:-1 gene:ENSG00000222399 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459434 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:223085186:223085289:-1 gene:ENSG00000239054 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
HM358976 // GenBank HTC // Homo sapiens clone Huh7-14 actin-like mRNA, partial sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pjm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens clone Hep3-5 actin-like mRNA, partial sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ599872 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-37938, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hof.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ41452 fis, clone BRSTN2010363. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390855 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:223976146:223976249:-1 gene:ENSG00000212157 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_152608 // RefSeq // Homo sapiens SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (SDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000272091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225982702:225999331:-1 gene:ENSG00000143751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366817 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:226172889:226187023:-1 gene:ENSG00000143751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366818 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:226170406:226187066:-1 gene:ENSG00000143751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC071563 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:87025 IMAGE:5261192), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091310 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:225982702:225999331:-1 Gene:OTTHUMG00000037504 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hpu.4 // UCSC Genes // Homo sapiens SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (SDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091311 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:225985188:225999322:-1 Gene:OTTHUMG00000037504 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022735 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA binding domain containing 3 (ACBD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226144679:226186730:-1 gene:ENSG00000182827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226154642:226161632:-1 gene:ENSG00000182827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045533 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:57123 IMAGE:5259930), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC060792 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:71593 IMAGE:4813993), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091528 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:226144679:226186730:-1 Gene:OTTHUMG00000037560 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099044 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:226154642:226161632:-1 Gene:OTTHUMG00000037560 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hpy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens acyl-CoA binding domain containing 3 (ACBD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459532 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:226503762:226503865:-1 gene:ENSG00000239094 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055856 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31294 fis, clone KIDNE2007810, weakly similar to DEOXYURIDINE 5-TRIPHOSPHATE NUCLEOTIDOHYDROLASE (EC 3.6.1.23). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hqe.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002221 // RefSeq // Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase B (ITPKB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000272117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226631690:226737458:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226707190:226739323:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:226631690:226739175:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC015009 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:23636 IMAGE:4862726), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091632 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:226631690:226737458:-1 Gene:OTTHUMG00000037582 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091633 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:226707190:226739323:-1 Gene:OTTHUMG00000037582 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hqh.3 // UCSC Genes // Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase B (ITPKB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pvo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase B (ITPKB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000408153 // ENSEMBL // [retired] ncrna:miRNA chromosome:GRCh37:1:227695169:227695276:-1 gene:ENSG00000221080 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000091687 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227510596:227520477:-1 Gene:OTTHUMG00000037610 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000422837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227510596:227520477:-1 gene:ENSG00000227711 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036753 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 847, pseudogene (ZNF847P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pjz.1 // UCSC Genes // Homo sapiens zinc finger protein 847, pseudogene (ZNF847P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001161465 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_023007 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227731189:227735411:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000485807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227730425:227734377:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091970 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227731189:227735411:-1 Gene:OTTHUMG00000037698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091971 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227731234:227735411:-1 Gene:OTTHUMG00000037698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091972 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227730425:227734377:-1 Gene:OTTHUMG00000037698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091973 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227733148:227735076:-1 Gene:OTTHUMG00000037698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091974 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227733619:227734371:-1 Gene:OTTHUMG00000037698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hrc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003395 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A (WNT9A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000272164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227918656:227947898:-1 gene:ENSG00000143816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497852 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:228106358:228135631:-1 gene:ENSG00000143816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC111960 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A, mRNA (cDNA clone MGC:138165 IMAGE:8327428), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC113431 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A, mRNA (cDNA clone MGC:141991 IMAGE:8322483), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091646 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227918656:227947898:-1 Gene:OTTHUMG00000037592 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hri.2 // UCSC Genes // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A (WNT9A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091647 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:227918657:227947930:-1 Gene:OTTHUMG00000037592 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_003493 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 3, H3 (HIST3H3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228424845:228425325:-1 gene:ENSG00000168148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069079 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 3, H3, mRNA (cDNA clone MGC:95354 IMAGE:7216893), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101837 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 3, H3, mRNA (cDNA clone MGC:126886 IMAGE:8069343), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096595 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228424845:228425325:-1 Gene:OTTHUMG00000040044 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hsx.1 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 3, H3 (HIST3H3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_033445 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 3, H2a (HIST3H2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228456979:228457873:-1 gene:ENSG00000181218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096598 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:228456979:228457873:-1 Gene:OTTHUMG00000040046 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hsy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens histone cluster 3, H2a (HIST3H2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015435 // GenBank HTC // Homo sapiens ring finger protein 187, mRNA (cDNA clone IMAGE:4415092), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hta.3 // UCSC Genes // Homo sapiens ring finger protein 187, mRNA (cDNA clone IMAGE:4415092), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hta.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001hta.2 cpcScore=0.3661160 cnci=-0.1480581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC039241 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 96, mRNA (cDNA clone MGC:32857 IMAGE:4731004), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001hto.1 // UCSC Genes // Homo sapiens cDNA FLJ35329 fis, clone PROST2013873. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012089 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (ABCB10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000498158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:229517797:229519103:-1 gene:ENSG00000135776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC064930 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:70707 IMAGE:6143235), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344517 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold796:51655:74671:+ gene:ENSG00000135776 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095240 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:229516582:229558695:-1 Gene:OTTHUMG00000039471 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095241 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:229526062:229531902:-1 Gene:OTTHUMG00000039471 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095242 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:229517797:229519103:-1 Gene:OTTHUMG00000039471 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001htp.4 // UCSC Genes // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (ABCB10), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000362802 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:229535064:229535189:-1 gene:ENSG00000199672 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390191 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:230049182:230049250:-1 gene:ENSG00000211525 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_024554 // RefSeq // [retired] Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5 (PGBD5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000391860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:230321646:230425729:-1 gene:ENSG00000177614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000525115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:230323248:230377645:-1 gene:ENSG00000177614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000530424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:230323542:230336295:-1 gene:ENSG00000177614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC150638 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5, mRNA (cDNA clone MGC:183548 IMAGE:9057008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000321327 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold2647:156042:201952:+ gene:ENSG00000177614 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092104 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:230321646:230425729:-1 Gene:OTTHUMG00000037759 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pwb.2 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000459395 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snoRNA chromosome:GRCh37:1:231031178:231031250:-1 gene:ENSG00000238985 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516322 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:230988989:230989123:-1 gene:ENSG00000252131 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000425559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231184098:231187627:-1 gene:ENSG00000235710 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000541173 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:231319851:231322143:-1 gene:ENSG00000235710 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092651 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231184098:231187627:-1 Gene:OTTHUMG00000037959 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_175876 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 8 (EXOC8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000360394 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:231468480:231473578:-1 gene:ENSG00000116903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231332753:231337852:-1 gene:ENSG00000116903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC035763 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 8, mRNA (cDNA clone MGC:46661 IMAGE:5552837), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092876 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231332753:231337852:-1 Gene:OTTHUMG00000038025 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001huq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens exocyst complex component 8 (EXOC8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022051 // RefSeq // Homo sapiens egl-9 family hypoxia-inducible factor 1 (EGLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231363751:231425044:-1 gene:ENSG00000135766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231366140:231420343:-1 gene:ENSG00000135766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000546322 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:231556815:231557234:-1 gene:ENSG00000135766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DQ975380 // GenBank // Homo sapiens egl nine-like protein 1 transcript variant 2 (EGLN1) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092879 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231363751:231425044:-1 Gene:OTTHUMG00000038027 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092880 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:231366140:231420343:-1 Gene:OTTHUMG00000038027 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001huu.3 // UCSC Genes // Homo sapiens egl nine homolog 1 (C. elegans) (EGLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001huv.2 // UCSC Genes // Homo sapiens egl nine homolog 1 (C. elegans) (EGLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033826 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 (SNRPD2P2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014600 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC645339, mRNA (cDNA clone MGC:26736 IMAGE:4826560), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pkl.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 (SNRPD2P2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002227 // RefSeq // Homo sapiens disrupted in schizophrenia 2 (non-protein coding) (DISC2), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hvd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens disrupted in schizophrenia 2 (non-protein coding) (DISC2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// DISC2 // lncRNA Db // hg19 chr1:231,945,691-231,960,682 AF222981.1 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:232832017:232832187:-1 gene:ENSG00000206835 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001077397 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (IRF2BP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_182972 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (IRF2BP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366610 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:234604269:234609525:-1 gene:ENSG00000168264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234607231:234608094:-1 gene:ENSG00000168264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK309579 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99620. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366609 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold302:928897:929630:- gene:ENSG00000168264 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092704 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234604269:234609525:-1 Gene:OTTHUMG00000037981 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092705 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234604269:234609525:-1 Gene:OTTHUMG00000037981 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000092706 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:234607231:234608094:-1 Gene:OTTHUMG00000037981 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hwf.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (IRF2BP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hwg.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (IRF2BP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xfw.3 // UCSC Genes // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (IRF2BP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000549744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234979647:234980804:-1 gene:ENSG00000258082 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002956 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 14B (SNORA14B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000384452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:235127803:235127937:-1 gene:ENSG00000207181 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hwm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 14B (SNORA14B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000357671 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:235333435:235334206:-1 gene:ENSG00000232686 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095573 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:235333435:235334206:-1 Gene:OTTHUMG00000039623 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000446945 // ENSEMBL // [retired] havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:235989882:235991238:-1 gene:ENSG00000226135 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516247 // ENSEMBL // [retired]ncrna:snRNA chromosome:GRCh37:1:236026688:236026737:-1 gene:ENSG00000252056 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_002508 // RefSeq // Homo sapiens nidogen 1 (NID1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000264187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:235975830:236065162:-1 gene:ENSG00000116962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:235975830:236065109:-1 gene:ENSG00000116962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB209448 // GenBank // Homo sapiens mRNA for nidogen (enactin) variant protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC045606 // GenBank // Homo sapiens nidogen 1, mRNA (cDNA clone MGC:33141 IMAGE:5271590), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096647 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:235975830:236065162:-1 Gene:OTTHUMG00000040071 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097390 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:235975830:236065109:-1 Gene:OTTHUMG00000040071 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hxo.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nidogen 1 (NID1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xgc.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nidogen 1 (NID1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xgd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens nidogen 1 (NID1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034040 // RefSeq // Homo sapiens LGALS8 antisense RNA 1 (LGALS8-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236523069:236524508:-1 gene:ENSG00000223776 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:236523071:236524500:-1 gene:ENSG00000223776 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096363 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:236523069:236524508:-1 Gene:OTTHUMG00000039952 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hxx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LGALS8 antisense RNA 1 (LGALS8-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000464121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:237004103:237004418:-1 gene:ENSG00000244020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC133032 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1 pseudogene 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40147054). // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hyk.1 // UCSC Genes // --- // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516481 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:237555040:237555171:-1 gene:ENSG00000252290 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_021186 // RefSeq // Homo sapiens zona pellucida glycoprotein 4 (ZP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237882405:237890794:-1 gene:ENSG00000116996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC069521 // GenBank // Homo sapiens zona pellucida glycoprotein 4, mRNA (cDNA clone MGC:97109 IMAGE:7262334), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095476 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:237882405:237890794:-1 Gene:OTTHUMG00000039586 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hym.3 // UCSC Genes // Homo sapiens zona pellucida glycoprotein 4 (ZP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc021plb.1 // UCSC Genes // transfer RNA pseudogene (anticodon TAA) // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516562 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:238325687:238325788:-1 gene:ENSG00000252371 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_015407 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1139 (LINC01139), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:238480384:238486023:-1 gene:ENSG00000215808 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095377 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:238480384:238486023:-1 Gene:OTTHUMG00000039532 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hyn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens uncharacterized LOC339535 (LOC339535), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000095448 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000095448 cpcScore=0.0187765 cnci=-0.3608279 gene:OTTHUMG00000039564 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442410 // ENSEMBL // [retired]havana:lincRNA chromosome:GRCh37:1:239433025:239461237:-1 gene:ENSG00000227185 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022469 // RefSeq // Homo sapiens gremlin 2, DAN family BMP antagonist (GREM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:240489573:240612149:-1 gene:ENSG00000180875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC046632 // GenBank // Homo sapiens gremlin 2, cysteine knot superfamily, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:44218 IMAGE:5288555), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096286 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:240489573:240612149:-1 Gene:OTTHUMG00000039909 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hys.3 // UCSC Genes // Homo sapiens gremlin 2, DAN family BMP antagonist (GREM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021plf.1 // UCSC Genes // Homo sapiens gremlin 2, DAN family BMP antagonist (GREM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_000143 // RefSeq // Homo sapiens fumarate hydratase (FH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:241497603:241519761:-1 gene:ENSG00000091483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:241513680:241519304:-1 gene:ENSG00000091483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003108 // GenBank // Homo sapiens fumarate hydratase, mRNA (cDNA clone MGC:2061 IMAGE:3502012), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC017444 // GenBank // Homo sapiens fumarate hydratase, mRNA (cDNA clone MGC:15363 IMAGE:3606118), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095490 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:241497603:241519761:-1 Gene:OTTHUMG00000039597 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095602 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:241511867:241513676:-1 Gene:OTTHUMG00000039597 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099249 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:241513680:241519304:-1 Gene:OTTHUMG00000039597 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hyx.3 // UCSC Genes // Homo sapiens fumarate hydratase (FH), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001821 // RefSeq // Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2) (CHML), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC117360 // GenBank // Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2), mRNA (cDNA clone MGC:150969 IMAGE:40125911), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366553 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold643:398410:400377:+ gene:ENSG00000203668 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000095712 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:241628853:241635930:-1 Gene:OTTHUMG00000039690 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hzd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2) (CHML), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004343 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma (MAP1LC3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC127722 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:157821 IMAGE:40127238), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC132986 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:164617 IMAGE:40147008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357246 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold643:175390:180521:- gene:ENSG00000197769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096185 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:241995490:241999073:-1 Gene:OTTHUMG00000039865 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001hzk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma (MAP1LC3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000411187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:242023949:242024054:-1 gene:ENSG00000223119 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000096193 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:242203555:242210827:1 Gene:OTTHUMG00000039869 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000425514 // ENSEMBL // [retired]havana:sense_intronic chromosome:GRCh37:1:242366857:242373825:-1 gene:ENSG00000232689 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
DQ576410 // GenBank // Homo sapiens piRNA piR-44522, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021plm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens piRNA piR-44522, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000390928 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:243081156:243081259:-1 gene:ENSG00000212230 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001126 // RefSeq // Homo sapiens adenylosuccinate synthase (ADSS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244408494:244452134:-1 gene:ENSG00000035687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449326 // ENSEMBL // [retired] cdna:known chromosome:GRCh37:1:244571797:244615119:-1 gene:ENSG00000035687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:244418894:244424914:-1 gene:ENSG00000035687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK308749 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98790. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC012356 // GenBank // Homo sapiens adenylosuccinate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:20404 IMAGE:4635347), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096697 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:244408494:244452134:-1 Gene:OTTHUMG00000040102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096699 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:244411367:244419273:-1 Gene:OTTHUMG00000040102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096700 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:244418894:244424914:-1 Gene:OTTHUMG00000040102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iaj.3 // UCSC Genes // Homo sapiens adenylosuccinate synthase (ADSS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xgr.2 // UCSC Genes // Homo sapiens adenylosuccinate synthase (ADSS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096698 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:244424354:244451743:-1 Gene:OTTHUMG00000040102 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000458882 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:244589546:244589644:-1 gene:ENSG00000238952 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364300 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245133927:245134090:-1 gene:ENSG00000201170 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000365314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:246189014:246189118:-1 gene:ENSG00000202184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000384596 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:246426006:246426119:-1 gene:ENSG00000207326 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_022366 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial (TFB2M), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:246540560:246566324:-1 gene:ENSG00000162851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544618 // ENSEMBL // [retired]cdna:known chromosome:GRCh37:1:246711847:246729563:-1 gene:ENSG00000162851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AK300238 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57434 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcription factor B2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC003383 // GenBank // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:5368 IMAGE:3049009), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096673 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:246540560:246566324:-1 Gene:OTTHUMG00000040091 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ibn.3 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial (TFB2M), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pys.1 // UCSC Genes // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial (TFB2M), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516202 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:246833448:246833529:-1 gene:ENSG00000252011 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_207401 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 229 (C1orf229), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247110266:247112417:-1 gene:ENSG00000221953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001icg.1 // UCSC Genes // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 229 (C1orf229), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004492 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11 (OR2B11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137181 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:168801 IMAGE:9021178), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137205 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:168825 IMAGE:9021202), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318749 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold783:170245:171192:+ gene:ENSG00000177535 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097620 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247451029:247451982:-1 Gene:OTTHUMG00000040572 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pyx.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11 (OR2B11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_198074 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3 (OR2C3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_027309 // RefSeq // Homo sapiens GCSAML antisense RNA 1 (GCSAML-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000366487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247530132:247533839:-1 gene:ENSG00000196242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247524679:247526752:-1 gene:ENSG00000227135 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC030717 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:23194 IMAGE:4860551), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097626 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247530132:247533839:-1 Gene:OTTHUMG00000040579 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097749 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247524679:247526752:-1 Gene:OTTHUMG00000040649 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idd.3 // UCSC Genes // Homo sapiens GCSAML antisense RNA 1 (GCSAML-AS1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xgy.3 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3 (OR2C3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc021pmb.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3 (OR2C3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000516585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:247607126:247607201:-1 gene:ENSG00000252394 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001005487 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1 (OR13G1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136736 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168349 IMAGE:9020726), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136738 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168351 IMAGE:9020728), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000359688 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold3504:116296:117213:+ gene:ENSG00000197437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096869 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247672118:247673041:-1 Gene:OTTHUMG00000040212 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idi.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1 (OR13G1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_012353 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily C, member 1 (OR1C1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000408896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247757462:247758406:-1 gene:ENSG00000221888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140914 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176591 IMAGE:9056726), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096855 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247757462:247758406:-1 Gene:OTTHUMG00000040198 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pza.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily C, member 1 (OR1C1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001966 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily A, member 16 (OR14A16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000357627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247814800:247815729:-1 gene:ENSG00000196772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096856 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247814800:247815729:-1 Gene:OTTHUMG00000040199 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idm.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily A, member 16 (OR14A16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001959 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 11, subfamily L, member 1 (OR11L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247840928:247841896:-1 gene:ENSG00000197591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140753 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 11, subfamily L, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176430 IMAGE:9021621), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096850 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:247840928:247841896:-1 Gene:OTTHUMG00000040193 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001idn.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 11, subfamily L, member 1 (OR11L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004695 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 33 (OR2T33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000318021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248272852:248273814:-1 gene:ENSG00000177212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136994 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:168609 IMAGE:9020986), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136995 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:168610 IMAGE:9020987), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097354 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248272852:248273814:-1 Gene:OTTHUMG00000040458 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzi.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 33 (OR2T33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004692 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 12 (OR2T12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248294616:248295578:-1 gene:ENSG00000177201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097353 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248294616:248295578:-1 Gene:OTTHUMG00000040457 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzj.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 12 (OR2T12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004691 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7 (OR2M7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248323630:248324568:-1 gene:ENSG00000177186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136944 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:168559 IMAGE:9020936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136946 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:168561 IMAGE:9020938), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097357 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248323630:248324568:-1 Gene:OTTHUMG00000040461 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzk.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7 (OR2M7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004694 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 29 (OR2T29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248558544:248559491:-1 gene:ENSG00000182783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140747 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176424 IMAGE:9021615), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140915 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176592 IMAGE:9056727), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097132 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248558544:248559491:-1 Gene:OTTHUMG00000040382 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ieo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 29 (OR2T29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001821 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 34 (OR2T34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136924 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:168539 IMAGE:9020916), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136926 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:168541 IMAGE:9020918), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000328782 // CSIRO // [mRNA]  locus=scaffold5101:473:1420:- gene:ENSG00000183310 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097138 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248573801:248574757:-1 Gene:OTTHUMG00000040387 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001iep.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 34 (OR2T34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004693 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10 (OR2T10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248592830:248593768:-1 gene:ENSG00000184022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136937 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:168552 IMAGE:9020929), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC136940 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:168555 IMAGE:9020932), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097139 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248592830:248593768:-1 Gene:OTTHUMG00000040388 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzn.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10 (OR2T10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000364732 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:248594925:248595033:-1 gene:ENSG00000201602 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001964 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 11 (OR2T11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000330803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248626178:248627128:-1 gene:ENSG00000183130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC140749 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:176426 IMAGE:9021617), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097134 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248626178:248627128:-1 Gene:OTTHUMG00000040384 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ier.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 11 (OR2T11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001827 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 35 (OR2T35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000317450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248638287:248639258:-1 gene:ENSG00000177151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097130 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248638287:248639258:-1 Gene:OTTHUMG00000040380 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ies.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 35 (OR2T35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001001824 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 27 (OR2T27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000344889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248649931:248650884:-1 gene:ENSG00000187701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097124 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248649931:248650884:-1 Gene:OTTHUMG00000040376 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010pzo.2 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 27 (OR2T27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001004734 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1 (OR14I1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248681369:248682304:-1 gene:ENSG00000189181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC137188 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168808 IMAGE:9021185), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097128 // Havana transcript // cdna:all chromosome:VEGA56:1:248681369:248682304:-1 Gene:OTTHUMG00000040378 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ieu.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1 (OR14I1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000436484 // ENSEMBL // [retired]cdna:putative chromosome:GRCh37:1:248881947:248885506:-1 gene:ENSG00000232694 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000171434 // Havana transcript // [retired]cdna:all chromosome:VEGA52:1:248881947:248885506:-1 Gene:OTTHUMG00000078489 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NM_001085474 // RefSeq // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 8 (LYPD8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009xhb.3 // UCSC Genes // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 8 (LYPD8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000363625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:248912690:248912795:-1 gene:ENSG00000200495 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007169 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007169 cpcScore=-0.9192430 cnci=-0.2066822 gene:OTTHUMG00000002525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006709 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006709 cpcScore=-1.3067200 cnci=-0.0610582 gene:OTTHUMG00000002330 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR623081 // NONCODE // accn=CR623081 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4692 cpcScore=1.3981100 cnci=-0.5631097 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR598056 // NONCODE // accn=CR598056 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4693 cpcScore=8.9975600 cnci=-0.3853513 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR614989 // NONCODE // accn=CR614989 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4694 cpcScore=1.5965800 cnci=-0.4403507 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001abc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abc.2 cpcScore=2.0578800 cnci=-0.2500801 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006891 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006891 cpcScore=-0.9360550 cnci=-0.3523093 gene:OTTHUMG00000002408 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006884 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006884 cpcScore=-1.2273500 cnci=-0.2878107 gene:OTTHUMG00000002404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006885 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006885 cpcScore=-1.1429200 cnci=-0.3498964 gene:OTTHUMG00000002404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000006887 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006887 cpcScore=-1.1375200 cnci=-0.2772114 gene:OTTHUMG00000002404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007013 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007013 cpcScore=-0.9392450 cnci=-0.2409324 gene:OTTHUMG00000002404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099678 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099678 cpcScore=-1.2613400 cnci=-0.2768348 gene:OTTHUMG00000002404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK096570 // NONCODE // accn=AK096570 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4696 cpcScore=-0.2557270 cnci=-0.2680641 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abs.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001abs.2 cpcScore=-1.1252800 cnci=-0.2998345 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000097856 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000097856 cpcScore=-0.1576960 cnci=-0.1560282 gene:OTTHUMG00000040716 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097857 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000097857 cpcScore=-1.0418400 cnci=-0.0274765 gene:OTTHUMG00000040717 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038869 // NONCODE // accn=NR_038869 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038869 cpcScore=8.9612700 cnci=-0.0815560 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037668 // NONCODE // accn=NR_037668 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037668 cpcScore=8.9212400 cnci=-0.0385420 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000331012 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000331012 cpcScore=-1.1634700 cnci=-0.4415390 gene:OTTHUMG00000153395 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033183 // NONCODE // accn=NR_033183 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033183 cpcScore=7.7464700 cnci=-0.0738654 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_002946 // NONCODE // accn=NR_002946 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_002946 cpcScore=5.5281500 cnci=-0.0311496 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000417099 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000417099 cpcScore=-0.2200240 cnci=-0.2145956 gene:ENSG00000227775 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR606168 // NONCODE // accn=CR606168 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=23 cpcScore=-0.5201380 cnci=-0.0592864 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000004637 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004637 cpcScore=-0.9628890 cnci=-0.1366037 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000002191 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000002191 cpcScore=-0.9858960 cnci=-0.2113823 gene:OTTHUMG00000000819 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036637 // NONCODE // accn=NR_036637 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036637 cpcScore=4.7395400 cnci=-0.1277912 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001814 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001814 cpcScore=-1.0676300 cnci=-0.2646974 gene:OTTHUMG00000000733 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001544 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001544 cpcScore=-0.7911120 cnci=-0.2028668 gene:OTTHUMG00000000646 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001545 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001545 cpcScore=-1.0098700 cnci=-0.1512812 gene:OTTHUMG00000000647 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037321 // NONCODE // accn=BC037321 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=29 cpcScore=-0.6937400 cnci=-0.2545276 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC042499 // NONCODE // accn=BC042499 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=31 cpcScore=-0.8124980 cnci=-0.1634849 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1222 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1222 cpcScore=-1.3430500 cnci=-0.1466343 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00000080-XLOC_l2_000048 // Broad TUCP // linc-ICMT-BP chr1:+:6297876-6298880 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00001970-XLOC_l2_000048 // Broad TUCP // linc-ICMT-BP chr1:+:6296299-6299000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001amm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001amm.2 cpcScore=3.6138000 cnci=-0.1345563 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000004978 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004978 cpcScore=0.1837990 cnci=-0.1871665 gene:OTTHUMG00000001785 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004979 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004979 cpcScore=-0.2811070 cnci=-0.2043062 gene:OTTHUMG00000001785 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000004980 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004980 cpcScore=-1.2370500 cnci=-0.2240908 gene:OTTHUMG00000001785 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038934 // NONCODE // accn=NR_038934 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038934 cpcScore=-0.1414320 cnci=-0.2121826 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK093159 // NONCODE // accn=AK093159 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=40 cpcScore=-0.7491010 cnci=-0.2158585 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130268 // NONCODE // accn=AK130268 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=45 cpcScore=0.6327660 cnci=-0.2730890 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000445300 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000445300 cpcScore=-0.9670220 cnci=-0.2284706 gene:ENSG00000238290 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1723 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1723 cpcScore=-1.4369900 cnci=-0.1818836 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00000832-XLOC_000042 // Rinn lincRNA // linc-SLC45A1-2 chr1:+:8138469-8185235 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000004930 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004930 cpcScore=0.0128703 cnci=-0.1952082 gene:OTTHUMG00000001769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000004915 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000004915 cpcScore=-0.9219270 cnci=-0.1141176 gene:OTTHUMG00000001764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_19 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_19 cpcScore=-1.3024900 cnci=-0.1482372 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF147310 // NONCODE // accn=AF147310 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4708 cpcScore=-1.3778600 cnci=-0.3494219 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055171 // NONCODE // accn=AK055171 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=95 cpcScore=-0.3832910 cnci=-0.2526585 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000005777 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000005777 cpcScore=2.2752100 cnci=-0.1455747 gene:OTTHUMG00000002076 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ass.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ass.1 cpcScore=0.6167130 cnci=-0.2582838 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037806 // NONCODE // accn=NR_037806 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037806 cpcScore=-0.8047070 cnci=-0.2381011 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
U00953 // NONCODE // accn=U00953 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000217398 cpcScore=-1.0595700 cnci=-1.0000000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000036896 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000036896 cpcScore=-0.9042530 cnci=-0.4145653 gene:OTTHUMG00000013154 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026705 // NONCODE // accn=AK026705 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=102 cpcScore=3.1226800 cnci=-0.2347879 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021789 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021789 cpcScore=-0.1453790 cnci=-0.2076816 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001awz.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001awz.2 cpcScore=-1.2346100 cnci=-0.3153092 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069790 // NONCODE // accn=BC069790 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=111 cpcScore=-0.7983990 cnci=-0.1552870 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000085369 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000085369 cpcScore=-1.2843800 cnci=-0.2482652 gene:OTTHUMG00000035305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007047 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007047 cpcScore=-0.2002640 cnci=-0.1620319 gene:OTTHUMG00000002490 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033316 // NONCODE // accn=BC033316 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4713 cpcScore=-1.2468100 cnci=-0.2599198 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ayv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ayv.1 cpcScore=1.4877700 cnci=-0.2178174 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC038781 // NONCODE // accn=BC038781 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4714 cpcScore=0.1647770 cnci=-0.1695154 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006253 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006253 cpcScore=-0.5522700 cnci=-0.3206624 gene:OTTHUMG00000002202 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF116647 // NONCODE // accn=AF116647 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4715 cpcScore=-1.3987000 cnci=-0.4851269 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006615 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006615 cpcScore=0.0782032 cnci=-0.1653799 gene:OTTHUMG00000002291 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1569 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1569 cpcScore=-1.5313000 cnci=-0.2484972 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007156 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007156 cpcScore=-1.2726100 cnci=-0.2501019 gene:OTTHUMG00000002515 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC035225 // NONCODE // accn=BC035225 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=118 cpcScore=-0.9529950 cnci=-0.2093651 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000006932 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000006932 cpcScore=-1.2906800 cnci=-0.2625232 gene:OTTHUMG00000002437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001baw.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001baw.1 cpcScore=-1.1116400 cnci=-0.2299238 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK056173 // NONCODE // accn=AK056173 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=120 cpcScore=-0.5140280 cnci=-0.2161551 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK094779 // NONCODE // accn=AK094779 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=121 cpcScore=-0.8656390 cnci=-0.2389892 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY578141 // NONCODE // accn=AY578141 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000255609 cpcScore=-1.4915000 cnci=-0.5157984 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK096098 // NONCODE // accn=AK096098 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=122 cpcScore=-0.8938230 cnci=-0.3616532 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033757 // NONCODE // accn=NR_033757 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033757 cpcScore=0.2305920 cnci=-0.2286451 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007685 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007685 cpcScore=-0.9975920 cnci=-0.3466818 gene:OTTHUMG00000002703 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000007686 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007686 cpcScore=-1.1353600 cnci=-0.3309296 gene:OTTHUMG00000002703 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007692 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007692 cpcScore=-1.2005500 cnci=-0.3558299 gene:OTTHUMG00000002707 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
M20838 // NONCODE // accn=M20838 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=123 cpcScore=-0.9653600 cnci=-0.3043971 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000008191 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000008191 cpcScore=-1.0188600 cnci=-0.1267141 gene:OTTHUMG00000002945 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008192 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000008192 cpcScore=-1.1298100 cnci=-0.1588755 gene:OTTHUMG00000002945 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038404 // NONCODE // accn=NR_038404 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038404 cpcScore=-1.0451600 cnci=-0.2116640 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR625155 // NONCODE // accn=CR625155 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=124 cpcScore=-1.0426600 cnci=-0.2097700 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000092373 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000092373 cpcScore=-1.1944600 cnci=-0.4017450 gene:OTTHUMG00000037843 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000007795 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000007795 cpcScore=-0.3549620 cnci=-0.2961560 gene:OTTHUMG00000002757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096537 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000096537 cpcScore=-0.9986980 cnci=-0.3025409 gene:OTTHUMG00000002757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096538 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000096538 cpcScore=-1.0124700 cnci=-0.2384404 gene:OTTHUMG00000002757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000096539 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000096539 cpcScore=-0.2521830 cnci=-0.2574745 gene:OTTHUMG00000002757 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bgg.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bgg.1 cpcScore=-0.7472240 cnci=-0.2156651 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bhf.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bhf.1 cpcScore=0.1274020 cnci=-0.2256355 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027042 // NONCODE // accn=NR_027042 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027042 cpcScore=5.2067200 cnci=-0.1933297 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhi.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bhi.3 cpcScore=0.7367430 cnci=-0.1776985 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bhj.3 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bhj.3 cpcScore=1.0231900 cnci=-0.1452564 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1994 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1994 cpcScore=-1.3234900 cnci=-0.1310763 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00000866-XLOC_000094 // Rinn lincRNA // linc-RPL11-1 chr1:+:23908136-23919157 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1971 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1971 cpcScore=-1.2628100 cnci=-0.3784802 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00000867-XLOC_000095 // Rinn lincRNA // linc-GRHL3-4 chr1:+:24348318-24350190 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000008408 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000008408 cpcScore=-0.4408140 cnci=-0.2432190 gene:OTTHUMG00000003038 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_978 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_978 cpcScore=-1.3257800 cnci=-0.3132740 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086431 // NONCODE // accn=AF086431 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000067310 cpcScore=-1.2259300 cnci=-0.3471052 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_979 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_979 cpcScore=-1.3089000 cnci=-0.2081494 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1249 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1249 cpcScore=-1.3129800 cnci=-0.1935577 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00001961-XLOC_000099 // Rinn lincRNA // linc-RHD-2 chr1:+:25367663-25373839 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY449385 // NONCODE // accn=AY449385 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000254734 cpcScore=4.1654500 cnci=-0.1050222 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC007687 // NONCODE // accn=BC007687 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=170 cpcScore=5.6344900 cnci=-0.1386286 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000012834 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000012834 cpcScore=0.2313690 cnci=-0.3586840 gene:OTTHUMG00000004419 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_023345 // NONCODE // accn=NR_023345 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_023345 cpcScore=10.0181000 cnci=-0.1601185 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000012180 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000012180 cpcScore=-0.7369500 cnci=-0.1139923 gene:OTTHUMG00000004228 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033926 // NONCODE // accn=NR_033926 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033926 cpcScore=3.8657600 cnci=-0.2730854 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000009779 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000009779 cpcScore=-1.0469200 cnci=-0.3601742 gene:OTTHUMG00000003517 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030725 // NONCODE // accn=NR_030725 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_030725 cpcScore=5.0420300 cnci=-0.1947177 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR036473 // NONCODE // accn=NR036473 class=mRNAlike lncRNA name=SNHG3 ref=lncRNAdb transcriptId=343016 cpcScore=-1.3181900 cnci=-0.3223314 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001bqd.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bqd.2 cpcScore=-1.1568000 cnci=-0.3572538 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123622 // NONCODE // accn=AK123622 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=190 cpcScore=0.0199781 cnci=-0.2508744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003109 // NONCODE // accn=NR_003109 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003109 cpcScore=3.2984000 cnci=-0.2821178 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1835 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1835 cpcScore=-1.4955100 cnci=-0.1434387 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000010343 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000010343 cpcScore=2.0860200 cnci=-0.2965307 gene:OTTHUMG00000003650 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000010419 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000010419 cpcScore=-1.0757200 cnci=-0.1753044 gene:OTTHUMG00000003685 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000091345 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000091345 cpcScore=-1.2139900 cnci=-0.3080642 gene:OTTHUMG00000037511 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000010557 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000010557 cpcScore=-1.1220900 cnci=-0.2124944 gene:OTTHUMG00000003749 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000010559 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000010559 cpcScore=-1.0156900 cnci=-0.1531204 gene:OTTHUMG00000003749 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000102020 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000102020 cpcScore=-1.1826000 cnci=-0.2446884 gene:OTTHUMG00000043647 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034182 // NONCODE // accn=NR_034182 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034182 cpcScore=2.8491100 cnci=-0.1326121 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC017506 // NONCODE // accn=BC017506 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=195 cpcScore=-0.7556320 cnci=-0.1918135 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001bsm.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001bsm.2 cpcScore=-1.1979400 cnci=-0.3553453 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000011056 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000011056 cpcScore=-0.1784900 cnci=-0.2616277 gene:OTTHUMG00000003882 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000091360 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000091360 cpcScore=-0.2949920 cnci=-0.2436869 gene:OTTHUMG00000003882 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1650 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1650 cpcScore=-1.2823400 cnci=-0.2328927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034112 // NONCODE // accn=NR_034112 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034112 cpcScore=1.4076400 cnci=-0.1421701 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_982 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_982 cpcScore=-1.6156500 cnci=-0.2959818 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000092577 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000092577 cpcScore=-0.2691160 cnci=-0.2791992 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000020210 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000020210 cpcScore=-1.2265600 cnci=-0.4670171 gene:OTTHUMG00000007585 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC103825 // NONCODE // accn=BC103825 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000337377 cpcScore=-0.9621240 cnci=-0.1175293 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021667 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021667 cpcScore=-0.2480600 cnci=-0.3119848 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_983 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_983 cpcScore=-1.3205300 cnci=-0.3599394 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC036308 // NONCODE // accn=BC036308 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4740 cpcScore=1.1858100 cnci=-0.3471726 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075070 // NONCODE // accn=AF075070 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=231 cpcScore=-1.1604300 cnci=-0.3022094 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_984 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_984 cpcScore=-1.2979000 cnci=-0.2316303 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_985 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_985 cpcScore=-1.3379500 cnci=-0.2775428 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033264 // NONCODE // accn=NR_033264 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033264 cpcScore=2.3098200 cnci=-0.2100746 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC031866 // NONCODE // accn=BC031866 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=233 cpcScore=-0.8913170 cnci=-0.2007079 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000011553 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000011553 cpcScore=-0.0698933 cnci=-0.3226666 gene:OTTHUMG00000004048 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC030120 // NONCODE // accn=BC030120 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=237 cpcScore=-1.1589100 cnci=-0.2398581 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125741 // NONCODE // accn=AK125741 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4743 cpcScore=6.2155700 cnci=-0.2995223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR598503 // NONCODE // accn=CR598503 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=243 cpcScore=-0.3066020 cnci=-0.3020096 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125879 // NONCODE // accn=AK125879 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=246 cpcScore=-0.2585130 cnci=-0.3162182 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_967 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_967 cpcScore=-1.3069900 cnci=-0.3141564 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC111428 // NONCODE // accn=BC111428 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000386628 cpcScore=0.3125080 cnci=-0.1228453 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000012051 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000012051 cpcScore=-1.1103000 cnci=-0.2014249 gene:OTTHUMG00000004187 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC141938 // NONCODE // accn=BC141938 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000435266 cpcScore=-0.8947930 cnci=-0.1824902 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_326 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_326 cpcScore=-1.3335900 cnci=-0.1720439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00000895-XLOC_000148 // Rinn lincRNA // linc-AKIRIN1-3 chr1:+:38658715-38676024 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001204 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001204 cpcScore=-1.0202600 cnci=-0.1918952 gene:OTTHUMG00000000481 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1737 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1737 cpcScore=-1.4036500 cnci=-0.2207935 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_987 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_987 cpcScore=-1.5519100 cnci=-0.2714056 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036543 // NONCODE // accn=NR_036543 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036543 cpcScore=6.0024000 cnci=-0.1522205 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040967 // NONCODE // accn=BC040967 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4748 cpcScore=-0.8635050 cnci=-0.1409322 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR605357 // NONCODE // accn=CR605357 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=272 cpcScore=-1.2488700 cnci=-0.2703721 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000020814 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000020814 cpcScore=-0.8871020 cnci=-0.0292738 gene:OTTHUMG00000007731 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Z70024 // NONCODE // accn=Z70024 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000327863 cpcScore=-1.0544400 cnci=-0.1728783 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL157461 // NONCODE // accn=AL157461 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=273 cpcScore=1.4498600 cnci=-0.1964324 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR608962 // NONCODE // accn=CR608962 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4749 cpcScore=-1.2097300 cnci=-0.3467325 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001chr.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001chr.2 cpcScore=-1.0738800 cnci=-0.2909232 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_040733 // NONCODE // accn=NR_040733 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_040733 cpcScore=2.6384200 cnci=-0.2553616 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000416689 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000416689 cpcScore=-1.0331500 cnci=-0.2273519 gene:ENSG00000227533 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000431759 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000431759 cpcScore=-1.2539100 cnci=-0.3017842 gene:ENSG00000227533 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CR621467 // NONCODE // accn=CR621467 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=280 cpcScore=-1.2430900 cnci=-0.3077894 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_030778 // NONCODE // accn=NR_030778 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_030778 cpcScore=8.6248000 cnci=-0.1365787 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036510 // NONCODE // accn=NR_036510 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036510 cpcScore=5.6063300 cnci=-0.1185565 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc010olk.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc010olk.1 cpcScore=1.3149500 cnci=-0.1718927 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021917 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021917 cpcScore=-0.9978520 cnci=-0.2962247 gene:OTTHUMG00000007985 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021894 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021894 cpcScore=-0.9417710 cnci=-0.2254282 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_038403 // NONCODE // accn=NR_038403 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038403 cpcScore=-0.5717480 cnci=-0.2291227 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000429472 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000429472 cpcScore=-0.5783990 cnci=-0.2451939 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021648 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021648 cpcScore=-1.0776100 cnci=-0.2652663 gene:OTTHUMG00000007850 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040537 // NONCODE // accn=BC040537 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=296 cpcScore=-0.8694670 cnci=-0.1808700 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021838 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021838 cpcScore=-0.7195580 cnci=-0.3167390 gene:OTTHUMG00000007956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021843 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021843 cpcScore=-0.6617740 cnci=-0.3295284 gene:OTTHUMG00000007961 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021833 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021833 cpcScore=-1.3464900 cnci=-0.2492636 gene:OTTHUMG00000007952 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000021834 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021834 cpcScore=-0.8987210 cnci=-0.2289151 gene:OTTHUMG00000007952 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000021839 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000021839 cpcScore=-0.9847120 cnci=-0.2059939 gene:OTTHUMG00000007957 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK131006 // NONCODE // accn=AK131006 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=302 cpcScore=-0.9645780 cnci=-0.4228229 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130284 // NONCODE // accn=AK130284 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=307 cpcScore=-1.0781400 cnci=-0.3100374 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036662 // NONCODE // accn=NR_036662 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036662 cpcScore=7.9485300 cnci=-0.2660864 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024350 // NONCODE // accn=NR_024350 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024350 cpcScore=0.8230270 cnci=-0.2841000 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AX748428 // NONCODE // accn=AX748428 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=318 cpcScore=-0.7435180 cnci=-0.2083030 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC045672 // NONCODE // accn=BC045672 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=319 cpcScore=0.0986544 cnci=-0.3115680 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC033363 // NONCODE // accn=BC033363 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=325 cpcScore=-1.0363200 cnci=-0.2162091 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137323 // NONCODE // accn=AL137323 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=337 cpcScore=-0.8680140 cnci=-0.2421241 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000023024 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000023024 cpcScore=-1.0268700 cnci=-0.2598217 gene:OTTHUMG00000008362 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR596789 // NONCODE // accn=CR596789 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=344 cpcScore=-1.1892900 cnci=-0.1747153 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124655 // NONCODE // accn=AK124655 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=345 cpcScore=-0.1514020 cnci=-0.2565417 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX640776 // NONCODE // accn=BX640776 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=346 cpcScore=-1.2049300 cnci=-0.3170792 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000022600 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000022600 cpcScore=-1.1304600 cnci=-0.2407584 gene:OTTHUMG00000008243 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000022602 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000022602 cpcScore=-1.3892400 cnci=-0.4589761 gene:OTTHUMG00000008245 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000022251 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000022251 cpcScore=-1.1806600 cnci=-0.4414931 gene:OTTHUMG00000008126 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000022253 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000022253 cpcScore=-1.0631600 cnci=-0.3037502 gene:OTTHUMG00000008128 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043195 // NONCODE // accn=BC043195 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=352 cpcScore=-1.2489300 cnci=-0.4051977 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK023382 // NONCODE // accn=AK023382 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=354 cpcScore=-0.9794540 cnci=-0.3852258 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC047487 // NONCODE // accn=BC047487 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=355 cpcScore=-0.8256250 cnci=-0.3621798 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001cyv.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001cyv.1 cpcScore=-0.6777050 cnci=-0.3765533 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_991 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_991 cpcScore=-1.3511100 cnci=-0.2854053 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_992 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_992 cpcScore=-1.5428800 cnci=-0.3357158 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055150 // NONCODE // accn=AK055150 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=357 cpcScore=-0.6566260 cnci=-0.2472848 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000544621 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000544621 cpcScore=-0.5142440 cnci=-0.1635440 gene:ENSG00000234807 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_034014 // NONCODE // accn=NR_034014 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034014 cpcScore=-0.4556020 cnci=-0.1626437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000023037 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000023037 cpcScore=-1.0336300 cnci=-0.3083419 gene:OTTHUMG00000008373 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000023038 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000023038 cpcScore=-1.2949700 cnci=-0.3477666 gene:OTTHUMG00000008373 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_366 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_366 cpcScore=-1.3159400 cnci=-0.2797017 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC031950 // NONCODE // accn=BC031950 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=358 cpcScore=-0.9843680 cnci=-0.2905566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000024223 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000024223 cpcScore=-1.3311700 cnci=-0.4757393 gene:OTTHUMG00000008767 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000024949 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000024949 cpcScore=-1.0927500 cnci=-0.3441774 gene:OTTHUMG00000008994 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK092769 // NONCODE // accn=AK092769 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=362 cpcScore=-1.2410500 cnci=-0.2655187 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK128778 // NONCODE // accn=AK128778 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=363 cpcScore=-1.0820600 cnci=-0.3246153 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000127843 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000127843 cpcScore=-0.6383700 cnci=-0.3063206 gene:OTTHUMG00000057525 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025349 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025349 cpcScore=0.2226580 cnci=-0.2566898 gene:OTTHUMG00000009148 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025342 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025342 cpcScore=-0.7499020 cnci=-0.3530309 gene:OTTHUMG00000009144 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
L12142 // NONCODE // accn=L12142 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000192147 cpcScore=3.1682700 cnci=-0.1254395 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086235 // NONCODE // accn=AF086235 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=367 cpcScore=-1.0426600 cnci=-0.3317993 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF254117 // NONCODE // accn=AF254117 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4755 cpcScore=0.7253460 cnci=-0.3903396 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000776 // NONCODE // accn=AK000776 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=368 cpcScore=-1.1257800 cnci=-0.3705974 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_994 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_994 cpcScore=-1.6472500 cnci=-0.2983984 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026966 // NONCODE // accn=AK026966 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4756 cpcScore=-1.2302400 cnci=-0.3511155 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AM990315 // NONCODE // accn=AM990315 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500199 cpcScore=3.9539700 cnci=-0.2801765 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990319 // NONCODE // accn=AM990319 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500203 cpcScore=3.6859800 cnci=-0.2353505 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990320 // NONCODE // accn=AM990320 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500204 cpcScore=2.2383000 cnci=-0.2543691 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990322 // NONCODE // accn=AM990322 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500206 cpcScore=1.7925800 cnci=-0.2885425 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990326 // NONCODE // accn=AM990326 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500210 cpcScore=1.9900100 cnci=-0.2692478 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990329 // NONCODE // accn=AM990329 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500213 cpcScore=2.5041100 cnci=-0.2392417 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AM990330 // NONCODE // accn=AM990330 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000500214 cpcScore=2.4331700 cnci=-0.2636688 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025987 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025987 cpcScore=-1.1456900 cnci=-0.3867873 gene:OTTHUMG00000009373 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123656 // NONCODE // accn=AK123656 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=370 cpcScore=-0.0164922 cnci=-0.3109091 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC016787 // NONCODE // accn=BC016787 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=376 cpcScore=-1.0083200 cnci=-0.3085869 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025521 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025521 cpcScore=-1.0700000 cnci=-0.3661055 gene:OTTHUMG00000009216 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025522 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025522 cpcScore=-1.2603100 cnci=-0.5414160 gene:OTTHUMG00000009217 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc009wbh.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc009wbh.1 cpcScore=2.0810500 cnci=-0.0830748 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC037323 // NONCODE // accn=BC037323 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=377 cpcScore=-1.3076000 cnci=-0.3949777 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027404 // NONCODE // accn=NR_027404 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027404 cpcScore=2.6811300 cnci=-0.2353635 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000025915 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000025915 cpcScore=-1.1257700 cnci=-0.3438533 gene:OTTHUMG00000009349 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026633 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026633 cpcScore=-1.1990300 cnci=-0.3001786 gene:OTTHUMG00000009658 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC070115 // NONCODE // accn=BC070115 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=386 cpcScore=-0.4868710 cnci=-0.2476239 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC054887 // NONCODE // accn=BC054887 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=387 cpcScore=-0.9928370 cnci=-0.3296203 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000413421 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000413421 cpcScore=-1.3224200 cnci=-0.3622662 gene:ENSG00000229956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000415780 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000415780 cpcScore=-1.2005900 cnci=-0.1709112 gene:ENSG00000229956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455406 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000455406 cpcScore=-0.9955430 cnci=-0.2693813 gene:ENSG00000229956 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026183 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026183 cpcScore=-0.9230130 cnci=-0.4560501 gene:OTTHUMG00000009452 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026413 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026413 cpcScore=-1.2586300 cnci=-0.4318614 gene:OTTHUMG00000009566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026414 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026414 cpcScore=-1.0757900 cnci=-0.3968364 gene:OTTHUMG00000009566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026415 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026415 cpcScore=-1.0688300 cnci=-0.3586342 gene:OTTHUMG00000009566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026416 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026416 cpcScore=-1.0694300 cnci=-0.5198441 gene:OTTHUMG00000009566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026417 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026417 cpcScore=-1.0671600 cnci=-0.4601048 gene:OTTHUMG00000009566 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026418 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026418 cpcScore=-1.2092400 cnci=-0.3188480 gene:OTTHUMG00000009567 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026419 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026419 cpcScore=-1.1271100 cnci=-0.2378002 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR627203 // NONCODE // accn=CR627203 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=398 cpcScore=-0.1933090 cnci=-0.3627204 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_027962 // NONCODE // accn=NR_027962 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_027962 cpcScore=3.5801900 cnci=-0.3531503 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000100228 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000100228 cpcScore=-1.1891200 cnci=-0.5263286 gene:OTTHUMG00000042097 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026985 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026985 cpcScore=-1.4023400 cnci=-0.2940394 gene:OTTHUMG00000009790 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026986 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026986 cpcScore=-1.0658700 cnci=-0.3399320 gene:OTTHUMG00000009791 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026695 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026695 cpcScore=-1.1544400 cnci=-0.3885336 gene:OTTHUMG00000009688 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026864 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026864 cpcScore=-0.4373570 cnci=-0.2466771 gene:OTTHUMG00000009742 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AL137635 // NONCODE // accn=AL137635 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=407 cpcScore=-1.1608600 cnci=-0.3501799 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001250 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001250 cpcScore=-1.0607400 cnci=-0.3975719 gene:OTTHUMG00000000507 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001251 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001251 cpcScore=-1.0708500 cnci=-0.3960913 gene:OTTHUMG00000000507 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001252 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001252 cpcScore=-1.0435200 cnci=-0.2884097 gene:OTTHUMG00000000507 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ244500 // NONCODE // accn=AJ244500 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000384069 cpcScore=-0.9854720 cnci=-0.2372664 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK026847 // NONCODE // accn=AK026847 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=409 cpcScore=-0.5609530 cnci=-0.3809215 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026937 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026937 cpcScore=-1.1287400 cnci=-0.4107956 gene:OTTHUMG00000009769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000026938 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026938 cpcScore=-0.8970640 cnci=-0.3937067 gene:OTTHUMG00000009769 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000026942 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000026942 cpcScore=-0.9342950 cnci=-0.2165147 gene:OTTHUMG00000009772 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY927367 // NONCODE // accn=AY927367 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332576 cpcScore=-0.8884420 cnci=-0.1866597 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY927368 // NONCODE // accn=AY927368 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000332577 cpcScore=-0.7819340 cnci=-0.2951554 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_995 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_995 cpcScore=-1.5540700 cnci=-0.3143055 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK125723 // NONCODE // accn=AK125723 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=420 cpcScore=-1.1070200 cnci=-0.3941228 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000426125 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000426125 cpcScore=-1.3622600 cnci=-0.3213348 gene:ENSG00000223653 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029185 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029185 cpcScore=-1.2139700 cnci=-0.5546700 gene:OTTHUMG00000010575 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_996 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_996 cpcScore=-1.3038800 cnci=-0.3960777 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00001012-XLOC_000278 // Rinn lincRNA // linc-CLCA2-2 chr1:+:86093301-86094050 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024602 // NONCODE // accn=NR_024602 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024602 cpcScore=14.7712000 cnci=-0.4156764 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
S83307 // NONCODE // accn=S83307 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=440 cpcScore=-1.4709800 cnci=-0.6518149 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029206 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029206 cpcScore=-0.3353860 cnci=-0.3451075 gene:OTTHUMG00000010305 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029205 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029205 cpcScore=-1.3147500 cnci=-0.3404178 gene:OTTHUMG00000010584 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_998 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_998 cpcScore=-1.3040000 cnci=-0.3485477 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC043369 // NONCODE // accn=BC043369 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=443 cpcScore=-0.9153390 cnci=-0.2999524 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000027727 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000027727 cpcScore=-1.3365100 cnci=-0.4455116 gene:OTTHUMG00000010019 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_003130 // NONCODE // accn=NR_003130 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_003130 cpcScore=7.7769300 cnci=-0.1174490 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK124503 // NONCODE // accn=AK124503 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=474 cpcScore=-0.9343280 cnci=-0.2892950 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX538286 // NONCODE // accn=BX538286 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000055068 cpcScore=7.8641900 cnci=-0.3909939 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY211918 // NONCODE // accn=AY211918 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000085291 cpcScore=4.2396300 cnci=-0.4179036 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX648062 // NONCODE // accn=BX648062 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4773 cpcScore=-1.1191500 cnci=-0.3849293 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034091 // NONCODE // accn=NR_034091 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034091 cpcScore=-0.4259350 cnci=-0.2189415 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_362 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_362 cpcScore=-1.3714300 cnci=-0.2082293 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041977 // NONCODE // accn=BC041977 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=476 cpcScore=-1.0809900 cnci=-0.1685354 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001dqe.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dqe.1 cpcScore=-0.0536533 cnci=-0.4174423 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029326 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029326 cpcScore=-0.8879220 cnci=-0.4750556 gene:OTTHUMG00000010623 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029383 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029383 cpcScore=-1.3919000 cnci=-0.4150587 gene:OTTHUMG00000010648 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029385 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029385 cpcScore=-0.8547400 cnci=-1.0000000 gene:OTTHUMG00000010650 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC040907 // NONCODE // accn=BC040907 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=485 cpcScore=-0.7632520 cnci=-0.2904039 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037643 // NONCODE // accn=NR_037643 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037643 cpcScore=4.9655400 cnci=-0.2968994 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000030074 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030074 cpcScore=0.0831919 cnci=-0.3874521 gene:OTTHUMG00000010909 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029413 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029413 cpcScore=-1.3712000 cnci=-0.4071349 gene:OTTHUMG00000010665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030151 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030151 cpcScore=-1.2463500 cnci=-0.4770264 gene:OTTHUMG00000010665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030152 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030152 cpcScore=-1.2890200 cnci=-0.3860130 gene:OTTHUMG00000010665 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030150 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030150 cpcScore=-1.4708200 cnci=-0.5930674 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_00001046-XLOC_000307 // Rinn lincRNA // linc-PTBP2-7 chr1:+:95749338-95753228 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001drl.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001drl.2 cpcScore=-1.0570600 cnci=-0.3995168 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029471 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029471 cpcScore=-1.0994800 cnci=-0.5088367 gene:OTTHUMG00000010691 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029472 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029472 cpcScore=-1.1772900 cnci=-0.3266083 gene:OTTHUMG00000010691 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029474 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029474 cpcScore=-1.1861300 cnci=-0.3471859 gene:OTTHUMG00000010691 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029473 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029473 cpcScore=-1.0947100 cnci=-0.3422308 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029438 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029438 cpcScore=-1.0581100 cnci=-0.3429825 gene:OTTHUMG00000010681 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1571 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1571 cpcScore=-1.5686100 cnci=-0.2627023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TCONS_l2_00002108-XLOC_l2_000325 // Broad TUCP // linc-SNX7-1 chr1:+:98676302-98738214 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033716 // NONCODE // accn=NR_033716 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033716 cpcScore=5.8972600 cnci=-0.3616182 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033940 // NONCODE // accn=NR_033940 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033940 cpcScore=-1.2586000 cnci=-0.3245300 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126296 // NONCODE // accn=AK126296 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=490 cpcScore=0.4416620 cnci=-0.3569114 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000030217 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030217 cpcScore=-1.3793400 cnci=-0.4887535 gene:OTTHUMG00000010984 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB015616 // NONCODE // accn=AB015616 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000058435 cpcScore=1.7864900 cnci=-0.2210704 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AB015616 // NONCODE // accn=AB015616 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=493 cpcScore=1.8078700 cnci=-0.1470052 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BX538249 // NONCODE // accn=BX538249 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4775 cpcScore=1.2845700 cnci=-0.2824834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416329 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000416329 cpcScore=-1.1018100 cnci=-0.3906966 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000446527 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000446527 cpcScore=-1.2277600 cnci=-0.2218841 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000449473 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000449473 cpcScore=1.9687300 cnci=-0.3115069 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000451213 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000451213 cpcScore=-1.0669700 cnci=-0.3820315 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000453011 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000453011 cpcScore=-1.1149100 cnci=-0.3295848 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000454721 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000454721 cpcScore=-1.1085700 cnci=-0.2486209 gene:ENSG00000233184 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_969 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_969 cpcScore=-1.6639500 cnci=-0.3176034 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001dub.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dub.2 cpcScore=-1.2489400 cnci=-0.2248080 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000029905 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029905 cpcScore=-1.1663200 cnci=-0.4376476 gene:OTTHUMG00000010834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029906 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029906 cpcScore=-1.1973100 cnci=-0.4552826 gene:OTTHUMG00000010834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000029907 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000029907 cpcScore=-1.3475400 cnci=-0.4364568 gene:OTTHUMG00000010834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF075087 // NONCODE // accn=AF075087 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=495 cpcScore=-0.3894130 cnci=-0.2680253 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1703 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1703 cpcScore=-1.7584600 cnci=-0.2846766 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000030148 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030148 cpcScore=-0.3963190 cnci=-0.2743031 gene:OTTHUMG00000010944 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_033424 // NONCODE // accn=NR_033424 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_033424 cpcScore=2.2175000 cnci=-0.4005404 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000099059 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099059 cpcScore=-1.0128700 cnci=-0.2906632 gene:OTTHUMG00000041346 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000099064 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000099064 cpcScore=-1.1066200 cnci=-0.3382783 gene:OTTHUMG00000041349 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK000015 // NONCODE // accn=AK000015 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000002490 cpcScore=1.2632400 cnci=-0.3562177 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024438 // NONCODE // accn=NR_024438 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024438 cpcScore=6.9732400 cnci=-0.1883503 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000001239 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000001239 cpcScore=-1.2819600 cnci=-0.3785744 gene:OTTHUMG00000000497 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AY764262 // NONCODE // accn=AY764262 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000257658 cpcScore=0.6608800 cnci=-0.1605465 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY764263 // NONCODE // accn=AY764263 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000257659 cpcScore=0.2703190 cnci=-0.1784718 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY764266 // NONCODE // accn=AY764266 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000257662 cpcScore=1.8528700 cnci=-0.1499449 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY764267 // NONCODE // accn=AY764267 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000257663 cpcScore=2.0538300 cnci=-0.1951501 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AY781194 // NONCODE // accn=AY781194 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000257698 cpcScore=1.5633100 cnci=-0.2957481 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK025924 // NONCODE // accn=AK025924 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=497 cpcScore=-1.1771800 cnci=-0.3208471 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000030278 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030278 cpcScore=-1.0487200 cnci=-0.4782355 gene:OTTHUMG00000011012 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000030279 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000030279 cpcScore=-1.0212600 cnci=-0.2666480 gene:OTTHUMG00000011012 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130480 // NONCODE // accn=AK130480 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=499 cpcScore=-0.6573440 cnci=-0.3412223 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001dvq.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dvq.2 cpcScore=7.3503600 cnci=-0.2763212 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000419814 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000419814 cpcScore=0.1764570 cnci=-0.1742381 gene:ENSG00000224698 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_037185 // NONCODE // accn=NR_037185 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_037185 cpcScore=3.8588800 cnci=-0.3103895 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001dwc.2 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001dwc.2 cpcScore=-1.0786300 cnci=-0.2897045 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
FR337126 // NONCODE // accn=NULL class=snoRNA name=small cajal body specific RNA (scaRNA) mgU2-25/61 ref=fRNAdb v3.0 transcriptId=FR337126 cpcScore=-1.5906100 cnci=-0.2770367 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ512826 // NONCODE // accn=AJ512826 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000248381 cpcScore=1.2431800 cnci=-0.0437563 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034072 // NONCODE // accn=NR_034072 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034072 cpcScore=0.3493420 cnci=-0.3068823 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_034073 // NONCODE // accn=NR_034073 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_034073 cpcScore=1.5577400 cnci=-0.2371474 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000032165 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000032165 cpcScore=-0.9935950 cnci=-0.1338875 gene:OTTHUMG00000011637 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_024538 // NONCODE // accn=NR_024538 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_024538 cpcScore=4.7678300 cnci=-0.1823067 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC015716 // NONCODE // accn=BC015716 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=508 cpcScore=-0.7561580 cnci=-0.1913484 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000098111 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000098111 cpcScore=-1.1087700 cnci=-0.2758818 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
NR_036437 // NONCODE // accn=NR_036437 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_036437 cpcScore=8.0485800 cnci=-0.0737311 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF086464 // NONCODE // accn=AF086464 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=514 cpcScore=-1.2125300 cnci=-0.3018495 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC069165 // NONCODE // accn=BC069165 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4778 cpcScore=-0.4522630 cnci=-0.1976982 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001ebn.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001ebn.1 cpcScore=0.2273310 cnci=-0.3693695 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC041428 // NONCODE // accn=BC041428 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=524 cpcScore=-0.9772480 cnci=-0.2598398 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000524935 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000524935 cpcScore=-1.0270600 cnci=-0.2565045 gene:ENSG00000227811 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_038952 // NONCODE // accn=NR_038952 class=lncRNA name= ref=RefGeneNoncode transcriptId=NR_038952 cpcScore=-0.9710150 cnci=-0.2327708 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
ENST00000428461 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000428461 cpcScore=2.8855300 cnci=-0.0924060 gene:ENSG00000231437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000442751 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000442751 cpcScore=3.1378400 cnci=-0.0552467 gene:ENSG00000231437 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC034233 // NONCODE // accn=BC034233 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=525 cpcScore=2.1514900 cnci=-0.2518129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001eby.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001eby.1 cpcScore=1.1852700 cnci=-0.3587856 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
CR610673 // NONCODE // accn=CR610673 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=568 cpcScore=0.2628060 cnci=-0.3701439 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000033260 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033260 cpcScore=-0.5959490 cnci=-0.3628253 gene:OTTHUMG00000012023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033261 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033261 cpcScore=-0.6295180 cnci=-0.3763411 gene:OTTHUMG00000012023 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AJ227918 // NONCODE // accn=AJ227918 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000245067 cpcScore=-1.3029100 cnci=-0.2594663 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC044921 // NONCODE // accn=BC044921 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=569 cpcScore=-0.8806690 cnci=-0.2042876 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000033546 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033546 cpcScore=-0.9400910 cnci=-0.2570283 gene:OTTHUMG00000012131 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000033547 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033547 cpcScore=-1.0232100 cnci=-0.3181288 gene:OTTHUMG00000012131 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF085853 // NONCODE // accn=AF085853 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4786 cpcScore=-0.8078080 cnci=-0.3597534 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
uc001eda.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001eda.1 cpcScore=3.7699900 cnci=-0.2006752 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
BC047723 // NONCODE // accn=BC047723 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4787 cpcScore=-1.0901400 cnci=-0.2748410 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416193 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000416193 cpcScore=-1.1527400 cnci=-0.2516649 gene:ENSG00000226419 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420168 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000420168 cpcScore=-1.1830000 cnci=-0.3016323 gene:ENSG00000226419 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000428411 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=EnsemblNoncode transcriptId=ENST00000428411 cpcScore=-1.2373100 cnci=-0.2977797 gene:ENSG00000226419 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001edc.1 // NONCODE // accn=NULL class=lncRNA name= ref=UCSCGeneNoncode transcriptId=uc001edc.1 cpcScore=-1.0676900 cnci=-0.2332997 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1004 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1004 cpcScore=-1.2821400 cnci=-0.2723123 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// linc_luo_1005 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1005 cpcScore=-1.2829200 cnci=-0.3146197 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK123199 // NONCODE // accn=AK123199 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=570 cpcScore=-0.3749090 cnci=-0.3284897 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF306690 // NONCODE // accn=AF306690 class=mRNAlike lncRNA name=NULL ref=H-invitational v7.5 transcriptId=HIT000076878 cpcScore=-1.3916500 cnci=-0.3570146 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000032873 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000032873 cpcScore=-1.3599300 cnci=-0.1938471 gene:OTTHUMG00000011899 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_2001 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_2001 cpcScore=-1.3018000 cnci=-0.2636240 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000032831 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000032831 cpcScore=-0.9768500 cnci=-0.4063610 gene:OTTHUMG00000011879 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK130715 // NONCODE // accn=AK130715 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=4788 cpcScore=-1.0566300 cnci=-0.2860236 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000033222 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033222 cpcScore=-1.1096000 cnci=-0.3786289 gene:OTTHUMG00000012009 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AB007959 // NONCODE // accn=AB007959 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=583 cpcScore=-1.1488300 cnci=-0.2795876 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000033488 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033488 cpcScore=2.0901400 cnci=-0.2275573 gene:OTTHUMG00000012112 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AF090945 // NONCODE // accn=AF090945 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=592 cpcScore=-0.9316380 cnci=-0.3105873 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000033591 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000033591 cpcScore=-1.1786300 cnci=-0.2672855 gene:OTTHUMG00000012147 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK126361 // NONCODE // accn=AK126361 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=594 cpcScore=-1.0293200 cnci=-0.3563183 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK129765 // NONCODE // accn=AK129765 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=595 cpcScore=-0.4591180 cnci=-0.4786692 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
linc_luo_1006 // NONCODE // accn=NULL class=lincRNA name=Human lincRNA ref=Scripture Reconstruction LincRNAs By Luo transcriptId=linc_luo_1006 cpcScore=-1.3406200 cnci=-0.3957361 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
AK055194 // NONCODE // accn=AK055194 class=mRNAlike lncRNA name=Human lncRNA ref=JounralRNA transcriptId=596 cpcScore=0.0275504 cnci=-0.3373976 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
OTTHUMT00000034530 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000034530 cpcScore=-1.0658500 cnci=-1.0000000 gene:OTTHUMG00000012409 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000034531 // NONCODE // accn=NULL class=mRNAlike lncRNA name=vega lncRNA ref=GENCODE transcriptId=OTTHUMT00000034531 cpcScore=-1.2509400 cnci=-0.4521239 gene:OTTHUMG00000012409 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0